Made available in DSpace on 2014-08-20T13:25:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_Adriana_Bresolin.pdf: 922904 bytes, checksum: 994cdef3777d7dda7255248c60c02f65 (MD5) Previous issue date: 2010-11-23 / Iron toxicity is one of the most important abiotic stresses limiting irrigated rice production worldwide. This study was performed with the goal of characterizing irrigated rice genotypes regarding Fe2+ stress tolerance under controlled conditions, using na hydroponic system. Furthermore, to analyse the expression profile of genes involved in iron homeostasis in plants, using quantitative PCR (qRT-PCR). The genotypes used were BRS-Agrisul, Epagri 108, BR-IRGA 409, BR-IRGA 410 and Nipponbare. An interference of the chelating agent (EDTA) was observed on the genotype characterization; when exposed to 0, 3, 6, 9 and 12 days of stress. The expression of genes OsFDRL1, OsNRAMP1 and OsNRAMP2 was measured at 0; 6; 12; 18 and 24h under Fe2+ stress. It was observed that Fe2+ in its free form without Na2EDTA, is acumulated in higher concentrations in the shoots of rice seedlings when compared to its chelated form (Fe-EDTA). Iron toxicity interfered negatively on the development of root length (RL) and shoot length (SL), being RL the variable that was most affected. Stress period increases led to iron accumulation in the shoots. The hydroponic system was efficient to allow discrimination between iron tolerant and sensitive genotypes. Iron sensitive genotypes observed in this study were BR-IRGA 409 and Nipponbare, which were those with higher iron accumulation in the shoots. Medium tolerant and tolerant genotypes also accumulated iron in the shoots. The increase in Fe2+ accumulation in the tissues under high iron stress was correlated with increased contents of Zn and Mn in the same tissues. Contrasting genotypes regarding iron tolerance showed differential expression of iron homeostasis genes OsFRDL1, OsNRAMP1 and OsNRAMP2. / A toxidez por ferro é um dos mais importantes estresses abióticos a limitar a produção de arroz irrigado em nível mundial. Este estudo foi realizado com o objetivo de caracterizar genótipos de arroz irrigado quanto a tolerância ao estresse por Fe2+ sob condições controladas, viabilizando o sistema de cultivo hidropônico para esta finalidade. Além disso, analisar o perfil de expressão de genes envolvidos na homeostase do metal em plantas, através da técnica de qRT-PCR. Foi verificada a interferência da utilização do agente quelante (EDTA) na caracterização dos genótipos; analisado o efeito do tempo de exposição a toxidez (0, 3, 6, 9 e 12 dias) sob o crescimento das plântulas; caracterizados genótipos de arroz ( BRS-Agrisul, Epagri 108, BR-IRGA 409, BR-IRGA 410 e Nipponbare) quanto a tolerância a toxidez por Fe2+ e por fim realizada a análise de expressão dos genes OsFDRL1, OsNRAMP1 e OsNRAMP2 nos tempos 0; 6; 12; 18 e 24h sob estresse por Fe2+. Foi verificado que o Fe2+ na sua forma livre sem Na2EDTA é acumulado em maior concentração na parte aérea de plântulas de arroz do que quando este se apresenta quelado na forma de Fe-EDTA. A toxidez por ferro interferiu negativamente sobre o desenvolvimento do CR e CPA, sendo o CR a variável mais afetada. O aumento do tempo de estresse resultou no incremento do acúmulo de ferro na parte aérea das plântulas. O sistema hidropônico demonstrou eficiência na caracterização de genótipos quanto a tolerância a toxidez por ferro. Genótipos caracterizados como sensíveis a toxidez por ferro neste estudo, BR-IRGA 409 e Nipponbare foram os que apresentaram o maior acúmulo de Fe2+ na parte aérea. Genótipos caracterizados como moderadamente tolerantes e tolerantes também acumularam elevados teores do íon metálico. O aumento do acúmulo de Fe2+ nos tecidos sob condição de excesso do íon na solução apresentou correlação com o aumento de Zn e Mn nestes mesmos tecidos. Constituições genéticas contrastantes quanto a tolerância a toxidez por ferro apresentam expressão diferencial dos genes OsFRDL1, OsNRAMP1 e OsNRAMP2 envolvidos na homeostase do metal.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-04-10T13:19:21Z No. of bitstreams: 1 Elizabete Cristina da Silva.pdf: 4327297 bytes, checksum: 969fe0e6e726dc739f29566fd5377097 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-10T13:19:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Elizabete Cristina da Silva.pdf: 4327297 bytes, checksum: 969fe0e6e726dc739f29566fd5377097 (MD5) Previous issue date: 2010-08-12 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / In Brazil, naturalized pigs or animals called locally adapted are endangered species due to the overvaluation of exotic pig breeds that have caused loss of genetic diversity in these populations. Thus, this study aimed to characterize diversity and genetic structure of nine pig genetics groups locally adapted: Baé (n=11), Caruncho (n=07), Canastra (n=29), Canastrão (n=09), Mamelado (n=07), Moura (n=18), Nilo (n=16), Piau (n=17) and mongrel (SRD; n=47) and three exotic breeds (Duroc=04, Landrace=21 and Large White=04) with 18 microsatellite markers as well as testing these markers to allocate individuals from a mongrel population and their actual population. It was detected 198 alleles with 18 loci examined in 190 pigs from 12 genetic groups, all of them were polymorphic with PIC (polymorphic information content) ranged from 0.541 (SW72) to 0.933 (S0005). The results of AMOVA showed that 3.2% of total variation came from the difference between genetic groups (P<0.0001) and 3.6% (P<0.0001) between local and commercials pigs. The average alleles and alleles effectives Nea were lower for commercial Duroc breed (3.65 and 3.008) and higher for mongrel populations (8.89 and 4.53) and Canastra (8.61, 4.58) detaching the high genetic diversity of the last ones. The nine local GG showed greater average value for the rates: alleles average number (Nam = 7.22), Nea (4.18), PIC (0.67) and the expected heterozygosis (He = 0.71), while the heterozygosis observed (Ho = 0.60) was lower due to intrapopulation inbreeding (FIS = 0.17). Using the UPGMA method, Landrace breed was grouped with Canastra, Moura, Canastrão, Baé and Caruncho populations. Another group was formed by populations Piau, Mongrel, Nilo and Mamelado, while Large White and Duroc breeds were isolated from the rest. Based on the two populations (K=2) for allocation of mongrel pigs, most (71.8%) individuals SRD was grouped into separate clusters of commercial breeds. Two clusters seem to accordingly describe the distribution of genetic variability found in 12 GG, which showed low level of differentiation, leading to a complex population genetic structure and the 18 loci were effective to allocate mongrel individuals to their actual population. / No Brasil, os suínos naturalizados ou animais ditos localmente adaptados encontramse em via de extinção devido à supervalorização das raças suínas exóticas que tem ocasionado perda de diversidade genética nessas populações. Dessa forma, objetivou-se caracterizar a diversidade e estrutura genética de nove grupos genéticos (GG) de suínos localmente adaptados: Baé (n=11), Caruncho (n=07), Canastra (n=29), Canastrão (n=09), Mamelado (n=07), Moura (n=18), Nilo (n=16), Piau (n=17) e Sem Raça Definida (SRD; n=47) e três raças exóticas: Duroc (n=04), Landrace (n=21) e Large White (n=04) com 22 marcadores microssatélites, e testar a viabilidade desses marcadores para alocar indivíduos de um GG SRD à sua população real. Detectou-se 198 alelos com 18 loci analisados em 190 suínos de 12 GG, todos foram polimórficos com PIC (conteúdo de informação polimórfica) variando de 0,54 (SW72) a 0,93 (S0005). Os resultados da AMOVA mostraram que 3,2% da variação total foram provenientes da diferença entre GG (P<0,0001) e 3,6% (P<0,0001) entre suínos locais e comerciais. As médias de alelos totais e efetivo de alelo (Nea) foram menores para a raça comercial Duroc (3,65 e 3,01) e maiores para os GG SRD (8,89 e 4,53) e Canastra (8,61e 4,58). Os nove GG locais apresentaram maior valor médio para os índices: número médio de alelos (Nam = 7,22), Nea (4,18), PIC (0,67) e heterozigosidade esperada (He = 0,71), enquanto, a heterozigosidade observada (Ho = 0,60) foi menor devido à consanguinidade intrapopulacional (FIS = 0,17). Com exceção da raça Large White, todos os GG apresentaram desvio significativo (P<0,05) para o Equilíbrio de Hardy-Weinberg. Utilizando o método UPGMA a partir da distância genética padrão de Nei, a raça Landrace foi agrupada com os GG locais Canastra, Moura, Canastrão, Baé e Caruncho. Baseando-se nos dois grupamentos (K=2) para os testes de alocação dos suínos SRD, a maior parte (71,8%) dos indivíduos SRD foi agrupada em clusters separados das raças comerciais. Dois grupamentos parecem descrever adequadamente a distribuição da variabilidade genética encontrada nos 12 GG, os quais apresentaram baixo nível de diferenciação, conduzindo a uma estrutura genética populacional complexa, e os 18 loci foram eficazes para alocar os indivíduos SRD a sua população real.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Mangaba (Hancornia speciosa Gomes) is a native fruit tree and geographically widespread in the Northeast Region and the Cerrado of Brazil. Currently, the increasing degradation and consequent reduction of natural occurrence areas resulting from anthropogenic activities has been putting strong pressure on native populations of this species. The aim of this study was to evaluate the diversity and genetic structure of remaining populations of mangaba tree in Northeastern Brazil by means of microsatellite (SSR) markers. From 6 to 20 individuals per population were randomly sampled, totaling 94 individuals and six populations proceeding from the States of Sergipe (Reserva do Caju, Barra dos Coqueiros, and Abaís), Ceará (Jacarecoara and Tapera), and Pernambuco (Tamandaré). Microsatellite regions were amplified by using nine primers previously developed. All populations had positive inbreeding coefficients (f), indicating that they are endogamous populations, with excess of homozygotes, absence of random outcrossing and existence of factors influencing allelic randomness. The highest value of genetic variability was observed in the population Jacarecoara from the State of Ceará and the lowest value, in the population Barra dos Coqueiros from the State of Sergipe. The values of genetic diversity indices GST, RST, and FST estimated for the six populations were equal to 0.14 (p < 0.05), showing moderate genetic differentiation among them. The lowest value of FST pairs (p > 0.05) was found between the populations Jacarecoara and Tapera (0.005), while the highest value was observed between populations Barra dos Coqueiros and Jacarecoara (0.287). The population Jacarecoara was the most divergent in relation to the others. Bayesian clustering analysis showed genetic differentiation of H. speciosa populations in two groups (K = 2). Therefore, the results show that populations of H. speciosa have moderate interpopulational genetic diversity, with the greatest variation due to differences within populations (83.18%), and that these populations have genetic potential for in situ conservation of the species, as well as for germplasm collection for ex situ conservation. / A mangabeira (Hancornia speciosa Gomes) é uma árvore frutífera nativa e de ampla distribuição geográfica na Região Nordeste e no Cerrado do Brasil. Atualmente, a crescente degradação e a consequente redução das áreas de ocorrência naturais resultantes de atividades antrópicas vêm exercendo forte pressão sobre as populações nativas da espécie. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade e a estrutura genética de populações de mangabeira remanescentes no Nordeste brasileiro, por meio de marcadores microssatélites (SSR). Foram amostrados aleatoriamente de 6 a 20 indivíduos por população, num total de 94 indivíduos e seis populações oriundas dos Estados de Sergipe (Reserva do Caju, Barra dos Coqueiros e Abaís), Ceará (Jacarecoara e Tapera) e Pernambuco (Tamandaré). As regiões com microssatélites foram amplificadas utilizando-se nove primers, previamente desenvolvidos. Todas as populações apresentaram coeficientes de endogamia (f) positivos, indicando que são endogâmicas, com excesso de homozigotos, ausência de cruzamento aleatório e existência de fatores influenciando a aleatoriedade alélica. Observou-se o maior valor de variabilidade genética na população Jacarecoara (Ceará) e, o menor na população Barra dos Coqueiros (Sergipe). Os valores dos índices de diversidade genética GST, FST e RST estimados para as seis populações foram iguais a 0,14 (p < 0,05), revelando moderada diferenciação genética entre elas. Verificou-se o menor valor de pares de FST (p > 0,05) entre as populações Jacarecoara e Tapera (0,005), enquanto o maior foi observado entre as populações Barra dos Coqueiros e Jacarecoara (0,287). A população Jacarecoara foi a mais divergente em relação às demais. A análise Bayesiana de agrupamentos evidenciou diferenciação genética das populações de H. speciosa em dois grupos (K = 2). Portanto, com base nesses resultados, depreende-se que as populações de H. speciosa apresentam moderada diversidade genética interpopulacional, sendo a maior variação devida a divergências dentro de populações (83,18%), e que essas populações têm potencial genético para a conservação in situ da espécie, bem como para coleta de germoplasma visando à conservação ex situ.

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-10-13T19:51:52Z No. of bitstreams: 1 ceciliafonsecapoggian.pdf: 268787 bytes, checksum: 5898d68297ebccdcc7f27145276525da (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2016-10-22T13:01:59Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ceciliafonsecapoggian.pdf: 268787 bytes, checksum: 5898d68297ebccdcc7f27145276525da (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-22T13:01:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ceciliafonsecapoggian.pdf: 268787 bytes, checksum: 5898d68297ebccdcc7f27145276525da (MD5) Previous issue date: 2008-02-26 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / FAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Os animais da raça Guzerá, bem adaptados às condições tropicais do Brasil, têm sido utilizados para produção de leite e carne. Em função da redução do tamanho efetivo da população, a probabilidade de endogamia e deriva genética na raça tem aumentado. Em 1994, iniciou-se o Programa Nacional de Melhoramento da Raça para leite por meio do teste de progênie e do núcleo MOET de seleção. O sucesso deste programa pode ser comprometido pelo aumento do coeficiente de endogamia (F) e perda de diversidade genética na raça, pois os animais de maior valor genético são mais utilizados para reprodução. O objetivo deste trabalho foi examinar a diversidade genética da população Guzerá selecionada para leite no Brasil, calcular a endogamia na raça e avaliar seus efeitos sobre características produtivas e reprodutivas, visando monitorar a variabilidade genética e orientar acasalamentos. Dados genealógicos de 10.051 animais nascidos até 2007 foram usados para estimação dos parâmetros populacionais. O coeficiente médio de endogamia dos animais endogâmicos foi 0,025, e o aumento esperado da endogamia, devido à contribuição não balanceada dos fundadores, foi 0,16%. O coeficiente de relação médio entre os indivíduos da população foi estimado em 1,06%, e o intervalo de gerações, em 7,48 anos. A média do tamanho efetivo populacional por geração foi 77, o número efetivo de fundadores, 318, o número efetivo de ancestrais, 101, e o efeito gargalo, 3,15. Dos 2.106 ancestrais, 47 foram responsáveis por 50% da diversidade genética da população referência. As características produção total de leite, produção de leite aos 305 dias de lactação, produção total de gordura, produção total de proteína e idade ao primeiro parto foram afetadas negativamente (p<0,05) pelo aumento do coeficiente de endogamia. Os valores médios de F, até o momento, são baixos, porém, o reduzido tamanho efetivo da população indica riscos de endogamia e perda de variabilidade genética na raça Guzerá selecionada para leite no Brasil. / Animals of the Guzerat breed have strongly fitted to tropical conditions of Brazil, and have been used for milk and beef production. The probability of inbreeding and genetic drift increases due to reduction in the effective population size. In 1994, a selection program for milk production traits was initiated in some purebred herds, using progeny test and MOET nucleus. Its success, otherwise, can be endangered by increase in inbreeding coefficient (F) and loss of genetic diversity, since animals with high genetic value have more chance to reproduce. This study was undertaken to evaluate the evolution and the current genetic status of the Guzerat cattle under milk selection, aiming to monitor the genetic variability and guide matings. Genealogical data of 10,051 animals born until 2007 were used to estimate population parameters. The average F for all inbred animals included in this data set was 0.025 and the increase of inbreeding by unbalancing of founders contribution was 0.16%. The average relationship coefficient was 1.06% and the generation interval was 7.48 years. The mean effective population size by generation was 77, the effective number of founders and effective number of ancestors for the reference population were, respectively, 318 and 101. The bottleneck effect was 3.15. Of 2,106 ancestors, 47 contributed to 50% of the reference population. Total milk production, milk production at 305 days of lactation, total fat production, total protein production and age at first calving was negatively affected (p<0.05) by the increase in F. Average F values and regression coefficients are still low, but the reduced effective population parameters indicates risk of inbreeding, genetic drift and, consequently, loss of variability in the Guzerat breed under milk selection in Brazil.

Submitted by Alisson Mota (alisson.davidbeckam@gmail.com) on 2015-06-30T19:17:25Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Pablo Roberto da Silva Ozório.pdf: 773168 bytes, checksum: 226550639f3d6045ccb166d38e42a2c4 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-06T17:36:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Pablo Roberto da Silva Ozório.pdf: 773168 bytes, checksum: 226550639f3d6045ccb166d38e42a2c4 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-06T17:42:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Pablo Roberto da Silva Ozório.pdf: 773168 bytes, checksum: 226550639f3d6045ccb166d38e42a2c4 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-06T17:42:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Pablo Roberto da Silva Ozório.pdf: 773168 bytes, checksum: 226550639f3d6045ccb166d38e42a2c4 (MD5) Previous issue date: 2013-06-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The genetic diversity among 18 guarana cultivars was characterized using 20 morphological descriptors including production aiming to support the selection of genetically divergent parents for controlled crosses. The similarity between cultivars was calculated using Gower general similarity coefficient. The dendrogram was constructed based on similarity matrix using the UPGMA clustering criterion. The scatter diagram of the cultivars was constructed based on the method of Principal Coordinates Analysis (PCO). Data were analyzed using the computational resources of the GENES program and MVSP v.3.22. Pairs of similar genotypes were BRS CG505 and BRS CG612 (0,823); BRS Amazonas and BRS CG608 (0,820); BRS Mundurucânia and BRS CG189 (0,807); BRS Cereçaporanga and BRS Andirá (0,805); BRS Marabitana and BRS Maués (0,796); BRS CG189 and BRS CG611 (0,784); BRS Andirá and BRS CG850 (0,771); BRS CG610 and BRS CG505 (0,770); BRS Saterê and BRS CG372 (0,717); BRS CG648 and BRS Andirá (0,703). Genotype pairs were less similar: BRS and BRS Marabitana CG850 (0.699); BRS BRS CG611 and CG882 (0.688); CG505 BRS and BRS Saterê (0.663); BRS BRS CG850 and CG612 (0.646); CG189 BRS and BRS Luzéia (0.640); Saterê BRS and BRS Andirá (0.628); BRS BRS CG189 and CG850 (0.585); BRS 372 and BRS CG850 CG (0.573). The dendrogram formed by the UPGMA method, obtained from the genetic distance Gower using a cutoff value of 0.64 allowed the formation of four groups, and indicated that there is high genetic diversity among cultivars currently recommended for planting in the State Amazon Embrapa Western Amazon. The graphic dispersion analysis method PCO showed good agreement with the cluster analysis by UPGMA method and showed great genetic variability among cultivars evaluated guarana in this work. / A divergência genética entre 18 cultivares de guaraná foi caracterizada utilizando 20 descritores morfoagronômicos inclusive produção visando subsidiar a seleção de genitores geneticamente mais divergentes para cruzamentos controlados. A similaridade entre as cultivares foi calculada utilizando o coeficiente de similaridade geral de Gower. O dendrograma foi calculado com base na matriz de semelhança, utilizando o método UPGMA como critério de agrupamento. O diagrama de dispersão das cultivares foi construído com base no método de Análise das Coordenadas Principais (PCO). Os dados foram analisados utilizando-se os recursos computacionais do programa GENES e do programa MVSP v.3.22. Os pares de genótipos mais similares foram: BRS CG505 e BRS CG612 (0,823); BRS Amazonas e BRS CG608 (0,820); BRS Mundurucânia e BRS CG189 (0,807); BRS Cereçaporanga e BRS Andirá (0,805); BRS Marabitana e BRS Maués (0,796); BRS CG189 e BRS CG611 (0,784); BRS Andirá e BRS CG850 (0,771); BRS CG610 e BRS CG505 (0,770); BRS Saterê e BRS CG372 (0,717); BRS CG648 e BRS Andirá (0,703). Os pares de genótipos menos similares foram: BRS Marabitana e BRS CG850 (0,699); BRS CG611 e BRS CG882 (0,688); BRS CG505 e BRS Saterê (0,663); BRS CG850 e BRS CG612 (0,646); BRS CG189 e BRS Luzéia (0,640); BRS Saterê e BRS Andirá (0,628); BRS CG189 e BRS CG850 (0,585); BRS CG 372 e BRS CG850 (0,573). O dendrograma formado pelo método hierárquico UPGMA, obtido a partir da distância genética de Gower utilizando como ponto de corte o valor de 0,64 permitiu a formação de quatro grupos, e indicou que existe alta divergência genética entre as cultivares atualmente recomendadas para plantio no Estado do Amazonas pela Embrapa Amazônia Ocidental. A análise de dispersão gráfica pelo método PCO apresentou boa concordância com a análise de agrupamento pelo método hierárquico UPGMA e evidenciou grande variabilidade genética entre as cultivares de guaraná avaliadas no trabalho.

Made available in DSpace on 2015-04-11T13:55:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Wanderleia Goncalves Ribeiro.pdf: 2671517 bytes, checksum: 05eb8fe34a413f7c6e4ed8a366450e51 (MD5) Previous issue date: 2012-07-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Studies on genetic diversity are an important tool for the use and conservation of plant genetic resources. One of the main reasons for the limited use of new germplasm is the lack of adequate documentation, characterization and evaluation of the material. Using this argument the objective of this study was to characterize morphological subsamples of snake gourd (Trichosanthes cucumerina L.), as well as develop a list of descriptors for the species and determine the genetic divergence among subsamples. The subsamples were collected in seven cities of Amazonas state Parintins (PIN I), Urucará (URU), Apuí (APU), Urucurituba (UTB), Itacoatiara (ITA), Manaus (MAO) and Iranduba (Ilha da Marchantaria - IMI), and one city of Pará state Terra Santa (TSA). Parintins was the only subsample that provided two subsamples (PIN II). The establishment of morphological characteristics that define the descriptors and the proposed methodology was made using lists for others cucurbits and adapted for the characteristics of snake gourd. Genetic variability was verified by multivariate analysis techniques expressing the multiples information in measures of similarity, thus the subsamples were grouped by the hierarchical method of average distances called UPGMA and graphic dispersion made by the method of principal coordinates analysis (PCO). The characterization of subsamples allowed establishing a list of 39 descriptors for Trichosanthes cucumerina referring to the flower, fruit and seed. The list was divided into characteristics (descriptors), classes, ranges and codes. The descriptors that exhibited the greatest variation were immature fruit color and shape of the ripe fruit, and the descriptors that not varied were number of flowers per raceme and shape of the seed. Analyze of genetic variability selected 14 descriptors that showed greater variation. The subsamples were more divergent APU and URU, and more similar were UTB and PIN I. The information from UPGMA and PCO showed the same results indicating no relationship between geographic distance and phenotypic similarity of snake gourd subsamples. The characterization and analysis of genetic variability indicated the existence of variability among the accessions evaluated of Trichosanthes cucumerina. / Os estudos sobre diversidade genética são uma importante ferramenta para o uso e conservação dos recursos genéticos vegetais. Uma das principais razões para a pouca utilização de novos germoplasmas é a falta de adequada documentação, caracterização e avaliação do material. Apoiado neste argumento, o objetivo deste estudo foi caracterizar morfologicamente subamostras de quiabo-de-metro (Trichosantes cucumerina L.), assim como elaborar uma lista de descritores morfológicos para a espécie e verificar a divergência genética entre as subamostras. As subamostras foram adquiridas nos municípios amazonenses de Parintins (PIN I), Urucará (URU), Apuí (APU), Urucurituba (UTB), Itacoatiara (ITA), Manaus (MAO) e Iranduba (Ilha da Marchantaria - IMI), e no município paraense de Terra Santa (TSA), sendo que apenas Parintins forneceu duas subamostras (PIN II). O estabelecimento das características morfológicas que definiram os descritores e da metodologia proposta foi feito a partir da consulta em listas para espécies pertencentes às cucurbitáceas e adaptadas de acordo com as características da planta de quiabo-de-metro. A variabilidade genética foi verificada através de técnicas de análises multivariadas, onde as informações múltiplas foram expressas em medidas de similaridade, a partir das quais as subamostras foram agrupados pelo método hierárquico das médias das distâncias, conhecido como UPGMA, e a dispersão gráfica feita pelo método da análise de coordenadas principais (PCO). Após a caracterização das subamostras, foi aperfeiçoada e estabelecida uma lista com 39 descritores para a espécie Trichosanthes cucumerina referentes à flor, fruto e semente. A lista foi dividida em características (descritores), classes, intervalos e códigos. Dos 39 descritores avaliados, os que apresentaram maior variação foram cor do fruto imaturo e formato do fruto maduro. Entre os descritores que não variaram ficaram número de flores por racimo e formato da semente. Para análise da variabilidade genética foram selecionados os 14 descritores que mais variaram. As subamostras mais divergentes foram APU e URU, e as mais similares foram UTB e PIN I. As informações geradas pelo UPGMA e PCO apresentaram os mesmos resultados, indicando que não há relação entre distância geográfica e similaridade fenotípica dos subamostras de quiabo-de-metro. A caracterização e a análise da variabilidade genética indicaram a existência de variabilidade entre as subamostras avaliadas de Trichosanthes cucumerina.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-18T14:03:13Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Gabriella Queiroz de Almeida - 2015.pdf: 4102376 bytes, checksum: bb3f5b9209a4e57ae49a1ae2383e6652 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-18T14:03:35Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Gabriella Queiroz de Almeida - 2015.pdf: 4102376 bytes, checksum: bb3f5b9209a4e57ae49a1ae2383e6652 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-18T14:03:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Gabriella Queiroz de Almeida - 2015.pdf: 4102376 bytes, checksum: bb3f5b9209a4e57ae49a1ae2383e6652 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-08-28 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / This study aimed to characterize the Mangaba (Hancornia speciosa Gomes) Germplasm Collection owned by the Universidade Federal de Goiás, by measuring 40 morpho-agronomic characters. The collection was designed in randomized blocks with 57 treatments (progenies) and four replications, totaling 192 individual accesses, which represent 29 natural populations and four botanical varieties. The variance components estimation was done using random model, and REML procedure, considering the effects of botanical varieties, populations within varieties, progenies within populations and individuals within progenies. Considering 40 morpho-agronomic characters, it was observed that there is significant genetic variability in seven characters among the progenies, 24 characters among the populations and 18 characters among botanical varieties. In addition, individual heritability was higher than 50% in 21 of them. The highest percentual individual selection gain was estimated for the character number of fruits produced by each plant. Significant correlation in some biometric characters between young and adult plants was noticed, including their productivity, which suggests the possibility of early selection. Among the 55 genetic correlations among the agronomic characters, 25 were significative. The fruit production peak occurred between June and October, H. speciosa var. cuyabensis being the most productive one. Multivariate analyses results showed that H. speciosa var. speciosa is the most genetically different in comparison with the others. The characters suggested as minimum quantitative descriptors for the Mangaba tree were: leaf length and width, petiole length and diameter, length between the knot, corolla diameter, flower peduncle diameter, fruit length and diameter, number of fruits, plant height and first branching height / Objetivou-se neste estudo caracterizar a Coleção de Germoplasma de Mangabeira (Hancornia speciosa Gomes) da Universidade Federal de Goiás, mediante medições de 40 caracteres morfoagronômicos. A coleção está implantada em delineamento em blocos casualizados com 57 tratamentos (progênies), com quatro repetições, totalizando 192 acessos individuais, que representam 29 populações naturais e quatro variedades botânicas. A estimativa dos componentes de variância foi realizada utilizando modelo aleatório pelo método REML, considerando os efeitos de variedades botânicas, populações dentro de variedades, progênies dentro de populações e indivíduos dentro de progênies. Dos 40 caracteres morfoagronômicos avaliados constatou-se que existe variabilidade genética significativa entre progênies para sete destes caracteres, para 24 caracteres entre populações e 18 caracteres entre variedades botânicas. Foi detectada herdabilidade individual acima de 50% para 21 dos caracteres avaliados. O maior ganho de seleção percentual em nível de indivíduos foi estimado para o número de frutos por planta. Foi constatada correlação significativa para alguns caracteres biométricos de plantas jovens com as plantas adultas, como a produção, sugerindo a possibilidade de seleção precoce. Das 55 correlações genéticas entre os caracteres agronômicos, 25 foram significativas. A maior produção de frutos ocorreu de junho a outubro, com destaque para a H. speciosa var. cuyabensis. Os resultados de análises multivariadas demonstraram que H. speciosa var. speciosa é a que mais se distancia das demais. Os caracteres sugeridos como descritores quantitativos mínimos foram: comprimento e largura foliar, comprimento e diâmetro do pecíolo, comprimento do entre nó, diâmetro da corola, diâmetro do pedúnculo floral, comprimento e diâmetro do fruto, número de frutos, altura da planta e altura da primeira ramificação.

O bioma Mata Atlântica contém muitas espécies frutíferas, sendo que o cambuci (Campomanesia phaea) se destaca por ser rico em vitamina C, com propriedades antioxidantes e adstringentes, que combatem radicais livres, além levar ao fortalecimento do sistema imunológico. Apesar do grande potencial de exploração, o cambuci é uma espécie semi-domesticada, e, atualmente, não há informações sobre sua diversidade genética. O conhecimento da variabilidade genética do cambuci é importante para o estabelecimento de estratégias de conservação, além de orientar pesquisas relacionadas a programas de coleta de material genético para bancos de germoplasma, já que a espécie se encontra em áreas prioritárias para conservação no Brasil. Existem diversos tipos de marcadores moleculares, sendo que os marcadores microssatélites têm sido considerados ideais para a caracterização e avaliação da diversidade genética em diversas culturas, por serem altamente polimórficos, de fácil interpretação e serem amplificados via PCR. Assim, buscou-se neste trabalho desenvolver marcadores microssatélites e avaliar a diversidade genética de 145 acessos de cambuci distribuídos em cinco populações, coletadas na vertente da Serra do Mar no Estado de São Paulo - Brasil (Juquitiba, Paraibuna, Mogi das Cruzes, Ribeirão Pires e Salesópolis). A biblioteca genômica enriquecida em microssatélites para cambuci gerou 16 loci microssatélites. Seis loci apresentaram perfis polimórficos, revelando dois a seis alelos em um total de 26 alelos. A partir das frequências alélicas, foram avaliados os parâmetros de diversidade, tais como número médio de alelos por loco (A = 3,83), porcentagem média de loci polimórficos (P = 0,57), heterozigosidade esperada (HE = 0,57) e heterozigosidade observada (HO = 0,54). A análise da estrutura genética permitiu verificar que a maior parte da diversidade genética se encontra dentro das populações (HS = 0,57) enquanto que a diversidade entre as populações foi baixa (GST = 0,19). A análise de agrupamento, baseada na distância genética de Nei, indicou que as cinco populações estão próximas entre si geneticamente, e os dados sustentam a hipótese que a distância genética entre elas pode ser atribuída pela distância geográfica, com exceção da população de Salesópolis à qual não foi possível fazer essa analogia. A partir dos dados obtidos pelos marcadores microssatélites, foi possível separar 18 genótipos distribuídos entre as cinco populações que representa toda diversidade genética das populações para formar uma coleção nuclear. / The Atlantic Forest biome has many fruit species, and cambuci (Campomanesia phaea) stands out due to its high content of vitamin C and its antioxidant and astringent properties, which combat free radicals, besides strengthening the immune system. Despite the great market potential, cambuci is a semi-domesticated species for which there is currently no information about its genetic diversity. The knowledge of the cambuci genetic variability is important for the establishment of conservation strategies, besides giving direction to research actions related to genetic material collection programs for the construction germplasm banks, considering that this species is located in conservation priority areas of Brazil. There are several types of molecular markers, and microsatellite markers have been considered ideal for the characterization and evaluation of genetic diversity in several crops because they are highly polymorphic, easily interpreted, and amplified via PCR. Thus, this work aimed to develop microsatellite markers and to evaluate the genetic diversity in 145 cambuci accesses distributed in five different populations collected at the Serra do Mar slope in the State of São Paulo - Brazil (Juquitiba, Paraibuna, Mogi das Cruzes, Ribeirão Pires and Salesópolis). The genomic library enriched in microsatellites for cambuci generated 16 microsatellite loci. Six loci had polymorphic profiles, revealing two to six alleles in a total of 26 alleles. From the allele frequencies, different diversity parameters were evaluated, such as the average number of alleles per locus (A = 3.83), mean percentage of polymorphic loci (P = 0.57), expected heterozygosity (He = 0.57), and observed heterozygosity (Ho = 0.54). The genetic structure analysis allowed to verified that most of the genetic diversity is found within the populations (Hs = 0.57), while the diversity among the populations was low (GST = 0.19). The cluster analysis, based on the genetic distance of Nei, indicated that the five populations are genetically close to each other, and the data support the hypothesis that the genetic distance among them can be attributed to geographic distance, except for the population of Salesópolis that was not possible to make this analogy. From the data obtained by the microsatellite markers, it was possible to separate 18 genotypes distributed among the five populations that represent all the genetic diversity of the populations to form a core collection.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2016-10-10T17:23:40Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) DAMBROS, JULIELE ILONE. DISSERTAÇÃO. 2014.pdf: 2962958 bytes, checksum: 34d825a9cf92ff3104e711a2674f58f6 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2016-10-11T20:49:06Z (GMT) No. of bitstreams: 2 DAMBROS, JULIELE ILONE. DISSERTAÇÃO. 2014.pdf: 2962958 bytes, checksum: 34d825a9cf92ff3104e711a2674f58f6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-11T20:49:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 DAMBROS, JULIELE ILONE. DISSERTAÇÃO. 2014.pdf: 2962958 bytes, checksum: 34d825a9cf92ff3104e711a2674f58f6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-02-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / As pimentas do gênero Capsicum spp. fazem parte da biodiversidade e da riqueza cultural brasileira, são cultivadas em todo o território nacional possuindo uma enorme variedade de cores, sabores, tamanho e pungência. A Embrapa Clima Temperado – Pelotas, com o intuito de conservar e caracterizar a variabilidade genética de pimentas do gênero Capsicum, mantém um banco ativo de germoplasma de Capsicum (BAG). As pimentas são utilizadas in natura ou processadas. Portanto muitos destes genótipos necessitam de avaliação quanto aos aspectos de qualidade e potencial para utilização em produtos alimentícios. Durante o processamento, pode ocorrer redução no teor de compostos bioativos, pela sua instabilidade às condições tecnológicas de processamento, o que consequentemente pode reduzir a capacidade antioxidante, além de interferir também nas características sensoriais. Com base nisto o presente trabalho teve como objetivo caracterizar acessos de pimenta Capsicum spp. para fins tecnológicos e avaliar a estabilidade de compostos potencialmente bioativos. O teor de compostos fenólicos de pimentas in natura variou de 52,45 mg.100g -¹ (P259) a 21,20 mg.100g -¹ (P27) equivalentes de ácido gálico. O teor de carotenoides totais variou de 0,64 mg.100g -¹ (P259) a 40,26 mg.100g -¹ (P115) equivalentes de β-caroteno, o teor de ácido L-ascórbico de 158,38 mg.100g -¹ (P22) a 18,86 mg.100g -¹ (P115) e o teor de capsaicinoides totais de 0,024 mg.100g -¹ (3,93 SHU) no acesso P27 a 1734 mg.100g -¹ (279.174,27 SHU) para o acesso P247. Em relação aos produtos observaram-se perdas e incrementos nos teores de compostos bioativos, os quais foram influenciados pelo tipo de processamento e pelas características iniciais do fruto in natura (principalmente para geleia e pirulito , quando comparado com teor do fruto in natura). A redução do teor de vitamina C (ácido L ascórbico), chegou a 81,62% para a conserva da pimenta P259, e o teor de compostos fenólicos totais em conserva de pimenta P115 foi 5 vezes menor quando comparado ao fruto in natura. O processamento de pimenta conserva, desidratada e em pasta promoveu o incremento no teor de carotenoides totais. A análise sensorial dos produtos revelou que os consumidores de pimenta da região de Pelotas/RS preferem produtos com pungência não muito elevada e de coloração vermelha. / Capsicum spp., part of the Brazilian biodiversity and cultural richness, are grown all over the country having a huge variety of colors, flavors, size and pungency. Embrapa Temperate Climate - Pelotas, in order to conserve and characterize the variability of Capsicum, maintains an active germplasm bank of Capsicum (BAG). The peppers are used fresh or processed. Therefore many of these genotypes require evaluation of quality attributes and potential for use in food products. During processing, a reduction in the content of bioactive compounds, due to their instability to technological processing conditions, can consequently reduce their antioxidant capacity, and also interfere with sensory characteristics. The present study aimed to characterize pepper Capsicum spp. accessions for technological purposes and to evaluate the stability of potentially bioactive compounds. The content of phenolic compounds in fresh pepper fruit ranged from 52.45 mg.100g -¹ (P259) to 21.20 mg.100g -¹ (P27) of gallic acid equivalents. The total carotenoid content ranged from 0.64 mg.100g -¹ (P259) to 40.26 mg 100g -¹ (P115) of β-carotene, the content of L-ascorbic acid from 158.38 mg 100g -¹ (P22) 18.86 mg.100g -¹ (P115) and total capsaicinoids content from 0.024 mg.100g -¹ (3,93 SHU) in accession P27 to 1734 mg.100g -¹ (279.174,27 SHU) for the P247 accession. For pepper products, losses and increments in the content of bioactive compounds were observed influenced by the type of processing and the initial characteristics of the fresh fruit (mainly for jelly and lollipops when compared to the content of the fresh fruit). Vitamin C (L-ascorbic acid) reduction was 81.62% for the pickled pepper P259, and total phenolics content of pickled pepper P115 was 5 times lower when compared to the fresh fruit. The processing of pickled, dehydrated and pepper sauce promoted the increase in the levels of total carotenoids. The sensory analysis of the products revealed that consumers of pepper in Pelotas/RS prefer products medium pungency and red color.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:44:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_franciele_olivo.pdf: 374136 bytes, checksum: e7414f9f61743a8705292951c7ef7a1f (MD5) Previous issue date: 2009-02-16 / Genetic variability in beans have great importance in breeding programs to improve productivity traits and can be used to improve the seeds laboratory manipulation work. Regarding the seeds, the cultivated beans offer great variability, presenting a variety of grain shapes, size and color, however, greater knowledge of how these factors affect the current procedures adopted by the analysis of seed is required. Therefore, the aim of this essay was to quantify the genetic variability among different genotypes of beans from southern Brazil, cultivated and crioulos , for traits related to the physical and physiological quality of the seeds. The results of this study show variability among the genotypes studied, both for phenotypic traits as regarding those evaluated in the laboratory as indicative of seeds quality. The genetic distance in beans is in large part a result of the traits that discriminate the size and shape of seeds, as the thickness of the skin is highly correlated with traits that show the size and shape of bean seeds. Genotypes as Iraí, Chocolate Sobradinho, Vermelho Itajaí, Preto Comprido and Vermelho Escuro, by presenting great genetic variability in relation to others employed in the study are indicated in order of increasing genetic variability of beans. Traits considered as indicative of seeds strength such as CE, TG, CP and EA do not maintain association with traits that show size and shape of seeds. / Os estudos de variabilidade genética em feijão apresentam grande importância na tomada de decisão no melhoramento das características de produtividade e podem ser utilizados visando o aprimoramento da qualidade fisiológica das sementes. Em relação aos caracteres da semente, o feijão cultivado oferece grande variabilidade, apresentando grãos das mais variadas formas e tamanhos, porém, é necessário maiores conhecimentos de como este fator influencia nos procedimentos para obtenção de sementes de alta qualidade. Com isso, o objetivo deste trabalho foi quantificar a variabilidade genética entre diferentes genótipos de feijão do sul do Brasil, melhorados e crioulos, para caracteres relacionados à qualidade física e fisiológica da semente. Os resultados deste trabalho revelam variabilidade entre os genótipos estudados, tanto para os caracteres fenotípicos quanto em relação àqueles avaliados em laboratório como indicativos de qualidade de sementes. A distância genética em feijão é resultante em grande parte por caracteres que discriminam o tamanho e a forma das sementes, assim como a espessura do tegumento esta altamente correlacionada com caracteres que revelam o tamanho e forma das sementes de feijão. Genótipos como Iraí, Chocolate Sobradinho, Vermelho Itajaí, Preto Comprido e Vermelho Escuro, por apresentarem grande variabilidade genética em relação aos demais empregados no estudo, são indicados como forma de ampliar a variabilidade genética em feijão. Caracteres avaliados como indicativos de vigor de sementes como Emergência a Campo, Teste de Germinação, Comprimento de Plântulas e Envelhecimento Acelerado não mantém associação com caracteres que revelam tamanho e forma das sementes, por outro lado o teste de frio apresenta estreita ligação com a espessura do tegumento e tamanho da sementes.