O estudo de 135 acessos de batata-doce (Ipomoea batatas L. Lam), do Banco de Germoplasma da Embrapa-CNPH, constituída com materiais oriundos de todas as regiões brasileiras, materiais do CIP-Peru e materiais dos Estados Unidos, Japão e Peru, com marcadores microssatélites e descritores morfoagronômicos, permitiu obter informações sobre a diversidade genética e a distribuição desta diversidade dentro e entre regiões geográficas. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a diversidade genética destes 135 acessos de batata-doce, a partir de oito locos de microssatélites, de 21 descritores morfológicos, que totalizaram 124 caracteres diferentes entre parte aérea e raiz tuberosa, e de caracteres agronômicos através da porcentagem de matéria seca, porcentagem de umidade e produtividade por planta. Podemos ressaltar que mesmo com o elevado número de acessos (135) e o elevado número de caracteres morfológicos (97) para a parte aérea avaliados neste trabalho, houve a expressão de 77% e dos (69) caracteres morfológicos da raiz, houve a expressão de 80% desses caracteres. A ausência de 23% e 20% dos caracteres avaliados para parte aérea e raiz, respectivamente, pode ser decorrente da sua não ocorrência no material avaliado, e em parte pela dificuldade de identificá-los na planta, por ser subjetivo ou qualitativo, uma vez que o resultado varia com o avaliador, principalmente para as características relacionadas à cor e forma. O grau de similaridade morfológica foi de 0,13 a 0,83, e o grau de similaridade molecular foi de 0,23 a 1,0 obtidos pelo coeficiente de Jaccard (J). Conclui-se que os materiais da Coleção do Banco de Germoplasma do CIP-Peru e dos demais países (Estados Unidos, Japão e Peru) não são geneticamente distintos dos materiais do Brasil, ou seja, não foram agrupados separadamente. Existe alta variabilidade entre os materiais estudados, que se verifica pelo coeficiente de similaridade de Jaccard para ambos os dados moleculares e morfológicos. Para ambos os marcadores, morfológicos e moleculares, a maior parte da variação ocorre dentro das regiões. / The study of 135 accessions of sweet potato (Ipomoea batatas L. Lam), from the Germplasm Bank of Embrapa-CNPH, constituted by materials from all Brazilian regions, from CIP-Peru and from the United States, Japan and Peru, with microsatellite markers and morphoagronomic descriptors, provided information about the genetic diversity and distribution of this diversity within and among geographic regions. The objective of this study was to characterize the genetic diversity of 135 accessions of sweet potato with eight microsatellite loci, 21 morphological descriptors, which totaled 124 different characters among the aerial vegetative and tuberous roots traits, and agronomic characters such as the dry matter percentage, moisture percentage and plant yield. We emphasize that even with the high number of accessions (135) and the large number of morphological characters (97) among to aerial vegetative traits assessed in this study, 77% of these traits were expressed and of the tuberous roots (69) morphological traits, 80% of these were expressed. The absence of 23% and 20% of the characters evaluated for aerial vegetative and tuberous roots traits, respectively, may be due to their non-occurrence in the material evaluated, and in part by the difficulty of their identification in the plants, considering that due to the fact of being subjective or qualitative, the results vary with the evaluator, especially for the characteristics related to color and shape. The degree of morphological similarity varied from 0.13 to 0.83, and the degree of molecular similarity varied from 0.23 to 1.0, both obtained by the Jaccards coefficient. It is concluded that the materials from the Germplasm Bank of CIP-Peru and other countries (United States, Japan and Peru) are not genetically distinct from the materials from Brazil, or were not grouped separately. There is high variability among the studied materials, verified by the Jaccards similarity coefficient for both molecular and morphological data. Also, for both markers, morphological and molecular, most of the variation occurs within regions.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-02-27Bitstream added on 2014-06-13T19:23:54Z : No. of bitstreams: 1 luz_fjf_dr_jabo.pdf: 696825 bytes, checksum: e6fae364aaea139b88622f336be9f094 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) / Com o objetivo de ampliar o conhecimento sobre uma coleção de pimentas da Embrapa Roraima, foram realizadas caracterizações morfológica com descritores do IPGRI e molecular com marcadores fAFLP, de 58 acessos de Capsicum chinense. Os resultados da avaliação morfológica detectaram que, 39% dos acessos não se agruparam e entre os mesmos observou-se uma dissimilaridade de até 70%, com 50% de média. A caracterização molecular revelou uma dissimilaridade média de 22,3% entre os acessos levando à conclusão de que há uma pequena variabilidade genética entre os acessos, considerando o genoma como um todo. Os resultados demonstraram que as diferenças morfológicas estariam baseadas apenas em uma parte do genoma das pimentas, focada em características visíveis e mensuráveis pelo ser humano. Por outro lado, a variação observada a partir do DNA genômico por meio do marcador molecular utilizado não foi suficiente para ratificar as diferenças morfológicas observadas. Ambas as formas de caracterizar os acessos foram úteis e necessárias para o conhecimento dos mesmos, revelando informações valiosas para estratégias de conservação e uso das pimentas da Amazônia. / In order to raise the knowledge about a pepper collection from Embrapa Roraima, IPGRI morphological descriptors and fAFLP molecular marker were used to characterize 58 acessions of Capsicum chinense, contributing with information about the diversity of those plants. The results of morphological evaluation showed that 39% of the accessions did not group together and it also detected a great dissimilarity among the accessions, reaching values above 70%, with a 50% medium. The molecular characterization showed an average dissimilarity of 22,3%, indicating little genetic variability on the collection evaluated, considering the total genome of the plants. These results demonstrate that variation detected by morphological descriptors would be related to only a small part of pepper genome, focusing on human visible and measurable traits. The variation observed directly on the genome by the molecular marker used was not sufficient to confirm the morphological differences observed among the accessions. Both ways of characterizing the accessions were useful and necessary to their knowledge, revealing valuable information for conservation strategies and the use of amazon peppers.

Resumo: Com o objetivo de ampliar o conhecimento sobre uma coleção de pimentas da Embrapa Roraima, foram realizadas caracterizações morfológica com descritores do IPGRI e molecular com marcadores fAFLP, de 58 acessos de Capsicum chinense. Os resultados da avaliação morfológica detectaram que, 39% dos acessos não se agruparam e entre os mesmos observou-se uma dissimilaridade de até 70%, com 50% de média. A caracterização molecular revelou uma dissimilaridade média de 22,3% entre os acessos levando à conclusão de que há uma pequena variabilidade genética entre os acessos, considerando o genoma como um todo. Os resultados demonstraram que as diferenças morfológicas estariam baseadas apenas em uma parte do genoma das pimentas, focada em características visíveis e mensuráveis pelo ser humano. Por outro lado, a variação observada a partir do DNA genômico por meio do marcador molecular utilizado não foi suficiente para ratificar as diferenças morfológicas observadas. Ambas as formas de caracterizar os acessos foram úteis e necessárias para o conhecimento dos mesmos, revelando informações valiosas para estratégias de conservação e uso das pimentas da Amazônia. / Abstract: In order to raise the knowledge about a pepper collection from Embrapa Roraima, IPGRI morphological descriptors and fAFLP molecular marker were used to characterize 58 acessions of Capsicum chinense, contributing with information about the diversity of those plants. The results of morphological evaluation showed that 39% of the accessions did not group together and it also detected a great dissimilarity among the accessions, reaching values above 70%, with a 50% medium. The molecular characterization showed an average dissimilarity of 22,3%, indicating little genetic variability on the collection evaluated, considering the total genome of the plants. These results demonstrate that variation detected by morphological descriptors would be related to only a small part of pepper genome, focusing on human visible and measurable traits. The variation observed directly on the genome by the molecular marker used was not sufficient to confirm the morphological differences observed among the accessions. Both ways of characterizing the accessions were useful and necessary to their knowledge, revealing valuable information for conservation strategies and the use of amazon peppers. / Orientador: Leila Trevizan Braz / Coorientador: Eliana Gertrudes de Macedo Lemos / Banca: Maria Helena de Souza Goldman / Banca: Arlete Marchi Tavares de Melo / Banca: João Carlos de Oliveira / Banca: Lúcia Maria Carareto Alves / Doutor

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Among the most representative families of the world flora, the Legumonosae (Fabaceae) is one of most expressive her the capacity in fixing nitrogen in the soil and its releasing for the agroecosystems, presence in many agricultural systems, aggressive characteristic of seed dispersion, and by the considerable forage potential. The present work aimed to characterize accessions of the native legume Jureminha, collected in different ecological- geographic regions of Sergipe state, using morphological reproductive descriptors. Two-hundred and twelve accessions of Desmanthus were cultivated the Embrapa Tabuleiros Costeiros Experimental Station in Nossa Senhora das Dores, SE. The experiment was carried out in a completely randomized block design with 2 replications and 3 representative plants per plot, spaced by 2x2 m from each other. The characters of fertilization percentage (Ft), flowering after pruning (Flo), pods per flower (Vi), pod length (CpV), pod width (LgV), seeds per pod (SV), locus per pod (LoV), weight of 100 seeds (PS) were evaluated. Analysis of variance was processed by the GENES statistical program (Cruz, 2001), estimating for each characteristic the average genetic inheritance (h2 m), the experimental variation (CVe%) and genetic (CVg%) coefficients, and the correlation between such coefficients. Grouping multivariate techniques by the method of Tocher Optimization and Hierarchic Closest Neighbor and the Plane Distance Projections, utilizing the Mahalanobis generalized distance as the dissimilarity measurements were also applied. Significant genetic variability for the characters VI. PS, CpV, and LoV were found between the studied accessions, indicating a genetic potential to be used in breeding programs. Largest genetic inheritance were found for the CpV and LoV characters with respectively 59.59% and 50.61%. Such characters also showed the highest degree of correspondence between the genetic value and phenotypic value with respectively 0.72 % and 0,859 %. The SV and LoV characters had the greatest contribution for the divergence with respectively 37.20% and 14.39% of the variation. Seven divergent groups were formed. There was concluded that there are not a large genetic divergence among the accessions considering the majority of the accessions composed the first group and two groups were composed by four accessions and three groups were composed by two accessions each one, and one group by only one accessions. / Entre as famílias mais representativas da flora no mundo, a Leguminosae (Fabaceae) é uma das mais expressivas, pela fixação de nitrogênio no solo e seu repasse ao agroecossistema, presença em vários sistemas agrícolas, pela sua agressividade na dispersão de sementes, além de possuir relevante potencial forrageiro. Nesse sentido, este trabalho objetivou caracterizar através de descritores morfológicos reprodutivos acessos de jureminha, leguminosa nativa, coletadas em várias regiões ecogeográficas do Estado de Sergipe. Foram implantados 212 acessos no Campo Experimental em Nossa Senhora das Dores, SE, pertencente a Embrapa Tabuleiros Costeiros. O delineamento utilizado foi de blocos ao acaso com duas repetições e três plantas úteis por parcela, separadas entre si e entre linha por 2 m, além de uma linha de bordadura externa em cada bloco. Os caracteres avaliados foram percentual de fertilização (Ft), florescimento após o corte (Flo), número de vagens por inflorescência (VI), comprimento de vagem (CpV), largura de vagem (LgV), número de sementes por vagem (SV), número de locos por vagem (LoV) e peso de 100 sementes (PS). A análise de variância foi realizada utilizando o programa GENES, Cruz (2001), o qual estimou para cada característica, a herdabilidade média (h2 m), os coeficientes de variação experimental (CVe%) e genético (CVg%) e a relação entre esses coeficientes. Foram realizadas também, técnicas multivariadas de agrupamento pelo método de Otimização de Tocher e Hieráquico do Vizinho Mais Próximo e a Projeção das Distâncias no Plano, utilizando-se a distancia generalizada de Mahalanobis (D²) como medida de dissimilaridade. Existe variabilidade genética significativa entre os acessos avaliados, para os caracteres VI, PS, CpV e LoV, indicando como um potencial genético a ser explorado em programas de melhoramento. Sendo os caracteres CpV e LoV os que apresentaram maiores herdabilidades, 59,59% e 50,61%, e os maiores graus de correspondência entre o valor genético e o valor fenotípico 0,72% e 0,86%, respectivamente. Já os caracteres que mais contribuíram para a divergência foram SV com 37,20% da variação, seguido por LoV com 14,39%. No entanto, houve formação de sete grupos divergentes, concluindo-se que a divergência genética entre os acessos não é grande, pois o primeiro grupo formado englobou a maioria dos acessos, dois grupos foram formados por quatro acessos, três grupos com dois acessos e um grupo com apenas um acesso.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-20T14:07:53Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lamartine Nogueira Gonzaga - 2017.pdf: 2017508 bytes, checksum: 1af67174911634205aaa1738758578cd (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-20T14:08:10Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lamartine Nogueira Gonzaga - 2017.pdf: 2017508 bytes, checksum: 1af67174911634205aaa1738758578cd (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-20T14:08:10Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lamartine Nogueira Gonzaga - 2017.pdf: 2017508 bytes, checksum: 1af67174911634205aaa1738758578cd (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-22 / Hymenaea stigonocarpa is classified as a priority for research and sustainable exploitation, with potential for fruit production. There is a phenotypic variation in the species that allows the distinction of three botanical varieties based on leaf characters. The present study aimed to characterize and evaluate the magnitude and distribution of the genetic variability of a germplasm collection of the species. The experimental material consisted of 336 accessions of 120 maternal families, from 24 subpopulations sampled in the Brazilian Cerrado. Plant height, stem diameter, number of branches and number of leaves were measured. Later, they were measured the morpho-agronomic variables: leaf length, leaf width, petiole length, petile diameter, leaf angle, leaflets angle and chlorophyll index. Growth dynamics and analysis of variance were performed to estimate genetic and statistical parameters and selection gain, for growth traits. Data from 113 progenies were used to estimate phenotypic and genetic correlation coefficients. It was also determined the relative importance of the variables for genetic divergence. The dynamics of growth were different in different periods, which is attributed to the formation of the root system in the initial phase of growth. The effects of progeny and subpopulation explain considerably part of the total variation, being significant between and, predominantly, not significant within subpopulations for the growth variables. The morpho-agronomic traits showed significant variation within subpopulations. The cluster analysis showed the formation of two distinct groups which corroborates a population study previously carried out with molecular markers. There is significant variation between subpopulations for growth trais, with possibility of selection for these variables. Based on morphological agronomic variables, the genetic variability is structured among subpopulations. Plants with high growth rates in height have a high growth rate of stem diameter. The variables petiole length (CP), petiole diameter (DP) and final stem diameter (DF) were the most determinant in the discrimination of accessions. / O jatobá-do-cerrado é uma espécie nativa do Cerrado, classificada como prioritária para a pesquisa e exploração sustentada em médio prazo, para produção de frutos. Há variação fenotípica na espécie que permite a distinção de três variedades por caracteres das folhas. O presente estudo teve como objetivo caracterizar e avaliar a magnitude e distribuição da variabilidade genética de uma coleção de germoplasma da espécie. O material experimental foi constituído por 336 acessos de 120 progênies maternas, de 24 subpopulações amostradas no Cerrado. Foram realizadas leituras das variáveis de crescimento: altura da planta, diâmetro do caule, número de ramificações e número de folhas. Posteriormente foram mensuradas as variáveis morfoagronômicas: comprimento do entrenó, comprimento do folíolo, largura do folíolo, comprimento do pecíolo, diâmetro do pecíolo, ângulo da folha, ângulo dos folíolos e índice de clorofila. Foi avaliada a dinâmica do crescimento e estimados componentes de variância para obtenção de parâmetros genéticos, estatísticos e ganho de seleção para os caracteres do crescimento. Dados de 113 progênies foram utilizados na estimativa de coeficientes de correlação. Foi determinada, ainda, a importância relativa das variáveis para a divergência genética. A dinâmica do crescimento foi diferente em períodos distintos, o que é atribuído à formação do sistema radicular na fase inicial de crescimento. Os efeitos de progênie e subpopulação explicam consideravelmente parte da variação total captada, sendo significativa entre e, predominantemente, não significativa dentro de subpopulações para as variáveis do crescimento. Com os caracteres morfoagronômicos houve significativa variação dentro de subpopulações. A análise de divergência por agrupamento mostrou a formação de dois grupos distintos o que corrobora estudo populacional realizado anteriormente com marcadores moleculares. Existe variação significativa entre subpopulações para os caracteres de crescimento, com possibilidade de seleção para estas variáveis. Há, com base em variáveis morfoagronômicas, estruturação da variabilidade genética entre subpopulações. Plantas com elevadas taxas de crescimento em altura apresentam elevada taxa de crescimento do diâmetro do caule. As variáveis avaliadas comprimento do pecíolo (CP), diâmetro do pecíolo (DP) e diâmetro final do caule (DF) foram as mais determinantes na discriminação dos acessos.

O estudo de 135 acessos de batata-doce (Ipomoea batatas L. Lam), do Banco de Germoplasma da Embrapa-CNPH, constituída com materiais oriundos de todas as regiões brasileiras, materiais do CIP-Peru e materiais dos Estados Unidos, Japão e Peru, com marcadores microssatélites e descritores morfoagronômicos, permitiu obter informações sobre a diversidade genética e a distribuição desta diversidade dentro e entre regiões geográficas. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a diversidade genética destes 135 acessos de batata-doce, a partir de oito locos de microssatélites, de 21 descritores morfológicos, que totalizaram 124 caracteres diferentes entre parte aérea e raiz tuberosa, e de caracteres agronômicos através da porcentagem de matéria seca, porcentagem de umidade e produtividade por planta. Podemos ressaltar que mesmo com o elevado número de acessos (135) e o elevado número de caracteres morfológicos (97) para a parte aérea avaliados neste trabalho, houve a expressão de 77% e dos (69) caracteres morfológicos da raiz, houve a expressão de 80% desses caracteres. A ausência de 23% e 20% dos caracteres avaliados para parte aérea e raiz, respectivamente, pode ser decorrente da sua não ocorrência no material avaliado, e em parte pela dificuldade de identificá-los na planta, por ser subjetivo ou qualitativo, uma vez que o resultado varia com o avaliador, principalmente para as características relacionadas à cor e forma. O grau de similaridade morfológica foi de 0,13 a 0,83, e o grau de similaridade molecular foi de 0,23 a 1,0 obtidos pelo coeficiente de Jaccard (J). Conclui-se que os materiais da Coleção do Banco de Germoplasma do CIP-Peru e dos demais países (Estados Unidos, Japão e Peru) não são geneticamente distintos dos materiais do Brasil, ou seja, não foram agrupados separadamente. Existe alta variabilidade entre os materiais estudados, que se verifica pelo coeficiente de similaridade de Jaccard para ambos os dados moleculares e morfológicos. Para ambos os marcadores, morfológicos e moleculares, a maior parte da variação ocorre dentro das regiões. / The study of 135 accessions of sweet potato (Ipomoea batatas L. Lam), from the Germplasm Bank of Embrapa-CNPH, constituted by materials from all Brazilian regions, from CIP-Peru and from the United States, Japan and Peru, with microsatellite markers and morphoagronomic descriptors, provided information about the genetic diversity and distribution of this diversity within and among geographic regions. The objective of this study was to characterize the genetic diversity of 135 accessions of sweet potato with eight microsatellite loci, 21 morphological descriptors, which totaled 124 different characters among the aerial vegetative and tuberous roots traits, and agronomic characters such as the dry matter percentage, moisture percentage and plant yield. We emphasize that even with the high number of accessions (135) and the large number of morphological characters (97) among to aerial vegetative traits assessed in this study, 77% of these traits were expressed and of the tuberous roots (69) morphological traits, 80% of these were expressed. The absence of 23% and 20% of the characters evaluated for aerial vegetative and tuberous roots traits, respectively, may be due to their non-occurrence in the material evaluated, and in part by the difficulty of their identification in the plants, considering that due to the fact of being subjective or qualitative, the results vary with the evaluator, especially for the characteristics related to color and shape. The degree of morphological similarity varied from 0.13 to 0.83, and the degree of molecular similarity varied from 0.23 to 1.0, both obtained by the Jaccards coefficient. It is concluded that the materials from the Germplasm Bank of CIP-Peru and other countries (United States, Japan and Peru) are not genetically distinct from the materials from Brazil, or were not grouped separately. There is high variability among the studied materials, verified by the Jaccards similarity coefficient for both molecular and morphological data. Also, for both markers, morphological and molecular, most of the variation occurs within regions.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2017-03-13T14:15:35Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) TESE HENRIQUE PADILHA!.pdf: 2745123 bytes, checksum: 6c3cc4bc0855288de567f8b22b28debe (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-03-17T21:15:43Z (GMT) No. of bitstreams: 2 TESE HENRIQUE PADILHA!.pdf: 2745123 bytes, checksum: 6c3cc4bc0855288de567f8b22b28debe (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T21:15:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE HENRIQUE PADILHA!.pdf: 2745123 bytes, checksum: 6c3cc4bc0855288de567f8b22b28debe (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-21 / O consumo de pimentas (Capsicum, Solanaceae) vem aumentando progressivamente, devido à diversidade, multiplicidade dos usos e propriedades funcionais dos seus frutos. Um dos problemas que limita a produtividade de pimentas é a antracnose, doença fúngica recorrente na região sul do Brasil, que resulta em prejuízos ao produtor e ao consumidor. Frente a esse problema, a ampla diversidade genética encontrada nas pimentas representa uma importante fonte para novas alternativas. O objetivo geral deste trabalho foi contribuir para a caracterização de recursos genéticos de pimentas do gênero Capsicum. A tese está apresentada na forma de três capítulos, cujos objetivos foram caracterizar morfologicamente acessos de pimentas do Banco Ativo de Germoplasma de Capsicum da Embrapa Clima Temperado, avaliar a divergência genética e estimar a entropia dos caracteres avaliados; avaliar a reação de acessos de pimentas à antracnose e identificar possíveis fontes de resistência; e realizar a avaliação metabolômica de acessos de pimentas contrastantes para resposta à antracnose. No primeiro capítulo, foram caracterizados 21 acessos de pimentas (C. baccatum e C. chinense) com o uso de 47 descritores morfológicos. Foi verificada ampla diversidade genética para os caracteres avaliados. Os descritores posição da flor, posição do estigma, cor de fruto maduro, pungência e comprimento de planta apresentaram elevada entropia. No segundo capítulo, os mesmos acessos foram avaliados quanto à resposta à antracnose. Os frutos foram colhidos e inoculados em duas fases de maturação. Foi possível diferenciá-los a partir da inoculação com um isolado do fungo Colletotrichum acutatum. Os acessos avaliados não apresentaram resistência total à antracnose. Foi observada variação para resposta à antracnose. A resistência de pimentas à antracnose se expressa de forma diferente de acordo com a fase de maturação do fruto. Dentre os acessos avaliados, P27 apresentou maior resistência à doença e P175 maior suscetibilidade. No terceiro capítulo, foi realizada a avaliação metabôlomica dos frutos dos acessos contrastantes para a resistência à antracnose. Para as análises foram utilizadas técnicas de cromatografia líquida, gasosa e espectrometria de massas. A concentração de metabólitos especializados em frutos de pimentas varia conforme a fase de maturação. A concentração de capsaicinoides e capsinoides dos frutos não influencia a resistência à antracnose. A produção dos compostos butano-2,3-diol, L-threitol, D-frutose e α-D-glucopyranoside nos frutos foi alterada pela incidência da antracnose. O estudo da relação dos compostos dos frutos de pimenta em resposta ao ataque do patógeno gera informações sobre o processo de resistência e suscetibilidade, assim como desperta novos estudos que busquem elucidar a compressão da interação planta-patógeno e uso de recursos genéticos para obtenção de genótipos resistentes. / The consumption of peppers (Capsicum, Solanaceae) increases progressively, due to diversity, multiplicity of usage and the functional properties of the fruits. One of the problems that limit the peppers produtivity is anthracnose, a recurrent fungal disease in South of Brazil, results in losses to producers and consumers. Facing this problem, the wide genetic diversity found in peppers represents an important source of new alternatives. The general objective of this work was to contribute to the characterization of genetic resources of Capsicum peppers. The thesis is presented in form of three chapters, whose objectives were to perform morphological characterization of peppers accessions from the Capsicum Genebank of Embrapa Temperate Agriculture, to evaluate the genetic divergence and estimate the entropy of descriptors; we performed the evaluation of peppers accessions reaction to anthracnose, as well as to identify possible new sources of resistance; and to perform the metabolomic evaluation of contrasting peppers accessions to anthracnose response. In the first chapter, 21 accessions of peppers (C. baccatum and C. chinense) were characterized using 47 morphological descriptors. A wide genetic diversity was verified for the evaluated characters. The descriptors flower positon, stigma position, ripe fruit color, pungence and plant length presented high entropy. In the second chapter, the same accessions were evaluated for anthracnose response. It was possible to differentiate them through inoculation of Colletotrichum acutatum isolate. The fruits were detached and inoculated in two maturation stage. Accessions did not present complete resistance to anthracnose. Great genetic diversity was observed to anthracnose response. Anthracnose resistance of peppers was expressed differently according to fruit maturation stage. Among evaluated accessions, P27 presented greater resistance to the disease and P175 more susceptibility. In the third chapter, metabomic evaluation of contrasting accessions for anthracnose resistance was performed. Liquid chromatography, gas chromatography and mass spectrometry were used for analyzes. Different metabolomic responses were observed for pepper accessions. The concentration of specialized metabolites in peppers fruits varies according to maturation stage. Capsaicinoids and capsinoids content in fruits did not influence resistance to anthracnose. The production of butane-2,3-diol, L-threitol, D-fructose and α-Dglucopyranoside in fruits was affected by anthracnose. The study of relationship of pepper fruit compounds in response to pathogen's attack, generates information about resistance and susceptibility process, as well as instigates new studies that aim to understand the plant-pathogen interaction and the usage of genetic resources to obtain resistant genotypes.

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV14MA152.pdf: 774187 bytes, checksum: 6209a89bbee8c01daff8bf25bc60aa35 (MD5) Previous issue date: 2014-07-14 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Be considering an alternative production potential and economic value due to incipient knowledge of genetic variation in cultivated populations, it is necessary to launch a study to the genetic improvement of the species, so that the knowledge of the variability may enable the selection of productive populations and adapted to local growing conditions. In this sense, the work was divided into two chapters, where the objectives were: i) to evaluate the genetic variation in populations of physalis about the growth of reproductive structures measured over time; ii) evaluate the genetic variability within and among populations of physalis for selecting promising populations. The experiment was conducted at the State University of Santa Catarina (UDESC) on the experimental field of the Institute of Molecular Genetics and Breeding (IMEGEM). Populations originate from different regions, being Fraiburgo, Caçador, Vacaria, Lages, Colômbia and Peru. The field experiment was conducted in a randomized block design with two replications. The characters were the number of buds, number of flowers, number of fruits, fruit weight, mass capsule, thousand seed mass, diameter of fruits and fruit polar diameter. Data were analyzed considering information relating to the data with repeated measures in time to the first chapter and considering information regarding the error between and within populations in the second chapter. The different behavior regarding reproductive growth among populations suggests that assessments should be carried out over time. Unable to select populations for early emergence in the reproductive structures. The population of Fraiburgo showed higher emergence of fruit. There is variability among populations of physalis (p<0.05) for the characters of fruits evaluated. There is no variation in the experimental unit. It is recommended the hybridization of population Vacaria with populations Caçador, Lages and Peru, to obtain segregating populations of Physalis / Considerando ser uma alternativa de produção com potencial valor econômico e devido ao conhecimento incipiente da variação genética nas populações cultivadas, é necessário iniciar um estudo para o melhoramento genético da espécie, de forma que o conhecimento da variabilidade poderá possibilitar a seleção de populações produtivas e adaptadas às condições locais de cultivo. Nesse sentido, o trabalho foi dividido em dois capítulos, onde os objetivos foram: i) avaliar a variação genética em populações de physalis quanto ao crescimento de estruturas reprodutivas medidas ao longo do tempo; ii) caracterizar a variabilidade genética em populações de physalis e selecionar genitores para utilização em programas de melhoramento genético. O experimento foi realizado na Universidade do Estado de Santa Catarina (UDESC), no campo experimental do Instituto de Melhoramento e Genética Molecular (IMEGEM). As populações são originárias de diferentes regiões, sendo Fraiburgo, Caçador, Vacaria, Lages, Colômbia e Peru. O experimento foi conduzido a campo, em delineamento de blocos casualizados, com duas repetições. Os caracteres avaliados foram número de botões florais, número de flores, número de frutos, massa de frutos, massa de cápsula, massa de mil sementes, diâmetro equatorial de frutos e diâmetro polar de frutos. Os dados foram analisados considerando informações referentes a dados com medidas repetidas no tempo para o primeiro capítulo e considerando informações referentes ao erro entre e dentro para a seleção de populações no segundo capítulo. O comportamento diferenciado quanto ao crescimento reprodutivo entre as populações sugere que as avaliações devem ser realizadas ao longo do tempo. Não foi possível selecionar populações quanto a precocidade na emergência das estruturas reprodutivas. A população de Fraiburgo apresentou maior emergência de frutos no último período de avaliação. Existe variabilidade entre as populações de physalis no Planalto Serrano Catarinense (p<0,05), para os caracteres de frutos. Não existe variação dentro da unidade experimental. Recomenda-se o cruzamento da população de Vacaria com as populações de Caçador, de Lages e do Peru, para a obtenção de populações segregantes de Physalis

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-05-17T14:59:07Z No. of bitstreams: 1 Stevens Brandao de Miranda.pdf: 553197 bytes, checksum: bd5cdbbe7ee482b2fcc3c767d18c8883 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-17T14:59:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Stevens Brandao de Miranda.pdf: 553197 bytes, checksum: bd5cdbbe7ee482b2fcc3c767d18c8883 (MD5) Previous issue date: 2013-08-02 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The potential use of native herbaceous legumes from the Northeast of Brazil as forage are large, among them the genus Stylosanthes spp. is highlighted for its adaptability to the semiarid conditions and for its high nutritive value. This research aimed to identify morphological differences among genotypes and to estimate genetic parameters, also identify characteristics correlated with high production of dry matter with the degree of reliability in the genotypic discrimination above 80% in plants of the Stylosanthes spp. genus. Two trials were made, the first one was developed in the Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE), in the experimental field from the Academic Unit of Serra Talhada (UAST). Were used morphological descriptors to help in the identification of the differences among thirteen accessions of Stylosanthes spp. from the germplasm bank from UAST, these were collected in different areas from the semiarid. In the analyses of main components, was verified that plant size (PS), width of the central petiole (WCP), length of spitule attached to the petiole (LEAP), petiole length (PL) were the descriptors that showed more importance in the eigenvectors. The second trial was developed in a greenhouse in the central campus of UFRPE, were used eight accessions of Stylosanthes scabra Vog. collected in the city of Bom Jardim-PE, also was used morphological descriptors, the data were submitted to the analyses of variance, genetics parameters, Pearson’s correlation and repeatability coefficient. Were observed significant difference (P< 0.05) among the accessions for all characters evaluated, except for the plant height (PH). The characteristics showed values for heritability from 62.78 to 97.70, and for repeatability 0.19 to 0.57. The descriptors: growth habit (GH), flowering (FLO), length of spitule attached to the petiole, branching (BCH), stem diameter (SD), number of leaves (NL), demonstrated positive correlation with dry matter production. Were observed genetic differences among the accessions of the Stylosanthes spp. when in field conditions, expressing the existence of the variability among them. To identify the accessions with better dry matter production at greenhouse conditions, the descriptors: growth habit, length of spitule attached to the petiole, stem diameter, number of leaves, length of central petiole, length of lateral foliole (LLF), hairiness of leaf (HL) and petiole length, were effective, requiring no more than five evaluations to predict its real value (R²=0.80). / O potencial forrageiro das leguminosas herbáceas nativas do Nordeste do Brasil é elevado, entre elas destaca-se o gênero Stylosanthes, por sua adaptabilidade às condições semiáridas e por seu elevado valor nutritivo. Este trabalho objetivou identificar divergências morfológicas entre genótipos de Stylosanthes e estimar parâmetros genéticos, bem como identificar caracteres correlacionados com maior produção de matéria seca, com grau de confiabilidade na discriminação genotípica acima de 80%, em plantas do gênero Stylosanthes. Foram realizados dois experimentos. O primeiro foi conduzido na Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE), na área experimental da Unidade Acadêmica de Serra Talhada (UAST). Foram utilizados descritores morfológicos para auxiliar na identificação da divergência morfológica entre 13 acessos de Stylosanthes spp. do banco de germoplasma da UAST, oriundos de coletas realizadas em diferentes municípios do semiárido. Na análise de componentes principais, verificou-se que, das variáveis avaliadas, o porte da planta (PT), largura do folíolo central (CFL), comprimento da estípula soldada ao pecíolo (CESP) e o comprimento do pecíolo (CP), foram os descritores que apresentaram maior peso nos autovetores. No segundo experimento, realizado em casa de vegetação na (UFRPE), foram utilizados oito acessos de Stylosanthes scabra Vog. coletados no município de Bom Jardim – PE, também foram utilizados descritores morfológicos, os dados foram submetidos à análise de variância, parâmetros genéticos, correlação de Pearson e coeficiente de repetibilidade. Observou-se que, com exceção do descritor altura (ALT), houve diferença significativa (P< 0,05) entre os acessos, para todos os caracteres estudados. Os caracteres apresentaram herdabilidade entre 0,62 e 0,97 e repetibilidade 0,19 a 0,57. Os descritores hábito de crescimento (HB), florescimento (FLOR), comprimento da estípula na parte soldada ao pecíolo (CESP), ramificações (RM), diâmetro do caule (DC) e número de folhas (NF), apresentaram correlação positiva significativa com a produção de matéria seca. Observou-se divergência genética entre os acessos de Stylosanthes spp em condições de campo, o que mostra a existência de variabilidade entre os acessos. Para identificar os acessos com maior produção de matéria seca, dentre os acessos avaliados em casa de vegetação, os descritores hábito de crescimento (HB), comprimento da estípula na parte soldada ao pecíolo (CESP), diâmetro do caule (DC), número de folhas (NF), comprimento do folíolo central (CFC), comprimento do folíolo lateral (CFL), pilosidade da folha (PLF) e comprimento do pecíolo (CP), foram eficazes, necessitando de, no máximo, cinco avaliações para predizer seu valor real (R²=0,80).

Submitted by Katiane Souza (katyane.souza@gmail.com) on 2016-06-05T13:21:28Z No. of bitstreams: 1 arquivogeral.pdf: 2116290 bytes, checksum: 06e1c61195711fc54f91cf9dd76556c0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-05T13:21:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivogeral.pdf: 2116290 bytes, checksum: 06e1c61195711fc54f91cf9dd76556c0 (MD5) Previous issue date: 2015-09-03 / Capsicum genus presents wide genetic variability and the most used way to determine this variability is through morphological descriptors, essential to obtain information on available diversity, making it possible to better use in breeding programs. Knowledge of this diversity is critical for breeding program of the species one wants to improve, which could be, in the case of pepper plant, cultivar development that are intended for fruit production, for fresh consumption, industries: food of condiments, canned and dyes; pharmaceutical; cosmetics; for use as a rootstock, or more recently as ornamental plant. So the first chapter of this doctoral thesis aimed to characterize and evaluate genetic divergence and heritability of morphoagronomic characteristics in thirteen populations of ornamental pepper plant, being eight populations F3: F21 (P-1), F24 (P-2), F25 (P-3), F27 (P-4), F29 (P-5), F210 (P-6), F211 (P-7) and F231 (P-8), of crossing between the accesses 134 (P-9) and 77.2 (P10), and five additional witnesses: accesses 134 (P9), 77.2 (P10), 10.1 (P11), 10.2 (P-12), and 10.3 (P-13). The P-9 access presents small size, green leaves, white flowers, and cream to red small fruits. The P-10 access is composed of high-sized plants with vein-like leaves, purple flowers and small fruits and lilac to red fruits. P-11, P-12, and P-13 accesses show plants with very similar size characteristics, large and showy fruits, only differing in the color of ripe fruit P-11 (yellow), P-12 (red), and P-13 (orange). The work was conducted in a greenhouse. Fifty plants of each F3 population and ten of each additional witnesses were distributed in a completely randomized experimental design with two factors: Population and Years. Sixteen morphological descriptors were evaluated, being six of plant and ten of fruit. Variance analysis was performed with the data of the five witnesses and used residual mean squared error to conduct the means comparison test. Genotypes were grouped according to Scott-Knott criteria (p ≤ 0.05). The interaction was significant for all traits, except for the height of the first fork and number of seeds per fruit. The heritability ranged from 91.18% (stem diameter) to 99.97% (greater fruit diameter), for the first year of evaluation, and 85.75% (dry matter content) to 99.65% (higher fruit diameter), for the second year. The relation between genetic variation coefficient and environmental variation coefficient presented values higher than 1 for all traits, except for stem diameter, fruit length / diameter ratio and dry matter content. P3 population was the one with the lowest average for plant height and canopy diameter, thus, being the most recommended for selection of ornamental size. In the second chapter, the objective was to evaluate the genetic divergence between thirteen populations of ornamental pepper plants, using multivariate techniques and determine which morphological characteristics contributed more for genetic divergence. Genetic divergence between populations of ornamental pepper plants was determined by clustering analysis and canonical variables. Multivariate analysis revealed that there is interaction between the studied factors (p <0.01). There was agreement between the multivariate techniques used. Fruit characteristics were those that most contributed for genetic divergence, separating the populations P11, P12 and P13 from other populations. These results were repeated in the two years of evaluation. The third chapter aimed to characterize and estimate genetic divergence within pre-established groups of populations F3 of ornamental pepper plants. Eight F3 populations were evaluated in a completely randomized design with two factors (Populations and Years). Quantitative and qualitative descriptors were used. Dissimilarity matrices were estimated between genotypes within the populations, using Gower dissimilarity coefficient. Ggenotypic divergence explained by dissimilarity matrices were analyzed via non-metric multidimensional scaling (nMDS). Internal consistency presented by populations P4, P6, P7, P5, and P8, indicates that the genotypes of these populations present capability for use in future ornamental pepper plant breeding programs. On the other hand, populations P1, P2, and P3 presented the highest visual dispersion, allowing selection, aiming advancement of future generations. / O gênero Capsicum apresenta ampla variabilidade genética e a maneira mais utilizada de determinar essa variabilidade é através dos descritores morfológicos, essenciais para se obter informações sobre a diversidade disponível, possibilitando sua melhor utilização em programas de melhoramento. O conhecimento dessa diversidade é fundamental para o programa de melhoramento genético da espécie que se deseja melhorar, a qual poderá ser, no caso de pimenteiras, o desenvolvimento de cultivares que se destinem a produção de frutos, para consumo in natura, indústrias: alimentícias de condimentos, conservas e corantes; farmacêutica; cosmética; para serem utilizadas como porta-enxerto ou, mais recentemente, como planta ornamental. Assim, o primeiro capítulo desta tese de doutoramento, teve como objetivo caracterizar e avaliar a divergência genética e a herdabilidade das características morfoagronômicas em treze populações de pimenteiras ornamentais, sendo oito populações F3: F21 (P-1), F24 (P-2), F25 (P-3), F27 (P-4), F29 (P-5), F210 (P-6), F211 (P-7) e F231 (P-8), originárias do cruzamento entre os acessos 134 (P-9) e 77.2 (P10), e cinco testemunhas adicionais os acessos 134 (P9), 77.2 (P10), 10.1 (P11), 10.2 (P-12) e 10.3 (P-13). O acesso P-9 apresenta porte baixo, folhas verdes, flores brancas frutos pequenos de coloração creme para vermelho. O acesso P-10 são plantas de porte alto com folhas jaspeadas, flores lilás e frutos pequenos e coloração de lilás para vermelho. Já os acessos P-11, P-12 e P-13 plantas com características de porte muito similares, frutos grandes e vistosos diferindo apenas na coloração do fruto maduro P-11(amarelo), P-12 (vermelho) e P-13 (laranja). O trabalho foi conduzido em casa de vegetação. Cinquenta plantas de cada população F3 e dez de cada testemunha adicional foram distribuídas em delineamento experimental inteiramente casualizado com dois fatores: Populações e Anos. Foram avaliados 16 descritores morfológicos, sendo seis referentes a planta e dez ao fruto. A análise de variância foi realizada com os dados das cinco testemunhas e utilizou-se o quadrado médio do resíduo para se realizar o teste de comparação de médias. Os genótipos foram agrupados de acordo com os critérios de Scott-Knott (P≤0,05). A interação foi significativa para todas as características, exceto para a altura da primeira bifurcação e número de sementes por fruto. A herdabilidade variou de 91,18% (diâmetro do caule) a 99,97% (maior diâmetro do fruto), para o primeiro ano de avaliação, e 85,75% (teor de matéria seca) a 99,65% (maior diâmetro do fruto), para o segundo ano. A relação entre o coeficiente de variação genética e o coeficiente de variação ambiental apresentou valores superiores a 1 para todas as características, com exceção para diâmetro do caule, relação comprimento /diâmetro do fruto e teor de matéria seca. A população P3 foi a que apresentou as menores médias para a altura da planta e diâmetro da copa, sendo consequentemente a mais recomendada para seleção dentro visando porte ornamental. No segundo capítulo, o objetivo foi avaliar a divergência genética entre treze populações de pimenteiras ornamentais, usando técnicas multivariadas, e determinar quais as características morfológicas que contribuíram mais para a divergência genética. A divergência genética entre as populações de pimenteiras ornamentais foi determinada por análise de agrupamento e de variáveis canônicas. A análise multivariada revelou que existe interação entre os fatores estudados (p < 0,01). Observou-se concordância entre as técnicas multivariadas utilizadas. As características de fruto foram as que mais contribuíram para a divergência genética, separando as populações P11, P12 e P13 das demais populações. Esses resultados se repetiram nos dois anos de avaliação. O terceiro capítulo, teve como objetivos caracterizar e estimar a divergência genética dentro de grupos pré-estabelecidos de populações F3 de pimenteiras ornamentais. Oito populações F3 foram avaliadas, em delineamento inteiramente casualizado, com dois fatores (Populações e Anos). Foram utilizados descritores quantitativos e qualitativos. Foram estimadas matrizes de dissimilaridade entre genótipos dentro das populações utilizando o coeficiente de dissimilaridade de Gower. A divergência genotípica, explicada pelas matrizes de dissimilaridade, foram analisadas via escalonamento multidimensional não-métrico (nMDS). A uniformidade interna apresentada pelas populações P4, P6, P7, P5 e P8, é indicativo de que os genótipos destas populações apresentam aptidão para serem utilizados em futuros programas de melhoramento de pimenteiras ornamentais. Por outro lado, as populações P1, P2 e P3 apresentaram a maior dispersão visual, possibilitando seleção, visando avanço de gerações futuras.