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ISOLAMENTO, IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE LINHAGENS ENDOFÍTICAS DE Bacillus thuringiensis DE MANDIOCA (Manihot esculenta Crantz) / Isolation, identification and characterization of endophytic strains of Bacillus thuringiensis from cassava (Manihot esculenta Crantz)Marise Tanaka Suzuki 08 June 2006 (has links)
Bactérias endofíticas provavelmente desenvolveram uma relação com planta hospedeira através de processos coevolucionários, podendo influenciar de alguma forma na fisiologia da planta. Na literatura, há muitos relatos sobre espécies de Bacillus endofíticos, no entanto, poucos se referem a espécie B. thuringiensis (Bt). Dessa forma, o objetivo desse trabalho foi isolar, identificar e caracterizar Bt de mandioca. Todos os isolados identificados como Bt produziram cristais pontuais e apenas um isolado, IIRAC22, produziu cristais amorfos maiores. Esse isolado apresentou genes cry4A, cry4B e cry10 e toxicidade a larvas de Aedes aegypti e Culex quinquefasciatus, evidenciando ser Bt var. israelensis. Todos os isolados produziram quitinase, sugerindo que elas podem ter ação controladora sobre fungos fitopatogênicos e insetos. Houve também produção de pectinase, enzimas envolvidas na penetração de planta hospedeira e estabelecimento como endófito. Esses Bt endofíticos podem levar ao desenvolvimento de produtos biotecnológicos para controle de insetos. / Endophytic bacteria probably developed a relationship with their plant host through coevoltionary processes what could influence in the physiology of the plant. In the literature, there are many reports about endophytic Bacillus species, however, few reports cite endophytic B. thuringiensis (Bt). Thus, the aim of the present work was to isolate, identify and characterize Bt from cassava. All the isolates identified as Bt were able to produce punctual crystals, but only one isolate, IIRAC22, produced large amorphous crystals. This isolate presented cry4A, cry4B and cry10 genes and toxicity against larvae of Aedes aegypti and Culex quinquefasciatus, evidencing to be Bt var. israelensis. All the isolates produced quitinase, suggesting that they can control phytopathogeni fungi and insects. There was also pectinase production, enzyme involved in the penetration of plant hosts and establishment as endophytes. These endophytic Bt can take to the development of biotechnological products for the control of insect.
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Codigestão anaeróbia de lixiviado de aterro industrial e glicerina / Anaerobic co-digestion of leaching industrial landfill and glycerinCastro, Thiago Morais de 31 January 2018 (has links)
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Previous issue date: 2018-01-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The main objective of this study was to evaluate the performance of the anaerobic co-digestion of different concentrations of industrial landfill leachate associated with crude residual glycerin, in a continuous anaerobic bioreactor with a fixed-structure bed (ABFSB) in the same process of anaerobic co-digestion. In this way, co-digestion tests were carried out in laboratory scale (400 mL of useful volume), batch operated in mesophilic conditions (30 ± 1 °C), with a 30-day incubation time in which five levels of (0, 1.5, 5, 8.5, and 10%) and five food/microorganism (F/M) levels (0.3, 0.5, 1, 0, 1.5, and 1.7), adopting experimental design of the Central Composite Rotational Design (CCRD). The results indicated a significant effect on the responses: methanogenic potential, removal of organic matter in terms of COD, accumulated production of CH4, and estimation of maximum production of CH4 using the modified Gompertz model, considering a confidence interval of 95% (p <0.05). From the results and with the desirability test it was verified that the ideal mixture was 95.13% of the industrial landfill leachate with 4.87% of the crude residual (v/v) residual glycerin with F/M ratio of 1.61 to optimize the process as a function of the response variables. From this recommended combination, with approximately 5% glycerin added to the leachate (v/v), the performance of ABFSB was evaluated in the co-digestion cited. The performance of the process was evaluated in three stages: biomass adaptation, gradual increase of organic loading rate (OLR) and reduction of alkaline supplementation. After the first 48-day period, the results were favorable to the application of the bioreactor in the evaluated anaerobic co-digestion, since the system presented stable conditions regarding the operational parameters with the addition of alkalinity with sodium bicarbonate (NaHCO3) and biomass adaptation. Thus, the second stage was started with application of increasing OLR (2, 3.5, 7.1 and 11.6 gCOD L-1 d-1). In the OLR of 7.1 gCOD L-1 d-1, the process reached the maximum methane flow rate (MFR) of 7.61 LNCH4 d-1, methane (MY) yield of 0.302 LNCH4 gCODrem-1 and volumetric methane production rate (VMPR) of 2.79 LNCH4 L-1 d-1, with total COD (ERCOD) and soluble COD removal efficiencies (ERsCOD) above 90%. Thus, the condition adopted in the third was OLR of 7.1 gCOD L-1 d-1, CODaffluent of 10.68 gO2 L-1 and hydraulic holding time of 35.2 h, aiming to optimize the quantity effectively required of NaHCO3. The minimum required concentration of alkalinity supplementation was of 0.28 gNaHCO3 gDQOaffluent-1. It is concluded that alkalinity supplementation was an important factor in the stability of the bioreactor. Finally, it is evidenced that the system is promising and that the results can serve as subsidy for industrial landfills to adopt this form of co-digestion, with biogas energy use. / O objetivo principal deste trabalho foi avaliar a codigestão anaeróbia de diferentes concentrações de lixiviado de aterro industrial e glicerina inicialmente em reatores em batelada e posteriormente o desempenho do processo em biorreator anaeróbio de leito fixo ordenado (Continuous Anaerobic Bioreactor with a Fixed-Structure Bed – ABFSB) em fluxo ascedente contínuo. Foram realizados ensaios de codigestão em reatores, em escala de laboratório, operados em batelada em condições mesofílicas (30 ±1 °C), com tempo de incubação de 30 dias, quando foram testados cinco níveis de adição de glicerina ao lixiviado (v/v) (0; 1,5; 5; 8,5 e 10%) e cinco níveis de relação alimento/microrganismo (A/M) (0,3; 0,5; 1,0; 1,5 e 1,7), adotando-se planejamento experimental do tipo Delineamento Composto Central Rotacional (DCCR). Os resultados obtidos indicaram efeito significativo para as variáveis respostas: potencial metanogênico, remoção de matéria orgânica, em termos de DQO, produção acumulada de CH4 e a estimativa da produção máxima de CH4 utilizando o modelo de Gompertz modificado, considerando intervalo de confiança de 95% (p<0,05). A partir dos resultados e com o ensaio da desejabilidade foi verificado que a mistura ideal foi de 95,13% do lixiviado de aterro industrial com 4,87% da glicerina residual bruta (v/v) com relação A/M de 1,61 para otimização do processo em função das variáveis respostas. A partir desta combinação recomendada, com aproximadamente 5% de glicerina adicionada ao lixiviado (v/v), avaliou-se o desempenho do ABFSB na codigestão citada. O desempenho do processo foi avaliado em três etapas: adaptação da biomassa, aumento gradual da carga orgânica volumétrica (COV) e redução da suplementação alcalina. Na primeira etapa o sistema apresentou condições estáveis quanto aos parâmetros operacionais com a suplementação da alcalinidade com bicarbonato de sódio (NaHCO3) e adaptação da biomassa. Na segunda etapa com aplicação de COV crescentes (2; 3,5; 7,1 e 11,6 gDQO L-1 d-1). Na COV de 7,1 gDQO L-1 d-1, o processo atingiu os máximos valores de vazão de metano (MFR) de 7,61 LNCH4 d-1, rendimento de metano (MY) de 0,302 LNCH4 gDQOrem-1 e a produção volumétrica de metano (VMPR) de 2,79 LNCH4 L-1 d-1, com eficiências de remoção de DQO total (ERDQO) e DQO solúvel (ERDQOs) superiores a 90%. Na terceira etapa com o COV de 7,1 gDQO L-1 d-1, DQOafluente de 10,68 gO2 L-1 e TDH de 35,2 h, visando otimizar a quantidade efetivamente necessária de NaHCO3. A concentração mínima necessária da suplementação de alcalinidade foi de 0,28 gNaHCO3 gDQOafluente-1. Concluiu-se que a suplementação da alcalinidade foi um fator de importância na estabilidade do biorreator, ficando evidenciado que o sistema é promissor e que os resultados podem servir de subsídio para que aterros industriais adotem esta forma de codigestão, com aproveitamento energético do biogás.
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Caracterização fisiológica e do perfil de expressão gênica do transporte de nitrogênio em genótipos contrastantes para processo de fixação biológica de N2 de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) / Physiological characterization and gene expression profile of the transport of nitrogen in contrasting cultivars for biological nitrogen fixation of sugarcane (Saccharum spp.)Layanne Batista Souza 29 January 2016 (has links)
A cana-de-açúcar é uma cultura agrícola de grande importância econômica para o Brasil, e a expansão de seu cultivo para solos marginais requer uma maior utilização de fertilizantes à base de nitrogênio (N). Na maioria dos países produtores, a adubação nitrogenada se baseia em altas doses de aplicação, enquanto, no Brasil, o seu uso é relativamente baixo devido, em parte, ao processo de fixação biológica de nitrogênio (FBN) pela ação de bactérias diazotróficas. Além da FBN, as plantas adquirem fontes de N, como amônio e nitrato, por meio de transportadores de membranas localizados nas raízes. Há evidências que a associação com microrganismos pode favorecer as plantas por meio da regulação dos genes de transportadores de N. Desta forma, este trabalho teve como objetivo caracterizar o transporte de amônio e nitrato, avaliando a expressão gênica dos principais transportadores de N em cana-de-açúcar cultivada in vitro sob o efeito da associação com bactérias diazotróficas. Também foi descrita a comunidade bacteriana de plântulas in vitro, bem como o efeito da fertilização com N e da inoculação com bactérias diazotróficas em plantas maduras. Plântulas de \'SP70- 1143\' e \'Chunee\', que contrastam para FBN, foram empregadas em ensaios in vitro sob diversas concentrações e fontes de N em associação ou não com uma estirpe de Gluconacetobacter diazotrophicus ou um mistura de bactérias diazotróficas (G. diazotrophicus, Herbaspirillum seropedicae, H. rubrisubalbicans, Azospirillum amazonense e Burkholderia tropica). A caracterização do transporte de N por meio de ensaios de absorção de nitrato e amônio marcados (15N) revelou que a interação entre cana-de-açúcar x G. diazotrophicus induziu a expressão do gene do transportador de nitrato ScNRT2.1, o que levou a uma tendência no aumento no influxo de nitrato, assim como dos genes de transportadores de amônio ScAMT1.1 e ScAMT1.3, resultando em maiores influxos de amônio apenas para a cultivar \'SP70- 1143\'. Já a associação da cana-de-açúcar com a mistura de bactérias diazotróficas revelou que somente houve indução transcricional de ScAMT1.1, o que resultou na maior absorção de amônio em \'SP70-1143\'. Por sua vez, quando analisada a interação in vitro por 30 dias, a presença da bactéria, apesar de transiente, possivelmente favoreceu a expressão dos genes de transportadores de nitrato ScNRT1.1 e ScNRT2.1, e do transportador de amônio ScAMT1.1, resultando no maior acúmulo de 15N-nitrato de amônio nas plantas de \'SP70-1143\'. Foi detectada uma comunidade bacteriana associada a plântulas micropropagadas, a qual é distinta entre os genótipos \'SP70-1143\' e \'Chunee\' e se altera com a inoculação com G. diazotrophicus. Para as plantas cultivadas em campo, a comunidade bacteriana existente foi alterada pela fertilização de N, mas não pela inoculação com diazotróficas. Portanto, a inoculação com bactérias diazotróficas parece induzir a expressão dos principais genes transportadores de amônio e nitrato em plântulas do genótipo \'SP70-1143\' resultando na maior absorção de fontes inorgânicas de N. / Sugarcane has a large economic importance to Brazil, and it\'s the expansion of cultivation to marginal soils requires a larger application of nitrogen fertilizers (N) to maintain yield. In most producing countries, N fertilization is based on high application rates, whereas in Brazil N fertilization is relatively low, possibly due in part, to the process of biological nitrogen fixation (BNF). In addition, plants acquire inorganic N sources from the soil by membrane transporters that may be regulated by association with microorganisms. This study aimed to characterize the ammonium and nitrate transport evaluating the gene expression profile of the major transporters grown in vitro in association with diazotrophic bacteria. It was also described the bacterial community in micropropagated plants, as well as the effect of N fertilization or inoculation with nitrogen fixing bacteria in mature plants. \'SP70-1143\' and \'Chunee\' which contrasted to BNF, were used in in vitro experiments in several concentrations and N source, in association or not with a strain of Gluconacetobacter diazotrophicus or a bacteria mixture (G. diazotrophicus, Herbaspirillum seropedicae, H. rubrisubalbicans, Azospirillum amazonense and Burkholderia tropica). The characterization of the N transport by uptake assays with 15N-labeled ammonium and nitrate, revealed that the interaction between sugarcane x G. diazotrophicus induced, the nitrate transporter gene ScNRT2.1 expression, which lead to trend to increase nitrate influx, as well as the ammonium transporter genes ScAMT1.1 and ScAMT1.3, resulting in higher ammonium influx in \'SP70-1143\'. Sugarcane associated with the bacterial mixture revealed a transcriptional induction of ScAMT1.1 resulting in larger ammonium acquisition in \'SP70-1143\'. Further, the presence of bacteria in vitro for 30 days, although transient, possibly favored the expression of nitrate transporters ScNRT1.1 and ScNRT2.1, and the ammonium transporter ScAMT1.1, resulting in accumulation of 15N-ammonium nitrate in \'SP70-1143\'. A bacterial community associated with in vitro plants of \'SP70-1143\' and \'Chunee\' was detected with different composition between genotypes, and which changed with artificial inoculation. For plants grown in the field, the bacterial community was affected by N fertilization but not by inoculation with diazotrophic. These results indicate that the inoculation with diazotrophic bacteria appears to induce the expression of the major ammonium and nitrate transporters genes in \'SP70-1143\' plants resulting in higher uptake of inorganic N sources.
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Bioindicadores de qualidade do solo em um sistema integrado de produção agropecuária / Soil quality bioindicators in an integrated crop-livestock systemNeufeld, Ângela Denise Hübert 07 December 2016 (has links)
Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Integrated crop‑livestock systems (ICLS) can improve the chemical, physical and biological soil attributes. However, grazing intensification may outweigh these benefits and cause severe losses to the system. Soil biota is considered a good environmental bioindicator and can attest to the quality of the system management. This study aimed to know the implications of grazing intensification on soil biota in a long-term ICLS, to
verify which soil conditions most influence biological attributes, and to evaluate if these attributes can be used as environmental quality indicators in ICLS. The experiment was started in 2001, on a 23 hectare area, with Glycine max in summer and Avena strigosa+Lolium multiflorum for continuous cattle grazing in winter. The treatments consisted of four sward heights (10, 20, 30, and 40 cm), plus an ungrazed area, as the control. Sampling was performed in four seasons between 2014-2016, two after the
grazing season and two after soybean harvest. Soil basal respiration, microbial biomass carbon (MBC), microbial quotient, diversity and abundance of meso and macrofauna, as well as chemical, physical and vegetation cover variables were evaluated for correlation. The highest microbial respiration, MBC content, abundance and diversity of the soil fauna were quantified under moderate (20 and 30 cm) and light
(40 cm) grazing intensities and under no grazing. At the high grazing intensity was a vegetal cover reduction and decreasing on the physical soil quality, which resulted in a lower soil moisture and activity, abundance and diversity reduction of soil organisms community. These results increase the need for an adequate management of pasture areas, without harming the ICLS sustainability. / Os sistemas integrados de produção agropecuária (SIPAs) podem melhorar os
atributos químicos, físicos e biológicos do solo. Porém, a intensificação do pastejo
pode suplantar estes benefícios e causar graves prejuízos ao SIPA. A biota do solo é
considerada uma boa bioindicadora ambiental e pode atestar sobre a qualidade do
manejo deste sistema. O objetivo do estudo foi conhecer as implicações da
intensificação do pastejo sobre a biota do solo em um SIPA de longa duração, verificar
quais as condições edáficas mais influenciam os atributos biológicos, e avaliar se
estes atributos podem ser utilizados como indicadores de qualidade ambiental do
SIPA. O experimento é conduzido há 15 anos em uma área de 23 hectares com a
sucessão Glycine max para produção de grãos no verão e Avena strigosa + Lolium
multiflorum para o pastejo contínuo dos bovinos no inverno. Os tratamentos são
constituídos pelas alturas de pastejo de 10, 20, 30 e 40 cm e por testemunhas sem
pastejo. A amostragem foi realizada em quatro épocas entre 2014 a 2016, duas após
o final da estação de pastejo e duas após a colheita da soja. Foram avaliados a
respiração basal do solo, o conteúdo de carbono na biomassa microbiana (CBM), o
quociente metabólico e a diversidade e abundância da meso e macrofauna epiedáfica,
além das variáveis químicas, físicas e de cobertura vegetal para fins de correlação.
No tratamento sem pastejo e nas maiores alturas da pastagem quantificaram-se a
maior respiração microbiana, conteúdo de CBM, abundância e diversidade da fauna
epiedáfica. Na menor altura de pastejo houve redução da cobertura vegetal e
prejuízos aos atributos físicos do solo, o que resultou em menor teor de umidade e
redução da atividade, abundância e diversidade dos organismos do solo. Estes
resultados reforçam a necessidade de um manejo adequado da carga animal na
pastagem para que não ocorra comprometimento à sustentabilidade dos SIPAs.
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CARACTERIZAÇÃO CITOGENÉTICA E DE CRESCIMENTO DE Schinus terebinthifolius Raddi / CYTOGENETICS CHARACTERIZATION AND GROWTH OF Schinus terebinthifolius RaddiLuz, Leandro Vinícius da 05 July 2013 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Tropical forests play vital role in maintaining the stability and quality of the environment, protecting the soil and water resources, conserving the biodiversity, protecting cultural and recreational values, which contribute to improving the quality of life of the population. Being the germplasm of forest species a wealth to be used and preserved. Schinus terebinthifolius (Anacardiaceae) has medicinal, alimentary and ecological properties, besides being destined for the recomposition of degraded areas of permanent preservation. However, there are few studies on the cytogenetics characterization and promotion growth of this species. Thus, aiming for conservation and sustainable use, the objective is to characterize cytogenetically this species, assess the quality of the seeds S. terebinthifolius from individuals of different accessions of populations of Rio Grande do Sul, as well as, to evaluate the effect of the interaction of Trichoderma spp. on the contamination and in vitro germination and ex vitro vegetative growth of S. terebinthifolius. For the determination of chromosome number were used tissues of root tips. In the germination study, the parcels with seeds were kept in a climatic chamber with a photoperiod of 16 hours at the temperature of 20°C (+/- 2°C). To the study the interaction between S. terebinthifolius and Trichoderma spp. were evaluated the isolates TSM1 and TSM2 of Trichoderma viride, 2B2 and 2B22 of Trichoderma harzianum for the in vitro experiment, through the cellophane technique and the ex vitro experiment was conducted in a greenhouse, where were evaluated the effects of the isolates 2B2 and 2B22 and the commercial product Trichodermil®, all in the presence and absence of growth regulator Stimulate®. It is concluded that the chromosome number of the species S. terebinthifolius determined for 22 accessions collected in Rio Grande do Sul is 2n = 28, indicating that there isn't intraspecific variability. The quality of the seeds of S. terebinthifolius shows great heterogeneity among the different accessions collection. With the technique of in vitro cellophane, all four isolates of Trichoderma spp. tested are efficient in controlling fungal contamination of seeds. In ex vitro cultivation, the difference was significant growth in leaf area index for strain 2B2 / As florestas tropicais desempenham função vital na manutenção da estabilidade e qualidade do meio ambiente, protegem o solo e os recursos hídricos, conservam a diversidade biológica, protegem os valores culturais e recreativos, que contribuem com a melhoria da qualidade de vida da população. Sendo o germoplasma de espécies florestais uma riqueza a ser utilizada e preservada. Schinus terebinthifolius (Anacardiaceae) possui propriedades medicinais, alimentícias e ecológicas, além de serem destinados à recomposição de áreas degradadas de preservação permanente. No entanto, ainda são poucos os estudos sobre a caracterização citogenética e promoção de crescimento dessa espécie. Assim, visando à conservação e a utilização sustentável, objetiva-se caracterizar citogeneticamente esta espécie, avaliar a qualidade das sementes de S. terebinthifolius provenientes de indivíduos de diferentes acessos do Rio Grande do Sul, bem como, avaliar o efeito da interação de Trichoderma spp. na contaminação e germinação in vitro e no crescimento vegetativo ex vitro de S. terebinthifolius. Para a determinação do número de cromossomos, foram utilizados tecidos de pontas de raízes. No estudo de germinação, as parcelas com as sementes foram mantidas em câmara climática com fotoperíodo de 16 horas à temperatura de 20°C (+/- 2°C). Para o estudo da interação entre S. terebinthifolius e Trichoderma spp. foram avaliados os isolados TSM1 e TSM2 de Trichoderma viride, 2B2 e 2B22 de Trichoderma harzianum para o experimento in vitro, através da técnica do papel celofane e o experimento ex vitro foi realizado em casa de vegetação, onde se avaliou os efeitos dos isolados 2B2 e 2B22, e o produto comercial Trichodermil®, todos na presença e ausência do regulador de crescimento Stimulate®. Conclui-se que o número de cromossomos da espécie S. terebinthifolius determinado para 22 acessos coletados no Rio Grande do Sul é de 2n = 28, indicando que não ocorre variabilidade intraespecífica. A qualidade das sementes de S. terebinthifolius apresenta grande heterogeneidade entre os diferentes acessos de coleta. Com a técnica in vitro do papel celofane, os quatro isolados de Trichoderma spp. testados são eficientes no controle da contaminação fúngica das sementes. No cultivo ex vitro, observou-se diferença significativa de crescimento no índice de área foliar para o isolado 2B2;
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Regulação da expressão gênica por oxigênio em microrganismos eucariotos: análises de ESTs (Expressed Sequence Tags) e microrrays de cDNA de Trichoderma reesei / Regulation of gene expression by oxygen in eukaryotic microorganisms: Expressed Sequence Tags ESTs and Trichoderma reesei cDNA \"microarrays\"Eric D\'Alessandro Bonaccorsi 29 April 2003 (has links)
Glicose e oxigênio são moléculas essenciais para a maioria dos organismos vivos. Além de sua importância nos processos de produção de energia - glicose como fonte de carbono e energia e oxigênio como aceptor dos elétrons doados por NADH e FADH2 - estes dois compostos funcionam como efetuadores, modulando vários processos metabólicos e fisiológicos nas células. Visto que a mitocôndria é um dos alvos afetados pelas disponibilidades destas duas moléculas, nós isolamos e seqüenciamos o genoma mitocondrial de Trichoderma reesei, um fungo multicelular empregado neste trabalho como sistema modelo. Foi estudado o efeito da variação de concentração de glicose e oxigênio sobre a expressão de transcritos do genoma mitocondrial, bem como sua implicação no metabolismo de glicose. São apresentadas análises da expressão gênica de aproximadamente 2000 transcritos de T. reesei submetido a concentrações limitantes de oxigênio dissolvido, realizadas com o emprego da técnica de microarrays de cDNA. Pelo menos 330 transcritos foram diferencialmente expressos em função da disponibilidade de oxigênio. Aqueles envolvidos nos processos de síntese protéica e divisão celular foram regulados negativamente, enquanto transcritos relacionados com funções de defesa celular e síntese de RNA foram positivamente regulados. Uma fração substancial de outros genes afetados pela baixa disponibilidade de oxigênio não possui, atualmente, funções celulares conhecidas. Esta observação deve contribuir para a posterior anotação funcional do genoma de T. reesei. Também foram identificados reguladores transcricionais diferencialmente expressos em baixas tensões de oxigênio. O perfil de expressão destes reguladores aponta-os como potenciais candidatos ao envolvimento com a expressão de genes afetados pela disponibilidade de oxigênio. / Glucose and oxygen are essential molecules in most of living organisms. In addition to their importance in production of energy - glucose as a carbon and energy source and oxygen as an acceptor of electrons donated by NADH and FADH2 - both molecules function as effectors modulating various metabolic and physiological processes in the cell. Because one of the targets affected by both molecules is the mitochondrion, we isolated and sequenced the mitochondrial genome of Trichoderma reesei, a multicellular fungus that is used in this study as a model system. The effect of varying the concentration of glucose and oxygen on the expression of the transcripts of the mitochondrial genome, and its implication on the metabolism of glucose, was studied. Gene-wide expression analyses of nearly 2000 transcripts of T. reesei under limited concentration of dissolved oxygen, using cDNA microarry technique, are presented. At least 330 transcripts were differentially expressed with respect to oxygen availability. Those involved in protein synthesis and cell division processes were downregulated, while transcripts involved in cell defense and RNA synthesis were upregulated. A substantive fraction of other anaerobically affected genes have currently unknown cellular roles, and these results should therefore contribute to further functional annotation of the genome. ln addition, we have identified transcriptional regulators that are differentially expressed at a low oxygen tensions. The expression profile of these regulators points them out as potential candidates involved in the expression of genes affected by oxygen availability.
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APLICAÇÃO DE ANTIOXIDANTES NATURAIS EM CARNE MECANICAMENTE SEPARADA (CMS) DE AVE / NATURAL ANTIOXIDANTS APPLICATION IN MECHANICALLY DEBONED POULTRY MEAT (MDPM)Pereira, Marlene Gomes 30 April 2009 (has links)
The purpose of this project was to evaluate the antioxidant activity in vitro and its effects at
the oxidative stability of mechanically deboned poultry meat (MDPM) of five natural extracts. It was studied: the yerba mate (Ilex paraguariensis), the marcela (Achyrocline satureioides), a mixture of yerba mate (50%) and marcela (50%), green tea (Camellia sinensis) and propolis without alcohol. The synthetic antioxidant BHA (Butylated Hydroxianisole) was used as a positive control and the meat treated with no antioxidant was used as negative control. Natural extracts were evaluated in vitro
for quantification of phenolic and flavonols total content, for antioxidant activity, by DPPH radicalscavenging, Phosphomolybdenum complex and Reducing Power assay methods. All antioxidants were mixed separately in different and equal portions of mechanically deboned poultry meat, as follow: 0.50% of yerba mate, marcela and the mixture, 0.05% of green tea, 0.10% of própolis without alcohol and 0.02% of BHA. Samples of MDPM were packed and storage at 0 to +4ºC for 10 days. The
samples were evaluated each two days and the pH, TBARS and peroxide index were measured, as well as the Total Mesophilic Aerobic counts, Total Coliforms, E. coli, Lactic Bacteria, Clostridium perfringens, Salmonella spp and Staphylococcus aureus. Surface and internal colour ( L*, a*, b*) were measured and pictures of each treatment were done. Green tea extract showed the higher (p<0.05)
phenolics contents and the higher (p<0.05) antioxidant activity in vitro compared to the other extracts.
Yerba mate extract showed the higher (p<0.05) flavonols content. Propolis without alcohol extract showed the lowest (p<0.05) phenolics, flavonols and antioxidant activity in vitro. Marcela had the best oxidative inhibitory effect at the MDPM, with the lowest TBARS values. Propolis extract showed the best performance for the meat colour stability. Natural antioxidant addition do not interfere at MDPM pH and peroxide values. Salmonella spp was not detected in any of the samples evaluated and
the results found to Staphylococcus aureus were in agreement with the Brazilian Mechanically Deboned Meat Legislation. The mixture of extracts showed the lowest (p<0.05) media for Total Mesophilic Aerobic counts. Propolis extract showed the lowest media count for Total Coliforms, E. coli and Clostridium perfringens. Yerba mate extract showed the lowest media count for Lactic Bacteria. The use of natural antioxidants should provide benefits in relation to the MDPM lipid oxidation and the microbiological growth inhibition. More researchs are necessary, looking for a better understanding about the action mechanisms of these extracts. / Este trabalho teve como objetivo avaliar cinco extratos naturais em relação a sua atividade antioxidante in vitro e na Carne Mecanicamente Separada (CMS) de frango. Foram estudadas a erva mate (Ilex paraguariensis), a marcela (Achyrocline satureioides), uma mistura de erva mate (50%)
com marcela (50%), o chá verde (Camellia sinensis) e o própolis sem álcool. O antioxidante sintético BHA foi utilizado como controle positivo e o tratamento sem adição de antioxidante como controle negativo. Nos extratos naturais foram identificados o conteúdo total de fenólicos, flavonóides e a atividade antioxidante pelos métodos do DPPH, Fosfomolibdênio e do Poder de Redução. Todos os
extratos foram aplicados separadamente em porções distintas e iguais de Carne Mecanicamente Separada (CMS) de frango, sendo os percentuais de aplicação de 0,50% de erva mate, marcela e da mistura, 0,05% de chá verde, 0,10% do própolis sem álcool e 0,02% de BHA. A CMS de frango foi mantida sob refrigeração de 0 a +4ºC durante 10 dias. As amostras foram avaliadas a cada dois dias, em relação ao pH, índice de TBARS, índice de peróxido, em relação a contagem média de Aeróbios Mesófilos Totais, Coliformes Totais, E. coli, Bactérias lácticas, Clostridium perfringens, Salmonella spp e Staphylococcus aureus. A cor objetiva (L*, a*, b*) foi medida na superfície e na parte interna da CMS de frango assim como o registro em foto de cada tratamento. O extrato de chá verde apresentou o maior (p<0,05) conteúdo de fenólicos e a maior (p<0,05) atividade antioxidante in vitro em relação aos demais extratos. O extrato de erva mate apresentou o maior (p<0,05) conteúdo de flavonóides. O
extrato de própolis sem álcool apresentou os menores (p<0,05) conteúdos de fenólicos, de flavonóides e a menor atividade antioxidante in vitro. O extrato de marcela teve o melhor efeito na inibição da oxidação lipídica da CMS de frango, apresentando os menores valores médios de TBARS. O extrato de própolis sem álcool manteve por mais tempo a estabilidade da cor da carne. A adição dos antioxidantes naturais não interferiu no pH e nem no índice de peróxido da CMS de frango. Não foi detectada a presença de Salmonella spp e os resultados de Staphylococcus aureus ficaram dentro dos padrões estabelecidos pela Legislação. O tratamento com a mistura de extratos de erva mate e de marcela apresentou a menor (p<0,05) contagem média de Aeróbios Mesófilos Totais em relação aos demais tratamentos. O extrato de própolis sem álcool apresentou a menor contagem média de
Coliformes totais, E. coli e Clostridium perfringens. O extrato de erva mate apresentou a menor contagem média de Bactérias lácticas. O uso de antioxidantes naturais pode trazer benefícios em relação a inibição da população microbiana da CMS de frango. Mais estudos são necessários visando um melhor entendimento dos mecanismos de ação desses extratos na carne mecanicamente separada
(CMS) de frango.
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