Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:45Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-04-22Bitstream added on 2014-06-13T18:59:27Z : No. of bitstreams: 1 nascimento_v_me_ilha.pdf: 462476 bytes, checksum: ae0dd510249aa914a2fba9f8c0a02f9c (MD5) / O acamamento de alguns cultivares de arroz no momento da colheita acarreta perdas significativas na produtividade, além disso, os manejos de água e nitrogênio inadequados em condições de alta tecnologia agravam mais o problema. O uso de reguladores vegetais é uma das alternativas para reduzir o acamamento, entretanto, as informações sobre o assunto são escassas. O trabalho foi desenvolvido com o objetivo de avaliar o uso de doses de etiltrinexapac (zero; 75, 150, 225 e 300 g ha-1 do i.a.) e épocas de aplicação (perfilhamento ativo, entre o perfilhamento ativo e a diferenciação floral e na diferenciação floral) no desenvolvimento e produtividade da cultura do arroz de terras altas. O experimento foi desenvolvido no município de Selvíria - MS, durante o ano agrícola de 2006/07. Concluiu-se que a aplicação de 150 g ha-1 de etil-trinexapac no momento da diferenciação floral do arroz cultivar Primavera reduz a altura de plantas, na média 0,40 m em relação às outras duas épocas, com ausência de acamamento; o etil-trinexapac promove maior número de grãos chochos, menor perfilhamento útil, reduzindo a produtividade de grãos em doses acima de 150 g ha-1, quando aplicado no estádio de diferenciação floral e, a aplicação de 75 e 150 g ha-1 de etil-trinexapac em qualquer época não interfere na produtividade de grãos. / The lodging of some rice cultivars at harvest time leads to significant yield losses and, besides this, the inadequate water and nitrogen management when high technology is used may aggravate this problem. The use of plant growth regulators is one of the alternatives for reducing the lodging; however, the information on such subject is not enough. The objective of this experiment was to evaluate the effect of ethyl-trinexapac doses (zero, 75, 150, 225 and 300 g ha-1 of the a.i.) and the application periods (at active tillering, between active tillering and floral differentiation and at floral differentiation) on the crops development and yield in non-flooded lands. The experiment was carried out in Selvíria – MS, during the agricultural year of 2006/07. The conclusion was that the application of 150 g ha-1 of ethyl-trinexapac at floral differentiation of the Primavera cultivar reduces the plants’ height, average of 0.40 m when compared to the two other application periods, and leads to lack of lodging; ethyltrinexapac leads to a higher number of dry grains and less useful tillering, reducing the grain yield when the doses are higher than 150 g ha-1 and applied at floral differentiation ; the application of 75 and 150 g ha-1 of ethyl-trinexapac at any of the stages does not influence the grain yield.

Os estresses abióticos impostos à planta no campo, tais como o estresse salino, toxidez por alumínio, frio, seca, entre outros, afetam seu crescimento, desenvolvimento e produtividade. Dentre as gramíneas cultivadas, o arroz (Oryza sativa) é uma das culturas de maior importância no Brasil, cuja oscilação na produção acarreta prejuízos consideráveis à economia brasileira. Dessa forma, o estudo das interações entre os estresses abióticos e as respostas dos vegetais frente a esses estímulos ambientais é fundamental para um conhecimento detalhado desses mecanismos. O arroz é um dos cereais mais tolerantes ao alumínio (Al), sendo um ótimo modelo para o estudo de mecanismos de tolerância. Neste trabalho, foi estudado o papel das proteínas ASR na tolerância ao Al. A expressão dos genes ASR (ABA, Stress and Ripening) é induzida por ABA, estresses e amadurecimento do fruto. Essas proteínas foram caracterizadas como chaperonas e fatores de transcrição. Os genes da família OsASR também têm o nível de transcritos aumentado em resposta ao Al, sendo OsASR1 e OsASR5 os genes com expressão mais abundante em arroz. No entanto, as regiões promotoras responsivas ao Al e os fatores de transcrição reguladores da expressão desses genes ainda não foram descritos. Assim, este trabalho tem como objetivo geral a identificação dos fatores que regulam a transcrição dos genes OsASR1 e OsASR5. Para tanto, construções contendo fragmentos dos promotores desses genes dirigindo a expressão do gene repórter GUS foram obtidas, visando ensaio de expressão transiente em protoplastos de arroz submetidos ao tratamento com Al. Os fragmentos das regiões promotoras de ambos os genes OsASR1 e OsASR5 foram todos responsivos ao Al. Também foi realizado ensaio de transativação em protoplastos de Arabidopsis thaliana para verificar a existência de auto-regulação nesses genes. Tanto ASR1 quanto ASR5 foram capazes de transativar seus próprios promotores. Além disso, foi realizada uma triagem de biblioteca de cDNAs por mono-híbrido em levedura com fragmento da região promotora de OsASR5. Com essa abordagem, foram identificados sete genes candidatos a codificadores de fatores capazes de interação DNA-proteína. / The abiotic stress that plants in the field are subjected to, such as salt, aluminum, cold, drought, among others, affect their growth, development and productivity. Among cultivated grasses, rice (Oryza sativa) is one of the most important crops in Brazil, whose oscillation in production causes considerable costs to the Brazilian economy. Thus, the study of interactions between abiotic stresses and plant responses to these environmental stimuli is essential to a detailed knowledge of these mechanisms. Rice is one of the most Al-tolerant crops, being a great model for studying Al-tolerance mechanisms. In this work, the role of ASR proteins in Al tolerance was studied. The expression of ASR (ABA, Stress and Ripening) genes is induced by ABA, stresses and fruit ripening. These proteins were characterized as chaperones and transcription factors. The OsASR genes also have increased transcript accumulation in response to Al, and OsASR1 and OsASR5 have the most abundant expression in rice. However, the Al-responsive promoter regions and the transcription factors that regulate these genes have not yet been described. Therefore, the goal of this work is to identify regulating factors of OsASR1 and OsASR5 gene transcription. For this, vectors containing promoter fragments of these genes driving the expression of the GUS gene were constructed and transient expression assays were performed in rice protoplasts subjected to Al treatment. All of the promoter fragments were Al-responsive for both OsASR1 and OsASR5 genes. Transactivation assays in Arabidopsis thaliana protoplasts were also conducted in order to verify the existence of auto-regulation in these genes. Both ASR1 and ASR5 were able to transactivate its own promoters. Furthermore, a library screening was performed by yeast one-hybrid using a promoter fragment from OsASR5. With this approach, seven candidate genes encoding transcription factors capable of DNA-protein interactions were identified.

Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2017-08-11T12:43:45Z No. of bitstreams: 1 PDF - Renata Priscila Almeida Silva.pdf: 34966612 bytes, checksum: bbc3151529e82fd3c60b18bc579ff4e3 (MD5) / Approved for entry into archive by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2017-08-29T15:45:10Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PDF - Renata Priscila Almeida Silva.pdf: 34966612 bytes, checksum: bbc3151529e82fd3c60b18bc579ff4e3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-29T15:45:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Renata Priscila Almeida Silva.pdf: 34966612 bytes, checksum: bbc3151529e82fd3c60b18bc579ff4e3 (MD5) Previous issue date: 2016-03-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Drought is an of the main constraints to food production worldwide, as well as in the cultivation of red rice, which in Brazil is currently restricted to small areas of the northeastern semiarid. The water stress affects virtually all aspects of plants growth and development, with consequent reduced productivity. In this sense, the use of cultivars resistant to water stress is required, and the plant-microbe interaction, beneficial to plant growth and promote increased tolerance to biotic and abiotic stresses. According to the above, this study aimed to evaluate the agro nomic and ecophysiological aspects of red rice plants inoculated with Gluconacetobacter diazotrophicus under water stress in vegetative stage of development. The experiment was conducted under controlled conditions, with a completely randomized design in a factorial 2x4, with two conditions of inoculation, four water restriction levels (100, 70, 50 and 30% of field capacity), a rice genotype red (405 Embrapa Meio Norte), totaling eight treatments with four replications each. Each experimental plot consisted of a drainage lysimeter, which were planted 70 seeds, which after thinning was a total of 60 plants per plot. Water stress was imposed in the vegetative stage of development between stages V3 and V5, in a period of 15 days. The evaluations were performed after 15 days of water stress, growth variables were evaluated (leaf area, biomass), ecophysiological (gas exchange and chlorophyll a fluorescence) and productive (1000-grain weight and total mass of production). It was found that there was interaction between plants and G. diazotrophicus with positive responses, where possibly the endophytic bacteria used their growth promoting mechanisms and induction of tolerance to drought, as shown by increases in biomass and shoot as well as higher rates of photosynthesis and photochemical efficiency and increases in total productivity of plants inoculated with the bacteria. The results indicate that the inoculation was beneficial plants, and that the plant inoculation with G. diazotrophicus suppressed various water stress deleterious effects. / A seca é uma das principais limitações para a produção de alimentos no mundo inteiro, assim como, no cultivo do arroz vermelho, que no Brasil, atualmente está restrito à pequenas áreas do semiárido nordestino. O déficit hídrico afeta praticamente todos os aspectos do crescimento e desenvolvimento das plantas, com consequente redução da produtividade. Neste sentido, se faz necessário o uso de cultivares resistentes ao déficit hídrico, bem como, a interação planta-microrganismos, benéficas para o crescimento das plantas e por promover aumento da tolerância à estresses bióticos e abióticos. De acordo com o exposto, este estudo teve como objetivo, avaliar os aspectos agronômicos e ecofisiológicos em plantas de arroz vermelho inoculadas com Gluconacetobacter diazotrophicus sob deficiência hídrica na fase vegetativa de desenvolvimento. O experimento foi conduzido em condições controladas, com um delineamento experimental inteiramente casualizado, em um fatorial 2x4, sendo duas condições de inoculação (I1= sementes não inoculadas e I2= sementes inoculadas), quatro níveis de restrição hídrica (100, 70, 50 e 30% da capacidade de campo), um genótipo de arroz vermelho (405 Embrapa Meio Norte), totalizando oito tratamentos com quatro repetições cada. Cada parcela constou de um lisímetro de drenagem, no qual foram semeadas 70 sementes, que após desbastes ficou um total de 60 plantas por parcela. O estresse hídrico foi imposto na fase vegetativa do desenvolvimento entre os estádios V3 e V5, em um período de 15 dias. As avaliações foram realizadas ao 15º dia do estresse, foram avaliadas variáveis de crescimento (área foliar, fitomassa), ecofisiológicos (trocas gasosas e fluorescência da clorofila a), e produtivas (massa seca de 1000 grãos e massa da produção total). Foi possível constatar que plantas e G. diazotrophicus houve interação entre as com respostas positivas, onde possivelmente a bactéria endofítica utilizou de seus mecanismos de promoção do crescimento bem como de indução à tolerância ao déficit hídrico, como pode ser observado por meio de incrementos da fitomassa e parte aérea, bem como maiores taxas de fotossíntese e eficiência fotoquímica e incrementos na produtividade total de plantas inoculadas com a bactéria. Os resultados indicam que a inoculação foi benéfica para as plantas, e que a inoculação das plantas com G. diazotrophicus suprimiu vários efeitos deletérios do estresse hídrico.

Os estresses abióticos impostos à planta no campo, tais como o estresse salino, toxidez por alumínio, frio, seca, entre outros, afetam seu crescimento, desenvolvimento e produtividade. Dentre as gramíneas cultivadas, o arroz (Oryza sativa) é uma das culturas de maior importância no Brasil, cuja oscilação na produção acarreta prejuízos consideráveis à economia brasileira. Dessa forma, o estudo das interações entre os estresses abióticos e as respostas dos vegetais frente a esses estímulos ambientais é fundamental para um conhecimento detalhado desses mecanismos. O arroz é um dos cereais mais tolerantes ao alumínio (Al), sendo um ótimo modelo para o estudo de mecanismos de tolerância. Neste trabalho, foi estudado o papel das proteínas ASR na tolerância ao Al. A expressão dos genes ASR (ABA, Stress and Ripening) é induzida por ABA, estresses e amadurecimento do fruto. Essas proteínas foram caracterizadas como chaperonas e fatores de transcrição. Os genes da família OsASR também têm o nível de transcritos aumentado em resposta ao Al, sendo OsASR1 e OsASR5 os genes com expressão mais abundante em arroz. No entanto, as regiões promotoras responsivas ao Al e os fatores de transcrição reguladores da expressão desses genes ainda não foram descritos. Assim, este trabalho tem como objetivo geral a identificação dos fatores que regulam a transcrição dos genes OsASR1 e OsASR5. Para tanto, construções contendo fragmentos dos promotores desses genes dirigindo a expressão do gene repórter GUS foram obtidas, visando ensaio de expressão transiente em protoplastos de arroz submetidos ao tratamento com Al. Os fragmentos das regiões promotoras de ambos os genes OsASR1 e OsASR5 foram todos responsivos ao Al. Também foi realizado ensaio de transativação em protoplastos de Arabidopsis thaliana para verificar a existência de auto-regulação nesses genes. Tanto ASR1 quanto ASR5 foram capazes de transativar seus próprios promotores. Além disso, foi realizada uma triagem de biblioteca de cDNAs por mono-híbrido em levedura com fragmento da região promotora de OsASR5. Com essa abordagem, foram identificados sete genes candidatos a codificadores de fatores capazes de interação DNA-proteína. / The abiotic stress that plants in the field are subjected to, such as salt, aluminum, cold, drought, among others, affect their growth, development and productivity. Among cultivated grasses, rice (Oryza sativa) is one of the most important crops in Brazil, whose oscillation in production causes considerable costs to the Brazilian economy. Thus, the study of interactions between abiotic stresses and plant responses to these environmental stimuli is essential to a detailed knowledge of these mechanisms. Rice is one of the most Al-tolerant crops, being a great model for studying Al-tolerance mechanisms. In this work, the role of ASR proteins in Al tolerance was studied. The expression of ASR (ABA, Stress and Ripening) genes is induced by ABA, stresses and fruit ripening. These proteins were characterized as chaperones and transcription factors. The OsASR genes also have increased transcript accumulation in response to Al, and OsASR1 and OsASR5 have the most abundant expression in rice. However, the Al-responsive promoter regions and the transcription factors that regulate these genes have not yet been described. Therefore, the goal of this work is to identify regulating factors of OsASR1 and OsASR5 gene transcription. For this, vectors containing promoter fragments of these genes driving the expression of the GUS gene were constructed and transient expression assays were performed in rice protoplasts subjected to Al treatment. All of the promoter fragments were Al-responsive for both OsASR1 and OsASR5 genes. Transactivation assays in Arabidopsis thaliana protoplasts were also conducted in order to verify the existence of auto-regulation in these genes. Both ASR1 and ASR5 were able to transactivate its own promoters. Furthermore, a library screening was performed by yeast one-hybrid using a promoter fragment from OsASR5. With this approach, seven candidate genes encoding transcription factors capable of DNA-protein interactions were identified.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:25:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_Viviane_Kopp_Luz.pdf: 1878214 bytes, checksum: 773673ed91b567de63552267f5779d03 (MD5) Previous issue date: 2011-07-02 / The existence of variability is essential for successful breeding. The use of mutagens can increase the mutation frequency, enabling the development of variation for traits of interest. The occurrence of low temperatures is a common stress in rice cultivation in temperate regions, therefore the tolerance to low temperatures is a desirable feature of Brazilian rice genotypes grown in the South, where low temperatures affect the germination and crop establishment causing reductions in the grain yield. This work aimed to identify mutants of rice genotypes for traits of agronomic importance and to evaluate the low temperature stress tolerance of genotypes on germination stage. In stage germination, 400 M3 families and control genotypes BRS Querência, BR IRGA 409 and Nourim Mochi, were subjected to treatments with different temperatures (13 C and 25 C) and compared for their relative performance, measured by the coleoptile, root and shoot length. To evaluate the traits of agronomic importance, M3 rice seeds were sown in the experimental field at Embrapa Clima Temperado. The experimental design was a completely randomized block with four replications. Seven traits of agronomic importance were evaluated: length of main panicle in cm, weight of main panicle in g; grain mass of the main panicle in g, length of flag leaf, in cm, width of flag leaf, in cm, plant height, in cm, and stem length, in cm. The results indicate that the ethylmethanesulfonate mutagen (EMS) was effective in generating mutants of rice for six of the traits, except for the character length of the flag leaf, which did not show increase in genetic variability. The induction of mutation was also efficient in generating genetic variability for tolerance to low temperatures at the stage of germination, but the results also indicated the occurrence of a large number of deleterious mutations, affecting negatively the performance of the mutant families. / A existência de variabilidade é fundamental para o sucesso do melhoramento genético. O uso de agentes mutagênicos pode incrementar a freqüência de mutação, possibilitando o desenvolvimento de variação para as características de interesse. A ocorrência de baixas temperaturas é um estresse comum na cultura do arroz em regiões temperadas, portanto a tolerância a baixas temperaturas é uma característica desejável em genótipos brasileiros de arroz cultivados no sul do país, onde as temperaturas baixas prejudicam a germinação, o estabelecimento da lavoura e diminuem o rendimento de grãos. Este trabalho teve como objetivo identificar genótipos mutantes de arroz para características de importância agronômica e avaliar a tolerância ao estresse por baixas temperaturas no estádio germinativo. No estádio germinativo 400 famílias M3 e as testemunhas BRS Querência, BR IRGA 409 e Nourim Mochi, foram submetidas a tratamentos com diferentes temperaturas (13 C e 25 C) e comparados quanto ao seu desempenho relativo, medido pelo comprimento do coleóptilo, comprimento de raiz e comprimento de parte aérea. Para avaliação dos caracteres de importância agronômica, sementes de arroz da geração M3 foram semeadas em campo experimental na Embrapa Clima Temperado. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos completamente casualizados com quatro repetições. Foram avaliados sete caracteres de importância agronômica: comprimento da panícula principal, em cm; peso da panícula principal, em g; massa de grãos da panícula principal, em g; comprimento da folha bandeira, em cm; largura da folha bandeira, em cm; estatura de planta, em cm, e comprimento de colmo, em cm. Os resultados indicam que o agente mutagênico etilmetanosulfonato (EMS), foi eficiente na geração de mutantes de arroz para seis dos caracteres avaliados, exceto para o caráter comprimento da folha bandeira, onde não foi verificado incremento da variabilidade genética. A indução de mutação também foi eficiente em gerar variabilidade genética para tolerância a baixas temperaturas no estádio de germinação, porém os resultados também indicaram a ocorrência de um grande número de mutações deletérias, afetando de forma negativa o desempenho das famílias mutantes.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2018-10-23T13:39:35Z No. of bitstreams: 1 Mistura de linhas polinizadoras com híbridos de arroz produt.pdf: 499842 bytes, checksum: 4c5b921fcccca59d819cc9d5d86cd21a (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-11-13T15:51:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Mistura de linhas polinizadoras com híbridos de arroz produt.pdf: 499842 bytes, checksum: 4c5b921fcccca59d819cc9d5d86cd21a (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-11-13T15:51:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Mistura de linhas polinizadoras com híbridos de arroz produt.pdf: 499842 bytes, checksum: 4c5b921fcccca59d819cc9d5d86cd21a (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-13T15:52:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mistura de linhas polinizadoras com híbridos de arroz produt.pdf: 499842 bytes, checksum: 4c5b921fcccca59d819cc9d5d86cd21a (MD5) Previous issue date: 2018-09-12 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Os avanços obtidos com a utilização de novos cultivares e técnicas de manejo do solo e cultivo, contribuem para o crescimento da produtividade no setor orizícola entre os avanços pode-se dar ênfase às sementes de arroz híbrido e como alternativa a semeadura das sementes híbridas misturadas com as sementes da linhagem polinizadora nas lavouras comerciais de arroz, visando operacionalidade do processo de produção e a redução do custo das sementes, o objetivo foi avaliar o comportamento de populações constituídas por misturas de sementes híbridas de arroz irrigado com diferentes proporções de sementes da linhagem polinizadora, sobre o comportamento agronômico dessas populações, produtividade de grãos e qualidade industrial dos grãos. O trabalho foi realizado na Embrapa Clima Temperado. Foi executado nas safras dos anos 2015/2016 e 2016/2017. Em que foram utilizadas sementes de arroz dos híbridos H7 e BRS AH 703 CL e do cultivar Puitá INTA - CL como polinizador. Foram utilizadas as proporções de 0%, 0,75%, 1,5%, 3%, 6%, 12% e 24% no primeiro ano e 0%, 0,75%, 1,5%, 3%, 6%, 12% e 24%, 50% e 100% para o segundo ano. O delineamento experimental foi de blocos ao acaso com quatro repetições, e os dados submetidos à análise de variância. a 5% de probabilidade. A semeadura foi realizada em novembro para o primeiro ano e outubro para o segundo ano, sendo as parcelas constituídas de 5 metros de comprimento em que foram marcados 4 metros em duas linhas da área útil de cada parcela, onde foram avaliados: Número de plantas.m-2, Número de colmos.m-2, Número de panículas.m-2, Comprimento da panícula, Produtividade de grãos, Uniformidade de parcela, Altura de plantas, Percentagem de grãos inteiros, Grãos quebrados, Avaliações de grãos gessados, menor que 1/3, entre 1/3-2/3 e maior que 2/3. Plantas oriundas de sementes hibridas de arroz não apresentam melhores componentes do rendimento, quando comparadas com populações de plantas com mistura ou totalidade de sementes autofecundadas. A mistura de sementes híbridas e autofecundadas proporciona desuniformidade maior com o aumento do polinizador. A qualidade industrial de grãos oriundos de sementes de arroz híbrido apresenta qualidade semelhante a grãos de plantas autofecundadas. O rendimento de grãos inteiros da fração dos grãos inteiros aumento em proporções equivalentes de sementes de arroz híbrido e do polinizador. / The advances obtained with the use of new cultivars and techniques of soil management and cultivation, contribute to productivity growth in the rice sector. Among advances, emphasis can be placed on hybrid rice seeds and as an alternative to sowing hybrid seeds mixed with the aim of this study was to evaluate the behavior of populations composed of mixtures of hybrid seeds of irrigated rice with different proportions of seeds of the pollinator lineage, on the agronomic behavior of these populations, grain yield and grain quality. The work was done at Embrapa Clima Temperado. It was executed in the harvests of the years 2015/2016 and 2016/2017. In which rice seeds of the hybrids H7 and BRS AH 703 CL and the cultivar Puitá INTA - CL were used as pollinator. The proportions of 0%, 0.75%, 1.5%, 3%, 6%, 12% and 24% in the first year and 0%, 0,75%, 1,5%, 3%, 6 %, 12% and 24%, 50% and 100% for the second year. The experimental design was a randomized block with four replications, and the data submitted to analysis of variance. to 5% probability. Seeding was carried out in November for the first year and October for the second year. The plots consisted of 5 meters in length, where 4 meters were marked in two lines of the useful area of each plot, where they were evaluated: Number of plants. m-2, Number of stalks.m-2, Number of panicles.m-2, Panicle length, Grain yield, Plot uniformity, Plant height, Percentage of whole grains, Broken grains, Evaluations of grains, minor than 1/3, between 1/3 - 2/3 and greater than 2/3. Plants derived from hybrid rice seeds do not present better yield components when compared to plant populations with mixed or total self-fertilized seeds. The mixture of hybrid and self-fertilized seeds provides greater unevenness with increasing pollinator. The industrial quality of grains originated from hybrid rice seeds presents similar quality to self - fertilized plants. The yield of whole grains of the whole grains fraction increased in equivalent proportions of seeds of hybrid rice and pollinator.

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-10-22T18:36:07Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Cristyene Gonçalves Benicio - 2012.pdf: 2894781 bytes, checksum: 3c9043dba7034429c44217077fc3cac5 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2014-10-22T20:22:44Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Cristyene Gonçalves Benicio - 2012.pdf: 2894781 bytes, checksum: 3c9043dba7034429c44217077fc3cac5 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-22T20:22:44Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Cristyene Gonçalves Benicio - 2012.pdf: 2894781 bytes, checksum: 3c9043dba7034429c44217077fc3cac5 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2012-08-30 / Rice (Oryza sativa L.) has great social and economic importance worldwide. Produce food for a growing world population, promoting increased productivity in environmentally appropriate conditions, it one of the great challenges of breeding programs. Rice production based on seasonal rainfall, typical of upland rice (rainfed), today represents about 40% of Brazilian production. The agricultural irrigation consumes much of the planet's fresh water, and restricting the use of water resources is a reality. With the rising cost of water for agriculture and potential shortages in some regions of the planet, the development of plants more efficient in the water use is a priority demand of breeding programs. This study aimed to evaluate and compare the polymorphism of a set of microsatellite markers (SSRs) and SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) and use them for mapping QTL for yield components under two irrigation conditions. The parentals Douradão (drought tolerant) and Primavera (susceptible to drought) resulted in a segregating population consisting of 221 F2:5, which were genotyped with fluorescent SSR markers in analyzer ABI3100 (Applied Biosystems) and SNP markers developed for the GoldenGate platform based on Veracode technology (Illumina). Among the 86 SSRs, 11 (12.8%) did not amplify and 41 (54.7%) were polymorphic. Among the 1920 SNPs, 316 (16.45%) did not amplify for both parentals and 46 (2.87%) were polymorphic. The parentals and their progeny were evaluated in two trials (with and without water deficit) in 12x19 rectangular lattice design with two replications. The composite interval mapping analysis identified 53 QTL, 10 of which related to ISS (index of susceptibility to drought) and five to productivity in water stress condition. Among the identified QTL it were found putative genes related to plant abiotic stress defense mechanisms. Families CNAx15128-70-B, CNAx15128-118-B, CNAx15128-74-B and CNAx15128-120-B showed higher yield under drought and lower ISS. These families may be evaluated by rice breeding programs aiming the development of superior cultivars. / A cultura do arroz (Oryza sativa L.) possui grande importância social e econômica no mundo inteiro. Produzir alimento para uma população mundial crescente, promovendo um aumento da produtividade e em condições de produção ambientalmente adequadas, é um dos grandes desafios dos programas de melhoramento. A produção de arroz em regime de irrigação natural, baseada em chuvas sazonais, típica de arroz de terras altas (sequeiro), representa hoje cerca de 40% da produção nacional. A irrigação agrícola consome grande parte da água potável do planeta, e a restrição do uso dos recursos hídricos é uma realidade. Com o aumento do custo da água para agricultura e potencial escassez em algumas regiões do planeta, o desenvolvimento de plantas mais eficientes no seu uso é uma demanda prioritária dos programas de melhoramento genético. Este trabalho teve como objetivo avaliar e comparar o polimorfismo de um conjunto de marcadores microssatélites (SSRs) e SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) e utilizá-los para o mapeamento de QTL para componentes de produção sob duas condições de irrigação. Os parentais Douradão (tolerante à seca) e Primavera (suscetível à seca) deram origem a uma população segregante composta por 221 famílias F2:5, que foram genotipadas com marcadores SSRs fluorescentes em analisador ABI3100 (Applied Biosystems) e marcadores SNPs desenvolvidos para a plataforma GoldenGate com tecnologia VeraCode (Illumina). Dentre os 86 SSRs, 11 (12,8%) não amplificaram e 41 (54,7%) foram polimórficos. Dentre os 1.920 SNPs, 316 (16,45%) não amplificaram para ambos parentais e 46 (2,87%) foram polimórficos. Os genitores e sua progênie foram avaliados em dois ensaios (com e sem déficit hídrico) no delineamento em látice retangular 12x19 com duas repetições. Através da análise de mapeamento por intervalo composto foram detectados 53 QTL, dos quais 10 relacionados ao ISS (índice de susceptibilidade à seca) e cinco à produtividade em condição de déficit hídrico. Dentre os QTLs identificados foram encontrados genes putativos relacionados a mecanismos de defesa da planta em resposta a estresses abióticos. As famílias CNAx15128-70-B, CNAx15128-118-B, CNAx15128-74-B e CNAx15128-120-B apresentaram maior produtividade sob déficit hídrico e menores ISS. Estas famílias poderão ser avaliadas pelo programa de melhoramento genético do arroz visando o desenvolvimento de cultivares superiores.

Made available in DSpace on 2016-04-26T19:39:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007-Rodrigo Grazinolli Garrido.pdf: 601974 bytes, checksum: 814bbefff5f3e886a2c729be5c43e178 (MD5) Previous issue date: 2007-02-16 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / About half of planet population depend on rice. In Brazil, this cereal crop is widely spread, and influenced by harsh climate conditions such as Humid Tropics one. In this region, certainly nitrogen is the most limiting nutrient. However, low insolation, acid and highly Al3+ satured soils still endangers the culture. In these soils, ammonium can be the single plant s Nitrogen source for plants. Its assimilatory pathway is economic and fast, although it presents strong integration with C metabolism. This work intended to recognize ammonium assimilation integrated with carbon metabolism. Two rice varieties were used: one adapted to Humid Tropics environment - Piau? - and an improved variety represented by IAC-47, selected under high N levels. Assays were carried on with 26 days after emergency plants, cultivated in Hoagland and Arnon (1950) modified solution with N-NH4 + 0.1 mM and 1.0 mM N-NH4 +. Plasmalem (P)-H+ATPases; vacuole (V)-H+ATPases; vacuole (V)-H+PPases activity as well as glutamine sinthetase (GS), glutamate synthase (GOGAT) and glutamate dehydrogenase (GDH) were analysed. Moreover, it was determined soluble sugars, amino-N, N-NH4 +, total-N, fresh and dry weight, and nutrition solution pH and N-NH4 + variation. Also, seminal root length was measured as well as glycolysis was analyzed through phosphofructokinase (PFK) activity at plants roots tissue. P-H+ATPases activity was higher in IAC-47 roots. On the other hand, at Piaui roots, enhances at microsomal protein were observed, and V-H+ATPases presented higher activity as well as root development was high. This allowed the adapted variety to absorb N like the improved one. However, both varieties accumulated fresh weight in shoots at treatment 1.0 mM N-NH4 + and showed roots/shoots decrease at the same treatment. Moreover, amino N and NH4 + concentration was higher at Piau? shoots under 1.0 mM N-NH4 +. Both Piau? shoots and roots cultivated under 1.0 mM NNH4 + accumulated less soluble sugars. Also, Piaui shoots had higher a+b chorophyl concentration. PFK activity was enhanced at every plant, what accompanied ammonium levels. Piau? plants always presented low sugar oxidation levels. It also seemed to concentrate its sugars. Probably it happened to later availability for grain fullfil. To ensure this, it has high ammonium and amino-N pools. Nitrogen absorbed by 1.0 mM N-NH4 + Piau? seemed to be substrate for GDH-amination, wich activity was superior. Despite this, GDH deamination was high. In this way, Piau? could have GDH activity as an anaplerotic pathway to regulate C skeletons need. Meanwhile, GS increases were observed at IAC-47, toghether with GOGAT increases at 1.0 mM N-NH4 + shoots. IAC-47 assimilated ammonium at GS/GOGAT pathway, wich was fed by glycolysis velocity. These plants would produce constitutive protein, what doesn t mean later grain stock. / Aproximadamente metade da popula??o do planeta depende do arroz. No Brasil, a cultura desse cereal ? largamente difundida, sofrendo a influ?ncia de severas condi??es clim?ticas como ocorre no Tr?pico ?mido. Nessa regi?o, certamente, o fator mais limitante para a cultura do arroz ? a disponibilidade de nitrog?nio. No entanto, ainda pesam sobre a cultura a baixa insola??o e os solos ?cidos com alta satura??o de Al+3. Nesses solos, o am?nio pode ser a ?nica fonte de nitrog?nio mineral para as plantas. Sua assimila??o ? econ?mica e r?pida, por?m, demanda estreita integra??o com o metabolismo de C. Pretendeu-se neste trabalho, reconhecer esta integra??o. Foi utilizada a variedade de arroz Piau?, adaptada ?s condi??es ambientais do Tr?pico ?mido, e a variedade melhorada IAC-47, selecionada sob altos teores de N. Os ensaios foram feitos em pl?ntulas com 26 dias ap?s a germina??o (DAG) cultivadas em solu??o de Hoagland e Arnon (1950) modificada com doses de 0,1 mM e 1,0 mM de NNH4 +. Avaliou-se a atividade de H+ATPases de plasmalema (P); H+ATPases de vac?olo (V); H+PPases de vac?olo (V) e das enzimas glutamina sintetase (GS), glutamato sintase (GOGAT) e glutamato desidrogenase (GDH) respons?veis pela assimila??o de nitrog?nio. Al?m disso, acompanharam-se os teores de a??cares livres, N-amino, N-NH4 +, N-total, massa fresca e massa seca e a varia??o do pH e do N-NH4 + da solu??o nutritiva. Foi ainda medido o comprimento da raiz seminal e o fluxo glicol?tico atrav?s da atividade da enzima fosfofrutocinase (PFK) do tecido radicular das plantas. A atividade das P-H+ATPases mostrouse maior nas plantas IAC-47. No entanto, a variedade Piau? mostrou maior teor de prote?na na fra??o microssomal, maior atividade V-H+ATPases e maior desenvolvimento de ra?zes, o que possibitou uma absor??o de am?nio semelhante ? da planta melhorada. Ambas as variedades apresentaram maior ac?mulo de massa fresca na parte a?rea e decaimento na rela??o raiz/parte a?rea no tratamento com 1,0 mM N-NH4 +. Observou-se ac?mulo de N-amino e NNH4 + na parte a?rea de plantas Piau? no tratamento 1,0 mM de N-NH4 +. Tanto a parte a?rea quanto a raiz da variedade Piau? cultivada a 1,0 mM N-NH4 + apresentaram menor ac?mulo de a??cares sol?veis e maiores teores de clorofila a+b. A atividade da PFK em todas as plantas foi aumentada com os n?veis de am?nio nutricionais. A variedade Piau? apresentou sempre menor oxida??o de a??cares. A variedade adaptada pareceu concentrar seus a??cares possivelmente para disponibilidade em est?dios posteriores de enchimento de gr?o. Para isso, manteve um maior pool de am?nio e N-amino. Houve ind?cios de que o am?nio absorvido por plantas Piau? cultivadas no tratamento 1,0 mM N-NH4 + teria sido drenado pela a??o aminativa da enzima GDH, que se mostrou exacerbada. No entanto, a fun??o desamina??o da GDH tamb?m se mostrou aumentada. Dessa forma, a Piau? poderia ter utilizado-se da GDH como via anapler?tica para regular a necessidade de esqueletos carb?nicos. A atividade de GS foi maior para a variedade IAC-47, acompanhada da atividade de GOGAT de parte a?rea no tratamento 1,0 mM N-NH4 +. As plantas IAC-47 assimilaram o am?nio prontamente a partir da via GS/GOGAT, a qual foi alimentada pela glic?lise acelerada. Essas plantas produziriam prote?na constitutiva n?o aplicando em reservas para o posterior enchimento do gr?o.

Com o objetivo de calibrar e avaliar o modelo ORYZA-APSIM para o arroz de terras altas no Brasil, foram conduzidos dezessete experimentos pela EMBRAPA Arroz e Feijão, em quatro regiões brasileiras (Santo Antônio de Goiás-GO, Sorriso-MT, Gurupi-TO e Teresina-PI) produtoras de arroz de terras altas, entre as safras de 2005/2006 e 2008/2009. O modelo foi calibrado e avaliado para a variedade cultivada de arroz de terras altas BRS-Primavera. Os dados da calibração foram obtidos de dois experimentos realizados na área experimental da EMBRAPA Arroz e Feijão, localizada no município de Santo Antônio de Goiás-GO, conduzidos em duas datas de semeadura durante a safra 2008/2009. As seguintes variáveis foram definidas na calibração: (i) unidades de calor efetivo diário, (ii) taxas de desenvolvimento fenológico para cada estádio, (iii) frações de massa de matéria seca das folhas, colmos, órgãos de armazenagem e colmos de reserva durante diferentes fases de desenvolvimento da cultura, (iv) taxa de crescimento inicial da área foliar e (v) parâmetros utilizados para determinar a área foliar específica. Na avaliação do modelo, foram comparados valores simulados com valores observados da massa de matéria seca total da parte aérea (MST) e de folhas verdes (MSF), índice de área foliar (IAF), produtividade e duração (número de dias) do período entre a emergência e o florescimento da cultura de arroz de terras altas. O modelo não apresentou desempenho satisfatório na simulação da duração das diferentes fases fenológicas de desenvolvimento para a região de Teresina-PI (os números de dias simulados foram, em média, oito dias superiores aos valores observados). O IAF, a MST e a MSF foram avaliados para as condições dos dois experimentos utilizados na calibração. As simulações do IAF diferiram dos valores observados nos dois experimentos, nos quais os valores finais da MST simulada foram semelhantes aos observados, mas diferiram dos observados durante a fase entre o florescimento e o ponto de maturidade fisiológica. A MSF simulada apresentou bom desempenho no primeiro experimento, mas regular no segundo experimento. No segundo experimento de campo, as variações da MSF, MST e o IAF foram causadas por um período de estresse hídrico simulado no modelo. O efeito do estresse hídrico foi superestimado no modelo. Comparando os valores simulados e observados de produtividade, por intermédio de uma regressão linear, verificou-se que o modelo (ORYZAAPSIM) pode determinar a ordem de grandeza da produtividade do arroz de terras altas ao nível de significância de 10%. / With the purpose of calibrating and evaluating the ORYZA-APSIM model for the upland rice in Brazil, seventeen field experiments were carried out at EMBRAPA Arroz e Feijão, in four upland rice Brazilian regions (Santo Antônio de Goiás-GO, Sorriso-MT, Gurupi and Teresina-PI), from 2005/2006 to 2008/2009 seasons. The model was calibrated and evaluated for an upland rice, cultivar BRS-Primavera. The calibration data were obtained from two field experiments carried out at the experimental area of EMBRAPA Arroz e Feijão, located at Santo Antônio de Goiás-GO, performed at two sowing dates during the 2008/2009 season. The following variables were defined in the calibration: (i) the effective heat daily units, (ii) phenological development rates at each crop stage, (iii) fractions of the dry matter of leaves, stems, storage organs and stems of reserves during the developmental crop stages, (iv) initial growth rate of leaf area and (v) parameters used to define the specific leaf area. In the model evaluation, simulated values were compared with observed values of total dry matter of shoot (DMS), dry matter of green leaves (DMGL), leaf area index (LAI), yield and duration (number of days) of the period from emergence to flowering of upland rice crop. The model did not present satisfactory performance to simulate the duration of different phenological phases of development for the Teresina-PI region (the numbers of simulated days were, in average, eight days greater than the observed values). The LAI, DMS and DMGL values were evaluated for the conditions of the two experiments used for calibration. The LAI simulations differed from the values observed in both experiments, where the final DMS simulated values were similar to those observed, but differed during the phase between flowering and physiological maturity point. The simulated DMGL showed a better performance in the first experiment, but regular in the second experiment. In the second field experiment, the DMS, DMGL and LAI variations were due to a period of drought stress simulated in the model. The model greatly penalized the growth of the culture under conditions of drought stress. The water stress effect was overestimated in the model. Comparing the simulated and observed values of yield, using a linear regression, it was verified that the model (ORYZA-APSIM) can define the magnitude order of upland rice productivity at 10% of significance level.

Na célula eucariota, os processos metabólicos estão compartimentalizados em organelas e proteínas sintetizadas no citosol são endereçadas para elas por meio de sistema celular específico. Devido a sobreposições funcionais entre organelas, uma dada proteína pode ser requerida em mais de um compartimento. É o caso de proteínas com duplo direcionamento, em que um gene nuclear é capaz de gerar produtos protéicos direcionados para mais de uma organela. Cerca de 60 proteínas de plantas já tiveram seu duplo direcionamento demonstrado, a maioria para mitocôndrias e cloroplastos, portanto um fenômeno não tão raro como imaginado. Estudos recentes procuram esclarecer os mecanismos que permitem esse duplo direcionamento, mesmo existindo fatores celulares que garantem a especificidade do transporte para cada organela. O presente trabalho está dividido em três partes. Na primeira, foram investigados aspectos evolutivos do duplo direcionamento. Na análise comparativa de famílias gênicas com membros cujos produtos protéicos apresentam duplo direcionamento, em Arabidopsis thaliana e Oryza sativa, foi demonstrada a conservação do duplo direcionamento de monodeidroascorbato redutase, metionina aminopeptidase e, provavelmente, de THI1 (enzima da biossíntese de tiazol), entre as duas espécies. Os dados sugeriram um mesmo padrão de evolução em famílias incluindo membros com duplo direcionamento. Na segunda parte, o foco foi a seqüência de duplo direcionamento. Documentado o duplo direcionamento, para mitocôndrias e cloroplastos, de proteínas de ligação ao RNA, RBP1a, RBP1b e RPS19, mutações sítiodirigidas foram introduzidas na seqüência de direcionamento de RBP1b. A importância de aminoácidos positivos para o direcionamento de proteínas para mitocôndrias foi confirmada. Demonstrou-se que a mutação da alanina na posição 2, conservada em seqüências de direcionamento ambíguas para mitocôdrias e cloroplastos, não afeta o duplo direcionamento de RBP1b. A informação para o duplo direcionamento foi localizada entre os 17 primeiros aminoácidos da região amino-terminal. Os sinais de direcionamento para cloroplastos se distribuíram ao longo da seqüência. Enquanto a metade amino-terminal da seqüência foi suficiente para determinar o duplo direcionamento, a seqüência compreendendo os 13 aminoácidos seguintes afetaram a eficiência do transporte. Nessas análises, mostrou-se a adequação de método quantitativo na medida dos sinais de fluorescência da GFP, para ser aplicado em estudos quantitativos do direcionamento de proteínas para mitocôndrias e cloroplastos, in vivo. Na terceira parte, o foco foi o mecanismo traducional do duplo direcionamento de THI1, em A. thaliana. Entretanto, não foi possível testar a hipótese da presença de um sítio interno de entrada do ribossomo (IRES) no mRNA de thi1, pois não se encontrou um sistema de expressão transiente capaz de reproduzir dados da literatura que mostraram o duplo direcionamento de THI1. Nos sistemas testados, a proteína foi encontrada somente em cloroplastos, o que inviabilizou o prosseguimento da investigação. / Compartimentalization of the metabolic processes in organelles, each one having a characteristic protein pool and distinct functions, is a property of eukaryote cells. A highly specific cellular system directs proteins, which are synthesized in the cytosol, to the proper organelles. However, due to functional overlaps between organelles, a given protein may be needed in different compartments. This is the case of dual-targeted proteins, which are the product of single nuclear genes, but are somehow directed to different organelles. About 60 plant proteins have had their dual targeting demonstrated, most of them to mitochondria and cloroplasts, the phenomenon being not so rare as previously supposed. Investigations have focused on the mechanisms, which enable protein dual targeting, even in the presence of other cell mechanisms that guarantee the specific protein transport to each organelle. The present work on the subject can be divided in three parts. In the first part, evolutionary aspects of dual targeting were investigated. A comparative analysis of gene families that included members encoding dual-targeted proteins in Arabidopsis thaliana and Oryza sativa demonstrated that the dual targeting of monodehidro-ascorbate reductase, methyonine aminopeptidase and, problably, of the thiazole biosynthetic enzyme THI1 was evolutionary conserved between the two species. In addition, the data suggested the same pattern of evolution for families with members presenting dual targeting. The focus of the second part was the ambiguous sequence for dual targeting. After showing that the RNA-binding proteins RBP1a, RBP1b and RPS19 were dual-targeted to mitochondria and cloroplasts, sitedirected mutations were introduced in the targeting sequence of RBP1b. The importance of positive-charged amino acids for directing the protein to mitochondria was confirmed. Mutation of alanine at position 2, which is conserved in ambiguous sequences, was shown not to affect RBP1b dual targeting. Information for dual targeting was localized among the 17 first amino acids in the amino-terminal region. The signals for directing the protein to cloroplasts appeared distributed along the targeting sequence. While the amino-terminal half of the sequence was sufficient for RBP1b dual targeting, the sequence comprising the next 13 amino acids appeared to affect the efficiency of the transport. In these analyses, a quantitative method to measure the intensity of fluorescent signals of GFP had its efficacy demonstrated to be adopted for in vivo quantitative analysis of dual targeting to mitochondria and cloroplasts. In the third part, the focus was the translational mechanism enabling THI1 dual targeting to mitochondria and cloroplasts, in A. thaliana. It was hypothesized that an internal ribosomal entry site (IRES) was present in thi1 mRNA. However, a transient expression system could not be found that reproduced the literature data demonstrating THI1 dual targeting. In the tested systems the protein was addressed solely to cloroplasts, thus preventing the objective to be pursued.