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Modelos de medidas repetidas aplicados a um experimento de pacientes com câncer tratados com exergames

MIRANDA, Isabela Pagani Heringer de 03 February 2017 (has links)
Objetivou-se usar técnicas de medidas repetidas para definir o modelo linear adequado que seja capaz de comparar três grupos de indivíduos quanto aos métodos aplicados na redução de fadiga muscular. O grupo câncer foi composto por indivíduos com diagnóstico de câncer que já foram tratados com quimioterapia e radioterapia, o grupo controle foi composto por indivíduos saudáveis e o grupo quimio/radio foi composto por indivíduos com diagnóstico de câncer em tratamento com quimioterapia e radioterapia. Os participantes do estudo foram submetidos a tratamento com exergames. Cada indivíduo obteve uma série de dados de força muscular em seis músculos (gastrocnêmio lateral esquerdo e direito, gastrocnêmio medial esquerdo e direito e tibial esquerdo e direito) e em três sessões (pré tratamento, metade do tratamento e final do tratamento). Os grupos, as sessões, as medidas, bem como as interações duplas e a interação tripla entre os fatores foram analisados segundo o esquema de parcelas subdividas no tempo usando modelos lineares mistos, que impõe forte restrição quanto à matriz de covariâncias do erro experimental. De acordo com os resultados do teste de Mauchly, para os seis músculos rejeitou-se a hipótese de esfericidade da matriz de covariâncias, assim procedeu-se com a escolha da estrutura da matriz de covariâncias do erro experimental que melhor se ajusta aos dados. A estrutura ARMA(1,1) foi a estrutura mais adequada segundo os critérios de AIC e BIC. Considerando a estrutura ARMA(1,1) no procedimento MIXED no software SAS, a análise de variância para os dados de força muscular em cada músculo em estudo foi realizada. Apenas para o músculo gastrocnêmio lateral esquerdo nenhum dos fatores foi significativo. Para os outros músculos houve diferenças significativas e tendências nas séries dos dados, principalmente para o músculo tibial esquerdo, no qual as interações entre grupo e sessão e entre grupo e medida foram significativas mostrando que o tratamento com exergames aumentou força muscular nos pacientes debilitados e, com 20 sessões do tratamento, os grupos se igualaram quanto a força muscular. / The objective was to use repeated measures techniques to define the appropriate linear model that is able to compare three groups of individuals regarding the methods applied in the reduction of muscular fatigue. The cancer group consisted of individuals diagnosed with cancer who were already treated with chemotherapy and radiotherapy, the control group was composed of healthy individuals and the chemo / radio group was composed of individuals diagnosed with cancer undergoing chemotherapy and radiotherapy. Study participants were treated with exergames. Each individual obtained a series of muscle strength data in six muscles (right/left medial gastrocnemius, right/left lateral gastrocnemius e right/left anterior tibialis) and in three sessions (pre treatment, half treatment and end treatment). The groups, the sessions, the measurements, as well as the double interactions and the triple interaction between the factors were analyzed according to the splits plots designs in time using linear mixed models, which imposes strong restriction regarding the covariance matrix of the experimental error. According to the results of the Mauchly test, the sphericity hypothesis of the covariance matrix was rejected for all six muscles, so we chose the structure of the covariance matrix of the experimental error that best fits the data. The structure ARMA(1.1) was the most adequate structure according to the AIC and BIC criteria. Considering the structure ARMA(1,1) in the MIXED procedure in the software SAS, the analysis of variance for the muscle strength data in each muscle under study was performed. Only for the left lateral gastrocnemius muscle none of the factors was significant. For the other muscles, there were significant differences and tendencies in the data series, especially for the left tibial muscle, in which the interactions between group and session and between group and measurement were significant, showing that exergamen treatment increased muscle strength in debilitated patients and, With 20 treatment sessions, the groups matched for muscle strength. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
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Efeito da interação reprodutor x rebanho sobre a produção de leite em bubalinos / Sire-by-herd interaction effect on the milk yield of buffaloes

Silva, Herluce Cavalcanti da 16 August 2002 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-06T18:01:27Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 151291 bytes, checksum: c7f381d9b243133c7618a177339b110a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-06T18:01:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 151291 bytes, checksum: c7f381d9b243133c7618a177339b110a (MD5) Previous issue date: 2002-08-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Foram utilizados dados de produção de leite, provenientes de rebanhos bubalinos do Estado de São Paulo, coletados pelo Programa de Controle Leiteiro do Departamento de Zootecnia da UNESP – Jaboticabal. A análise visava verificar a efetividade da inclusão do termo da interação reprodutor x rebanho ou reprodutor x rebanho-ano no modelo para as estimativas dos componentes de variância, para a avaliação genética dos reprodutores e para a tendência genética no período de 1987 a 2001.Os dados de produção de leite até 305 dias de lactação foram distribuídos de acordo com a idade ao parto e duração da lactação. Os componentes de variância foram estimados através da máxima verossimilhança restrita (REML), utilizando-se três modelos animais de característica simples. O teste da razão de verossimilhança foi utilizado para se avaliar a importância da inclusão do termo da interação no modelo. A estimativa do componente de (co)variância genética aditiva apresentou reduções de 0,62% e 2,42%, já para o componente de (co)variância permanente de meio reduziu em viii0,098% e aumentou 0,10% ,para o componente de (co)variância residual as reduções foram de 1,92% e 4%, para os modelos que continham a interação reprodutor x rebanho e reprodutor x rebanho-ano, respectivamente, em relação ao modelo sem o termo da interação. Os valores de herdabilidade obtidos para a produção de leite foram 0,32 para os modelos sem e com o termo da interação reprodutor x rebanho e de 0,31 para o modelo com a interação reprodutor x rebanho-ano. O teste da razão de verossimilhança foi significativo (P<0,05) para o modelo com a interação reprodutor x rebanho-ano. A média dos valores genéticos aditivos preditos praticamente não se alterou entre os modelos sem e com interação reprodutor x rebanho, com redução para o modelo que continha o termo da interação reprodutor x rebanho-ano. Do mesmo modo se comportou a amplitude entre os valores genéticos aditivos. As correlações de Pearson e Spearman entre os valores genéticos aditivos preditos e entre a ordem de classificação destes valores, foram iguais a unidade para os modelos sem e com a interação reprodutor x rebanho e ligeiramente abaixo da unidade para o modelo que continha a interação reprodutor x rebanho-ano. A acurácia dos valores genéticos aditivos preditos foi pouco afetada quando o modelo de análise considerou o termo referente a interação reprodutor x rebanho-ano. Avaliação semelhante foi realizada para 5, 10, 25, 40, 50 e 100% dos animais com resultados próximos aos encontrados para as avaliações dos reprodutores. A estimativa da tendência genética anual para a produção de leite com base nos 436 animais foi de -4,32 ± 4,00 kg entre os anos de 1987 a 1993. No período de 1993 a 2001 a tendência genética estimada foi de 24,86 ± 5,88 kg. Quando foi considerado o período total entre os anos de 1987 a 2001 a estimativa foi de 19,01 ± 2,89 kg. / Milk yield records from buffaloes herds of São Paulo State, provided by the Milking Recording Program of the Department of Animal Science/UNESP – Jaboticabal, was used. The objective of the analysis was to verify the effectiveness of including a sire-by-herd or sire-by-herd-year interaction effect in the model for the variance components estimates, for the sire genetic evaluation and the genetic trend, from 1987 to 2001. Milk yield records adjusted for 305 days of lactation were estimated according to the age at calving and lactation length. The variance components were estimated by the Restricted Maximum Likelihood Methodology, using three single trait animal models. Likelihood ratio test was used to estimate the importance of including a interaction effect in the model. The additive genetic covariance component estimate showed reduction of .62 and 2.42%, while the environment permanent covariance component showed reduction of .098% and increase of .10%. The residual covariance component showed reduction of 1.92 and 4%, for the models including a sire-by-herd and sire-by-herd-year interaction, respectively, compared to the model without the interaction effect. The heritability values obtained for milk yield were .32 for the xmodels including or not sire-by-herd interaction effect and .31 for the model including sire-by-herd-year interaction effect. Likelihood ratio test was significant (P<.05) for the model including a sire-by-herd-year interaction effect. The average predicted additive genetic values did not change between the models including or not sire-by-herd interaction effect, showing reduction for the model including sire-by-herd-year interaction effect. The range among the additive genetic values showed the same results. Pearson and Spearman correlations among the predicted additive genetic values and the rank order of these values were similar to the unit for the models without and with a sire-by-herd interaction effect and smaller than the unit for the model with a sire-by-herd-year interaction effect. The accuracy of the predicted additive genetic values was less affected when the model included the sire-by-herd-year interaction effect. Similar evaluation was performed for 5, 10, 25, 40, 50 and 100% of animals, with results similar to those obtained with sire evaluations. Annual genetic trend estimate for milk yield, based on the 436 animals, was of –4.32 ± 4.00 kg from 1987 to 1993. Estimated genetic trend from 1993 to 2001 was of 24.86 ± 5.88 kg. When the total period (from 1987 to 2001) was considered, the estimate was of 19.01 ± 2.89 kg.
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A distribuição Touchard e suas aplicações

Oliveira, Sandro Barbosa de 19 December 2016 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Estatística, 2016. / Submitted by Camila Duarte (camiladias@bce.unb.br) on 2017-01-20T14:28:41Z No. of bitstreams: 1 2016_SandroBarbosadeOliveira.pdf: 715956 bytes, checksum: b81a53b96acbf27ec06b16baf942a577 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-03-22T17:09:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_SandroBarbosadeOliveira.pdf: 715956 bytes, checksum: b81a53b96acbf27ec06b16baf942a577 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-22T17:09:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_SandroBarbosadeOliveira.pdf: 715956 bytes, checksum: b81a53b96acbf27ec06b16baf942a577 (MD5) / A distribuição de Poisson é uma das mais importantes distribuições de probabilidade, sendo amplamente utilizada para modelagem de dados provenientes de experimentos de contagem. Seu único parâmetro também sua média e sua variância, o que a torna inadequada para a modelagem de dados com subdispersão, superdispersão e excesso de zeros. Nesta dissertação será apresentada a distribuição Touchard, uma generalização com dois parâmetros da Poisson, com a proposta de modelar dados com subdispersão, superdispersão e excesso de zeros. Será também introduzido o modelo de regressão Touchard e uma generalização com três parâmetros. Diversas aplicações ilustraram como a distribuição Touchard pode ser uma alternativa competitiva para modelagem de dados não-Poisson, equiparando-se com as mais clássicas e recentes generalizações da Poisson. / The Poisson distribution, one of the most important distributions in probability theory, has been widely used to model count data. The Poisson distribution depends on a single parameter lambda. The expected value and variance of a Poisson-distributed random variable are both equal to lambda, so using standard Poisson model with under or overdispersed data may result in lack-of-fit. This dissertation presents a two-parameter extension of the Poisson distribution: the Touchard distribution. It is a flexible distribution that can account for both under- or overdispersion and concentration of zeros that are frequently found in non-Poisson count data. Touchard regression and three-parameter extension of the Poisson distribution will also be shown in this work. Several applications will illustrate the capabilities of this approach to be a useful model for assessing non- Poisson data.
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Problemas elípticos com peso e crescimento crítico

Souza, Bruno Nunes de 13 November 2014 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Matemática, 2014. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2015-01-15T16:32:09Z No. of bitstreams: 1 2014_BrunoNunesdeSouza.pdf: 530349 bytes, checksum: 0986b83bdbf84f05d9d4e44f2f44b943 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2015-02-23T19:57:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_BrunoNunesdeSouza.pdf: 530349 bytes, checksum: 0986b83bdbf84f05d9d4e44f2f44b943 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-23T19:57:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_BrunoNunesdeSouza.pdf: 530349 bytes, checksum: 0986b83bdbf84f05d9d4e44f2f44b943 (MD5) / Neste trabalho, estudaremos a existência de soluções para equações do tipo –div(p(x)∇u=b(x) |u|^(-q-2)+c(x) |u|^(-r-2) u,x ϵ Ω, em pesos p, b e c satisfazem hipóteses que nos permitirão tratar o problema variacionalmente. Consideramos o problema acima para 1<q<2* e tratamos, especialmente, variações para quando r=2^* é o expoente crítico de Sobolev. A principal ferramenta utilizada será o Teorema do Passo da Montanha e suas versões. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / In this work, we will study the existence of solutions for the equation -–div(p(x)∇u=b(x) |u|^(-q-2)+c(x) |u|^(-r-2) u,x ϵ Ω, with the weights p, b and c verifying some hypothesis which produce a variational structure for the prolem. We considered the equation for 1<q<2* and deal specially with the critical case r = 2^*. We use the Mountain Pass Theorem as well as some of your variants.
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Analise de variaveis de processo e mistura pelo metodo "split-plot"

Bortoloti, João Alexandre 29 July 2018 (has links)
Orientador: Roy Edward Bruns / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-29T00:20:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bortoloti_JoaoAlexandre_M.pdf: 2264686 bytes, checksum: 6ecdde6d2651faad9e3bfeec691d0baa (MD5) Previous issue date: 2001 / Mestrado
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Estudo comparativo de métodos de estimação da variância de coeficiente de herdabilidade / not available

Joaquim Pereira Neto 04 November 1994 (has links)
Este trabalho apresenta um estudo comparativo de fórmulas aproximadas para o cálculo da variância do coeficiente de herdabilidade considerando-se um modelo hierárquico. Foram utilizadas estimativas dos componentes de variâncias e covariâncias pelo método dos momentos no cálculo do coeficiente de herdabilidade. Os dados foram obtidos a partir de simulação de 50 experimentos com várias combinações do número de machos e fêmeas e 2 descendentes por acasalamento. A formúla de Osborne & Paterson (1952) adaptada por Barbin (1969) apresentou menor estimativa da variância do coeficiente de herdabilidade do que as fórmulas de Falconer (1960) e Dickerson (1969) / not available
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Heterogeneidade de variância na avaliação genética de bovinos da raça Tabapuã / Heterogeneity of variance on genetic evaluation of Tabapuã cattle

Campêlo, José Elivalto Guimarães 12 February 2001 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-27T11:41:09Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 376017 bytes, checksum: 40339e192628ee46bcc68029ed1095bd (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-27T11:41:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 376017 bytes, checksum: 40339e192628ee46bcc68029ed1095bd (MD5) Previous issue date: 2001-02-12 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Com base no banco de dados usado na avaliação genética, em nível nacional, da raça Tabapuã, objetivou-se verificar a importância de efeitos maternos e a influência da heterogeneidade de variâncias na avaliação genética de bovinos de corte. Dados de pesos corrigidos aos 120, 240 e 420 dias de idade, referentes a estratificados 35.478, com 34.303 base no e 26.892 animais, desvio-padrão respectivamente, fenotípico dos foram grupos de contemporâneos, com peso aos 120 dias, em três classes: baixo (< 14,9 kg), médio (de 14,9 a 18,3 kg) e alto (>18,3 kg) desvios-padrão. Avaliaram-se modelos com e sem efeitos maternos pelo teste da razão de verossimilhança. Em análises de característica única geral, as herdabilidades diretas foram de 0,17, 0,15 e 0,12, em modelos co m efeitos maternos, e de 0,28, 0,29 e 0,15, em modelos sem efeitos maternos, para pesos aos 120, 240 e 420 dias, respectivamente. Os efeitos maternos mostraram-se mais importantes nos pesos nas fases da pré-desmama e da desmama, com herdabilidades de 0,13 e 0,17, respectivamente. Constatou-se antagonismo entre os efeitos genéticos direto e materno, com correlações de – 0,40, - 0,48 e – 0,21 para pesos aos 120, 240 e 420 dias, respectivamente. No estudo da heterogeneidade de variâncias recorreu- se à utilização de transformações para a escala logarítmica e à padronização, dividindo-se o valor do registro pelo desvio-padrão fenotípico da classe. Ao constatar a ineficiência das transformações, realizaram-se análises de características múltiplas, sendo o peso, em cada classe de desvio-padrão fenotípico, considerado característica distinta. Nas análises de múltiplas características, em que o peso foi considerado característica distinta em cada classe de desvio-padrão fenotípico, constatou-se que variâncias genéticas e residuais aumentaram com o aumento do desvio-padrão fenotípico da classe, implicando herdabilidades nas classes de baixo, médio e alto desvio -padrão fenotípico iguais, respectivamente, a 0,26, 0,32 e 0,37 (peso aos 120 dias), 0,28, 0,35 e 0,35 (peso aos 240 dias) e 0,14, 0,18 e 0,18 (peso aos 420 dias). As correlações genéticas entre o mesmo peso, nas classes de baixo e alto desvios- padrão fenotípicos (classes representativas de ambientes mais contrastantes), foram inferiores a 0,80. As correlações entre os valores genéticos, obtidos de análises múltiplas e de análise geral (sem as classes), foram superiores a 0,93. Nas classes de maior desvio-padrão fenotípico, foram observados maiores médias e desvios-padrão dos valores genéticos dos reprodutores. Ao selecionar 10% dos melhores reprodutores, observou-se maior percentual de touros em comum, classificados por análise de característica geral (sem as classes), quando comparados com os classificados na classe de alto desvio -padrão das análises de características múltiplas. / Data of Tabapuã cattle were used to verify the influence of maternal effects and heterogeneity of variance on genetic evaluation of beef cataleto. Data of adjusted weight of 35,478, 34,303 and 26,892 animals, at 120, 240 and 420 days of age, respectively, were used to classify contemporary groups among three classes of phenotypic standard deviation: low (< 14.9 kg), medium (from 14.9 to 18.3 kg) and high (> 18.3 kg). The likelihood ratio test was applied to evaluate models with or without maternal effects. In a general analysis with single trait, the direct heritabilities were 0.17, 0.15 and 0.12, in the models with maternal effects, and 0.28, 0.29 and 0.15 in the models without maternal effects, for weightsat 120, 240 and 420 days, respectively. The inclusion of the maternal effects was more important on pre-weaned and weaned weights, with heritabilities of 0.13 and 0.17, respectively. An antagonism between genetic direct and maternal effects was verified, with correlations of -0.40, -0.48 and – 0.21 for weights at 120, 240 and 420 days, respectively. The data were transformed to base 10 logarithmic and standardized as a ratio of the phenotypic standard deviation of the class. Data transformation did not eliminate the heterogeneity of variance among classes. Multiple trait analysis, considering each class of phenotypic standard deviation as a distinct trait, were realized. The genetic and residual variances increased with the increase on phenotypic standard deviation of the class. Heritabilities on low, medium and high standard deviation classes were 0.26, 0.32 and 0.37 (weight at 120 days), 0.28, 0.35 and 0.35 (weight at 240 days) and 0.14, 0.18 and 0.18 (weight at 420 days), respectively. Genetic correlations between the same weight, on low and high phenotypic standard deviation, were lower than 0.80. The correlations between breeding values, obtained from multiple analysis, and from general analysis (without classes), were greater than 0.93. In the classes of higher phenotypic standard greater means and standard deviations of the sire’s breeding values deviation were observed. Selecting 10% of the top sires, it was observed a greater percentage of common sires, classified by general trait analysis (without classes), when compared with sires classified on the high standard deviation class of the multiple traits analysis. / Tese importada do Alexandria
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Flutuação populacional e fatores climáticos afetando a distribuição de machos de Ceratitis capitata (wied., 1824) (Diptera: Tephritidae) em pomares de citros / Population dinamics and climatic factors affecting the Ceratitis capitate (WIED., 1824) (Diptera: Tephritidae) male distributions on citric orchards

Ferraudo, Antonio Sérgio 00 December 1900 (has links)
Procurou-se determinar um modelo matemático que possa representar, pelo menos aproximadamente, a evolução da mosca-do-mediterrâneo, Ceratitis capitata (Wied., 1824) (Diptera: Tephritidae) em dois pomares situados no município de São Pedro (SP). Os dados, número de machos coletados, foram obtidos de experimentos realizados durante quatro anos (janeiro de 1980 a dezembro de 1983). Em cada um dos pomares distribuíram-se armadilhas que coletaram os insetos machos da mosca e, com os dados obtidos, estudaram-se regressões harmônicas para cada variedade e ano, de acordo com metodologia descrita por BLISS (1970), com as respectivas análises de variância. Com exceção da variedade Pêra, que no primeiro ano apresentou resultados não signficativos, as análises mostraram que nos dois primeiros anos, onde a densidade populacional da praga foi alta, todas as regressões harmônicas foram significativas, sendo que quatro resultaram em ajuste ao modelo do primeiro grau, duas do segundo, sete o terceiro e quarto grau. Nos dois anos finais a praga praticamente desapareceu dos pomares apresentando baixa densidade populacional, o que resultou em análises com resultados não significativos. Foi realizado também um estudo da relação variância/média, como uma medida de aproximação à distribuição espacial da praga, assim como as possíveis correlações de dados climáticos, para verificar possíveis interferências na evolução da praga / In the present work it was looked for determining a mathematical model to represent, at least nearly, the mediterranean fly Ceratitis capitata (Wied., 1984) (Diaptera: Tephritidae) in two citric orchards in São Pedro (SP). The experiment data, the number of males, were obtained in experiments during four years from january 1980 to december 1983. Some traps were installed in each orchard to catch the mediterranean fly males. After counting the number of males in the traps the harmonic regression for each year and variety was studied according to the methodology described by BLISS (1970), with the respective variance analysis. Excluding the variety Pêra, witch in the first year presented no significant results, the analysis showed that in the two first years, where the populational density was high, all the harmonic regressions were significant. Four among them fitted to the first grade model, two to the fourth grade. In the two last years the pest was gone form the orchards, the populational density was low and the regression analysis was not significant. It was also realized a study of the mean/variance relationship as a measure of the approximation of the spatial distribution of the pest, as well as the possible correlations of climatic data for verifying the possible interferences in the pest evolution
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Aplicação de técnicas de planejamento experimental em otimizadores baseados em algoritmos genéticos. / Design of experiments applied to optimizers based on genetic algorithms.

Federico, Heitor Honda 02 April 2007 (has links)
Um importante problema enfrentado por engenheiros é a busca por soluções ótimas para problemas com um grande número de soluções possíveis. Neste trabalho, estudamos métodos otimização probabilísticos baseados em algoritmos genéticos, propostos inicialmente para o estudo de sistemas biológicos. Propomos algumas alterações do método de otimização por algoritmos genéticos tradicional, utilizando técnicas estatísticas de planejamento experimental, que resultaram em uma melhoria da convergência, percebida, não só na velocidade de convergência, como no número de possibilidades de soluções diferentes analisadas. Como resultado, é proposto um algoritmo que cobre o domínio de atuação dos métodos por algoritmos genéticos e do método por gradientes, permitindo uma melhor sintonização do otimizador com o problema. / A important problem faced by engineers is the search of optimal solutions for problems with a great number of possible solutions. Throughout this work, it is studied stochastic optimizers based on genetic algorithms, applied initially to the study of biological systems. Some alterations on the traditional genetic algorithms based optimizer are proposed through the use of experiment design techniques, which resulted in a improvement of the convergence that can be perceived, not only in the convergence speed, but on the number of solutions analyzed as well. As a consequence, a algorithm is proposed, covering both the traditional genetic algorithms based optimizer and the gradient method domains, allowing a better tuning of the optimizer to the problem.
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Avaliação genética na presença de heterogeneidade utilizando dados simulados / Genetic evaluation with heterogeneity across herds, using simulation

Carneiro, Antonio Policarpo Souza 31 March 2003 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-12T16:24:50Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 230332 bytes, checksum: 5b41a9ec99d8c6835507f9f522bb1e8c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-12T16:24:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 230332 bytes, checksum: 5b41a9ec99d8c6835507f9f522bb1e8c (MD5) Previous issue date: 2003-03-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os objetivos deste trabalho foram simular estruturas de dados similares às condições reais observadas em rebanhos bovinos em relação a heterogeneidade; comparar os resultados das análises que consideram ou não a presença da heterogeneidade; quantificar o real efeito da heterogeneidade sobre a avaliação genética e seleção de touros, vacas e progênies, além de verificar a relação entre heterogeneidade e conexidade genética dos dados. Foram simulados vários conjuntos de dados formados por 75 touros, 3750 vacas e 7500 progênies, distribuídos em 15 rebanhos, por intermédio do programa Genesys (EUCLYDES, 1996). Quatro estruturas de heterogeneidade foram simuladas: rebanhos com heterogeneidade para todos os parâmetros tanto genéticos quanto fenotípicos - RHTP; rebanhos com médias genéticas similares e demais parâmetros heterogêneos - RMGS; rebanhos com heterogeneidade fenotípica - RHF e rebanhos sem heterogeneidade - RSH. Os rebanhos foram agrupados em três níveis: alta, média e baixa variabilidade. Foram simulados quatro graus de conexidade genética entre os níveis de variabilidade: 0%, 20%, 40% e 100% de conexidade genética (CG-0, CG-20, CG-40 e CG-100). Os arquivos de dados foram utilizados em análise de característica única que não considerava a heterogeneidade. Também, efetuou-se análise de características múltiplas, onde a produção em cada nível de variabilidade foi analisada como uma característica diferente, considerando- se, portanto, a heterogeneidade. As estimativas de variância genética e herdabilidades foram subestimadas para a estrutura de dados RHTP, mesmo nas análises de características múltiplas e para conjuntos de dados com alto grau de conexidade. Para as estruturas de dados que não apresentavam heterogeneidade para médias genéticas (RMGS, RHF e RSH), estas estimativas foram próximas dos valores simulados. Os valores genéticos preditos nas diferentes estruturas de dados foram comparados com os valores genéticos verdadeiros, através das correlações de ordem e de Pearson. Para RHTP, estas correlações foram inferiores a 50%, exceto para os valores genéticos de touros com 100% de conexidade entre os níveis de variabilidade. Para RMGS e RHF, as correlações foram altas e próximas às obtidas para dados sem heterogeneidade (RSH). Valores baixos para as correlações de Pearson indicam baixa acurácia na predição dos valores genéticos, enquanto baixas correlações de ordem indicam que a ordem de classificação dos animais com base nos valores genéticos preditos e verdadeiros é diferente. Conseqüentemente, classificados, animais com menor incorretamente, entre os valor animais genético poderão geneticamente ser superiores, prejudicando a eficiência da seleção. A heterogeneidade de média genética entre rebanhos prejudicou a acurácia da predição dos valores genéticos de touros e, principalmente de vacas e progênies, mas a heterogeneidade para outros parâmetros, não influenciou a avaliação genética dos animais. A análise de características múltiplas não foi eficiente para eliminar os problemas da heterogeneidade sobre a avaliação genética e o grau de conexidade dos dados influenciou os resultados das análises, apenas quando os rebanhos tinham médias genéticas heterogêneas. Assim, verificou-se que o problema da heterogeneidade sobre as avaliações genéticas é devido, basicamente à presença de médias genéticas diferentes entre rebanhos. / The objectives of this study were to simulate data structures similar to the real conditions observed in bovine herds according to parameters heterogeneous; to compare the results of the analysis that account or not for heterogeneity; to quantify the true effect of heterogeneity on the genetic evaluation and selection of bulls, cows and progenies, and to verify the relationship between parameters heterogeneous and genetic connectness of the data. It were simulated several groups of data formed by 75 bulls, 3750 cows and 7500 progenies, distributed in 15 herds, through the program Genesys (EUCLYDES, 1996). Four parameters heterogeneous structures were simulated: herds with heterogeneity for all the parameters, genetic and phenotypic - RHTP; herds with genetic means similar and the other parameters heterogeneous - RMGS; herds with heterogeneity phenotypic - RHF and herds without heterogeneity - RSH. Herds were grouped in three levels: high, mean and low variability. It were simulated four degrees of genetic connectness between the variability levels: 0%, 20%, 40% and 100% of genetic connectness (CG-0, CG-20, CG-40 and CG-100). Data files were used in single-trait analysis that didn't account for parameters heterogeneous. Also, it was carried out a multiple-trait analysis in which the production in each variability level was analyzed as a different trait. The estimates of genetic variance and heritability were underestimated for the data structure RHTP, even in the multiple-trait analysis and for groups of data with high connectness degree. For the structures of data that didn't present heterogeneity for genetic means (RMGS, RHF and RSH), these estimates were close to the simulate values. The estimated breeding values in the different structures of data were compared with the true breeding values, through rank correlations and Pearson correlations. For RHTP, these correlations were lower than 50%, except for the breeding values of bulls with 100% of connectness between the variability levels. For RMGS and RHF, correlations were high and close to values obtained for data without heterogeneity (RSH). Low values for Pearson correlations indicate low accuracy in the prediction of breeding values, while low rank correlations indicate that the ranking of animals based on estimated and true breeding values is different. Consequently, animals with smaller breeding value may be included, incorrectly, among the animals genetically superiors, harming the efficiency of selection. The heterogeneity of genetic mean between herds harmed the accuracy of breeding value predictions of bulls and, mainly of cows and progenies, but the heterogeneity for other parameters, didn't influence the genetic evaluation of the animals. The multiple- trait analysis was not efficient to eliminate the problems of parameters heterogeneous on genetic evaluation. The degree of connectness of the data influenced the results of the analysis, just when the herds had heterogeneous genetic means. Like this, it was verified that the problem of parameters heterogeneous about the genetic evaluations is due, basically to the presence of different genetic means between herds. / Tese importada do Alexandria

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