Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-14T15:00:32Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Saimom A. G. Oliveira.pdf: 2140109 bytes, checksum: cba354e98876b23e958476c31fa20e30 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-14T15:00:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Saimom A. G. Oliveira.pdf: 2140109 bytes, checksum: cba354e98876b23e958476c31fa20e30 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-14T15:01:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Saimom A. G. Oliveira.pdf: 2140109 bytes, checksum: cba354e98876b23e958476c31fa20e30 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-14T15:01:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Saimom A. G. Oliveira.pdf: 2140109 bytes, checksum: cba354e98876b23e958476c31fa20e30 (MD5) Previous issue date: 2013-02-25 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Plukenetia volubilis is the specie that needs selection to enable commercial exploration of culture, especially about seed quality, because populations with rapid and uniform germination of seeds, followed by ready emergence seedling are highly desirable characteristics. The objectives of this study were to estimate genetic parameters based on germination performance characters, infer on the genetic variability of sacha inchi (Plukenetia volubilis) and describe the type of germination of the specie. Two experiments were conducted at Embrapa Amazônia Ocidental in a greenhouse during two periods: Amazon winter, average temperatures minimum and maximum of 68 °F and 87.8 °F, 91% RH, 49 ml of monthly evaporation and 91 monthly hours of insolation and the Amazon summer average temperatures minimum of 73.4 ° F and maximum of 93 °F , 83% RH, 67 ml of monthly evaporation and 179 hours monthly insolation. 25 progenies of P. volubilis were evaluated in each test, in a completely randomized design in 4 replicates of 5 seeds per plot. The characteristics were evaluated: Emergence seedling substrate (E), Emergence first count (FC), Emergence speed index (ESI), Diameter of the stem (DS), hypocotyl length (H) and aerial length part of seedlings (LS). Individual and joint variance analysis were performed, Scott Knot test and estimate genetic parameters. Seedling leveling occurred between 19 to 41 days and 25-42 days, respectively, in Amazon winter and summer seasons. In the analyses of individual and joint variance experiments to E, ESI and FC, there was a significant effect (P <0.05) treatments. In the joint analysis there was a significant effect of sowing date and genotype x sowing date for E, FC and ESI. The values of broad-sense heritability ranged from 7.551 (LS) to 91.587 (ESI). The ESI characteristics of the individual analysis showed high values of heritability and favorable conditions for selection. The germination of P. volubilis can be classified as the epigeal phanerocotylar and the matrix plants in this study have significant genetic variability for the characters E, ESI, LS, DS and H indicating the possibility for selection of progeny with superior quality seeds and seedlings characteristics / Plukenetia volubilis é espécie que necessita de seleção para permitir a exploração comercial da cultura, principalmente quanto a qualidade das sementes, pois populações com germinação rápida e uniforme das sementes, seguida por pronta emergência das plântulas são características altamente desejáveis. Os objetivos do presente trabalho foram estimar parâmetros genéticos com base em caracteres de desempenho germinativo, inferir sobre a variabilidade genética de sacha inchi (Plukenetia volubilis) e descrever o tipo de germinação da espécie. Foram realizados dois experimentos na Embrapa Amazônia Ocidental, em casa de vegetação, em duas épocas: inverno amazônico; temperaturas médias mínimas de 20 oC e máximas de 31 oC, 91% UR, 49 ml de evaporação mensal e 91 horas mensais de insolação e verão amazônico temperaturas médias mínimas de 23 oC e máximas de 34 oC, 83% UR, 67 ml de evaporação mensal e 179 horas mensais de insolação. Foram avaliadas em cada ensaio 25 progênies de P. volubilis, no delineamento inteiramente casualizado, em 4 repetições e 5 sementes por parcela. Foram avaliadas as características: Emergência de plântulas em substrato (E), primeira contagem de emergência (PC), índice de velocidade de emergência (IVE), diâmetro do coleto (DC), comprimento do hipocótilo (H) e comprimento da parte aérea de plântulas (CP). Foram realizadas análise de variância individual e conjunta, teste de Scott Knot e estimados parâmetros genéticos. A emergência das plântulas ocorreu entre 19 a 41 dias e 25 a 42 dias, respectivamente, nas épocas de inverno e verão amazônico. Nas análises de variância individual e conjunta dos experimentos para PG, IVE e PCP, observou-se efeito significativo (P<0,05) dos tratamentos. Na análise conjunta verificou-se efeito significativo de época de semeadura e da interação genótipo x época de semeadura para E, PC e IVE. Os valores de herdabilidade no sentido amplo oscilaram de 7,551 (CP) a 91,587 (IVE). A característica IVE nas análises individuais apresentou valores altos de herdabilidade e condições favoráveis à seleção. A germinação de P. volubilis pode ser classificada como do tipo epígea fanerocotiledonar e as plantas matrizes utilizadas no trabalho apresentam variabilidade genética significativa para os caracteres E, IVE, CP, DC e H indicando a possibilidade de seleção de progênies com características superiores de qualidade de sementes e mudas.

O MHC (Major Histocompatibility Complex) é um sistema genético importante para a manutenção de espécies ameaçadas, uma vez que baixa variabilidade para locos MHC tem sido associada a uma menor capacidade de resposta a doenças e diminuição do sucesso reprodutivo. Deste modo, pesquisas sobre a variabilidade genética do MHC têm demonstrado ser bastante informativas em estudos populacionais voltados para aspectos referentes à conservação. No presente trabalho foi investigada a variabilidade genética do MHC para três espécies de mamíferos marinhos (toninha, baleia franca austral e lobo marinho sul-americano) do sul do Brasil, com intensa mortalidade provocada por atividades humanas atuais ou passadas. As amostras foram coletadas de animais mortos encalhados na costa, de animais capturados acidentalmente por barcos pesqueiros, e também através de um sistema de biópsia. A região variável do exon 2 do gene DQB do MHC foi amplificada por PCR (Polymerase Chain Reaction) em 109 amostras de toninhas (Rio de Janeiro n=32, Rio Grande do Sul n=52, Argentina n=25), 35 amostras de lobo marinho sul-americano e 30 amostras de baleia franca austral, utilizando-se um par de primers heterólogos. O fragmento resultante de 172 pares de bases foi analisado quanto ao polimorfismo de seqüência através da técnica de SSCP (Polimorfismo de Conformação de Fita Simples) em todas as amostras de toninha e de lobo marinho sul-americano e 14 amostras de baleia franca austral. Dificuldades associadas à amplificação resultaram em padrões de SSCP pouco informativos para as amostras de lobo marinho sul-americano e baleia franca austral Todas as amostras de toninha apresentaram um padrão de pelo menos 4 bandas por indivíduo. As 4 bandas de um único indivíduo do Rio Grande do Sul foram seqüenciadas, tendo sido possível verificar que 2 seqüências relacionadas ao genes DQB estão sendo amplificadas com estes primers. Pelas análises de SSCP foi possível detectar ausência de variabilidade para as amostras de toninha provenientes do Rio de Janeiro e diferenciá-las da população da Argentina, que é polimórfica. A população do Rio Grande do Sul parece apresentar níveis intermediários de variação em relação aos extremos da distribuição da espécie. Analisando as três populações amostradas, conclui-se que a espécie apresenta baixos níveis de variabilidade para o loco DQB, a exemplo do que é reportado para os genes de MHC de outros mamíferos marinhos.

O método do retrocruzamento é bastante utilizado no melhoramento de plantas para transferir um ou mais caracteres qualitativos de um genitor doador para um genitor recorrente, que usualmente é um cultivar, sendo assim um método de substituição alélica. Entretanto, existem poucas informações sobre o uso do método do retrocruzamento para o melhoramento de caracteres quantitativos. As informações teóricas baseados no modelo de um loco com dois alelos indicam que uma geração de retrocruzamento para o genitor mais produtivo acarreta um aumento na média da população, mas uma redução na variância genética, o que limita o uso deste método para o melhoramento de caracteres quantitativos. Por outro lado, diversos trabalhos relatam a ocorrência de um aumento da variância genética em seguida a um ou mais retrocruzamentos. Neste sentido, este trabalho foi conduzido para avaliar a eficiência de uma geração de retrocruzamento para o desenvolvimento de linhas puras superiores em soja, em uma população derivada de um cruzamento biparental entre os cultivares BRS-134 e EMGOPA-315, onde este último foi utilizado como genitor recorrente, por ser mais produtivo. Vinte progênies F2:5 e 20 progênies RC1F4 foram selecionadas para produção de grãos a partir de duas populações básicas (F2:4 e RC1F3) compostas de 100 progênies cada, previamente avaliadas para produção de grãos e caracteres agronômicos em três ambientes. A avaliação experimental das progênies selecionadas foi realizada no ano agrícola de 2011/12 na Estação Experimental de Anhumas, pertencente ao Departamento de Genética da ESALQ/USP, em Piracicaba, SP. As progênies de cada população foram avaliadas em um experimento em blocos ao acaso com 20 repetições e parcelas lineares de 2 m, separadas por 0,5 m, contendo 30 plantas após o desbaste. Os seguintes caracteres foram avaliados: Produção de grãos (PG), número de dias para maturação (DM), altura das plantas na maturação (AM) e acamamento (AC). Os resultados mostraram que a população derivada de um retrocruzamento gerou um maior número de progênies mais produtivas e, portanto, uma geração de retrocruzamento para o genitor mais produtivo pode ser uma boa estratégia para melhorar a eficiência da seleção para produção de grãos em soja. / The backcross method is commonly used in plant breeding to transfer one or more qualitative traits from a donor parent to a recurrent parent, which is usually a cultivar. Therefore is a method of allelic substitution. However, there is limited information on using the backcross method for the improvement of quantitative traits. Theoretical information, based on a one-locus two-allele model, indicates that one generation of backcrossing for the higher yielding parent increases the population mean but decreases the genetic variance. The latter could limit the use of backcross method for the improvement of quantitative traits. On the other hand, several reports have shown a genetic variance increase following one or more backcrossing. This work was carried out to evaluate the efficiency of one generation of backcrossing for the development of superior soybean lines, in a population derived from a two-way cross between BRS-134 and EMGOPA-315 cultivars, where the latter one was used as recurrent parent for being higher yielding. Twenty F2:5 and 20 RC1F4 higher yielding progenies were selected from two base populations (F2:4 and RC1F3) previously evaluated for grain yield and agronomic traits in three environments. Evaluation trials of the selected progenies were carried out in 2011/12 growing season at Anhumas Experimental Station, belonging to the Department of Genetics, ESALQ/USP, in Piracicaba, state of São Paulo, Brazil. A randomized complete block design with 20 replications and plots of 2 m rows spaced by 0.5 meter with 30 plants after thinning, was used for each population. The following traits were recorded: grain yield (PG) number of days to maturity (DM), plant height at maturity (AM), and lodging (AC). General results have shown that the backcross population generates a higher number of more yielding progenies, and therefore one generation of backcrossing for the higher yielding parent could be a good strategy to improve the efficiency of selection for grain yield in soybeans.

Existem poucas informações relacionadas com a comparação de populações de soja derivadas de cruzamentos com diferentes níveis de divergência genética (DG). Os objetivos deste trabalho foram comparar o desempenho de duas populações de soja derivadas de genitores com baixa e alta DG. Foram realizados dois cruzamentos com genitores diferindo quanto à divergência genética baseada em marcadores moleculares AFLP: baixa DG (IAC-12 x IAC-100) e alta DG (EMBRAPA-60 x EMGOPA-315). Para cada cruzamento foram obtidas 100 progênies F2:3, que foram avaliadas experimentalmente em três ambientes e, posteriormente, selecionadas as 25 progênies mais produtivas. Em seguida foram obtidas 10 linhas puras F5:7 de cada uma das 25 progênies, originando aproximadamente 250 linha puras de cada cruzamento. No ano agrícola 2012/13 foram conduzidos os experimentos de avaliação, utilizando um delineamento em parcelas subdivididas, onde as progênies foram alocadas nas parcelas e as linhas puras dentro de progênies nas subparcelas, e as parcelas arranjadas em um látice balanceado 5x5 (seis repetições). As subparcelas foram constituídas de linhas de 2 m, espaçadas de 0,5 m, contendo 30 plantas após o desbaste. Os caracteres avaliados foram: número de dias para a maturação (DM), altura das plantas na maturação (AM), acamamento (AC) e produção de grãos (PG). A partir da análise de variância foram estimados os seguintes parâmetros para cada cruzamento: média geral, amplitude de variação das médias das linhas puras dentro de progênies, variância genética entre linhas puras dentro de progênies (?^2l/p ), variância fenotípica entre médias de linhas puras dentro de progênies (?^2/ F (l/p) ), coeficiente de herdabilidade entre médias de linhas puras (h ^2/X(l/p) ) e resposta esperada com seleção (Rs). Para todos os caracteres, as médias gerais foram maiores para o cruzamento de maior DG. Para PG, AM e DM as estimativas das variâncias genéticas entre linhas puras dentro de progênies F5:7 foram maiores no cruzamento de maior DG, bem como as amplitudes de variação das médias das linhas puras. Consequentemente, a resposta esperada com seleção entre médias de linhas puras dentro de progênies para PG foi 47,6% maior, em média, bem como a proporção de linhas puras de alta produção, para o cruzamento de maior DG. Os resultados deste trabalho indicam que o uso das medidas de divergência baseada em marcadores moleculares AFLP na escolha de genitores para cruzamentos pode ser uma ferramenta útil para reduzir o número de cruzamentos e, consequentemente, aumentar a eficiência da seleção para produção de grãos em soja. / There is limited information in relation to comparison of populations derived from crosses with different levels of genetic divergence (DG) in soybeans. This work was carried out to compare the performance of two soybean populations derived from parents with low and high DG. From two two-way crosses of soybeans with different levels of AFLP molecular marker genetic divergence (DG): low DG (IAC-12 x IAC-100) and high DG (EMBRAPA-60 x EMGOPA-315), one hundred F2:3 progenies were evaluated in three environments and then selected the 25 high yielding progenies. Ten inbred lines were derived in the generation F5:7 from each of 25 high yielding progeny giving rise to approximately 250 inbred lines for each cross. Evaluation trials were carried out in the 2012/13 growing season, using a split plot design, where progenies were allocated in the plots and inbred lines within progenies in the subplots, and plots arranged according to a 5x5 balanced lattice (six replications). Subplots consisted of 2 m rows spaced by 0.5 m, with 30 plants after thinning. The following traits were recorded: number of days to maturity (DM), plant height at maturity (AM), lodging (AC) and grain yield (PG). The following parameters were estimated: general mean, amplitude of variation of inbred lines within progenies means, genetic variance of inbred lines within progenies ( ?^2 l/p ), phenotypic variance on inbred lines within progenies mean basis ( ?^ 2 F(l/p) ), heritability coefficients on inbred line mean basis ( h ^2 X(l/p) ) and expected response to selection (Rs) on inbred line mean basis. For all traits, general means were higher for the high DG cross. For PG, AM and DM, genetic variance among inbred lines within F5:7 progenies were higher for the high DG cross, as well as the amplitude of variation of inbred line means. As a result, expected response to selection for grain yield (PG) was 47.6% higher, on average, as well as the proportion of high yielding inbred lines for the high DG cross. General results indicate that the use of genetically divergent parents based on AFLP molecular markers for choosing parents for crossings can be useful to reduce the number of crossings, and thus, to improve the efficiency of selection for grain yield in soybeans.

Existem poucas informações sobre o uso do método do retrocruzamento visando o melhoramento de caracteres quantitativos. Este trabalho teve como objetivo avaliar a eficiência de uma geração de retrocruzamento para o desenvolvimento de linhagens superiores em soja, a partir de um cruzamento biparental. Para isso, foram utilizados como genitores os cultivares BRS-134 e EMGOPA-315, sendo este utilizado como genitor recorrente por ser mais produtivo, mais alto e mais tardio. Foram avaliadas experimentalmente 100 progênies F2:4 e 100 progênies RC1F3, em três ambientes (combinação de locais e anos): área experimental do Departamento de Genética da ESALQ/USP e Estação Experimental Anhumas, ambas localizadas em Piracicaba, SP, utilizando o delineamento látice simples duplicado 10x10 (quatro repetições) e parcelas lineares de 2 m com espaçamento de 0,5 m, contendo 30 plantas após o desbaste. Os caracteres avaliados foram: número de dias para o florescimento (DF), altura das plantas no florescimento (AF), número de dias para a maturação (DM), altura das plantas na maturação (AM), acamamento (AC) e produção de grãos (PG). Para todos os caracteres foram estimados os seguintes parâmetros: média geral ( 2:4 F e 1 3 RC F ), amplitude de variação das médias das progênies ( 2 4 F : D e 1 3 DRC F ), variância genética entre progênies ( 2 p ^ ), variância fenotípica entre médias de progênies (2 F ^ ), coeficiente de herdabilidade entre médias de progênies (h2%) x ^ e resposta esperada com seleção (Rs), para as progênies F2:4 e RC1F3. Para todos os caracteres, a média geral foi superior para as progênies RC1F3, conforme o esperado. Entretanto, para PG e AF, as variâncias genéticas foram maiores para as progênies RC1F3, bem como as amplitudes de variação das médias, o que não era esperado com base em um modelo de um loco. Para DF também houve um pequeno aumento na variância genética, embora não significativo, enquanto para DM, AM e AC a variância genética foi maior nas progênies F2:4. Devido a isso, o coeficiente de herdabilidade entre médias de progênies retrocruzadas também foi maior para PG, bem como a resposta esperada com seleção. Os resultados deste trabalho indicam, portanto, que uma geração de retrocruzamento para o genitor mais produtivo pode ser uma boa estratégia para melhorar a eficiência da seleção para produção de grãos em soja. / There is little information on using the backcross method for the improvement of quantitative traits in soybeans. This work was carried out to evaluate the efficiency of a generation of backcrossing for the development of superior soybean lines, in a population derived of a two-way cross. The cultivars BRS-134 and EMGOPA-315 were used as parents, where the last one was used as recurrent parent for being higher yielding, taller and later. One hundred F2:4 progenies and one-hundred RC1F3 progenies were evaluated in three environments (combination of locations and years): experimental area of the Department of Genetics at ESALQ/USP and Anhumas Experimental Station, both located in Piracicaba, state of São Paulo, Brazil, using a simple 10x10 lattice design twice (four replications). Plots consisted of 2 meter long spaced by 0.5 meter, with 30 plants after thinning. The following traits were evaluated: number of days to flowering (DF), plant height at flowering (AF), number of days to maturity (DM), plant height at maturity (AM), lodging (AC) and grain yield (PG). The following parameters were estimated for both, F2:4 and RC1F3 progenies: general mean ( 2:4 F and 1 3 RC F ), amplitude of the individual progeny means ( 2 4 F : D and 1 3 DRC F ), genetic variance among progenies ( 2 p ^ ), phenotypic variance on a progeny mean basis (2 F ^ ), heritability coefficient on a progeny mean basis (h2%) x ^ and expected response to selection (Rs). For all traits general mean was higher for RC1F3 progenies, as expected. However, for PG and AF, genetic variances were higher for RC1F3 progenies, as well as the amplitude of individual progeny means, which are not expected, based on a onelocus model. For DF, there was also a small increase in genetic variance, although not significant, while for DM, AM and AC genetic variances were higher for F2:4 progenies. Consequently, heritability based on a progeny mean basis was higher for PG in the backcross population, as well as the expected response to selection. General results indicate that one generation of backcross for the higher yielding parent could be a good strategy to improve the efficiency of selection for grain yield in soybeans.

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:33:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Dante_Trindade_Avila.pdf: 3385238 bytes, checksum: 3a6019cfb9071a2701125d07c8a61d4d (MD5) Previous issue date: 2010-12-13 / The tung is a temperate deciduous species of the Euphorbiaceae family that needs about 350 to 400 chilling hours to resume growth after winter. This species is cultivated in order to produce oil, which is extracted from seeds by pressing or using solvents. The results of research on this crop in Brazil are few. Therefore, the objective of this study was to evaluate genetic variability in two tung populations in Pelotas, evaluate the yield of commercial plantations in the Serra Gaúcha region and compare methods of vegetative propagation. The observations occurred during growing season 2007/2008, 2008/2009 and 2009/2010. The populations showed variability in yield, earliness and number of female and male flowers. The average productivity of 8.232kg.ha-1 of dried fruit with the almond oil content of 47% demonstrates high oil yield, exceeding annual crops currently grown in Brazil; producing plants from seeds demands previous seed scarification; for vegetative propagation, the best method is the use of grafting cleft and cleft, with herbaceous branches. / O tungue é uma espécie de clima temperado da família Euphorbiaceae, caducifólia, que necessita cerca de 350 a 400 horas de frio para a indução floral e frutificação. A espécie é cultivada com objetivo de produzir óleo, o qual é extraído das sementes, por prensagem. Poucos são os resultados de pesquisas com esta cultura no Brasil. Portanto o objetivo do trabalho foi avaliar a variabilidade genética em populações de tungue em Pelotas, avaliar o rendimento de plantios comerciais na Serra Gaúcha e comparar métodos de propagação. Para tanto, foram observadas duas populações de tungue na Embrapa Clima Temperado, quatro plantios comerciais na Serra Gaúcha e realizados experimentos com sementes e enxertia. As observações ocorreram nas safras de 2007/2008, 2008/2009 e 2009/2010. Observou-se que os plantios apresentaram variabilidade nas características produtividade, precocidade e número de flores femininas e masculinas. A produtividade média foi de 8.232kg.ha-1 de fruto seco, com teor de óleo na amêndoa de 47%, o que demonstra alto rendimento de óleo, superior a culturas anuais atualmente cultivadas no Brasil; para produzir mudas via sementes necessita-se de escarificação prévia das sementes; para a propagação vegetativa o melhor método é a utilização da enxertia de garfagem do tipo fenda cheia, com ramos herbáceos.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Carqueja (Baccharis trimera) is a native plant from South America, occurs in several settings, it is highly employed in popular medicine, and has been explored under a grasping way. This study had the purpose of producing information for the establishment of adequate strategies to the conservation of genetic resources of this specie. Assuming this, one searched for information related to the reproductive and genetic aspects of this specie. In the cytogenetics analysis, one looked for information related to the number of chromosomes, formation of male gametes (microsporogenesis) and polinic viability within eight native populations in the states of Rio Grande do Sul and Santa Catarina. In the calculation of the number of chromosomes, an average of 10 metaphasics cells by population was analyzed. It was used Giemsa 2% (v/v) dye. In the microsporogenesis analysis, the chromosomes association and distribution stages in the meiosis, as well as the formation of tetrads and polinic viability by the test of (2 (P(0,01) were compared. The dye used in the cells identification was propionic carmin 2% (m/v) and for the estimate of pollen viability, three different dyes were tested: propionic carmin 2%, orcein acetic 2% (m/v) and alexander reaction. For the genetic variability classification, samples of ten natural populations of adults and four to maternal progenies, come from southern Brazil, were colected. Allozyme markers were used, revealed from the electrophoresis in starch gel (penetrose 30 at 13%), with Tris-citrate gel-electrode buffer for the ACP, a - EST, b - EST, MDH, PRX, NADHDH and GTDH enzimatic systems. For the genetic structure portrayal, F de Wright s statistics were used. The reproductive system was classified from the evaluation of the existence of panmixy and inbreeding equilibrium, as well as from the multiloci rate crossing estimate. The main results revealed that the populations analyzed are diploids with 2n=2X=18 chromosomes. Within the eight populations of Baccharis trimera, either in meiosis I and meiosis II, the percentage of normal cells, meiotic index and pollen viability was up to 85%. These data indicate that the populations have a normal microsporogenesis in the development process of the specie, having no problems in its introduction to selection, crossing and seed production programs. When comparing the three dyes, significant differences were observed among them, what suggests that alexander reaction may be the most reliable in order to estimate the pollen s viability in this specie. The results obtained from the allozyme markers revealed high levels of diversity either in adults (P=71% A=2,1, Ho=0,217 and He=0,215) and progenies (P=81%, A=2,4, Ho=0,272 e He=0,269). Mostly of the genetic variability of Baccharis trimera is inside the populations (FST = 0,0326), with a surplus of heterozygotes in most populations. There are indicators that the effective populational size and the vegetation type are the most influencial factors in the differences found among the populations. The specie is allogamic with Tm=1,05. The populations studied are under an equilibrium of panmixy and inbreeding. If taken together, the results of this research give referential that can define strategies for the conservation of genetic resources of this specie. / A carqueja (Baccharis trimera (Less) DC.) é uma planta nativa da América do Sul, ocorre em vários ambientes, muito utilizada na medicina popular, sendo explorada de forma predatória. O desenvolvimento deste estudo teve como objetivo gerar informações para o estabelecimento de estratégias adequadas para a conservação de recursos genéticos da espécie. Desta maneira, buscou-se informações relativas a aspectos reprodutivos e genéticos da mesma. Nas análises citogenéticas, buscou-se informações a respeito do número de cromossomos, formação dos gametas masculinos (microsporogênese) e viabilidade polínica em oito populações nativas dos Estados do Rio Grande do Sul e de Santa Catarina. Na contagem do número de cromossomos, foram analisadas em média 10 células metafásicas por população. O corante usado foi Giemsa 2% (v/v). Nas análises da microsporogênese, foram comparadas as fases de associação e distribuição dos cromossomos na meiose, a formação de tétrades e viabilidade polínica pelo teste do (2 (P(0,01). O corante usado na identificação das células foi o carmim propiônico 2%(m/v) e para a estimativa da viabilidade do pólen foram testados três diferentes corantes: carmim propiônico 2%, orceína acética 2% (m/v) e reativo de alexander. Para a caracterização da variabilidade genética foram coletadas amostras de dez populações naturais de indivíduos adultos e quatro para progênies maternas procedentes do Sul do Brasil. Foram utilizados marcadores alozímicos, revelados a partir de eletroforese em gel de amido (penetrose 30-13%), com tampão eletrodo gel Tris citrato para os sistemas enzimáticos ACP, a - EST, b - EST, MDH, PRX, NADHDH e GTDH. Para a caracterização da estrutura genética foram usadas as estatísticas F de Wright. O sistema reprodutivo foi caracterizado a partir da avaliação da existência de equilíbrio de panmixia e endogamia, bem como a partir da estimativa da taxa de cruzamento multilocos. Os principais resultados revelaram que as populações analisadas são diplóides com 2n=2x=18 cromossomos. Para as oito populações de Baccharis trimera, tanto na meiose I quanto na meiose II, a porcentagem de células normais, índice meiótico e viabilidade do pólen foram acima de 85%. Estes dados indicam que as populações possuem uma microsporogênese normal, no processo evolutivo da espécie, não ocorrendo problemas quando de sua introdução em programas de seleção, cruzamento e produção de sementes. Na comparação entre os três corantes, foram observadas diferenças significativas entre os mesmos, sugerindo o corante reativo de alexander como o mais indicado para estimar a viabilidade do pólen nesta espécie. Os resultados obtidos pelos marcadores alozímicos revelaram níveis elevados de diversidades tanto para adultos (P=71% A=2,1, Ho=0,217 e He=0,215), quanto para as progênies (P=81%, A=2,4, Ho=0,272 e He=0,269). A maior parte da variabilidade genética de Baccharis. trimera está dentro das populações (FST = 0,0326), com excesso de heterozigotos para a maioria das populações. Há indicativos de que o tamanho efetivo populacional e o tipo vegetacional são os fatores de maior influência nas diferenças encontradas entre as populações. A espécie é alógama com Tm=1,05. As populações estudadas estão em equilíbrio de panmixia e endogamia. Tomados em conjunto, os resultados desta pesquisa fornecem referenciais que possibilitam definir estratégias para a conservação de recursos genéticos da espécie.

Larus dominicanus é uma espécie de ampla distribuição no Hemisfério Sul, que se reproduz em ilhas próximas ao continente. Esta espécie vem apresentando grande expansão populacional nas últimas décadas, devido ao seu hábito generalista e sua alta capacidade competitiva. O crescimento de sua população tem causado o deslocamento de diversas outras espécies de aves e mamíferos marinhos de seus sítios reprodutivos, devido ao constante impacto da predação e parasitismo. Todas essas características tem feito com que muitos pesquisadores considerem essa espécie como uma praga nos ambientes costeiros. Dessa forma, estudos que busquem compreender biologia e evolução são fundamentais para a criação de futuros planos de manejo e conservação da assembléia de aves marinhas na costa brasileira. O presente estudo teve como objetivo caracterizar a biologia reprodutiva de L. dominicanus, buscando determinar seu sucesso reprodutivo. Bem como avaliar a razão sexual de suas populações ao longo da costa brasileira e estimar a variabilidade genética de suas populações no litoral do Brasil. Para isto estudamos a biologia reprodutiva dessa espécie em uma colônia do estado de São Paulo. Observamos que L. dominicanus apresenta alto sucesso reprodutivo, cerca 70% dos ovos eclodiram e cerca de 50% dos filhotes sobreviveram até a fase de vôo. Os filhotes apresentaram um rápido crescimento, em 30 dias já estão grande o suficiente para voarem, o que os tornam aptos a escaparem os predadores. Os principais predadores dessa espécie no estado de São Paulo são os urubus, sendo a fase mais suceptível aos ataques foram a fase de ovo e os primeiros 15 dias de vida dos filhotes. Dessa forma, com uma sobrevivência de 50% dos filhotes e baixa predação após a fase de vôo, as populações de L. dominicanus potencialmente podem apresentar grandes incrementos populacionais a cada ano. A razão sexual secundária para todas as populações amostradas ao longo do litoral brasileiro não apresentaram desvio da proporção 1:1 . Isso indica que as populações de L. dominicanus devem estar estáveis, o que é esperado de populações que se reproduzem em sítos com boas condições ambientais. De forma que, os pais não precisam favorecer o sexo que apresenta menor custo reprodutivo, levando ao desvio da razão sexual. Dentro deste panorama de grande sucesso reprodutivo e proporção similar de machos e fêmeas em uma espécie de ampla distribuição geográfica, como L. dominicanus, esperávamos encontrar grande variabilidade genética dentro e entre suas 13 populações. Entretanto, os resultados do presente estudo relativos a marcadores do DNA mitocondrial revelaram um cenário oposto. Estudando dois genes mitocondriais (citb e ATPase 8 e 6) foi observado que ao longo de toda a costa brasileira a diversidade genética desse grupo foi praticamente nula. Encontramos um único haplótipo para o citocromo b e dois haplótipos para a ATPase 8 e 6 que se diferenciam por um único par de base. Essa baixa diferenciação se manteve quando ampliamos a amostragem ao longo da distribuição dessa espécie, com amostras da Península Antartica, ilhas Marion e de sequências disponíveis no Genbank provenimentes da Austrália e Ilhas Kerguelen. Para justificar essa baixa diversidade genética levantamos duas possíveis explicações, as populações de L. dominicanus teriam passado por um severo evento demográfico ou por eventos de seleção. Para distinguir entre esses dois cenários desenvolvemos 13 marcadores nucleares não ligados, buscando encontrar um padrão caso as populações de L. dominicanus tivessem passado por eventos demográficos. Eventos demográficos marcam o genoma da espécie como um todo (DNA mitocondrial e nuclear), por outro lado eventos seletivos marcam somente o loccus sob seleção e gene ligados a estes. Dessa forma, se a redução da variabilidade genética de Larus dominicanus for resultado de eventos seletivos é esperado que marcadores DNA nuclear apresentem variação, mas não apresentem sinal de expansão populacional. Nos 13 loci nucleares analisados no presente estudo foi observado grande diversidade genética e nenhum sinal de expansão populacional. Assim, concluímos que L. dominicanus é uma espécie adaptada às novas condições ambientais criadas pelas atividades antrópicas. Essa espécie apresenta grande suceso reprodutivo e nenhum desvio da razão sexual. A baixa diversidade genética observada no DNA mitocondrial comparada com a alta variabilidade encontrada em diferente loci nucleares, parece indicar que essa espécie tenha passado por um evento de seleção na molécula mitocodrial. Do ponto de vista da conservação a alta variabilidade genética encontrada no nuclear é condizente com a ampla distribuição da espécie. Aparentemente essa espécie não demonstra ter o baixo nível de diversidade a ponto de ser preocupante para a manutenção da espécie. Por outro lado, a baixa diversidade encontrada no DNA mitocondrial abre uma importante expectativa para se compreender como a evolução tem atuado nos organismos marinhos e quais os processos que tem levado à diversificacação desse grupo. / Larus dominicanus is a widely distributed species in the Southern Hemisphere, and it breeds on islands close to the continents. In the last few decades this species presented great population expansions, due to its generalist habits and its great competitive capacity. These populations expansions ended up leading to the displacement of other seabirds and marine mammals of the breeding sites. In this sense, studies that seek understanding the biology and evolution of L. dominucanus are fundamental to create management and conservation plans to the seabird assemblage on the Brazilian coast. The primary aim of this study was to characterize the reproductive biology of Larus dominicanus, in order to determine the species reproductive success. In addition we evaluated the sex ratio of the populations throughout the Brazilian coast. In order to accomplish this we studied the reproductive biology of the species in one breeding colony in São Paulo state. We observed that L. dominicanus presented high reproductive success with about 70% of the eggs hatching and 50% of the chicks surviving until the flight phase. The chicks present a fast growth and within 30 days were mature enough to fly, making them able to escape from the predators. We also observed that before the flight phase, during the egg phase and mainly the first 15 days of life, the eggs and the chicks were more susceptible to vulture attacks, the main predator of the species in São Paulo state. In this sense, with a 50% rate survival and low predation rates after the flight phase, we can infer that the populations of L. dominicanus must be going through high increments per year. The secondary sex ratio analyzed to all populations sampled through the Brazilian coast did not show deviation from the 1:1 proportion. This result indicated that the L. dominicanus populations are stable, a characteristic expected to be found in populations that breed in sites with good environmental conditions. In a case like this, the parents do not need to favor the gender that needs less energy to survive, what would lead to a deviation in the sex ratio. In this scenario of high reproductive success and equal proportion of males and females in a widely distributed species, we expected to find high levels of genetic variability both among and in the populations. Nevertheless, our mitochondrial DNA (mtDNA) data revealed an opposite situation. We studied two mitochondrial genes (cytb, ATPase 8 and 6) and observed that throughout the whole Brazilian coast the 11 genetic diversity for the group was practically null. We found only one haplotype to the cytb and two haplotypes for the ATPase 8 and 6, these last two were different for one base pair. The low differentiation was maintained when we extended the sampling to the whole species\' distribution , with samples from the Antarctic Peninsula and the Marion Islands, and sequences from the Genbank from Australia and Kerguelen Islands. We proposed two scenarios that could explain this extremely low variability, either the populations of L. dominicanus went through a severe demographic event, or through selection events. In order to distinguish among this processes, we development 13 not linked nuclear markers, searching for a common pattern between the nuclear markers and the mtDNA genes. If the L. dominicanus populations had gone through demographic events, we expected to find the same expansion signal in the nuclear markers, once demographic events would be marked in the whole genome, both nuclear and mitochondrial. On the other hand, if the low genetic variability observed resulted from selective events, we expected to find variation in the nuclear DNA, and not to find an expansion signal. Our results showed exactly the last scenario, with high genetic diversity in all 13 nuclear not linked loci and no expansion signal. Even in more detailed analyses, with a higher number of individuals, the same pattern of neutrality, and not of population expansion, for the nuclear markers was found. Therefore, we concluded that L. dominicanus is an extremely well adapted species for the new environmental conditions generated by antropic activities. The species showed great reproductive success and no deviation of the 1.1 sex ratio. The low genetic diversity observed in mitochondrial DNA compared with the high variability found in different nuclear loci, indicate that this species has gone through selective processes on the mitochondrial molecule. To the conservation point of view, the high genetic variability found in nuclear markers is in agreement with the wide distribution of the species. Apparently, this species do not present diversity levels low enough to generate worries regarding its maintenance. In addition, the low levels of diversity found on the mitochondrial DNA open new frontiers to understand how evolution has acted on marine organisms and what are the processes that lead to the diversification of this group.

O Vale do Ribeira é uma área que ocupa cerca de 10% da região sul do estado de São Paulo e abriga pelo menos 30 remanescentes de quilombos. Dessas, 24 já foram oficialmente reconhecidos ou estão em fase de reconhecimento. Com a finalidade de contribuir para o conhecimento da estrutura populacional e da história de formação dessas comunidades afro-descendentes, estudamos o DNA mitocondrial de 939 indivíduos adultos de doze populações de quilombos: Abobral Margem Esquerda (100), Abobral Margem Direita (41), Galvão (59), São Pedro (65), Pedro Cubas (100), Pilões (49), Maria Rosa (19), André Lópes (110), Nhunguara (123), Sapatu (95), Ivaporunduva (133), Poça (51), além de uma amostra de 104 indivíduos da cidade de São Paulo. As estratégias empregadas para a determinação dos haplogrupos de DNA mitocondrial se basearam em PCR-RFLP (sítio 3592 com a enzima Hpa I), estudo da deleção de 9pb (entre os genes da COII e RNAtLys) e sequenciamento da região hipervariável I do DNA mitocondrial (HVS-I). Nas doze populações de quilombos, importante contribuição ameríndia (com 49,3% de linhagens) e africana (49,2% das linhagens) foram detectadas e poucas linhagens européias foram observadas. Resultados de estudos sobre a origem dos cromossomo Y, realizados nas mesmas comunidades do Vale do Ribeira por nossa equipe contrastam com as análises de DNA mitocondrial, pois indicaram reduzida contribuição ameríndia. Essa assimetria sugere pouca importância do homem indígena e muita importância da mulher indígena na origem dessas comunidades. Os resultados de sequenciamento da HVS-I indicaram a provável origem na região centro-oeste africana (Bantos) para as linhagens africanas, com destaque para o atual território de Angola. Uma possível contribuiçãodas populações indígenas Guarani e Kaigang na origem das linhagens ameríndias foi detectada. Foi possível identificar em quase todas as populações afro-descendentes haplótipos predominantes, tanto de origem africana como ameríndia, candidatos a fundadores, com exceção feita a Maria Rosa, André Lópes, Nhunguara e Poça. Galvão foi a comunidade de quilombo que evidenciou maior efeito de fundador e, consequentemente, onde se observou o menor índice de diversidade haplotípica. Na análise dos dendrogramas, os remanescentes de quilombos de Galvão, São Pedro, Sapatu e Ivaporunduva mostram-se mais próximos das populações ameríndias do que das demais populações da literatura. As demais comunidades remanescentes de quilombos (André Lópes, Poça, Pedro Cubas, Abobral, Nhunguara, Pilões e Maria Rosa) estão geneticamente mais próximas de populações da etnia Banto. A comunidade da Poça se manteve próxima a São Paulo e separada das demais comunidades quilombolas, provavelmente devido à maior presença de material genético europeu nessa comunidade. As proximidades genéticas observadas entre os grupos de populações Galvão e São Pedro; Abobral Margem Esquerda e Margem Direita; São Pedro, Galvão, Sapatu e Ivapotunduva e, finalmente, entre Nhunguara e André Lopes, é confirmada pelos registros históricos, que atestam para proximidade genealógica e geográfica desses grupos. Pilões e Maria Rosa não se apresentaram tão próximas entre si, como esperado, provavelmente devido à redução do tamanho populacional. Finalmente, como esperado pelos registros históricos, os demais afro-descendentes do Brasil e populações africanas da etnia banto formaram um clado, assim como os brasileiros brancos e as populações de origem portuguesa que também formaram um clado. Os nossos resultados apontam para uma formação genética e histórica muito rica e diversa nos remanescentes de quilombos. Especialmente relevante foi a constatação de importante contribuição genética indígena preservada nos quilombos. Essas populações, paradoxalmente, podem fornecer um excelente material para investigar a diversidade genética dos ameríndios. Este fato é é importante, se considerarmos o processo contínuo de depopulação indígena provocada pela entrada de grupos europeus no continente americano. / At least 30 quilombo remnants are supposed to exist in the Vale do Ribeira region, located in the southern part of São Paulo State. Twenty-four of those African-derived have already been identified and officially recognized as quilombo remnants. In order to shed light on the structure and history of the foundation of these quilombo remnants we investigated the mitochondrial DNA of 939 individuals from twelve populations: Abobral Left Margin (100), Abobral Right Margin (41), Galvão (59), São Pedro (65), Pedro Cubas (100), Pilões (49), Maria Rosa (19), André Lópes (110), Nhunguara (123), Sapatu (95), Ivaporunduva (133), Poça (51). In addition, we investigated 104 individuals sampled from the city of São Paulo. The mitochondrial DNA haplogroups were identified by PCR-RFLP (site 3592 with the Hpa I enzyme), a 9pb deletion (between COII e RNAtLys genes) and sequencing of the first mitochondrial DNA hipervariable region (HVS-I). The twelve African-derived populations investigated showed high frequencies of Amerindian (49,3%) and African (49,2%) lineages and a small European contribution (1,5%). Studies based on Y chromosome haplotypes carried out with the same quilombo populations in our laboratory presented contrasting results with the analyses of mtDNA and showed reduced amerindian contribution. This asymmetry suggests reduced genetic contribution of Amerindian men and an important role of Amerindian women during the foundation process of these populations. The sequencing data indicated a probable geographic origin in Central and Western Africa (Bantu) for the African lineages, especially in the current territory of Angola. A possible Guarani and Kaigang origin for the amerindian lineages was indicated. It was possible to identified in almost all the afro-derived populations, frequent haplotypes considered as candidates to founders, some African and some Amerindian. Exceptions to this rule occurred in Maria Rosa, André Lopes, Nhunguara e Poça populations. Galvão showed the lowest genetic diversity, indicating that this population was the most influenced by founder effect. In the neighbor-joining tree, built with haplotypic frequencies found in the quilombos, São Paulo and other previously reported populations, the quilombos of Galvão, São Pedro, Sapatu and Ivaporunduva were closer to the Amerindian populations. The remaining populations (André Lopes, Poça, Pedro Cubas, Abobral Left Margin, Abobral Right Margin, Nhunguara, Pilões and Maria Rosa) were closer to African Bantu populations. The genetic similarities observed between the population groups of Galvão and São Pedro, Abobral Left Margin and Abobral Right Margin; Nhunguara and André Lopes, and São Pedro, Galvão, Sapatu and Ivaporunduva, were confirmed by historical records that support their geographic and genealogical proximity. Pilões and Maria Rosa, also geographically close, did not cluster together as expected, probably due to a recent population bottleneck. Poça clustered with São Paulo, but kept distant from the remaining quilombo remnants, probably due to the highest relative European ancestral contribution. As expected based on historical records, other Brazilian African-derived populations and African Bantu populations grouped. The same was observed with white Brazilian and Portuguese populations. Our results indicated a diverse genetic background in the foundation of the quilombo populations. Interestingly, these studies have revealed a high matrilineal genetic contribution of Amerindians. The quilombo remnant populations, paradoxically, seem to be an excellent source of material to investigate the genetic diversity of Amerindian populations. This is of great relevance, taking into account the depopulation of Brazilian native populations which happened after the beginning of the occupation process by European colonizers.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:24:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 taryana.pdf: 5876234 bytes, checksum: 626e6debe969770d6329c335e12d0cad (MD5) Previous issue date: 2006-08-24 / The Species Palicourea coriacea (Cham) K,Shum is a species little know, it is belonging to the Rubiaceae family, popularly known as douradinha. The popular use medicine in the therapy of kidneys illnesses. The popular name douradinha is associated with the color of the bracts and of the stem and the species occurs in Cerrado s Bioma, however in different environments. Studies about the genetic diversity and its distribution in natural populations of P. coriacea are of extreme importance for the definition of adequate strategies of handling and cultivation, however they do not exist in literature, studies of this nature. This work had as objective to evaluate the genetic structure from nine natural populations of P. coriacea, collected in States of Goiás and Bahia and to evaluate the genetic diversity of these populations through markers RAPD. The P. coriacea species presented one high level of genetic diversity, or heterozygosity waited by Nei (1972) that it varied between 0,259 and 0,338 in the populations, with equal on average value the 0,296. The AMOVA disclosed that 23% of the total variability is meeting each other between populations. Although the estimates of apparent gene flow (Nm) have disclosed values inferior to one, on the other hand, equal the 0,83. The analyses of Bayesian Statistics had disclosed to a value of f (FIS) equal the 0,98 suggesting the possibility of this species has behavior like autogamous species. The analyses of grouping of the populations using Bayesian and AMOVA statistics disclosed that it does not exist a correlation between geographic distance and genetic distance all the nine populations they grouping, eventually, not obeying its geographic origin. Then, the hypothesis previously formulated of that geographically next populations would be genetic next, was discarded for the results gotten for the Mantel test where it got a correlation of 0,155. In addition, this relatively high inter populations differentiation allows to recommend to a strategy ex situ of the genetic variability using the biggest possible number of populations. In what, the conservation says respect in situ must be taken in account characteristic genetic and demographic of this species considering that this fact implies in the possibility of a continuous evolution and in the development of new adaptable strategies. It is necessary to have conscience on the distribution of the genetic diversity of these areas with intention to not only promote polities for preservation of found natural populations in national parks, but yes to private preservation of the legal reserves and properties. / A espécie Palicourea coriacea (Cham.) K. Schum é uma espécie pouco conhecida cientificamente, pertencente à família Rubiaceae, popularmente conhecida como douradinha. É utilizada pela medicina popular na terapia de doenças renais. O nome popular douradinha está associado à cor das brácteas e do caule e a espécie ocorre no bioma Cerrado, porém em diferentes fitofisionomias. Estudos sobre a diversidade genética e sua distribuição em populações naturais de P. coriacea são de extrema importância para a definição de estratégias adequadas de manejo e cultivo, porém não existem, na literatura, estudos dessa natureza. Este trabalho teve como objetivo avaliar a estrutura genética de nove populações naturais de P. coriacea, coletadas nos Estados de Goiás e Bahia e avaliar a diversidade genética dessas populações utilizando marcadores RAPD. A espécie P. coriacea apresentou um alto nível de diversidade genética, ou heterozigosidade esperada de Nei (1972) que variou entre 0,259 e 0,338 nas populações, com um total geral igual a 0,296. A AMOVA revelou que 23 % da variabilidade total se encontram entre populações e 77 % se encontra dentro de populações. As estimativas de fluxo gênico aparente (Nm) foram inferiores a um, ou seja, igual a 0,83. As análises do índice de fixação (f) por abordagem bayesiana forneceram valores médio igual a 0,98 sugerindo a possibilidade dessa espécie se comportar como uma espécie autógama. As análises de divergência genética e padrão espacial das populações utilizando as matrizes de &#952;B e &#934;ST par a par revelou que não existe uma correlação entre distância geográfica e distância genética todas as nove populações se agrupam aleatoriamente, não obedecendo a sua origem geográfica. Assim, a hipótese previamente formulada de que populações geograficamente próximas teriam que ser geneticamente próximas, foi descartada pelos resultados obtidos no teste de Mantel onde a correlação foi igual a 0,155. Assim essa diferenciação interpopulacional relativamente alta permite recomendar uma estratégia de amostragem para a conservação ex situ da variabilidade genética, utilizando o maior número de populações possível. No que diz respeito a conservação in situ, deve ser levado em conta características genéticas e demográficas dessa espécie, considerando que esse fato implica na possibilidade de uma evolução contínua e no desenvolvimento de novas estratégias adaptativas. É necessário ter conhecimento sobre a distribuição da diversidade genética destas áreas com o intuito de auxiliar nas políticas para preservação não somente de populações naturais encontradas em parques nacionais, mas também preservação das reservas legais e propriedades privadas.