Ctenomys lami e C. minutus são espécies irmãs de roedores subterrâneos, pertencentes ao grupo filogenético torquatus do gênero Ctenomys. Estas espécies são indistinguíveis através da morfologia externa, no entanto C. lami foi recentemente descrita como uma nova espécie distinta de C. minutus devido às diferenças em seus cariótipos, principalmente com relação às formas dos cromossomos e números diplóides, os habitats distintos que ocupam e também pelas diferenças encontradas através de análises morfométricas de seus crânios e mandíbulas. Ambas as espécies são endêmicas da planície costeira do Sul do Brasil e apresentam um notável polimorfismo cromossômico. Ctenomys minutus se distribui em uma estreita faixa de dunas ou campos arenosos próximos da linha da costa, nos estados do Rio Grande do Sul (RS) e sul de Santa Catarina (SC). Apresenta números diplóides variando de 2n = 42 até 50 e números autossômicos (NA) de 68 a 80, compreendendo um total de 45 cariótipos descritos até o momento. Ctenomys lami é geograficamente restrito a uma área de 78 x 12 km, chamada Coxilha das Lombas, correspondente aos campos arenosos mais internos da planície costeira do RS. Apresenta 5 números diplóides variando de 2n = 54 a 58 e NA variando de 74 a 84, os quais combinados formam 26 cariótipos. Quatro blocos cariotípicas, denominados blocos A, B, C e D, foram descritos para esta espécie considerando os rearranjos Robertsonianos encontrados. Além disso, duas zonas híbridas intraespecíficas foram descritas, uma entre os blocos cariotípicos A x B e outra localizada entre os os blocos C x D. Ainda, nas proximidades da Lagoa dos Barros existem evidências da ocorrência de uma zona de hibridação interespecífica. Com os objetivos de acessar os padrões filogeográficos e populacionais dessas duas espécies, confirmar e caracterizar a zona híbrida interespecífica e providenciar informações para ajudar a traçar estratégias conservacionistas, foram analisados 2 fragmentos do DNA mitocondrial e 14 loci de microssatélites em 172 espécimes de C. lami, 340 espécimes de C. minutus e 19 possíveis híbridos, associados aos cariótipos de cada um dos espécimes e informações geomorfológicas a respeito do ambiente que ocupam. Para as duas espécies as descontinuidades no ambiente agem como um dos principais fatores estruturantes da variabilidade genética, representadas principalmente por cursos de água mais volumosos. Além disso, o isolamento pela distância também desempenha um papel importante no padrão de diferenciação populacional para as duas espécies, sendo mais evidente em alguns trechos da distribuição geográfica do que em outros. Não foram observadas associações diretas entre mudanças significativas na estrutura genética com os diferentes rearranjos cromossômicos encontrados tanto em C. lami quanto em C. minutus, demonstrando que os diferentes cariótipos presentes nestas espécies desempenharam, até o momento, um papel secundário na estrutura genética das populações. Apesar da ausência de clados reciprocamente monofiléticos para o DNAmt, C. lami e C. minutus são consideradas como duas espécies distintas com base nos resultados das análises citogenéticas, dos loci de microssatélites, pelas diferenças na morfologia do crânio e mandíbula e a distinção dos habitats que ocupam. A presença de uma zona de hibridação interespecífica foi confirmada, os 19 híbridos apresentaram cariótipos intermediários entre as espécies analisadas, genoma mitocondrial proveniente de C. minutus, e a composição dos loci de microssatélites provenientes de C. lami, levando a conclusão de que houve um cruzamento preferencial, ou até mesmo exclusivo, ao menos nos primeiros estágios da formação dessa zona híbrida, entre fêmeas de C. minutus com machos de C. lami. Os dados demonstraram também uma introgressão substancial do genoma nuclear de C. lami nos espécimes de C. minutus coletados nas proximidades da zona híbrida. Mediante o exposto, medidas conservacionistas devem ser tomadas focando conter o avanço da hibridação e introgressão entre essas espécies, além de preservar a integridade de populações puras que não sofrem a influência desses eventos. Além disso, sugerimos que C. minutus seja incluído em listas vermelhas de espécies ameaçadas como quase ameaçado, e C. lami como vulnerável. / Ctenomys minutus and C. lami are burrowing rodents that have been considered sister species of the torquatus group in the Ctenomys genus. These species are undistinguishable trough the external morphology, however C. lami were recently described as a separated species from C. minutus due to differences in their karyotypes, mainly regards the chromosomal forms and diploid numbers, the distinct habitats that these species occupy, and even by differences in the morphology of their skulls and mandibles. Both species are endemic to the southern Brazilian coastal plain and have notable chromosomal polymorphisms. Ctenomys minutus have a narrow distribution along the first dunes or sand fields near to the coast, in Rio Grande do Sul (RS) and Santa Catarina (SC) Brazilian states. This species presents diploid numbers ranging from 2n = 42 to 50, and the autosomal arm numbers (AN) ranging from 68 to 80, comprising a total of 45 karyotypes described until now. Ctenomys lami are geographically restricted to an area of 78 x 12 km, named as Coxilha das Lombas, corresponding to more internalized sandy fields of the RS coastal plain. This species have five diploid numbers from 2n = 54 to 58 and ten AN from 74 to 84, which combined formed 26 karyotypes. Four karyotypic blocks, named as Blocks A, B, C and D, were described for this species considering the Robertsonian rearrangements. Also, two intra-specific hybrid zones were reported for this species, one between blocks A x B, and another between blocks C x D. Near to the Barros Lake there are evidences of an interspecific hybrid zone between these species. The aims of this study are assess the phylogeographical and populational patterns for both species, to confirm and characterize the interspecific hybrid zone and provide informations to help future conservation decisions and management strategies for both species. For this, 2 fragments of mtDNA and 14 microsatellite loci were analyzed in 172 specimens of C. lami, 340 specimens of C. minutus, and 19 possible hybrids, associated to the karyotypes of each specimen sampled and geomorphological informations about the habitat occupied. In both species the environmental discontinuities act as effective geographical barriers to the gene flow, mainly major water streams. Moreover the isolation-by-distance also plays a key role in the pattern of genetic differentiation of populations, being more evident is some areas of the geographical distributions. There were no direct associations between distinct chromosomal rearrangements and genetic structures in both C. lami and C. minutus, evidencing that karyotypes do not play a causative role in the genetic structure of populations. The absence of monophyletic clades separating both species was not considered by us as enough evidence to detract C. minutus and C. lami to a single taxa, since all other analyses regarding the pattern retrieved in microsatellite data, cytogenetic analyzes, and morphological and habitat differences confirm their status as two separated sister species, only recently differentiated. The interspecific hybrid zone was strongly evidenced by 19 individuals with intermediate karyotypic forms between the species analyzed. All hybrids showed mtDNA content exclusively from C. minutus, and nuclear microsatellite composition from C. lami, suggesting that the hybrid zone was formed by a pattern of crossings between females of C. minutus with males of C. lami. Also, a substantial clinal introgression of the genomic content of C. lami into C. minutus individuals sampled around the hybrid zone was reported. Conservation efforts should focus in hold the progress of introgression, to preserve the integrity of pure populations. Moreover, C. minutus have to be included in red lists of endangered fauna as near threatened and C. lami have to be included as vulnerable.

A infecção por Mycoplasma (M.) hyopneumoniae é responsável por perdas econômicas significativas na suinocultura, causando uma pneumonia crônica que normalmente afeta clinicamente suínos de crescimento e terminação. Considerando-se a importância das matrizes de menor ordem de parto na transmissão de M. hyopneumoniae e que uma grande quantidade de leitoas é introduzida nos planteis anualmente, este projeto teve como objetivo compreender aspectos pouco conhecidos da dinâmica de infecção de M. hyopneumoniae em leitoas de reposição. O primeiro estudo avaliou a dinâmica e persistência da infecção por M. hyopneumoniae em leitoas em condições naturais de campo. Quarenta e quatro leitoas foram selecionadas aos 20 dias de idade (ddi) e a detecção de M. hyopneumoniae por PCR foi avaliada mensalmente por suabe de laringe, resultando em um total de 12 coletas. Além disso, 220 leitões filhos dessas matrizes foram amostrados um dia antes do desmame para avaliação da transmissão vertical. Os resultados deste estudo demonstraram que o início da detecção ocorreu aos 110 ddi e um aumento significativo foi observado aos 140 ddi (p<0,05). Ao desmame, apenas 2,3% das fêmeas foi positiva e não foram detectados leitões desmamados positivos. Adicionalmente, 77,2% das leitoas foi detectada positiva por um a três meses, 4,6% por quatro a cinco meses e 18,2% nunca foi detectada positiva, indicando a presença de subpopulações de animais negativos em granjas positivas. Em um segundo estudo, avaliou-se a detecção de M. hyopneumoniae por PCR em leitoas de reposição interna e a variabilidade genética entre granjas foi avaliada por MLVA (Multiple Locus Variable-number tandem repeats Analysis). Um total de 298 leitoas provenientes de três multiplicadoras positivas foram selecionadas e coletadas uma vez para realização de ELISA e duas a três vezes para PCR em um estudo longitudinal. Ainda, a transmissão vertical foi avaliada em 425 leitões pré-desmame. Aos 150 ddi, 47 a 67,4% das leitoas foi detectada positiva por PCR, decréscimos foram observados até a última amostragem nas três granjas avaliadas (p<0,05), e nenhum leitão foi positivo pré-desmame. Ainda, 30,7% das leitoas não foi detectada positiva em nenhuma nas amostragens e os resultados de MLVA indicaram um ampla variabilidade genética de M. hyopneumoniae em leitoas aos 150 ddi. No terceiro estudo, 210 leitoas de reposição negativas para M. hyopneumoniae introduzidas em três granjas positivas foram selecionadas e avaliadas longitudinalmente por PCR e ELISA com o objetivo de comparar dois tipos de fluxo de aclimatação (all-in all-out ou fluxo contínuo). Ainda, a variabilidade genética foi analisada por MLVA. Observou-se um aumento significativo (p<0,05) nas prevalências de leitoas positivas para M. hyopneumoniae por PCR na segunda coleta e um decréscimo ao longo do tempo independentemente do tipo de fluxo de aclimatação utilizado. Os resultados de ELISA revelaram que as três granjas avaliadas tiveram um aumento significativo na prevalência de leitoas positivas da primeira para a segunda coleta (p<0,05), que se manteve alta até o fim do experimento. Ainda, baixa variabilidade genética de M. hyopneumoniae foi observada por MLVA. Um quarto estudo também foi conduzido com o objetivo de avaliar a absorção e detecção de M. hyopneumoniae utilizando-se suabes de nylon flocados e de ponta de rayon. Os resultados deste experimento indicaram uma maior absorção e uma maior detecção de M. hyopneumoniae por PCR (p<0,05) utilizando-se suabes de nylon flocados. / Mycoplasma (M.) hyopneumoniae infection is responsible for important economic losses to pig production, causing a chronic pneumonia that usually affects growing and finishing pigs. Regarding the importance of low parity dams on M. hyopneumoniae transmission and that a high proportion of gilts is introduced in the farms every year, this project aimed to better understand unknown aspects about the infection dynamics of M. hyopneumoniae in replacement gilts. The first study assessed the dynamics and persistence of M. hyopneumoniae infection in gilts in natural conditions. Forty-four gilts were selected at 20 days of age (doa) and M. hyopneumoniae detection was evaluated using laryngeal swabs for PCR testing every month, resulting in 12 samplings. Additionally, 220 piglets born from the selected dams were sampled one day prior to weaning to evaluate vertical transmission. The results of this study showed that the first detection occurred at 110 doa and a significant increase was observed at 140 doa (p<0.05). A small proportion (2.3%) of positive gilts was detected one day prior to weaning and no piglets were detected positive at the same sampling moment. Moreover, 77.2% of the gilts was detected positive for one to three months, 4.6% for four to five months, and a lack of detection was observed in 18.2% of the gilts, indicating the presence of negative subpopulations in positive farms. A second study assessed the M. hyopneumoniae detection in self-replacement gilts longitudinally. A total of 298 gilts from three positive multiplier farms were selected and sampled once for ELISA testing and two or three times for PCR. Moreover, vertical transmission was evaluated in 425 piglets one day prior to weaning, and the genetic variability within farms was assessed in gilts by MLVA (Multiple Locus Variablenumber tandem repeats Analysis). The prevalence of positive gilts at 150 doa ranged from 47 to 67.4% within farms by PCR, decreases were observed up to the last sampling in all farms (p<0.05), and no positive piglets were detected prior to weaning. A lack of detection was observed in 30.7% of the gilts during the study, and high genetic variability was detected within farms. In the third study, 210 M. hyopneumoniae negative purchased gilts were introduced in three farms with two types of acclimation flow (all-in all-out or continuous flow). The gilts were selected for ELISA and PCR testing in a longitudinal study, which aimed to compare the infection dynamics regarding the type of flow. Also, genetic variability was assessed by MLVA. The results showed a significant increase (p<0.05) in the prevalence of M. hyopneumoniae positive gilts by PCR in the second sampling, and a decrease over time regardless the type of flow. The ELISA results revealed a significant increase in the prevalence of positive gilts in the three farms (p<0.05) from the first to the second sampling, which remained high up to the completion of the study. Moreover, limited genetic variability of M. hyopneumoniae was observed by MLVA testing. A fourth study was also performed, which aimed to assess the absorption and detection of M. hyopneumoniae using two types of swabs (nylon-flocked and rayon-bud). The results indicated a higher absorption and M. hyopneumoniae detection by PCR using nylon-flocked swabs (p<0.05).

Ctenomys lami e C. minutus são espécies irmãs de roedores subterrâneos, pertencentes ao grupo filogenético torquatus do gênero Ctenomys. Estas espécies são indistinguíveis através da morfologia externa, no entanto C. lami foi recentemente descrita como uma nova espécie distinta de C. minutus devido às diferenças em seus cariótipos, principalmente com relação às formas dos cromossomos e números diplóides, os habitats distintos que ocupam e também pelas diferenças encontradas através de análises morfométricas de seus crânios e mandíbulas. Ambas as espécies são endêmicas da planície costeira do Sul do Brasil e apresentam um notável polimorfismo cromossômico. Ctenomys minutus se distribui em uma estreita faixa de dunas ou campos arenosos próximos da linha da costa, nos estados do Rio Grande do Sul (RS) e sul de Santa Catarina (SC). Apresenta números diplóides variando de 2n = 42 até 50 e números autossômicos (NA) de 68 a 80, compreendendo um total de 45 cariótipos descritos até o momento. Ctenomys lami é geograficamente restrito a uma área de 78 x 12 km, chamada Coxilha das Lombas, correspondente aos campos arenosos mais internos da planície costeira do RS. Apresenta 5 números diplóides variando de 2n = 54 a 58 e NA variando de 74 a 84, os quais combinados formam 26 cariótipos. Quatro blocos cariotípicas, denominados blocos A, B, C e D, foram descritos para esta espécie considerando os rearranjos Robertsonianos encontrados. Além disso, duas zonas híbridas intraespecíficas foram descritas, uma entre os blocos cariotípicos A x B e outra localizada entre os os blocos C x D. Ainda, nas proximidades da Lagoa dos Barros existem evidências da ocorrência de uma zona de hibridação interespecífica. Com os objetivos de acessar os padrões filogeográficos e populacionais dessas duas espécies, confirmar e caracterizar a zona híbrida interespecífica e providenciar informações para ajudar a traçar estratégias conservacionistas, foram analisados 2 fragmentos do DNA mitocondrial e 14 loci de microssatélites em 172 espécimes de C. lami, 340 espécimes de C. minutus e 19 possíveis híbridos, associados aos cariótipos de cada um dos espécimes e informações geomorfológicas a respeito do ambiente que ocupam. Para as duas espécies as descontinuidades no ambiente agem como um dos principais fatores estruturantes da variabilidade genética, representadas principalmente por cursos de água mais volumosos. Além disso, o isolamento pela distância também desempenha um papel importante no padrão de diferenciação populacional para as duas espécies, sendo mais evidente em alguns trechos da distribuição geográfica do que em outros. Não foram observadas associações diretas entre mudanças significativas na estrutura genética com os diferentes rearranjos cromossômicos encontrados tanto em C. lami quanto em C. minutus, demonstrando que os diferentes cariótipos presentes nestas espécies desempenharam, até o momento, um papel secundário na estrutura genética das populações. Apesar da ausência de clados reciprocamente monofiléticos para o DNAmt, C. lami e C. minutus são consideradas como duas espécies distintas com base nos resultados das análises citogenéticas, dos loci de microssatélites, pelas diferenças na morfologia do crânio e mandíbula e a distinção dos habitats que ocupam. A presença de uma zona de hibridação interespecífica foi confirmada, os 19 híbridos apresentaram cariótipos intermediários entre as espécies analisadas, genoma mitocondrial proveniente de C. minutus, e a composição dos loci de microssatélites provenientes de C. lami, levando a conclusão de que houve um cruzamento preferencial, ou até mesmo exclusivo, ao menos nos primeiros estágios da formação dessa zona híbrida, entre fêmeas de C. minutus com machos de C. lami. Os dados demonstraram também uma introgressão substancial do genoma nuclear de C. lami nos espécimes de C. minutus coletados nas proximidades da zona híbrida. Mediante o exposto, medidas conservacionistas devem ser tomadas focando conter o avanço da hibridação e introgressão entre essas espécies, além de preservar a integridade de populações puras que não sofrem a influência desses eventos. Além disso, sugerimos que C. minutus seja incluído em listas vermelhas de espécies ameaçadas como quase ameaçado, e C. lami como vulnerável. / Ctenomys minutus and C. lami are burrowing rodents that have been considered sister species of the torquatus group in the Ctenomys genus. These species are undistinguishable trough the external morphology, however C. lami were recently described as a separated species from C. minutus due to differences in their karyotypes, mainly regards the chromosomal forms and diploid numbers, the distinct habitats that these species occupy, and even by differences in the morphology of their skulls and mandibles. Both species are endemic to the southern Brazilian coastal plain and have notable chromosomal polymorphisms. Ctenomys minutus have a narrow distribution along the first dunes or sand fields near to the coast, in Rio Grande do Sul (RS) and Santa Catarina (SC) Brazilian states. This species presents diploid numbers ranging from 2n = 42 to 50, and the autosomal arm numbers (AN) ranging from 68 to 80, comprising a total of 45 karyotypes described until now. Ctenomys lami are geographically restricted to an area of 78 x 12 km, named as Coxilha das Lombas, corresponding to more internalized sandy fields of the RS coastal plain. This species have five diploid numbers from 2n = 54 to 58 and ten AN from 74 to 84, which combined formed 26 karyotypes. Four karyotypic blocks, named as Blocks A, B, C and D, were described for this species considering the Robertsonian rearrangements. Also, two intra-specific hybrid zones were reported for this species, one between blocks A x B, and another between blocks C x D. Near to the Barros Lake there are evidences of an interspecific hybrid zone between these species. The aims of this study are assess the phylogeographical and populational patterns for both species, to confirm and characterize the interspecific hybrid zone and provide informations to help future conservation decisions and management strategies for both species. For this, 2 fragments of mtDNA and 14 microsatellite loci were analyzed in 172 specimens of C. lami, 340 specimens of C. minutus, and 19 possible hybrids, associated to the karyotypes of each specimen sampled and geomorphological informations about the habitat occupied. In both species the environmental discontinuities act as effective geographical barriers to the gene flow, mainly major water streams. Moreover the isolation-by-distance also plays a key role in the pattern of genetic differentiation of populations, being more evident is some areas of the geographical distributions. There were no direct associations between distinct chromosomal rearrangements and genetic structures in both C. lami and C. minutus, evidencing that karyotypes do not play a causative role in the genetic structure of populations. The absence of monophyletic clades separating both species was not considered by us as enough evidence to detract C. minutus and C. lami to a single taxa, since all other analyses regarding the pattern retrieved in microsatellite data, cytogenetic analyzes, and morphological and habitat differences confirm their status as two separated sister species, only recently differentiated. The interspecific hybrid zone was strongly evidenced by 19 individuals with intermediate karyotypic forms between the species analyzed. All hybrids showed mtDNA content exclusively from C. minutus, and nuclear microsatellite composition from C. lami, suggesting that the hybrid zone was formed by a pattern of crossings between females of C. minutus with males of C. lami. Also, a substantial clinal introgression of the genomic content of C. lami into C. minutus individuals sampled around the hybrid zone was reported. Conservation efforts should focus in hold the progress of introgression, to preserve the integrity of pure populations. Moreover, C. minutus have to be included in red lists of endangered fauna as near threatened and C. lami have to be included as vulnerable.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-09-19T13:03:22Z No. of bitstreams: 1 Robson da Silva Ramos.pdf: 2083261 bytes, checksum: a3bd5f9d9f715a880c77016b51a793ad (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-19T13:03:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Robson da Silva Ramos.pdf: 2083261 bytes, checksum: a3bd5f9d9f715a880c77016b51a793ad (MD5) Previous issue date: 2016-01-29 / The genetic variability of sugarcane is explored by genetic improvement from hybridizations between parents that presents high yield per si. However, parental recommendation has as a limiting factor the lack of floral synchronism between the genotypes and the lack of characterization of the accessions by the pollen viability, which may reflect on infertility or low fertility of caryopses. Informations about pollen viability of genotypes of sugarcane during the storage time, allow us to estimate the moment when pollen retains its germination power, vigor and genetic integrity to promote hybridizations between parents that have asynchronous flowering. This work aimed to study general aspects from hybridization in sugarcane, verify the existence of correlation between the pollen viability and the fertility of caryopsis, evaluate the viability of the pollen obtained from the upper and lower third of the panicles of tem genotypes, as well as pollen viability during the storage time of four varieties. The experiments were conducted at Estação de Floração e Cruzamento da Cana-de-açúcar de Devaneio. The pollen viability was tested by lugol solution and its conservation was made in a freezer at -18°C. The experimental design was completely randomized in a factorial design. Significant differences were identified among genotypes for all variables analyzed. The conservation method used in this study proved effective for maintaining the viability of three of the four genotypes. It was found a positive correlation between pollen viability and fertility of the caryopsis. / A variabilidade genética da cana-de-açúcar é explorada pelo melhoramento genético a partir de hibridações entre genitores que apresentam alto rendimento per si. Entretanto, a recomendação de parentais tem como fator limitante a falta de sincronismo floral entre os genótipos, bem como a falta de caracterização dos acessos quanto a viabilidade polínica, o que pode refletir em infertilidade ou baixa fertilidade das cariópses. Informações sobre a viabilidade polínica de genótipos da cana-de-açúcar no decorrer do tempo de conservação permite estimar o tempo no qual o pólen preserva seu poder germinativo, vigor e integridade genética para promover hibridações entre genitores que apresentam florescimento assíncronos. O presente trabalho objetivou estudar aspectos gerais da hibridação em cana-de-açúcar, verificar a existência de correlação entre a viabilidade polínica e a fertilidade da cariópse, avaliar a viabilidade de pólens obtidos do terço superior e inferior de panículas de dez genótipos, assim como a viabilidade polínica no decorrer do tempo de armazenamento de quatro variedades. Os experimentos foram conduzidos na Estação de Floração e Cruzamento da Cana-de-açúcar de Devaneio. A viabilidade polínica foi testada através da solução de lugol e a sua conservação foi feita em freezer a -18ºC. O delineamento experimental adotado foi o inteiramente casualizado em esquema fatorial. Foram identificadas diferenças significativas entre os genótipos para todas variáveis analisadas. A metodologia de conservação empregada no estudo mostrou-se eficiente para manutenção da viabilidade em três dos quatro genótipos avaliados. Foi verificada correlação positiva entre a viabilidade do pólen e a fertilidade da cariópse.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-09-23T12:47:02Z No. of bitstreams: 1 Rafaela Lima de Araujo.pdf: 5175233 bytes, checksum: a9acd861166189ddbd0b21c9b3ec9f11 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-23T12:47:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rafaela Lima de Araujo.pdf: 5175233 bytes, checksum: a9acd861166189ddbd0b21c9b3ec9f11 (MD5) Previous issue date: 2014-01-20 / The Psidium guineense species, popularly known as strawberry guava, belongs to the Myrtaceae family, which is native to South America having a broad geographical distribution. In the Brazilian Northeast, is found on the coast, in the Forest Zone region. The fruit of the strawberry guava flavor is slightly reminiscent of the guava, although it is slightly more acidic and sharper scent. The culture of strawberry guava (P. guinenese) has no economic significance in the context of the national fruit production, not even existing commercial orchards. It is necessary, studies of genetic population level character, since there is little information on ecological and genetic aspects of the species. In order to provide information on the genetic resources of strawberry guava (P. guineense) in the State of Pernambuco, the objectives of this study were to evaluate the genetic diversity of four natural populations of P. guineense distributed in the Forest Zone of Pernambuco and characterize the genetic structure of these four populations from isozyme markers. Eighteen loci were used to estimate allele frequencies relating to 114 individuals in four populations: Itamaracá Arariba, Marieta and Palmares. Populations had generally high level of polymorphism and average of 1.5 alleles per locus. The heterozygosity observed was higher than heterozygosity expected, which ranged between 0.22 and 0.23 and the heterozygosity expected ranged between 0.34 and 0.40. The fixation index ranged from = -0.794 to = -0.549, presenting all negative, indicating the absence of inbreeding and heterozygosity excess. The estimated population in pairs all showed gene flow are generally high, ranging from Nm = 3.23 to Nm = 20.77 showing a high proportion of migrants among populations. / A espécie P. guineense, conhecida popularmente como araçá, pertence à família Mirtácea, que é originária da América do Sul apresentando uma ampla área de distribuição geográfica. Nos Estados do Nordeste Brasileiro, é encontrada no litoral, na região da Zona da Mata. O fruto do araçazeiro tem sabor que lembra um pouco o da goiaba, embora seja ligeiramente mais ácido e de perfume mais acentuado. A cultura do araçá (P. guinenese) não possui expressão econômica no contexto da fruticultura nacional, não existindo, inclusive, pomares comerciais. Faz-se necessário, estudos de caráter genético a nível populacional, uma vez que existem poucas informações sobre aspectos ecológicos e genéticos da espécie. Com o intuito de disponibilizar informações sobre os recursos genéticos do araçá (P. guineense) no Estado de Pernambuco, os objetivos do presente trabalho foram avaliar a diversidade genética de quatro populações naturais de P. guineense distribuídas na Zona da Mata do Estado de Pernambuco e caracterizar a estrutura genética dessas quatro popurações a partir de marcadores isoenzimáticos. Dezoito locos foram utilizados para estimar as frequências alélicas referentes aos 114 indivíduos, nas quatro populações: Itamaracá, Arariba, Marieta e Palmares. As populações apresentaram em geral, alto nível de polimorfismo com média de 1,5 alelos por loco. A heterozigosidade observada apresentou-se maior do que a esperada, onde variou entre 0,22 e 0,23 e variou entre 0,34 e 0,40 . O índice de fixação variou de = -0,549 a = -0,794, apresentando-se negativo para todos, indicando ausência de endogamia e excesso de heterozigosidade. O fluxo gênico estimado para as populações aos pares apresentou-se em geral elevado variando de Nm= 3,23 a Nm= 20,77 evidenciando alta proporção de migrantes entre populações.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-10-06T13:31:22Z No. of bitstreams: 1 Tiago Vinicius Batista do Carmo.pdf: 833536 bytes, checksum: 6f420d513b278867c960dacc4bea24ac (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-06T13:31:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tiago Vinicius Batista do Carmo.pdf: 833536 bytes, checksum: 6f420d513b278867c960dacc4bea24ac (MD5) Previous issue date: 2014-01-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The Passiflora cincinnata Mast. species is gaining popularity in the market and it has been considered a wild species that has great potential to contribute to the genetic improvement of commercial passion fruit. This study aims to evaluate the genotypes of wild passion fruit (P. cincinnata) by using morphological descriptors, agronomic traits and molecular markers ISSR. The experimental was randomized blocks in simple scheme with five replications and two plants per plot. For morphoagronomic characterization were evaluated 22 quantitative traits and 13 qualitative characteristics. For molecular characterization 12 ISSR primers were tested. Ac cording to the mean squares obtained from the analyzes of the variance to 21 traits evaluated, it can be highlighted that the significant differences (p <0.01) among the means of the genotypes for all traits. It was found that for the 21 morphological traits measured, which contributed most to the diversity was the MI (internode mean) with 43.12%, followed by DH5 (diameter stems to 5 cm of soil) and LS (spread sepal). The average similarity found was 68%. UBC 887 and UBC 841 primers stood out with the highest values for the attributes of the markers observed, demonstrating suitability to use in researches of different types of P. cincinnata. It was diagnosed low genetic variability among genotypes. The genotypes have potential to be used in breeding programs, especially those exploiting obtaining ornamental passiflora. / A espécie Passiflora cincinnata Mast. vem se popularizando no mercado e tem sido considerada uma das espécies silvestres que possuem grande potencial para contribuir com o melhoramento genético do maracujazeiro comercial. Diante do exposto, este trabalho tem como objetivo avaliar genótipos de maracujá-do-mato (P. cincinnata) por meio de descritores morfológicos e descritores agronômicos, além de marcadores moleculares do tipo ISSR, visando identificar variabilidade genética. O delineamento experimental foi em blocos casualizados em esquema simples com cinco repetições, com duas plantas por parcela. Para caracterização morfoagronômica foram avaliadas 22 características quantitativas e 13 características qualitativas. Para caracterização molecular foram testados 12 primers de ISSR. De acordo com os quadrados médios obtidos das análises de variância para as 21 características avaliadas pode-se ressaltar as diferenças significativas (p<0,01) entre as médias dos genótipos para todos os caracteres avaliados. Verificou-se que para os 21 descritores morfológicos avaliados, o que mais contribuiu para a diversidade foi o MI (média internódio) com 43,12%, seguido por DH5 (diâmetro das hastes a 5 centímetros do solo) e LS (largura da sépala). A similaridade média encontrada foi 68%. Os primers UBC 887 e UBC 841 se destacaram com os valores mais altos para os atributos dos marcadores observados, demonstrando aptidão para serem utilizados em pesquisas de diversidade em P. cincinnata. Foi diagnosticada baixa variabilidade genética entre os genótipos avaliados. Os genótipos possuem potencial para serem utilizados em programas de melhoramento, principalmente os que exploram a obtenção de passifloras ornamentais.

Due to the great social, economic and cultural context which Mangabeira (Hancornia speciosa) represents, as well as the intense devastation of the areas where it occurs naturally, was implemented in 2006, the Active Bank Mangabeira Embrapa Tabuleiros Costeiros (BAGMangaba) in Itaporanga d'Ajuda, SE. The Genebank (bags) gather genetic constitutions of different backgrounds and represent sources of genes for breeding programs. Therefore, it is essential that the breeder knows the genetic diversity of germplasm available. The aim of this study was to estimate the genetic variability of 55 accessions of BAG Mangaba RAPD markers (Polymorphic DNA Randomly Amplified). 13 primers were used for synthesis (primers), which generated 82 fragments (bands), 72 polymorphic, which were analyzed as binary data. From these data yields a similarity matrix using Jaccard's coefficient. With this coefficient and the UPGMA method agglomerative cluster analysis were performed using the programs FreeTree; TreeView and XLSTAT and a method of resampling (bootstraps) generated dendrograms that used to distinguish among the accessions. The similarity ranged from 0.02 to 0.91. Individuals were more similar CA4 and CA5 and more divergent lining IP6 and PR4. From the SGM were detected at the pair of individuals and CA5 CA4, CA1 and CA2, PT2, and PT3 are considered similar (clones). Through Clustering UPGMA and PCoA was possible to identify five groups. The high level of polymorphism (95%) suggests that RAPD markers are a useful tool to detect genetic differences among accessions of H. speciosa, assisting in a future program to improve the species. / Devido à grande importância social, econômica e cultural que a mangabeira (Hancornia speciosa Gomes) representa, bem como a intensa devastação das áreas onde ocorre naturalmente, foi implantado em 2006, o Banco Ativo de Mangabeira da Embrapa Tabuleiros Costeiros (BAG Mangaba), em Itaporanga d‟Ajuda, SE. Os Bancos de Germoplasma (BAGs) reúnem constituições genéticas de diferentes origens e representam fontes de genes para programas de melhoramento. Para tanto, é fundamental que o melhorista conheça a variabilidade genética do germoplasma disponível. O objetivo deste estudo foi estimar a variabilidade genética de 55 acessos do BAG Mangaba utilizando marcadores RAPD (Polimorfismo de DNA amplificado ao acaso). Foram usados 13 iniciadores de síntese (primers), que geraram 82 fragmentos (bandas), sendo 72 polimórficos, os quais foram analisados como dados binários. A partir desses dados foi obtida uma matriz de similaridade utilizando o coeficiente de Jaccard. Com esse coeficiente e com o método aglomerativo UPGMA foram realizadas análises de agrupamento utilizando os programas FreeTree; TreeView e XLSTAT e um método de reamostragens (bootstraps), gerou dendrogramas que permitiu a distinção genética entre os acessos. A similaridade variou entre 0,02 e 0,91. Os indivíduos mais similares foram CA4 e CA5 e mais divergentes forram IP6 e PR4. A partir do nível SGM foram detectados que os pares de indivíduos CA4 e CA5; CA1 e CA2; PT2 e PT3 são considerados similares (duplicatas). Por meio do Agrupamento UPGMA e ACoP foi possível identificar seis grupos. O alto nível de polimorfismo observado (95%) sugere que os marcadores RAPD são uma ferramenta adequada para detectar diferenças genéticas entre acessos de mangabeira, auxiliando futuros programas de melhoramento da espécie.

Morphological characterization, performed by use of descriptors, identifies and describes the variability or diversity within and between accessions maintained in Germplasm Banks Assets. This information, provided for genetic resources studies may be used in improvement programs of coconut, especially when there are characteristics of interest to serve as matrices for production of hybrids or the selection of adapted or resistant varieties to certain factors. The study aimed to characterize and evaluate the dwarf accessions stored in the Active Germplasm Bank of Embrapa Coastal Boards, using a descriptive list drawn up by IBPGR in 1995, now Bioversity International. The experimental design was randomized block, with six treatments (accessions) and five replications, 16 useful plants /plot, spaced 7.5 x 7.5 x 7.5. It evaluated 11 useful plants of six accessions of Dwarf coconut: Green Dwarf Jiqui Brazil (DGeBrJ), Red Dwarf Cameroon (DRC), Red Dwarf Malaysia (DRM), Red Dwarf Gramame (DRG), Yellow Dwarf Gramame (DYG), Yellow Dwarf of Malaysia (DYM). Quantitative and qualitative descriptors, all data-related to vegetative, morphological and reproductive were considered. The genetic-statistical analysis was executed by SAS 9.1 and genes 2009 program. Data were submitted to ANOVA and the means of cultivars compared by Tukey test (5%) and genetic parameters (h2, CVg, and CVe Iv) were estimated. Genetic divergence between genotypes was quantified by Standardized mean Euclidean distance. The clustering methods used to group the genotypes were the UPGMA, the Tocher optimization and Main Components. With descriptors morpho-agronomics was possible to detect genetic divergence among accessions of the dwarf coconut germplasm bank. The UPGMA cluster analysis, Tocher and principal components demonstrated efficiency in the evaluation of the accessions. It was observed that characters like number of leaves, length of leaflets, width of leaflets, peduncle length, number of male flowers, number of floral branches, average length of floral branches, length of reproductive cycle, male reproductive phase duration, period between emergency and opening of inflorescences and number of inflorescence have high genetic variability, allowing success in improving of coconut using simpler selection methods such as mass selection. The AVeBrJ had the highest means to following characteristics: number of leaflets, length of leaflets, number of flower branches, length of reproductive cycle, male reproductive phase duration, showing a good vegetative and reproductive development. / A caracterização morfológica, realizada por meio de descritores, identifica e descreve a variabilidade ou diversidade existente dentro e entre os acessos conservados em Bancos Ativos de Germoplasma (BAGs). Estas informações, fornecidas pela área de recursos genéticos, podem ser utilizadas nos programas de melhoramento de coco, especialmente quando da utilização dos acessos com características de interesse para servir como matrizes para produção de híbridos ou na escolha de variedades mais adaptadas ou resistentes a determinados fatores. O trabalho teve como objetivo caracterizar e avaliar por meio da lista descritiva elaborada pelo IBPGR 1995, atual Bioversity International, os acessos de coqueiro anão conservados no Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Tabuleiros Costeiros. Os acessos caracterizados e avaliados encontram-se no delineamento experimental em blocos casualizados, com seis tratamentos (acessos) e cinco repetições, sendo 16 plantas úteis por parcela, no espaçamento de 7,5 x 7,5 x 7,5. Foram avaliadas 11 plantas úteis de seis acessos de coqueiro-anão: Anão Verde do Brasil Jiqui (AVeBrJ), Anão Vermelho de Camarões (AVC), Anão Vermelho da Malásia (AVM), Anão Vermelho de Gramame (AVG), Anão Amarelo de Gramame (AAG), Anão Amarelo da Malásia (AAM). Foram utilizados descritores quantitativos e qualitativos, sendo todos relacionados a dados vegetativos, morfológicos e reprodutivos. As análises genético-estatísticas foram realizadas com o programa SAS 9.1 e genes 2009, os dados foram submetidos à análise de variância e as médias das cultivares comparadas pelo teste de Tukey a 5% de probabilidade e estimados parâmetros genéticos (h2, CVg, CVe e Iv). Para quantificar a divergência genética entre os genótipos foi empregada a distância euclidiana média padronizada. Os métodos de agrupamento utilizados para agrupar os genótipos foram o hierárquico UPGMA, o de otimização Tocher e os Componentes Principais. Utilizando descritores morfoagrômicos foi possível detectar divergência genética entre os acessos de coqueiro anão do Banco de germoplasma de coco. Os métodos de agrupamento UPGMA, Tocher e componentes principais demonstraram a eficiência na avaliação dos acessos. Foi observado que os caracteres, número de folíolos, comprimento do folíolo, largura do folíolo, comprimento do pedúnculo, número de flores masculinas, número de ramos florais, comprimento médio dos ramos florais, duração do ciclo reprodutivo, duração da fase reprodutiva masculina, período entre emergência e abertura das inflorescências e número de inflorescência dispõem de alta variabilidade genética, possibilitando êxito no melhoramento do coqueiro empregando métodos de seleção mais simples, como a seleção massal. O AVeBrJ apresentou as maiores médias quanto: número de folíolos, comprimento do folíolo, número de ramos florais, duração do ciclo reprodutivo, duração da fase reprodutiva masculina, indicando bom desenvolvimento vegetativo e reprodutivo.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:25:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_jones_eloy.pdf: 1690635 bytes, checksum: 35ae8138d7942712200eb8662fa2812e (MD5) Previous issue date: 2013-06-25 / Pollination is presented as a determining factor in the production of fruits in various fruit species, especially those that do not reproduce by parthenocarpy. This study aimed to evaluate the influence of self-pollination and cross-pollination of jelly palm in production and fruit quality. To this end, we used 14 genotypes of jelly palm of BAG of FAEM-UFPel, RS, Brazil. The treatments were: non-bagging (T1) and bagging with TNT (T2). Evaluated: average production cycle (days), average fruit weight (g), the average mass of pulp (g), pulp yield (%), average mass of pyrenes (g), number of fruits, equatorial diameter of fruits (EDF), longitudinal diameter of fruits (LDF), equatorial diameter of pyrenes (EDP), longitudinal diameter of pyrenes (LDP), relationship LDF/EDF, relationship LDP/EDP, amount of juice (ml), average number of almonds/pyrene (NA/P), almonds brocade/pyrene (%AB/P), average mass unitarian of almonds (AMUA), without almonds pyrenes (%WAP), skin colorimetry (°Hue), soluble solids (°Brix), titratable acidity (TA) ratio (SS/TA), juice pH, ascorbic acid (mg.100ml-1 juice), average date of flowering (DF) and average date of harvest (H). Self-pollination of jelly palm caused a reduction of the overall rates in the variables average mass of fruit, fruit number, EDP, NA/P, %AB/P, TA and ascorbic acid, significantly increased the average mass of pulp, relationship LDF/EDF , relationship LDP/EDP, amount of juice (ml), AMUA, % PSA, SS, ratio and pulp yield (%). It was concluded that the bagging of clusters of jelly palm cause declines, in the production, of 49.31%. However, leads to improvement in the quality of the fruit. The fruits that have been deprived of cross-pollination resulted in increased pulp yield (2.87%). The cross-pollination is essential in genotypes G. 32, G. 35, G. 57 and G. 63, without it there is no fruit production. / A polinização apresenta-se como fator determinante na produção de frutos em várias espécies de fruteiras, em especial naquelas que não se reproduzem por partenocarpia. Esta pesquisa objetivou avaliar a influência da autopolinização e da polinização cruzada de Butia odorata (Barb. Rodr.) Noblick & Lorenzi na produção e na qualidade do butiazeiro. Para tal, foram utilizados 14 genótipos de butiazeiros do banco ativo de germoplasma (BAG) da FAEM-UFPel. Os tratamentos utilizados foram: não-ensacamento (T1) e ensacamento com TNT (T2). Avaliou-se: ciclo médio de produção (dias), massa média dos frutos (g), massa média de polpa (g), rendimento de polpa (%), massa média dos pirênios (g), número de frutos, diâmetro equatorial dos frutos (DEF), diâmetro longitudinal dos frutos (DLF), diâmetro equatorial dos pirênios (DEP), diâmetro longitudinal dos pirênios (DLP), relação DLF/DEF, relação DLP/DEP, volume de suco (em ml), número médio de amêndoas/pirênio (NA/P), amêndoas brocadas/pirênio (%AB/P), massa média unitária de amêndoas (MMUA), pirênios sem amêndoas (%PSA), colorimetria da epiderme (°Hue), sólidos solúveis (°Brix), acidez titulável (AT), ratio (SS/AT), pH do suco, teor de ácido ascórbico (em mg de AA.100ml-1 suco), data média de floração (DMF em dd/mm/aa) e data média de colheita (DMC em dd/mm/aa). A autopolinização dos butiazeiros provocou redução dos índices gerais nas variáveis massa média dos frutos, número de frutos, DEP, NA/P, %AB/P, AT e ácido ascórbico; aumentou de forma significativa a massa média de polpa, relação DLF/DEF, DLP/DEP, volume de suco, MMUA, %PSA, SS, Ratio e rendimento de polpa. Concluiu-se que o ensacamento de cachos do butiazeiro diminui a produção em 49,31%, todavia, provoca melhoria na qualidade das frutas. As frutas que foram privadas da polinização cruzada resultaram em aumento do rendimento de polpa (2,87%). A polinização cruzada é fundamental nos genótipos G. 32, G. 35, G. 57 e G. 63, sem a qual não há produção de frutas.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:25:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Laerte_Reis_Terres.pdf: 206888 bytes, checksum: 2f477d53394d634ff349b9beb50a74ae (MD5) Previous issue date: 2010-02-25 / In potato breeding programs, tuber appearance and processing quality have been investigated to support the demands of consumers, industries and farmers. For a new potato genotype, many characters must be considered in the selection. Therefore, it is essential that the breeding is dynamic and efficient. The establishment of selection criteria is essential in breeding programs, providing efficient genetic gain for interest traits. The objectives of this study was to estimate genetic variability, heritability and expected selection responses for skin texture and fry color of potato in hybrid populations and their correlation with yield traits, determine the frequency of clones with smooth skin and light fry color in hybrid populations of potato. The research comprised two studies, the first was developed using four hybrid populations derived from contrasting parents for reducing sugar content, in autumn of 2007 and 2008. In the second study, was analyzed three populations derived from crosses between parents contrasting in fry color and skin texture, the experiment was conduced in spring 2008. The first study results, showed that to generate populations with light fry color is necessary to include at least one parent with low sugar. The highest estimated genetic value was observed in the population originating from crosses between parents with extreme levels of reducing sugars. In the second study, the heritability estimate was moderate for skin texture and low for fry color. Skin texture and fry color was independent and can be selected simultaneously. The associations between these characters and yield components were weak, suggesting that there is reduced genetic association between these characters. / Em programas de melhoramento genético de batata, além dos caracteres de produção, a aparência dos tubérculos e a qualidade de processamento têm sido alvo de estudos para atender as exigências dos consumidores ( in natura ), das indústrias e dos agricultores. Para que um novo genótipo atenda essas exigências, muitos caracteres devem ser considerados na seleção. Para isso, o estabelecimento de critérios de seleção é indispensável a programas de melhoramento, fornecendo eficiente ganho genético para os caracteres de interesse. Desta forma, os objetivos deste estudo foram o de estimar a variabilidade genética, herdabilidade e a resposta de seleção esperada em relação à textura de película de tubérculos e coloração de fritura em populações hibridas de batata e estimar a magnitude de correlações com os caracteres de produção. Além disto, verificar a freqüência de clones com tubérculos de película lisa e de coloração clara de fritura nestas populações. A pesquisa foi composta de dois estudos, o primeiro, foi desenvolvido utilizando quatro populações hibridas derivadas de genitores contrastantes quanto teor de açúcares redutores, cultivado nas safras de outono de 2007 e 2008. No segundo estudo, foram analisadas três populações derivadas de cruzamentos entre genitores contrastantes quanto à coloração de fritura e textura de película, sendo este experimento conduzido na primavera de 2008. Em ambos os estudos foram efetuadas avaliações de coloração de fritura e caracteres componentes de produção, e no segundo estudo foi analisada textura de película de tubérculos. No primeiro estudo, os resultados permitiram inferir que para a geração de populações superiores quanto à coloração de fritura, é necessário a inclusão de pelo menos um genitor de baixo teor de açúcares redutores. E que a maior estimativa de valor genético observado foi na população originária do cruzamento entre genitores com níveis extremos de açúcares redutores. Os resultados do segundo estudo mostram que, as estimativas de herdabilidade foram moderadas quanto à textura de película e baixas em relação à coloração de fritura. Textura de película e coloração de fritura mostraram-se independentes, podendo ser selecionados simultaneamente. As fracas associações entre estes caracteres e os componentes de produção sugerem que há reduzida associação genética entre esses caracteres.