261 |
Caracterização de isolados de Corynespora cassiicola e avaliação da sensibilidade in vitro a fungicidas / Characterization of Corynespora cassiicola isolates and evaluation of in vitro sensitivity to fungicidesAguiar, Frederick Mendes 13 May 2015 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2015. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-05-12T16:45:26Z
No. of bitstreams: 1
2015_FrederickMendesAguiar.pdf: 1843726 bytes, checksum: 4fb24b86358626af48318bf95c8540c0 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-05-24T21:25:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1
2015_FrederickMendesAguiar.pdf: 1843726 bytes, checksum: 4fb24b86358626af48318bf95c8540c0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-24T21:25:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1
2015_FrederickMendesAguiar.pdf: 1843726 bytes, checksum: 4fb24b86358626af48318bf95c8540c0 (MD5) / A macha-alvo, causada pelo fungo Corynespora cassiicola, tornou-se uma das mais importantes doenças da parte aérea do tomateiro e pepineiro em diversas regiões produtoras do Brasil e do mundo nos últimos anos. Além do tomate e pepino, este fungo apresenta uma grande diversidade de hospedeiras sendo relatado em mais de 350 espécies de plantas, distribuídas por mais de 80 países. Os isolados deste fungo também apresentam uma grande diversidade morfológica, principalmente em relação à coloração da colônia, tamanho e formato dos conídios, dificultando ainda mais sua identificação e caracterização. Outra dificuldade relacionada à mancha-alvo é a ausência de cultivares comerciais resistentes e de fungicidas recomendados para o tomate e o pepino no Brasil, sendo um grande desafio para seu controle. Em função dos problemas apresentados, esta tese teve como objetivo investigar a variabilidade genética, morfométrica e patogênica entre isolados de Corynespora de diferentes plantas hospedeiras e regiões geográficas e verificar in vitro a sensibilidade micelial de isolados de Corynespora a diferentes fungicidas. Na caracterização molecular todos os isolados avaliados foram identificados como pertencentes à espécie C. cassiicola. Quanto à distribuição e a resolução intraespecífica dos isolados avaliados, as sequências obtidas das regiões genômicas ITS e fator de elongação 1-α apresentaram limitada resolução intraespecífica dos isolados quanto à hospedeira de origem e região geográfica de coleta nas respectivas árvores filogenéticas. Já a árvore filogenética com as sequências do gene β-tubulina apresentou melhor distribuição dos isolados quanto à hospedeira de origem, com formação de dois clados distintos, cada um representado em sua maioria por isolados provenientes da cultura do tomate e do pepino. Os treze isolados de C. cassiicola utilizados na caracterização morfométrica apresentaram grande variabilidade quanto à cor da colônia, com a ocorrência de seis diferentes cores; quanto à textura micelial, os isolados dividiram em sete com textura fina e seis com textura cotonosa; e quanto ao formato da colônia, com predominância da forma poligonal. A taxa de crescimento micelial foi de 6,05 mm/d. As dimensões dos conídios variaram de 7,39 a 386,05 μm de comprimento, 5,8 a 14,08 μm de largura e 0 a 24 para o número de pseudoseptos. Os três isolados de C. cassiicola avaliados confirmaram patogenicidade às suas hospedeiras de origem. Somente oito espécies de plantas avaliadas não apresentaram suscetibilidade aos isolados. Após caracterização molecular, morfométrica e patogênica dos isolados de C. cassiicola avaliados, concluiu-se que, exceto para a região β-tubulina, nenhuma relação entre a hospedeira de origem e a região geográfica de coleta dos isolados foi estabelecida neste estudo. No teste de sensibilidade a fungicidas, em ensaios preliminares foi obtida a dose efetiva capaz de inibir o crescimento micelial de C. cassiicola em 50% (DE50). Nos resultados, os fungicidas clorotalonil e carbendazim apresentaram altos valores da DE50 para a maioria dos isolados avaliados, com média superior a 50 mg.L-1. Para o fungicida tebuconazole, os valores da DE50 variaram de 0,50 a 18,79 mg.L-1. Já para os fungicidas pyrimethanil, fludioxonil e cyprodinil, verificou-se menores valores da DE50 quando comparados aos fungicidas anteriores. Após estes ensaios, as concentrações obtidas foram de 1 mg.L-1 para o fungicida fludioxonil, 3 mg.L-1 para cyprodinil, 5 mg.L-1 para boscalid e fluopyram, 10 mg.L-1 para tebuconazole, azoxystrobin e pyrimethanil e 50 mg.L-1 para clorotalonil e carbendazim. Os resultados obtidos no teste de inibição do crescimento micelial (ICM) de 55 isolados de C. cassiicola, mostraram uma variação entre os fungicidas e os isolados avaliados. O fungicida fludioxonil na concentração de 1 mg.L-1 apresentou maior valor de ICM quando comparado aos demais fungicidas avaliados, com valor médio de 85,69%. Já o fungicida clorotalonil apresentou menor valor de ICM, com média de 31,56%. O isolado EH-1710 apresentou maior valor de ICM de 74,14%, já o isolado EH-2125 apresentou o menor valor entre os isolados avaliados, com média de 34,57%. Os resultados obtidos evidenciam uma grande expectativa de efeitos satisfatórios do fungicida fludioxonil no controle da mancha-alvo. Já os fungicidas carbendazim, pyrimethanil, azoxystrobin e, principalmente, clorotalonil apresentam grande possibilidade de desenvolvimento de resistência dos isolados de C. cassiicola. / Target spot, caused by the fungus Corynespora cassiicola, has been one of the most important disease of the aerial parts of the tomato and cucumber plants in different regions of Brazil and world in the last years. Besides the tomato and cucumber, this fungus has a big host diversity, detected in more than 350 plants, distributed by more than 80 countries. The isolates of this fungus also have a big morfological diversity, mainly in relation to colony colour, conidia size and shape. These characters difficult its identification and characterization to species level. Another difficult concerning to target spot is the absence of resistant cultivars and fungicides recommended for tomato and cucumber in Brazil, representing a big challenge for its control. In function on the presented problems, this thesis aimed to investigate the genetic variability, morphometric and pathogenic among Corynespora isolates from different geographic regions and test the in vitro mycelial sensitivity of Corynespora isolates to different fungicides. In the molecular characterization all isolates were identified as C. cassiicola. As to distribution and intraspecific resolution of isolates, the sequences obtained from genomic regions ITS and elongation factor 1-α showed limited intraspecific resolution of the isolates as to host of origin and geographical region of collection in its phylogenetic trees. The phylogenetic tree with the sequences of β-tubulin gene showed better distribution of isolates as to its host of origin. In this tree it was formed two distinct clades, each one represented mostly by isolates from tomato and cucumber crop. Thirteen isolates of C. cassiicola used in morphometric characterization showed big variability as to color, with occurrence of six different colors; as to texture, with isolates divided into seven presenting fine texture and six with cottony texture; and as to colony shape, with predominance of polygonal shape. The mycelial growth rate was 6.05 mm/d. The dimensions of the conidia ranged from 7.39 to 386.05 mm in length, 5.8 to 14.08 mm in width and 0 to 24 for the number of pseudosepts. The three isolates of C. cassiicola tested confirmed pathogenicity to its host of origin. Only eight species of plants tested didn't show susceptibility to isolates. After molecular, morphometric and pathogenic characterization of isolates of C. cassiicola tested, was concluded that, except for β-tubulin region, no relationship between host of origin and geographical region of isolates was established in this study. In the fungicidal sensitivity test was performed in preliminary tests to determine the actual dose able of inhibiting the mycelial growth of C. cassiicola by 50% (ED50). In the results, the fungicide chlorothalonil and carbendazim showed great ED50 values to majority of isolates, with average higher to 50 mg.L-1. For the tebuconazole fungicide the values of ED50 varied from 0.50 to 18.79 mg L-1. The pyrimethanil, cyprodinil and fludioxonil fungicides presented lower values of DE50 when compared to the former fungicides. After these tests, the ED50 concentrations found were 1 mg.L-1 to fludioxonil, 3 mg.L-1 to cyprodinil, 5 mg l-1 to boscalid and Fluopyram, 10 mg.L-1 to tebuconazole, azoxystrobin and pyrimethanil and 50 mg L-1 to chlorothalonil and carbendazim. The results obtained in the inhibition test of mycelial growth (ICM) of 55 isolates of C. cassiicola, showed a variation among fungicides and isolates tested. The fludioxonil fungicide at a concentration of 1 mg L-1 showed higher ICM when compared to fungicides tested, with average of 85.69%. Already chlorothalonil fungicide showed the lowest ICM values with average of 31.56%. EH-1710 showed higher ICM of 74.14% and the isolate EH-2125 showed the lowest value of ICM among the isolates tested, with average of 34.57%. The results show a great expectation of good effects of fludioxonil fungicide on target spot control. Already carbendazim fungicides, pyrimethanil, azoxystrobin and chlorothalonil showed great possibility of development of resistance of isolates of C. cassiicola.
|
262 |
Estudo de diversidade genética e efeito inibitório do látex de Calotropis procera em fungos fitopatogênicos / Genetic diversity study and inhibitory effect of Calotropis procera latex in pathogenic fungiSilva, Shamyra Georgia de Azevedo e 27 February 2015 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-12T19:15:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1
ShamyraGAS_Dissert.pdf: 1345668 bytes, checksum: 408f47b3e8a408dc7702858d04d13fc8 (MD5)
Previous issue date: 2015-02-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Silk Flower [Calotropis procera (Aiton) W.T. Aiton] is a plant that has been highlighted by the case of a species that has several features such as animal feed, traditional medicine, agriculture, environment, cosmetics and textile industry, and may also act to combat pests, fungi and viruses through mechanisms defense associated with your latex. This study aimed to evaluate latex fluid from Silk Flower in inhibiting the development of pathogenic fungi of Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani, Colletotrichum musae and Monosporascus cannonballus and study the genetic diversity from Silk Flower genotypes using the RAPD and ISSR molecular markers. Twenty samples of species of leaves were collected in the Grossos/RN and Mossoró/RN cities (ten plants from each city). The plants latex were tested on four different types of phytopathogenic fungi, Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani, Colletotrichum musae and Monosporascus cannonballus with two different methods (adding latex to the culture medium before and after polymerization middle), and with two different concentration level (neat and diluted 1:1). For molecular analysis, DNA of each plant was extracted with 11 RAPD primers and 10 ISSR primers. For latex analyzes, it was observed that there was no inhibitory effect for any of Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani, Colletotrichum musae and Monosporascus cannonballus isolates in any of the concentrations tested under the conditions studied. Molecular results showed a good standard for both amplification of DNA markers, showing the formation of different groups, and the presence of genetic variability has been detected. For the analysis with molecular markers there was the formation of the four distinct groups, and in the ISSR marker was observed the formation of six groups. When it was analyzed the two markers in a corresponding manner it was possible to detect the formation of seven distinct groups showing the existence of variability. The difference in the results of both markers can be explained by the case of two markers that covered different regions of the genome / Flor de Seda [Calotropis procera (Aiton) W.T. Aiton] é uma planta que tem recebido destaque por se tratar de uma espécie que possui diversas funcionalidades como alimentação animal, medicina tradicional, agricultura, meio ambiente, indústria cosmética e têxtil, podendo também atuar no combate à pragas, fungos e vírus através de mecanismos de defesa associados ao seu látex. Objetivou-se nesse estudo avaliar fluidos laticíferos da Flor de Seda na inibição do desenvolvimento de fungos fitopatogênicos de Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani, Colletotrichum musae e Monosporascus cannonballus e estudar a divergência genética de genótipos de Flor de Seda por meio de marcadores moleculares RAPD e ISSR. Vinte amostras de folhas da espécie foram coletadas na cidade de Grossos/RN e na cidade de Mossoró/RN no Campus Leste da UFERSA (dez plantas para cada local de coleta). O látex das plantas foram testados em quatro diferentes tipos de fungos fitopatogênicos, Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani, Colletotrichum musae e Monosporascus cannonballus com duas diferentes metodologias (adicionando o látex ao meio de cultura antes e após a polimerização do meio) e com dois níveis diferentes de concentração (puro e diluído 1:1). Para as análises moleculares, o DNA de cada uma das plantas foi extraído com 11 primers RAPD e 10 primers ISSR. Para as análises do látex, foi observado que não houve efeito inibitório para nenhum dos isolados de Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani, Colletotrichum musae e Monosporascus cannonballus em nenhuma das concentrações testadas nas condições estudadas. Os resultados moleculares obtidos revelaram um bom padrão de amplificação para ambos os marcadores de DNA, mostrando à formação de grupos distintos, tendo sido detectada a presença de variabilidade genética. Para as análises com os marcadores RAPD houve a formação de quatro grupos distintos, e para o marcador ISSR foi possível observar a formação de seis grupos. Quando se analisou os dois marcadores de forma correlacionada foi possível detectar a formação de sete grupos distintos demonstrando a existência de variabilidade. A diferença encontrada nos resultados de ambos marcadores pode ser explicada por se tratar de dois marcadores que cobriram diferentes regiões do genoma
|
263 |
Qualidade e potencial de utilização de frutos de genótipos de Cambuí, Guajiru e Maçaranduba nativos da vegetação litorânea de Alagoas / Qualidade e Potencial de utilização de frutos de genótipos de Cambuí, Guajiru e Maçaranduba nativos da vegetação litorânea de AlagoasAraújo, Rychardson Rocha de 06 March 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-12T19:18:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1
RychardsonRA_TESE.pdf: 2995837 bytes, checksum: 05e99c47bdfd7dd13516d35596c04e3e (MD5)
Previous issue date: 2012-03-06 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The work had the aim to characterize physical and chemically fruits of genotypes of guajiru, maçaranduba and cambuí from native populations of Paripueira, Maceió, Marechal Deodoro and Piaçabuçu, Alagoas, Brazil. The samples were evaluated
individually for the following characters: fresh weight of the fruits, fresh weight of the pulp, fresh weight of the peel, fresh weight of the seed, longitudinal and cross diameter of the fruit and yield of pulp. The characterization of the pulp were determined by the total acidity, ash, moisture, pH, reducing sugars and total soluble solids (° Brix), proteins, lipids, vitamin C and total energetic value. All genotypes showed the physical
characteristics required by the processing industries featuring fruits with low acidity, lightly sweetened and pulp yield exceeding 60%. The fruits of cambui maçaranduba presented high content of Vitamin C, averaging 1101.4 mg.100 g-1 and 227.4 mg.100 g-
1, respectively. All the genotypes showed differences between the evaluated parameters allowing to select genotypes with a single character or more simultaneously / O trabalho teve como objetivo caracterizar física e quimicamente frutos de genótipos de cambuí, guajiru e maçaranduba nativos de ocorrência nos municípios de Paripueira, Maceió, Marechal Deodoro e Piaçabuçu, Alagoas. As amostras foram avaliadas individualmente quanto aos caracteres: massa fresca do fruto, massa fresca da polpa, massa fresca da casca, massa fresca da semente, diâmetro longitudinal e transversal do fruto e rendimento de polpa. Na caracterização da polpa foram determinadas acidez total, cinzas, umidade, pH, açúcares redutores e totais, sólidos solúveis (ºBrix), proteínas, lipídios, vitamina C e valor energético total. Todos os genótipos apresentaram características físicas exigidas pelas indústrias de processamento apresentando frutos com baixa acidez, levemente adocicados e rendimento de polpa superior a 60%. Os frutos de cambuizeiro e maçarandubeira destacam-se pelo elevado teor de Vitamina C, com médias de 1101,4 mg.100 g-1 e 227,4 mg.100 g-1, respectivamente. Os genótipos avaliados apresentaram variabilidade entre os parâmetros analisados possibilitando selecionar genótipos através de um único caráter superior ou simultaneamente
|
264 |
Estudo de diversidade genética e efeito inibitório do látex de Calotropis procera em fungos fitopatogênicos / Genetic diversity study and inhibitory effect of Calotropis procera latex in pathogenic fungiSilva, Shamyra Georgia de Azevedo e 27 February 2015 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-12T19:18:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1
ShamyraGAS_Dissert.pdf: 1345668 bytes, checksum: 408f47b3e8a408dc7702858d04d13fc8 (MD5)
Previous issue date: 2015-02-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Silk Flower [Calotropis procera (Aiton) W.T. Aiton] is a plant that has been highlighted by the case of a species that has several features such as animal feed, traditional medicine, agriculture, environment, cosmetics and textile industry, and may also act to combat pests, fungi and viruses through mechanisms defense associated with your latex. This study aimed to evaluate latex fluid from Silk Flower in inhibiting the development of pathogenic fungi of Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani, Colletotrichum musae and Monosporascus cannonballus and study the genetic diversity from Silk Flower genotypes using the RAPD and ISSR molecular markers. Twenty samples of species of leaves were collected in the Grossos/RN and Mossoró/RN cities (ten plants from each city). The plants latex were tested on four different types of phytopathogenic fungi, Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani, Colletotrichum musae and Monosporascus cannonballus with two different methods (adding latex to the culture medium before and after polymerization middle), and with two different concentration level (neat and diluted 1:1). For molecular analysis, DNA of each plant was extracted with 11 RAPD primers and 10 ISSR primers. For latex analyzes, it was observed that there was no inhibitory effect for any of Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani, Colletotrichum musae and Monosporascus cannonballus isolates in any of the concentrations tested under the conditions studied. Molecular results showed a good standard for both amplification of DNA markers, showing the formation of different groups, and the presence of genetic variability has been detected. For the analysis with molecular markers there was the formation of the four distinct groups, and in the ISSR marker was observed the formation of six groups. When it was analyzed the two markers in a corresponding manner it was possible to detect the formation of seven distinct groups showing the existence of variability. The difference in the results of both markers can be explained by the case of two markers that covered different regions of the genome / Flor de Seda [Calotropis procera (Aiton) W.T. Aiton] é uma planta que tem recebido destaque por se tratar de uma espécie que possui diversas funcionalidades como alimentação animal, medicina tradicional, agricultura, meio ambiente, indústria cosmética e têxtil, podendo também atuar no combate à pragas, fungos e vírus através de mecanismos de defesa associados ao seu látex. Objetivou-se nesse estudo avaliar fluidos laticíferos da Flor de Seda na inibição do desenvolvimento de fungos fitopatogênicos de Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani, Colletotrichum musae e Monosporascus cannonballus e estudar a divergência genética de genótipos de Flor de Seda por meio de marcadores moleculares RAPD e ISSR. Vinte amostras de folhas da espécie foram coletadas na cidade de Grossos/RN e na cidade de Mossoró/RN no Campus Leste da UFERSA (dez plantas para cada local de coleta). O látex das plantas foram testados em quatro diferentes tipos de fungos fitopatogênicos, Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani, Colletotrichum musae e Monosporascus cannonballus com duas diferentes metodologias (adicionando o látex ao meio de cultura antes e após a polimerização do meio) e com dois níveis diferentes de concentração (puro e diluído 1:1). Para as análises moleculares, o DNA de cada uma das plantas foi extraído com 11 primers RAPD e 10 primers ISSR. Para as análises do látex, foi observado que não houve efeito inibitório para nenhum dos isolados de Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani, Colletotrichum musae e Monosporascus cannonballus em nenhuma das concentrações testadas nas condições estudadas. Os resultados moleculares obtidos revelaram um bom padrão de amplificação para ambos os marcadores de DNA, mostrando à formação de grupos distintos, tendo sido detectada a presença de variabilidade genética. Para as análises com os marcadores RAPD houve a formação de quatro grupos distintos, e para o marcador ISSR foi possível observar a formação de seis grupos. Quando se analisou os dois marcadores de forma correlacionada foi possível detectar a formação de sete grupos distintos demonstrando a existência de variabilidade. A diferença encontrada nos resultados de ambos marcadores pode ser explicada por se tratar de dois marcadores que cobriram diferentes regiões do genoma
|
265 |
História evolutiva de Ctenomys minutus e Ctenomys lami (RODENTIA, CTENOMYIDAE) na planície costeira do sul do BrasilLopes, Carla Martins January 2011 (has links)
Ctenomys lami e C. minutus são espécies irmãs de roedores subterrâneos, pertencentes ao grupo filogenético torquatus do gênero Ctenomys. Estas espécies são indistinguíveis através da morfologia externa, no entanto C. lami foi recentemente descrita como uma nova espécie distinta de C. minutus devido às diferenças em seus cariótipos, principalmente com relação às formas dos cromossomos e números diplóides, os habitats distintos que ocupam e também pelas diferenças encontradas através de análises morfométricas de seus crânios e mandíbulas. Ambas as espécies são endêmicas da planície costeira do Sul do Brasil e apresentam um notável polimorfismo cromossômico. Ctenomys minutus se distribui em uma estreita faixa de dunas ou campos arenosos próximos da linha da costa, nos estados do Rio Grande do Sul (RS) e sul de Santa Catarina (SC). Apresenta números diplóides variando de 2n = 42 até 50 e números autossômicos (NA) de 68 a 80, compreendendo um total de 45 cariótipos descritos até o momento. Ctenomys lami é geograficamente restrito a uma área de 78 x 12 km, chamada Coxilha das Lombas, correspondente aos campos arenosos mais internos da planície costeira do RS. Apresenta 5 números diplóides variando de 2n = 54 a 58 e NA variando de 74 a 84, os quais combinados formam 26 cariótipos. Quatro blocos cariotípicas, denominados blocos A, B, C e D, foram descritos para esta espécie considerando os rearranjos Robertsonianos encontrados. Além disso, duas zonas híbridas intraespecíficas foram descritas, uma entre os blocos cariotípicos A x B e outra localizada entre os os blocos C x D. Ainda, nas proximidades da Lagoa dos Barros existem evidências da ocorrência de uma zona de hibridação interespecífica. Com os objetivos de acessar os padrões filogeográficos e populacionais dessas duas espécies, confirmar e caracterizar a zona híbrida interespecífica e providenciar informações para ajudar a traçar estratégias conservacionistas, foram analisados 2 fragmentos do DNA mitocondrial e 14 loci de microssatélites em 172 espécimes de C. lami, 340 espécimes de C. minutus e 19 possíveis híbridos, associados aos cariótipos de cada um dos espécimes e informações geomorfológicas a respeito do ambiente que ocupam. Para as duas espécies as descontinuidades no ambiente agem como um dos principais fatores estruturantes da variabilidade genética, representadas principalmente por cursos de água mais volumosos. Além disso, o isolamento pela distância também desempenha um papel importante no padrão de diferenciação populacional para as duas espécies, sendo mais evidente em alguns trechos da distribuição geográfica do que em outros. Não foram observadas associações diretas entre mudanças significativas na estrutura genética com os diferentes rearranjos cromossômicos encontrados tanto em C. lami quanto em C. minutus, demonstrando que os diferentes cariótipos presentes nestas espécies desempenharam, até o momento, um papel secundário na estrutura genética das populações. Apesar da ausência de clados reciprocamente monofiléticos para o DNAmt, C. lami e C. minutus são consideradas como duas espécies distintas com base nos resultados das análises citogenéticas, dos loci de microssatélites, pelas diferenças na morfologia do crânio e mandíbula e a distinção dos habitats que ocupam. A presença de uma zona de hibridação interespecífica foi confirmada, os 19 híbridos apresentaram cariótipos intermediários entre as espécies analisadas, genoma mitocondrial proveniente de C. minutus, e a composição dos loci de microssatélites provenientes de C. lami, levando a conclusão de que houve um cruzamento preferencial, ou até mesmo exclusivo, ao menos nos primeiros estágios da formação dessa zona híbrida, entre fêmeas de C. minutus com machos de C. lami. Os dados demonstraram também uma introgressão substancial do genoma nuclear de C. lami nos espécimes de C. minutus coletados nas proximidades da zona híbrida. Mediante o exposto, medidas conservacionistas devem ser tomadas focando conter o avanço da hibridação e introgressão entre essas espécies, além de preservar a integridade de populações puras que não sofrem a influência desses eventos. Além disso, sugerimos que C. minutus seja incluído em listas vermelhas de espécies ameaçadas como quase ameaçado, e C. lami como vulnerável. / Ctenomys minutus and C. lami are burrowing rodents that have been considered sister species of the torquatus group in the Ctenomys genus. These species are undistinguishable trough the external morphology, however C. lami were recently described as a separated species from C. minutus due to differences in their karyotypes, mainly regards the chromosomal forms and diploid numbers, the distinct habitats that these species occupy, and even by differences in the morphology of their skulls and mandibles. Both species are endemic to the southern Brazilian coastal plain and have notable chromosomal polymorphisms. Ctenomys minutus have a narrow distribution along the first dunes or sand fields near to the coast, in Rio Grande do Sul (RS) and Santa Catarina (SC) Brazilian states. This species presents diploid numbers ranging from 2n = 42 to 50, and the autosomal arm numbers (AN) ranging from 68 to 80, comprising a total of 45 karyotypes described until now. Ctenomys lami are geographically restricted to an area of 78 x 12 km, named as Coxilha das Lombas, corresponding to more internalized sandy fields of the RS coastal plain. This species have five diploid numbers from 2n = 54 to 58 and ten AN from 74 to 84, which combined formed 26 karyotypes. Four karyotypic blocks, named as Blocks A, B, C and D, were described for this species considering the Robertsonian rearrangements. Also, two intra-specific hybrid zones were reported for this species, one between blocks A x B, and another between blocks C x D. Near to the Barros Lake there are evidences of an interspecific hybrid zone between these species. The aims of this study are assess the phylogeographical and populational patterns for both species, to confirm and characterize the interspecific hybrid zone and provide informations to help future conservation decisions and management strategies for both species. For this, 2 fragments of mtDNA and 14 microsatellite loci were analyzed in 172 specimens of C. lami, 340 specimens of C. minutus, and 19 possible hybrids, associated to the karyotypes of each specimen sampled and geomorphological informations about the habitat occupied. In both species the environmental discontinuities act as effective geographical barriers to the gene flow, mainly major water streams. Moreover the isolation-by-distance also plays a key role in the pattern of genetic differentiation of populations, being more evident is some areas of the geographical distributions. There were no direct associations between distinct chromosomal rearrangements and genetic structures in both C. lami and C. minutus, evidencing that karyotypes do not play a causative role in the genetic structure of populations. The absence of monophyletic clades separating both species was not considered by us as enough evidence to detract C. minutus and C. lami to a single taxa, since all other analyses regarding the pattern retrieved in microsatellite data, cytogenetic analyzes, and morphological and habitat differences confirm their status as two separated sister species, only recently differentiated. The interspecific hybrid zone was strongly evidenced by 19 individuals with intermediate karyotypic forms between the species analyzed. All hybrids showed mtDNA content exclusively from C. minutus, and nuclear microsatellite composition from C. lami, suggesting that the hybrid zone was formed by a pattern of crossings between females of C. minutus with males of C. lami. Also, a substantial clinal introgression of the genomic content of C. lami into C. minutus individuals sampled around the hybrid zone was reported. Conservation efforts should focus in hold the progress of introgression, to preserve the integrity of pure populations. Moreover, C. minutus have to be included in red lists of endangered fauna as near threatened and C. lami have to be included as vulnerable.
|
266 |
Calogênese e Uso de Fatores Abióticos e Bióticos na Produção de Metabólitos Secundários da Catingueira (Poincianella pyramidalis Tull.)Copeland, Kícia Karinne Pereira Gomes 04 September 2015 (has links)
Submitted by Renorbio (renorbioba@ufba.br) on 2017-08-03T16:10:36Z
No. of bitstreams: 1
Tese - Kicia Karine Pereira Gomes Copeland.pdf: 2608232 bytes, checksum: 98052da7375a345d81c9bb7394b11047 (MD5) / Approved for entry into archive by Delba Rosa (delba@ufba.br) on 2017-08-10T15:11:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1
Tese - Kicia Karine Pereira Gomes Copeland.pdf: 2608232 bytes, checksum: 98052da7375a345d81c9bb7394b11047 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-10T15:11:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Tese - Kicia Karine Pereira Gomes Copeland.pdf: 2608232 bytes, checksum: 98052da7375a345d81c9bb7394b11047 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A Caatinga a alguns anos atrás era dita como um ecossistema pobre no que tange a espécies endêmicas, fato esse que, após diversos estudos, são contestados, mostrando que possui uma rica biodiversidade e altos índices de endemismos. Dentre essas muitas espécies endêmicas, temos a Poincianella pyramidalis (Tul.) L. P. Queiroz, sinônimo botânico Caesalpinia pyramidalis Tul., conhecida por diversos nomes populares como pau-de-rato, catinga de porco, catingueira, dentre outros. Apresenta diversos usos, dentre um dos mais importantes, o seu uso medicinal que, destaca-se pela produção de compostos bioativos como flavonoides, triterpenos, fenilpropanoides e biflavonóides; sendo este último grupo de bioativos, relativamente raro na família Leguminosae e, na subfamília Caesalpinaceae, onde foi isolado pela primeira vez. No perfil químico dessa espécie já foram identificadas a amentoflavona e agatisflavona pertencentes à classe dos biflavonóides. Fatores tais como, condições geográficas, sazonalidade, ambiente, entre outros, provocam oscilação na concentração de metabólitos secundários e, em árvores da Caatinga, em períodos de seca, a coleta do material vegetal é prejudicada, uma vez que não há frutos, folhas, flores, para extração de metabólitos secundários em qualquer época do ano. Assim, esses aspectos demonstram a necessidade urgente de implementação de programas voltados para a multiplicação, conservação, produção e potencialização dos bioativos de interesse de espécies vivendo nesses ambientes. Diante do exposto, esse trabalho teve como objetivos estabelecer a calogênese in vitro de P. pyramidalis visando construir um protocolo de produção da amentoflavona e agatisflavona, bem como, testar diferentes tipos de fontes de carbono, ausência/presença de luz, acessos e, diferentes concentrações de 2,4-D combinados ao meio de cultivo, no intuito de aumentar a produção de amentoflavona e agatisflavona a partir de cultura de calos de P. pyramidalis. Os estudos mostraram que o 2,4-diclorofenoxiacético induz calos em explantes nodal, foliar e internodal de P. pyramidalis e, que concentrações de 6,28 mg.L-1, 6,49 mg.L-1 e 4,91 mg.L-1 de 2,4-D nos segmentos nodal, internodal e foliar, respectivamente, favorecem a maior formação de calos aos 30 dias. Além disso, pode-se verificar que concentração de 10 mg.L-1 de 2,4-D proporciona
ix
maior oxidação nos calos aos 30 dias de cultivo, sendo que a maior formação de calos ocorre na concentração de 4,91 mg.L-1 de 2,4-D para o explante foliar aos 30 dias de cultivo in vitro. O acesso de Pernambuco, produz uma maior biomassa (0,1882 g) dos calos de Catingueira. No entanto, em ambos os acessos (BA e PE), a produção de amentoflavona é maior do que da agatisflavona em todos os tratamentos. Pode-se ainda verificar que a maior biomassa em calos de P. pyramidalis ocorre no tratamento com sacarose + 5 mg.L-1 de 2,4-D e, que o período de tempo de 60 dias é ideal para a produção da biomassa em calos de P. Pyramidalis; sendo que Sacarose + 5 mg.L-1 de 2,4-D favorece uma maior produção de amentoflavona (16,44 mg.L-1) e agatisflavona (0,58 mg.L-1). Enquanto que, o tratamento GT3 (Claro – Glicose 30 g.L-1 + 1 mg.L-1 de 2,4-D) é ótimo para a biossíntese de agatisflavona (5,87 mg.L-1) e amentoflavona (6,27 mg.L-1) aos 70 dias após inoculação. A biossíntese da amentoflavona é superior a agatisflavona em todos os tratamentos estudados. / A few years ago, the caatinga was said to be a poor ecosystem with respect to endemic species, a fact that, after several studies, are contested showing that boasts a rich biodiversity and high levels of endemism. Among these many endemic species, Poincianella pyramidalis (Tul.) L. P. Queiroz, botanical synonymous Caesalpinia pyramidalis Tul., known by several common names as pau-de-rato, catinga de porco, catingueira, among others. This specie has several uses, among the most important, its medicinal use that stands out for the production of bioactive compounds such as flavonoids, triterpenes, phenylpropanoids and bioflavonoids. The latter bioactive group is relatively rare in the Leguminosae family and the subfamily Caesalpinaceae, which was first isolated. In the chemical profile of this specie have been identified amentoflavone and agatisflavone, compounds belonging to the biflavonoid groups. Among other factors, geographical conditions, seasonality, environment cause during dry periods, fluctuation in the concentration of secondary metabolites in the Caatinga trees, and, the collection of plant material is impaired, since there is no fruit, leaves and flowers for extraction of secondary metabolites in any season. These aspects demonstrate the urgent need for implementation of programs for multiplication, conservation, production and enhancement of bioactive interest species living in these environments. Thus, this study aimed to establish the in vitro callus formation of P. pyramidalis in order to build a protocol of amentoflavone and agatisflavone, productions as well as to test different types of carbon sources, absence/presence of light, access and different 2,4-D concentrations to the culture medium combinations to increase the production of amentoflavone and agatisflavone from culture of callus of P. pyramidalis. The studies showed that 2,4-dichlorophenoxyacetic induces callus of P. pyramidalis nodal, leaf and internodal explants, and that 2,4-D concentrations of 6.28 mg.L-1, 6.49 mg.L-1 and 4.91 mg.L-1, in the nodal, internodal and leaf segments, respectively, favor higher callus formation at 30 days. Moreover, it can be seen that 2,4-D concentration of 10 mg.L-1 provides increased oxidation in callus after 30 days of cultivation, and the higher callus formation occurs at a 2,4-D concentration of 4.91 mg.L-1 to the leaf explant at 30 days of in
xi
vitro culture. The Pernambuco access produces a greater biomass (0.1882 g) of Catingueira calluses. However, in both access (BA and PE), the production of amentoflavone is greater than the agatisflavona in all treatments. It´s also observed that the higher biomass in P. pyramidalis callus occurs upon treatment with sucrose + 2,4-D 5 mg.L-1, and the 60 day time period is optimal for biomass production in P. Pyramidalis calluses; wherein Sucrose + 2,4-D 5 mg.L-1 favors an increased production of amentoflavone (16.44 mg.L-1) and agatisflavone (0.58 mg.L-1). While the GT3 treatment (Light - Glucose 30 mg.L-1 + 2,4-D 1 mg.L-1) is great for agatisflavona biosynthesis (5.87 mg.L-1) and amentoflavone (6,27 mg.L-1) at 70 days after inoculation. The biosynthesis of amentoflavone is greater than agatisflavone in all treatments.
|
267 |
Análise molecular da variabilidade genética entre genótipos de Ricinus communis L. revelada por marcadores RAPD.Cunha, Muciana Aracely da Silva 11 September 2006 (has links)
The high world energy demand requires a search for renewable sources which are less
harmful to environment. Castor bean (Ricinus communis L.) cultivation is an excellent
alternative to compound the national energy matrix due to its traditional small and
intermediate producers, standing out as a culture with high economical and social appeal,
especially in Northeast region. There is a lack of information, especially at molecular level,
related to the amount of high genetic variability available in this oil crop. The objective of this
work was to characterize the genetic diversity within ten genotypes of Ricinus communis L.
by using RAPD molecular markers. A total of seven lines and three cultivars were evaluated,
which included five lines from Germplasm Bank of Embrapa Algodão, two lines from Costa
Rica and three Northeastern cultivars. Genomic DNA extraction was performed according
both to Graham et al. (1994) and an alternative protocol proposed in this study. Seven
arbitrary oligonucleotides employed in the RAPD-PCR amplification permitted to evaluate
the efficiency of the genomic DNA extraction protocols, DNA banding profiles and
calculation of similarity indexes. Similarity and cluster analysis were conducted using both
Jaccard and Dice coefficient and the unweighted pair group method. The similarity data
matrix was converted into a dendrogram. The amplified fragments yielded a total of 58
polymorphic bands ranging from 2394 to 3386 bp. On the basis of the performed analysis,
similarity indexes and data clustering revealed the occurrence of high genetic variability
among the genotypes. RAPD molecular markers were efficient on the detection of DNA
polymorphism within genotypes evaluated, suggesting that this marker could be suitable for
further characterization studies related to the main agroindustrial features of castor bean
germplasm. / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Alagoas / A elevada demanda energética mundial faz necessária a busca por fontes renováveis e menos
agressivas ao meio ambiente. O cultivo da mamona (Ricinus communis L.) constitui uma
excelente alternativa na composição da matriz energética nacional por ser tradicionalmente
praticado por pequenos e médios produtores, destacando-se como uma cultura de elevado
apelo econômico e social, em especial na região Nordeste. Existe uma escassez de
informações, especialmente no âmbito molecular, acerca da grande variabilidade genética
apresentada por essa oleaginosa. O objetivo do presente trabalho foi caracterizar a diversidade
genética entre dez genótipos de Ricinus communis L. por meio de marcadores moleculares
RAPD. Foram avaliadas cinco linhagens do BAG da Embrapa Algodão, duas linhagens
provenientes da Costa Rica e três variedades comerciais da região Nordeste. A extração do
DNA genômico total dos genótipos foi realizada segundo metodologia descrita por Graham et
al. (1994) e através de um protocolo alternativo proposto nesse estudo. O emprego de sete
iniciadores arbitrários na amplificação RAPD-PCR permitiu avaliar a eficiência dos
protocolos na extração do DNA genômico total, o padrão de bandas de DNA gerado e o
cálculo de índices de similaridade. A matriz de dados de similaridade entre os genótipos foi
convertida num dendrograma. Na análise dos fragmentos amplificados foram reveladas 58
bandas polimórficas com fragmentos de 2394 a 3386 pb. Ainda na avaliação dos resultados, a
distância genética e o agrupamento gerado pelo dendrograma evidenciaram a grande
variabilidade genética existente entre os indivíduos. Os marcadores moleculares RAPD
mostraram-se eficientes na detecção de polimorfismos de DNA dos demais genótipos
avaliados, tornando possível seu emprego em posteriores estudos de caracterização
correlacionados com os principais caracteres agroindustriais de germoplasma de mamona.
|
268 |
Análise de variabilidade genética e obtenção de protoplastos do fungo Fusarium solani f. sp. glycines, agente causal da síndrome da morte súbita em soja (Glycine max L. Merrill) / Genetic variability and protoplasts isolation of Fusarium solani f. sp. glycines, the causative agent of sudden death syndrome in soybean (Glycine max L. Merrill)Aleixo, Luciana Aguilar 26 June 2003 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-01T18:40:48Z
No. of bitstreams: 1
texto completo.pdf: 2130474 bytes, checksum: b9156f2bfd2a4a0f4c702f5e05f2d6c3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-01T18:40:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1
texto completo.pdf: 2130474 bytes, checksum: b9156f2bfd2a4a0f4c702f5e05f2d6c3 (MD5)
Previous issue date: 2003-06-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Fusarium solani f. sp. glycines, agente causal da síndrome da morte súbita em soja, é um importante patógeno no Brasil e em outras partes do mundo. Foram obtidos 15 isolados de F. solani f. sp. glycines a partir de 57 fragmentos de raíz de soja coletados em diferentes localidades no Brasil. A diversidade genética destes 15 isolados e de outros 4 isolados cedidos pelo Departamento de Fitotecnia da Universidade Federal de Viçosa, foi avaliada por RAPD. As amplificações com 15 oligonucleotídeos resultaram em 175 fragmentos polimórficos e 5 monomórficos. As distâncias genéticas entre os isolados variaram de 12,2 a 85%, revelando alta variabilidade genética. Não houve agrupamento dos isolados de acordo com seu local de coleta. Esta alta variabilidade genética provavelmente se deve à presença de transposons e de ciclo parassexual do patógeno. Protoplastos de Fusarium solani f. sp. glycines foram obtidos por digestão enzimática do micélio, na presença de MgSO 4 1,2 M como estabilizador osmótico. Foram liberados 2,4 X 10 7 protoplastos/mL após 4 horas de digestão do micélio a 28°C e 80 rpm. A concentração ideal de enzima lítica para a protoplastização foi de 15 mg/mL. A maior taxa de regeneração dos protoplastos foi de 5,5% em meio BDA estabilizado com sacarose 1,0 M. / Fusarium solani f. sp. glycines, the causative agent of sudden death syndrome in soybean, is an important pathogen in Brazil and in other parts of the world. Fifteen F. solani f. sp. glycines isolates were obtained out of 57 root fragments collected in different growing regions in Brazil. The genetic diversity of these isolates and that of four isolates obtained from the Department of Plant Sciences of the Federal University of Viçosa were analyzed by RAPD. Amplification with 15 primers resulted in 175 polymorphic and 5 monomorphic DNA fragments. The genetic distances among the isolates ranged from 12.2 to 85%. No grouping was obtained based on geographic localization, certainly because there were not enough differentiation. This high genetic variability is probably due to the activity of transposons and the presence of the parassexual reproduction. Fusarium solani f. sp. glycines protoplasts were obtained by enzymatic digestion of micelium, using 1,2 M MgSO 4 as osmotic stabilizer. Aproximately 2.4 X 10 7 protoplasts/mL were obtained after 4 hours of micelium digestion at 28°C e 80 rpm. The optimum enzyme concentration was 15 mg/mL. The highest protoplast regeneration rate was 5.5% in BDA stabilized with 1,0 M sucrose. / Dissertação importada do Alexandria
|
269 |
Interação genótipos x ambientes, adaptabilidade, estabilidade e repetibilidade em clones de guaraná (Paullinia cupana var. sorbilis (Mart.) Ducke) / Genotype x environment interaction, adaptability, stability, and repeatability in clones of guarana (Paullinia cupana var. sorbilis (Mart) (Ducke)Nascimento Filho, Firmino José do 10 October 2003 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T18:11:20Z
No. of bitstreams: 1
texto completo.pdf: 691583 bytes, checksum: 4ef3641fa5567e83a1b4ec4ac4985770 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T18:11:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1
texto completo.pdf: 691583 bytes, checksum: 4ef3641fa5567e83a1b4ec4ac4985770 (MD5)
Previous issue date: 2003-10-10 / A guaranaicultura vem se tornando importante atividade agrícola no Estado do Amazonas, onde existe grande variação ambiental, principalmente em se tratando de seus solos e da atual expansão de seu plantio, que vem atingindo novos locais e regiões. Desta forma, a cultura é submetida a diversos fatores de ordem física, como no caso do tipo de solo, do clima e da aplicação de tecnologias modernas, a exemplo do uso de corretivos e fertilizantes, o que cria novas condições ambientais aos materiais genéticos que vêm sendo selecionados. O conhecimento da existência da interação genótipos x anos ou genótipos x locais e outros tipos de interações, de sua magnitude e também de sua significância, apesar de contribuir para melhorar a eficiência dos programas de melhoramento, não fornece informações detalhadas sobre o comportamento individual de cada genótipo, em relação aos fatores ambientais. Com essa finalidade, os dados deste estudo foram gerados em experimentos instalados em delineamento de blocos casualizados completos, com duas repetições, e em parcelas constituídas por três plantas, espaçadas 5 m x 5 m. Para atender aos objetivos propostos, foi fundamental a avaliação em várias condições de cultivo, para possibilitar o estudo das interações e, a partir destas, estimar os parâmetros adaptabilidade e estabilidade fenotípica dos clones de guaraná e também, com base nos coeficientes de repetibilidade, o número mínimo de medições necessárias para se obter o real valor genotípico dos materiais. Os resultados das análises biométricas têm como propósitos contribuir, orientar e adotar melhores estratégias de seleção para o Programa de Melhoramento Clonal do Guaraná da Embrapa Amazônia Ocidental (Centro de Pesquisa Agroflorestal da Amazônia Ocidental – CPAA), em Manaus, AM, além de identificar genótipos superiores, objetivando proporcionar aos produtores clones de bom desempenho produtivo e adequado às condições disponíveis de cultivo. Os resultados alcançados neste trabalho indicaram a existência de expressiva variabilidade entre os clones e interação significativa de genótipos x ambientes, com predominância da fração comfplexa e de condições favoráveis à seleção, em razão dos altos coeficientes de determinação genético (H 2 ) e da existência de relação CVg/CVe maior ou próxima de 1,0. Maior discriminação entre os clones avaliados foi verificada nos ambientes de alta potencialidade, ou seja, o local Maués, em solo de mata primária e capoeira, sendo neste último caso adubado. Com base no comportamento dos clones, foram detectados materiais com adaptabilidades ampla e específica às condições favoráveis e desfavoráveis, destacando-se o clone CMU871, com alta produção, boa estabilidade e alta adaptabilidade, ou seja, responsivo à melhoria das condições de cultivo; e o clone CMU619, que apresentou alta produção, porém com especificidade às condições favoráveis. Determinou-se que quatro anos de avaliação da produção são necessários para acessar o real valor dos clones, porém, para isso, deve-se excluir da análise a primeira produção mensurável. / Guarana culture is increasingly becoming an important agricultural activity in the state of Amazon, which presents great environmental variation, especially in soil and expanded planted area, reaching new places and regions. Thus, the culture is submitted to several physical factors such as type of soil, climate and modern technologies, e.g., correctives and fertilizers, creating new environmental conditions for the genetic materials being currently selected. Despite contributing to improving breeding program efficiency, knowledge about genotype x year or genotype x place interactions and other types of interactions, their magnitude as well as their significance does not supply detailed information on the individual behavior of each genotype in relation to the environmental factors. Thus, experiments were arranged in a randomized complete block design with two repetitions with plots being three 5 m x 5 m spaced plants. In order to meet the proposed objectives, evaluation under various cultivation conditions was fundamental to allow the study of interactions and based on these, to estimate the parameters adaptability and phenotypic stability of the guarana clones and also, based on the repeatability coefficients, the minimal number of necessary measurements to obtain the real genotypic value of the materials. The biometric analysis results aim at contributing to, guiding, and adopting improved selection strategies for the Guarana Clonal Breeding Program – Embrapa Amazonia Ocidental (Centro de Pesquisa da Amazonia Oriental – CPAA) in Manaus, AM, besides identifying superior genotypes to provide producers clones with good productive performance and adequate to the available cultivation conditions. The results obtained in this work indicate an expressive variability among clones and significant genotype x environment interaction, with a predominance of the complex fraction and favorable selection conditions, due to the high genetic determination coefficients (H 2 ) and CVg/CVe relation greater or close to 1.0 Greater discrimination among the clones evaluated was verified in highly potential environments, i.e., Maues, located in primary forest soil and second growth soil, being fertilized in the latter. Based on the behavior of the clones, amply and specifically adapted materials for favorable and unfavorable conditions were detected, especially clone CMU871,which displayed high production, good stability and high adaptability, i.e., was responsive to the improved cultivation conditions; and clone CMU619, which presented high production but with specificity under favorable conditions. It was determined that four years of production evaluation are necessary to assess the real value of the clones. However, the first measurable production must be excluded from the analysis. / Tese importada do Alexandria
|
270 |
Mancha-angular do feijoeiro-comum: variabilidade genética do patógeno e identificação de marcadores moleculares ligados à resistência / Common bean angular leaf spot pathogen genetic variability and identification of molecular markers associated with resistanceNietsche, Silvia 02 March 2000 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-10-10T18:16:30Z
No. of bitstreams: 1
texto completo.pdf: 13406581 bytes, checksum: 15d4117957a92e914ab43a5c6615e1ba (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-10T18:16:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1
texto completo.pdf: 13406581 bytes, checksum: 15d4117957a92e914ab43a5c6615e1ba (MD5)
Previous issue date: 2000-03-02 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A mancha-angular, causada pelo fungo Phaeoisariopsis griseola (Saco) Ferraris, é atualmente uma das principais doenças do feijoeiro no Brasil. O patógeno apresenta alta variabilidade, e o desenvolvimento de novas variedades depende da identificação de novas fontes de resistência. Trabalhos recentes têm demonstrado a alta diversidade genética desse patógeno e a sua co-evolução com os grupos Andino e Mesoamericano de feijoeiro. Trabalhos acerca da herança da resistência a P. griseola têm evidenciado uma herança monogênica dominante em alguns casos e recessiva em outros. Os objetivos dessa série de estudos foram investigar a diversidade genética de P. griseola, determinar a herança da resistência e identificar marcadores RAPD e SCAR ligados ao gene de resistência à mancha-angular no cruzamento entre Rudá e Cornell 49-242. Para avaliar a diversidade genética de isolados de P. griseola coletados no Estado de Minas Gerais e em diversos estados brasileiros. foi utilizada uma série diferenciadora composta de 12 variedades de feijão e marcadores RAPD. Os estudos acerca da diversidade genética confirmaram a 17 raças fisiológicas. O patótipo 63.31 foi a raça que agrupou o maior numero de isolados, estando distribuída em quatro das cinco regiões amostradas. Apenas um isolado apresentou reação de compatibilidade com todos os genótipos da série diferenciadora e foi classificado como do patótipo 63.63, o que indicou a necessidade de inclusão de novos genótipos na série diferenciadora. Por meio do uso do primer OPAA 11 e dos dados do fenótipo de virulência, determinou-se a presença do acervo Mesoamericano no Estado de Minas Gerais. Foram estudados 39 isolados provenientes de diversos estados brasileiros, tendo sido identificados 20 patótipos. Além da determinação da diversidade genética, foram testadas nove potenciais fontes de resistência. 0 cultivar México 54 evidenciou-se como o mais resistente, apresentando reação de incompatibilidade a 20 das 25 raças testadas. Os cultivares AND 277, MAR 2, Cornell 49-242, Bat 332 e G 5686 também se destacaram como boas fontes de resisténcia. O cultivar Rudá foi suscetível à maioria dos isolados testados. Os resultados do estudo de herança indicaram a presença de um gene dominante controlando a resistência à mancha-angular no cultivar Cornell 49-242. Foram mapeados dois marcadores RAPD (OPNOZ
890 e OPEO4 650) ligados em fase de acoplamento a 3,2 e 12,5 CM do gene de resistência. 0 fragmento NOOZ 890 foi transformado em um marcador do tipo SCAR. Foi proposta a designação Phg-2 para o gene de resistência presente no cultivar Cornell 49-242. As análises efetuadas na série diferenciadora indicaram que alguns genótipos não são bons diferenciadores da mancha-angular. Fatores experimentais podem estar contribuindo para uma classificação incorreta dos patótipos de P. griseola. / Angular leaf spot, caused by fungus Phaeoisariopsis griseola (Saco) Ferraris, is one of the most important bean disease in Brazil. The pathogen has demonstrated to be highly variable and breeding programs dependent on the identification of new resistance genes to develop resitant cultivars. Recent studies demonstrated a high genetic diversity of this pathogen and its co- evolution with the Andean and Mesoamerican common bean groups. Several works has demonstrated that resistance to this pathogen has been attributed to one gene, sometimes dominant or recessive. The objective of this study were to determinate the inheritance of the resistance and to identify RAPD and SCARs markers linked to angular leaf spot resistance gene in the cross between Cornell 49 -2424 and Ruda, and to assay the genetic diversity P. griseola isolates from the state of Minas Gerais and from others Brazilian states. A differential series composed of 12 bean varieties and RAPD markers were used. Out of 49 isolates tested in Minas Gerais state, 17 races were identified. Race 63.31 grouped the greatest number of isolates. being distributed in four of the five studied regions. The virulence phenotypes showed a high virulence of the isolates. One isolate presented a reaction of compatibility with all genotypes of the differential series and was classified as being from race 63.63, wich suggest the introduction of the new genotypes in the series. The use of OPAA 11 primer and differential series, suggest the group mesoamerican in Minas Gerais state presence. The genetic diversity of 39 P. griseo/a isolates from the seven brasilian states were studied. The results confirmed a variability of the pathogen in Brazil: in 30 isolates tested, 20 phisiological races were obtained. In this study, not only the determination of the races was carrie out, but also nine potential resistance sources were tested. The results confirmed a variability of the pathogen in Mlnas Gerais state and in Brazil. The Mexico 54 cultivar was the most resistant, pressenting incompatibility reaction to 20 of the 25 races tested. AND 277, MAR-2, Cornell 49-242, BAT 332 and (55686 cultivars were good resistance sources. The cultivar Rudá, type, was susceptible to most of the isolates. In the inheritance study, the results indicated that a single gene dominant controls resistance in Cornell 49-242. Two RAPD markers were mapped OPNo2 ago and OPEO4 650 in coupling phase at 3.2 and 12.5 CM from the resistance gene. The No02 890 fragment was transformed into a SCAR marker and we proposed the designation Phg-2 for the angular leaf spot resistance gene in cultivar Cornell 49-242. The use of RAPD markers and the characterization of the pathotypes of P. griseola indicate the necessity of the substitution of some genotypes and the standardization of the protocols and methodologies related to the characterization of the genetic variability of P. griseola.
|
Page generated in 0.102 seconds