Yes / Here, we report the biochemical characterization of the mono-ADP-ribosyltransferase 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin poly-ADP-ribose polymerase (TIPARP/ARTD14/PARP7), which is known to repress aryl hydrocarbon receptor (AHR)-dependent transcription. We found that the nuclear localization of TIPARP was dependent on a short N-terminal sequence and its zinc finger domain. Deletion and in vitro ADP-ribosylation studies identified amino acids 400–657 as the minimum catalytically active region, which retained its ability to mono-ADP-ribosylate AHR. However, the ability of TIPARP to ADP-ribosylate and repress AHR in cells was dependent on both its catalytic activity and zinc finger domain. The catalytic activity of TIPARP was resistant to meta-iodobenzylguanidine but sensitive to iodoacetamide and hydroxylamine, implicating cysteines and acidic side chains as ADP-ribosylated target residues. Mass spectrometry identified multiple ADP-ribosylated peptides in TIPARP and AHR. Electron transfer dissociation analysis of the TIPARP peptide 33ITPLKTCFK41 revealed cysteine 39 as a site for mono-ADP-ribosylation. Mutation of cysteine 39 to alanine resulted in a small, but significant, reduction in TIPARP autoribosylation activity, suggesting that additional amino acid residues are modified, but loss of cysteine 39 did not prevent its ability to repress AHR. Our findings characterize the subcellular localization and mono-ADP-ribosyltransferase activity of TIPARP, identify cysteine as a mono-ADP-ribosylated residue targeted by this enzyme, and confirm the TIPARP-dependent mono-ADP-ribosylation of other protein targets, such as AHR. / This work was supported by Canadian Institutes of Health Research (CIHR) operating grants [MOP-494265 and MOP-125919]; CIHR New Investigator Award; an Early Researcher Award from the Ontario Ministry of Innovation [ER10-07-028]; the Johan Throne Holst Foundation; Novo Nordic Foundation; and the Norwegian Cancer Society to J.M. This work was also funded by grants from the Johan Throne Holst Foundation; and the Novo Nordic Foundation to H.I.N.

Vision based active safety systems have become more frequently occurring in modern vehicles to estimate depth of the objects ahead and for autonomous driving (AD) and advanced driver-assistance systems (ADAS). In this thesis a lightweight deep convolutional neural network performing real-time depth estimation on single monocular images is implemented and evaluated. Many of the vision based automatic brake systems in modern vehicles only detect pre-trained object types such as pedestrians and vehicles. These systems fail to detect general objects such as road debris and roadside obstacles. In stereo vision systems the problem is resolved by calculating a disparity image from the stereo image pair to extract depth information. The distance to an object can also be determined using radar and LiDAR systems. By using this depth information the system performs necessary actions to avoid collisions with objects that are determined to be too close. However, these systems are also more expensive than a regular mono camera system and are therefore not very common in the average consumer car. By implementing robust depth estimation in mono vision systems the benefits from active safety systems could be utilized by a larger segment of the vehicle fleet. This could drastically reduce human error related traffic accidents and possibly save many lives. The network architecture evaluated in this thesis is more lightweight than other CNN architectures previously used for monocular depth estimation. The proposed architecture is therefore preferable to use on computationally lightweight systems. The network solves a supervised regression problem during the training procedure in order to produce a pixel-wise depth estimation map. The network was trained using a sparse ground truth image with spatially incoherent and discontinuous data and output a dense spatially coherent and continuous depth map prediction. The spatially incoherent ground truth posed a problem of discontinuity that was addressed by a masked loss function with regularization. The network was able to predict a dense depth estimation on the KITTI dataset with close to state-of-the-art performance.

Ce manuscrit présente différentes études expérimentales des collisions en incidence rasante (< 3 degrés) sur LiF(001) d'ions simplement chargés tels que le néon et le fluor de basses énergies (< 3 keV). Le faisceau incident est pulsé. Le produit de la diffusion après une analyse en charge entre des plaques électrostatiques est détecté sur un détecteur sensible en position. Les particules secondaires (électrons ou ions) sont recueillies sur un détecteur composé de 16 unités de détection (2 galettes microcanaux) couvrant 2p stéradian au dessus de la surface. La technique de mesure de perte d'énergie (spectroscopie de translation) associée à la détection des particules diffusées en coïncidence avec les électrons émis de la surface lors de la collision d'ions néons simplement chargés, a permis de mettre en évidence des états excités de la surface. Ces états excités, localisés sur les ions fluors négatifs de la surface, sont soit centrés autour d'une seule lacune (les excitons), soit autour de 2 lacunes, ce dernier, complexe à 3 corps est connu dans la littérature sous le nom de trion. On trouvera dans ce manuscrit la première caractérisation de ces états par impact d'ions. Dans le cas du néon la capture correspond à une neutralisation Auger Les collisions d'atomes de fluors ont confirmé l'existence d'un seuil en vitesse, lors de la formation des ions négatifs. La formation de ces ions à partir d'ions positifs sous ce seuil, donne une preuve expérimentale d'une double capture simultanée. La valeur de la perte d'énergie s'explique correctement si l'on tient compte de l'interaction entre les deux lacunes voisines. La corrélation statistique se double donc d'une corrélation spatiale où les captures d'électrons s'effectuent sur deux sites halogènes voisins. Dans ce cas l'expérience ne permet pas de différencier un processus di-électronique d'un processus mono-électronique du second ordre alors que la théorie semble indiquer qu'il s'agit de processus du second ordre.

This dissertation focuses on the experiences of second language pupils which involve linguistic encounters. The overarching aim is to analyse second language pupils' encounters with Swedish as a Second Language and the Swedish school, using a “curriculum theory” and a ”life story” approach". The goal is achieved by examining two empirical contexts which can be described as expressed and experienced curricula. In the first context, an idea analysis is carried out of the contents of the syllabi and curricula for Swedish as a Second Language over a period of time. In the second context, a narrative analysis is carried out of the life stories given by second language pupils of their encounter with Swedish as a Second Language and the Swedish school. Trainee teachers with Swedish as a Second Language participate by telling their life stories. A framework for interpretation emerges by reasoning about language and the creation of meaning, as well as about culture, cultural capital, similarities/differences, compensating/completing and limited participation/full participation. The reasoning leads to the construction of a theoretical interpretation framework and prisms through which the offered and experienced learning can be studied. The analysis shows that what is on offer in the curricula and syllabi is mainly monocultural. It shows that a new subject has grown up based on the need to teach pupils about the Swedish cultural heritage and Swedish norms. Moreover, both changes in the expressed educational ideals over a period of time and contradictory educational ideals become evident. It is also clear that those providing the information felt both different and excluded. They were not monolingual, and did not have Swedish as their mother tongue. To make up for this lack of Swedishness, they were separated from the other classmates and offered special teaching in an attempt to compensate. They also received mother tongue tuition, which was not in Swedish, and this became a problem for those around them, who considered this was an easy option. The second language tuition they were offered focussed partly on their mistakes and shortcomings, and partly on the Swedish cultural heritage. Their earlier experience and skills were not used.

La nécessité de différencier les molécules biologiques selon leur chiralité est d'un intérêt majeur dans l'industrie pharmaceutique. Un nanotube de carbone chiral placé dans une configuration de résonateur diélectrique gigahertz permet de détecter sélectivement et de façon réversible les énantiomères (gauche et droit) d'acides aminés adsorbés sur le résonateur, via la variation de sa fréquence. la sensibilité du capteur est optimisée quand l'angle chiral du nanotube avoisine 15°. pour améliorer les performances de sélectivité chirale du capteur et de conserver sa réversibilité d'adsorption, une hélice peptidique insérée à l'intérieur du nanotube permet de supprimer le contact direct entre le peptide et la molécule sondée. L'hélice peptidique polaire induit sur le nanotube un champ dipolaire chiral, qui exalte les effets non linéaires de polarisation à la surface du tube et augmente la sélectivité. En fonctions des propriétés électriques de l'hélice et du tube , la sélectivité chirale du capteur fonctionnalisé est augmenté de 50 à 10% par rapport au capteur initial. La chiralité des nanotubes de carbone joue un rôle prépondérant dans la stabilisation des nanotubes doubles parois (DWNTs), notamment si les deux parois sont de la même chiralité. Les modes de vibration du tube sont alors grandement modifiés. Par une étude d'un grand nombre de (DWNTs), des lois simples connectant le rayon, l'angle chiral, la longueur des tubes ont été obtenues pour décrire la discrimination chirale en énergie et l'influence de la chiralité sur les modes de vibration Raman de DWNTs.L'extension de ce travail sera d'utiliser les DWNTs comme détecteurs de structures chirales de plus grande dimension. / Sorting biological molecules according to their chirality appears a challenge for the parmaceutical industries. Chiral carbon nanotubes formed by rolling up grapheme sheet(s) in a helical arrangement are used in a gigahertz resonator configuration to selectively and reversely detect the right and left handed enantiomers of amino acids. The chiral selectivity is probed through the modification of the resonance frequency of the nanotube, the variations depending on the polarization of the tube and the molecule. The sensitivity of the resonator is optimized when the chiral angle is around 15°. To improve the chiral recognition of molecules by the nanotube and to keep reversibility, the inclusion of peptidic helices inside a single walled nanotube (SWNT) avoids a direct interaction between the peptide and the tube. The polar nature of the helix is responsible for the occurrence of a chiral electric field, which polarizes the tube. Depending on the chiral electric properties of the helix and the nanotube, the sensitivity of the resonator is enhanced from 50 to 100 %. Chirality of carbon nanotubes plays a major influence in the structure stabilization of double-walled nanotubes (DWNTs). The role of chirality in the formation of the inner and outer walls of the DWNTs depending on the radius, chiral angle, length of the tubes has been studied. From an analysis of a large sampling of DWNTs, simple rules connecting RT, θ and LT have been found. The Raman vibrational modes of the DWNT provide information on the chiral arrangement of the two walls. With a larger diameter than the SWNTs, the DWNTs used in resonator configuration could be efficient probes of larger chiral species.

Dans ce manuscrit nous décrivons des études originales sur les propriétés photophysiques des nanotubes de carbone monoparois réalisées à l'échelle de la molécule unique. Nous nous sommes concentrés sur deux problématiques : l'effet du remplissage des nanotubes par de l'eau sur leurs propriétés de photoluminescence (PL) et la création de complexes multi-excitoniques en régime de forte excitation laser. Dans ce but nous avons utilisé une combinaison de microscopie, de spectroscopie et de mesures de déclin de PL. Nos résultats montrent pour des nanotubes de différents diamètres un décalage vers le rouge des énergies d'émission pour les nanotubes remplis d'eau. De plus, des déclins de PL biexponentiels sont obtenus pour des nanotubes individuels (6,4) vides et remplis d'eau. Les temps de déclin caractéristiques de ces deux espèces de nanotubes sont distincts, avec une réduction de la composante courte pour les nanotubes remplis. Ces résultats sont expliqués par une augmentation de la constante diélectrique dans les nanotubes remplis d'eau. Notre résultat le plus conséquent a été l'observation de la génération de trions dans des nanotubes non dopés en utilisant des moyen tout optiques. L'émission du trion apparaît dans les spectres de PL comme une bande latérale décalée vers le rouge. Basé sur nos observations expérimentales, nous proposons le modèle de génération du trion suivant lequel dans un régime multiexcitonique les interactions d'annihilation exciton-exciton créent des porteurs de charge qui sont piégés dans les fluctuations de potentiel électrostatique induites par les inhomogénéités de l'environnement. L'absorption subséquente d'un photon amène à la formation d'un trion localisé sur les charges piégées. / In this dissertation we report on original experimental investigations of the photophysical properties of individual single-walled carbon nanotubes (SWCNTs) at the single molecule level. We focused on two problems: the effect of water-filling nanotubes on their photoluminescence (PL) properties and generation of multi-excitonic complexes in regimes of strong laser excitation. To do so we used a combination of microscopy, PL spectroscopy and PL time decay measurements. Our results show, for different nanotube diameters, a red-shift of the PL emission energy for water-filled nanotubes. Furthermore, biexponential PL time decay behaviors are obtained for individual water-filled and empty (6,4) SWCNTs. The characteristic decay times for both species of nanotubes are distinct, with a reduction of the short component in water-filled SWCNTs. These results are explained by an increase of the dielectric constant for water-filled nanotubes. Our most consequential experimental result was the observation of all optical trion generation in undoped nanotubes. Trion emission appears in the PL spectrum as a red-shifted sideband. Based on our experimental observations, we propose a trion generation model according to which, at a multiexcitonic regime, exciton-exciton annihilation interactions create charge carriers that are transiently trapped at electrostatic potential fluctuations induced by the inhomogeneities of the environment. Subsequent photon absorption leads to trion formation localized at the trapped carriers.

Cette thèse porte sur l'analyse d'un phénomène particulièrement important dérivant des conséquences mécaniques des transformations de phases solide-solide dans les aciers : la plasticité de transformation ou TRIP (Transformation Induced Plasticity) et son interaction avec la plasticité classique. Ce sujet est abordé à la fois par des investigations expérimentales et par une approche de modélisation numérique, pour les transformations martensitiques. / This thesis concerned with the analysis of a particularly important phenomenon which corresponds to one of the mechanical consequences of solid-solid phase transformations in steels: the transformation plasticity or TRIP (TRansformation Induced Plasticity) and its interaction with classical plasticity. This subject is addressed from the point of view of experimental investigations as well as with a nuimerical modelling approach, concerning martensitic transformations.

Le suivi d’objets et la prédiction de mouvement sont des aspects importants pour les véhicules autonomes. Tout d'abord, nous avons développé une méthode de suivi mono-objet en utilisant le compressive tracking, afin de corriger le suivi à base de flux optique et d’arriver ainsi à un compromis entre performance et vitesse de traitement. Compte tenu de l'efficacité de l'extraction de caractéristiques comprimées (compressive features), nous avons appliqué cette méthode de suivi au cas multi-objets pour améliorer les performances sans trop ralentir la vitesse de traitement. Deuxièmement, nous avons amélioré la méthode de suivi mono-objet basée sur DCF en utilisant des caractéristiques provenant d’un CNN multicouches, une analyse de fiabilité spatiale (via un masque d'objet) ainsi qu’une stratégie conditionnelle de mise à jour de modèle. Ensuite, nous avons appliqué la méthode améliorée au cas du suivi multi-objets. Les VGGNet-19 et DCFNet pré-entraînés sont testés respectivement en tant qu’extracteurs de caractéristiques. Le modèle discriminant réalisé par DCF est pris en compte dans l’étape d'association des données. Troisièmement, deux modèles LSTM (seq2seq et seq2dense) pour la prédiction de mouvement des véhicules et piétons dans le système de référence de la caméra sont proposés. En se basant sur des données visuelles et un nuage de points 3D (LiDAR), un système de suivi multi-objets basé sur un filtre de Kalman avec un détecteur 3D sont utilisés pour générer les trajectoires des objets à tester. Les modèles proposées et le modèle de régression polynomiale, considéré comme méthode de référence, sont comparés et évalués. / Object tracking and motion prediction are important for autonomous vehicles and can be applied in many other fields. First, we design a single object tracker using compressive tracking to correct the optical flow tracking in order to achieve a balance between performance and processing speed. Considering the efficiency of compressive feature extraction, we apply this tracker to multi-object tracking to improve the performance without slowing down too much speed. Second, we improve the DCF based single object tracker by introducing multi-layer CNN features, spatial reliability analysis (through a foreground mask) and conditionally model updating strategy. Then, we apply the DCF based CNN tracker to multi-object tracking. The pre-trained VGGNet-19 and DCFNet are tested as feature extractors respectively. The discriminative model achieved by DCF is considered for data association. Third, two proposed LSTM models (seq2seq and seq2dense) for motion prediction of vehicles and pedestrians in the camera coordinate are proposed. Based on visual data and 3D points cloud (LiDAR), a Kalman filter based multi-object tracking system with a 3D detector are used to generate the object trajectories for testing. The proposed models, and polynomial regression model, considered as baseline, are compared for evaluation.

Cette étude apporte des données sur l'intérêt des chromites de lanthane strontium dopés au ruthénium La1-xSrxCr1-yRuyO3δ (LSCrRu) comme anode de pile à combustible ITSOFC. La synthèse sous champ micro-onde d'oxydes mixtes a permis la mise en forme de demi-cellules et cellules complètes modèles par pulvérisation cathodique magnétron et par sérigraphie. Les propriétés de reformage de CH4 ont pu être étudiées dans un dispositif mono-chambre couplé à un spectromètre de masse en collaboration avec l'Institut de REcherche Hydro-Québec. La réactivité à l'interface anode/électrolyte a été analysée par SIMS et XRD sur demi-cellules modèles vieillies sous H2 à 800°C. Elle a permis de préciser la chimie du film après traitement. Les cellules complètes, testées en condition de fonctionnement, ont mis en évidence, après dissolution sélective de LSCrRu, une modification de la microstructure à l'interface anode/électrolyte. Des analyses XPS et SEM-EDX n'ont pas montré de réactivité chimique.

Les Rejets Urbains par Temps de Pluie (RUTP) contiennent des polluants sous forme soluble ou particulaires, issus du lessivage des bassins-versants qu'ils drainent. Ces rejets sont le plus souvent déversés dans les milieux récepteurs, en particulier les cours d'eau péri-urbains, sans traitement préalable. Il en résulte, dans certaines configurations, un risque de toxicité pour les écosystèmes des milieux concernés. Cette thèse propose deux démarches méthodologiques pour évaluer les risques écotoxicologiques (EDREcotox) liés à un tel scénario: une démarche a priori et une démarche a posteriori. La démarche a priori a été développée selon 3 approches complémentaires de caractérisation des effets écotoxicologiques: i) une «approche substances», ii) une «approche substances avec effets combinés» et iii) une «approche matrice». Cette démarche a priori a été par la suite appliquée à un scénario d'une ville française et à un scénario d'une ville haïtienne. Pour une optimisation de la méthodologie proposée dans le cadre de la démarche a priori, nous avons procédé, dans un premier temps, à une étude de l'écotoxicité et des effets combinés des principaux polluants généralement présents dans les RUTP, vis-à-vis de Daphnia magna puis de Pseudokirchneriella subcapitata. En ce qui concerne l'«approche matrice», nous avons procédé à une caractérisation écotoxicologique d'échantillons de RUTP provenant des 2 sites étudiés. La démarche a posteriori a été développée sur la base d'une comparaison entre un «état amont» et un «état aval», par rapport au point de déversement des RUTP dans la rivière du site français, pour 3 horizons (eau de surface, zone benthique et zone hyporhéique). L'application de ces 2 démarches méthodologiques a conduit à des résultats cohérents qui mettent en évidence un risque important pour les organismes du cours d'eau récepteur, avec une accentuation de ce risque pour les organismes des zones benthique et hyporhéique. Au titre des perspectives, la poursuite du développement de ces premières méthodologies pourra prendre en compte certains aspects additionnels comme la biodisponibilité des polluants, leur bioaccumulation, etc.