p. 1-144 / Submitted by Santiago Fabio (fabio.ssantiago@hotmail.com) on 2013-04-29T19:12:41Z No. of bitstreams: 1 88888888888888888.pdf: 1991557 bytes, checksum: 935c5a8ee336f8e4a6dfcb35cfa69802 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Creuza Silva(mariakreuza@yahoo.com.br) on 2013-05-04T17:37:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 88888888888888888.pdf: 1991557 bytes, checksum: 935c5a8ee336f8e4a6dfcb35cfa69802 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-04T17:37:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 88888888888888888.pdf: 1991557 bytes, checksum: 935c5a8ee336f8e4a6dfcb35cfa69802 (MD5) Previous issue date: 2011 / A utilização de técnicas para genotipagem de Mycobacterium tuberculosis possibilita um melhor entendimento da dinâmica de transmissão da tuberculose. Entretanto, há carência de investigações com esta abordagem no município de Salvador (BA), a fim de elucidar aspectos relacionados à ocorrência e manutenção da doença. Foi realizado um estudo transversal de base populacional para caracterizar e descrever a distribuição espacial de cepas de M. tuberculosis isoladas de casos bacilíferos residentes no município entre agosto de 2008 e dezembro de 2009. A captação dos dados sóciodemográficos foi realizada com a aplicação de questionário e amostras clínicas foram coletadas para isolamento do M. tuberculosis e enotipagem por RFLP IS6110 e spoligotyping. Um total de 326 casos foi analisado e 70 isolados (23,3%) formaram 27 clusters, enquanto 230 (76,7%) apresentaram perfis únicos. Alguns casos em cluster apresentaram diagnósticos realizados em meses subseqüentes e muitos clusters foram compostos por residentes em bairros limítrofes ou próximos e nos mesmos distritos sanitários. O 9° DS Cabula/Beiru apresentou a maior proporção de casos em cluster (34%), com associação estatisticamente significante em residir neste DS e cluster (RP = 1,61; IC 95%: 1,03 – 2,52). Sete famílias de M. tuberculosis foram identificadas: LAM (50,6%), Haarlem (10,7%), T (8,6%), X (7,4%), U (4,6%), S (0,3%) e EAI (0,3%), 57 (17,5%) isolados não puderam ser classificadas em famílias utilizando a base de dados SpolDB4. Observou-se um padrão diversificado na distribuição dos perfis genéticos de M. tuberculosis nos DS de Salvador, com maior concentração de casos nos bairros periféricos da cidade. Os dados apresentam um panorama preliminar sendo de interesse para a compreensão da epidemiologia da tuberculose. Concluímos que em Salvador há predomínio de uma população geneticamente diversificada de M. tuberculosis com circulação diferencial dos perfis e famílias genéticas nos diferentes espaços, indicando transmissão ativa de determinados perfis em áreas específicas. Sugere-se a realização de análise espacial mais refinada, com a integração de metodologias e dados de genotipagem e georeferenciamento. / Salvador

As pesquisas sobre comportamento animal possuem como objetivo identificar e quantificar sinais de sofrimento a fim de eliminar os problemas obedecendo às normas de bem-estar. As alterações destes comportamentos mostram as necessidades ambientais para sua sobrevivência. Em certos casos, apenas as mudanças comportamentais podem evidenciar uma situação de estresse. Quando há mudanças na temperatura do ambiente, os animais apresentam várias respostas para manter a temperatura do corpo, começando com a conservação máxima de energia como a inatividade. Duas das mais efetivas características do comportamento termorregulatório incluem seleção de ambiente e ajuste de postura. Técnicas de processamento e análise de imagens podem vir a colaborar com a busca de informações contidas em imagens de animais confinados. Métodos invasivos de quantificação de comportamento mostram que há interferência do experimentador nas reações dos animais, comprometendo os resultados da pesquisa. Este trabalho visou obter, através da Visão Computacional, informações quanto à distribuição espacial de aves poedeiras frente a situações de conforto e estresse térmicos. Foram analisadas seqüências de imagens em ambiente MATLAB 7.0 ® de dois grupos de 5 aves (Hy-line W36) com 21 semanas de idade em condições de conforto térmico (T= 26°C ± 2°C e UR= 60% ± 2%) e 5 aves em condições de estresse térmico (T= 35°C ± 2°C e UR= 70% ± 2%) controladas em câmara climática. As aves foram demarcadas com tintas não tóxicas na região dorsal. Através de técnicas de clusterização de cores e localização do centro geométrico das aves, foi possível analisar a freqüência destas nas regiões de ninho, comedouro, bebedouro, área livre e \"bebedouro + comedouro\", e através do uso de redes Neurais Artificiais, foi possível obter padrões de formas do corpo das aves e relacioná-los a alguns comportamentos. A distribuição espacial é um forte indício das necessidades do animal em diferentes condições evidenciando que a freqüência em algumas regiões pode ser um indicativo de desconforto. A técnica de processamento e análise de imagens mostra-se como um método confiável e livre de subjetividade ou influência da fadiga humana no auxilio da classificação da dinâmica dos animais confinados. Trata-se de uma forma eficiente de analisar imagens de forma rápida para se ter conhecimento da dinâmica dos animais confinados ao longo do tempo. A necessidade do animal é demonstrada através de freqüências em determinadas regiões de interesse para seu bem-estar. / The animal behavior researches have as objective identify and quantify suffering signals in order to eliminate the problems obeying the welfare norms. The alterations of these behaviors show the ambient necessities for the animals\' survivals. In certain cases, only the abnormal behaviors can evidence a situation of stress. When the environment temperature changes, the animals present some answers to keep the body\'s temperature constant, starting with the maximum conservation of energy as the inactivity. Two of the most effective characteristics of the thermoregulatory behavior includes environment selection and position adjustment. Image processing and analysis techniques can collaborate with the research of information contained in images of confined animals. Invasive methods of quantification of the behavior show that there is interference of the experimenter on the animal reactions compromising the research results. This work aimed to know, through the Computer Vision, information about the laying hens\' spatial distribution at the thermal comfort and stress situations. Image sequences of two groups of 5 birds (hy-line W36) aging 21 weeks in conditions of thermal comfort (T= 26°C ± 2°C and UR= 60% ± 2%) and 5 birds in conditions had been analyzed of stress thermal (T= 35°C ± 2°C and UR= 70% ± 2%) and controlled in climatic chamber. The birds had been demarcated with not toxic inks in the dorsal region. Through colors clusters techniques in MATLAB 7.0 ® and the localization of the geometric center of the birds, it was possible to analyze the frequency of these birds in the nest regions, feed through, water through, free area and \"water through + feed through\", and through of Artificial Neural Network was possible to have standards shapes of bodies birds and to refers to some behaviors. The spatial distribution is an important indicative fort of the animal necessities in different conditions evidencing that the frequency in some regions can be a discomfort indicative. The processing technique and analysis of the images reveals as a trustworthy method and free of subjectivity or of the fatigue human`s influence in support of the dynamics classification of the confined animals. It is about one of the efficient form to analyze the images to have a better understanding of the dynamics of the confined animals` dynamics throughout time. The necessity of the animal is demonstrated through frequencies in determined regions of interest for its welfare condition.

As pesquisas sobre comportamento animal possuem como objetivo identificar e quantificar sinais de sofrimento a fim de eliminar os problemas obedecendo às normas de bem-estar. As alterações destes comportamentos mostram as necessidades ambientais para sua sobrevivência. Em certos casos, apenas as mudanças comportamentais podem evidenciar uma situação de estresse. Quando há mudanças na temperatura do ambiente, os animais apresentam várias respostas para manter a temperatura do corpo, começando com a conservação máxima de energia como a inatividade. Duas das mais efetivas características do comportamento termorregulatório incluem seleção de ambiente e ajuste de postura. Técnicas de processamento e análise de imagens podem vir a colaborar com a busca de informações contidas em imagens de animais confinados. Métodos invasivos de quantificação de comportamento mostram que há interferência do experimentador nas reações dos animais, comprometendo os resultados da pesquisa. Este trabalho visou obter, através da Visão Computacional, informações quanto à distribuição espacial de aves poedeiras frente a situações de conforto e estresse térmicos. Foram analisadas seqüências de imagens em ambiente MATLAB 7.0 ® de dois grupos de 5 aves (Hy-line W36) com 21 semanas de idade em condições de conforto térmico (T= 26°C ± 2°C e UR= 60% ± 2%) e 5 aves em condições de estresse térmico (T= 35°C ± 2°C e UR= 70% ± 2%) controladas em câmara climática. As aves foram demarcadas com tintas não tóxicas na região dorsal. Através de técnicas de clusterização de cores e localização do centro geométrico das aves, foi possível analisar a freqüência destas nas regiões de ninho, comedouro, bebedouro, área livre e \"bebedouro + comedouro\", e através do uso de redes Neurais Artificiais, foi possível obter padrões de formas do corpo das aves e relacioná-los a alguns comportamentos. A distribuição espacial é um forte indício das necessidades do animal em diferentes condições evidenciando que a freqüência em algumas regiões pode ser um indicativo de desconforto. A técnica de processamento e análise de imagens mostra-se como um método confiável e livre de subjetividade ou influência da fadiga humana no auxilio da classificação da dinâmica dos animais confinados. Trata-se de uma forma eficiente de analisar imagens de forma rápida para se ter conhecimento da dinâmica dos animais confinados ao longo do tempo. A necessidade do animal é demonstrada através de freqüências em determinadas regiões de interesse para seu bem-estar. / The animal behavior researches have as objective identify and quantify suffering signals in order to eliminate the problems obeying the welfare norms. The alterations of these behaviors show the ambient necessities for the animals\' survivals. In certain cases, only the abnormal behaviors can evidence a situation of stress. When the environment temperature changes, the animals present some answers to keep the body\'s temperature constant, starting with the maximum conservation of energy as the inactivity. Two of the most effective characteristics of the thermoregulatory behavior includes environment selection and position adjustment. Image processing and analysis techniques can collaborate with the research of information contained in images of confined animals. Invasive methods of quantification of the behavior show that there is interference of the experimenter on the animal reactions compromising the research results. This work aimed to know, through the Computer Vision, information about the laying hens\' spatial distribution at the thermal comfort and stress situations. Image sequences of two groups of 5 birds (hy-line W36) aging 21 weeks in conditions of thermal comfort (T= 26°C ± 2°C and UR= 60% ± 2%) and 5 birds in conditions had been analyzed of stress thermal (T= 35°C ± 2°C and UR= 70% ± 2%) and controlled in climatic chamber. The birds had been demarcated with not toxic inks in the dorsal region. Through colors clusters techniques in MATLAB 7.0 ® and the localization of the geometric center of the birds, it was possible to analyze the frequency of these birds in the nest regions, feed through, water through, free area and \"water through + feed through\", and through of Artificial Neural Network was possible to have standards shapes of bodies birds and to refers to some behaviors. The spatial distribution is an important indicative fort of the animal necessities in different conditions evidencing that the frequency in some regions can be a discomfort indicative. The processing technique and analysis of the images reveals as a trustworthy method and free of subjectivity or of the fatigue human`s influence in support of the dynamics classification of the confined animals. It is about one of the efficient form to analyze the images to have a better understanding of the dynamics of the confined animals` dynamics throughout time. The necessity of the animal is demonstrated through frequencies in determined regions of interest for its welfare condition.

O peixe-boi marinho, Trichechus manatus manatus, à um mamÃfero com dieta herbÃvora, e distribuiÃÃo costeira em rios, estuÃrios e Ãguas litorÃneas da Zona Tropical brasileira. No Estado do Cearà ocorre em duas Ãreas distintas, no extremo dos seus setores leste e oeste. No litoral leste nÃo existe nenhuma Unidade de ConservaÃÃo com abrangÃncia marinha que restrinja os impactos causados ao meio ambiente e à populaÃÃo do peixe-boi, tais como urbanizaÃÃo, turismo e ocupaÃÃo de praias, dunas, falÃsias e manguezais. Sendo considerado pela UniÃo Internacional para ConservaÃÃo da Natureza como âespÃcie vulnerÃvelâ e estando inserido na Lista Oficial de EspÃcies da Fauna Brasileira AmeaÃadas de ExtinÃÃo de acordo com o IBAMA, corre risco de extinÃÃo extremamente alto num futuro prÃximo. Os objetivos desta DissertaÃÃo foram determinar a distribuiÃÃo espacial e padrÃes de uso da Ãrea, escolha da metodologia mais adequada ao monitoramento da populaÃÃo, e realizar levantamento das Ãreas de alimentaÃÃo e fontes e Ãgua doce provavelmente utilizadas pelos animais. A base de dados foi obtida atravÃs de prospecÃÃes aÃrea, realizada de junho/2003 a outubro/2004, totalizando 11 sobrevÃs e 24 horas de esforÃo de monitoramento, e nÃutica, realizada de agosto/2003 a novembro/2004, num total de 10 embarques e 157 horas de esforÃo de monitoramento. Dentre os mÃtodos de prospecÃÃo aÃrea e nÃutica, o primeiro gera erros devido à turbidez da Ãgua, e dificuldades de identificaÃÃo e contagem dos indivÃduos, enquanto o segundo, por sua maior proximidade em relaÃÃo aos animais, mostrou-se mais eficiente. O status da populaÃÃo do peixe-boi marinho foi avaliado atravÃs dos seguintes parÃmetros: (a) conservaÃÃo do habitat, com Ãnfase para a manutenÃÃo do territÃrio; (b) acesso a fontes de Ãgua doce e a Ãreas preferenciais de alimentaÃÃo e reproduÃÃo; (c) geraÃÃo de condiÃÃes ambientais Ãtimas para os cuidados parentais. Os fatores de ameaÃa de extinÃÃo nessa Ãrea estariam relacionados com reduÃÃo das fontes de alimento e Ãgua doce, assoreamento do Rio Jaguaribe, alÃm de captura acidental por aparelhos de pesca. Estes se traduzem nas seguintes conseqÃÃncias: reduÃÃo do habitat; aumento da frequÃncia de encalhes de recÃm-nascidos; aumento da mortalidade de adultos. A regiÃo de Picos, com destaque para o Banco dos Cajuais, foi definida como Zona de Alta Densidade, com padrÃo de distribuiÃÃo âaltamente agregadaâ por causa da abundÃncia de macroalgas e do menor fluxo de barcos motorizados. Dentre as recomendaÃÃes para se minimizar os riscos de extinÃÃo do peixe-boi, destacam-se: (a) desenvolvimento de campanhas educacionais que ressaltem aspectos importantes da conservaÃÃo do ambiente marinho; (b) reintroduÃÃo de espÃcimes em locais onde o declÃnio populacional à evidente; (c) criaÃÃo de unidades de conservaÃÃo com abrangÃncia marinha e aplicaÃÃo e fiscalizaÃÃo da legislaÃÃo pertinente ao habitat do peixe-boi e (d) monitoramento sistemÃtico da populaÃÃo no litoral leste para determinaÃÃo dos padrÃes ambientais que influenciam na ocorrÃncia do peixe-boi no municÃpio de IcapuÃ, litoral leste do CearÃ. / The Antillean manatee, Trichechus manatus manatus, is a mammal with an herbivorous diet and costal distribution in rivers, estuaries and inshore waters of the Brazilian Tropical Zone. In Cearà State, the species may found in the outermost ends of its western and eastern sectors. In the eastern sector there are no Marine Conservation Units to ward off impacts to the environment and the manatee population, such as urban development, tourism and occupation of beaches and mangrove forests. Manatees have been classified by the International Union for Nature Conservation as a âvulnerable speciesâ and included on the Official List of Endangered Species of the Brazilian Fauna. According to the Brazilian Institute for the Environment, it runs an extremely high risk of extinction in the near future. The objectives of this Thesis have been to determine the spatial distribution and patterns of usage of the living area, choice of the most appropriate methodology for population monitoring and mapping of feeding grounds and freshwater sources likely to used by the animals. The database was obtained by means of aerial surveys from June, 2003 to October, 2004, making up a 24-hour monitoring effort during 11 overhead flights, as well as nautical surveys performed from August, 2003 to November, 2004, making up a 157-hour monitoring effort during 10 voyages. Of the two prospecting techniques, the aerial one was less practical because of water turbidity, which made it difficult to identify and count manatee specimens, whereas the nautical one, because of its nearness to the targets, proved to the most efficient. The status of the Antillean manatee population was evaluated through the following parameters: (a) habitat conservation, with emphasis on territory maintenance; (b) access to freshwater sources and areas suitable for feeding and reproduction; (c) yielding of optimum environmental conditions for parental care. The threatened extinction in the studied area is related to factors such as decreasing of food and freshwater sources, silting-up of the Jaguaribe River, by-catch by trawl and gillnet fishing. The worrying outcome of such a scenario is likely to result in a reduction of the habitat size; increase in the straying of newborns plus an increase in adult mortality rates. The Picos region, specially the Cajuais sandbank, was defined as a High Density Zone, which displays a highly aggregate distribution because of seaweed abundance and smaller deployment of fishing boats. Among the suggestions for lowering the extinction risks of the Antillean manatee in Eastern Cearà State, the following ones stand out; (a) development of education campaigns which deal with the main aspects of environment preservation; (b) reintroduction of specimens in zones where population decline is evident; (c) installation of Marine Conservation Units and enforcement of the pertinent management measures and (d) constant monitoring of the population in the known habitat to determine environmental patterns which influence manatees in Icapuà county, eastern Cearà State.