Orientadores: Jancarlo Ferreira Gomes, Alexandre Xavier Falcão / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-23T15:19:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carvalho_JulianaBarboza_M.pdf: 1818938 bytes, checksum: d44ab358d0482575e52d1f77a3f4c07b (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: As parasitoses intestinais são altamente prevalentes no mundo, estando entre as maiores causadoras de doenças e óbitos em seres humanos. Atualmente, o diagnóstico laboratorial destas parasitoses é realizado por meio de procedimentos técnicos manuais, desenvolvidos na sua grande maioria há décadas, o que justifica a aplicabilidade de técnicas mais sensíveis e práticas para esta finalidade, visando obter resultados eficientes, especialmente em programas governamentais direcionados à Saúde Pública. Sendo assim, o objetivo do projeto foi de avaliar e validar uma nova técnica parasitológica, denominada TF-Test Modified, em comparação com três técnicas parasitológicas convencionais consagradas pela literatura: TF-Test Conventional; Rugai, Mattos e Brisola; e Kato-Katz/Helm-Test. As etapas do trabalho consistiram em realizar coleta de material fecal de 457 indivíduos localizados em regiões endêmicas para parasitoses no município de Campinas, SP; no processamento laboratorial de 1.828 exames; no diagnóstico de 14 espécies parasitárias; e na análise estatística qualitativa de resultados de maneira abrangente. Dentre as espécies parasitárias encontradas, helmintos e protozoários intestinais foram detectados em 42,23% de indivíduos pela técnica de TF-Test Modified, ante 36,76% por TF-Test Conventional, 5,03% por Kato-Katz/Helm-Test, e 4,16% por Rugai, Mattos e Brisola. Destes casos, 54,40% de infecção simples dos indivíduos demonstrou serem portadores de monoparasitismo. A nova técnica parasitológica de TF-Test Modified, quando comparada com as demais técnicas, apresentou alto valor de infecção, como exemplo para dupla, tripla e múltipla, de maneira a perfazer um total de 98,37% de infecções. Ademais, a nova técnica apresentou índice Kappa com grau de concordância Quase Perfeito em todos os parâmetros avaliados com estimativa de 95% (P<0,05), permitiu encontrar com alta eficiência diagnóstica todas as espécies parasitárias estudadas, mostrou um notável diagnóstico verdadeiro, especialmente quando analisada comparativamente com as outras três técnicas convencionais. O atual estudo permitiu concluir que a técnica de TF-Test Modified pode ser utilizada de forma abrangente no diagnóstico qualitativo de protozoários e helmintos intestinais de humanos. O ganho de sensibilidade diagnóstica proporcionada por esta nova técnica deverá ser de estimável contribuição para o diagnóstico individual laboratorial, inquéritos populacionais e controle das parasitoses intestinais, de modo a repercutir em contribuição social / Abstract: Intestinal parasites are highly prevalent worldwide and is among the largest cause of illness and death in humans. Currently, the laboratory diagnosis of these parasites is accomplished through technical procedures manuals, developed mostly for decades, justifying the applicability of more sensitive techniques and practices for this purpose, to obtain effective results, especially in government programs aimed at Public Health. Thus, the objective of the project was to evaluate and validate a new technique parasite, called TF-Test Modified, compared with three conventional parasitological techniques enshrined in literature: TF-Test Conventional; Rugai, Mattos and Brisola, and Kato-Katz / Helm-Test. The steps of the work consisted of conducting a collection of fecal samples from 457 individuals located in regions endemic for parasitic infections in Campinas, SP, in laboratory processing of 1,828 examinations, the diagnosis of 14 parasitic species, and the qualitative statistical analysis of results so comprehensive. Among the species found parasitic, helminths and intestinal protozoa were detected in 42,23% of subjects using the technique of TF-Test Modified, against 36,76% by TF-Test Conventional, 5,03% by Kato-Katz/Helm-Test, and 4,16% Rugai, Mattos and Brisola. Of these cases, 54,40% of single infections of individuals were shown to be carriers of monoparasitism. The new technique parasitological TF-Test Modified compared to other techniques of infection showed a high value, for example double, triple and multiple so as to make a total of 98,37% infections . Moreover, the new technique presented Kappa index level of agreement with Almost Perfect in all parameters with estimated 95% (P <0.05), allowed to meet with high diagnostic efficiency all parasitic species studied showed remarkable true diagnosis, especially when viewed in comparison with other three conventional techniques. The current study showed that the technique TF-Test Modified can be used comprehensively in qualitative diagnosis of intestinal protozoa and helminths of humans. The gain in diagnostic sensitivity afforded by this new technique should be estimable contribution to the individual diagnostic laboratory, population surveys and control of intestinal parasites, in order to reflect on social contribution / Mestrado / Parasitologia / Mestra em Parasitologia

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:31:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_tony_da_silveira.pdf: 2236842 bytes, checksum: 944d753a4ecf58121a6ca37c8589d2f5 (MD5) Previous issue date: 2014-02-21 / Pontoporia blainvillei is a cetacean popularly know in Brasil as toninha. Its distribution is restrict for estuarine and coastal waters of south-west of Atlantic. Studies of gastrintestinalparasitology of toninhas indicate a component community formed for less species, including nematodes, trematodes and acantocephalans. However, despite knowing that the course of infection is the ingestion of infected prey, intermediate hosts are unknown. The toninhas s diet is composed mainly for fishes, squids and shrimps. Many of these fishes in various areas of distribution of the cetacean have been reported with parasites that attack the species in some stage of development. However, larval forms of the trematode Synthesium pontoporiae and the acantocephalan Bolbosoma turbinella were not identified in any of the food items of P. blainvillei. The present study aimed to evaluate three components of the diet of P. blainvillei as possible sources transmission of parasitiasis. Fifty specimens of Doryteuthis sanpaulensis; forty-three specimens of Paralonchurus brasiliensis and fifty specimens of Trachurus lathami were necropsied. The organs were individually, washed in tamis (150μm) and examined under a stereomicroscope. Helminths were collected, counted, fixed in AFA, stained with Delafield s hematoxylin or Gomori s trichrome, clarified in Amman s lactophenol or Beech creosote and mounted on slides. Parasitological indices were calculated. None of the food items analyzed showed infection by metacercariae of S. pontoporiae. Helminths found in D. sanpaulensis did not have records of infection of P. blainvillei. Cistacanths of C. australe were found in the coelomic cavity and mesentery of P. brasiliensis (P=53,49%; IMI=6,74) and of T. lathami (P=4%; IMI=1,50). Cistacanths of B. turbinella were on same sites of T. lathami (P=14%; IMI=2,14). Paralonchurus brasiliensis and T. lathami are recorded in this study as new paratenics hosts for C. australe, as well as T. lathami is to B. turbinella. In addition to the parasites that infect P. blainvillei, the nematodes Hysterothylacium sp., Dichelyne (D.) spinicaudatus and Procamallanus pereirai, and trematodes Diphterostomum brusinae, Opecoeloides catarinensis, O. stenosomae, Pachycreadium gastrocotylum, Aponurus laguncula, A. pyriformis and Lecithochirum sp. are registered as members of the component community of P. brasiliensis and five new records of parasitism on fish and a new record of parasite species to brazilian waters. The use of nematodes as biomarkers for distinguishing the populations of P. brasiliensis is discussed. Through the present study more about the ecology and parasitology of final and paratenic hosts were revealed, as well as aspects of the biology of parasites, contributing to the knowledge about the marine biology of the south Atlantic. / Pontoporia blainvillei é um cetáceo conhecido popularmente no Brasil como toninha, cuja distribuição é restrita às águas estuarinas e costeiras do sudoeste do Atlântico. Estudos sobre parasitologia gastrintestinalde toninhas indicam uma comunidade componente formada por poucas espécies, incluindo nematódeos, trematódeos e acantocéfalos. Entretanto, apesar de se saber que a forma de infecção é a ingestão de presas infectadas, os hospedeiros intermediários são pouco conhecidos. A dieta da toninha é composta principalmente por peixes, lulas e camarões. Muitos desses peixes em várias áreas da distribuição do cetáceo já foram reportados com parasitos que acometem a espécie em algum estágio de desenvolvimento. Contudo, formas larvais do trematódeo Synthesium pontoporiae e do acantocéfalo Bolbosoma turbinella não foram identificadas em nenhum dos itens alimentares de P. blainvillei. O presente estudo teve como objetivo avaliar três espécies componentes da dieta de P. blainvillei como possíveis fontes transmissoras de parasitíases. Cinquenta espécimes de Doryteuthis sanpaulensis; quarenta e três espécimes de Paralonchurus brasiliensis e cinquenta espécimes de Trachurus lathami foram necropsiados. Os órgãos foram individualizados, lavados em tamis (150μm) e examinados sob estereomicroscópio. Os helmintos coletados foram contados, fixados em AFA, corados com hematoxilina de Delafield ou tricrômico de Gomori, clarificados em lactofenol de Amman ou creosoto de Faia e montados em lâminas. Índices parasitológicos foram calculados. Nenhum dos itens alimentares analisados apresentou infecção por metacercárias de S. pontoporiae. Helmintos encontrados em D. sanpaulensis não têm registros de infecção em P. blainvillei. Acantocistos de C. australe foram encontrados na cavidade celômica e mesentério de P. brasiliensis (P=53,49%; IMI=6,74) e de T. lathami (P=4%; IMI=1,50). Acantocistos de B. turbinella estiveram nos mesmos sítios de T. lathami (P=14%; IMI=2,14). Paralonchurus brasiliensis e T. lathami são registrados no presente estudo como novos hospedeiros paratênicos para C. australe, assim como T. lathami é para B. turbinella. Além dos parasitos que infectam P. blainvillei, os nematódeos Hysterothylacium sp., Dichelyne (D.) spinicaudatus e Procamallanus (S.) pereirai, e os trematódeos Diphterostomum brusinae, Opecoeloides catarinensis, O. stenosomae, Pachycreadium gastrocotylum, Aponurus laguncula, A. pyriformis e Lecithochirum sp. são registrados como membros da comunidade componente de P. brasiliensis sendo cinco novos registros de parasitismo para o peixe e um novo registro de espécie parasita para águas brasileiras. A utilização de nematódeos como biomarcadores para a distinção de populações de P. brasiliensis é abordada. Através do presente estudo mais informações sobre a ecologia e parasitologia dos hospedeiros definitivo e paratênicos foram reveladas, assim como aspectos da biologia dos parasitos, contribuindo para o conhecimento sobre a biologia marinha do Atlântico sul.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-05-06T22:23:51Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DiagnosticoCoproparasitologicoAvaliacao.pdf: 1391708 bytes, checksum: d1b5d96bfadb6ce76d4aaa714cc609ad (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-05-17T14:06:56Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DiagnosticoCoproparasitologicoAvaliacao.pdf: 1391708 bytes, checksum: d1b5d96bfadb6ce76d4aaa714cc609ad (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-17T14:06:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DiagnosticoCoproparasitologicoAvaliacao.pdf: 1391708 bytes, checksum: d1b5d96bfadb6ce76d4aaa714cc609ad (MD5) Previous issue date: 2005 / As parasitoses intestinais estão entre as doenças mais freqüentes que acometem o homem, principalmente nos países mais pobres, onde as condições higiênico-sanitárias são muito precárias. Este estudo tem como objetivo determinar a prevalência e identificar os fatores de risco para enteroparasitoses, na comunidade ribeirinha da Ilha de Jutuba, localizada no município de Belém-Pa. Foram examinadas 109 amostras de fezes pelos métodos direto e de sedimentação espontânea em água potável. A prevalência de enteroparasitose encontrada foi de 77,98% (85/109). O protozoário mais prevalente foi a Entamoeba histolytica (49,41%) e entre os helmintos destacaram-se os ancilostomideos (40,0%), Ascaris lumbricoides (29,41%) e Trichuris trichiura (24,71%). Não foram encontradas diferenças, estatisticamente, significativas entre parasitismo e sexo. A correlação entre o parasitismo por Giárdia lamblia e idade apresentou significância estatística (p<0,05) na faixa etária infantil. Entre os fatores de risco para doença parasitária na Ilha consideramos o baixo nível sócio-econômico, a falta de saneamento básico, o consumo de água direto do rio e o consumo de açaí in natura. A correlação entre o consumo de água não tratada e parasitose intestinal não mostrou significância estatística. A razão de chances (Oddes Ratio) calculada mostrou que os indivíduos que consomem açaí têm quatro vezes mais chances de adquirir parasitose intestinal do que os que não consomem. Conclui-se que para redução significativa na morbidade das doenças parasitárias na Ilha de Jutuba é fundamental a ação do poder público e levar à comunidade noções básicas de higiene e de educação sanitária, pois os fatores pertinentes no sentido de reduzir a prevalência de parasitoses intestinais envolvem, além de medidas de saneamento básico, o conhecimento da comunidade sobre o assunto. / The intestinal parasitosis are the most frequent diseases that infect the men, maily in undeveloped or on development countries, where, in general, the sanitation system do not exist or is under very bad condition. This study aims to determine the prevalence and identify the risk factors of each enteroparasitosis, on the population of the community of Jutuba Island, Belém city, Pará state. We had tested 109 stool samples using the following methods: direct and spontaneous sedimentation. He total prevalence found was 77,89% (85/109). Among the protozoas, the Entamoeba histolytica (49,41%) and among the helmints the ancilostomides (40%), Ascaris lumbricoides (29,41) and Trichiuris trichiura (24,71%) were the most frequent parasites. There was no statistical sigfnificance between parasitism and sex. The correlation between the parasitism by Giardia lamblia and age was significant (p < 0,05) for the children groups. The risk factors more important for the parasitic diseases for the population of Jutuba Island were the low lever of the economical situation, the lack of sanitation system, the intake of river water without any previous treatment and the intake of açaí juice in natura. The correlation between untreated water and intestinal parasitosis was no statistical significant. The odd rates index had showed that the açaí intake raises the chance of parasitism among the Jutuba Island population it is very important the action of the healthy authorities in order to provide to them the sanitary education since this is an important factor to help to control the parasitism reducing the prevalence of each parasite.

Os nematoides que atualmente tem sido classificados como P. coffeae, demonstram ampla variabilidade morfológica, molecular e quanto à reação à diferentes hospedeiros. Por conseguinte, é essencial que se identifique corretamente as espécies e que se conheça a capacidade de parasitismo em alguns hospedeiros, para que se possa estabelecer medidas de controle e estimar eventuais riscos da entrada de um patógeno em uma área com hospedeiro suscetível. Neste sentido, a presente pesquisa propõe, numa primeira parte, uma medida de controle de P. jaehni (K5), que é muito agressivo à cafeeiro arábico, baseada no uso de plantas má hospedeiras. Na segunda parte deste trabalho é realizada uma caracterização da reação de diferentes espécies vegetais à quatro populações de Pratylenchus spp. Em virtude do exposto, este estudo objetivou avaliar a reação de diferentes cultivares de feijoeiro comum frente à P. jaehni (K5), visando seu possível uso no manejo de áreas cafeeiras infestadas e caracterizar a reação de diferentes espécies vegetais de importância econômica (café, porta-enxertos cítricos, banana e sorgo) frente à quatro populações de Pratylenchus spp. As populações inciais utilizadas nos experimentos variaram entre 180 e 200 nematóides. Em todos os experimentos, os nematóides foram extraídos das raízes pelo método de Coolen e D´Herde (1972) e, eventualmente, do substrato pelo método de Jenkins (1964). Foram realizados três ensaios: i) o primeiro com feijoeiro comum, onde todas as cultivares utilizadas foram resistentes à P. jaehni (K5), inclusive na réplica; ii) o segundo com porta-enxertos cítricos, no qual somente o limão-cravo foi hospedeiro de P. jaehni (K5); iii) o terceiro, no qual foi utilizado café, limão-cravo, banana e sorgo para o conhecimento das respectivas reações frente à 4 populações de Pratylenchus spp. Neste último experimento ocorreu uma reação hospedeira diferenciada para cada população. De acordo com os resultados, concluise que as cultivares de feijoeiro comum utilizadas apresentam potencial de uso em áreas cafeeiras infestadas por P. jaehni (K5), em consórcio ou em áreas de renovação de cafezal, e que as populações de Pratylenchus spp. são capazes de se reproduzir de forma diferenciada frente às espécies vegetais testadas. / Nematode populations that have been classified as P. coffeae show wide morphological, molecular and host range variability. Therefore, is essential the correct identification of the species and the knowledge about its parasitism capacity on some hosts, to ensure appropriate control measures and to estimate the entry risks of a pathogen in an area with susceptible host. In this sense, the present research report, firstly, propose a control measure of P. jaehni (K5), which is very aggressive to the arabic coffee, based on the use of poor host plants. In the second part, was carried out a host status evaluation of different plant species to four populations of Pratylenchus spp. In this context, were evaluated the reaction of different common bean cultivars to P. jaehni (K5), for its possible use in management of coffee areas infested with this nematode, and characterized the response of different economic important plant species (coffee, citrus rootstocks, banana and sorghum) to four populations of Pratylenchus spp (IB01P, IB02P, K5 e C1). The initial population used in experiments ranged between 180 and 200 nematodes. In all experiments, nematodes were extracted from roots by Coolen e D\'Herde´s method (1972) and eventually from the substrate by Jenkins´ method (1964). Three assays were conducted and results was as following: i) in the first one, with common bean, all tested cultivars were resistant to P. jaehni (K5), including the replica; ii) in the second one, with rootstocks, only rangpur lime was a good host of P. jaehni (K5); iii) in the third one, in which was used coffee, rangpur lime, banana and grain sorghum, was observed a differential host reaction for each nematode population evaluated. According to the present results, we suggest that common bean cultivars tested have great potential for use, or in intercropping or in crop rotation, in coffee areas infested by P. jaehni (K5) and populations of Pratylenchus spp. have different reproductive fitness in the plants species tested.

Ácaros tetraniquídeos são considerados pragas secundárias em soja, no entanto, nos últimos anos, foram registrados ataques severos e freqüentes destes em diferentes regiões produtoras do Brasil. Experimentos foram realizados em campo e laboratório com o objetivo de estudar os fatores determinantes dos aumentos populacionais de ácaros tetraniquídeos em soja. Para determinar se cultivares transgênicas de soja seriam mais susceptíveis aos ácaros, foi estudado o ciclo biológico e a tabela de vida dos ácaros Mononychellus planki (McGregor) e Tetranychus urticae Koch em três cultivares de soja transgênicas, glifosato-tolerante, e três não-transgênicas com elevada semelhança genética às respectivas cultivares transgênicas. Testes de toxicidade foram realizados em laboratório com agrotóxicos comumente utilizados em soja para determinar os efeitos destes sobre importantes inimigos naturais dos ácaros tetraniquídeos e das lagartas da soja, os fungos Neozygites floridana e Nomuraea rileyi, respectivamente. Em campo, durante duas safras agrícolas (2007/2008 e 2008/2009), foi estudado o efeito de cinco manejos fitossanitários sobre a flutuação populacional de ácaros tetraniquídeos, lagartas, percevejos fitófagos e de alguns de seus inimigos naturais. As cultivares transgênicas não afetaram significativamente o ciclo biológico de M. planki e T. urticae e as pequenas diferenças observadas para alguns parâmetros da tabela de vida destas espécies entre cultivares não estão relacionadas à modificação genética. A avaliação do efeito dos agrotóxicos sobre os patógenos revelou que o fungicida Alto 100 e o herbicida Roundup Ready inibiram o crescimento micelial de N. rileyi. Para N. floridana todos os fungicidas contendo estrubirulinas inibiram completamente a esporulação, enquanto que os produtos do grupo dos triazóis resultaram em taxas intermediárias de esporulação e germinação de conídios. A espécie M. planki foi mais abundante do que T. urticae em campo. O ácaro predador Neoseiulus anonymus e o fungo N. floridana foram os inimigos naturais associados a estes ácaros pragas. Os fungicidas Priori Xtra e Alto 100 reduziram a prevalência de N. floridana, mas não interferiram na dinâmica de N. anonymus. O inseticida piretróide Decis 25 EC reduziu a densidade deste predador, mas não afetou o fungo. No tratamento onde foram aplicados os fungicidas com o inseticida observou-se aumentos populacionais de ácaros fitófagos. A pulverização do herbicida glifosato não afetou N. anonymus e N. floridana, e a presença de plantas daninhas favoreceu o predador. Os picos populacionais mais elevados de Anticarsia gemmatalis foram observados em 2008/09, nas parcelas onde foram empregados fungicidas, e maiores densidades de Pseudoplusia includens foram observadas no tratamento com Decis 25 EC. A aplicação deste inseticida também afetou negativamente a densidade de insetos predadores e resultou em maiores densidades de percevejos fitófagos. O herbicida glifosato não afetou a densidade de pragas e inimigos naturais, no entanto, a presença de plantas daninhas favoreceu os insetos predadores e desfavoreceu os percevejos fitófagos. Em geral, os estudos em campo indicam que o uso de fungicidas e inseticidas são fatores associados aos aumentos populacionais de ácaros em soja. / Spider mites are secondary pests of soybean, however, recently outbreaks has frequently been reported on different producing regions of Brazil. Experiments were carried out in field and laboratory aiming to determine the main factors associates with spider mite outbreaks in soybean. To determine if genetically modified (GM) soybean varieties are more susceptible to spider mites, the life cycle and life table of the mites Mononychellus planki and Tetranychus urticae was studied on three GM soybean cultivars glyphosate-tolerant and three non-transgenic cultivars genetically similar to the transgenic ones. Toxicological tests were carried out in laboratory with pesticides commonly used in soybean to determine the pesticide effect on important natural enemies of spider mites and soybean catterpillars, the fungi Neozygites floridana and Nomuraea rileyi, respectively. In the field during two growing seasons (2007/2008 and 2008/2009), the effects of five plant protection managements were studied on the population dynamics of spider mites, caterpillars, stink bugs and some of their natural enemies. The transgenic cultivars did not significantly affect the life cycle parameters of M. planki e T. urticae and differences observed for some life table parameters between cultivars are not related to the genetic modification. Evaluation of the effect of pesticides on the pathogens showed that the fungicide Alto 100 and the herbicide Roundup Ready inhibited the mycelial growth of N. rileyi. Against N. floridana, all fungicides with strobilurins completely inhibited sporulation, while the triazole products hence showed intermediate rates of sporulation and conidia germination. The spider mite M. planki was more abundant than T. urticae in the field. The predatory mite Neoseiulus anonymus and the fungus N. floridana were the main natural enemies associated to these mite pests. The fungicides Priori Xtra and Alto 100 reduced the prevalence of N. floridana, though this pesticide did not negatively affected N. anonymus. The pyrethroid insecticide Decis 25 EC reduced the density of this predator, but did not affect the fungus. The treatment where fungicides and the insecticide were applied, increases on populations of phytophagous mites were observed. Spraying of the herbicide glyphosate did not affect N. anonymus and N. floridana, and the presence of weeds favored the predator. Higher population peaks of Anticarsia gemmatalis were associated with fungicide applications in 2008/09 and higher densities of Pseudoplusia includens were observed in treatment with Decis 25 EC. This insecticide also negatively affected the density of predatory insects and resulted on higher densities of stink bugs. The herbicide glyphosate did not affect density of pests and natural enemies; however, the presence of weeds favored insect predators, and resulted on lower populations of stink bugs. Overall, the field studies indicate that the use of fungicides and insecticides are important factors associated to spider mite outbreaks in soybean.

Xanthomonas axonopodis pv citri (Xac), uma bactéria gram negativa, é a causadora da doença Cancro Cítrico que ocasiona enormes prejuizo na citricultura brasileira. Com o seqüenciamento do genoma deste patógeno foram encontradas inúmeras sequências codificadores com funções desconhecidas. Assim com a finalidade de estudos funcionais do genoma de Xac, foram gerados mutantes randômicos usando o transposon EZ::TN, que induziu disrupção aleatoria de seus genes com o intuito de avaliar que genes inativados afetam a patogenicidade da bactéria. Para o mapeamento do local de inserção do transposon foi desenvolvida uma metodologia baseada na técnica de PCR touchdown utizando oligonucleotídeos semidegenerados. A confiabilidade deste novo método foi comprovada através do mapeamento por Southem blot de alguns mutantes. Conseguiu-se mapear 90 mutantes randômicos com este método. Os testes de patogenicidade em citros mostraram mutantes com sua patogenicidade afetada observando-se variações nos sintomas da doença. Mutantes interessantes contendo uma ORF hipotética inativada ou tendo uma inserção num espaço intergênico foram achadas, sendo também detectados alguns mutantes com nocaute de genes nos seus plasmídeos pXac33 e pXac66. / Xanthomonas axonopodis pv citri (Xac), a gram-negative bacteria, is the causer of the Citrus Canker disease that produces enormous losses to the brazilian citrus sector. Many coding sequences with unknown functions were found in the genome sequence of this pathogen. Therefore, with the goal of functional studies of Xac\'s genome, random mutants using the EZ::TN transposon, have been generated, which carry aleatory disruptions of their genes, with the aim of evaluating inactived genes that potentially affect bacterial pathogenicity. A method based in the PCR touchdown technique using semidegenerate primers was developed for the mapping of the transposon insertion site. The reliability of this new method was tested by means of mapping some mutants using Southern blot. Ninety random mutants were mapped with this method. The pathogenicity tests in citrus showed mutants with their pathogenicity affected and variations in the disease symptoms were observed. Interesting mutants containing an inactive hypothetical ORF or with an insertion in intergenic regions have been found, and also some mutants with inactivated genes in their plasmids pXac33 and pXac66 were detected.

Na indução de resistência a planta possui mecanismos de defesa físicos e químicos para impedir a entrada e o desenvolvimento de patógenos e parasitas, incluindo fungos, bactérias, vírus, nematóides e até insetos. Estes mecanismos são ativados por infecções prévias ou pelo tratamento com agentes indutores (eliciadores) bióticos ou abióticos. Entre os agentes indutores bióticos, destaca-se a S. cerevisiae, que além da importância biotecnológica, tem demonstrado em estudos prévios potencial para o controle de doenças em várias plantas de importância econômica. Produtos à base de S. cerevisiae, como por exemplo o Agro-Mos® (carboidratos da parede celular da levedura) estão disponíveis no mercado, mas não como indutores de resistência. Já o indutor químico registrado como Bion® vem sendo comercializado e utilizado na indução de resistência em diversas espécies de plantas contra vários patógenos. Os objetivos deste trabalho foram purificar parcialmente frações de S. cerevisiae indutoras de resistência em pepineiro contra antracnose, causada por Colletotrichum lagenarium, e avaliar o efeito do extrato bruto autoclavado de S. cerevisiae, Agro-Mos® e Bion® na indução de resistência contra o inseto T. absoluta em tomateiro, o nematóide M. incognita em pepineiro, como também, verificar o efeito destes agentes na interação simbiótica entre soja e B. elkanii. Os resultados mostraram que o extrato bruto aquoso de S. cerevisiae autoclavado por 4 h foi o mais efetivo na redução da antracnose. Dessa maneira, o mesmo foi submetido à precipitação etanólica e o sobrenadante da precipitação foi fracionado utilizando-se Cromatografia de Troca Aniônica - CTA. Obtiveram-se quatro picos, sendo que os picos I (frações não ligada à resina DEAE-celulose) e II (frações ligadas à resina DEAE-celulose) foram os mais efetivos na proteção de plântulas de pepineiro reduzindo a severidade de antracnose em 80% e 72%, respectivamente. A aplicação foliar do extrato bruto aquoso de S. cerevisiae, Agro-Mos® e Bion® não afetou o desenvolvimento do inseto em tomateiro, como também, não interferiu significativamente na multiplicação do nematóide em raízes de pepineiro. Na interação simbiótica da soja com B. elkanii, os agentes testados não afetaram a nodulação por B. elkanii em raízes e o desenvolvimento vegetativo das plantas. Porém, a aplicação foliar do extrato bruto autoclavado de S. cerevisiae aumentou a quantidade de nitrogênio total da parte aérea das plantas. Finalmente, conclui-se que frações de S. cerevisiae induziram resistência em pepineiro contra C. lagenarium. Por sua vez, os agentes testados são foram eficientes no controle do inseto herbívoro e do nematóide e não demonstraram efeito negativo na interação soja - rizóbio. / In the resistance induction, the plant has physical and chemical defense mechanisms to avoid the entrance and the development of pathogens and parasites, including fungi, bacteria, virus, nematodes and even insects. These mechanisms are activated by previous infections or by the treatment with biotic and abiotic inducer agents. Among the biotic agents there is S. cerevisiae, that besides the biotechnological importance, was shown in previous studies to control diseases in several plants of economical importance. Products made of S. cerevisiae, as for exemple, the Agro-Mos® (formulated with carbohydrates from the cellular wall of the yeast) are available in the market, but not resistance inducers. The chemical inducer known as Bion® is already marketed and used to induced resistance in several plant species against several pathogens. The objectives of this work were to partially purify fractions of S. cerevisiae able to induce resistance in cucumber against anthracnose, caused by Colletotrichum lagenarium, and also evaluate the effect of the autoclaved crude aqueous extract from S. cerevisiae, Agro-Mos® and Bion® in the resistance induction against the insect T. absoluta in tomato plants, the nematode M. incognita in cucumber plants, as well as to verify the effect of the agents in the symbiotic interaction envolving soybean and B. elkanii. The results showed that the crude aqueous extract of S. cerevisiae autoclaved for 4 h was the most effective out in the reduction of cucumber anthracnose. Thus, the same extract was submitted to ethanolic precipitation and the obtained supernatant was fractioned by using Anion Exchange Chromatography - AEC. For peaks were obtained and peak I (non-adsorbed fraction to DEAE-Cellulose) and II (fraction adsorbed to DEAE-Cellulose) were the most effective out in the protection of the cucumber seedling by reducing anthracnose severity in 81% and 72% ,respectively. The application of the autoclaved extract of S. cerevisiae, Agro-Mos® and Bion® did not affect the development of the insect in tomato plants as well as did not interfere significantly in the multiplication of the nematode in cucumber roots. In the symbiotic interaction of soybean and B. elkanii, the tested agents did not affect the formation of nodules in soybean roots and the vegetative development of the plants. However, the foliar application of the autoclaved crude extract of S. cerevisiae significantly increased the amount of total nitrogen in the aerial part of the plants. Finally, it is concluded that the fractions (peaks I and II) of S. cerevisiae induced resistance of the cucumber plants. However the tested agents were not efficient in the control of the herbivore insect and the nematode and did not exhibit negative effects in the symbiotic interaction soybean and rhizobium.

Realizou-se estudo da fauna de fitonematóides em dois municípios do estado de São Paulo (Pariquera-Açu e Cananéia) sob domínio da Mata Atlântica e dois do estado do Mato Grosso (Nova Maringá e Guarantã do Norte) sob domínio da Floresta Amazônica, com o objetivo de conhecer a diversidade de fitonematóides desses biomas e avaliar o efeito do uso agrícola do solo sobre a comunidade de fitonematóides. Para tanto, foram efetuadas amostragens em áreas de vegetação primária e em áreas próximas cultivadas. Para cada amostra, foram extraídos os nematóides de 200 cm³ de solo e em 10 gramas de raízes pela técnica de peneiramento combinada com flutuação em centrífuga com solução de sacarose. Em seguida, os espécimes foram mortos pelo calor e fixados em formalina. Os nematóides foram posteriormente quantificados, para determinação da abundância de cada táxon, sendo as identificações taxonômicas realizadas com base em características morfológicas e morfométricas. Os dados foram analisados com base na abundância, freqüência e índices de similaridade (Jaccard e Bray e Curtis). Assinalaram-se 34 gêneros e as identificações específicas foram efetuadas para 22 táxons. Para a espécie Aorolaimus banoae foram apresentadas novas características morfológicas e morfométricas. Observou-se que, com a retirada da vegetação primária e a implantação dos cultivos de plantas perenes ou anuais, houve intenso processo de redução da diversidade de fitonematóides e da introdução de novos táxons, o que resultou em baixa similaridade entre os locais de vegetação primária e aqueles cultivados, demostrando-se elevada influência da atividade agrícola sobre a comunidade de fitonematóides. / A study about plant parasitic nematode fauna was conducted in two municipalities from São Paulo State (Pariquera-Açu and Cananéia in the Atlantic Forest) and two from Mato Grosso State (Nova Maringá and Guarantã do Norte in the Amazon Forest), Brazil. The aims of this study were to evaluate the diversity of plant-parasitic nematode fauna in locations of primary and to evaluate the effect of agricultural land use on the plant parasitic nematode communities. Nematodes were extracted from 200 cm³ of soil and 10 grams of roots by a sieving and sugar flotations technique and fixed with formalin. Nematodes were counted for determination of abundances of each taxon and the taxonomic identification was based on morphological and morphometric features. The following variables were obtained: abundance, frequency and similarity indexes (Jaccard and Bray e Curtis). A total number of 34 genera were recorded and 22 taxons were identified at species level. Concerning Aorolaimus banoae species, new morphological and morphometric features were presented. It was observed that, after removal of primary vegetation and implantation of perennial or annual crops, occurred a conspicuous reduction of plant parasitic nematode diversity, associated with introduction of exotic species, resulting in low similarity between location of primary vegetation and the cultivated ones. The results demonstrated that the agricultural practices affect strongly the plant parasitic nematode communities.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-02-15T18:34:02Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_CaliforideosDipteraOestroidea.pdf: 1919056 bytes, checksum: 32f1d3a07cb2ded2293a8db4aeeba3d6 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-02-18T15:01:07Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_CaliforideosDipteraOestroidea.pdf: 1919056 bytes, checksum: 32f1d3a07cb2ded2293a8db4aeeba3d6 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-02-18T15:01:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_CaliforideosDipteraOestroidea.pdf: 1919056 bytes, checksum: 32f1d3a07cb2ded2293a8db4aeeba3d6 (MD5) Previous issue date: 2012 / O presente estudo teve como objetivo conhecer a fauna e o padrão de distribuição temporal de califorídeos que colonizam cadáveres suínos em uma área de cerrado na Reserva Ecológica do Inhamum (REI), Caxias, MA. Foram realizados dois experimentos, um no período seco (julho a agosto/2010) e o outro no período chuvoso (março a abril/2011). Em cada experimento foram utilizados três suínos de 12 kg cada, colocados em gaiola de metal. Sobre cada gaiola foi colocada uma “armadilha do tipo suspensa” para capturar os califorídeos adultos que visitassem os cadáveres suínos. Bandejas com serragem foram acopladas debaixo das gaiolas, para coleta de imaturos. Foram obtidos 51.234 espécimes de califorídeos, sendo 25.093 de adultos coletados e 26.141 de adultos criados. Foram identificadas as seguintes espécies: Chloroprocta idioidea (Robineau-Desvoidy, 1830) Chrysomya albiceps (Wiedemann, 1819), Chrysomya megacephala (Fabricius, 1794), Chrysomya rufifacies (Macquart, 1843), Cochliomyia macellaria (Fabricius, 1775), Hemilucilia benoisti Séguy, 1925, Hemilucilia segmentaria (Fabricius, 1805), Hemilucilia townsendi Shannon, 1926, Lucilia eximia (Wiedemann, 1818) e Lucilia sp1. Chrysomya rufifacies e H. townsendi são novos registros para o Brasil. Cochliomyia macellaria e C. idioidea foram as mais abundantes, em relação aos adultos coletados, enquanto que C. albiceps e C. rufifacies foram as mais abundantes entre os adultos criados. Apenas as espécies do gênero Hemilucilia não se criaram nos cadáveres suínos. A duração da decomposição dos cadáveres suínos foi, em média, de 10 dias e não variou entre os perídos seco e chuvoso, assim como a duração de cada estágio também foi semelhante entre os períodos. As durações dos estágios de decomposição foram diferentes entre si, sendo que o estágio de fermentação foi o mais duradouro. As espécies adultas coletadas de L. eximia, C. idioidea e C. macellaria foram pioneiras na colonização dos cadáveres suínos e estiveram presentes em todos os estágios de decomposição, mas somente L. eximia apresentou associação com o estágio Inicial, segundo o índice de IndVal. Os imaturos de L. eximia foram os primeiros a abandonarem os cadáveres para empuparem no solo, seguidos pelos imaturos de C. macellaria, C. albiceps e C. rufifacies. Segundo o índice de IndVal, os adultos coletados das espécies H. townsendi e H. benoisti foram as únicas que apresentaram associação a apenas um estágio, o de Inchamento; C. rufifacies e C. megacephala apresentaram associação aos estágios de Putrefação Escura e Fermentação; e as demais espécies apresentaram associação a quatro estágios. Em relação aos adultos criados, L. eximia e C. macellaria foram as únicas que apresentaram associação ao estágio de Inchamento, enquanto que C. albiceps e C. rufifacies, as únicas que apresentaram associação ao estágio seco. Os valores de abundância das espécies adultas coletadas de L. eximia, C. idioidea, C. macellaria, C. albiceps e C. rufifacies diferiram entre os estágios de decomposição, sendo que, o de Putrefação Escura foi o mais atrativo. Os valores de abundância dos adultos criados de C. albiceps, C. rufifacies e L. eximia também diferiram entre os estágios, sendo que, o estágio seco foi onde ocorreu maior abundância das espécies de Chrysomya e o de Putrefação Escura, o de L. eximia. Os adultos coletados de L. eximia e C. idioidea, e os adultos criados de C. rufifacies foram mais abundantes no período chuvoso. Em relação aos adultos coletados, a análise de ordenação demonstrou que as comunidades de califorídeos apresentaram maior semelhança entre os estágios de Putrefação Escura, Fermentação e Seco, devido aos maiores valores de riqueza e abundância; no entanto, em relação aos adultos criados, as comunidades dos estágios de Fermentação e Seco foram as mais semelhantes. Estes resultados contribuem para o entendimento do processo de sucessão das espécies de califorídeos adultos visitantes e criados durante a decomposição de cadáveres suínos em uma área de cerrado do estado do Maranhão. / The objective of this study was to determine the fauna and the pattern in the temporal distribution of blow flies collected visting or reared from pig carcasses in a cerrado area at the Reserva Ecológica do Inhamum (REI), Caxias, MA. Two experiments were performed, one in the dry season (July and August of 2010) and the another in the rainy season (March and April of 2011). In each experiment three pig carcasses weighing 12 kg each were utilized. The carcasses were placed inside wire metal cages to prevent the access of large scavengers. A suspended trap was placed above each cage to capture adult blow flies that visited the pig carcass. Trays containing sawdust were placed under the cages in order to collect larvae leaving the carcass for pupation. A total of 51,234 specimens was collected. Of these, 25,093 adults were collected in the suspended traps and 26,141 adults were reared from the carcasses. The following species were identified: Chloroprocta idioidea (Robineau-Desvoidy, 1830) Chrysomya albiceps (Wiedemann, 1819), Chrysomya megacephala (Fabricius, 1794), Chrysomya rufifacies (Macquart, 1843), Cochliomyia macellaria (Fabricius, 1775), Hemilucilia benoisti Séguy, 1925, Hemilucilia segmentaria (Fabricius, 1805), Hemilucilia townsendi Shannon, 1926, Lucilia eximia (Wiedemann, 1818) and Lucilia sp1. Chrysomya rufifacies and H. townsendi are new records for Brazil. Cochliomyia macellaria and C. idioidea were the most abundant among the adults collected in traps, and C. albiceps and C. rufifacies were most abundant among reared specimens. The species of Hemilucilia were the only ones not reared from the carcasses. The mean time of decomposition of the pig carcasses was 10 days, and there was no difference between carcasses exposed in dry and rainy seasons. In adition, the duration of each decomposition stage did not vary between the two seasons. The duration of the stages was different, and the fermentation stage was the longest. Lucilia eximia, C. idioidea and C. macellaria, collected in the traps, were the pioneers in colonizing the pig carcasses, and they were found in all stages of decomposition. However, only L. eximia showed an association with the Initial stage, according to the IndVal index. The larvae of L. eximia were the first to leave the carcasses for pupation, followed by C. macellaria, C. albiceps and C. rufifacies. According to the IndVal index, the adults of H. townsendi and H. benoisti collected in the traps, were the only species that showed an association with only one stage, the Bloated stage. Chrysomya rufifacies and C. megacephala showed an association with the Black Putrefaction and Fermentation stages. The other species showed an association with four stages. With respect to species reared from carcasses, L. eximia and C. macellaria were the only ones that showed an association with the Bloat stage, and C. rufifacies and C. albiceps were the only species that had an association with the Dry Decay stage. The abundance values of L. eximia, C. idioidea, C. macellaria, C. albiceps, and C. rufifacies, collected in the traps, were different between the stages of decomposition, and the Black Putrefaction was the more attractive to these species. The abundance values of C. albiceps, C. rufifacies, and L. eximia, reared from the carcasses, were different between the stages, and the Dry Decay and Black Putrefaction stages showed the higher abundance of Chrysomya species and L. eximia, respectively. The species of L. eximia and C. idioidea, collected in the traps, and reared specimens of C. rufifacies were more abundant in the rainy season. With respect to the specimens collected in the traps, the ordination analyses showed that the community of blow flies has higher similarity between the Black Putrefaction, Fermentation and Dry Decay stages, due to higher richness and abundance values. However, with respect to the reared species, the community of the Fermentation and Dry Decay stages were the most similar. These results contribute to understanding the successional process of visitors adults and reared larvae of blow flies during the decomposition of pig carcasses in a cerrado area of the state of Maranhão.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-08-02T20:48:05Z No. of bitstreams: 2 Dissertacao_MosquitosDipteraCulicidae.pdf: 107419885 bytes, checksum: 669fe86d8e2e589eb29870dd4f722e4e (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-08-14T12:54:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_MosquitosDipteraCulicidae.pdf: 107419885 bytes, checksum: 669fe86d8e2e589eb29870dd4f722e4e (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-14T12:54:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_MosquitosDipteraCulicidae.pdf: 107419885 bytes, checksum: 669fe86d8e2e589eb29870dd4f722e4e (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 1996 / MPEG - Museu Paraense Emílio Goeldi / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este trabalho foi realizado de fevereiro a dezembro de 1995, na Estação Científica Ferreira Penna, localizada no interior da Floresta Nacional de Caxiuanã, município de Melgaço, estado do Pará, com o objetivo de estudar as atividades sazonal e diária na floresta e no ambiente humano, e a estratificação arbórea das várias espécies de culicídeos. As coletas foram realizadas com a utilização de isca humana e armadilha luminosa do tipo CDC - isca ave, na floresta, no solo e copa das árvores e isca humana no peridomicílio. Um total de 1919 mosquitos foram coletados, distribuídos nos gêneros Aedes Meigen, 1818, Anopholes Meigen, 1818, Haemagogus Williston, 1896, Psorophora Robineau-Desvoidy, 1827, Culex Linnaeus, 1758, Coquillettidia Dyar, 1905, Mansonia Blanchard, 1904, uranotaenia Lynch-Arribalzaga, 1891, Limatus Theobald, 1901, Phoniomya Theobald, 1903, Ruchomya Theobald, 1903, Sabethes Robineau-Desvoidy, 1827, Trichoprosopon Theobald, 1901 e Wyeomyia Theobald, 1901. As espécies predominantes foram Culex (Melanoconion) portesi Senevet & Abonnec, 1941 (50,65%), Coquillettidia (Rhynchotaenia) venezuelensis (Theobald, 1912) (9,17%) e Haemagogus (Haemagogus) janthinomys dyar, 1921 (6,51%). As atividades horária e sazonal foram relacionadas com a temperatura, umidade e precipitação pluviométrica, e através do teste de correlação de Spearman, comprovou-se a interferência desses fatores sobre a atividade de algumas espécies. A hipótese de haver diferença significativa entre o número de espécies e exemplares, no solo e copa, foi verificada com utilização do teste do X² (qui-quadrado), que comprovou a diferença significativa somente entre o número de exemplares coletados no solo e copa, em isca humana na floresta. / This research was developted in 1995 from February to December, at the Ferreira Penna Research Station, in the municipality of Melgaço, state of Pará, within the Caxiuanã National Forest, with the objective of study the seasonal and daily activities in the forest and anthropic environment and the levels at which various species are found in the forest. The collects were made using human bait and CDC light trap with bird bait in the forest at ground and canopy and human bait in the anthropic environment. The total collection consisted of 1.919 mosquitoes belonging to the genera Aedes Meigen, 1818, Anopheles Meigen, 1818, Haemagogus Williston, 1896, Psorophora Robineau-Desvoidy, 1827, Culex Linnaeus, 1758, Coquillettidia Dyar, 1905, Mansonia Blanchard, 1904, Uranotaenia Lynch-Arribalzaga, 1891, Limatus Theobald, 1901, Phoniomyia Theobald, 1903, Ruchomyia Theobald, 1903, Sabethes Robineau-Desvoidy, 1827, Trichoprosopon Theobald, 1901 e Wyeomyia Theobald, 1901. The predominant species were Culex (Melanoconion) portes! Senevet & Abonnec, 1941 (50,65%), Coquillettídia (Rhynchotaenia) venezuelensis (Theobald, 1912) (9,17%) and Haemagogus (Haemagogus) janthinomys Dyar, 1921 (6,51%). The daily and seasonal activities of mosquitoes species was correlated with temperature, relative humidity and rainfall, using the Spearman correlation, and statistically significant relations were found for some species with these factors. The hypothesis of the significative difference between the species and exemplaries mosquitoes number at ground and canopy was tested using X² test, that was just significant between the exemplaries mosquitoes number at ground and canopy in human bait in the forest.