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A System for Determining the Statistical Significance of the Frequency of Short DNA Motif Matches in a Genome - An Analytical Approach

Pfeiffer, Philip Edward 16 May 2011 (has links)
No description available.
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Building Representative Sets Of RNA 3D Structures and Selecting High Quality Loops

Sweeney, Blake Alexander 01 December 2016 (has links)
No description available.
213

Multiple Uses of Frequent Episodes in Temporal Process Modeling

Patnaik, Debprakash 19 August 2011 (has links)
This dissertation investigates algorithmic techniques for temporal process discovery in many domains. Many different formalisms have been proposed for modeling temporal processes such as motifs, dynamic Bayesian networks and partial orders, but the direct inference of such models from data has been computationally intensive or even intractable. In this work, we propose the mining of frequent episodes as a bridge to inferring more formal models of temporal processes. This enables us to combine the advantages of frequent episode mining, which conducts level wise search over constrained spaces, with the formal basis of process representations, such as probabilistic graphical models and partial orders. We also investigate the mining of frequent episodes in infinite data streams which further expands their applicability into many modern data mining contexts. To demonstrate the usefulness of our methods, we apply them in different problem contexts such as: sensor networks in data centers, multi-neuronal spike train analysis in neuroscience, and electronic medical records in medical informatics. / Ph. D.
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Retourner la bêche : les fonctions de l'autobiographie dans l'œuvre de Stanley Cavell

D'Amours, Benoît 07 July 2021 (has links)
Mon objectif ici sera de montrer que Cavell fait de l'autobiographie un exercice d'investigation philosophique. Afin d'atteindre ce but, j'emprunte une approche chronologique. Analysant une par une ses publications les plus importantes, je démontre que l'autobiographie remplit cinq fonctions distinctes dans son œuvre à savoir, une fonction descriptive, une fonction anthropologique, une fonction révisionniste, une fonction morale et une fonction perfectionniste. Ensuite, j'analyse le rapport entre le perfectionnisme moral et le récit autobiographie de Cavell intitulé Si j'avais su. Ma thèse trouve son originalité dans le fait que les commentateurs accordent généralement une faible attention au rôle de l'autobiographie dans l'œuvre de ce penseur. D'ailleurs, ce n'est que tardivement que celui-ci indique que l'autobiographie a toujours joué un rôle important dans ses écrits. Mon intention était donc de relire l'œuvre de Cavell afin de mettre en évidence l'importance de l'autobiographie dans sa pensée.
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L'importance des funérailles dans la pièce Antigone de la Grèce antique à nos jours

Yosefi Soran, Elnaz 18 December 2023 (has links)
Titre de l'écran-titre (visionné le 6 décembre 2023) / Cette étude propose l'analyse de la représentation de l'interdiction de l'inhumation par ordre de pouvoirs autoritaires et, plus précisément, dans la pièce d'Antigone de Sophocle et les adaptations d'Anouilh et de Brecht, et dans le roman de Dorfman. À l'aide des réflexions issues des théories de Hegel, de Freud et d'Agamben, l'objectif est de montrer les similitudes et les transformations de l'intrigue initiale et d'interroger comment le personnage d'Antigone est réapproprié et devenu pluriel par les événements historico-politiques dans les adaptations modernes. De manière plus générale, ce mémoire s'intéresse à l'interdiction des funérailles par les États et met en lumière les perspectives philosophiques et psychologiques liées à la rébellion d'Antigone dans quatre textes littéraires ayant le même thème dans un contexte social différent. Notre recherche est divisée en trois chapitres. La première porte sur le concept de théâtre politique et par une analyse de la pièce Antigone et de la situation politique de la Grèce antique, au travers d'une critique de la théorie d'Hegel sur Antigone. Le deuxième s'intéresse à la réévaluation de la Seconde Guerre mondiale basée sur le concept de traumatisme et sa théorisation par Freud, en vue d'une analyse des deux pièces Antigone d'Anouilh et de Brecht et de leurs opinions différentes sur l'adaptation de la pièce Antigone dans le contexte de la guerre. Le troisième se penche sur les diverses adaptations d'Antigone à notre époque en fonction de la situation politique spécifique de cette époque. Et à la fin, il y a une analyse du roman Les Veuves de Dorfman, selon la théorie philosophique et politique d'Agamben sur les crises résultant de gouvernements totalitaires. Comment le théâtre et la littérature peuvent-ils être les porte-parole des moments critiques d'une société et comment un texte ancien peut-il être entendu par l'adaptation de telle sorte qu'il parle de nos vies ? / This study proposes the analysis of the representation of the prohibition of burial going by the totalitarian powers to the theater and the literature, more precisely in the play of Antigone by Sophocles and the adaptations of Anouilh, Brecht and Dorfman. Using reflections from the philosophical theories of Hegel, Freud and Agamben and theories of adaptation, the objective is to demonstrate the similarities and transformations of this play and to question how the character of Antigone is reproduced and made plural by historical and political events in literary adaptations. More generally, this thesis focuses on the prohibition of funerals by the states and highlights the philosophical-psychological perspectives linked to the rebellion of Antigone in four literary texts having the same theme in a context of different social. The thesis consists of research divided into three chapters. The first deals with the concept of political theater and it is an analysis of the play Antigone and the political situation in ancient Greece, and it is a critique of Hegel's theory of Antigone. The second deals with the description of the Second World War based on the concept of trauma and Freud's theory on this subject, and it is an analysis of the two plays Antigone by Anouilh and Brecht and their differing opinions on the adaptation of the play Antigone in Atmosphere War. The third looks at the various adaptations of Antigone to our time depending on the specific political situation of that time. And at the end, there is an analysis of Dorfman's novel The Widows according to Agamben's philosophical-political theory of the resulting crises of our time in totalitarian governments. How can theater and literature be the mouthpieces of a society's critical moments and how can an ancient text be audited through adaptation in such a way that it speaks to our lives?
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Rouge ; : suivi de L'aurore de la parole / Aurore de la parole

Leblanc, Jean-François 17 April 2018 (has links)
ROUGE libère de l'hermétisme la poésie d'un homme se découvrant une nouvelle identité au sein de sa propre douleur amoureuse. Originaire du traumatisme de la rupture, une voix poétique s'y déploie peu à peu, cherchant d'un lyrisme ténu à accepter l'inéluctable et embrasser la vie devant la mort. Transcendé par la déchéance et la folie, le poète revient vivre sur les terres du drame pour ériger le mémorial du reflet de la femme aimée dépouillant à jamais son existence du regret. Or, pour que la poésie puisse tracer un chemin vers la réalité du monde, l'être doit accepter de se révéler dans l'essence même de sa vérité. L'AURORE DE LA PAROLE vient donc réfléchir les instances fatidiques que sont devenues l'hermétisme du symbole et l'objectivité littéraire afin que la poéticité de l'image et la puissance de l'analogie puissent surgir au cœur de l'être comme une aurore affirmant l'irrémédiable nécessité d'aimer.
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La quête d'universel dans le roman québécois des années 1950 : les cas de La fin des songes, d'Alexandre Chenevert et de La Patience des justes

Garneau, Émilie 24 April 2018 (has links)
Datant du XIXe siècle et popularisé aux lendemains de la crise de 1929, le discours social sur l'universel occupe une place importante au sein de la production littéraire des années 1950 et semble être suggéré de façon récurrente par les romanciers comme remède aux maux humains de leurs personnages. Partant du constat du caractère aliénant du mode de vie associé à la modernité, il prône un retour à des valeurs proprement humaines, détachées de toute forme d'individualisme et de matérialisme. Or, très peu de chercheurs s'y sont, jusqu'à maintenant, intéressés. Ce mémoire tentera donc de rendre compte de ce discours pourtant omniprésent dans les romans de l'après-guerre, mais écarté de la plupart des recherches déjà effectuées. Il démontrera, par le fait même, que le roman n'est pas uniquement une voie d'expression du discours social sur l'universel, mais qu'il suggère également une sorte de condition à son avènement, soit la mort d'un personnage, comme si seule la perte d'un proche, dans toute sa violence, était indispensable à la prise de conscience des autres personnages et à la réconciliation qui peuvent seules rendre l'universel possible. Pour explorer cette hypothèse, cette recherche se fondera sur l'étude de trois romans, soit La fin des songes de Robert Élie (1950), Alexandre Chenevert de Gabrielle Roy (1954) et La Patience des justes de Pierre de Grandpré (1966). Ces trois œuvres, par des schémas narratifs bien différents, abordent tous l'universel comme unique solution aux maux humains de leurs personnages. Or, bien qu'elles laissent présager que cette promesse de salut est à portée de main, elles démontrent également que la route qui y mène est ardue.
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Moby Dick ou la recherche de l'absolu : une quête métaphysique à la poursuite de la mort

Sainson, Camille 18 July 2022 (has links)
Ce mémoire étudie la façon dont Herman Melville élève la baleine blanche au rang d'une Idée platonicienne, faisant d'elle la métaphore de la mort. Sous le prisme du Phédon de Platon et de La mort de Jankélévitch, nous analysons le roman comme une allégorie, longue réflexion sur le rôle de la littérature et de la mémoire pour parvenir à transcender la mort. Si Achab est condamné dès le début à errer sur l'océan dans une quête métaphysique à la recherche de la Vérité, c'est finalement Ishmael qui, en devenant narrateur, parvient à survire au désastre. Unique rescapé, c'est parce qu'il a côtoyé la mort de près qu'il peut la faire entrer dans le récit et ainsi raconter l'inénarrable.
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The Role of Alternaria and its Major Allergen, Alt a 1, in the Pathogenesis of Allergic Airway Disorders

Rumore, Amanda Joan 30 April 2012 (has links)
Chronic exposure to the ubiqutious airborne fungus, Alternaria alternata, has long been implicated in the development and exacerbation of human allergy and asthma. Alt a 1 was identified previously by several groups as the major allergen secreted by A. alternata, due to its IgE-specific reactivity with sera from atopic patients. Despite the well-documented clinical importance of Alternaria and its major allergen, little knowledge exists regarding their role and interaction with the innate immune system. Here for the first time we characterize the innate immune response to A.alternata and verify the significance of Alt a 1 in contributing to this response in human airway cells and murine models. Our studies establish a baseline response for both a chronic and single-challenge murine inhalation model with Alternaria spores. Both models demonstrate live conidia induce a robust response, arguably more pathologically relevant compared to studies employing Alternaria extracts. We also elucidate the overall importance of Alt a 1 by utilizing recombinant Alt a 1 protein, A. alternata (Δalt a 1) deletion mutants, and an A.alternata (Alt a 1+) overexpression mutant. Both Alt a 1 protein and A. alternata conidia stimulated production of pro-inflammatory cytokines/chemokines in mice after a single intranasal challenge. Infiltration of effector cells (macrophages, neutrophils, eosinophils, and lymphocytes) into the lungs along with other hallmarks of airway inflammation was observed. In addition, Alt a 1 protein and conidia evoked secretion of pro-inflammatory cytokines in treated human airway epithelial cells while the Alt a 1+ overxpression mutant induced a significantly higher response. In contrast, spores of Δalt a 1 caused an attenuated response in both human cells and murine lungs suggesting that this single protein may play a major role in inducing the innate immune response in airway epithelium at the organismal level. Finally, we identified key biochemical properties of the Alt a 1 protein including a single histidine required for esterase activity and a unique RXLR-like motif which controls Alt a 1's ability to bind external lipids and enter human airway cells. Overall, these results improve our understanding of how Alternaria induces innate immunity and identifies possible therapeutic targets within allergenic proteins. / Ph. D.
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La dramaturgie du silence de Samuel Beckett et son héritage dans l’écriture dramaturgique de Nathalie Sarraute, Marguerite Duras et Franz Xaver Kroetz

Durivage, Isabelle 25 February 2021 (has links)
Ce mémoire s’intéresse au silence dans le théâtre postdramatique, et ce, à partir de la dramaturgie de Samuel Beckett, que nous nommerons « dramaturgie du silence ». Notre recherche vise à analyser les manières avec lesquelles Beckett a donné naissance à une nouvelle forme dramaturgique en mettant à profit les formes d’un héritage dans le théâtre postdramatique, au travers des œuvres de certains auteurs tels que Nathalie Sarraute, Marguerite Duras et Franz Xaver Kroetz. Pour ce faire, nous analyserons deux pièces de théâtre beckettiennes, soit En attendant Godot et Fin de partie. Nous relèverons alors les stratégies et les effets du silence qui est privilégié pour ensuite chercher des pistes de réponses à nos questions de recherche au travers de certaines œuvres de nos trois autres auteurs précédemment identifiés. Les hypothèses issues de cette phase de travail ont alors été analysées et comparées, afin que l’héritage beckettien en ressorte. Le présent mémoire retrace donc ce processus et met en évidence les stratégies de cette dramaturgie du silence, dans l’intention de démontrer que Samuel Beckett est le précurseur d’un renouvellement dramaturgique basé sur le silence.

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