Panicum coloratum es una especie C4 perenne originaria del Sur de África, que fue introducida a nuestro país en la década del 90´a partir de pocos eventos no debidamente registrados. A pesar de sus buenos atributos como forrajera ha sido escasamente difundida en los sistemas ganaderos. Sin embargo, existe hoy una tendencia a aumentar su uso debido a su potencial y a su adaptación a condiciones marginales que es donde se sitúa predominantemente la actividad ganadera en la actualidad. En los últimos años se han dado a conocer varios trabajos que estudian diversos aspectos del crecimiento y de la adaptación de la especie a estreses abióticos, a la vez que se han instituido planes de mejoramiento con el fin de obtener nuevos cultivares para afrontar la creciente demanda de esta especie. P. coloratum está constituida principalmente por dos variedades botánicas, var. makarikariense y var. coloratum. En esta tesis en particular se describe detalladamente las características morfo-fisiológicas de la var. makarikariense de una colección del INTA EEA Rafaela, y se la compara con una accesión de la var. coloratum de la misma colección. Esta información sumada a la caracterización de la variación molecular presente en la colección son de suma importancia para la conservación de los recursos genéticos presentes en la colección a la vez que resultan muy informativos para el planteo de estrategias a seguir en el programa de mejoramiento que se está siguiendo en INTA. En el desarrollo de esta tesis se trabajó con cinco accesiones, 15 materiales clonales y un material comercial de la var. makarikariense y una accesión de la var. coloratum que se estudiaron utilizando descriptores fenotípicos asociados a producción de forraje y semillas y marcadores moleculares ISSR y SSR. Se identificaron accesiones superiores en cuanto a su potencial forrajero y de producción de semillas, con rendimientos en algunos casos por encima del material comercializado en el país. La variabilidad genética encontrada por medio del uso de marcadores ISSR y SSR tanto dentro como entre accesiones, se visualizó a través de bandas y alelos únicos por accesión. Con respecto al material actualmente comercializado en el país, la variabilidad genética existente, nos indicaría que se trata de una población estabilizada que no ha sido objeto de procesos de selección definidos. La accesión de la var. coloratum fue diferenciada morfológica y genéticamente de la var. makarikariense, detectándose loci y alelos que diferencian ambas variedades. La baja correlación entre la distancia morfológica y molecular indicaría que cada set de datos provee información diferente y complementaria para la caracterización y evaluación de los materiales. Dentro de la var. makarikariense, se encontraron accesiones que difieren entre sí y en sus niveles de diversidad, pudiéndose tratar de materiales que han sufrido algún proceso de diferenciación. La evaluación del número cromosómico y modo reproductivo de los materiales, mostró que se trataría de accesiones tetraploides. Por otra parte, la diferenciación en cuanto a la producción de mayor número de semillas llenas con respecto a vanas y la supervivencia diferencial de las plántulas cuando las semillas se obtienen bajo polinización libre en comparación a la autofecundación, asegura que se trata de una especie cuyo modo reproductivo preferencial es la alogamia. El análisis de test de progenie con marcadores SSR mostró que el 100% de la progenie presenta recombinación genética y el 83% presenta alelos paternos, lo que refuerza las evidencias sobre la naturaleza principalmente alógama de la especie. Las estimaciones de los componentes de varianza sobre familias de medias hermanas mostraron que más del 80% de la variación reside dentro de familias mientras que sólo una baja proporción de la variación estaría entre familias. Asimismo fue posible diferenciar entre familias de medias hermanas para varios de los caracteres evaluados. Se lograron hacer estimaciones de heredabilidad, aunque las mismas resultaron en general con valores moderados a bajos. Estas estimaciones se utilizaron para predecir ganancias genéticas a obtenerse después de un ciclo de selección con una presión del 15% en caracteres morfo-fisiológicos asociados a producción de forraje y semillas. Los métodos utilizados para estimar heredabilidad mostraron similar tendencia entre variables y una concordancia entre ellos, lo que nos indicaría que cualquiera de ellos sería un método apropiado para la estimación de estos parámetros. Se estudiaron relaciones entre caracteres, coheredabilidades y ganancias por selección indirecta entre rasgos relacionados que pudieran ser útiles en programas de selección. Estos resultados adicionan nuevos conocimientos sobre la diversidad genética, biología reproductiva y niveles de ploidía en materiales disponibles de P. coloratum, brindan información pertinente a la vez que abren nuevas perspectivas para el programa de mejoramiento de la especie lo que permitirá la planificación y desarrollo de metodologías de cruzamientos y de utilización de los materiales para ser manipulados de forma práctica y eficiente.

Under hösten 2022 trädde nya skrivningar i gymnasieskolans läroplan i kraft. Dessa skrivningar gäller bland annat området sexualitet, samtycke och relationer som nu ska inkorporeras i skolans alla ämnen, däribland svenskämnet. Det saknas dock tydliga direktiv från Skolverket för hur detta arbete ska ske i svenskämnet. Syftet med uppsatsen var att undersöka hur Margaret Atwoods roman Penelopiaden (2005) gestaltar sexualitet, samtycke och relationer (SSR) och vilken didaktisk potential romanen har kopplat till SSR med utgångspunkt i critical literacy. Först genomfördes en kvalitativ textanalys som undersökte hur sexualitet, samtycke och relationer gestaltades i romanen. Sedan följde en didaktisk analys som i sin tur undersökte hur romanen skulle kunna användas inom svenskämnet för att utveckla elevers kritiska förhållningssätt. Den kvalitativa textanalysen visade att Penelopiaden skildrar SSR på olika sätt exempelvis genom att beröra brist på samtycke, tabu kring kvinnors sexualitet, maktobalans samt könsmönster. Den didaktiska analysen, med utgångspunkt i resultaten från den litterära analysen, visade i sin tur att läsning av romanen tillsammans med kritiska frågor ger goda möjligheter att utveckla elevers kritiska förhållningssätt och diskutera teman inom SSR.

Los objetivos de esta tesis son estudiar el comportamiento y el control genético de diferentes caracteres relacionados con la resistencia al encamado del arroz, así como parámetros de calidad del grano, en dos poblaciones que comparten el mismo parental femenino, y en dos condiciones de cultivo: las balsetas en que generalmente se realiza la selección de las primeras generaciones segregantes, y parcelas de campo; y analizar si es posible aumentar la eficiencia en la selección de estos caracteres: idoneidad de la selección en F2 e identificación de las regiones cromosómicas más importantes en la determinación de estos caracteres, y que puedan ser apropiadas para un programa de selección asistida por marcadores (M.A.S.). Para ello se ha realizado un análisis cuantitativo (estimas de heredabilidad, correlación entre caracteres y eficacia de selección), y un análisis de QTLs (loci que controlan los caracteres cuantitativos). En el genotipado de las poblaciones se han utilizado marcadores de tipo SSR. Se han identificado y caracterizado los loci implicados en el control genético de cada uno de los caracteres, y se han comparado su estabilidad y efectos en los diversos genotipos y ambientes. En muchos casos, se detectaron QTLs que afectan simultáneamente a varios caracteres, en coincidencia con las correlaciones encontradas entre los mismos caracteres. Se han localizado zonas de especial interés que podrían ser utilizadas para M.A.S. (selección asistida por marcadores). La selección fue efectiva para reducir la altura y aumentar el grosor y la longitud de los entrenudos basales en las dos poblaciones, y para incrementar del número de panículas y la resistencia al doblado en una de las poblaciones. / Torró Torró, I. (2010). Análisis de los factores que determinan la resistencia al encamado y características de grano en arroz (Oryza sativa L.), y su asociación con otros caracteres, en varias poblaciones y ambientes: bases genéticas y QTLs implicados [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/9317

Las enfermedades de etiología viral destacan por ser el principal factor limitante de las hortalizas. La estrategia más eficaz para el control consiste en la identificación de genes de resistencia y el posterior desarrollo de variedades resistentes. El principal objetivo de esta tesis se centra en el aprovechamiento y la caracterización de la variabilidad genética de las especies cultivadas del género Capsicum (C. annuum, C. chinense, C. frutescens, C. baccatum y C. pubescens). Se ha puesto a punto una plataforma de EcoTILLING que permite un cribado eficiente de la colección de entradas de Capsicum del Banco de Germoplasma del COMAV. Esta plataforma se exploró para la búsqueda de variantes alélicas de los genes eIF4E y eIF(iso)4E, implicados en la resistencia a virosis. Una colección de 31 entradas que representan distintas combinaciones de los alelos eIF4E y eIF(iso)4E se inocularon mecánicamente con el Potato virus Y (PVY) y el Tobacco etch virus (TEV). Cinco nuevas variantes del gen eIF4E (pvr210, pvr211, pvr212, pvr213, pvr214) están relacionadas con la respuesta de resistencia al PVY y al TEV. Diez microsatélites y cuatro combinaciones de AFLPs se utilizaron para caracterizar 260 entradas del género Capsicum. Se detectó la existencia de cierta estructuración intraespecífica relacionada geográficamente. C. baccatum y C. pubescens muestran un par de grupos genéticos, por un lado están las entradas procedentes de Bolivia y por el otro las entradas de Ecuador y Perú. Además, las entradas de C. chinense procedentes de Perú pudieron ser diferenciadas del resto. En este estudio las entradas de Ecuador y Perú han mostrado una diversidad elevada y similar a las de Bolivia, el cual es un importante centro de diversidad del género Capsicum. Por tanto, las entradas procedentes de estos países podrán constituir fuentes importantes de variación para ser utilizadas en los programas de mejora del pimiento. / Ibiza Gimeno, VP. (2011). Nuevas herramientas en la lucha contra las virosis del pimiento [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/11549

Tesis por compendio / [ES] La rehabilitación de las redes de drenaje es uno de los procesos fundamentales que los administradores y responsables de la gestión de redes de drenaje deben implementar para adaptar las redes defectuosas a los efectos adversos del cambio climático y la urbanización. Las soluciones tradicionales pasan por la sustitución de tuberías o la instalación de tanques de tormenta (TT). En esta tesis, el escenario propuesto combina la sustitución de tuberías y la instalación de TT para la rehabilitación de redes de drenaje. Los resultados de varias simulaciones en varias redes mostraron que el uso combinado de la sustitución de tuberías y la instalación de TT en la rehabilitación de redes de drenaje proporciona mejores resultados que la separación de los dos escenarios de rehabilitación. Tal metodología de rehabilitación necesita un tiempo de computación elevado para proporcionar soluciones aceptables que a menudo se encuentran atrapados en mínimos locales. El objetivo de esta tesis es proponer una metodología que permita obtener mejores resultados durante la rehabilitación de redes de drenaje considerando el uso combinado de la sustitución de tuberías y la instalación de TT. La metodología debe considerar la reducción del espacio de búsqueda (SSR). Cuatro opciones claves están combinadas para lograr reducir el espacio de búsqueda del problema. Estas opciones son: Reducir la cantidad de nudos en los que podrían instalarse los TT. Reducir el número de líneas en las que podría haber un cambio en el diámetro Reducir la discretización que se hace de la sección de cada uno de los TT. Reducir el número de diámetros candidatos en las tuberías. Una vez que se reduce el espacio de búsqueda, el algoritmo pseudo genético (APG) utilizado en esta tesis para la optimización mono-objetivo puede explorar más partes del espacio de búsqueda en menos tiempo. Lo que resulta es la obtención de mejores resultados. Por la optimización multiobjetivo, el NSGA-II utilizado puede proporcionar frentes de Pareto rápidamente para los diferentes escenarios considerados después del proceso de optimización. El objetivo general se dividió en objetivos específicos que se detallan a continuación: El primer objetivo específico consiste en formular un problema de optimización que verifique que la rehabilitación teniendo en cuenta la instalación de los TT y la sustitución de las tuberías proporciona mejores resultados que cualquiera de las dos estrategias implementadas por separado. Evaluar adecuadamente las funciones de costes utilizadas para formar las funciones objetivo constituye el segundo objetivo específico. Los diferentes costes considerados son: costes de sustitución de tuberías, costes de instalación de TT y costes de daños por inundación. El tercer objetivo específico es desarrollar un modelo de rehabilitación considerando la instalación de TT y la sustitución de tuberías, basado en APG y el Modelo SWMM. Los costes de inversiones y los costes de daños por inundaciones no se pueden sumar debido a sus tipos. Los costes de inversiones son reales mientras que los costes de daños por inundaciones son futuribles, dependen de la probabilidad de ocurrencia de la lluvia. Por lo tanto, el cuarto objetivo específico de esta tesis es proponer un algoritmo multiobjetivo evolucionario para la rehabilitación de redes de drenaje considerando la instalación de TT y la sustitución de tuberías. Para la optimización de un mono objetivo y multiobjetivo, el tiempo de cálculo es elevado. También las soluciones objetivas estaban atrapadas en mínimos locales. El quinto objetivo es proponer una metodología de reducción del espacio de búsqueda (SSR) para resolver este problema. El sexto objetivo específico consiste en llevar a cabo un análisis de sensibilidad para verificar los efectos del SSR en el resultado final del proceso de optimización. Por lo tanto, se seleccionaron diferentes tamaños de poblac / [CA] La rehabilitació de les xarxes de drenatge és un dels gestors de processos fonamentals i la necessitat responsable d'implementar per adaptar les xarxes defectuoses als efectes adversos del canvi climàtic i la urbanització. A la literatura, la installació de canonades o substitució de canonades són els dos escenaris presentats pels autors. En aquesta tesi, un tercer escenari proposa combinar la installació de canonades de substitució i tancs de tempesta (TT) per a la rehabilitació de xarxes de drenatge. Els resultats de diverses simulacions a diverses xarxes van mostrar que la combinació d'ús de canvis de substitució de canonades i TT a la rehabilitació de xarxes de drenatge proporciona millors resultats que la separació dels dos escenaris de rehabilitació. Desafortunadament, aquesta metodologia de rehabilitació requereix temps de càlcul elevat per proporcionar solucions acceptables que sovint es troben en mínim local. L'objectiu d'aquesta tesi és proposar una metodologia que permeti reduir el temps de càlcul i obtenir millors resultats durant la rehabilitació de la xarxa de drenatge considerant l'ús combinat de la instal·lació dels TT de substitució de canonades. L'estratègia adoptada combina, en una metodologia estructurada, quatre opcions clau per reduir l'espai de cerca del problema: Reduir el nombre de nodes en què podrien instal·lar-se els TT. Reduir el nombre de línies en què podria haver-hi un canvi de diàmetre Reduir la discretització que es fa de la secció de cadascun dels TT. Reduir la quantitat de diàmetres candidats à les canonades. Un cop reduït l'espai de cerca, l'algorisme pseudo-genètic (PGA) que s'utilitza en aquesta tesi per a l'optimització d'un únic objectiu (SO) pot explorar fàcilment l'espai de cerca en menys temps, resultant en obtenir millors resultats. Per a l'optimització del MO, la NSGA-II pot proporcionar fronts de Pareto ràpidament per als diferents escenaris considerats després del procés d'optimització. L'objectiu general es va a dividir en objectius específics detallats a continuació: El primer objectiu específic consisteix a formular un problema d'optimització que verifiqui que la rehabilitació considerant la instal·lació de TT i la seva substitució proporciona millors resultats que qualsevol de les dues estratègies implementades per separat. Valorar adequadament les funcions de cost que s'utilitzen per formar les funcions objectives, i constitueix el segon objectiu específic. Els diferents costes considerats són: Costes d'inversions i costes de danys a les inundacions. El tercer objectiu específic és desenvolupar un model de rehabilitació considerant la instal·lació de TT i la substitució de canonades, basant-se en el PGA i el model SWMM. Els costos d'inversions i els costos de danys per inundacions no es poden sumar a causa d'un tipus. Els costes d'inversions són reals mentre els costes d'anuncis per a les futures fonts del futur són dependents de la probabilitat d'obertura de la pluja. Per tant, el cos objectiu específic d'aquesta tesi és propiciar un algorisme multiobjetiu evolutiu per a la rehabilitació de la xarxa de navegació considerant la instal·lació de TT i la substitució de tuberies. Per a l'optimització d'un únic objectiu i multi-objectiu, el temps de càlcul s'eleva. També es va sospitar que les solucions objectives eren atrapades en els mínims locals. El cinquè objectiu és proposar una metodologia de la reducció de l'espai de cerca (SSR) per resoldre aquest problema El sisè objectiu específic consisteix a realitzar una anàlisi de sensibilitat per verificar els efectes de SSR sobre el resultat final del procés d'optimització. Per tant, es van seleccionar diferents grandàries de població i valors de criteris de parada i es van realitzar simulacions per a diferents configuracions. El setè objectiu específic d'aquesta tesi és proposar una nova metodologia de rehabilitació considerant la tècnica / [EN] Drainage networks rehabilitation is one of the fundamental process that managers and responsible need to implement to adapt defective networks to climate change and urbanization adverse effects. In the literature, pipes substitution or storm tanks (STs) installation are the two scenarios presented by authors. In this thesis, a third scenario proposed combine pipes substitution and STs installation for drainage networks rehabilitation. Results of several simulations on various networks showed that the combine use of pipes substitution and STs installation in drainage networks rehabilitation provides better results than separation of the two rehabilitation scenarios. Unfortunately, such rehabilitation methodologies are computationally time consumers. They need much time to provide acceptable solutions which are often caught up in local minima. The aim of this thesis is to propose a drainage networks rehabilitation methodology based on the combine use of pipes substitution and STs installation. The methodology considers search space reduction (SSR) technique. The adopted strategy combines in a structured methodology four key options aiming at reducing the search space (SS) of the problem: Reduce the number of nodes in which STs could potentially be installed. Reduce the number of lines in which there could potentially be a change in diameter Reduce the discretization that is made of the section of each of the STs. Reduce the number of candidate diameters in the pipes. Once the search space is reduced, the pseudo genetic algorithm (PGA) used in this thesis for single objective (SO) optimization can easily explore the search space in less time resulting in the obtention of better results. For the MO optimization, the NSGA-II can provide rapidly Pareto fronts for the different considered scenarios after the optimization process. The general objective was divided in specific objectives detailed as follow: The first specific objective consists of formulate an optimization problem that verifies that rehabilitation considering STs installation and pipes substitution provides better results than any of the two strategies implemented separately. Adequately assess the cost functions used to form the objective functions constitutes the second specific objective. The different costs considered are: Investments costs and flood damage costs. The third specific objective is to develop a rehabilitation model considering STs installation and pipes substitution, based on PGA and the Storm Water management Model. Investment costs and flood damage costs could not be summed due to their types. Investment costs are reals while, flood damage costs depend on the rainfall probability. So, the fourth specific objective of this thesis is to propose a MOEA for drainage networks rehabilitation considering STs installation and pipes substitution. For SO and Multi-objective (MO) optimization, the computation time is elevated. It was also suspected that the objective solutions were caught up in local minima. The fifth objective is to propose an SSR methodology to solve this issue The sixth specific objective consist of carry out a sensitivity analysis to verify the effects of the SSR on the final result of the optimization process. So, different population sizes and stop criteria values were selected and simulation for different configurations were performed. The seventh specific objective of this thesis is to propose a new rehabilitation methodology considering SSR technique for MO optimization. For each specific objective presented in this thesis, an application to a drainage network has been made and the obtained results were satisfactory. A simple network was used to apply the simple optimization methodology based on PGA algorithm A medium size network was used to apply the SO optimization, the MO optimization and the SSR methodology. Finally, a large and mesh network was used to apply the MO optimization methodology considering SSR. / Ngamalieu Nengoue, UA. (2019). URBAN DRAINAGE NETWORK REHABILITATION CONSIDERING STORM TANK INSTALLATION AND PIPE SUBSTITUTION [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/129869 / Compendio

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Sunflower (Helianthus annuus L.) high oleic acid content lines differ from conventional sunflower by an increase in oleic acid (C18:1) content of more than 60%. The current sunflower cultivars under production in South Africa are standard sunflower with high levels of linoleic acid (C18:2). The aim of this study was to improve the quality of oil produced by local sunflower germplasm with respect to oleic acid through employing a marker-assisted breeding technique to facilitate and speed up the recovery of the high oleic acid allele into the background of the recurrent parent genome. Eleven sunflower breeding genotypes with high and low oleic acid traits were obtained from the Agricultural Research Council-Grain Crops Institute (ARC-GCI) in Potchefstroom. The breeding genotypes were phenotypically characterised based on their oleic and linoleic acid levels using gas chromatography. Results demonstrated that the average mean of oleic and linoleic acid contents in high oleic acid genotypes were 72% and 17% respectively, while the average mean of oleic acid and linoleic acid contents in wild type lines were 33.5 % and 54 % respectively. These results indicated a perfect negative correlation between the amount of oleic and linoleic acids possessed in high and low oleic acid genotypes (R2 = -99.16%). Sequence characterised amplified region (SCAR) markers were tested to ascertain if any of the ten available dominant FAD2-1 markers was segregating with the high oleic acid allele. Four dominant SCAR markers (FAD2-1F4/R1; FAD2-1F4/R2; FAD2-1F13/R1; FAD2-1F14/R2) were strongly associated with the high oleic acid trait (P< 0.001). With regard to the inheritance of the high oleic acid trait, 143 plants of the F2 segregating population derived from a cross between the high oleic acid parent (AP901-95-3-4-1) and low oleic acid parent (H55-9-2-1-1) were genotyped with the four SCAR markers to determine the genetic state concerning the high oleic acid gene (Ol). Results from a Chi square analysis of the observed frequencies of each dominant FAD2-1 marker locus in 143 F2 individuals indicated that the deviation from the expected ratio of 3:1 (high to low oleic acid) was not statistically significant (P< 0.95) from the observed segregation ratio. These results were consistent with the previous finding that an incomplete dominant gene governs sunflower high oleic acid. A multiplex assay of 78 Simple sequence repeat (SSR) markers was optimised and evaluated on 143 plants of the F2 population to determine suitable SSR markers that can be used in a marker-assisted background selection. Only 14 markers were suitable for marker-assisted background selection based on their high polymorphic information content, allele frequency and maximum allele numbers. In conclusion, this study demonstrated the potential of using SSR and SCAR marker systems as a breeding tool to characterise and speed up the selection process in marker-assisted backcross breeding. / Thesis (MSc (Botany))--North-West University, Potchefstroom Campus, 2013.

Sunflower (Helianthus annuus L.) high oleic acid content lines differ from conventional sunflower by an increase in oleic acid (C18:1) content of more than 60%. The current sunflower cultivars under production in South Africa are standard sunflower with high levels of linoleic acid (C18:2). The aim of this study was to improve the quality of oil produced by local sunflower germplasm with respect to oleic acid through employing a marker-assisted breeding technique to facilitate and speed up the recovery of the high oleic acid allele into the background of the recurrent parent genome. Eleven sunflower breeding genotypes with high and low oleic acid traits were obtained from the Agricultural Research Council-Grain Crops Institute (ARC-GCI) in Potchefstroom. The breeding genotypes were phenotypically characterised based on their oleic and linoleic acid levels using gas chromatography. Results demonstrated that the average mean of oleic and linoleic acid contents in high oleic acid genotypes were 72% and 17% respectively, while the average mean of oleic acid and linoleic acid contents in wild type lines were 33.5 % and 54 % respectively. These results indicated a perfect negative correlation between the amount of oleic and linoleic acids possessed in high and low oleic acid genotypes (R2 = -99.16%). Sequence characterised amplified region (SCAR) markers were tested to ascertain if any of the ten available dominant FAD2-1 markers was segregating with the high oleic acid allele. Four dominant SCAR markers (FAD2-1F4/R1; FAD2-1F4/R2; FAD2-1F13/R1; FAD2-1F14/R2) were strongly associated with the high oleic acid trait (P< 0.001). With regard to the inheritance of the high oleic acid trait, 143 plants of the F2 segregating population derived from a cross between the high oleic acid parent (AP901-95-3-4-1) and low oleic acid parent (H55-9-2-1-1) were genotyped with the four SCAR markers to determine the genetic state concerning the high oleic acid gene (Ol). Results from a Chi square analysis of the observed frequencies of each dominant FAD2-1 marker locus in 143 F2 individuals indicated that the deviation from the expected ratio of 3:1 (high to low oleic acid) was not statistically significant (P< 0.95) from the observed segregation ratio. These results were consistent with the previous finding that an incomplete dominant gene governs sunflower high oleic acid. A multiplex assay of 78 Simple sequence repeat (SSR) markers was optimised and evaluated on 143 plants of the F2 population to determine suitable SSR markers that can be used in a marker-assisted background selection. Only 14 markers were suitable for marker-assisted background selection based on their high polymorphic information content, allele frequency and maximum allele numbers. In conclusion, this study demonstrated the potential of using SSR and SCAR marker systems as a breeding tool to characterise and speed up the selection process in marker-assisted backcross breeding. / Thesis (MSc (Botany))--North-West University, Potchefstroom Campus, 2013.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2017-04-07T12:34:26Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Ferreira, D.M.C.-DELIMITAÇÃO DE ESPÉCIES E FILOGEOGRAFIA DO COMPLEXO Cryptanthus zonatus (Vis.) Vis. (BROMELIACEAE).pdf: 2597427 bytes, checksum: 104e86eeb5b9dc72d1a7d96ef9fa743f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-07T12:34:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Ferreira, D.M.C.-DELIMITAÇÃO DE ESPÉCIES E FILOGEOGRAFIA DO COMPLEXO Cryptanthus zonatus (Vis.) Vis. (BROMELIACEAE).pdf: 2597427 bytes, checksum: 104e86eeb5b9dc72d1a7d96ef9fa743f (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / CAPES / Cryptanthus Otto & A.Dietr. (Bromeliaceae, Bromelioideae) é um gênero endêmico do Brasil. Cryptanthus burle-marxii Leme e C. zonatus (Vis.) Vis. são restritas ao norte da Floresta Atlântica nordestina e não apresentam delimitação taxonômica bem definida, pois muitos de seus caracteres morfológicos se sobrepõem. Ambas as espécies compõem o complexo C. zonatus (Vis.) Vis.. O objetivo do presente estudo foi realizar a delimitação de espécies e descrever os padrões filogeográficos do complexo C. zonatus, utilizando dados morfológicos, moleculares e de modelagem de nicho ecológico. Para o estudo foram feitos testes de amplificação heteróloga em C. burle-marxii e C. zonatus, utilizando 38 locos de microssatélites nucleares de cinco espécies de Bromeliaceae. Dos 38 locos testados, 24 apresentaram amplificação positiva e 13 foram polimórficos. Dez locos polimórficos foram selecionados para serem amplificados e genotipados em 147 indivíduos de oito populações do complexo C. zonatus. O resultado da análise morfológica e de estrutura genética mostrou que C. burle-marxii e C. zonatus são dois nomes dados à mesma espécie. A análise filogeográfica mostrou que a distribuição geográfica e estrutura genética do complexo C. zonatus pode ter sofrido modificações no quaternário. No último máximo glacial a distribuição geográfica potencial do complexo era contínua e maior em algumas áreas que atualmente é mar, o que deve ter ocorrido provavelmente devido à regressão marinha neste local. No Holoceno médio houve a potencial separação da distribuição possivelmente devido a uma barreira ecológica que perdurou até o presente formando dois grupos geneticamente estruturados, um ao norte e outro ao sul. Para a conservação da espécie foram indicadas populações prioritárias para o estabelecimento de unidades de conservação. / Cryptanthus Otto & A.Dietr. (Bromeliaceae, Bromelioideae) is an endemic genus from Brazil. Cryptanthus burle-marxii Leme and C. zonatus (Vis.) Vis. are species restricted to the north of the northeastern Atlantic Forest and have no well-defined taxonomic delimitation due to overlaping of some morphological characters. Both species are included in the Cryptanthus zonatus complex. The main goal of this study was to delimit species boudaries and to describe the phylogeographic patterns of the complex C. zonatus using morphological, molecular and ecological niche modeling data. For this study were carried out cross-amplification tests in C. burle-marxii and C. zonatus using 38 loci of nuclear microsatellite of five species of Bromeliaceae. Of the 38 loci tested, 24 showed positive amplification and 13 were polymorphic. Ten polymorphic loci were selected to be amplified and genotypes in 147 individuals from eight populations of the complex C. zonatus. The results of the morphological and genetic structure analyses showed that C. burle-marxii and C. zonatus are two names given to the same species. The phylogeographic analysis showed that the geographic distribution and genetic structure of the complex C. zonatus may have been modified in the Quaternary. The potential geographic distribution of the complex in the last glacial maximum was continuous and larger in some areas which are sea in present, what have probably occurred due to marine regression at this location. In the middle Holocene, there was the potential separation of distribution, possibly due to an ecological barrier that lasted until the present, forming two genetically structured groups, one in the north and other in the south. For conservation of the species priority populations were indicated for the establishment of protected areas

Made available in DSpace on 2016-12-23T14:37:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sara Coser Morra.pdf: 1157047 bytes, checksum: ca26cc99cfaca69da596f91375dc0dcb (MD5) Previous issue date: 2012-07-12 / A goiabeira (Psidium guajava L.) é uma das fruteiras de maior importância econômica da família Myrtaceae. O Brasil é um dos maiores produtores de goiaba do mundo, sendo esta uma cultura potencial em expansão e rentabilidade. A polinização cruzada da espécie e a existência de pomares heterogêneos de propagação seminal resultam em variabilidade, permitindo a seleção de genótipos para o melhoramento da cultura. O objetivo deste trabalho foi estudar a diversidade genética em genótipos de P. guajava selecionados em pomar de origem seminal e cultivares por características morfológicas e químicas de qualidade de fruto, também associar dados de conteúdo de DNA nuclear (2C), cariótipo, morfológicos e de marcadores moleculares microssatélites. Verificou-se a existência de divergência entre as Cortibel com relação às características de fruto, com genótipos apresentando performance superior e genótipos com desempenho semelhante à cultivares, potenciais para uso em hibridações ou como cultivares. As análises cariotípica e de conteúdo de DNA nuclear (2C) mostraram que os genótipos possuem um genoma estável, pequeno e diplóide e características cariotípicas relacionadas a grupos ancestrais de angiospermas. O dendrograma UPGMA baseado em dados morfológicos e SSR evidenciaram diversidade entre os genótipos, com melhor discriminação pelos dados de SSR. Como a maioria dos genótipos mostraram similaridade morfológica para as características de frutos, aliada a dissimilaridade molecular, estes se mostraram interessantes para o uso em hibridações em programas de melhoramento. O conjunto de dados gerados contribuiu para expandir o conhecimento sobre o genoma e a diversidade genética em P. guajava. Também é importante na estruturação de programas de melhoramento para a cultura, além de contribuir para estudos evolutivos / Guava (Psidium guajava L.) is one of the most economically important fruit crop from Myrtaceae family. Brazil is one of the largest producers of guava in the world, which is a potential crop in growth and profitability. Cross-pollination of the species and the existence of heterogeneous seminal propagation orchards result in variability, allowing the selection of genotypes for crop improvement. The aim of this study was to evaluate genetic diversity between P. guajava L genotypes selected from seminal origin orchard and cultivars, by morphological and fruit quality chemical characteristics, also associate data from nuclear 2C-value, karyotypic, morphological and simple sequence repeat (SSR) marker. There were divergences between Cortibel selections by fruit characteristics, with genotypes showing superior and similar performance when compared with cultivated genotypes, potential for use in hibridation and as cultivars. Karyotype and nuclear 2C-value analyses showed that all genotypes have a stable and very small diploid genome (2n = 2X = 22; 2C = 0.95 pg), and karyotypic characteristics related to ancestral angiosperm groups. UPGMA dendrogram based on morphological and SSR data evidenced diversity among the genotypes, with better discrimination by SSR data. Since most genotypes showed morphological similarity for fruit characteristics, combined with molecular dissimilarity, the use of these genotypes in hybridation breeding programs could be of interest. The obtained data set contributed to expand the knowledge about genome and genetic diversity of P. guajava. Also are important to structure crop improvement programs and contribute to evolutionary approaches