In most eukaryotes, alternative splicing is an important regulatory mechanism of gene expression that results in a single gene coding for multiple protein isoforms, thus largely increases the diversity of the proteome. RNA-seq is widely used for genome-wide splicing isoform quantification, and several effective and powerful methods have been developed for splicing analysis with RNA-seq data. However, it remains problematic for genes with low coverages or large number of isoforms. These difficulties may in principle be ameliorated by exploiting correlations encoded in the structured data sources. This thesis contributes to developments of Bayesian methods for splicing analysis by leveraging additional information in multiple datasets with structured prior distributions. First, we developed DICEseq, the first isoform quantification method tailored to time-series RNA-seq experiments. DICEseq explicitly models the correlations between experiments at different time points to aid the quantification of isoforms across experiments. Numerical experiments on both simulated and real datasets show that DICEseq yields more accurate results than state-of-the-art methods, an advantage that can become considerable at low coverage levels. Furthermore, DICEseq permits to quantify the trade-off between temporal sampling of RNA and depth of sequencing, frequently an important choice when planning experiments. Second, we developed BRIE (Bayesian Regression for Isoform Estimation), a Bayesian hierarchical model which resolves the difficulties in splicing analysis in single-cell RNA-seq (scRNA-seq) data by learning an informative prior distribution from sequence features. This method combines the quantification and imputation for splicing analysis via a Bayesian way, which is particularly useful in scRNA-seq data due to its extreme low coverages and high technical noises. We validated BRIE on several scRNA-seq data sets, showing that BRIE yields reproducible estimates of exon inclusion ratios in single cells. Third, we provided an effective tool by using Bayes factor to sensitively detect differential splicing between different single cells. When applying BRIE to a few real datasets, we found interesting heterogeneity patterns in splicing events across cell population, for example alternative exons in DNMT3B. In summary, this thesis proposes structured Bayesian methods to integrate multiple datasets to improve splicing analysis and study its biological functions.

Submitted by JOSIANE SANTOS DE OLIVEIRA (josianeso) on 2017-06-06T17:03:04Z No. of bitstreams: 1 Giseli Barbosa de Lima_.pdf: 1516784 bytes, checksum: b62cf6126e2c71668ad61f65afdfbc82 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-06T17:03:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Giseli Barbosa de Lima_.pdf: 1516784 bytes, checksum: b62cf6126e2c71668ad61f65afdfbc82 (MD5) Previous issue date: 2017-01-12 / Nenhuma / A indústria da construção civil tem um papel fundamental em termos econômicos e sociais para o país. Mas do ponto de vista ambiental, é um dos setores que mais se destaca em relação ao consumo de matérias-primas, além de gerar um grande volume de resíduos de construção e demolição. Para evitar ou reduzir a geração destes resíduos é necessário investigar a sua origem, que pode ser desde a fase do projeto até a de produção, e quantificar a geração para o estabelecimento de parâmetros e controle. Neste contexto, este estudo propõe um modelo para estimar a geração de resíduos na construção de obras comerciais verticais, considerando características específicas das construtoras que atuam na região metropolitana de Porto Alegre/RS. O método de pesquisa consiste num estudo de múltiplos casos, utilizando ferramenta de análise estatística. A pesquisa foi realizada em três etapas: 1) levantamento de dados através de variável dependente (geração de resíduos por área construída – m³/m²) e as variáveis independentes (características de projeto arquitetônico e sistema construtivo); 2) tratamento dos dados utilizando regressão linear múltipla; e 3) aplicação do modelo estatístico e análise com ampliação da amostra. Inicialmente a amostra é constituída por dados de 6 obras comerciais verticais de 5 empresas da região metropolitana de Porto Alegre/RS, gerando um modelo estatístico com R² ajustado = 0,967, permitindo explicar 97% da geração de resíduos por área construída em obras com características semelhantes. As variáveis que formam o modelo consistem em: variável dependente “geração de resíduos por área construída” e as variáveis independentes “tipo/total”; “área total construída”; “índice econômico de compacidade” e “sistema construtivo”. A amostra ampliada é formada por 12 obras, incluindo 6 obras residenciais verticais que atuam na região metropolitana de Porto Alegre/RS. Como resultado foi testado um modelo estatístico, formado pela variável dependente e as variáveis independentes. Ao comparar os valores estimados de geração de resíduos (m³/m²) utilizando este modelo é possível observar que o modelo gerado a partir das obras somente do segmento comercial mostra maior aproximação aos valores de geração de resíduos informados pelas empresas construtoras. / The construction industry plays a key role in economic and social terms for the country. But from the environmental point of view, it is one of the sectors that stands out more in relation to the consumption of raw materials, besides generating a large volume of construction and demolition waste. To avoid or reduce the generation of these wastes, it is necessary to investigate their origin, which can be from the project to the production phase, and quantify the generation for the establishment of parameters and control. In this context, this study proposes a model to estimate the generation of residues in the construction of vertical commercial works, considering specific characteristics of the constructors that operate in the metropolitan region of Porto Alegre/RS. The research method consists of a multiple case study using a statistical analysis tool. The research was performed in three stages: 1) data collection through a dependent variable (generation of waste by constructed area - m³/m²) and independent variables (characteristics of architectural design and construction system); 2) data treatment using multiple linear regression; and 3) application of the statistical model and analysis with amplification of the sample. Initially the sample consists of 6 vertical commercial works of 5 companies from the metropolitan region of Porto Alegre/RS, generating a statistical model with adjusted R² = 0.967, allowing to explain 97% of the waste generation by area constructed in works with similar characteristics . The variables that form the model consist of: dependent variable "generation of residues per constructed area" and independent variables "type/total"; "Total built area"; "Economic index of compactness" and "constructive system". The expanded sample consists of 12 works, including 6 vertical residential works that operate in the metropolitan region of Porto Alegre/RS. As a result was tested a statistical model, formed by the dependent variable and the independent variables. When comparing the estimated values of waste generation (m³/m²) using this model it is possible to observe that the model generated from the works only of the commercial segment shows a greater approximation to the values of generation of waste reported by the construction companies.

As especificações do biodiesel são garantidas por um rigoroso controle de qualidade; entre outros parâmetros, a quantificação de antioxidantes é fundamental para assegurar um produto satisfatório para comercialização. No presente estudo, foram desenvolvidas técnicas voltamétricas e cromatográficas para análise direta de BHA, TBHQ, BHT e PG em biodiesel. Medidas por voltametria de pulso diferencial (DPV) em mistura biodiesel:etanol 1:1 (v/v), contendo perclorato de tetra-hexilamônio como eletrólito suporte e empregando ultramicroeletrodo (ume) de Pt, mostraram picos da corrente diferencial de oxidação bem definidos para TBHQ e PG, sendo obtidos gráficos de calibração lineares na faixa de concentrações de 10-3 mol L-1. Analogamente, empregando um ume de Au em microemulsão de biodiesel livre de surfactante (SFME) contendo tetrafluoroborato de tetra-n-butilamônio, medidas por DPV apresentaram picos da corrente diferencial bem definidos para TBHQ e BHT. Para esses compostos, foram obtidos gráficos de calibração lineares na faixa de concentrações de 10-4 mol L-1. Em ambos os casos, devido à sobreposição dos voltamogramas, os teores de antioxidantes foram calculados por um procedimento matemático de deconvolução empregando o software Origin 8.0®. A quantificação de BHA, BHT e TBHQ por cromatografia GC/qMS em biodiesel diluído em metanol apresentou linearidade entre 5 e 25 mg L-1, para cada um dos antioxidantes. Medidas por HPLC em fase reversa com coluna fenílica apresentaram boa separação dos picos cromatográficos na análise simultânea de BHA, BHT, TBHQ e PG assim como curvas de calibração com linearidade entre 10 e 80 mg L-1, para cada um dos antioxidantes. A identificação dos ésteres metílicos de ácidos graxos (FAMEs) no biodiesel foi realizada por UHPLC-ESI-Orbitrap/MS; os teores de FAMEs e antioxidantes permaneceram estáveis nas amostras fortificadas mesmo após 8 semanas de exposição à luz solar, porém diminuíram significativamente em amostras não-fortificadas. As metodologias propostas são de fácil preparo e baixo consumo de amostra, podendo vir a ser do interesse da indústria para o monitoramento de antioxidantes em biodiesel, na linha de produção. A principal vantagem é não ser necessário nenhum tipo de pré-tratamento da amostra: a simples diluição em metanol ou etanol ou a preparação do biodiesel na forma de SFME conferem rapidez e simplicidade à determinação dos antioxidantes investigados. / Biodiesel features are assured by strict quality control procedures; among those, antioxidants quantification is essential to guarantee a good and satisfactory final product for commercialization. In the present study, voltammetric and chromatographic methodologies were developed for direct analyses techniques of BHA, TBHQ, BHT and PG in biodiesel. Differential pulse voltammetry (DPV) in biodiesel:ethanol 1:1 (v/v), with tetrahexylammonium perchlorate as supporting electrolyte at a Pt ultramicroelectrode (ume), presented well-defined oxidation peaks for TBHQ and PG, with corresponding linear calibration graphs in the range of 10-3 mol L-1. Likewise, DPV at an Au ume in biodiesel surfactant-free microemulsion (SFME), with tetra-n-butylammonium tetrafluoroborate, presented well-defined oxidation peaks for TBHQ and BHT. For these compounds, linear calibration graphs were obtained in the range of 10-4 mol L-1. In both techniques, due to significant voltammograms overlapping, amounts of antioxidants were calculated through mathematical deconvolution process using software Origin 8.0®. BHA, BHT and TBHQ quantification by GC/qMS in biodiesel diluted in methanol presented linearity between 5 and 25 mg L-1 for each antioxidant. Reversed-phase liquid chromatography by HPLC using phenyl column showed good peak separation in simultaneous analysis of BHA, BHT, TBHQ and PG and calibration curves with linearity between 10 and 80 mg L-1. Biodiesel fatty acid methyl esters (FAMEs) identification was carried out by UHPLC-ESI-Orbitrap/MS; both FAMEs and antioxidants contents remained stable in spiked samples even after 8 weeks under sunlight exposure; in non-spiked samples, FAMEs content was significantly reduced. All proposed methodologies are easy to perform and present low sample consumption, which are interesting features for industry to monitor the aforementioned and other antioxidants in biodiesel. Their main advantage lies in the absence of any sample pre-treatment: the simple dilution in methanol or ethanol or biodiesel preparation as SFME deliver speed and simplicity for determination of target antioxidants.

Para avaliar os possíveis efeitos que os corantes artificiais podem causar à saúde, é de grande importância possuir dados relativos à exposição a estas substâncias. O fato de diversos estudos apontarem problemas de saúde relacionados ao consumo do corante artificial Amarelo Crepúsculo (AC) justifica a necessidade de verificar se a ingestão desta substância, através do consumo de alimentos industrializados, ultrapassa a Ingestão Diária Aceitável (IDA). O objetivo deste trabalho foi estudar e caracterizar a ingestão de AC pela população brasileira. Para isso, primeiramente foram verificados quais os alimentos comercializados por uma das maiores redes de supermercados do país que continham AC na sua formulação. Foi avaliada a ingestão média destes alimentos utilizando as Pesquisas de Orçamento Familiar (POF, 2008-2009) e determinada a Ingestão Diária Máxima Teórica (IDMT) de AC, através dos valores estipulados pela legislação brasileira para a concentração máxima permitida deste corante nos diferentes grupos de alimentos. Posteriormente foram realizadas analises, através de Cromatografia Líquida de Alta Eficiência (CLAE), para avaliar o teor de Amarelo Crepúsculo em refrescos em pó, refrigerantes, bebidas isotônicas, gelatinas e balas, e verificar as faixas de utilização deste corante e a adequação à legislação vigente. Através dos dados obtidos, verificou-se que a IDMT para AC, considerando o consumo médio per capita de alimentos, não supera a IDA para nenhuma das distribuições populacionais estudadas. No entanto, ao considerar a prevalência de consumo alimentar, a IDMT é superior à IDA para adolescentes de 10 a 18 anos (277% da IDA), adultos (181% da IDA) e idosos (140% da IDA) das áreas urbanas e rurais e nas cinco regiões do país Em relação às amostras analisadas, pode-se constatar que, considerando-se as médias obtidas, os produtos que mais contêm AC são na ordem: Refrigerantes (7,91 mg/100 mL); Bebidas Isotônicas (6,22 mg/100 mL); Refrescos em pó (5,96 mg/100 mL); Gelatinas (5,92 mg/100 mL) e Balas (menor que 1,25 mg/100 g). Através da realização deste trabalho, conclui-se que considerando o consumo médio per capita a ingestão diária representa entre 14 e 31% da IDA, não representando risco à saúde. No entanto, verificou-se que alguns indivíduos de todos os grupos populacionais podem estar ingerindo o corante em quantidades superiores às recomendadas. Cabe destacar que a POF (2008-2009), utilizada como fonte de dados nesta pesquisa, entrevistou crianças a partir dos 10 anos de idade. Visto que neste estudo o consumo de AC aumentou ao diminuir a faixa etária, é provável que esta tendência se aplique para crianças com menos de 10 anos. Diante do exposto, torna-se necessário um maior rigor no emprego e na fiscalização do uso de Amarelo Crepúsculo em produtos alimentares, visto que o consumo elevado deste corante pode ocasionar reações adversas aos seus consumidores. / To evaluate the possible effects that artificial dyes can cause health is very important to have data on exposure to these substances. The fact that several studies suggest health problems related to the consumption of artificial dye Sunset Yellow (SY) justifies the need to verify that the ingestion of this substance through consumption of processed foods, exceeds the Acceptable Daily Intake (ADI). The aim of this study was to evaluate and characterize the SY intake by the Brazilian population. For this, they were first checked which foods marketed by one of the country's largest supermarket chains containing SY in its formulation. the average intake of these foods using the Household Budget Surveys were evaluated (HBS 2008-2009) and determined the Theory Maximum Daily Intake (TMDI) SY, through the values set by the Brazilian legislation for the maximum permitted concentration of the dye in the different groups of food. Later analyzes were performed by High Performance Liquid Chromatography (HPLC) to evaluate the Yellow Twilight content in powdered drinks, soft drinks, isotonic drinks, gelatins and candy, and check the use of bands of this dye and the adequacy of legislation current. Through the data, it was found that the TMDI for SY, considering the average per capita consumption of food does not exceed the ADI for any of the studied population distributions. However, when considering the prevalence of food consumption, the TMDI is higher than the ADI for adolescents 10-18 years (277% of ADI), adults (181% of ADI) and the elderly (140% ADI) in urban areas and rural and in five regions of the country. Regarding the samples, it can be seen that, considering the averages, the products that contain SY are in order: Soft drinks (7.91 mg/100 mL); Isotonic drinks (6.22 mg/100 mL); powdered drinks (5.96 mg/100 mL); Gelatins (5.92 mg/100 mL) and candy (below 1,25 mg/100 g) Through this work, it is concluded that considering the average consumption per capita daily intake is between 14 and 31% of ADI and do not represent a health risk. However, it was found that some individuals of all population groups may be ingesting the dye in amounts greater than those recommended. It should be noted that the HBS (2008-2009), used as a data source in this research, interviewed children from 10 years old. Since in this study the use of SY increased by reducing the age, it is likely that this trend will apply to children under 10 years. Given the above, it is necessary a greater rigor in applying and monitoring the use of Sunset Yellow in food products, as the high consumption of this dye can cause adverse reactions to their consumers.

Le paysage des thérapies inhalées connaît de profondes évolutions depuis les deux dernières décennies, avec pour objet la considération nouvelle du poumon comme un site de transfert des agents thérapeutiques vers le compartiment sanguin. Cette approche originale est apparue par la combinaison de développements théoriques et pratiques multiples impliqués dans la mise au point de nombreux médicaments, depuis le traitement de la douleur et du diabète jusqu'à la vaccination et le traitement de certains cancers. La quantité effective de médicament délivrée par aérosols est pondérée par de nombreux facteurs dont le mode et les conditions d’inhalation, les propriétés physiques des gaz en jeu, la morphologie des voies respiratoires ou encore les propriétés physico-chimiques des particules véhiculées. Les développements en cours ces quatre dernières années ont été conditionnés par des résultats encore mal compris, soulignant les limites des connaissances sur le transport et le dépôt d'aérosols dans le poumon. Ces manques mettent en avant le besoin d'outils performants pour l'évaluation du dépôt de particules dans les voies respiratoires.Les techniques d’imagerie permettent à la fois l’évaluation spatiale et quantitative du dépôt, avec pour seules références aujourd’hui, les techniques de médecine nucléaire. Outre l’aspect ionisant de ces techniques, elles bénéficient d’une sensibilité de détection encore inégalée. Elles demeurent néanmoins limitées par des résolutions spatiale et temporelle faibles, rendant le plus souvent difficile tant l’interprétation du dépôt que le rôle joué par les principaux mécanismes de clairance dans les voies aériennes. Depuis la fin des années 1990, les techniques de résonance magnétique imagent des noyaux hyperpolarisés (hélium-3 et xenon-129) et établissent de nouveaux standards dans l’exploration de la fonction pulmonaire.Cette thèse établit, sur la base de l’IRM de l’hélium-3 hyperpolarisé, une nouvelle modalité d’imagerie pour détecter et quantifier le dépôt d’aérosols dans les voies aériennes.Dans un premier temps, et dans un contexte où l’imagerie par résonance magnétique ne s’était pas encore penchée sur la problématique des aérosols thérapeutiques, un vaste travail d’investigation a été mené pour évaluer la sensibilité de l’IRM de l’hélium-3 hyperpolarisé au dépôt d’aérosols marqués à base d’oxyde de fer superparamagnétique. Le second volet de ce travail s’est porté sur la validation de notre méthode d’évaluation, et sur le développement de la quantification du dépôt d’aérosols. Nous avons enfin pu tester la reproductibilité de notre méthode d’évaluation du dépôt in vivo chez le rat, grâce à la réalisation d’une plateforme de ventilation et d’administration de gaz et d’aérosols dédiée, SAGAS. / Inhalation therapy has broadened its field of application over the last two decades by considering the lung not only as an organ to cure, but also as a portal toward systemic circulation. This new approach is being made possible by the emergence of biotherapeutics and a greater understanding of the absorption properties of the lung. Systemic delivery across the oronasal route was then investigated for a number of indications including migraine, diabetes, pain, and cancer. However, progress into the market of systemic aerosolized drug delivery has been slowed down to-date by a number of confounding factors including rapid clearance, instability, long-term toxicity, and dosing issues. Final drug distribution in such complex geometries strongly depends on a variety of parameters like the aerosol administration protocol, particle size, density, and physicochemical properties, as well as the airway geometry. Independently of drug formulation and pharmacokinetic considerations, these parameters determine the deposition distribution throughout the lung. Quantification and spatial localization are primordially needed to better control and optimize drug concentration at specific or less- and nonspecific sites. Nuclear medicine techniques are currently the only available modalities that combine both aerosol quantification and regional localization. They are considered as reference techniques even though they remain limited by their spatial and temporal resolutions as well as by patient exposure to radiations. With regard to lung imaging, hyperpolarized helium-3 MRI has been developed as a powerful tool to quantitatively characterize the parenchyma and the organ function and morphology. The technique is innocuous and provides millimeter and sub-second resolutions with rather high signal to noise ratios. In this thesis, a new imaging modality was developed on the grounds of hyperpolarized helium-3 MRI to probe and quantify aerosol deposition in the airways. In the first part of the thesis, I describe the potential of helium-3 MRI to probe aerosol deposition by using superparamagnetic contrast agents. The second part mainly focuses on the validation of this new modality by comparing it to a reference technique, single photon emission computed tomography (SPECT), and computational fluid dynamics. The last part of the manuscript is dedicated to aerosol administration and in vivo measurements in rat lungs. This experiment was possible by designing and building an MR compatible gas administrator and ventilator dedicated to small animals, SAGAS (Small Animal Gas Administration System). Its complete hardware and software description is presented in the same chapter.

O uso profilático dos antimicrobianos é frequente na produção animal para a prevenção de infecções entéricas ou respiratórias de origem bacteriana, contudo, pouco se conhece a respeito do impacto dessa administração. Assim, o presente estudo avaliou o uso profilático de ceftiofur em leitões neonatos sobre a ocorrência de infecções, o desempenho, a frequência de dias com escore fecal alterado e a quantificação de bactérias eliminadas nas fezes na maternidade e na creche. Foram utilizados 174 leitões recém-nascidos divididos em dois tratamentos: Ceftiofur (CEF, 5 mL/kg, n=89) e Controle (CTR, solução salina tamponada, n=85), ambos administrados no primeiro dia de vida e pela via de intramuscular. O delineamento foi em blocos, sendo considerados a ordem de parto e o peso dos leitões como bloco e os dados foram submetidos à análise de variância, empregando-se o programa SAS (2002). O nível de significância considerado foi de 5%. Na maternidade, os leitões tratados com ceftiofur não apresentaram redução na ocorrência de infecções e na eliminação de bactérias nas fezes, assim como não houve maior frequência de escore fecal alterado. Verificou-se um aumento gradativo na eliminação de bactérias até o 14º dia de vida com posterior declínio (P<,0001). Já para o desempenho, os leitões que receberam o ceftiofur apresentaram peso superior aos 21 dias de idade (P=0,0002) e o ganho de peso superior (P<,0001) em relação ao controle. Esta última característica também aumentou com o avançar da idade (P<,0001). Na creche, o tratamento ceftiofur não foi capaz de influenciar a ocorrência de infecções, bem como não interferiu no escore fecal (P>0,005), no desempenho (P>0,005) e na quantificação de bactérias eliminadas (P=0,6833). Conclui-se que a administração profilática de ceftiofur no primeiro dia de vida do leitão não reduziu a ocorrência de infecções, não reduziu a frequência de dias com escore fecal alterado e os leitões não eliminaram menor quantidade de bactérias nas fezes na maternidade e na creche, contudo os leitões apresentaram melhor desempenho durante o aleitamento, mas não na fase de creche / Prophylactic use of antimicrobials is a widespread practice in livestock production as a therapy for enteric or respiratory bacterial infections, however, little is known regarding the consequences of this management. Thus, the aim of the present study was to evaluate the prophylactic use of ceftiofur on the occurrence of infections, performance, frequency of days with altered fecal score as well as the quantification of bacteria excreted through feces of suckling and nursery piglets. For this purpose, 174 newborn piglets were assigned to two treatments as follows: Ceftiofur (CEF, 5 mL/kg, n=89) and Control (CTR, tamponed saline solution, n=85), both administered intramuscularly on the first day of life. The experimental design was in blocks; parturition order and piglet weight was considered as one block. Data were subjected to analysis of variance using the SAS software (2002). At the level of 5% of significance. During the suckling period, piglets treated with ceftiofur showed no reduction in the occurrence of infections and the excretion of bacteria through feces; also the frequency of altered fecal score was unchanged. There was a gradual increase in fecal bacterial excretion until the 14th day of life, declining after this period (P<.0001). Regarding piglet performance, the group treated with ceftiofur were heavier at 21 days (P=0.0002) and had higher average daily gain (ADG) (P<.0001) compared to control. Moreover, ADG traits also increased concomitantly with the age (P<.0001). In nursery piglets, treatment with ceftiofur had no influence on the occurrence of infections, fecal score (P>0.005), performance (P>0.005) and quantification of excreted fecal bacteria (P=0.6833). In conclusion, prophylactic use of ceftiofur on the first day of the piglets life was not able to reduce the occurrence of infections, had no influence in the frequency of days with altered fecal score and piglets did not excreted fewer bacteria in feces, however, piglets showed better performance during the suckling period, but not in the nursery period

O acirramento da competição entre as empresas produtoras de tratores agrícolas tem levado ao aumento da exportação de produtos e a consequente necessidade da manutenção dos níveis de qualidade destes produtos. Os custos relativos ao retrabalho em tratores exportados para os mercados externos é um dos problemas enfrentados pelas empresas manufatureiras de máquinas agrícolas. Dentre as principais causas geradoras de retrabalho estão os problemas gerados pelo manuseio destes tratores quando transportados de um país para outro. No caso das máquinas exportadas para o mercado norte-americano este problema se torna ainda mais oneroso, uma vez que os custos de mão-de-obra naquele mercado são bastante elevados. Tendo em vista reduzir a níveis mínimos os custos com retrabalho, o presente trabalho teve como objetivo analisar comparativamente duas propostas para o processo logístico de processamento de tratores nos portos norteamericanos. Desta forma decidiu-se comparar a proposta atual com uma proposta alternativa adotada pela indústria automobilística. Esta proposta envolve a utilização de VPC (vehicle processing center) que são centros de processamento de veículos com preparação completa das unidades para serem entregues às revendas. Desse modo a solução adotada pelo mercado automobilístico foi analisada para efeito de utilização na indústria de tratores através da consideração dos ganhos relativos à eliminação da perda de qualidade quando em comparação ao processo atual. De posse dos resultados desta análise foi concluído que a utilização da solução alternativa gera ganhos de qualidade, os quais foram quantificados em valores monetários. / The increasing competition among companies that produce agricultural tractors, has led to the increase in the export of products and the consequent need for maintenance of quality levels for these products Costs due to rework in exported tractors for foreign markets is one of the problems faced by agricultural machinery manufacturers. Problems generated by tractor handling when shipped from one country to another are among the main causes that produce rework. In the case of machines exported to the North American market the problem becomes even more costly, once labor costs are extremely high in that market. In order to reduce the cost of rework to a minimum level, this study had the target of analyzing comparatively two proposals for the logistic process of handling tractors at North American ports. Therefore, it was decided to compare the current proposal to an alternate proposal in use by the automobile industry. This solution involves the use of VPC (Vehicle Processing Center), with a complete preparation of units so as to be delivered to dealers. Therefore the solution adopted by the automobile industry was analyzed so as to be used by the tractor industry, by means of taking in consideration the gains related to the elimination of quality loss when compared to the current process in use. By use of the results it was inferred that the use of the alternative solution generates quality advantages, which were quantified in monetary values.

O Brasil se destaca na produção agrícola intensiva omitindo em diversas situações práticas conservacionistas acarretando a má estrutura do solo, que por sua vez, propicia a dispersão da argila quando submetida em meio líquido. A argila prontamente dispersa em água (APDA) é a que sofre pequena agitação e pode ser quantificada pelo método do turbidímetro por definir desde os mais elevados graus de turvação até os menores (10000:1) em solução. O uso da espectroscopia tem sido crescente como uma ferramenta eficaz na quantificação das propriedades do solo. Diante disso, objetivou-se comparar métodos de determinação da APDA pelo turbidímetro e pela espectroscopia nas regiões espectrais VisNIR-SWIR-MidIR (400-25000 nm). 68 amostras foram adquiridas do horizonte B de Latossolos e subsuperficial de Neossolos Quartzarênicos e apresentam ampla variabilidade textural, química e mineralógica pertencentes aos estados de Goiás, Mato Grosso do Sul e São Paulo, estas foram avaliadas química e fisicamente. A determinação da APDA ocorreu por turbidimetria e esta foi relacionada com a argila total (AT) quantificada nos comprimentos de onda VisNIR-SWIR (350-2500 nm) e MidIR (4000-400 cm-1) via espectroscopia. Através da determinação da APDA, modelos foram criados por análise de regressão múltipla e estes foram ajustados conforme o resultado da análise de variância enquanto que a AT foi quantificada através da regressão por mínimos quadrados parciais (PLSR) por meio da validação cruzada, a ACP e o PLSR foram pressupostos e os modelos foram escolhidos levando em consideração o coeficiente de determinação, erro quadrado médio e a previsão para intervalo interquartil. Ocorreu uma relação negativa entre as variáveis AT, Ca, K, Mg, C e Al com a APDA e uma relação positiva da CTC, P e m com a APDA. Ao serem transformadas para logaritmo as variáveis estiveram mais próximas da normalidade. Das 9 variáveis independentes testadas 5 foram significativamente correlacionadas com a APDA em até 95% (log(AT), log(Ca), log(CTC), log(Al) e log(P)), o modelo foi adquirido por exclusão das variáveis não significativas equivalente ao modelo gerado pelo stepwise. Houve correlação negativa entre a APDA e AT (R2=0,27). A curva espectral evidenciou elevadas discrepâncias na amplitude de reflectância e nas feições das curvas, em razão das diferenças físicas, químicas e mineralógicas dos diferentes solos estudados. Para a AT o desempenho do modelo mensurado na faixa espectral MidIR foi superior (R2 &ge; 0,6; RMSE &ge; 103; RPIQ &ge; 249). Para a APDA os modelos validados sofreram pequena variação (R2 &ge; 0,5; RMSE &ge; 3,5; RPIQ &ge; 10,2) sendo a região MidIR a melhor desempenhada. O turbidímetro mostrou-se ser um método eficaz sendo portanto recomendado para futuros trabalhos. O conteúdo de argila total dos solos estudados foi a variável mais explicativa da APDA. A espectroscopia de reflectância foi eficiente em estimar a APDA tanto quanto o turbidímetro. / Brazil stands out in the intensive agricultural production omitting in several situations conservationist practices causing poor soil structure, which in turn, propitiates the dispersion of the clay when submitted in a liquid environment. The readily-dispersible clay in water (APDA) is the one that undergoes slight agitation and can be quantified by the turbidimeter method to be defined from the highest turbidity to the lowest turbidity (10000: 1) in solution. The use of spectroscopy has been increasing as an effective tool in the quantification of soil properties. The aim of this study was to compare APDA methods by the turbidimeter and by spectroscopy in the VisNIR-SWIR-MidIR (400-25000 nm) spectral regions. 68 samples were obtained from the B horizon of Latosols and subsurface of Quartzarenic Neosols and present wide textural, chemical and mineralogical variability belonging to the states of Goiás, Mato Grosso do Sul and São Paulo, which were evaluated chemically and physically. The determination of APDA occurred by turbidimetry and this was related to the total clay (AT) quantified at the wavelengths VisNIR-SWIR (350-2500 nm) and MidIR (4000-400 cm-1) via spectroscopy. Through the determination of the APDA, models were created by multiple regression analysis and these were adjusted according to the result of the analysis of variance while the AT was quantified through the partial least squares regression (PLSR) through the cross validation, the ACP and The PLSR were assumptions and the models were chosen taking into account the coefficient of determination, mean square error and the forecast for interquartile range. There was a negative relationship between the variables AT, Ca, K, Mg, C and Al with APDA and a positive relation of CTC, P and m with APDA. When they were transformed to logarithm the variables were closer to normal. Of the 9 independent variables tested 5 were significantly correlated with APDA in up to 95% (log (AT), log (Ca), log (CTC), log (Al) and log (P)), the model was acquired by excluding the Non-significant variables equivalent to the model generated by stepwise. There was a negative correlation between APDA and AT (R2 = 0.27). The spectral curve showed high discrepancies in reflectance amplitude and curves, due to the physical, chemical and mineralogical differences of the studied soils. For AT, the performance of the model measured in the MidIR spectral range was higher (R2&gt; 0.6, RMSE&gt; 103, RPIQ&gt; 249). For the APDA, the validated models suffered a small variation (R2&gt; 0.5, RMSE&gt; 3.5, RPIQ&gt; 10.2), with the MidIR region being the best performed. The turbidimeter proved to be an effective method and is therefore recommended for future work. The total clay content of the studied soils was the most explanatory variable of APDA. Reflectance spectroscopy was efficient in estimating APDA as much as the turbidimeter.

Made available in DSpace on 2015-04-22T22:01:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Magno Perea Muniz.pdf: 3877083 bytes, checksum: a620a7990787a4877c1b18ca0f4428ae (MD5) Previous issue date: 2013-03-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The species Endopleura uchi, Humiriaceae family, native to the Amazon, is commonly known as uxi-amarelo or uxi-liso. The tea from its bark is popularly referred to uterine inflammation, urinary, and extremely effective in treating specific fibroids and polycystic ovary. Based on information collected about the popular use of this species in the region of Manaus, the study was conducted to obtain the phytochemical investigation of Endopleura uchi which led to the isolation of friedelin, a pentacyclic triterpene, and also bergenin, a gallic acid derivative, known to have various biological activities and is the main component in the species. In the present study were quantified bergenin in different extracts of different parts of the plant and also in commercial bark Endopleura uchi. The result showed a higher percentage of Bergenin in methanol extracts of bark (CEM-1 = 4.17% and CEM-2 = 4.75%) followed by extracts of leaves and in lower concentrations in aqueous extracts of twigs (GEA-1 = 1.95% and GEA-2 = 1.89%), bergenin as indicating the major component Endopleura uchi and that may be related to biological activities popularly given to the species. All samples analyzed showed the presence of bergenin with percentages ranging from 0.20% to 3.57%, confirming the authenticity of the plant material. Was also performed quantification of total phenolics by Folin-Ciocalteu, which revealed high levels of phenolic compounds from 16.69 to 43.02 mg GAE/g dry extract. This evaluation of the antioxidant activity by reducing iron ranged from 230.43 to 567.89 mmol Fe+2/g of dry extract and the scavenge of radical DPPH ranged from CS50 = 12.04 to 24.20 g/ml. The test for evaluation of antiulcer activity of the fractions ethyl acetate and chloroform leaves showed preventive effects of ulcerations as much as the positive control. The anti-inflammatory assay of aqueous extracts and fractions of Endopleura uchi by inhibition of nitric oxide (NO ) showed significant inhibition capacity, the best result being attributed to chloroform fraction of the leaves with IC50 = 3.2 g/mL. The results obtained from the leaves, twigs and bark species Endopleura uchi with great therapeutic value by the presence of antioxidant compounds and their ability anti-inflammatory and antiulcer, enabling the use of this popular safer plant species and the possible contribution to the development of herbal products or news drugs. / A espécie Endopleura uchi, da família Humiriaceae, nativa da Amazônia, é conhecida comumente como uxi-amarelo ou uxi-liso. O chá de suas cascas é popularmente indicado para inflamação uterina, urinária, e extremamente eficaz no tratamento específico de miomas e ovário policístico. Com base nas informações coletadas sobre o uso popular dessa espécie na região de Manaus, foi desenvolvida a investigação fitoquímica de Endopleura uchi que levou ao isolamento da friedelina, um triterpeno pentacíclico, e também da bergenina, um derivado do ácido gálico, conhecido por apresentar diversas atividades biológicas e por ser o principal componente na espécie. No presente estudo foi realizado a quantificação de bergenina em diferentes extratos de partes distintas da planta e também em amostras de cascas comerciais de Endopleura uchi. Os resultados dos extratos mostraram maior porcentagem de bergenina nos extratos metanólicos das cascas (CEM-1 = 4,17 % e CEM-2 = 4,75 %) seguido dos extratos das folhas e em menor quantidade nos extratos aquosos dos galhos (GEA-1 = 1,95 % e GEA-2 = 1,89%), indicando a bergenina como componente majoritário de Endopleura uchi e que pode estar relacionada às atividades biológicas indicadas popularmente para a espécie. Todas as amostras comerciais analisadas indicaram a presença de bergenina com porcentagens que variaram entre 0,20 % a 3,57 %, confirmando a autenticidade do material vegetal. Foi realizado a quantificação de fenólicos totais nos extratos pelo método de Folin Ciocalteu, que revelou altos teores de compostos fenólicos entre 16,69 43,02 mg EAG/g de extrato seco. A avalição da atividade antioxidante dos extratos pela redução de ferro variou de 230,43 a 567,89 mmol Fe+2/g de extrato seco e pelo sequestro de radicais de DPPH variou entre CS50 = 12,04 a 24,20 g/mL. O ensaio para avaliação da atividade antiúlcera das frações acetato de etila e clorofórmica das folhas evidenciaram efeitos preventivos das ulcerações tanto quanto o controle positivo. O ensaio anti-inflamatório dos extratos aquosos e frações de Endopleura uchi pela inibição de óxido nítrico (NO) apresentaram capacidade de inibição significantes, sendo o melhor resultado atribuído à fração clorofórmica das folhas com IC50 = 3,2 g/mL. Os resultados obtidos das folhas, galhos e cascas revelam a espécie Endopleura uchi com amplo valor terapêutico pela presença de compostos antioxidantes e por sua capacidade anti-inflamatória e antiúlcera, possibilitando o uso popular mais seguro dessa espécie vegetal e para a contribuição do desenvolvimento de possíveis produtos fitoterápicos ou até de novos fármacos.

Esta dissertação apresenta uma análise semântica, no paradigma da Semântica Formal, da (i) restrição de domínio no DP e da (ii) expressão kar, que veicula a ideia de totalidade, no dialeto paranaense da língua Kaingang, do tronco Macro-Jê, família Jê, falada nas regiões sul e sudeste do Brasil. Num primeiro momento, o artigo definido parece ter, no Kaingang Paranaense, uma distribuição não trivial: aplica-se primeiro a um determinante quantificacional e restringe, via essa combinação, o domínio do quantificador, tal como no Basco, Grego e Státimcets (Giannakidou 2003, Etxeberria 2005 e Etxeberria & Giannakidou 2009), línguas muito parecidas com o Kaingang no domínio nominal. Alguns dados, contudo, apontaram a análise em outra direção. Entendemos que certos padrões de comportamento semântico e sintático apresentado por kar nas sentenças, tal como sua neutralidade quanto à propriedade de distributividade e a possibilidade da conjunção de duas sequências de [NP+kar] sob um mesmo artigo definido (ao contrário do Basco, no qual a mesma estrutura é agramatical, sugerindo que os quantificadores universais em Basco criam um QP), são algumas das evidências que, no conjunto, dão suporte para a hipótese, defendida nesta dissertação, de que kar, no Kaingang Paranaense, parece ser um modificador - à la Lasersohn (1999) -, não tendo, por isso, uma força quantificacional própria. A função semântica de kar seria de controlar o quanto de desvio da verdade é pragmaticamente permissível. Como consequência desta análise, no Kaingang Paranaense o artigo definido não operaria sobre um determinante quantificacional, mas sim sobre um NP. O que aponta no sentido de que os artigos definidos ag/fag (os/as) no Kaingang Paranaense, em contextos em que eles co-ocorrem com kar, não perderiam a sua função max, i.e., de formadores de indivíduo a partir de um conjunto, para funcionar meramente como um operador preservador de tipo e restritor de domínio adjungido ao determinante quantificacional, como proposto por Giannakidou 2003, Etxeberria (2005) e Etxeberria & Giannakidou (2009) para o Basco e o Grego. Ag/fag continuariam sendo artigos definidos clássicos ocupando o núcleo de uma projeção DP e kar um modificador. Também discutimos brevemente algumas das vantagens e problemas de se tentar estender esta análise para o Basco, Grego e Státimcets. E, por último, investigamos o comportamento de kar na sentença, as possíveis leituras quando da sua interação com indefinidos, numerais, tipos de predicados e o operador distributivo introduzido via reduplicação verbal. Com base nos dados, nossa proposta é de que - em função de a leitura distributiva, na maioria dos exemplos, ser permitida pelos informantes somente quando houve reduplicação verbal - kar é neutro quanto à propriedade da distributividade e que o operador distributivo introduzido por reduplicação verbal tem escopo sobre todo o VP. / This dissertation presents, in the paradigm of formal semantics, a semantic analysis of both (i) the phenomenon of domain restriction in the DP and (ii) the expression kar, which conveys the idea of totality, in a dialect of the Kaingang language, a Brazilian language from the Macro-Jê Stock, Jê family, spoken in southern and southeastern Brazil. Although, at first, the definite article in Kaingang seems to have a non-trivial distribution: it applies first to a quantificational expression, and via such combination restricts the domain of quantifier, such as in Basque, Greek and Státimcets (Giannakidou 2003, Etxeberria 2005 and Etxeberria & Giannakidou 2009), some data pointed the analysis in another direction. Patterns of semantic and syntactic bevavior presented by kar in some sentences, such as its neutralite regarding the property of distributivity and the possibility of conjoining two [NP + kar] sequences under the same definite article (unlike Basque, which does not allow such structure, suggesting that in Basque the universal quantifier creats a QP), seem to be as a whole evidences for the hypothesis, advocated in this thesis, that the expression kar may be a modifier - à la Lasersohn (1999) - and as such would not have a quantificational force of its own. The semantic function of kar would be to control how much deviation from the truth conditions of the sentences is pragmatically allowed. As a result of this analysis, the definite articles ag/fag in Kaingang do not operate on a quantificational expression, as in Basque and Greek, but on the NP. Such fact suggests that the definite articles in Kaingang, in contexts they co-occur with kar, do not lose their max function in order to work merely as a type preserver and a domain restrictor combined with a quantificational expression, as proposed by Giannakidou 2003, Etxeberria (2005) e Etxeberria & Giannakidou (2009) for Basque and Greek. Ag/fag would still be a classical definite article occupying the head of a DP projection and kar a modifier, instead of a universal quantifier. We also discuss briefly some of the advantages and problems of trying to extend this analysis to the Basque, Greek and Státimcets languages. And lastly, we investigated the behavior of kar in the sentence, its interaction with indefinites, numerals, types of predicates and the distributive operator introduced via verbal reduplication. Based on such data, once distributive readings were permitted by the informants only via verbal reduplication, our proposal is that kar is neutral regarding the property of distributivity and that the distributive operator introduced via verbal reduplication has scope over the VP.