O fenômeno do aumento global da temperatura é uma realidade inquestionável. Tendo em vista tal cenário, acredita-se que haverá uma expansão geográfica (migração de populações humanas) e um aumento na incidência de infecções tropicais. No entanto, a tendência de aumento da severidade destas infecções como função do aumento da temperatura ainda é desconhecida. Suponha que duas cepas de um dado parasita estejam competindo pelo mesmo hospedeiro. É possível mostrar que, em geral, a cepa com uma estratégia evolu- cionária estável, isto é, aquela que vence a competição, é aquela com maior valor de reprodutibilidade basal. Queremos saber quais combinações de temperatura ambiental T e virulência V maximizam Ro(T, V). Para isto calculamos o plano tangente ao ponto máximo (ou a uma região de máximo) e analisamos as respectivas curvas de nível. Para tanto, calculamos o seguinte sistema de equações diferenciais: ?Ro/?T = 0 ; ?Ro/?V = 0 (1). Agora, consideremos o caso de uma infecção transmitida por um vetor. De- monstramos que, neste caso, o aumento na Virulência do parasita está associada ao aumento na Temperatura. Esta hipótese é embasada por evidências empíricas de dengue hemorrágica em Singapura que vem aumentando sua virulência à medida em que há um aumento observado da temperatura local nos últimos anos. / The phenomenon of global increase of the temperature is reality unquestionable. In this case, it is expected that the increase in the global temperature will lead to an expansion of the geographical spread and to an increase in the incidence of tropical infections. However, the trend in severity of those infections as a function of the increase in the temperature is still unknown. Suppose that two strains of a given parasite are competing for the same host. It is possible to demonstrate that, in general, the strain with an evolutionary stable strategy, that is, the one that wins the competition, is the one with the highest value of R 0. We want to know which combination of environmental temperature T and virulence V maximizes R 0( V ). For this we calculate the tangent plane to the maximum point, that is ?Ro/?T=0 ; ?Ro/?V=0 (2) Now, let us consider the case of a vector-borne infection. We demonstrate, in this case, that the increase in temperature is associated with an increase in the parasite virulence. This hypothesis is supported by empirical evidence from dengue hemorrhagic fever in Singapore, which is increasing its virulence along with the increase in the local temperature observed in the last years.

Submitted by camilla martins (camillasmmartins@gmail.com) on 2016-12-13T13:25:05Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_CarimboCanalRetorno.pdf: 3013619 bytes, checksum: 8b15e2a109bce37be96c990d534d3870 (MD5) / Rejected by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br), reason: on 2016-12-15T12:07:14Z (GMT) / Submitted by camilla martins (camillasmmartins@gmail.com) on 2016-12-15T13:42:20Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_CarimboCanalRetorno.pdf: 3013619 bytes, checksum: 8b15e2a109bce37be96c990d534d3870 (MD5) / Rejected by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br), reason: on 2016-12-15T14:01:08Z (GMT) / Submitted by camilla martins (camillasmmartins@gmail.com) on 2016-12-15T14:26:04Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_CarimboCanalRetorno.pdf: 3013619 bytes, checksum: 8b15e2a109bce37be96c990d534d3870 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2016-12-19T14:06:09Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_CarimboCanalRetorno.pdf: 3013619 bytes, checksum: 8b15e2a109bce37be96c990d534d3870 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-19T14:06:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_CarimboCanalRetorno.pdf: 3013619 bytes, checksum: 8b15e2a109bce37be96c990d534d3870 (MD5) Previous issue date: 2006-12-15 / Esta tese de doutorado propõe um framework para controle e gerenciamento da rede de retorno da Televisão Digital a partir de quatro componentes: o Provedor de Televisão Digital, o Terminal Interativo, o Provedor de Canal de Retorno e o Provedor de Conteúdo. Juntos, interagem com base em um mecanismo de sinalização que propaga restrições de QoS associadas à programação interativa corrente pelo sistema de carrossel de dados. O conjunto também provê um sistema de admissão que investiga, periodicamente, a condição do canal de retorno autorizando ou restringindo acesso em função das necessidades das aplicações interativas. Também é flexível a ponto de viabilizar aplicações tanto em larga escala, quanto localmente uma vez que permite mobilidade ao gestor do serviço. Uma aplicação de e-gov/ehealth foi desenvolvida em Java XleTView para consolidar o desempenho do sistema. Realizou-se a avaliação utilizando técnicas de aferição e modelagem de acordo com a escala. Na última milha, avaliaram-se tecnologias de baixo custo e que não requerem tarifação periódica como é o caso de redes locais sem fio. Em escala maior, o sistema foi modelado e seu desempenho avaliado em diferentes cenários com auxílio do simulador de redes Network Simulator. / This doctoral thesis proposes a framework has controling and management the return network in Digital Television from four components: Digital Television Provider, Interactivity Terminal, Return Channel Provider, and Content Provider. Together, they interact based on a signaling mechanism that propagates QoS restrictions associated to the current interactive programming through the data carrousel system. The set of them also provide an admission control that investigates, periodically, the return channel status allowing or restricting the access according to the necessities of the interactive applications. Moreover, the system is so flexible that admit applications as in large scale as in small scale (local), thanks to the mobility of the service provider. An e-gov/e-health application was development in Xlet Java to evaluate the performance of the system. The performance analysis was proceeded using measurement and modeling techniques according to the system scale. In the last mille, some technologies of low cost and without periodically billing were tested such as wireless local area network. In large scale, the system was evaluated in different scenarios by means of simulation using the Network Simulator.

Submitted by camilla martins (camillasmmartins@gmail.com) on 2017-01-04T12:32:44Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_HidrogeradoraVirtualUtilizacao.pdf: 8137058 bytes, checksum: c5379d53f363f157f0471daff0e69c62 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-01-10T17:16:29Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_HidrogeradoraVirtualUtilizacao.pdf: 8137058 bytes, checksum: c5379d53f363f157f0471daff0e69c62 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-10T17:16:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_HidrogeradoraVirtualUtilizacao.pdf: 8137058 bytes, checksum: c5379d53f363f157f0471daff0e69c62 (MD5) Previous issue date: 2006-12-21 / Eletronorte - Centrais Elétricas do Norte do Brasil S/A / Esta dissertação apresenta a concepção, projeto e implementação de um ambiente educacional que usa técnicas de Realidade Virtual Desktop para estudo de uma planta industrial. O aplicativo utiliza modelos CAD das peças constituintes da planta organizados hierarquicamente e tem como base de dados documentos no padrão XML. Apresenta também uma área textual por meio da qual o usuário recebe informações sobre o que está sendo exibido no mundo virtual. Para o estudo de caso é utilizada a planta de uma Unidade Hidrelétrica de Energia. / This dissertation presents the conception, project and implementation of an educational environment that uses Virtual Reality Desktop techniques for study of an industrial plant. The application uses CAD models of plants constituent parts, hierarchically organized having as database documents in XML format. It also presents a textual area through which trainee receives information on what is being shown in virtual world. For case study the plant of a Hydroelectric Generating Unity is used.

CAPES / Esta tese propõe um novo algoritmo baseado em Sistemas Imunológicos Artificiais (SIA) para classificação hierárquica e multi-label, onde os classificadores gerados são representados na forma de regras SE-ENTÃO. A classificação hierárquica e multi-label é considerada desafiadora uma vez que um exemplo está associado a uma ou mais classes organizadas hierarquicamente, sendo que esta organização estrutural de classes deve ser considerada na construção dos classificadores. A técnica proposta aborda a construção de classificadores hierárquicos locais (onde cada classificador processa apenas exemplos de classes em uma região local da hierarquia) e globais (onde um único classificador processa exemplos de todas as classes ao mesmo tempo). A área de aplicação utilizada para validação desta tese foi a predição de função biológica de proteínas usando termos da ontologia gênica como classes a serem preditas pelo SIA. O desempenho do algoritmo é avaliado experimentalmente para 10 bases de proteínas. Os critérios de avaliação do algoritmo nos experimentos computacionais são a precisão preditiva (taxa de acerto e área da curva precision-recall) e a simplicidade do conhecimento descoberto (medida pelo número de regras e número total de condições nas regras descobertas). Os experimentos computacionais permitem identificar parâmetros e procedimentos que influenciam no desempenho da técnica proposta. Os testes comparativos com outras abordagens mostram que sobre alguns conjuntos de experimentos a abordagem proposta se mostrou superior, enquanto em outros conjuntos não foi possível superar a técnica da literatura usada para comparação. / This thesis proposes a new approach based on Artificial Immune System (AIS) for hierarchical multi-label classification, where the classifiers produced by the system are represented in the form of IF-THEN classification rules. Hierarchical multi-label classification is a challenging problem, because an example is associated with one or more classes organized into a hierarchy and the class hierarchy must be considered in the construction of the classifiers. The proposed method addresses the construction of local hierarchical classifiers (where each classifier processes only examples of classes in a local region of the hierarchy) and global hierarchical classifiers (where a single classifier processes examples of all classes at the same time). The application domain used to validate the proposed methods was the prediction of the biological function of proteins, using terms of the Gene Ontology as classes to be predicted by the AIS. The performance of the algorithm was evaluated in computational experiments with 10 datasets of proteins. The evaluation criteria in these experiments were the predictive accuracy (accuracy rate and the area under the precision-recall curve) and the simplicity of the discovered knowledge (measured by the number of rules and total number of conditions in the discovered rules). The computational experiments allowed the identification of parameter settings and procedures that significantly influence the performance of the proposed method. The experiments comparing the proposed method with other methods have shown that in some datasets the proposed method outperformed other methods, whilst in other datasets it was not possible to outperform other methods proposed in the literature.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. / Made available in DSpace on 2012-10-17T15:20:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0Bitstream added on 2013-07-16T17:52:03Z : No. of bitstreams: 1 176212.pdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / São inúmeros os benefícios trazidos pela utilização de computadores na execução de tarefas diárias. Cada vez mais, novos sistemas são criados com o intuito de prover soluções para os mais variados problemas. No ramo da música não é diferente. Atualmente, músicos vêm utilizando programas de computador para auxiliá-los em tarefas que vão desde a criação automática de partituras, até a composição de novas peças. Neste contexto, procuram-se desenvolver novas técnicas capazes de analisar e processar as ondas sonoras vindas de um instrumento da forma mais eficiente possível. Este trabalho se propõem a desenvolver uma metodologia para verificar se um instrumento musical está afinado. O método estatístico de autocorrelação é utilizado como dispositivo básico para detectar a freqüência e consequentemente altura do som. Devido a fatores apresentados durante o trabalho, em muitos casos, um som de mesma freqüência ao ser executado em dois instrumentos, pode soar afinado em um deles enquanto no outro não. Para evitar este problema, foram criados módulos especiais no sistema, para que as características específicas de cada instrumento pudessem ser consideradas, obtendo assim um melhor resultado.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Civil, Florianópolis, 2009 / Made available in DSpace on 2012-10-24T14:39:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 269220.pdf: 2196133 bytes, checksum: 93925260e165a3bb74448b2bcc1fa405 (MD5) / O aproveitamento de água pluvial para fins não potáveis em edificações é uma medida que proporciona a redução da demanda de água potável e a minimização de problemas relacionados à disponibilidade dos recursos hídricos. A eficiência dos sistemas de aproveitamento de água pluvial é afetada sobretudo pelo dimensionamento do reservatório de armazenamento. O dimensionamento adequado é essencial para evitar a operação do reservatório de forma ociosa quando superdimensionado ou insuficiente, quando subdimensionado. O objetivo principal deste trabalho é validar o algoritmo do programa computacional Netuno, utilizado para avaliar o potencial de economia de água potável e o dimensionamento de reservatórios para aproveitamento de água pluvial em edificações. Dados reais de consumo de água potável e pluvial, precipitação pluviométrica e da variação do nível de água no reservatório, foram obtidos junto a uma residência experimental localizada em Florianópolis. O monitoramento do sistema de aproveitamento de água pluvial da edificação ocorreu em quatro períodos distintos, totalizando 196 dias. Devido à ocupação variável da residência e, também, ao baixo consumo de água verificado em testes preliminares, foi necessário intervir na demanda de água pluvial, simulando a permanência constante de quatro moradores. Como referência para o cálculo da demanda diária de água pluvial, considerou-se uma demanda de água potável de 150 litros per capita por dia, e um percentual variando de 40 a 150% desta demanda conforme o período monitorado. Diariamente, descartou-se o volume correspondente à demanda de água pluvial através de um ponto de consumo dessa água. Uma versão modificada do algoritmo do programa Netuno foi proposta, onde a principal diferença em relação à versão original é a consideração do consumo de água pluvial antes da chuva. O estudo foi baseado em simulações computacionais para estimar o potencial de economia de água potável com os dados levantados em campo, considerando diferentes intervalos de tempo e as características físicas do sistema. Os resultados das simulações foram comparados à economia de água potável obtida através da utilização de água pluvial, para fins não potáveis, na residência estudada. As demandas médias de água pluvial efetivamente descartadas foram de 279, 293, 607 e 624 litros/dia, respectivamente, do primeiro ao quarto período monitorado. Os resultados do trabalho mostram potenciais de economia de água potável estimados pelo Netuno idênticos às economias obtidas na residência quando se dispõe de água em quantidade suficiente nos reservatórios, para atendimento integral da demanda de água pluvial. Por outro lado, quando não há água pluvial em quantidade suficiente para suprir a demanda, observam-se diferenças absolutas entre os potenciais estimados e as economias efetivas variando de 0,2 a 6,7%, para economias de água potável de 48,7 a 76,2%. A principal conclusão do trabalho é que o algoritmo do programa Netuno prediz adequadamente o potencial de economia de água potável obtido através do aproveitamento de água pluvial em edificações. / Rainwater use for non-potable purposes in buildings is a measure that provides the reduction of potable water demand and the minimization of problems related to availability of water resources. The efficiency of rainwater harvesting systems is affected mostly by the sizing of the storage cistern. The appropriate sizing is essential to avoid the superfluous room in the cistern when it is oversized; or insufficient room when it is undersized. The main objective of this research is to validate the algorithm of the Neptune computer programme, used to evaluate the potential for potable water savings and the sizing of cisterns for rainwater storage in buildings. Actual potable water and rainwater consumption, rainfall and variation of the water level in the cistern were obtained from an experimental house in Florianópolis. The monitoring of the rainwater harvesting system occurred in four different periods, totalling 196 days. Due to the variation of the house occupation, and also to the low water consumption verified in preliminary tests, it was necessary to increase the demand of rainwater, simulating the constant occupation of four residents. The daily demand of rainwater was taken as a percentage of the potable water demand, which was 150 litres per capita a day. Such a percentage was varied from 40 to 150% of the potable water demand, according to the monitored period. The volume corresponding to the rainwater demand was discarded daily. A modified version of the algorithm of Neptune was proposed, where the main difference in relation to the original version is the consideration of rainwater consumption before the rainfall. The study was based on computer simulations to evaluate the potential for potable water savings considering all data collected on site, considering different time intervals and the physical characteristics of the system. The results of the simulations were compared to the potable water savings obtained by using rainwater for non-potable purposes in the studied house. The average rainwater demands that were discarded were 279, 293, 607 and 624 litres a day, respectively, from the first to the fourth monitored period. The results of the study showed that the potential for potable water savings estimated by Neptune were identical to savings obtained in the house when there was enough rainwater in the cistern to fulfil the demand for rainwater. On the other hand, when there was not enough rainwater to supply the rainwater demand, absolute differences between Neptune results and the effective savings varied from 0.2 to 6.7%, for potable water savings ranging from 48.7 to 76.2%. The main conclusion obtained from the research is that the algorithm of the Neptune computer programme correctly predicts the potential for potable water savings by using rainwater in buildings.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia Civil. / Made available in DSpace on 2012-10-23T02:59:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Este trabalho apresenta uma análise do desempenho energético de edificações comerciais com base na influência da transmitância e da capacidade térmica das paredes externas e coberturas de edificações comerciais. A análise foi realizada através de simulação computacional, utilizando o programa EnergyPlus. Foram simulados casos com diferentes condições de carga interna, absortância solar externa, padrão de uso, razão de área de janelas nas fachadas, entre outros parâmetros; sempre analisando a influência destes em relação ao consumo anual de energia elétrica das edificações. Adotaram-se três climas: Florianópolis, Curitiba e São Luís. Foram adotadas duas tipologias sendo que a tipologia 1 representa um edifício de 5 pavimentos e a tipologia 2 uma loja comercial de 1 pavimento. Para analisar os ganhos e as perdas de calor dos componentes opacos da edificação realizou-se o cálculo do balanço térmico das edificações, o qual envolve os processos de condução, convecção e radiação. O sistema de iluminação, pessoas, equipamentos, condicionamento de ar e infiltração também fazem parte do cálculo do balanço térmico. Na análise dos casos observou-se que o aumento da transmitância térmica das paredes da tipologia 1 para todos os climas analisados proporcionou uma redução do consumo anual da edificação, principalmente para os casos simulados em conjunto com alta densidade de carga interna ou alto padrão de uso e com baixa absortância solar externa. Nos casos referentes à tipologia 2, notou-se que o aumento da transmitância térmica da cobertura representou um aumento do consumo anual da edificação para todos os casos simulados nos três climas adotados. Observa-se que os resultados encontrados para os valores de transmitância térmica contestam os limites adotados pela ASHRAE Standard 90.1, podendo estes limites ser excedidos uma vez que para os três climas analisados a utilização de uma parede com alto valor de transmitância térmica facilita a dissipação dos ganhos internos para o ambiente externo reduzindo o consumo do sistema de condicionamento de ar. Foram analisados os picos de carga do sistema de condicionamento de ar e o dimensionamento da potência da máquina calculada pelo programa EnergyPlus, que deve ser instalada nos ambientes para que estes permaneçam em condições de conforto. This work presents an analysis of the energy performance of commercial buildings as a function of the influence of thermal transmittance and thermal capacity of external walls and roof. Cases with different internal load densities, exterior absorptance, patterns of use, window to wall ratio and other parameters were simulated to analyze their influence on the annual energy consumption. The analysis was accomplished through computer simulation by using the EnergyPlus programme and weather files of Florianopolis, Curitiba and Sao Luis. Two architectural typologies were adopted: the typology 1 represents a building of a 5-storey office building and the typology 2 represents a 1 storey commercial store. To analyze the heat gain and loss through the opaque elements of buildings, heat balance calculation was utilized which involves the process of convection, conduction and radiation. The lighting system, people, equipment, air conditioning system and infiltration are also part of the calculation of the heat balance. Analyzing the cases were simulated and it was observed that increasing thermal transmittance of walls of typology 1 resulted in reduction of the building annual energy consumption, mainly for those cases with high internal load densities or high patterns of use and with low exterior absorptance. In those cases simulated using the typology 2, it was noticed that increasing the thermal transmittance of roof represented an increase of the annual consumption for all the cases. These results show that the limits adopted by ASHRAE Standard 90.1 can be exceeded as using high values of thermal transmittance in the walls of those weathers can help to dissipate the internal heat gain to the exterior, minimizing the air conditioning energy consumption. The peaks of the air conditioning consumption and its sizing which should be installed in the ambient to have a best comfort condition had been analyzed. xviii

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-10T18:44:12Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 437834 bytes, checksum: a9362b709e4bab8e60ce9fbd5d55af52 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-10T18:44:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 437834 bytes, checksum: a9362b709e4bab8e60ce9fbd5d55af52 (MD5) Previous issue date: 2002-02-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O presente trabalho utilizou dados simulados pelo programa GENESYS, com o objetivo de verificar o efeito das diferentes combinações de fatores de ponderação sobre características de alta, média e baixa herdabilidade, utilizando-se BLUP, seleção individual e índice de seleção. Nesse sentido, foi simulado um genoma constituído de três características quantitativas, governadas por 250 locos por característica, distribuídos em 20 pares de cromossomos de tamanho aleatório. A partir deste genoma, foi simulada uma população-base, constituída de 1.000 animais (500 machos e 500 fêmeas), considerando-se três características, com herdabilidades alta (0,60), média (0,30) e baixa (0,10). Dessa forma, a população inicial foi constituída de 10 machos, 100 fêmeas e 5 filhos/fêmea tomados ao acaso da população. Nesta população iniciou-se o processo de avaliações genéticas, utilizando os três métodos de seleção por 10 gerações de seleção. O processo de seleção foi repetido para cada método 10 vezes, com o propósito de avaliar o efeito da flutuação genética atribuída à amostragem gamética. Foram avaliadas as combinações de fatores de ponderação para as características de alta, média e baixa herdabilidade: 0,00-0,00-1,00; 0,05-0,05-0,90; 0,10-0,10- 0,80; 0,10-0,20-0,70; 0,20-0,30-0,50; e 0,33-0,33-0,34. Os resultados de ganhos fenotípicos para a característica de baixa herdabilidade, obtidos através do índice de seleção, revelou aumento de até 615% quando a seleção focalizou somente essa característica, características; de média e alta herdabilidade apresentaram perdas em seus ganhos fenotípicos de 97 e 92%, respectivamente. As variações observadas para ganhos e perdas por fixação de alelos favoráveis e desfavoráveis foram relativamente pequenas e atribuídas, possivelmente, às oscilações gênicas. Da mesma forma, a redução na variabilidade genética foi mais acentuada para as combinações estudadas ao final das 10 gerações de seleção. A seleção individual também apresentou acréscimos nos ganhos fenotípicos à medida que maiores valores foram atribuídos às características. Os valores fenotípicos observados foram altos para a característica de baixa herdabilidade quando o BLUP foi utilizado. A maior variação, de 445%, foi verificada entre as combinações 0,10-0,10-0,80 e 0,10-0,20-0,70. O estudo também revelou que grande parte dos ganhos fenotípicos na característica de baixa herdabilidade foi perdida para as demais características apenas pela perda de uma unidade no fator de ponderação para esta característica. Comparando os três métodos de seleção dentro de cada combinação de fatores de ponderação, verificou-se a superioridade do BLUP na maioria dos casos, para todas as características estudadas. / The data simulated by the “Genesys” program in the present study were used to verify the effects from different combinations of the weighing factors on the traits for high, medium and low heritabilities, by using the BLUP, individual selection, and selection index methods. So, a simulation was performed for a genome consisting of three qualitative traits each one governed by 250 loci distributed into 20 pairs of randomly sized chromosomes. A base-population constituted by 1.000 animals (500 males and 500 females) was simulated from this genome, by considering three traits with high (0.60), medium (0.30) and low (0.10) heritabilities. Thus, the initial population consisted of 10 males, 100 females and 5 offsprings/female randomly taken from the population. The genetic evaluation process was began in this population, by using those three selection methods for each 10 selected generations. The selection process was repeated 10 times for each method in order to evaluate the effects of the genetic fluctuations attributed to the gamete sampling. The combinations of the weighing factors, that is, 0.00- 0.00-1.00; 0.05-0.05-0.90; 0.10-0.10-0.80; 0.10-0.20-0.70; 0.20-0.30-0.50, and 0.33-0.33-0.34 were evaluated for the traits of high, medium, and low heritabilities. The results of the phenotypic gains for low heritability, obtained through selection index, showed an increase up to 615% when the selection focused only upon this trait, while the medium and high heritabilities presented losses of 97% and 92% in their phenotypic gains, respectively. The variation observed in the gains and losses by fixation of both favorable and unfavorable alleles were relatively low and probably is due to gene oscillations. After 10 selected generations, a higher reduction occurred in the genetic variability. The individual selection also presented increments in the phenotypic gains as higher values were attributed to the traits. High phenotypic values were observed for low heritability, when using the BLUP method. The highest variation (445%) was found among the combinations 0.10-0.10-0.80 and 0.10-0.20-0.70. This study also showed that a great part of the phenotypic gains in the trait of low heritability was lost for the other traits, just due to a lost unit in the weighing factor for this trait. When comparing those three selection methods within each combination of the weighing factors, the superiority of the BLUP method was shown in most cases for all studied traits. / Tese importada do Alexandria

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T19:09:41Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 372842 bytes, checksum: 12b29825980afde297d6a985988fe93c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T19:09:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 372842 bytes, checksum: 12b29825980afde297d6a985988fe93c (MD5) Previous issue date: 2005-02-14 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Foram simulados quatro distintos tipos de populações por meio do programa GENESYS com os objetivos de: verificar a influência do número de genes e do tamanho da população na estimação de componentes de variância e na predição de valores genéticos; verificar a adequabilidade do modelo infinitesimal como pressuposição nas análises genéticas; comparar as metodologias clássica e Bayesiana na análise genética de dados selecionados; e verificar a influência do nível de informação a priori ao utilizar metodologia Bayesiana. Dois processos seletivos foram aplicados por 10 gerações a partir da população-base formada por 120 (população pequena) ou por 2.400 indivíduos com registros (população grande): Seleção ao Acaso e Seleção Fenotípica. Foi considerado que dois diferentes números de genes governavam a característica sob seleção, para cada tamanho de população: 900 ou 10 pares de locos. Para as populações pequenas, foram realizadas 500 repetições de cada processo seletivo e para as populações grandes, 300 repetições. Na análise Bayesiana, três níveis de informação a priori foram considerados: não- informativo, pouco informativo e informativo. Os componentes de variância foram estimados utilizando-se somente a população-base, somente a população da 10a geração após seleção ou todas as populações, desde a população-base até a 10a geração após seleção. Os valores genéticos foram preditos para a população-base e para a 10a geração após seleção, considerando, porém, diferentes conjuntos de dados no processo de predição. A Porcentagem de Erro entre os componentes de variâncias estimados e os reais foi utilizada para comparar as metodologias, assim como as diferentes populações e gerações analisadas. Os valores genéticos, por sua vez, foram comparados por meio do Quadrado Médio do Desvio, da Porcentagem de indivíduos Selecionados em Comum entre os 15% melhores indivíduos e pela Correlação de Ordem entre os valores reais e preditos. Conforme os resultados obtidos, pôde-se concluir que quando a característica é governada por elevado número de genes, os componentes de variância genética aditiva e ambiental são satisfatoriamente estimados em populações selecionadas grandes ou pequenas pelas metodologias usuais, desde que os registros de todos os indivíduos e a matriz completa de parentesco sejam conhecidos. Por outro lado, quando a característica é governada por reduzido número de genes, estimativas menos acuradas do componente de variância genética aditiva são obtidas em populações grandes e, caso as informações de parentescos e registros anteriores sejam desconhecidos, o erro na estimação desse componente aumenta consideravelmente, em populações grandes ou pequenas. Verificou-se também que os valores genéticos são superestimados sob seleção fenotípica quando os registros de todos os indivíduos e a matriz completa de parentesco são incluídos nas análises, independentemente do tamanho da população. A queda na acurácia é ainda mais acentuada quando a característica é governada por reduzido número de genes, sendo a classificação correta dos indivíduos também prejudicada. A inclusão do registro de todos os indivíduos, assim como da matriz de parentesco completa beneficiam a classificação adequada dos indivíduos. Verificou-se também que o modelo infinitesimal não é adequado para ser utilizado como pressuposição nas análises genéticas quando a característica é governada por poucos genes, independentemente do tamanho da população. Ao comparar as metodologias REML e Bayesiana verificou-se que, em geral, essas metodologias produzem resultados bastante semelhantes na estimação dos componentes de variância. Para análises com menor quantidade de dados, no entanto, estimativas mais acuradas são obtidas ao se utilizar priors informativos por meio da análise Bayesiana. Concluiu-se também que a acurácia na predição dos valores genéticos, assim como a classificação dos indivíduos não são alteradas pelo nível de informação a priori das análises Bayesianas, cujos resultados também se assemelham aos da metodologia EBLUP. / Four different population types were simulated using GENESYS program with the following objectives: to verify the influence of the number of genes and the population size on variance component estimation and on breeding values prediction; to verify the infinitesimal model as an appropriate assumption on genetic analyses; to compare the classic and Bayesian methodologies on the genetic analysis of selected data; and to verify the influence of a priori information level in Bayesian methodology. Two selective processes were applied for 10 generations starting from base population formed by 120 (small population) or by 2,400 individuals with records (large population): Random Selection and Phenotypic Selection. It was considered that two different numbers of genes governed the trait under selection, for each population size: 900 or 10 pairs of loci. Five hundred repetitions of each selective process for small populations and three hundred repetitions were accomplished for large populations. On Bayesian analysis, three a priori information levels were considered: no-informative, slightly informative and informative. Variance components were estimated using only base population, only population of the 10 th generation after selection or all of populations, from base population up to 10 th selection generation. Breeding values were predicted for base population and for 10 th selection generation, considering, however, different groups of data on the prediction process. Error Percentage between estimated and real variance components was used to compare the methodologies, as well as the different populations and generations analyzed. Genetic values were compared using Average Square Deviation, Percentage of Common Individuals selected among the 15% better individuals and Rank Correlation among predicted and real values. According to the results, it was concluded that when the trait is xgoverned by high number of genes, the genetic additive and environmental variance component are well estimated by usual methodologies in large or small selected populations, since data of all animals and complete relationship matrix are known. On the other hand, when the trait is governed by reduced number of genes, less accurate estimates of additive genetic variance are obtained in large populations and, when relationship information and previous data are unknown, estimate errors of that component increase considerably, in large or small populations. It was also verified that breeding values are overestimated under phenotypic selection when data of all individuals and complete relationship matrix are included on analyses, independently of population size. Accuracy decrease is more accentuated when the trait is governed by reduced number of genes, being the correct classification of individuals also affected. The inclusion of all data, as well as complete relationship matrix benefit the appropriate classification of individuals. It was also verified that the infinitesimal model is not appropriate to be used as assumption in genetic analyses when the trait is governed by few genes, independently of population size. When comparing REML and Bayesian methodologies, it was verified that, in general, these methodologies produce similar results on variance components estimation. However, when analyses are performed with smaller amount of data, informative priors using Bayesian analysis yields more accurate estimates. Finally, accuracy of breeding values prediction, as well as the rank of individuals are not changed by a priori information level on Bayesian analyses, whose results are also similar to the EBLUP methodology.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-05T18:48:36Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 607753 bytes, checksum: 6c910f242adb58351c752e924cd83694 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-05T18:48:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 607753 bytes, checksum: 6c910f242adb58351c752e924cd83694 (MD5) Previous issue date: 2005-05-20 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Os objetivos deste estudo foram analisar, via simulação de dados, o efeito de diferentes pressuposições quanto à variância dos efeitos ambientais, frente a dados com determinada estrutura de variâncias, e verificar o comportamento de diferentes estratégias de análise frente ao desbalanceamento dos dados. Foram simulados dados referentes a um teste de progênie, do cruzamento de 30 progenitores masculinos com três genitores femininos diferentes cada um, onde cada cruzamento deu origem a dez indivíduos, distribuídos em três locais diferentes. O efeito fixo de local foi gerado de forma a não apresentar diferenças estatísticas significativas. Para cada indivíduo da prole foram geradas informações fenotípicas em cinco idades diferentes. Portanto, o arquivo de dados consistiu de 1020 indivíduos no total, sendo que 900 indivíduos apresentaram registros nas cinco idades, totalizando 4500 registros de produção. Para estudar o efeito da heterogeneidade das variâncias ambientais, em modelos de regressão aleatória adotou-se, modelos que ajustaram uma função polinomial de segundo grau para o efeito genético aditivo e de ambiente permanente e que ajustaram uma função polinomial apenas para o efeito genético aditivo foram analisados, considerando-se ou não a heterogeneidade da variância do efeito de ambiente temporário, gerando-se assim, quatro diferentes modelos de regressão aleatória. Além disso, os modelos de regressão aleatória, repetibilidade e multi-característica foram avaliados sob diferentes níveis de desbalanceamento dos dados. O modelo de regressão aleatória mais adequado foi aquele que considerou a heterogeneidade de variâncias dos efeitos de ambiente permanente e temporário. Assumir pressuposições incorretas sobre a estrutura de covariância dos efeitos aleatórios do modelo conduziu à alterações nas estimativas de componentes de covariância e nas estimativas dos parâmetros genéticos. Sob desbalanceamento sem seleção, todos os modelos apresentaram estimativas de herdabilidade bastante semelhantes aos resultados obtidos quando se considerou o conjunto de dados completos. Entretanto, quando se considerou o efeito da seleção, modelos de regressão aleatória com até 10% de desbalanceamento não promoveram alterações nas estimativas de componentes de variância. / The aim of this study was to analyze the effect of assuming different assumptions about environmental variance effects to data with certain variance structure, and verify genetic parameters estimates in different analysis strategies behind unbalanced data. A progeny test data was simulated, by crossing 30 male with three different female, where each crossing originated ten individuals, distributed in three different places. The fixed effect of place was generated in order not to present significant statistical difference. For each individual offspring, phenotypic information were generated in five different ages. Then, the data consisted in a total of 1020 individuals, in what 900 of them presented information in the five ages, computing 4500 observations of production. To verify the importance of consider or not the environmental heterogeneity of variance, in random regression models, models that adjusted a second polynomial function both for the additive genetic as for the permanent environmental effect and adjusted a polynomial function only for the additive genetic effect were analyzed, considering or not the variance heterogeneity of the temporary environmental effect, then generating four different random regression models. Moreover, the single-trait random regression model, the repeatability model and the multiple-trait model were analyzed on different lost of information levels. The most adequate random regression model was the one who considered both, the variance heterogeneity of permanent environmental effect, and the temporary environmental effect. Assuming the incorrect assumptions about the covariance structure of random effects of the model, conducted to change in the covariance components estimates and in the genetic ixparameters estimates. With incomplete data, without selection, all the models presented heritability estimates very similar to the results when complete data were considered. However, when effect of selection was considered, random regression models with less or equal to 10% of lost of information didn’t conduct to change in the covariance components estimates.