Les particules en suspension dans l’air (notées « PM » pour « Particulate matter ») sont aujourd’hui au cœur des préoccupations sociétales en raison de leur impact majeur sur la santé publique et leur forte participation au changement climatique. La matière organique (MO) représente généralement la première composante en masse des PM mais reste encore très mal appréhendée, en particulier la fraction organique d’origine biogénique primaire (PBOA). Des sucres primaires sont proposés comme des traceurs moléculaires pour étudier les processus de transport atmosphérique ainsi que pour estimer la contribution des PBOAs à la masse totale des PM. Cependant, les connaissances sont encore très limitées sur leurs distributions spatiales et temporelles (i.e., cycles journaliers, saisonniers et annuels), leurs principales sources d’émissions, ou encore les facteurs environnementaux qui déterminent leurs concentrations atmosphériques. Par ailleurs, si la comprehension du potentiel oxydant (PO) —proxy de l’effet sanitaire des PM— inhérent à la composante chimique des aérosols a relativement bien avancé ces dernières années, la contribution de cette fraction PBOA est encore est très mal connue. Ces différents aspects constituent les objectifs de ce travail de thèse. D’un point de vue méthodologique, nos questions ont été abordées par une approche interdisciplinaire, qui a impliquée l’exploitation statistique d’une large base de données et le couplage de campagnes de terrain spécifiques avec la mise en œuvre d’une stratégie expérimentale novatrice développée pour l’étude simultanée des caractéristiques chimiques et microbiologiques des échantillons prélevés.Dans un premier travail basé sur l’exploitation d’une large base de données, nous avons montré que les PBOAs constituent une fraction très importante des PM en France, independamment de la typologie de l’environnement, contribuant en moyenne annuelle à 13 ± 4 % de la MO dans les PM10. On met en évidence une similitude entre les évolutions temporelles de concentrations et de ratios entre sucres primaires pour des sites localisés dans une même région géographique (jusqu’à une distance inter-sites d’environ 200 km). Ces observations indiquent que la source PBOA est très homogène spatialement sur des distances cohérentes avec celle de grands types d'écosystèmes. Cette observation a ensuite été validée par une expérimentation basée sur deux échantillonnages annuels de terrain qui nous a permis de démontrer (i) que les évolutions journalières des concentrations atmosphériques en sucres primaires sont déterminées par seulement quelques taxons microbiens atmosphériques, variables d’un point de vue regionale ; et (ii) que ces taxons proviennent respectivement de la flore locale et régionale pour les sites d’étude qui sont directement influencés et non par les activités agricoles. Enfin, dans le cadre d’étude de PO, nos résultats ont permis de démontrer (i) que tous les bioaérosols modèles testés possèdent un PO intrinsèque significatif, comparable pour certaines espèces à celui de composants chimiques atmosphériques modèles connus pour leur forte reactivité redox ; et (ii) qu’ils sont capables d’influencer significativement le PO des PM chimiques modèles ou collectées en condition réelle.Ces travaux apportent un nouveau regard sur l’importance massique des PBOAs et des nouvelles connaissances sur les sources et processus dominants conduisant à leur introduction dans l’atmosphère, ainsi que l’influence des facteurs environnementaux sur ces processus. L’ensemble des résultats de ce travail plaide pour une prise en compte systematique des PBOAs dans les modèles de chimie atmosphérique pour une meilleure prédiction de la qualité de l’air. / Airborne particles (called « PM » for Particulate matter") are nowadays at the core of societal concerns because of their major impact on public health and their strong participation in climate change. Organic matter (OM) generally represents the first mass component of PM but it is still poorly understood, in particular the organic fraction from primary biogenic origin (PBOA). Some specific primary sugars are proposed as molecular tracers to study the atmospheric transport processes as well as to estimate the contribution of PBOAs to the total mass of PM. However, knowledge is still very limited about their spatial and temporal distributions (i.e., daily, seasonal and annual cycles), their main emission sources, or the environmental factors that drive their atmospheric concentrations. Moreover, although the understanding of the oxidative potential (OP) —a proxy of the health effect of PM— inherent in the chemical component of aerosols has progressed quite well in recent years, the contribution of this PBOA fraction is still very poorly understood. These aspects constitute the main objectives of this thesis work. From a methodological point of view, our questions were addressed by an interdisciplinary approach, which involved the statistical exploitation of a large database and the coupling of specific field campaigns with the implementation of an innovative experimental strategy developed for the simultaneous study of the chemical and microbiological characteristics of the samples collected.In a first work based on the exploitation of a large database, we showed that PBOAs constitute a very important fraction of PM in France, regardless of the typology of the environment, contributing on average to 13 ± 4% of the annual MO in PM10. We observed a synchronous temporal trends in both concentrations and ratios between primary sugars species for sites located in the same geographical region (up to an inter-site distance of about 200 km). These observations indicate that the PBOA source is very spatially homogeneous over distances consistent with those of large ecosystem types. This observation was then validated by an experimental approach based on two annual field sampling studies that allowed us to demonstrate (i) that daily changes in atmospheric concentrations of primary sugars are drived by only a few regionally variable atmospheric microbial taxa; and (ii) that these taxa come from local and regional flora for study sites that are directly influenced and not by agricultural activities, respectively. Finally, in the framework of the OP study, our results demonstrated (i) that all the tested model bioaerosols have a significant intrinsic OP, which is comparable for some species to the model atmospheric chemical components known for their high redox reactivity; and (ii) that they can significantly influence the OP of chemical PM models or sampled under real ambient conditions.This work provides a different look into the mass importance of PBOAs and new insights into the dominant sources and processes leading to their introduction into the atmosphere, as well as the influence of environmental factors on these processes. Alltogether these results argue for a systematic consideration of PBOAs in atmospheric chemistry models for better prediction of air quality.

Cette recherche de type exploratoire examine l'effet-inspecteur sur la direction des écoles primaires au Maroc. Elle essaie d'identifier et de décrire les dimensions du rôle et les types de pratiques d'inspection qui peuvent avoir une influence sur la qualité de la direction d'école primaire. À la suite d'un tour d'horizon des principaux courants qui ont marqué l'évolution de l'inspection scolaire, l'auteur a abouti à un cadre théorético-analytique devant permettre l'examen de l'influence de l'inspection (effet-inspecteur) sur la qualité de la direction d'école primaire au Maroc. Cette étude est menée à partir d'une méthode d'approche qualitative utilisant l'entrevue semi-dirigée comme instrument privilégié de cueillette de données auprès des inspecteurs et des directeurs d'école primaire et l'analyse du contenu pour le traitement et l'interprétation des données. L'analyse des données fait ressortir de l'ensemble des descriptions des écarts de perception entre ce que pensent les inspecteurs de leur rôle et ce que ressentent les directeurs envers ce rôle. L'analyse met ainsi en évidence l'inspection de la direction comme étant figée dans un fonctionnement routinier et trop formel. Ces résultats montrent en filigrane que l'effet-inspecteur peut avoir une influence sur la qualité de la direction et l'efficacité scolaire.

Tout au long de cette étude, notre préoccupation a été celle de cerner le degré avec lequel les trois dimensions des soins de santé primaires (SSP) telles que définies à Alma-Ata (la participation communautaire, la globalité et la structure sanitaire) influencent les résultats des programmes de santé. Pour y parvenir, nous avons conçu un devis de recherche essentiellement qualitatif, en triangulation avec des méthodes quantitatives. Le cadre opératoire a été celui d'une étude des cas multiples imbriqués, avec une population de huit sous-localités. Seules quatre d'entre elles ont été retenues, deux ayant eu des meilleurs résultats de santé et les deux autres, des faibles. Au terme de notre analyse, l'étude a révélé que les meilleurs résultats de santé sont associés positivement à la participation communautaire habilitante et négativement à la participation communautaire instrumentale. De même, ils sont négativement associés à la présence de la globalité des soins et de la structure sanitaire et positivement à leur absence. En plus, la présence simultanée de la globalité et de la structure sanitaire est positivement associée à la participation instrumentale et négativement à la participation habilitante. En définitive, il y a un paradoxe. Le fondement de ce paradoxe est la capacité des sous-localités appliquant la participation communautaire habilitante de s'organiser pour suppléer à la carence d'un système de santé formel fondé sur les SSP. Il en résulte de meilleurs résultats de santé, même en l'absence d'une globalité et d'une structure sanitaire formelles, mais toutefois inefficaces. Il nous paraît donc évident que c'est la participation communautaire habilitante qui est le seul déterminant et, plus que cela, qu'elle est une condition indispensable et suffisante pour obtenir de meilleurs résultats. En définitive, il en ressort que lorsqu'une organisation non gouvernementale (ONG) ou un gouvernement utilise les membres d'une communauté uniquement à des fins instrumentales, elle aura des difficultés à produire de meilleurs résultats de santé.

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Le cil primaire est une antenne sensorielle présente à la surface de la plupart des cellules qui contrôle des voies de signalisation clés au cours du développement et de l’homéostasie tissulaire. Des défauts de formation ou de fonctionnement des cils sont responsables de maladies génétiques complexes appelées ciliopathies. La néphronophtise (NPH) est une ciliopathie caractérisée par une néphropathie tubulo-interstitielle chronique évoluant généralement vers l’insuffisance rénale terminale (IRT) avant l’âge adulte. La NPH peut être isolée ou associée à des signes extra-rénaux tels que la rétinite pigmentaire et des défauts du squelette permettant de définir des syndromes comme celui de Saldino-Mainzer (MZSDS). La NPH est une maladie à transmission autosomique récessive très hétérogène sur le plan génétique et les protéines codées par les gènes identifiés ont quasiment toutes été impliquées dans des fonctions ciliaires. Le séquençage d’exome de patients, ciblant plus de 1300 gènes ciliaires (ciliome), a permis de mettre en évidence des mutations dans deux nouveaux gènes candidats pour la NPH : CEP83 et TEKT1. Mon travail de thèse a consisté à caractériser l’effet des mutations et à valider leur implication dans les phénotypes des patients. CEP83 a été retrouvé muté chez plusieurs patients non-apparentés présentant une NPH avec IRT précoce (< 5 ans). CEP83 est un composant des appendices distaux du centriole père qui joue un rôle clé dans les étapes précoces de la formation du cil. J’ai montré que les mutations identifiées entraînaient une désorganisation des appendices distaux qui pourrait expliquer les défauts de ciliogénèse observés dans les fibroblastes et les biopsies rénales de patients. Ces résultats ont permis de démontrer l’implication d’une nouvelle protéine centriolaire dans la physiopathologie des formes sévères de NPH. TEKT1 présente des mutations hétérozygotes composites chez un patient ayant un tableau clinique complexe associant un MZSDS et une dyskinésie ciliaire primitive (PCD) due à des défauts de cils motiles. Une analyse génétique détaillée a mis en évidence des mutations sévères dans un second gène, WDR19, déjà caractérisé dans les formes de NPH associées à des défauts osseux. TEKT1 code la protéine Tektine-1, un membre encore non caractérisé de la famille des tektines impliquées dans les cils motiles. L’analyse de cellules nasales multiciliées a montré que Tektine-1 était localisée le long de l’axoneme des cils motiles contrôles et absent des cils des cellules du patient qui présentaient aussi des anomalies sévères de battement. En parallèle, des défauts de ciliogénèse, typiques de mutations de WDR19, ont été observés dans les fibroblastes du patient. Ces résultats suggèrent que ce phénotype complexe est dû aux effets complémentaires des mutations des deux gènes TEKT1 et WDR19, responsables des défauts dans les cils motiles et primaires, respectivement. / The primary cilium is a sensory antenna present on the surface of most of the cells. It controls key signaling pathways during development and tissue homeostasis. Defects in cilia growth or activity are responsible for complex genetic diseases called ciliopathies. Nephronophthisis (NPH) is a ciliopathy characterized by chronic tubulointerstitial nephritis which usually progresses to end-stage renal disease (ESRD) before adulthood. NPH may be isolated or associated with extra-renal defects such as retinitis pigmentosa and skeleton involvement. The combination of these symptoms defines syndromes such as Saldino-Mainzer (MZSDS). NPH is an autosomal recessive disorder highly genetically heterogeneous and almost all of proteins encoded by the identified genes have been involved in ciliary function. The exome sequencing in patients, targeting up to 1300 ciliary genes (ciliome), highlighted new mutations in 2 NPH candidate genes: CEP83 and TEKT1. My work was to characterize the effects of the mutations and validate their involvement in patient phenotypes. CEP83 was found mutated in several unrelated patients with early-onset of NPH (IRT<5 years). CEP83 is a component of distal appendages on the mother centriole which play a crucial role in the early steps of cilia formation. I have shown that the identified mutations perturbed the distal appendages formation which might explain the defects in ciliogenesis observed in fibroblasts and kidney biopsies from patients. These results have demonstrated the involvement of a new centriolar protein in the pathophysiology of NPH severe forms. TEKT1 presents compound heterozygous mutations in a patient with a complex phenotype combining a MZSDS and primary ciliary dyskinesia (PCD) due to defects in motile cilia. The genetic analysis showed mutations in a second gene, WDR19, already characterized in NPH associated with bone defects. TEKT1 encodes the Tektin-1 protein, an uncharacterized member of the tektin family involved in motile cilia. The nasal multiciliated cells analysis showed that Tektin-1 was localized along the axoneme of control motile cilia and absent from the cilia in patient cells, which also had severe beating impairment. In parallel, defects in ciliogenesis, typical of WDR19 mutations, were observed in the fibroblasts from the patient. These results suggest that this dual ciliary phenotype is rather due to the additional effect of mutations in both TEKT1 and WDR19, responsible for the defects in motile and primary cilia, respectively.

La continuité des soins est une caractéristique centrale des soins primaires. Celle-ci représente principalement l’idée d’une relation durable dans le temps entre le patient et son médecin. Elle a été associée dans la littérature à un impact positif sur la qualité des soins, et sur la santé : amélioration de la satisfaction des patients vis-à-vis de leurs soins, réduction du nombre d’hospitalisations et de visites aux urgences. Cependant, la question de la continuité est peu présente dans les réformes françaises des soins primaires à l’inverse de la question de l’accès aux soins. L’objectif de la thèse est de valider un indicateur de la continuité, évaluer la continuité des soins en France, son évolution et son impact sur la santé. L’indicateur pourra fournir un outil de pilotage des soins primaires aux Agences Régionales de Santé (ARS). Celui-ci pourra être utilisé dans le cadre du suivi des schémas régionaux d’organisation des soins ambulatoires afin de garantir le maintien et l’amélioration de la continuité en France.Ce travail s’est appuyé principalement sur les données de l’échantillon généraliste des bénéficiaires. Il s’agit d’un échantillon au 1/97e des données de remboursements de l’assurance maladie, représentatif de la population générale. La continuité a été évaluée à l’aide d’un indice de continuité qui permet d’évaluer la concentration des visites médicales d’un patient avec le même médecin généraliste. Cette mesure est un reflet indirect de la longitudinalité. Après avoir évalué le niveau de continuité en France, l’association de continuité à la mortalité a été testée à l’aide d’un modèle de Cox, en introduisant la mesure de continuité comme une variable dépendante du temps. Dans un deuxième temps, le rôle des facteurs contextuels d’offre de soins et des facteurs individuels sur le niveau de continuité a été testé à l’aide d’un modèle multiniveau. Enfin, les caractéristiques métrologiques de la mesure de continuité des soins ont été testées afin de valider la mesure en tant qu’indicateur.Les résultats montrent que la continuité des soins en France a peu évolué ces dernières années et se maintient à un niveau relativement élevé. Une variation interrégionale existe avec des régions ayant une meilleure continuité des soins et d’autres avec une continuité plus faible. Les analyses montrent par ailleurs que la diminution de la continuité des soins est associée à une augmentation du risque de décès de l’ordre de 4 % en population générale. Le niveau de continuité est associé principalement à des facteurs individuels et aux caractéristiques du médecin. Les facteurs d’offres de soins n’ont qu’un rôle modéré dans la variation de la continuité des soins, même si les résultats confirment l’association négative entre continuité et accès. Enfin, la mesure a des qualités métrologiques suffisantes pour être validées en tant qu’indicateur de qualité.En conclusion, la continuité des soins est associée au niveau de santé de la population. L’évaluation de la continuité dans le contexte français montre un niveau moyen élevé en France, sous doute lié à l’attachement en France au médecin généraliste, mais révèle également des variations interrégionales. Ces variations représentent une marge d’amélioration de la continuité et l’opportunité d’améliorer le niveau de santé de la population. Ainsi, l’utilisation d’outils tels qu’un indicateur de continuité pourrait permettre aux ARS de suivre l’évolution de la continuité et de mesurer l’impact de réforme comme les parcours de patients. La mise en place de stratégie nationale de santé représente une opportunité d’introduire la notion de continuité au cœur des soins primaires. / Continuity of care is a central feature of primary care. It represents the idea of a long lasting relationship between the patient and his doctor. It has been associated with a positive impact on the quality of care and on health outcomes such as improving patient satisfaction with health care or fewer hospitalizations and emergency room visits. However, continuity has been somewhat neglected in the French primary care reforms in contrast to issues such as access to care. Furthermore, it has been suggested that the efforts to improve access could have reduced continuity. Thus, the aim of the thesis is to evaluate continuity of care in France and assess its recent evolution and its impact on health. The final objective is to validate a measure of continuity that could be used as a management tool for Regional Agencies of Health.This work is based on data from a 1/97e, representative of the general population, sample of the national health insurance database that contains every health care reimbursements made to French beneficiaries. Continuity was assessed using the continuity index of Bice and Boxerman that assesses the concentration of medical consultations with the same general practitioner. This measure is an indirect reflection longitudinality. The measure was used to assess the level of continuity in France and assess the association between continuity and all-cause mortality using a Cox model and introducing the measure of continuity as a time-dependent variable. Furthermore, the measure was also used to assess the role of individual and contextual factors, including provision of care, on the level of continuity using a multilevel model. Finally, the metrological characteristics of the measure were tested to validate the measurement as an indicator based on the Agency for Health Research and Quality.The analyses showed that continuity of care in France has remained constant in recent years at a relatively high level. However, interregional variation with regions with better continuity of care and others with lower continuity were seen. Lower continuity of care values were associated with a four percent increase in likelihood of death in the general population. Continuity levels were also associated with individual factors, such as sex, age and social status of the beneficiaries, as well as factors at the physician level. Provision of care factors had a moderate role in the variation of continuity of care levels. However, the results confirm the negative association between continuity and access. Finally, the measure was validated as a quality indicator.In conclusion, continuity of care is associated with the level of health of the population. The evaluation of the continuity in the French context shows a relatively high level in France, no doubt due to the attachment in France to the general practitioner model. However, it also revealed interregional variations that suggest that there is room for improvement and thus an opportunity to improve the level of health of the population. The use of tools such as a continuity indicator could allow regulatory agencies to monitor continuity and measure the impact of implementing actions, such as care pathways. The elaboration of the national healthcare strategies is a tremendous opportunity to include continuity of care in primary care organization planning.