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O Teste de motricidade sobre grade como ferramenta de triagem no modelo de parkinsonismo induzido por 6-hidroxidopamina em ratos

Silvestrin, Roberta Bristot January 2008 (has links)
A infusão de 6-hidroxidopamina (6-OHDA) na via nigroestriatal em ratos é um modelo da Doença de Parkinson (DP). O Teste de Motricidade sobre Grade (TMG ou, em inglês, footfault test) é um teste comportamental utilizado para avaliar a função motora em ratos. Observamos que animais lesionados unilateralmente com 6-OHDA mostram atividade rotacional ipsilateral induzida pelo contexto quando colocados no aparato do TMG por 3 minutos e isso pode ser utilizado como índice para detectar animais lesionados. Nossos resultados mostraram que o TMG tem sensibilidade e especificidade de 100% para lesões maiores que 94 e 64%, respectivamente (Curva Operacional Característica: Área sob a curva = 0,988). Um modelo de regressão logística binária mostrou exp(B)= 1,116 (95% CI, 1,007-1,236) e C = -9,081 ± 4,554 (p = 0,046) utilizando a imunoistoquímica para tirosina-hidroxilase como técnica padrão (cada unidade representa 10% de lesão). Além disso, o TMG foi mais sensível que o teste de atividade rotacional induzida por apomorfina 1mg/kg quando os testes foram realizados em dias diferentes e foi menos sensível que o teste de atividade rotacional induzida por metilfenidato 40mg/kg (Teste do Sinal, p < 0,05). Portanto, o TMG pode ser bastante útil nesse modelo animal de DP para triagem de animais, uma vez que é um teste rápido, simples e não requer drogas para indução de atividade rotacional. / The administration of 6-hydroxydopamine (6-OHDA) into the nigrostriatal pathway is a rat model of Parkinson’s Disease (PD). The footfault test is a behavioural task in which rodents have their motor functions assessed. Here, we observed that unilaterally 6-OHDA-lesioned animals show a context-induced ipsilateral rotational behaviour when placed on the footfault apparatus for 3 minutes and this may be used as index to detect lesioned animals. Our results showed a sensitivity and specificity of 100% for lesions higher than 94 and 64%, respectively (ROC curve: AUC = 0.988). A binary logistic regression model showed an exp(B)= 1.116 (95% CI, 1.007-1.236) and C = -9.081 ± 4.554 (p = 0.046) using the nigral tirosine hidroxylase immunocontent as standard (each unit represents a 10%-lesion extension). Additionally, the footfault test was more sensitive than apomorphine challenging at 1 mg/kg when these tests were carried out days apart and it was less sensitive than methylphenidate at 40 mg/kg (Sign Test, p < 0.05). Therefore, the footfault test may be very useful in the PD animal model for screening animals since it is fast and simple and it does not require a drug to induce rotational activity.
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Pequenos mamíferos em paisagens fragmentadas do estado do Rio de Janeiro e implicações na transmissão de Hantavírus

Oliveira, Jonathan Gonçalves de January 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2016-01-07T13:41:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 jonathan_oliveira_ioc_mest_2014.pdf: 2250142 bytes, checksum: 1ef72016a6815c4200fb3797c82d3e75 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-04-14 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A Mata Atlântica é um dos biomas de maior biodiversidade e um dos mais ameaçados, principalmente pelo processo de fragmentação florestal. Roedores e marsupiais formam o grupo mais diversificado dentre os mamíferos e exercem influência no dinamismo de florestas neotropicais, sendo bons indicadores de alterações na paisagem. Além disso, este grupo é de grande interesse para saúde humana, pois diversas espécies estão envolvidas em ciclos zoonóticos. Os roedores em particular, são hospedeiros específicos dos hantavírus, e o acompanhamento do seu ciclo de transmissão em áreas silenciosas para hantavirose contribui para estudos epidemiológicos sobre a doença. Os objetivos desse estudo foram: a) levantar a fauna de pequenos mamíferos de áreas fragmentadas de Mata Atlântica predominantemente na região noroeste fluminense; b) identificar os indivíduos por taxonomia integrativa; c) avaliar a influência de variáveis geográficas e de habitat na composição de espécies; d) avaliar a infecção por hantavírus nos roedores capturados e a preferência de habitat das espécies infectadas. Foram capturados 128 roedores e 81 marsupiais em 11 fragmentos florestais e em áreas de matriz alterada nos municípios de Cambuci, Miracema, Sumidouro e Varre-sai A identificação taxonômica dos animais capturados foi feita por morfologia externa, cariotipagem e análises moleculares para os gêneros Trinomys, Calomys, Oligoryzomys e Akodon. A composição de espécies foi relacionada ao tamanho, forma e grau de isolamento dos fragmentos florestais, distância entre fragmentos e também a características do habitat (complexidade e heterogeneidade) por regressão múltipla de matrizes de similaridade. A similaridade na composição de espécies nos fragmentos e nos municípios foi então avaliada por dendrogramas de dissimilaridade. As amostras sorológicas dos roedores capturados foram submetidas ao teste imunoenzimático (ELISA) para detectar a infecção por hantavírus. A preferência do hábitat da única espécie sororreativa para infecção por hantavírus (Akodon 2 cursor) foi avaliada por modelo linear generalizado utilizando as variáveis de habitat (os três primeiros componentes de uma análise de componentes principais) como variáveis independentes e a abundância de A. cursor nas estações de captura como variável dependente. A composição de espécies de pequenos mamíferos não foi influenciada pelos descritores geográficos e de hábitat. No dendrograma gerado pela similaridade na composição de espécies nos fragmentos observou-se que fragmentos que continham apenas espécies mais generalistas agruparam-se separadamente dos que continham ao menos uma espécie especialista Similarmente, paisagens amostradas que eram mais conservadas agruparam-se separadamente daquelas mais perturbadas. Akodon cursor, única espécie sororreativa, prefere áreas com dossel mais aberto e mais baixo, com sub-bosques abertos e com mais caules herbáceos e lenhosos, mostrando que esta espécie está adaptada a ambientes alterados. A ocorrência de circulação de hantavírus neste roedor e sua preferência por habitat alterado,sinaliza a importância da continuidade nos estudos sobre a circulação de hantavírus no estado do Rio de Janeiro, especialmente em áreas estudadas onde a paisagem encontra-se fragmentada e composta por espécies em sua maioria generalistas / he Atlantic rainf orest is one of the species’ richest biomes and one of the most threate ned, mainly by forest fragmentation. Marsupials and rodents are most diverse group among the mammals and influence the dynamics of N eotropical forests, being g reat indicators of landscape changes. Furthermore, this group is important to human health,becaus e s ome species are involved in zoonotic cycles . Some rodents , in particular , ar e specific hosts for hantaviru s; the monitoring of such species and the parasite transmission cycle in silent areas for hantavirus contributes to epidemiolog ical studies of the disease. The objectives of this study were: a) to perform an inventory of sm all mammal s in fragmented A tlantic f orest areas predominantly in the northwest region of the Rio de Janeiro state ; b) to identify specimens by integrative taxonomy; c) to evaluate the influence of geographic variables and habitat characteristics in species composition; d) to evaluate the hantavirus infection in rodents and to investigate habitat preference of the infected species. T he captured animals were identified by external mo rphology, karyotyp e and molecular analy s es for the genus Trinomys , Calomys , Akodon and Oligoryzomys . The influence of fragment size, shape and degree of isolation , distance between fragmentsand habitat features (complexity and heterogeneity) on species com position was tested using a multiple regression of dissimilarity matrices . S pecies composition in fragments and fragmented landscapes as a whole was then evaluated by cluster analysis using Jaccard similarity index and Wad’s method of linkage . The serum sa mples of rodents were subjected to enzyme - linked immuno no sorbent assay (ELISA) to detect hantavirus infection. The habitat preference of Akodon cursor (the only species infected with hantavirus) was tested by generalized linear model with habitat features (the first three principal components of a Principal Component Analysis) as independent variables and A. cursor abundance in capture stations as the dependent variable . We obtained 128 rodents and 81 marsupials captured in 11 forest fragments and areas in the disturbed matrix in the municipalities of Cambuci, Miracema, Sumidouro e Varre - sai . The species composition of small mammals was not influenced by any geographic and habitat descriptors. In the dendrogram generated by the similarity in species composit ion in fragments , we observed t hat fragments containing only generalist species w ere clustered separately from those that had at least one specialist species. Similarly, conserved landscapes clustered separately from disturbed ones . A kodon cursor prefer red areas with more open and low canopy height, with open understory , more herbaceous cover and woody stems, showing that this species is adapted to disturbed habitats. The oc currence of hantavirus circulation in this rodent and its preference for altered hab itat, signals the importance of monitoring studies about the this zoonosis in the s tate of Rio de Janeiro, especially in areas where the landscape is fragmented and composed of generalist species
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Estudo longitudinal da infecção por hantavirus em roedores silvestres no estado do Paraná

Teixeira, Bernardo Rodrigues January 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2016-04-15T13:03:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 bernardo_teixeira_ioc_dout_2013.pdf: 5433655 bytes, checksum: 460c11dcfc59f27f0382b69db7e4b342 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2013 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A Síndrome Cardio-Pulmonar por Hantavírus (SPH) é uma zoonose cuja emergência está relacionada a alterações ambientais que modificam os padrões de riqueza e abundância das espécies. Nestas situações, espécies de hábitos generalistas/oportunistas podem ser favorecidas, como é o caso das principais espécies de roedores hospedeiros de hantavírus no Brasil. Em geral os hantavírus apresentam uma associação específica entre o genótipo viral e a espécie de roedor hospedeiro, entretanto trabalhos recentes vêm reportando a ocorrência de spillover em hospedeiros secundários. No Brasil, são conhecidos nove genótipos virais, sendo cinco associados a roedores e casos de SPH e quatro associados apenas a roedores hospedeiros. O Estado do Paraná é o 4º em número de casos de SPH no Brasil e o município de General Carneiro se localiza na região da Floresta Ombrófila Mista, região que concentra a maioria dos casos do Estado. Este trabalho teve como objetivos: (1) Caracterizar a fauna de pequenos mamíferos e determinar a taxa de infecção por hantavírus em roedores silvestres em quatro unidades de paisagem do Estado do Paraná; (2) realizar um estudo das populações de roedores silvestres e de sua infecção por hantavírus, no município de General Carneiro/PR, considerando os parâmetros populacionais, as variáveis de micro-habitat e a estrutura das comunidades, ao longo de dois anos. A identificação taxonômica foi baseada na análise cariotípica e, quando necessário, pela análise da morfologia craniana. Os espécimes infectados por hantavírus tiveram sua identificação específica confirmada por sequenciamento do gene Citocromo b. O diagnóstico de infecção por hantavírus foi realizado através de ensaio imunoenzimático ELISA, utilizando o antígeno Araraquara, e sequenciamento de DNA O levantamento de espécies foi realizado em sete municípios do Estado do Paraná e o estudo temporal em General Carneiro foi realizado em seis áreas com diferentes graus de conservação. Foram encontradas no total 14 espécies de roedores e 7 de marsupiais, todas de ocorrência frequente no Estado do Paraná. As principais espécies hospedeiras foram os roedores Akodon montensis e Oligoryzomys nigripes, associados aos genótipos virais Jaborá (JABV) e Juquitiba (JUQV), respectivamente. O grau de conservação das áreas não influenciou a composição das espécies ou a ocorrência de hantavírus no estudo temporal. As quatro espécies infectadas (Akodon serrensis, Akodon montensis, Akodon paranaensis, Oligoryzomys nigripes) apresentaram maiores prevalências de infecção na primavera/verão, estações com maior atividade reprodutiva, maior quantidade de indivíduos adultos e menores tamanhos populacionais. Maiores tamanhos populacionais ocorreram no outono/inverno devido à grande quantidade de indivíduos jovens recrutados. Estes padrões populacionais foram semelhantes também para Oxymycterus judex e Thaptomys nigrita. No estudo total foram identificadas infecções spillover em A. montensis/JUQV, O. judex/JUQV, A. serrensis/JABV, A. paranaensis/JABV e A. paranaensis/JUQV. Estas infecções spillover ocorrem em períodos de baixa prevalência nos hospedeiros primários, sendo importantes na manutenção dos genótipos JABV e JUQV no ambiente. A infecção spillover entre A. serrensis e A. montensis está relacionada a ocupação do micro-habitat por estas espécies. A infecção por JABV em roedores está relacionada à uma menor abundância de A. serrensis, à presença de roedores machos adultos e à ocorrência da espécie A. montensis nas áreas de estudo / Hantavirus cardio - pulmonary syndrome (HPS) is a zoonosis whose emergence is associated to habitat disturbance that alter diversit y and abundance of natural communities, thereby favoring generalist/opportunistic rodent species , as is the case of the main species of hantavirus rodent hosts in Brazil. Each hantavirus genotype is associated predominantly with a specific rodent host spec ies; however, an increasing number of studies have reported the occurrence of hantavirus spillover to secondary hosts. Until now, there are nine known viral genotypes in Brazil , five of them are associated with rodents and HPS cases, and the remaining are associated with rodent hosts only . The state of Paraná has one of the highest incidences of HPS in Brazil and the General Carneiro municipality is located in Mixed Ombrophilous Forest, a biome with the highest incidence of HPS in Paraná. This study purpose was (1) to conduct a survey of small mammals and their hantavirus infection in the State of Paraná, southern Brazil ; (2) to analyze population dynamics, micro - habitat associations and community structure of rodent hosts and hantavirus infection over a two - year period in General Carneiro municipality . All species were identified by karyotyping or cranial morphology/morphometry. Hantavirus antibody - positive specimens were confirmed by molecular analysis (amplification of the cytochrome b gene). Serum and tis sue samples obtained from rodents were submitted to IgG enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA), using N - Araraquara hantavirus recombinant nucleocapsid protein, and DNA sequencing, respectively. The species survey was conducted in seven counties and the two - year study in General Carneiro was conducted in six sites with different vegetational types . Fourteen rodent species and seven marsupial species were captured , all of them considered common species in Paraná . The main host species were Akodon montensis and Oligoryzomys nigripes associated with Jaborá Virus genotype ( JABV) and Juquitiba virus genotype ( JUQV), respectively. T he species composition and the occurrence of hantavirus were not correlated to any vegetation type in two - year study . A clear patter n of higher hantavirus prevalence in seasons with higher reproductive activity, greater numbers of adult individuals and lower population size was observed for the hantavirus infected species ( A. serrensis , A. montensis , A. paranaensis , O. nigripes ). Incre ases in rodent abundance occurred in cooler months with higher numbers of younger individuals . These population patterns were also similar for Oxymycterus judex and Thaptomys nigrita . Spillover infections of A. montensis /JUQV, O. judex /JUQV, A. serrensis /J ABV, A. paranaensis /JABV and A. paranaensis /JUQV were observed. The spillover infections to secondary hosts took place during periods of low prevalence in the primary host, which suggest that secondary hosts may play an important role for maintaining JABV and JUQV sylvatic cycles. The spillover infection between A. serrensis and A. montensis is related to micro - habitat preferences of these species . The JABV infection in rodents is related to a lower abundance of A. serrensis and the occurrence of adult male rodents and A. montensis in the study areas
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Diversidade, diferenciação e biogeografia de pequenos mamíferos não-voadores na Mata Atlântica ao norte do rio São Francisco Centro de Endemismo Pernambuco / Diversity, differentiation and biogeography of non-volant small mammals of the Atlantic Forest north of São Francisco river - Pernambuco Endemism Center

Paulo Henrique Asfora Lopes Peres 30 August 2011 (has links)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / As florestas tropicais brasileiras (Amazônia e a Mata Atlântica) possuem alta diversidade de espécies e atualmente estão separadas por um cinturão de vegetação aberta. Parte deste cinturão é ocupada pela Caatinga, onde se encontram os Brejos de Altitude, testemunhos das conexões históricas entre a Mata Atlântica e a Amazônia. O Centro de Endemismos Pernambuco (CEPE) é a unidade biogeográfica que compõe a Mata Atlântica ao norte do rio São Francisco e contém diversos táxons endêmicos. Esta região apresenta uma mastofauna compartilhada com a Amazônia, devido às conexões existentes durante o Cenozóico. A presença do rio São Francisco em seu limite sul pode atuar como barreira ao fluxo gênico e explicar os endemismos encontrados no CEPE. Contrastando com sua situação peculiar, a mastofauna do CEPE ainda carece de estudos aprofundados sobre a identificação de suas espécies, padrões geográficos e relações filogenéticas. Revisões recentes têm identificado espécies diferentes ao norte e ao sul do rio São Francisco, mas poucos trabalhos têm proposto hipóteses biogeográficas para o CEPE. Para ampliar o conhecimento sobre a identidade e distribuição geográfica dos pequenos mamíferos do CEPE e sua estrutura filogeográfica, foram realizados levantamentos de espécies e análises de diversidade genética e morfométrica para algumas espécies. Os levantamentos consistiram de visitas às coleções científicas a fim de identificar as espécies ocorrentes no CEPE e excursões de coleta com 5 a 17 noites consecutivas em 12 localidades ao longo do CEPE, que totalizaram 64691 armadilhas noites e resultaram na coleta de 476 exemplares de 31 espécies. As espécies foram identificadas com base na morfologia externa e craniana e por análises citogenéticas. Para investigar a biogeografia do CEPE, análises de genética de populações, filogeográficas e morfométricas foram realizadas para os marsupiais Caluromys philander, Didelphis aurita, Marmosa murina, Metachirus nudicaudatus e os roedores Akodon cursor, Oecomys catherinae e Rhipidomys mastacalis para avaliar a existência de diferenciação nas populações do CEPE e suas relações com as linhagens Amazônicas e Atlânticas. Estes resultados mostraram que a diversificação dos pequenos mamíferos do CEPE ocorreu tanto no Terciário quanto no Quaternário. Algumas populações, como em Caluromys philander e Oecomys catherinae, mostraram afinidades com linhagens amazônicas, enquanto outras, como em Metachirus nudicaudatus e Rhipidomys mastacalis, apresentaram afinidades com linhagens atlânticas. Os pequenos mamíferos do CEPE apresentaram diferenciação em relação às suas linhagens irmãs, com algumas linhagens podendo tratar-se de espécies ainda não descritas (e.g. Didelphis aff. aurita e Rhipidomys aff. mastacalis). Esta diferenciação provavelmente foi causada pelos eventos cíclicos de flutuações climáticas que provocaram elevações no nível do mar e retração das florestas tropicais, isolando as populações do CEPE. Por fim, para auxiliar na identificação das espécies em novas coletas, de suas distribuições geográficas e de suas características citogenéticas e ecológicas, foi elaborado um guia reunindo todas as informações disponíveis sobre as espécies de pequenos mamíferos do CEPE. / The Brazilian tropical rainforests (Amazon and Atlantic Forest) present high species diversity and are currently separated by a belt of open and dry vegetation. Part of this belt is occupied by the Caatinga, where are found the Brejos de Altitude, evidence of the historical connections between the Atlantic Forest and the Amazon. The Pernambuco Endemism Center (CEPE) is the biogeographic unit of the Atlantic Forest located north of the São Francisco River and contains several endemic taxa. Part of its mammal fauna is shared with the Amazon, due to former connections in the Cenozoic. The presence of the São Francisco river in its southern limit may act as a barrier to gene flow and explain the endemism found in CEPE. In contrast to their peculiar situation, the mammalian fauna from CEPE still lacks detailed studies on its taxonomic composition, geographic patterns and phylogenetic relationships. Recent reviews have identified different species in the north and south of the San Francisco river, but few studies have proposed biogeographical hypotheses for the CEPE. In order to increase knowledge on the identity and geographical distribution of the small mammals in the CEPE and their phylogeographic structure, species surveys were carried out and the genetic and morphometric diversity of some of the species found were assessed. The surveys consisted of visits to scientific collections to identify the species occurring in CEPE and trapping trips, with 5 to 17 consecutive nights, in 12 sites throughout the CEPE, totaling 64,691 trap-nights, resulting in the collection of 476 specimens of 31 species. The specimens were identified based on external and cranial morphology and cytogenetic analysis. To investigate the biogeography of CEPE, genetics, phylogeographic and morphometric analysis were performed with the marsupials Caluromys philander, Didelphis aurita, Marmosa murina, Metachirus nudicaudatus and the rodents Akodon cursor, Oecomys catherinae and Rhipidomys mastacalis to assess the existence of differentiation in CEPE populations and their relationships with the Amazon and Atlantic Forest lineages. These results showed that diversification of small mammals in CEPE occurred in both the Tertiary and Quaternary. Some populations, such as Caluromys philander and Oecomys catherinae showed affinities with amazonian lineages, while others, like Metachirus nudicaudatus and Rhipidomys mastacalis, showed affinities with atlantic lineages. The small mammals from CEPE showed differentiation from their sisters lineages, with some lineages probably being, in fact, undescribed species (eg Didelphis aff. aurita and Rhipidomys aff. mastacalis). This differentiation was probably caused by cyclical events of climate fluctuations that led to sea level rises and retractions of the tropical forests, thus isolating the populations in CEPE. Finally, to help identifying species in future field surveys, their geographic distributions and ecological and cytogenetic features, a guide was prepared by gathering all available information on the species of small mammals from CEPE.
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ESTRUTURA DAS COMUNIDADES DE PEQUENOS MAMÍFEROS DE DUAS UNIDADES DE CONSERVAÇÃO (TAIM E ESPINILHO) DO BIOMA PAMPA, SUL DO BRASIL / SMALL-MAMMAL COMMUNITY STRUCTURE OF TWO CONSERVATION UNITS (TAIM AND ESPINILHO) IN THE PAMPA BIOME, SOUTHERN BRAZIL

Sponchiado, Jonas 23 February 2011 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The small-mammal community structure of two conservation unit (CUs), Taim Ecological Station (TES) and Espinilho State Park (ESP), of the Pampa biome in southern Brazil, was investigated and compared regarding species richness, composition and abundance. Additionally, a Deciduous forest area was compared with those ones. For this purpose, ten transects with live-traps pitfall traps were used. In addition, sixteen environmental variables were measured in the TES to verify the small-mammal micro-spatial distribution. During six field phases in each area, 11 species were capture at TES, while nine species were captured in the ESP. The two areas of the Pampa biome showed high species richness when compared to forested areas, since both are influenced by other biomes: TES by the Atlantic Forest, as it is close to the coastal region, and the ESP by the interior of the continent biomes, Chaco and Espinal. The abundance and composition were different due to environmental heterogeneity, biogeography effect, size areas and degree of disturbance. However, environmental heterogeneity allows both areas to have similar species richness. When compared with the Atlantic forest CU, they differ in species richness, composition and abundance of individuals due to greater homogeneity and complexity of the forested area. With respect to the microspatial distribution, species richness and abundance were associated with sites close to water, with greater availability of arthropods and herbs. Since there is great variability of environments at TES, the heterogeneity is primarily responsible for the variation in richness and abundance of small mammals among microhabitats. The analysis indicated a significant effect of environmental variables on species abundance, showing the selection of some environments more often than others. / A estrutura da comunidade de pequenos mamíferos de duas Unidades de Conservação (UCs), a Estação Ecológica do Taim (ESET) e o Parque Estadual do Espinilho (PEE), do bioma Pampa no sul do Brasil, foi investigada e comparada quanto à riqueza, composição e abundância de espécies. Adicionalmente, uma área de Floresta Estacional Decidual, foi comparada com essas duas. Para tanto, foram utilizadas transecções com armadilhas convencionais e de queda. Ainda, na ESET dezesseis variáveis ambientais foram mensuradas para verificar a distribuição micro-espacial de pequenos mamíferos. Durante seis fases de campo em cada área, 11 espécies foram capturadas na ESET, enquanto nove foram capturadas no PEE. As duas áreas do bioma Pampa apresentaram alta riqueza de espécies quando comparadas a áreas florestadas, já que ambas sofrem influência de outros biomas: a ESET da Mata Atlântica, por se situar na região costeira, e o PEE dos biomas do interior do continente, Chaco e Espinal. A abundância e a composição foram diferentes, devido à heterogeneidade ambiental, efeito biogeográfico, diferença no tamanho das áreas e grau de perturbação. Porém, a heterogeneidade ambiental permite que ambas as áreas possuam riqueza de espécies similar. Quando comparadas com a UC de Floresta Atlântica, diferem na riqueza, composição e abundância de espécies devido à maior homogeneidade e complexidade da área florestada. Com relação à distribuição micro-espacial, a riqueza e a abundância estiveram associadas a locais próximos à água, maior disponibilidade de artrópodes e herbáceas. Uma vez que existe uma grande variabilidade de ambientes na ESET, a heterogeneidade é a principal responsável pela variação na riqueza e abundância de pequenos mamíferos entre os microhabitats. As análises mostraram um efeito significativo das variáveis ambientais na abundância das espécies, evidenciando a seleção de alguns ambientes mais favoráveis em detrimento a outros.
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Estudo da comunidade e do fluxo gênico de roedores silvestres em um gradiente altitudinal de Mata Atlântica na área de influência da RST-453/RS-486 - Rota-do-Sol

Marinho, Jorge Reppold January 2003 (has links)
A RS 486 - Rota do Sol vem sendo motivo de polêmica desde o início da implantação da obra, em 1990. O fato de a estrada afetar um dos ecossistemas mais ameaçados no Brasil, a Mata Atlântica, somado a alguns problemas na condução das obras, que terminaram por levar ao embargo das mesmas, configuram a situação a ser enfrentada no presente trabalho. Ao longo do trajeto a estrada percorre vales e encostas da Reserva da Biosfera, na Serra Geral, apresentando grande variação altitudinal e secionando diversas comunidades vegetais de Mata Atlântica distintas estrutural e fisionomicamente. O levantamento da fauna de roedores silvestres foi realizado na área de influência da rodovia RST-453/RS-486, Rota-do-Sol, entre junho de 1997 e setembro de 2003, perfazendo um total de 14 expedições de amostragem. As coletas foram realizadas em três pontos dentro de um gradiente altitudinal, entre os municípios de Terra de Areia e Tainhas no estado do Rio Grande do Sul, onde foram reconhecidos três ambientes estrutural e fisionomicamente distintos. Estas localidades diferem em altitude e em formação vegetal estando assim distribuídas: Mata Paludosa, altitude 30 metros ─ S 29.30.392, W 050 06.422, Floresta Ombrófila Densa, altitude 350 metros ─ S 29 22.506, W 050 11.318 e Floresta Ombrófila Mista, altitude 780 metros ─ S 29 19.261, W 050 12.282 A estrutura genética de duas espécies de roedores silvestres (Oligoryzomys nigripes e Oryzomys russatus) foi analisada através de seqüências da região hipervariável do mtDNA por estimativa do fluxo gênico e da diferenciação genética entre as populações a partir do índice de diferenciação Gst. As espécies analisadas pertencem ao mesmo local, porém subdivididas em populações separadas pela fragmentação dos habitats. Estas espécies foram escolhidas devido à diferença na história de vida e utilização do habitat, características que influenciam suas respectivas estruturas populacionais e genéticas. Os resultados obtidos corroboram o padrão descrito para comunidades abertas onde poucas espécies são abundantes, espécies dominantes, e muitas são raras. A Mata Paludosa com 113 ha. apresenta diversos microambientes tendo apresentado a maior diversidade e abundância de roedores. Foi verificado um padrão de sazonalidade discreto para duas espécies: Akodon montensis — inverno nos três pontos de amostragem e Oligoryzomys nigripes — inverno na Floresta Ombrófila Densa. Os ciclos populacionais das espécies mais representativas em cada ponto foram de aproximadamente quatro anos. Os ciclos populacionais de Oligoryzomys nigripes acompanham os ciclos de Akodon montensis, via de regra com valores de captura inferiores. Delomys dorsalis, na Floresta Ombrófila Mista apresentou ciclo populacional mais longo com flutuação e Oryzomys russatus e Oligoryzomys flavescens apresentaram ciclos populacionais com períodos de inatividade maiores. As capturas de Delomys dorsalis e Euryzygomatomys spinosus na Mata Paludosa e Brucepatersonius iheringi na Floresta Ombrófila Mista caracterizam ampliação do registro de ocorrência. A Floresta Ombrófila Densa e a Floresta Ombrófila Mista apresentam maior correlação, tanto através de análise de Grupamento Hierárquico (capturas) como através de Análise de Correspondência Simples (freqüência). A freqüência de captura de Akodon montensis foi regular em todo gradiente, Delomys dorsalis, Oligoryzomys nigripes e Oryzomys russatus, aparentemente, selecionam de forma positiva um determinado tipo de formação vegetal. D. dorsalis e O. russatus, padrão de distribuição em gradiente. A utilização do marcador de uma região hipervariável do mtDNA indica que não há estruturação geográfica das populações nem um mecanismo de isolamento por distância, levantando a hipótese de que o gradiente altitudinal não tem influência na estruturação genética das populações de Oligoryzomys nigripes e Oryzomys russatus. Os resultados obtidos para Oligoryzomys nigripes e Oryzomys russatus — mtDNA — indicam uma distribuição que, se em gradiente, não apresenta relação com a altitude ou formação vegetal. Os padrões de abundância para as diferentes espécies, em cada local de captura, devem estar associados a fatores ecológicos independentes do isolamento por distância, formação vegetal e variação altitudinal.
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Biologia populacional e classificação etária do roedor subterrâneo Tuco-Tuco Ctenomys minutus Nehring, 1887 (Rodentia, Ctenomyidae) na planície costeira do Rio Grande do Sul, Brasil

Fonseca, Miriam Benicio da January 2003 (has links)
O roedor subterrâneo tuco-tuco Ctenomys minutus (Rodentia, Ctenomyidae) habita campos arenosos da Planície Costeira do RS. Esta espécie é uma das cinco existentes no Rio Grande do Sul (Brasil), ocorrendo desde o Farol de Santa Marta (SC) até São José do Norte (RS). O objetivo deste trabalho foi descrever a biologia populacional de C. minutus e desenvolver um método para classificação etária individual que utilize medidas corporais de fácil obtenção em campo. Foram realizadas 22 campanhas de amostragens em 14 meses em três locais de amostragem. Foram capturados 191 animais (73 machos e 118 fêmeas) e foram obtidas 39 recapturas ao longo do estudo. Os animais foram capturados com armadilhas Oneida Victor nº 0, anestesiados, marcados e soltos após serem tomadas medidas corporais de peso, comprimento total, comprimento da cauda e largura do dente incisivo. Durante os trabalhos, foram registradas evidências de atividade nas tocas, indicadas pelo bloqueio das aberturas das tocas após a colocação das armadilhas. Foi desenvolvido um método de classificação etária com base em diagramas de dispersão de pontos entre medidas corporais e sua associação com estado reprodutivo de fêmeas. Os resultados demonstram que a utilização de pelo menos duas medidas corporais, associadas às informações de estado reprodutivo permite a construção de um diagrama consistente com os dados biológicos obtidos em campo. Com base nesta constatação, é proposto o Diagrama de Classificação Etária que pode ser utilizado para quaisquer duas medidas, associado a dados de estado reprodutivo, podendo ser adaptado para outras espécies de tuco-tucos Entretanto, o método deve ser aperfeiçoado para machos, possivelmente a partir de informações sobre estruturas reprodutivas internas. As classes etárias utilizadas foram jovem, subadulto e adulto. As fêmeas foram classificadas quanto ao estado reprodutivo em não perfurada, perfurada, cicatrizada e prenhe. O estado reprodutivo de machos não foi determinado porque estes não possuem testículos aparentes. A população de C. minutus estudada foi composta por 84,8 % de adultos, 9,4 % de subadultos e 5,8 % de jovens, com razão sexual nas fases jovem e subadulta de 1:1 e na fase adulta de 0,5 machos:1 fêmea. Há uma época preferencial de acasalamento nos meses de inverno e de nascimentos no final do inverno e primavera. Entretanto, ocorrem indivíduos com atividade reprodutiva durante todas as estações do ano, porém em menor número. Ctenomys minutus atinge a maturidade sexual com aproximadamente seis ou sete meses de idade, com o comprimento do corpo por volta de 155 mm e a partir de 170 mm todos os indivíduos são considerados adultos. Os machos tendem a ser mais pesados que fêmeas de mesmo comprimento, principalmente a partir de 150 mm de comprimento de corpo. O tamanho aproximado de primeira maturação (início da fase adulta) é de 155 mm de comprimento do corpo Com dados de captura-marcação-recaptura foi demonstrado que esta espécie pode viver até aproximadamente três anos. Ctenomys minutus é uma espécie solitária, que compartilha as galerias somente para o acasalamento e durante o cuidado das crias. Aparentemente, os machos não participam do cuidado da prole, uma vez que somente fêmeas foram capturadas na mesma toca que jovens. O menor número mínimo de indivíduos na população de um local de amostragem foi de 20 indivíduos (setembro/2001) e o maior foi de 39 indivíduos (março/2002). A densidade absoluta encontrada em cada dia de amostragem foi de no mínimo sete indivíduos/ha (janeiro/2002) e de no máximo 15 indivíduos/ha (setembro/2002). Não foram detectadas diferenças sazonais no padrão de atividade (IAp), nem no número mínimo de indivíduos na população ou na densidade absoluta (indivíduos/ha) da população estudada.
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Variação morfométrica e citogenética em Kerodon rupestris (Wied, 1820) (Rodentia : Caviidae)

Giúdice, Gisele Mendes Lessa del January 2004 (has links)
Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2017-10-18T22:06:05Z No. of bitstreams: 1 634510.pdf: 6585594 bytes, checksum: aec406934c973a7c01d144219e678b61 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-18T22:06:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 634510.pdf: 6585594 bytes, checksum: aec406934c973a7c01d144219e678b61 (MD5) Previous issue date: 2004 / CAPES / Kerodon rupestris Wied, 1820) é uma espécie de caviídeo de grandes proporções corporais e portador de um habitat especialista dentro do grupo. Desde o Pleistoceno sua distribuição espacial está restrita à região semi-árida brasileira onde encontra-se confinado a afloramentos rochosos. Três abordagens metodológicas foram aqui adotadas para definir este padrão: 1) uma análise de variabilidade morfométrica craniana qualitativa e sexual dentro de uma população recente e uma sub-fóssil que posteriormente foi complementada por 2) uma análise geográfica, com base também em caracteres cranianos, de nove populações recentes distribuídas ao longo da distribuição geográfica da espécie, além da população de sub-fósseis e uma população de K. acrobata e 3) uma análise cariotíca comparativa entre três populações de K. rupestris. As evidências morfológicas e cariotícas sugerem que: a) ocorre uma variação geográfica significativa; b) morfologicamente, os espécimens sub-fósseis apresentam valores médios cranianos maiores do que os indivíduos recentes da mesma idade; c) ocorre uma variação clinal de incremento nas dimensões cranianas no sentido geográfico norte-sul entre as populações de K. rupestris estudadas; d) existe uma completa discriminação da população de K. acrobata no espaço multivariado dos caracteres morfológicos cranianos, não se sobrepondo ao cline encontrado em K. rupestris; e) há duas formas cromossômicas para K. rupestris manifestada por diferenças obtidas no número e na morfologia cromossômica; f) existe uma similaridade do bandamento-C entre as três populações de K. rupestris avaliadas g) a população de Botumirim, ao sul da distribuição de K. rupestris é a portadora do cariótipo até o momento conhecido, mais próximo da loclidade tipo definida por WIED 1820); e h) as características morfológicas e cariotípicas dos espécimes provenientes de Botumirim (MG) diferem das demais populações de K. rupestris estudadas. Para elucidar estas diferenças encontradas indicativas de uma complexidade de variação, será necessário a realização de novas análises, com um número maior de populações de K. rupestris ao longo da sua distribuição geográfica. / Kerodon rupestris Wied, 1820) is a specie of caviídeo bearer of great corporal proportions and considered a habitat specialist inside of the group. Since the Pleistocene this specie has had its space distribution restricted to the Brazilian semi-arid area where is confined to rock islands. Three methodological approaches were adopted to define this pattern: 1) a sexual and cranial qualitative morfometric variability analysis inside of a recent population and a sub-fossil that later on was complemented by 2) a geographical analysis, also based on cranial characters, of nine recent populations spread along the geographical distribution of the specie, besides the population of sub-fossils and a population of K. acrobat; and 3) a comparative karyotype analysis among three populations of K. rupestris. The morphological and karyotypes evidences suggest that: a) a significant geographical variation takes place; b) morphologically, the sub-fossils specimens present cranial medium values larger than the recent individuals at the same age; c) a clinal increment variation of cranial dimensions in geographical north-south direction, among the populations of K. rupestris studied occur; d) there is a complete discrimination in the population of K. acrobat in the multivariate space of the cranial morphologic characters, not putting upon to the cline found in K. rupestris; e) there are two chromosomic forms for K. rupestris manifested by the differences obtained in the number and in the chromosomal morphology; f) there is a similarity for C-Band among the three populations of K. rupestris appraised; g) the Botumirim population in the southern of K. rupestris distribution is bearer of the karyotype, so far known, closer of the locality type defined by WIED 1820); and h) the morphological and karyotypes characteristics of the specimens from Botumirim (MG) differ from other populations of K. rupestris studied. To elucidate these differences found, an indicative of a complexity variation, it will be necessary new analyses, with a larger number of populations of K. rupestris along its geographical distribution.
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Diversidade de espécies, variação cariotípica e distribuição dos roedores da Chapada Diamantina, BA

Souza, Ana Lazar Gomes e 02 1900 (has links)
Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2017-10-18T22:47:32Z No. of bitstreams: 1 633897.pdf: 13502617 bytes, checksum: 3ed829ad8ef2133cdafe46cf1bf47d48 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-18T22:47:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 633897.pdf: 13502617 bytes, checksum: 3ed829ad8ef2133cdafe46cf1bf47d48 (MD5) Previous issue date: 2005-02 / CAPES / A Chapada Diamantina é um vasto platô montanhoso localizada no interior do estado da Bahia, com altitudes variando de 400 a 2000m. Nenhum trabalho sistemático sobre a fauna de mamíferos englobando todo o gradiente latitudinal e longitudinal da Chapada Diamantina foi realizado até o momento. Seis coletas foram realizadas em 18 localidades diferentes entre Dezembro/2002 e Fevereiro/2004. Os espécimes foram capturados em armadilhas Sherman e pitfall, cariotipados, preparados e foram depositados no Museu Nacional, Rio de Janeiro. Também foram analisados espécimes anteriormente depositados na Coleção de Mamíferos do Museu Nacional. Um total de 19 espécies foram registradas, sendo que destas, 12 são novos registros para a região. Todas as espécies foram caracterizadas morfologicamente no nível craniano e da morfologia externa. As análises cariotípicas foram realizadas em 14 espécies, sendo que o número diplóide e fundamental foram dados para 18 espécies. As 19 espécies registradas podem ser separadas em três principais grupos em relação ao ambiente. O primeiro, mais amplo, encontrado em habitats de caatinga e agreste, o segundo, composto por espécies que frequentam ambientes mais florestados e o terceiro, característico de altitudes extremas como campos rupestres e formações rochosas. Um padrão de diversidade no gradiente latitudinal também foi observado. Cinco das 19 espécies registradas ocorrem somente em altitudes acima de 1000m. Considerando os roedores coletados neste estudo, a Serra do Sincorá (região central) e Morro do Chapéu (região norte) apresentaram a fauna de roedores mais diversa. Somando com as espécies anteriormente depositadas no Museu Nacional, a Serra do Sincorá passa a ser a mais diversa. Três áreas foram consideradas como potenciais para a preservação, sendo elas localizadas nos municípios de Mucugê e Palmeiras, na Serra do Sincorá e a região de Morro do Chapéu. / The Chapada Diamantina is a vast mountainous plateau in the interior of Bahia state, with altitudes varying from 400 to 2000m. No systematic mammal survey encompassing the total latitudinal and altitudinal ranges of the Chapada Diamantina was attempted so far. Six expeditions were performed in to a total of 18 different sampling localities, between December/2002 and February/2004. Specimens were captured in Sherman and pit-fall traps, karyotyped and prepared as vouchers deposited in the Museu Nacional, Rio de Janeiro. In addition, specimens previously deposited in mammal's collection in Museu Nacional were also analyzed. A total of 19 species of rodents was registered and 12 of them are new registers for the area. All species were characterized on the basis of cranial morphology and pelage coloration. Karyological studies were performed to 14 species but the diploid and fundamental numbers were given to 18 species recorded. The 19 species can be separated in three main groups. a more widespread one, proper of caatinga and agreste habitats, a second one, composed mainly by forms from more densely forested landscapes, and the third group, which usually occurs in altitudinal fields in the rocky outcrops of higher limits of the Chapada Diamantina. A pattern of latitudinal diversity was also observed. Five of the 19 species registered occurs only above 1000m. The Serra do Sincorá (central region) and Morro do Chapéu (north region) presented the most diverse rodents fauna, considering the specimens collected in our surveys. In addition with the species previously deposited in Museu Nacional, the Serra do Sincorá region is the most diverse. Therefore, three areas were considered as potentially areas for preservation in Chapada Diamantina: Mucugê and Palmeiras located in Serra do Sincorá and Morro do Chapéu.
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Variação craniana, bacular e citogenética em três populações de Thrichomys apereoides (Lund, 1839) (Rodentia: Echimyidae) do nordeste, centro e sudeste do Brasil

Silva, André Luiz Guedes da 06 1900 (has links)
Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-01-12T14:47:06Z No. of bitstreams: 1 656201.pdf: 8945602 bytes, checksum: 289b373a1e3a852f99cbb987c9674493 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-12T14:47:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 656201.pdf: 8945602 bytes, checksum: 289b373a1e3a852f99cbb987c9674493 (MD5) Previous issue date: 2005-06 / No gênero Thrichomys cinco descrições de espécies são reconhecidas, sendo que geralmente este gênero é considerado monotípico. Thrichomys apereoides (Lund, 1839) descrito de Lagoa Santa em Minas Gerais é um roedor echimídeo que difere da maioria dos roedores desta família por apresentar pelagem macia e cauda densamente pilosa. Em estudos recentes que enfocam a espécie, os resultados das análises já realizadas (morfométricas, citogenéticas e moleculares) sugerem que Thrichomys seja politípico. O objetivo deste estudo foi realizar análises morfológicas (crânio e báculo) e análise citogenética em três amostras populacionais de Thrichomys apereoides em Minas Gerais (Lagoa Santa, Matozinhos e Santana do Riacho) incluindo os espécimes coletados por Lund (1839), na Bahia (Morro do Chapéu, Mucugê, Palmeiras e Rio de Contas) e em Mato Grosso (Barão de Melgaço), visando compreender os limites morfológicos de possíveis unidades evolutivas independentes dentro do gênero Thrichomys. As análises qualitativa e quantitativa do crânio foram úteis na diferenciação das amostras. Estados de caracteres cranianos, Análise das Funções Discriminantes e Análise dos Componentes Principais discriminaram as amostras. A amostra da Bahia foi totalmente discriminada no eixo canônico principal 1 e parcialmente discriminada das demais amostras no componente principal 1. A análise bacular não discriminou as amostras. A análise citogenética apresentou cariótipos diferenciados: Minas Gerais com 2n = 28 e NF = 50; Bahia com 2n = 26 e NF = 48; Mato Grosso com 2n = 34 e NF = 64. A amostra de Minas Gerais é alocada a Thrichomys aperoides. A amostra da Bahia é alocada a Thrichomys inermis. A amostra de Mato Grosso é alocada a Thrichomys pachyurus. / Five nominal forms in Thrichomys has described, but this genera is currently regarded as monotypic. Thrichomys apereoides (Lund, 1839) described from Lagoa Santa (Minas Gerais) can be distinguished from other genera within the Echimyidae by its soft fur and densely-haired tail. Morphometric, karyological and molecular analysis in Thrichomys suggested that genera is politypic. The present study realized morphological (cranial and bacular) and Karyological analysis in three Thrichomys apereoides samples from Minas Gerais (Lagoa Santa, Matozinhos and Santana do Riacho) within specimens Lund ( 1839) collected, Bahia (Morro do Chapéu, Mucugê Palmeiras and Rio de Contas) and Mato Grosso (Barão de Melgaço) attempt to found independent evolutionary units. Qualitative and quantitative cranial analysis shows differences among the samples studied. Cranial traits conditions, Discriminant Functions Analysis and Principal Component Analysis discriminated the samples. The sample from Bahia has fully discriminated a1ong an axis CV 1 and parti11y discriminated along axis CP 1 . Bacular analysis not discriminated the samples. Karyological analysis discriminated the samples: 2n = 28 and FN = 50 from Minas Gerais; 2n = 26 and FN = 48 from Bahia; 2n = 34 and NF = 64 from Mato Grosso. Thrichomys apereoides is the oldest name the sample from Minas Gerais. Thrichomys inermis is the oldest name the sample from Bahia. Thrichomys pachyurus is the oldest name the sample from Mato Grosso.

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