Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-22T16:07:26Z No. of bitstreams: 1 Natalya Monique Ribeiro Barbosa.pdf: 540479 bytes, checksum: b3638a01426e2f087c88f8f1d9ef73d3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-22T16:07:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Natalya Monique Ribeiro Barbosa.pdf: 540479 bytes, checksum: b3638a01426e2f087c88f8f1d9ef73d3 (MD5) Previous issue date: 2013-02-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Considering Meloidogyne incognita and M. javanica importance for sugarcane and reports of M. enterolobii in the crop in Northeastern Brazil, this study had as objective identifying through biochemical methods the species of Meloidogyne occurring in sugarcane fields of Pernambuco and Paraíba States and evaluating reproduction of this three species in association or individually on the variety RB 867515. It was identified 19 nematode populations, mostly constituted exclusively by M. incognita phenotype I1(Rm: 1.0) and I2 (Rm: 1.0, 1.1). Meloidogyne incognita, M. javanica and M. enterolobii, in association or individually, did not affect plant growth variables. RB 867515 was a good host for M. incognita and M. javanica, but not for M. enterolobii, permitting free reproductions for the former nematodes. Esterease phenotypes at the end of the experiment presented quantitative variations in the species ratios used for inoculation, indicating M. incognita prevalence over the other species. The second study evaluated Meloidogyne enterolobii penetration, development and life cycle length on sugarcane variety RB 98710 as well the reaction of the variety to the nematode parasitism. After soil infestation with M. enterolobii and M. javanica (control), roots were evaluated at 3, 7, 10, 17, 24, 31, 38 and 45 days after inoculation for nematode development. At 45 days, M. javanica complete the life cycle in contrast to the low number of vermiform and swollen juveniles and no adult female of M. enterolobii found in roots. Using different nematode initial population densities, M. enterolobii did not affect initial sugarcane development at 120 days after inoculation. In contrast to M. javanica, M. enterolobii reproduction was inhibited presenting reproductive factor always lower than 1. / Considerando a importância de Meloidogyne incognita e M. javanica em cana-de-açúcar e o assinalamento de M. enterolobii em canaviais do Nordeste, o primeiro estudo teve como objetivo identificar por métodos bioquímicos espécies de Meloidogyne ocorrentes em canaviais nos Estados de Pernambuco e Paraíba e avaliar a reprodução das três espécies, isoladamente e conjuntas, na variedade RB 867515. Foram identificadas 19 populações do nematoide, através da eletroforese de isoenzimas, a maioria constituída exclusivamente por M. incognita fenótipo I1(Rm: 1.0) e I2 (Rm: 1.0, 1.1). Meloidogyne incognita, M. javanica e M. enterolobii, isoladamente ou em população conjunta, não afetaram as variáveis de crescimento da planta avaliadas. RB 867515 mostrou-se boa hospedeira para M. incognita e M. javanica, mas não para M. enterolobii, permitindo que as duas primeiras espécies se multiplicassem livremente. Os fenótipos de esterase obtidos após a realização do experimento mostraram variações quantitativas nas proporções das espécies inoculadas, indicando prevalência de M. incognita sobre as demais. O segundo estudo avaliou a penetração, o desenvolvimento e o comprimento do ciclo de Meloidogyne enterolobii em cana-de-açúcar variedade RB 98710 e o comportamento dessa variedade em relação ao parasitismo do nematoide. Após a infestação do solo com M. enterolobii e M. javanica (testemunha), raízes foram avaliadas aos 3, 7, 10, 17, 24, 31, 38 e 45 dias após inoculação dos nematoides. Aos 45 dias, M. javanica conseguiu completar o ciclo, enquanto o número de formas vermiformes, salsichóides e ovoides de M. enterolobii foram reduzidos, não sendo encontradas fêmeas imaturas ou com massas de ovos. Utilizando diferentes densidades de inóculo, M. enterolobii não afetou o desenvolvimento inicial da cana-de-açúcar aos 120 dias após a inoculação. Ao contrário de M. javanica, M. enterololobii teve a reprodução inibida, apresentando sempre fatores de reprodução menores do que 1.

Made available in DSpace on 2017-07-10T17:36:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_Diss_Rafael_Augusto_Swarowsky.pdf: 1265471 bytes, checksum: b7b6c650055a2ba1f2346656fda7a03d (MD5) Previous issue date: 2014-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Considering the importance of the tomato crop and the high costs of the control of Meloidogyne incognita with resistant cultivar or nematicides, grows the search of new alternatives to control the root-knot disease. The homeopathy may be an alternative way of control, by inducing resistance. This study aimed to evaluate the influence of the homeopathic drug Cina in the number of root galls, eggs and J2 present in the roots of tomato and soil, as well as the growth of tomato plants. The dynamizations used were 12, 24, 50, 100, 200, and 400CH (centesimal hahnemanian dilutions). It was also used the chemical carbofuran, 70% ethanol and water as control treatments. The assay was conducted in pots in greenhouse for the in vivo assay and in laboratory for the in vitro ones. In both assays, homeopathic treatments were diluted with distilled water to 0.1% before application. On the in vivo assay, the homeopathic drug was applied weekly by foliar spray. The first treatments were done three days before pathogen inoculation with approximately 5000 eggs and 500 J2 per pot. The evaluations were made 50 days after transplanting of the tomato seedlings and 44 days after inoculation. The Cina demonstrated effectiveness in stimulating root development, once the results of root volume were higher in homeopathic treatments than in control. Cina 100CH also favored the growth of the stalk diameter of the plants. However, the homeopathic product showed no nematostatic nor nematicide effect / Considerando a importância da cultura do tomateiro e os custos com variedades resistentes e com nematicidas para controle de Meloidogyne incognita, são necessárias alternativas para manejo da doença das galhas radiculares. A homeopatia pode ser uma alternativa de controle, através da indução de resistência de plantas. Este trabalho objetivou avaliar a influência do medicamento homeopático Cina quanto ao número de galhas radiculares, ovos e J2 presentes nas raízes do tomateiro e no solo, bem como variáveis de crescimento das plantas de tomate. As dinamizações usadas foram 12, 24, 50, 100, 200 e 400CH (centesimal hahnemanniana). Também foram utilizados como tratamentos para comparação o nematicida carbofurano, etanol 70% e água. O experimento foi conduzido em vasos dentro de estufa climatizada para ensaio in vivo e em laboratório para o ensaio in vitro. Em ambos os ensaios, os tratamentos homeopáticos foram diluídos em água destilada a 0,1% antes da aplicação. No ensaio in vivo o medicamento homeopático foi aplicado semanalmente por aspersão foliar. A primeira aplicação dos tratamentos foi realizada três dias antes da inoculação, com aproximadamente 5000 ovos e 500 J2 por vaso. As avaliações foram feitas 50 dias após o transplante das mudas de tomate e 44 dias após a inoculação. A Cina demonstrou eficiência em estimular o desenvolvimento radicular, pois os resultados de volume de raiz foram maiores nos tratamentos homeopáticos do que nas testemunhas. Cina a 100CH também favoreceu o crescimento do diâmetro de caule das plantas. Contudo, o medicamento homeopático não demonstrou nenhum efeito nematostático e nem nematicida

Submitted by Helena Bejio (helena.bejio@unioeste.br) on 2019-02-06T16:57:43Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Carla Rosane Kosmann.pdf: 790665 bytes, checksum: 9ba5338adc46a33d1fa873abcb4d6970 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2019-02-06T16:57:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Carla Rosane Kosmann.pdf: 790665 bytes, checksum: 9ba5338adc46a33d1fa873abcb4d6970 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The root-knot nematodes are pathogens of great economic importance for many craps, as tomato, for promoting a reduction in crop productivity. Thus, control methods are required and the use of plant extracts is gaining emphasis due their compounds with nematicide and resistance induction properties. The objective of this work was evaluate the control of Meloidogyne incognita in susceptible and resistant tomato plants treated with avocado seed extract (Persea americana Mill.) incorporated into the hydrogel. To obtain the extract, avocado seeds were cut and left in methanol for 24 h and passed through two vacuum filtering. The obtained solution was evaporated on a rotary evaporator and resuspended in distilled water containing Tween 80 (0.6%) to give concentrations of 100, 200, 400, 800 and 1.000 mg L-1 of red color (RE) and brown color (BE) extract. The control treatment was distilled water + Tween 80 (0.6%). Hatching of juvenile second stage (J2) and motility and mortality of J2 were evaluated. From the in vitro results, we selected the most efficient concentration in controlling nematode, incorporating the hydrogel and dried in an oven. Then, this material at different doses (0; 0.1; 0.25; 0.5; 0.75 and 1.0 g pit1) were added to the soil before the transplantation of the tomato. Three days after transplanting was made the inoculation with 2.067 eggs and J2 of M. incognita. Thirty days after inoculation were evaluated: relative chlorophyll content (SPAD index), total volume of root, number of galls and eggs mass, viability of the egg mass, number of eggs and J2 per root and 100 cm3 of soil. With the data obtained from this test in a greenhouse, a new experiment was carried out from the dose that provided the best control of the nematode. This was then added to extract pits containing different concentrations (0, 1.000, 2.000, 4.000, 6.000, and 8.000 mg L-1) in the hydrogel. After 30 days of inoculation with 2.184 eggs and J2 of M. incognita, there were the same described above ratings. For in vitro assays, the extracts promoted a reduction of J2 hatched, with the concentration of 1.000 mg L-1 of RE, the most effective in this reduction. The mobility and mortality of J2 were not affected by different concentrations of the extracts. In vivo, referring to the first assay, the dose of 1.0 g pit-1 controlled the nematode in susceptible plants, and therefore was chosen for use in the second assay. In this latter, the concentration of 8.000 mg L-1 was the most effective to control M. incognita. / Os nematoides das galhas são patógenos de grande importância econômica para várias culturas, como o tomateiro, por promoverem redução da produtividade. Métodos de controle com a utilização de extratos vegetais vem ganhando ênfase por apresentarem compostos nematicidas e indutores de resistência. O objetivo deste trabalho foi avaliar o controle de Meloidogyne incognita em tomateiros suscetível e resistente, tratados com extratos de sementes de abacate (Persea americana Mill.), veiculado em hidrogel. Para a obtenção do extrato, sementes de abacate foram cortadas e deixadas em metanol por 24 h, e passadas por duas filtragens à vácuo. A solução obtida foi roto-evaporada e ressuspensa em água destilada contendo Tween 80 (0,6%), obtendo-se as concentrações de 100, 200, 400, 800 e 1.000 mg L-1 dos extratos de coloração vermelha (EV) e marrom (EM). O tratamento controle foi representado por água destilada + Tween 80 (0,6%). Foram avaliadas a eclosão de juvenis de segundo estádio (J2) e a motilidade e mortalidade de J2. A partir dos resultados in vitro, selecionou-se a concentração mais eficiente no controle do nematoide, incorporando-a em hidrogel, que foi posteriormente seco em estufa. Após, diferentes doses deste material (0; 0,1; 0,25; 0,5; 0,75 e 1,0 g cova-1) foram adicionadas às covas realizadas para o transplante dos tomateiros. Três dias após o transplante ocorreu a inoculação com 2.067 ovos e J2 de M. incognita. Após 30 dias da inoculação foram avaliados: teor relativo de clorofila (índice SPAD), volume total de raiz, número de galhas e de massas de ovos, viabilidade das massas de ovos, número de ovos e J2 por sistema radicular e por 100 cm3 de solo. Com os dados obtidos deste ensaio em casa de vegetação, um novo experimento foi realizado, a partir da dose que proporcionou o melhor controle do nematoide. Esta foi então adicionada às covas contendo diferentes concentrações do extrato (0, 1.000, 2.000, 4.000, 6.000, e 8.000 mg L-1) no hidrogel. Passados 30 dias da inoculação com 2.184 ovos e J2 de M. incognita, foram realizadas as mesmas avaliações descritas anteriormente. Para os ensaios in vitro, o aumento da concentração dos extratos promoveu uma diminuição dos J2 eclodidos, sendo a concentração de 1.000 mg L-1 do EV, a mais efetiva nesta redução. Quanto à motilidade e mortalidade de J2, estas não foram afetados pelas diferentes concentrações dos extratos. In vivo, referente ao primeiro ensaio, a dose de 1,0 g cova-1 proporcionou maior redução deste fitonematoide em plantas suscetíveis, sendo, portanto, a escolhida para a incorporação nas covas dos tomateiros do segundo ensaio. Neste, a concentração de 8.000 mg L-1 foi a que proporcionou o controle mais eficaz de M. incognita.

Submitted by PATRÍCIA MEIRIELE MARINI (patriciammarini@hotmail.com) on 2018-06-28T22:29:52Z No. of bitstreams: 1 Tese final corrigida - PATRICIA MARINI.pdf: 1191208 bytes, checksum: e96c8b003a5ccafde276681e172519cb (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Pizzani null (luciana@btu.unesp.br) on 2018-07-04T14:37:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 marini_pm_me_bot.pdf: 1191208 bytes, checksum: e96c8b003a5ccafde276681e172519cb (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-04T14:37:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 marini_pm_me_bot.pdf: 1191208 bytes, checksum: e96c8b003a5ccafde276681e172519cb (MD5) Previous issue date: 2018-05-02 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Meloidogyne incognita é considerado um dos nematoides de maior importância econômica em termos mundiais. Para seu adequado manejo, uma das estratégias mais eficientes é o uso de cultivares resistentes. Portanto, estratégias para otimizar os programas de melhoramento genético são necessárias. A análise de expressão gênica tem ampliado a compreensão dos mecanismos de interação planta-nematoide e acelerado o desenvolvimento de genótipos resistentes. A cultivar de aveia branca IPR Afrodite, resistente a M. incognita, e cultivares suscetíveis foram avaliadas em relação à sua tolerância a este nematoide, além de ter sido estudado o comportamentode genes candidatos que regulam sua resistência, desafiados com densidades populacionais iniciais crescentes de M. incognita, durante o seu estabelecimento e manutenção do parasitismo. Para a avaliação da tolerância, plantas cultivadas em vasos de 3.600 cm3 foram inoculadas com 0,0625 (187,5); 0,125 (375); 0,25 (750); 0,5 (1500); 1 (3000); 2 (6000); 4 (12000); 8 (24000); 16 (48000) e 32 (96000) exemplares por cm3 de solo e avaliadas aos 67 dias após a inoculação (DAI), através da mensuração do desenvolvimento das plantas, além da multiplicação do nematoide. Os resultados mostraram que, em densidades menores, IPR Afrodite apresentou fator de reprodução próximo a 1,0, sugerindo menor expressão da resistência. Em função desses resultados, experimento semelhante foi conduzido para análise da expressão gênica dessa cultivar ao nematoide, com avaliações aos 0 (imediatamente antes da inoculação), 2 e 9 DAI. A partir de reações de RT-qPCR, verificou-se que dois genes (Lrk 14 e LOX) apresentaram regulação em resposta ao nematoide e padrões de regulação diferenciados entre as cultivares. IPR Afrodite apresentou estratégias moleculares contrastantes às observadas em URS Torena, sugerindo-se que há regulação tardia e negativa em URS Torena, enquanto que, em IPR Afrodite, Lrk14 atuou como amplificador de respostas de defesa inicial, prolongando o sinal de ameaça após a detecção inicial do patógeno. O gene que codifica LOX foi desencadeado, como resposta induzida por efetores, o que geralmente resulta em reação de hipersensibilidade, como já observado em trabalhos anteriores envolvendo tal interação. / Meloidogyne incognita is considered one of the main economic important nematodes worldwide. For its management, the use of resistant cultivars is amongst the more efficient strategy. Therefore, strategies to optimize the genetic breeding programs are necessary. The gene expression analysis has amplified the comprehension about the mechanisms involved in the plant-nematode interaction and accelerated the development of resistant genotypes. The oat cultivar IPR Afrodite, resistant to M. incognita, and cultivars suscetibles was evaluated in relation to its tolerance to this nematode and, besides, the behavior of candidate genes regulating the resistance reaction was studied, challenged with crescent initial population densities of M. incognita, during its establishment and parasitism maintenance. To tolerance evaluation, plants cropped in 3,600 cm3 -pots were inoculated with 0,0625 (187,5); 0,125 (375); 0,25 (750); 0,5 (1500); 1 (3000); 2 (6000); 4 (12000); 8 (24000); 16 (48000) e 32 (96000) exemplars.cm-3 of soil and evaluated at 67 days after inoculation (DAI), through the mensuration of the plant development and nematode multiplication. Results showed that, in lower densities, IPR Afrodite showed reproduction factor values closed to 1.0, suggesting a lower resistance expression. In face of these results, a similar experiment was conducted to gene expression analysis of this cultivar to nematode, with evaluations at 0 (immediately before inoculation), 2 and 9 DAI. From RT-qPCR reactions, we could verify that two genes (Lrk and LOX) were regulated in response to nematode and that different regulatory patterns were observed between cultivars. IPR Afrodite showed molecular strategies contrasting to those observed in URS Torena, suggesting a late and negative regulation in URS Torena, while to IPR Afrodite, Lrk14 acted as an amplifier of initial defense responses, prolonging the threat signal after the initial detection of the pathogen. The gene that codifies to LOX was unleashed, as a response induced by effectors, which usually results in a hypersensitive reaction, as observed previously.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-06-20T13:12:20Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 735483 bytes, checksum: a3a0e2545f3a747dc8561b1bcf3bd7a4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-20T13:12:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 735483 bytes, checksum: a3a0e2545f3a747dc8561b1bcf3bd7a4 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / Fundação de apoio a pesquisa do Estado do Espírito Santo / A produção de café conilon (Coffea canephora) no Brasil corresponde a 1/3 da mundial e a maioria das variedades clonais utilizadas são suscetíveis a Meloidogyne incognita (M.i.) e M. paranaensis (M.p.), comprovadamente as espécies de nematoides mais agressivas e limitantes à cafeicultura. Os trabalhos conduzidos em casa-de-vegetação e no campo tiveram como objetivo estudar a interação entre clones suscetíveis e resistentes de conilon e Meloidogyne spp. com ênfase no crescimento vegetativo, produtividade e trocas gasosas dos clones. No ensaio de casa-de-vegetação, avaliou-se a reação dos clones 12V (suscetível) e do clone C14 (resistente) a diferentes densidades de inóculo (ovos) de M. p. (0, 5000 e 50000). As trocas gasosas foram avaliadas no plantio, 120 e 400 dias após a inoculação (DAI). Aos 400 DAI, determinou-se o potencial hídrico e a matéria seca da parte aérea (MSPA) e do sistema radicular (MSSR). Experimento com a mesma estrutura foi instalado com M. i., porém com a avaliação final aos 370 DAI. O experimento de campo foi realizado no município de Sooretama-ES em solo naturalmente infestado com M. p. e foram avaliados os clones suscetíveis 1V e 12V e os resistentes 13V e C14, enxertados ou não sobre o C14. Nas safras 2013, 2014 e 2015 foram avaliados o crescimento vegetativo, a produtividade (sacas beneficiadas de 60 kg.ha-1) e as trocas gasosas. Essa estrutura e avaliações foram repetidas em área isenta de M. paranaensis. Na área infestada, no período de novembro/2010 a junho/2015 a população de J2 (J2.200cc solo-1) e ovos (ovos.10g raiz-1) de M. p. foi monitorada nos meses de junho e dezembro. Observou-se que, em condições controladas, as densidades a partir de 5000 ovos de M. i. e M. p. reduziram a MSPA e MSSR do clone 12V em mais de 50% e somente M.i interferiu negativamente no desenvolvimento do clone C14. Reduções significativas na taxa assimilatória de CO2, condutância estomática para vapor de H2O e taxa transpiratória foram observadas aos 120 e 370 DAI para M. i. e aos 400 DAI para M. p. O clone C14 não apresentou diferenças significativas para as variáveis e parâmetros estudados quando inoculado com M. p. No campo, observou-se que ambos os clones, 13V e C14, foram resistentes a M. p. e influenciaram negativamente a reprodução do nematoide. Os clones 1V e 12V foram suscetíveis a M. p., porém não apresentaram diferenças significativas na produtividade entre as áreas sadia e infestada. O clone C14, quando usado como porta-enxerto, apresentou compatibilidade com os diferentes clones de conilon, mas, não acrescentou vantagens significativas ao crescimento, produtividade e as trocas gasosas do enxerto. Em conclusão, M. paranaensis foi capaz de causar danos severos aos clones suscetíveis de C. canephora na fase vegetativa e reprodutiva, todavia o clone 14, caracterizado como resistente, apresentou excelentes características para o uso como porta-enxerto ou para cultivo em áreas infestadas, além de ser uma potencial fonte de genes de resistência a Meloidogyne. / The conilon coffee (Coffea canephora) Brazilian production corresponds to 1/3 of the worldwide, by which the main conilon clones are susceptible to Meloidogyne incognita (M. i.) and M. paranaensis (M. p.). These nematodes species have been proved the more aggressive and limiting to coffee production. The studies were carried out on greenhouse and field to evaluate the consequences of the interactions between (susceptible and resistant) conilon clones to Meloidogyne spp. with emphasis on vegetative growth, gas exchange and yield clones. By the greenhouse experiment evaluated the response of the 12V (susceptible) and C14 (resistant) clones to inoculum densities different (eggs) of M. p. (0; 5,000 and 50,000). The gas exchange was evaluated at planting, 120 and 400 days after inoculation (DAI). To 400 DAI was determined the water potential, dry matter from canopy (DMC) and root system (DMRS) of the clones. The same experiment was carried out with M. i., however the evaluation lasted 370 DAI. The field experiment was carried out on Sooretama city, Espírito Santo state, due the soil be naturally infested only with M. p. On this experiment were evaluated two susceptible clones (1V and 12V), two resistant clones (13V and C14), both grafted or not on C14 clone. During three years (2013, 2014 and 2015) were evaluated the vegetative growth, yield (bags of 60 kg.ha-1) and gas exchange. The same experiment was carried out as described above but on areas uninfested by M. p. During the November/2010 until June/2015 period, the M. p. population – J2 (J2.200cc soil-1) and eggs (ovos.10g root-1) – was monitored on June and December months on the infested area. It was observed under controlled conditions that the densities from 5,000 eggs of the both M. i. and M. p. reduced more than 50% the DMC and DMRS on 12V clone. There were significant reductions on CO2 assimilation rate, steam stomatal conductance and transpiration rate at 120 and 370 DAI to M. i. and 400 DAI to M. p. The C14 clone showed no significant differences for variables and parameters studied when inoculated with M. p. The 13V and C14 clones were resistant to M. p. on field experiment. Moreover, they negatively affected this nematode species reproduction. The 1V clone was susceptible and reduced the yield. The 12V clone was also susceptible but showed no significant differences on yield between infested and uninfested area. When the C14 clone was used as a rootstock it showed compatibility with conilon clones different but not significant advantages was observed to the vegetative growth, yield and gas exchange of the graft. In conclusion, M. paranaensis was able to cause severe damage to C. canephora susceptible clones in the vegetative and reproductive phase, however, clone 14, characterized as resistant, presented excellent characteristics for use as rootstock or for cultivation in infested areas, as well as being a potential source of Meloidogyne resistance genes.

Submitted by Guilherme Matos Martins Diniz null (guilhermedinizz@yahoo.com.br) on 2016-11-12T20:47:10Z No. of bitstreams: 1 Tese - Guilherme Matos Martins Diniz.pdf: 1713375 bytes, checksum: 4e35cf3867e761830ba22f92034a1e15 (MD5) / Rejected by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo a orientação abaixo: O arquivo submetido não contém o certificado de aprovação fornecido pela Seção de Pós-Graduação. . Corrija esta informação e realize uma nova submissão com o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2016-11-18T19:54:47Z (GMT) / Submitted by Guilherme Matos Martins Diniz null (guilhermedinizz@yahoo.com.br) on 2016-11-19T00:18:22Z No. of bitstreams: 1 TESE - Guilherme Matos Martins Diniz.pdf: 1878561 bytes, checksum: ae58a835b95bed9b80bdbc3c2fd5633a (MD5) / Approved for entry into archive by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br) on 2016-11-22T16:25:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 diniz_gmm_dr_jabo.pdf: 1878561 bytes, checksum: ae58a835b95bed9b80bdbc3c2fd5633a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-22T16:25:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 diniz_gmm_dr_jabo.pdf: 1878561 bytes, checksum: ae58a835b95bed9b80bdbc3c2fd5633a (MD5) Previous issue date: 2016-10-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os nematoides das galhas estão entre os patógenos que mais causam prejuízos em cultivos protegidos de pimentão, destacando-se as espécies Meloidogyne incognita, M. javanica e M. enterolobii. Este último já foi relatado em plantas de Capsicum spp., e vem causando problemas, pois a utilização de genótipos resistentes a outras espécies não é eficaz em seu controle. Estudos relacionados à resistência a esse patógeno, bem como a obtenção de fontes de resistência ainda são escassos, o que dificulta a adoção de programas de melhoramento genético, visando a esse fim. Sendo assim, o presente trabalho teve por objetivo estudar a herança da resistência à M. enterolobii em Capsicum frutescens. O trabalho foi desenvolvido na UNESP-FCAV, Câmpus de Jaboticabal-SP. Para o estudo da herança da resistência, foi realizado o cruzamento entre C. frutescens, resistente a M. enterolobii e uma linhagem de pimenta C24, C. chinense, suscetível a nematoide. A partir desse cruzamento, foram obtidas as gerações F1, F2, RC1 e RC2. Depois de obtidas todas as gerações necessárias para o estudo, as plantas foram inoculadas com 5.000 ovos e juvenis de segundo estádio de M. enterolobii no ato do transplantio. Após 60 dias da inoculação, realizou-se a avaliação da resistência das plantas ao nematoide, coletando-se as raízes e realizando-se os procedimentos de extração dos nematoides em laboratório. A avaliação da resistência das plantas aos nematoides foi realizada com base no fator de reprodução (FR), sendo consideradas FR ≥ 1, suscetíveis, e FR < 1, resistentes. Os dados foram avaliados pelo teste qui-quadrado e cinco metodologias de avaliação dos genes envolvidos no controle, além do teste de máxima verossimilhança para a verificação da presença de efeitos relacionados ao ambiente ou polígenes. A análise genética mostrou ausência de dominância e epistasia, indicando ação gênica somente aditiva. A dominância apresentada tendeu à suscetibilidade, indicando que a resistência é recessiva. O número de locos segregantes mostrou que apenas um gene estaria envolvido na herança da resistência à M. enterolobii. O valor de herdabilidade foi alto, evidenciando possibilidade de ganho seletivo sendo um caráter pouco afetado pelo ambiente. Todas as plantas da geração F1 foram suscetíveis, as gerações F2 e retrocruzamentos tiveram variações de sintomas do parasitismo. A hipótese de herança monogênica foi aceita, de acordo com os métodos estatísticos utilizados no estudo, até o limite de significância do qui-quadrado. O controle genético da resistência à M. enterolobii, em C. frutescens é monogênico recessivo. / Root-knot nematode are among the pathogens that cause most damage in pepper crops protected highlighting the species Meloidogyne incognita, M. javanica and M. enterolobii. The latter has been reported in plants Capsicum spp., and causes problems since the use of resistant genotypes other species is not effective as a control. Studies related to resistance to this pathogen as well as obtaining sources of resistance are still scarce, hindering the adoption of breeding programs for this purpose. Therefore, this study aimed to study the inheritance of resistance to M. enterolobii in Capsicum frutescens. The study was conducted at UNESP-FCAV in Jaboticabal-SP. To study the inheritance of resistance was the cross between C. frutescens, resistant M. enterolobii and C24 pepper strain, C. chinense, susceptible to the nematode. From this junction were obtained F1, F2, BC1 and BC2. After obtaining all generations necessary for the study, the plants were inoculated with 5.000 eggs and juveniles of second stage M. enterolobii in transplanting the act. After 60 days of inoculation was performed to evaluate the resistance of plants to nematode collecting the roots and carrying out the nematode extraction procedures in the laboratory. The evaluation of plant resistance to nematodes was performed based on the reproduction factor (RF) is considered FR ≥ 1, and RF susceptible <1 resistant. The data were analyzed by chi-square test five methods of assessing the genes involved in the control beyond the maximum likelihood test for the presence of related environmental effects or polygenes. Genetic analysis showed no dominance and epistasis indicating only additive gene action. The dominance presented tended susceptibility, indicating that resistance is recessive. The number of loci segregating showed that only one gene was involved in the inheritance of resistance to M. enterolobii. The heritability value was high showing possibility of selective gain being one character unaffected by the environment. All plants of F1 generation were susceptible, generations, F2 and backcross had variations of symptoms of parasitism. The hypothesis of monogenic inheritance was accepted, according to the statistical methods used in the study, up to the limit of significance of the chi-square. The genetic control of resistance to M. enterolobii in C. frutescens is monogenic recessive.

The nematodes from the genus Meloidogyne are the most important causal agents of plant damages considering that they have a large geographical distribution and they are difficult to be controlled. Considering that the actual information about species from the genus Meloidogyne infecting plants in agriculture areas are still short in the State of CearÃ, the present research was developed with the following objectives: identify Meloidogyne species and races which occur in the different micro-regions from the State of Cearà and identify the natural hosts for M. enterolobii in guava (Pisidium guajava) orchards. A hundred and twelve plants with gall symptoms in the roots were collected from producing areas of 29 counties including 13 micro-regions from the State of CearÃ. It was observed that 112 nematode populations collected from infected plants, 46 presented phenotype typical of M. enterolobii, 27 of M. incognita, 15 of M. javanica, five of M. arenaria and one of M. hapla. Six nematode populations presented esterase phenotype distinct from those known for the Meloidogyne species already described in Brazil. In the physiologic race determination it was found races 2 and 3 of M. incognita, and race 1 of M. arenaria and a race 2 of M. javanica. The following nematode associations found in the present paper were not yet mentioned which could demonstrate that they could be the first report in the State: M. incognita in Beta vulgaris var. cicla L., B. vulgaris L., Capsicum chinensi Jacq. and Spondia tuberosa x S. mombim; M. javanica in Sieges beckiaorientalis L., S. mombim L., Hybanthus ipecacuanha (L.) Oken. and Abelmoschus esculentus L.; M. arenaria in Impatiens walleriana L., Morinda citrifolia L. and Duranta repens L. var. aurea; and M. hapla in Rosa sp. Meloidogyne enterolobii was identified in all guava root samples collected in the orchards distributed in 13 counties from the State. Besides guava, M. enterolobii was also detected in Malpighia glabra L., Ipomoea batatas (L.) Lam, Solanummelongena L., Cactus sp., Emilia fosbergii Nicolson, Hypericum sp., Inga edulis Mart., Carica papaya L., Ocimum basilicum L., Solanum americanum Mill, S. paniculatum L., Gladiolus sp. and C. frutescens L. The present research is the first report about those plant nematode associations in the State of CearÃ. The specie M. enterolboii was present in 52% of the counties and in 77% of the micro-regions visited, while M. incognita and M. javanica were detected only in 35% and 31% of the visited counties, respectively, and in 46% of the micro-region visited. The present research will contribute to update the scientific information about the occurrence of Meloidogyne species in the main agriculture producing regions from the State of CearÃ. / Os nematoides pertencentes ao gÃnero Meloidogyne estÃo entre os maiores agentes causadores de danos em plantas, pois possuem ampla distribuiÃÃo geogrÃfica e sÃo de difÃcil controle. Considerando que as informaÃÃes atualizadas sobre as espÃcies de Meloidogyne afetando plantas em Ãreas de produÃÃo agrÃcola ainda sÃo escassas no Estado do CearÃ, conduziu-se a presente pesquisa com os seguintes objetivos: identificar espÃcies e raÃas de Meloidogyne que ocorrem nas diferentes microrregiÃes do Estado do Cearà e identificar hospedeiras de M. enterolobii em pomares de goiabeira. Cento e doze amostras de plantas infestadas foram coletadas em 29 municÃpios em Ãreas produtoras do estado pertencentes a 13 diferentes microrregiÃes. Verificou-se que das 112 populaÃÃes obtidas nas coletas, 46 apresentaram fenÃtipos tÃpicos de M. enterolobii, 27 de M. incognita, 15 de M. javanica, cinco de M. arenaria, uma de M. hapla. Seis populaÃÃes apresentaram fenÃtipos de esterase distintos daqueles conhecidos para as espÃcies de Meloidogyne jà relatadas no Brasil. Na determinaÃÃo das raÃas fisiolÃgicas, foram encontradas as raÃas 2 e 3 para M. incognita, a raÃa 1 para M. arenaria e a raÃa 2 para M. javanica. As seguintes associaÃÃes encontradas neste trabalho nÃo foram ainda mencionadas podendo ser os primeiros relatos no estado: M. incognita em acelga (Beta vulgaris var. cicla L.), beterraba (B. vulgaris L.), pimenta de cheiro (Capsicum chinensi Jacq.) e umbu-cajà (Spondia tuberosa x S. mombim); M. javanica em botÃo de ouro (Siegesbeckia orientalis L.), cajà (S. mombim L.), papaconha (Hybanthus ipecacuanha (L.) Oken.) e quiabo (Abelmoschus esculentus L.); M. arenaria em maria-sem-vergonha (Impatiens walleriana L.), noni (Morinda citrifolia L.) e pingo de ouro (Duranta repens L. var. aurea); M. hapla em roseira (Rosa sp.). A espÃcie M. enterolobii foi identificada em todas as amostras de raÃzes de goiabeira coletadas em pomares distribuÃdos em 13 municÃpios do estado. AlÃm da goiabaeira, M. enterolobii foi constatada tambÃm em acerola (Malpighia glabra L.), batata doce (Ipomoea batatas (L.) Lam), berinjela (Solanum melongena L.), cactos (Cactus sp.), falsa serralha (Emilia fosbergii Nicolson), Hypericum sp, ingà (Inga edulis Mart.), mamÃo (Carica papaya L.), manjericÃo (Ocimum basilicum L.), maria-pretinha (Solanum americanum Mill), jurubeba (S. paniculatum L.), palma (Gladiolus sp.) e pimenta tabasco (C. frutescens L.), associaÃÃes estas relatadas pela primeira vez no Estado do CearÃ. A espÃcie M. enterolboii estava presente em 52% dos municÃpios e em 77% das microrregiÃes visitadas enquanto que M. incognita e M. javanica foram constatadas em 35% e 31% dos municÃpios, respectivamente, ambas em 46% das microrregiÃes visitadas. Este estudo vem contribuir na atualizaÃÃo das informaÃÃes sobre a ocorrÃncia de espÃcies de Meloidogyne nas principais regiÃes produtoras do Estado do CearÃ.

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Orientador: Silvia Renata Siciliano Wilcken / Resumo: Meloidogyne incognita é considerado um dos nematoides de maior importância econômica em termos mundiais. Para seu adequado manejo, uma das estratégias mais eficientes é o uso de cultivares resistentes. Portanto, estratégias para otimizar os programas de melhoramento genético são necessárias. A análise de expressão gênica tem ampliado a compreensão dos mecanismos de interação planta-nematoide e acelerado o desenvolvimento de genótipos resistentes. A cultivar de aveia branca IPR Afrodite, resistente a M. incognita, e cultivares suscetíveis foram avaliadas em relação à sua tolerância a este nematoide, além de ter sido estudado o comportamentode genes candidatos que regulam sua resistência, desafiados com densidades populacionais iniciais crescentes de M. incognita, durante o seu estabelecimento e manutenção do parasitismo. Para a avaliação da tolerância, plantas cultivadas em vasos de 3.600 cm3 foram inoculadas com 0,0625 (187,5); 0,125 (375); 0,25 (750); 0,5 (1500); 1 (3000); 2 (6000); 4 (12000); 8 (24000); 16 (48000) e 32 (96000) exemplares por cm3 de solo e avaliadas aos 67 dias após a inoculação (DAI), através da mensuração do desenvolvimento das plantas, além da multiplicação do nematoide. Os resultados mostraram que, em densidades menores, IPR Afrodite apresentou fator de reprodução próximo a 1,0, sugerindo menor expressão da resistência. Em função desses resultados, experimento semelhante foi conduzido para análise da expressão gênica dessa cultivar ao nematoide, com aval... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Meloidogyne incognita is considered one of the main economic important nematodes worldwide. For its management, the use of resistant cultivars is amongst the more efficient strategy. Therefore, strategies to optimize the genetic breeding programs are necessary. The gene expression analysis has amplified the comprehension about the mechanisms involved in the plant-nematode interaction and accelerated the development of resistant genotypes. The oat cultivar IPR Afrodite, resistant to M. incognita, and cultivars suscetibles was evaluated in relation to its tolerance to this nematode and, besides, the behavior of candidate genes regulating the resistance reaction was studied, challenged with crescent initial population densities of M. incognita, during its establishment and parasitism maintenance. To tolerance evaluation, plants cropped in 3,600 cm3 -pots were inoculated with 0,0625 (187,5); 0,125 (375); 0,25 (750); 0,5 (1500); 1 (3000); 2 (6000); 4 (12000); 8 (24000); 16 (48000) e 32 (96000) exemplars.cm-3 of soil and evaluated at 67 days after inoculation (DAI), through the mensuration of the plant development and nematode multiplication. Results showed that, in lower densities, IPR Afrodite showed reproduction factor values closed to 1.0, suggesting a lower resistance expression. In face of these results, a similar experiment was conducted to gene expression analysis of this cultivar to nematode, with evaluations at 0 (immediately before inoculation), 2 and 9 DAI. From RT-qPCR... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2017-10-04T22:20:39Z No. of bitstreams: 1 Tese Soniane Costa.pdf: 5470162 bytes, checksum: c446c8cec1a4893eca8260700896103a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-04T22:20:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese Soniane Costa.pdf: 5470162 bytes, checksum: c446c8cec1a4893eca8260700896103a (MD5) Previous issue date: 2017-03-24 / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do Estado da Bahia - FAPEB / The decline of guava is a complex disease, which causes progressive galls in guava roots parasitized by Meloidogyne enterolobii. The objective of the present study is to study the genetic divergence in guava and ara?azeiros accessions by means of SNPs markers developed for Eucalyptus to serve as a subsidy for activities of genetic resources and improvement of guava, such as the broad genomic association and to estimate the number of genes involved in resistance to M. enterolobii, using F2 population of Psidium guajava and P. guineense hybrid.In the evaluation of the genetic diversity of Psidium accessions, presented in chapter I, the transferability of Eucalyptus SNPs to Psidium for application in analyzes of genetic divergence and other applications, including studies of genome association. The segregation results and broad sense heritability estimates in population F2, presented in chapter II, support dominance model controlled by two genes, with epistatic effects, and the presence of only one dominant allele conditions the resistance of the hybrid of P. guajava x P. guineense for M. enterolobii. New hybrids of P. guajava with other accessions of wild Psidium should be developed and evaluated in order to increase the sources of resistance to the pathogen, allowing effective control of the same in commercial areas of guava. Seven markers associated with resistance to Meloidogyne enterolobii in Psidium species presented in Chapter III were identified.The results also suggest the existence of different sources of resistance to the nematode, since several SNPs were identified on chromosome 3 of Eucalyptus. / O decl?nio da goiabeira ? uma doen?a complexa, que causa a podrid?o progressiva das ra?zes das goiabeiras parasitadas por Meloidogyneenterolobii. O objetivo do presente estudo ? estudar a diverg?ncia gen?tica em acessos de goiabeira e ara?azeiros por meio de marcadores SNPs (Polimorfismo de nucleot?deo ?nico) desenvolvidos para Eucalyptus, que servir?o de subs?dio as atividades de recursos gen?ticos e melhoramento da goiabeira, bem como a associa??o gen?mica ampla (GWAS), e estimar o n?mero de genes envolvidos na resist?ncia a M. enterolobii, tendo como refer?ncia a segrega??o em popula??o F2 de h?brido de Psidium guajava x P. guineense. Na avalia??o da diversidade gen?tica dos acessos de Psidium, apresentado no cap?tulo I, relata-se a transferibilidade de SNPs de Eucalyptus para Psidium, estes podem ser utilizados em an?lises de diverg?ncia gen?tica e outras aplica??es, incluindo estudos de associa??o do genoma. Os resultados de segrega??oe as estimativas de herdabilidade no sentido amplo em popula??o F2, apresentado no cap?tulo II, suportam modelo de resist?ncia dominante controlada por dois genes, com efeitos epist?ticos, sendo que, a presen?a de apenas um alelo dominante condiciona a resist?ncia do h?brido de P. guajava x P. guineensepara M.enterolobii. Novos h?bridos de P. guajava com outros acessos de Psidium silvestres devem ser desenvolvidos e avaliados de forma a aumentar as fontes de resist?ncia ao pat?geno, possibilitando efetivo controle do mesmo em ?reas comerciais de goiabeira. Foram identificados sete marcadores associados ? resist?ncia a Meloidogyne enterolobii em esp?cies de Psidium apresentado no cap?tulo III. Os resultados sugerem ainda a exist?ncia de diferentes fontes de resist?ncia ao nematoide, pois foram identificados v?rios SNPs no cromossomo 3 de Eucalyptus.