Orientador: Geraldo Biasoto Junior / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Economia / Made available in DSpace on 2018-08-06T17:52:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Semeghini_UlyssesCidade_D.pdf: 1220469 bytes, checksum: 76fe149625be2d9d172736c4d1334e5b (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: O tema central da tese é o da gestão e financiamento metropolitanos. Sua prática no Brasil, mesmo em seu período mais efetivo (segunda metade dos anos 70), parece pouco encorajadora, olhada retrospectivamente. Não obstante, as razões para efetivação de formas integradas de gestão metropolitana permanecem válidas. No caso do Brasil, essas justificativas tornam-se ainda mais relevantes, dada a escala dos problemas, a limitação de recursos e os tremendos desequilíbrios sociais e espaciais. A tese inicialmente procura esboçar um quadro conceitual sobre as metrópoles e a evolução de seus aparatos institucionais de gestão e financiamento. Na seqüência, reconstituem-se as trajetórias demográfica, econômica e financeira recentes, bem como os processos determinantes da evolução da mancha urbana no caso da Região Metropolitana de Campinas. Nos capítulos finais é feita uma apreciação crítica da experiência recente de gestão e de financiamento na RM de Campinas À guisa de conclusão, procura-se destacar elementos que podem representar um salto de qualidade na constituição e no desempenho do aparato de gestão e financiamento para a Região Metropolitana de Campinas / Abstract: Not informed. / Doutorado / Teoria Economica / Doutor em Ciências Econômicas

The Monte Alegre Stock is a granitic intrusion (5 km2) in the Macururé Domain of the Sergipe Belt. This belt is a Neproterozoico fold system, in this context, the Monte Alegre Granite Stock integrates an expressive set of granites assumed to be post-tectonic the climax of the Brasiliano Cycle. The rocks of this stock were grouped into three petrographic facies: Porphyritic Facies, Leucocratic Equigranular Facies and Enclaves Facies, with an Equigranular Leucocratic Facies that dominates. Petrographic studies have indicated in stock existence quartz biotite monzonite, granite muscovite, granite with muscovite and biotite and subordinate manner, monzodiorites quartz. The mineralogy is essential andesine / oligoclase, alkali feldspar, quartz, muscovite , biotite and accessory apatite, magmatic epidote, titanite, zircon, carbonate and opaque . The enclaves are monzonite and monzodiorite, with the predominant mafic mineral bearing biotite and diopside.The geochemichal data indicates that the rocks the are potassic alkaline, and the enclaves are metaluminous, the granites and quartz - monzonite are peraluminous. In Harker diagrams we observed positive correlations between increasing silica and K2O, Al2O3 and Na2O, which expresses the fractionation of plagioclase, mafic minerals and accessories. The total REE values tend to decrease with fractionation and this is also observed in the negative anomalies of Eu. In the tectonic settings diagrams the granites occupy the field of syn- collisional rocks while the quartz-monzonite and enclaves occupy the field of volcanic-arc granite. The petrogenetic model proposed for the formation of porphyritic rocks is the mixture, in varying degrees, between mafic and felsic magma materialized by the presence of syn-plutonic dikes . The muscovite granite are interpreted as resulting from partial melting of metasedimentary rocks when the enplacement of the porphyritic rocks. / O Stock Granítico Monte Alegre constitui uma intrusão (5 km2) do Domínio Macururé da Faixa Sergipana. Essa faixa é um sistema de dobramentos Neproterozoico, e nesse contexto, o Stock Granítico Monte Alegre integra um conjunto bastante expressivo de granitos tidos como pós-tectônicas ao clímax do Ciclo Brasiliano. As rochas deste stock foram agrupadas em três fácies petrográficas: Fácies Porfirítica, Fácies Equigranular Leucocrática, a mais abundante, e Fácies Enclaves. Os estudos petrográficos permitiram identificar nesse stock a existência de biotita quartzo monzonitos, muscovita granitos, granitos com muscovita e biotita e de forma subordinada, quartzo monzodioritos. A mineralogia essencial nessas rochas é andesina/oligoclásio, feldspato alcalino, quartzo, muscovita, biotita e os acessórios apatita, epídoto magmático, titanita, zircão, carbonato e opacos. Os enclaves são de monzonito e monzodiorito, tendo como minerias máficos predominantes biotita e diopsídio. A geoquímica indicou que as rochas do stock são alcalinas potássicas, sendo os enclaves metaluminosos e os granitos e quartzo-monzonitos peraluminosos. Em diagramas do tipo Harker observam-se correlações positivas com o aumento da sílica para K2O, Al2O3 e Na2O, expressando o fracionamento de plagioclásio, minerais máficos e acessórios. Os valores totais de ETR tendem a decrescer com o fracionamento e isso também é observado nas anomalias negativas de Eu. Nos diagramas de ambiência tectônica os granitos ocupam o campo das rochas sin-colisionais enquanto os quartzo monzonitos e enclaves ocupam o campo dos granitos de arcos vulcânicos. O modelo petrogenético proposto para a formação das rochas porfiríticas é a mistura em diferentes graus entre magma máfico e félsico, materializado pela presença de diques sinplutônicos. Os muscovita granito são interpretados como resultantes da fusão parcial de metassedimentos quando da colocação das rochas porfiríticas.

Orientador: Lucia Elvira Alvares / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-13T02:44:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Grade_CarlaVermeulenCarvalho_M.pdf: 54304678 bytes, checksum: 869f67d6a836e256bbd7ee9e15980659 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: A proteina Miostatina (tambem conhecida como GDF8) e um membro da superfamilia de crescimento e diferenciacao ß (TGF- ß) e e expressa quase que exclusivamente em musculatura esqueletica, tanto no embriao em desenvolvimento quanto no individuo adulto, onde circula livre pela corrente sanguinea. A Miostatina foi inicialmente identificada em 1997 por MCPHERRON et al. e, desde entao, muitos estudos tem demonstrado seu papel essencial na regulacao do desenvolvimento de musculatura esqueletica de aves e mamiferos. O nocaute genico da Miostatina causa hiperplasia e hipertrofia das fibras musculares, resultando em musculos individuais ate duas vezes maiores do que em animais selvagens. Isso demonstra que a Miostatina e um regulador negativo da deposicao de musculatura esqueletica. A estrutura e a funcao desta proteina sao conservadas em diversas especies, incluindo humanos, onde os niveis de Miostatina circulante no sangue se encontram aumentados durante condicoes de distrofia e na caquexia que acompanha alguns tipos de cancer e a AIDS. Um melhor entendimento dos mecanismos que regem a expressao da Miostatina e essencial para o desenvolvimento de estrategias que possam regular sua atividade durante tais condicoes. No presente trabalho, nos identificamos, com o uso de ferramentas de Bioinformatica, elementos cisregulatorios putativos (promotor e enhancers) que possivelmente regulam a transcricao do gene da Miostatina. Inicialmente foi realizada uma comparacao dos loci do GDF8, incluindo as regioes intergenicas adjacentes, provenientes dos genomas de Humano, Camundongo e Galinha. Essa analise revelou a presenca de diferentes regioes evolutivamente conservadas (RECs) adjacentes a sequencia codificadora desta proteina, sete downstream e uma upstream ao gene. Por terem sido mantidas relativamente conservadas ao longo da evolucao, essas regioes supostamente possuem um papel funcional, possivelmente como elementos cis-regulatorios do gene da Miostatina. Em seguida, com o intuito de entender as funcoes que cada uma dessas regioes possa estar exercendo sobre a regulacao da atividade transcricional do gene da Miostatina, foi realizada uma busca por sitios de ligacao para fatores transcricionais que tenham sido conservados evolutivamente nessas RECs. Muitos sitios conservados foram observados nas sete RECs downstream ao gene da Miostatina, entre eles estao sitios para fatores relacionados ao desenvolvimento de musculatura esqueletica (MyoD, Myogenin, E47, EN1), membros (Pax3, Tbx5) e coracao (Nkx2.5, Pitx2). Juntos, esses dados sugerem uma regulacao modular do gene da Miostatina durante a embriogenese dos vertebrados. A unica REC localizada upstream ao GDF8 representa o promotor minimo putativo deste gene. Essa hipotese e reforcada pela presenca de um sitio de ligacao conservado para a Proteina de Ligacao ao sitio TATA. Com o intuito de validar as hipoteses formuladas com base nas analises de Bioinformatica, no presente trabalho buscamos caracterizar funcionalmente o promotor minimo do gene da Miostatina. Para tanto, a regiao do promotor minimo foi inicialmente clonada em um vetor que nao contem promotor e possui como gene reporter o GFP. Essa construcao de expressao foi entao testada atraves de experimentos de eletroporacao em embrioes de galinha in ovo. A analise dos embrioes eletroporados revelou que a regiao de DNA elegida para as analises funcionais e capaz de dirigir a transcricao do gene reporter, indicando que ela corresponde ao promotor minimo do gene da Miostatina. Alem do sitio TATA, ha, na regiao do promotor, diversos sitios conservados para a ligacao de proteinas envolvidas na via de sinalizacao mediada por cAMP (CREB, ATF, NFY). Esse achado esta de acordo com estudos recentes que demonstram o envolvimento do cAMP na regulacao dos fatores miogenicos Myf5 e MyoD, bem como de Pax3, sugerindo que a atividade do gene da Miostatina tambem possa estar sendo regulada por essa via de sinalizacao. Outras regioes do genoma humano que possuem arquitetura semelhante a observada no promotor da Miostatina foram identificadas, demonstrando que outros genes podem estar sob influencia da mesma via de sinalizacao que regula a atividade do promotor da Miostatina, dentre eles genes envolvidos na miogenese e neurogenese. / Abstract: The Myostatin protein (also known as GDF8) is a member of the transforming growth factor-ß (TGF-ß) superfamily and is expressed almost exclusively in skeletal muscle, both in the embryo and in the adult, where the protein circulates in the blood flow. It was initially identified in 1997 by MCPHERRON et al., and since then many studies have been demonstrating its essential role in the regulation of the development of skeletal muscle from birds and mammals. The knockout of the Myostatin gene causes both hyperplasia and hypertrophy of the skeletal muscle fibers, resulting in muscles twice as big as the wildtype ones, thus showing that Myostatin is a negative regulator of skeletal muscle deposition. The GDF8 structure and function is conserved in many species, including humans where the Myostatin levels are increased during dystrophy conditions and in the cachexia that accompanies some types of cancer and AIDS. A better understanding of the mechanisms that rule the Myostatin expression is essential for the development of strategies that might regulate its activity during such conditions. In this research, we have identified, with the use of bioinformatic tools, the cis-regulatory elements (promoter and enhancers) that regulate the Myostatin gene transcription. We compared the GDF8 loci from human, chicken and mouse and found different evolutionary conserved regions (ECRs), adjacent to the GDF8 coding sequence. Because these intergenic sequences remained relatively conserved throughout evolution, they supposedly have a functional role, possibly as cis-regulatory elements for the Myostatin gene. Our analyses revealed the presence of seven possible enhancers downstream of the GDF8 gene and one conserved region upstream of it. In order to understand the role these regions might have in the regulation of Myostatin's transcription activity, we searched for binding sites that were also evolutionary conserved. Many conserved binding sites were observed in the RECs downstream to the Myostatin gene, and among them are sites for factors related to the development of the skeletal muscle (MyoD, Myogenin, E47, EN1), limbs (Pax3, Tbx5) and heart (Nkx2.5, AREB6, Pitx2). Together, these data suggest a modular regulation of the Myostatin gene during vertebrates' embryogenesis. The only REC observed upstream of the Myostatin locus represents the putative basal gene promoter. This hypothesis is strengthened by the presence of a binding site for the Tata Binding Protein conserved for the studied species. In this research, we aimed at functionally characterizing the Myostatin gene basal promoter. For that purpose, we cloned the studied region in a promoterless vector, which contains GFP as a reporter gene. This expression construct was then tested through in ovo electroporation assays. The analysis of the electroporated embryos revealed that the cloned DNA region is capable of driving the transcription of the reporter gene, which indicates that it truly corresponds to the basal promoter of the Myostatin gene. Moreover, there are conserved binding sites for the CREB and ATF1 transcription factors in the basal promoter, which are activated by the cAMP signaling path. This finding is in agreement with recent studies that demonstrate the involvement of cAMP in the regulation of the myogenic factors Myf5 and MyoD, as well as Pax3, thus suggesting that the activity of the Myostatin gene might be under the influence of this signaling path. Other regions of the human genome that have a similar architecture to the one observed in the Myostatin promoter were identified. This demonstrates that other genes are possibly under the influence of the same signaling path regulating the activity of the Myostatin promoter, among them genes involved in myogenesis and neurogenesis. / Mestrado / Histologia / Mestre em Biologia Celular e Estrutural

Orientadores: Marcelo Menossi Teixeira, Eugenio Cesar Ulian / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-09T08:36:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Camargo_SandraRodriguesde_D.pdf: 3039020 bytes, checksum: 14d2f6b74500161c7e839b7d6776dd47 (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: A cana-de-açúcar é uma cultura de grande importância social e econômica para o Brasil. Além da produção de açúcar, que coloca o país como o maior produtor mundial, a cana-de-açúcar tem alcançado grande destaque na produção de energia renovável e pouco poluente, o etanol. Devido ao rápido crescimento das áreas cultivadas e do aumento no número de indústrias processadoras da cana-de-açúcar, milhares de novos empregos têm sido gerados no Brasil. Por se tratar de uma cultura tão importante para a sociedade e economia brasileira, a cana-de-açúcar vem ganhando cada vez mais destaque e atenção das instituições de pesquisa públicas e privadas. Grande parte da pesquisa e experimentação desenvolvida atualmente para esta cultura visa o desenvolvimento de variedades mais adaptadas às condições edafoclimáticas do Brasil e mais resistentes e tolerantes contra pragas e doenças. Outro importante campo de estudo que tem sido bastante focado no momento é a compreensão dos mecanismos bioquímicos da síntese de sacarose com a finalidade de aumentar a produção deste açúcar e conseqüentemente de etanol. O desenvolvimento de um sistema genético capaz de modificar o metabolismo da planta, através de um estímulo artificial, pode ser muito útil no aumento da produtividade e qualidade ou na redução dos custos envolvidos com a produção de cana-de-açúcar. Esta tecnologia poderá contribuir significativamente para um avanço ainda maior da cana-de açúcar no país. A partir desta premissa, o presente estudo buscou identificar e caracterizar um sistema de indução de expressão gênica disparado pela aplicação externa de etanol em folhas de cana-de-açúcar. Para isso, fazendo uso da técnica de macroarranjos de cDNA, analisamos a expressão gênica de 3.575 ESTs, isolados de folhas de cana-de-açúcar, em resposta a aplicação de etanol. Setenta ESTs apresentaram padrão de expressão alterado pelo etanol. Dentre estes, foram identificados ESTs que codificavam para proteínas relacionadas ao processo de transcrição e tradução e estresse abiótico. Muitos genes cuja função ainda permanece desconhecida também foram identificados nesta análise. Dos 70 ESTs identificados, 48 tiveram expressão induzida pela aplicação de etanol. A partir dos ESTs selecionados como induzidos pelo tratamento com etanol, foi possível selecionar o gene ERD (early responsive dehydration) como candidato para identificação e caracterização da sua seqüência promotora. O EST do gene ERD apresentou um perfil de expressão interessante, com expressão basal baixa durante os tratamentos controle e indução da expressão após a primeira hora de tratamento com etanol. Estudos realizados com várias espécies de plantas demonstram que o sistema alc é um sistema eficiente de expressão gênica baseado na indução por etanol. A partir desta informação, desenvolvemos um vetor de expressão contendo o promotor alcA regulando a expressão do gene repórter da ß-glucuronidase e em seqüência, o promotor constitutivo Ubi-1 de milho controlando a expressão do gene alcR, um fator de transcrição indispensável para a ativação do sistema. Posteriormente, esta construção foi utilizada para transformação genética de plantas de cana-de-açúcar que no momento estão sendo selecionadas e analisadas quanto a introgressão estável do cassete gênico. Outra etapa do presente estudo foi realizada com o gene SsNAC23, já descrito como induzido por estresse de frio, estresse hídrico e herbivoria. Neste trabalho foi demonstrado que SsNAC23 também é induzido pela aplicação de etanol nas folhas de cana-de- açúcar logo após uma hora de exposição ao agente indutor. Concluindo, os resultados obtidos neste trabalho contribuem para elucidar questões importantes do processo de regulação da expressão gênica induzida por etanol, além da validação de um processo útil para aplicação na agricultura. A partir dos dados gerados nas análises de macroarranjos de cDNA foi possível ainda, validar um novo método de quantificação do erro estatístico resultante das análises realizadas no programa SOM (Self Organizing Maps) / Abstract: The sugarcane is a very important crop in Brazil, the biggest producer of the World. Besides sugar, the sugarcane is also used to produce ethanol, a very important renewable source of energy in Brazil. Nowadays this crop is responsible for generation of thousands of job positions directly and indirectly linked to the sugar and ethanol industry and market. Since the sugarcane is getting an important role in the Brazil economy, Brazilians researchers are focusing a lot of work in this crop to breed new varieties with improved traits and better adaptation to stressing environmental, such as cold, poor and acid soils, and attack of pests and diseases. Other important field of study is the improvement of sucrose content to increase the efficiency of ethanol production. The development of a genetic system triggered by an external stimulus and able to modify the plant metabolism may be very useful to improve productivity and quality, besides the cost reduction of sugarcane production. This technology might permit Brazil to increase the expansion of this crop without degrading the environmental. Therefore, the aim of this work was the identification of an efficient system of gene expression induced by ethanol. The technique of cDNA array was used to check the expression of 3,575 ESTs isolated from sugarcane leaves previously treated with ethanol. Seventy ESTs showed expression profile altered by ethanol. Among these ESTs with altered expression we have identified sequences encoding proteins involved with transcription and translation and genes previously reported as responsive to abiotic and biotic stresses. Forty eight of the 70 ESTs with altered expression were up-regulated by ethanol. The SsNAC23, a gene induced by cold, dry and insect attack, was also responsive to ethanol in this study. The expression of SsNAC23 in sugarcane leaves was increased after one hour of exposition to ethanol. The expression analysis of genes induced by ethanol in arrays filters allowed us select a candidate gene whose promoter region will be identified and studied. The gene chosen was the ERD, Early Responsive to Dehydration, whose expression profile was the absence of expression under control treatment and high induction after one hour of ethanol application. Previous works have showed that the genetic system based in ethanol induction, also known as alc system, can be very useful in crops. This system was tested in several plant species and the results were very promising. Therefore, one of the goals of this work was the production of genetic altered sugarcane plants with the alc system. For that, we have developed an expression cassette using the alcA promoter regulating the expression of the ß -glucuronidase, used as a reporter gene, and the constitutive promoter Ubi-1 from maize controlling the expression of the gene alcR, a transcriptor factor essential to ctivation of the alc system. The transformed sugarcanes are being analysed and selected to construct introgression. The results obtained in this work will contribute to understanding of gene expression regulation using an external and chemical inductor as well as provide new insights to the development of new approaches of gene expression control in sugarcane. Besides that, the array data was also used to validate a new statistical method of error estimation by using the SOM software / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutor em Genetica e Biologia Molecular

O porte alcançado pela urbanização dispersa e fragmentada permite considerar esse fenômeno tão ou até mesmo mais importante para o urbanismo quanto as questões relacionadas à cidade compacta. Embora seja um fato em regiões metropolitanas do mundo inteiro, esse tipo de urbanização se apresenta como tema ainda não abordado de modo abrangente no país. As abordagens propositivas a respeito dele usualmente consistem na aplicação de soluções consagradas para a cidade compacta, cujos efeitos em suas especificidades são questionáveis. Nesse contexto, presente nas franjas das regiões metropolitanas das grandes capitais, observa-se uma relação contraditória e de particular interesse para o desenvolvimento deste trabalho: o processo de dispersão e fragmentação urbanas permitiu, de modo não intencional, a conservação de uma quantidade expressiva de espaços livres com potencial para qualificações e articulações para fins de preservação, conservação, recreação e convívio. Como objeto de estudo é adotado o processo de produção formal de áreas urbanizadas dispersas e fragmentadas na Região Metropolitana de São Paulo (RMSP), no qual figuras urbanas como os loteamentos fechados e condomínios horizontais desempenham papel relevante. Como recorte específico, foi adotado o Vetor Oeste da RMSP, composto pelos municípios de Barueri, Carapicuíba, Cotia, Embu das Artes, Itapecerica da Serra, Itapevi, Jandira, Santana de Parnaíba e Vargem Grande Paulista. Em comum, além de apresentarem de modo expressivo e simultaneamente dinâmicas de dispersão e fragmentação em seus territórios, todos esses municípios possuem suas manchas urbanizadas conectadas direta ou indiretamente à cidade de São Paulo. A partir da compreensão do local, das ações existentes e da definição dos parâmetros de qualidade projetual, são elencadas possíveis soluções para o estabelecimento de relações menos conflituosas entre dinâmicas naturais e urbanas no vetor por meio da qualificação do seu sistema de espaços livres / The proportions urban sprawl and urban fragmentation reach allow us to consider it a phenomenon as important (or even more so) to urbanism as matters related to the compact city. Even though it is a fact for metropolitan areas all over the world, this urbanization type regards a theme not yet widely discussed in Brazil. The propositional approaches on this matter usually consist of implementing established solutions for the compact city, bringing questionable effects to its specificities. In this context, one can observe a conflicting relation of particular interest to the evolution of this thesis in the outskirts of the capital cities metropolitan areas: the urban sprawl and the urban fragmentation have unintentionally allowed the conservation of a significant amount of open spaces potentially qualifying and articulate for preservation, protection, recreation and socializing. As subject of study, a formal production process of urban sprawl and urban fragmentation in the Metropolitan Area of São Paulo (RMSP) was adopted, in which urban structures, such as gated communities and low3rise residential condominiums, play an important role. The western portion of the RMSP is chosen as a specific scope. Thanks to the metropolitan extent these phenomena exhibit, the scope comprehends the municipalities of Barueri, Carapicuíba, Cotia, Embu das Artes, Itapecerica da Serra, Itapevi, Jandira, Santana de Parnaíba and Vargem Grande Paulista. As common denominator, besides exhibiting significantly and simultaneously sprawl and fragmentation dynamics within their territories, these municipalities also present urban fabrics interconnected directly or indirectly to the city of São Paulo. The choosing of this portion also refers to the high amount of new urbanized areas the portion in comparison with the RMSP, bringing different pressure levels to its current open spaces. As instrument for analysis, project quality parameters and criteria considered appropriate for the landscape urban proposals drafting are identified in the fragmented and sprawl urbanization areas. Further, a scanning of the urban morphology and the understanding of the current open spaces system is presented to identify existing conflicts and potentials, focused on the relations between natural and urban dynamics. Next, an analysis of the actions undertaken by several social actors and legal mechanisms involved in the portion is performed, aiming to understand the existing deficiencies and identify practices that reached any success or that are subject to improvement. Ultimately, based on the understanding of the location, the existing actions and the project quality parameters defined, possible solutions for the establishment of less conflicting relations between natural and urban dynamics in the portion are evidenced by the qualification of its open spaces system.

Orientador: Lucia Elvira Alvares / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-22T18:28:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Grade_CarlaVermeulenCarvalho_D.pdf: 3007033 bytes, checksum: 522d9d385305f8744861d38f7dabf5aa (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: A Miostatina é um regulador negativo da deposição de musculatura esquelética e mutações no gene que codifica esta proteína têm sido associadas a um aumento marcante na massa muscular de organismos vertebrados, resultado de hiperplasia e hipertrofia das fibras musculares. Nosso grupo identificou previamente o promotor basal do gene da Miostatina e análises de bioinformática revelaram a presença de sítios evolutivamente conservados para a ligação de CREB, Meis, FXR e NFY, além de um sítio TATA. No presente trabalho nós utilizamos mutagênese sítio-dirigida para gerar diversas construções delecionais que possuem um ou mais sítios mutados, e testamos sua atividade in vitro usando mioblastos C2C12 de camundongo sob condições de proliferação e diferenciação, para analisar o papel destes sítios de ligação sobre a atividade do promotor. Os resultados mostraram que FXR aparentemente não confere efeito na atividade transcricional do promotor da Miostatina em ambos os momentos analisados, indicando que o papel regulador desta proteína pode estar relacionado ao controle da expressão da Miostatina em outro tipo celular, que não o mioblasto. O NFY apresentou um papel de ativador transcricional, enquanto CREB e Meis atuaram inicialmente como repressores durante a proliferação, passando a relaxar esta repressão durante a diferenciação dos mioblastos, permitindo que a atividade do promotor aumentasse significativamente. Trabalhando juntos, estes fatores de transcrição são capazes de manter a atividade do promotor em níveis mais baixos durante a proliferação dos mioblastos e, com o início da diferenciação, a repressão é liberada, e os níveis de atividade podem aumentar. Este padrão está de acordo com o padrão de expressão dinâmico observado para a proteína da Miostatina durante o desenvolvimento da musculatura esquelética em vertebrados / Abstract: Myostatin is a negative regulator of skeletal muscle deposition and mutations in the gene that encodes this protein have been associated to a remarkable increase in skeletal muscle mass, attributable to both hyperplasia and hypertrophy. We have previously identified Myostatin's basal promoter and bioinformatic analyses revealed the presence of evolutionarily conserved binding sites for CREB, Meis, FXR and NFY, besides a TATA box. In the present study we used site-directed mutagenesis to generate several expression constructs possessing one or more mutated sites, and tested their activity in vitro using mouse C2C12 myoblasts in proliferation and differentiation conditions, to analyze the role of these sites on the activity of the promoter. The results show that FXR appears not to confer any effect on the transcriptional activity of the promoter in both conditions, indicating that the regulatory role of this protein might be involved in the control of Myostatin expression in another cell type. NFY presents a role as transcriptional activator, while CREB and Meis act initially as repressors during proliferation, releasing this repression upon differentiation, which allows the activity of the promoter to significantly increase. Working together, these transcription factors are capable of maintaining the promoter activity at lower levels during the proliferation of myoblasts and, upon differentiation, the repression is released, and activity levels can be increased. This pattern is in agreement with the dynamic expression pattern observed for Myostatin during the skeletal muscle development in vertebrates / Doutorado / Histologia / Doutor em Biologia Celular e Estrutural

Orientador: Paulo Eduardo de Andrade Baltar / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Economia / Made available in DSpace on 2018-08-19T17:57:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Araujo_JulianaBacelarde_M.pdf: 1976712 bytes, checksum: f8020f89c246d888d4aa4b42ed102c00 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: Nos anos 2000, o Brasil apresentou sinais de recuperação econômica, com geração de empregos e crescimento da renda nacional. A partir de 2004, a expansão do crédito e do consumo das famílias, o aumento das exportações, decorrente do movimento favorável do crescimento internacional (até a crise financeira de 2008/09), e a reativação do investimento produtivo e na infraestrutura econômica e social permitiram que o País mantivesse um ritmo sustentado de crescimento do PIB. Nesse contexto de retomada do crescimento, em que o mercado interno registrou um peso relativamente maior do que o do mercado externo, observou-se a reativação do dinamismo da economia das metrópoles, que apresentam estruturas produtivas e ocupacionais de maior complexidade e diversidade, além de terem suportado um enorme passivo socioeconômico, nos anos de 1990, expresso, em grande medida, por elevadas taxas de desemprego aberto. A forte redução do desemprego, a ampliação da geração de empregos, sobretudo dos formais, o crescimento médio da renda do trabalho e seu consequente efeito sobre a redução das desigualdades de renda entre os espaços metropolitanos e não metropolitanos constituem as principais características do mercado de trabalho brasileiro no período de 2004-2008. Contudo, ainda é cedo para falar-se em reestruturação do mercado de trabalho nacional. É preciso avançar nesse cenário, nos próximos anos. Por ora, estão claras as limitações da análise, enfocando apenas as questões do emprego e da renda, para o entendimento geral da problemática metropolitana, sem, todavia, menosprezar a importância da melhoria recente dos aspectos do mercado de trabalho, aqui analisados / Abstract: In the 2000's, Brazil showed signs of economic recovery with job creation and growth of national income. Since 2004, the expansion of credit, family consumption, and exports due to favorable international growth (until the financial crisis of 2008/09), as well as the recovery on productive investments allowed the country to maintain a steady pace of GDP growth. In this context, with a bigger importance of the domestic market, there was also a recovery on the metropolitan regions, which exhibit productive and occupational structures of higher complexity and diversity, besides having supported a huge socioeconomic liability in the 1990's, due to high unemployment rates. The decline in unemployment, the expansion of job creation, especially on formal labor, the growth of labor income and its subsequent effect on the reduction of income inequalities between metropolitan and non-metropolitan areas are the main characteristics of the Brazilian labor market evolution in the 2004-2008 period. However, it is still too early to speak of a restructured the national labor market. It's imperative to advance in this way for the coming years. For now, the limitations of the analysis are clear; especially by focusing only on issues of employment and income while understanding the metropolitan question, but without underestimating the importance of the recent improvement in this matter / Mestrado / Economia Social e do Trabalho / Mestre em Desenvolvimento Econômico

Submitted by Pedro Henrique Rodrigues (pedro.henriquer@ufpe.br) on 2015-03-05T16:44:47Z No. of bitstreams: 2 Dissertacao_Rafael_C_Barros_VersaoFinal.pdf: 3086911 bytes, checksum: a71e3520c1f218291e2cb7b5423a3564 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-05T16:44:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_Rafael_C_Barros_VersaoFinal.pdf: 3086911 bytes, checksum: a71e3520c1f218291e2cb7b5423a3564 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012-09-10 / Os sistemas de bancos de dados espaciais (SBDEs) são capazes de manipular dados geográficos. Sua principal aplicação é em sistemas de informações geográficas (SIGs), pois disponibilizam diversas funções, como indexação, consultas, exibição gráfica e algoritmos geométricos. Por padrão, os SBDEs realizam consultas a posteriori, ou seja, as operações envolvidas em cada consulta são executadas no momento da solicitação do usuário. Por isso, as consultas espaciais, geralmente compostas de diversos cálculos geométricos, possuem alto custo computacional. Recentemente, surgiram abordagens que processam consultas sobre dados geográficos através de raciocínio espacial. Uma das vantagens disso é a capacidade de obter resultados utilizando lógica, evitando, dessa forma, muitos cálculos geométricos. O cálculo de conexões de regiões (Region Connection Calculus - RCC) é um exemplo de formalização bastante utilizado em raciocínio espacial, pois define axiomas de relacionamentos entre regiões, em lógica de primeira ordem. Disso posto, esta dissertação propõe uma nova abordagem de raciocínio espacial utilizando lógica de descrições. Nessa abordagem, um conjunto mínimo de relacionamentos espaciais é calculado a priori, por um SBDE, e armazenado em uma ontologia, formalizada com regras de composição de relacionamentos do RCC. Dessa forma, utilizando lógica de descrições e o conjunto inicial de relacionamentos, é possível raciocinar todos os outros relacionamentos definidos na ontologia RCC. A partir de então, consultas espaciais qualitativas podem ser realizadas sem a necessidade de cálculos geométricos sobre dados espaciais. Com o objetivo de validar a abordagem proposta, também foi realizada uma aplicação com dados reais do estado de Pernambuco, de difícil obtenção e tratamento. Apesar dessas dificuldades, a aplicação pôde ser utilizada concretamente para checagem semântica no projeto NTDO (Neglected Tropical Disease Ontology), em uma aplicação que processa dados públicos integrados de doenças tropicais negligenciáveis.

Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-09-27T22:28:21Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Caio Cesar Farias Diaz.pdf: 5357479 bytes, checksum: ce05f5301ba496ca654682d5d19ff500 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-11-19T22:32:11Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Caio Cesar Farias Diaz.pdf: 5357479 bytes, checksum: ce05f5301ba496ca654682d5d19ff500 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-19T22:32:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Caio Cesar Farias Diaz.pdf: 5357479 bytes, checksum: ce05f5301ba496ca654682d5d19ff500 (MD5) Previous issue date: 2017-02-17 / FACEPE / A maior parte da renda nos municípios do sertão pernambucano vem da agricultura em virtude das atividades agrícolas desenvolvidas no semiárido que é feita, majoritariamente, em sequeiro sendo, portanto, esse tipo de atividade altamente dependente da precipitação que ocorre na região. O objetivo principal deste trabalho foi, portanto, analisar a influência da variabilidade da precipitação sobre a produtividade agrícola na bacia hidrográfica do rio Pajeú. Foram utilizados para realização da pesquisa, métodos estatísticos aplicados não apenas na precipitação nas mais diversas escalas temporais, como também na produtividade agrícola anual de mandioca, milho, feijão e banana e em anomalias de temperatura da superfície do mar no Pacífico e Atlântico. Percebeu-se que a precipitação tem maior influência nas produtividades de mandioca e banana e menor influência nas produtividades de milho e feijão. As anomalias de pressão e TSM no Pacífico e Atlântico mostraram ter influências específicas em determinadas regiões do Pajeú ditando o deslocamento e intensidade dos sistemas atmosféricos. A precipitação e a produtividade apresentaram padrões com diferentes níveis de definição ao longo do tempo de acordo com a cultura estudada e percebeu-se que o potencial de previsibilidade da produtividade agrícola usando a precipitação para os padrões adotados na pesquisa foi satisfatório, porém, com alguns erros que podem ser vitais para a qualidade de previsão para até 10 anos. / The majority of income at the counties of the pernambucan semiarid arrive of agriculture because of agricultural activities developed in semiarid that have been done in dry farming being, therefore, highly dependent of precipitation that happens in the region. The main aim of this research was analyze the influence of precipitation variability over the agricultural productivity in Pajeu River basin. Were used to realization of the research, statistical methods applied not only to rainfall in otherwise time scales, as also in yearly agricultural productivities of cassava, corn, bean and banana and also in sea surface temperature anomalies in Pacific and Atlantic oceans. Figured out that rainfall engage major influences in productivities of cassava and banana and minor influences in productivities of corn and bean. Pressure and SST anomalies of Pacific and Atlantic oceans showed to have specific impacts in certain Pajeu regions looking to control the movement and intensity of the main atmospheric systems of Nordeste. Rainfall and productivity presented standards with different levels of definition over time according with the culture researched and figured out that the potential of predictability of the agricultural productivity using rainfall to the adopted standards in the researches was satisfied, however, with some errors that can be relevant to the quality of the forecasting until 10 years.

Made available in DSpace on 2010-04-20T20:53:25Z (GMT). No. of bitstreams: 3 43899.pdf.jpg: 18897 bytes, checksum: ccb406c1cdf8876575c632be2e952fa5 (MD5) 43899.pdf: 1378881 bytes, checksum: 97696d3f569c1fd33c629d9fecf411fc (MD5) 43899.pdf.txt: 596098 bytes, checksum: b3e47550fc65faef26cfec805ea404db (MD5) Previous issue date: 2004-12-16T00:00:00Z / This study portrays the history of the creation of the Metropolitans Regions in São Paulo state, in its formation and trajectory, as well as the construction of its institutions of development. It analyzes the impact of intergovernmental cooperation in the metropolitan management through the participation of the state-level government. The questions that lead this discussion are the impacts of the federative variable and the absence of politics seeking solutions for common problems concerning the various government agencies on a metropolitan region, which discourages intergovernmental cooperation amongst the federative units in these regions. The importance of the intergovernmental coordination is the central point of the analysis. Although coordination and intergovernmental cooperation present technical and political restrictions, they represent and appear to be a solution for collective action problems. / Retrata, em sua formação e trajetória, a história da criação das Regiões Metropolitanas paulistas, bem como da criação de suas instituições de desenvolvimento, analisando o impacto da cooperação intergovernamental na gestão metropolitana, através da participação do governo estadual. As questões que conduzem a discussão são os impactos da variável federativa e a ausência de políticas de solução de problemas comuns das várias unidades de governo de uma Região Metropolitana, que desestimulam a cooperação entre os entes federativos nessas regiões. A importância da cooperação intergovernamental é o ponto central da análise. Embora a cooperação intergovernamental apresente limitações, tanto em aspectos técnicos, como políticos, representa e aparece como solução para os problemas da ação coletiva.