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Uso de modelos de regressão aleatória na análise de dados longitudinais no melhoramento genético vegetal / Use of random regression models in longitudinal analysis data in genetic plant breedingAraújo, Simone Inoe 20 May 2005 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-05T18:48:36Z
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Previous issue date: 2005-05-20 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Os objetivos deste estudo foram analisar, via simulação de dados, o efeito de diferentes pressuposições quanto à variância dos efeitos ambientais, frente a dados com determinada estrutura de variâncias, e verificar o comportamento de diferentes estratégias de análise frente ao desbalanceamento dos dados. Foram simulados dados referentes a um teste de progênie, do cruzamento de 30 progenitores masculinos com três genitores femininos diferentes cada um, onde cada cruzamento deu origem a dez indivíduos, distribuídos em três locais diferentes. O efeito fixo de local foi gerado de forma a não apresentar diferenças estatísticas significativas. Para cada indivíduo da prole foram geradas informações fenotípicas em cinco idades diferentes. Portanto, o arquivo de dados consistiu de 1020 indivíduos no total, sendo que 900 indivíduos apresentaram registros nas cinco idades, totalizando 4500 registros de produção. Para estudar o efeito da heterogeneidade das variâncias ambientais, em modelos de regressão aleatória adotou-se, modelos que ajustaram uma função polinomial de segundo grau para o efeito genético aditivo e de ambiente permanente e que ajustaram uma função polinomial apenas para o efeito genético aditivo foram analisados, considerando-se ou não a heterogeneidade da variância do efeito de ambiente temporário, gerando-se assim, quatro diferentes modelos de regressão aleatória. Além disso, os modelos de regressão aleatória, repetibilidade e multi-característica foram avaliados sob diferentes níveis de desbalanceamento dos dados. O modelo de regressão aleatória mais adequado foi aquele que considerou a heterogeneidade de variâncias dos efeitos de ambiente permanente e temporário. Assumir pressuposições incorretas sobre a estrutura de covariância dos efeitos aleatórios do modelo conduziu à alterações nas estimativas de componentes de covariância e nas estimativas dos parâmetros genéticos. Sob desbalanceamento sem seleção, todos os modelos apresentaram estimativas de herdabilidade bastante semelhantes aos resultados obtidos quando se considerou o conjunto de dados completos. Entretanto, quando se considerou o efeito da seleção, modelos de regressão aleatória com até 10% de desbalanceamento não promoveram alterações nas estimativas de componentes de variância. / The aim of this study was to analyze the effect of assuming different assumptions about environmental variance effects to data with certain variance structure, and verify genetic parameters estimates in different analysis strategies behind unbalanced data. A progeny test data was simulated, by crossing 30 male with three different female, where each crossing originated ten individuals, distributed in three different places. The fixed effect of place was generated in order not to present significant statistical difference. For each individual offspring, phenotypic information were generated in five different ages. Then, the data consisted in a total of 1020 individuals, in what 900 of them presented information in the five ages, computing 4500 observations of production. To verify the importance of consider or not the environmental heterogeneity of variance, in random regression models, models that adjusted a second polynomial function both for the additive genetic as for the permanent environmental effect and adjusted a polynomial function only for the additive genetic effect were analyzed, considering or not the variance heterogeneity of the temporary environmental effect, then generating four different random regression models. Moreover, the single-trait random regression model, the repeatability model and the multiple-trait model were analyzed on different lost of information levels. The most adequate random regression model was the one who considered both, the variance heterogeneity of permanent environmental effect, and the temporary environmental effect. Assuming the incorrect assumptions about the covariance structure of random effects of the model, conducted to change in the covariance components estimates and in the genetic ixparameters estimates. With incomplete data, without selection, all the models presented heritability estimates very similar to the results when complete data were considered. However, when effect of selection was considered, random regression models with less or equal to 10% of lost of information didn’t conduct to change in the covariance components estimates.
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Modelagem e previsão de volatilidade realizada: evidências para o BrasilWink Junior, Marcos Vinício 08 April 2011 (has links)
Submitted by Cristiane Shirayama (cristiane.shirayama@fgv.br) on 2011-05-30T17:33:11Z
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Previous issue date: 2011-04-08 / Usando dados intradiários dos ativos mais negociados do Bovespa, este trabalho considerou dois modelos recentemente desenvolvidos na literatura de estimação e previsão de volatilidade realizada. São eles; Heterogeneous Autorregresive Model of Realized Volatility (HAR-RV), desenvolvido por Corsi (2009)e o Mixed Data Sampling (MIDAS-RV) desenvolvido por Ghysels et. al (2004). Através de medidas de comparação de previsão dentro e fora da amostra, constatou-se resultados superiores do modelo MIDAS-RV apenas para previsões dentro da amostra. Para previsões fora da amostra, no entanto, não houve diferença estatisticamente significativa entre os modelos. Também encontram-se evidências que a utilização da volatilidade realizada induz distribuições dos retornos padronizados mais próximas da normal.
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Volatility Triggered Range Forward (VTRF): an instrument for protection against volatility fluctuations in the BRL/USD pairBovo, Vitor Juliano 05 August 2011 (has links)
Submitted by Vitor Bovo (vitorbovo@hotmail.com) on 2011-08-26T00:07:04Z
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Previous issue date: 2011-08-05 / Este trabalho propõe um instrumento capaz de absorver choques no par BRL/USD, garantindo ao seu detentor a possibilidade de realizar a conversão entre essas moedas a uma taxa observada recentemente. O Volatility Triggered Range Forward assemelha-se a um instrumento forward comum, cujo preço de entrega não é conhecido inicialmente, mas definido no momento em que um nível de volatilidade pré-determinado for atingido na cotação das moedas ao longo da vida do instrumento. Seu cronograma de ajustes pode ser definido para um número qualquer de períodos. Seu apreçamento e controle de riscos é baseado em uma árvore trinomial ponderada entre dois possíveis regimes de volatilidade. Esses regimes são determinados após um estudo na série BRL/USD no período entre 2003 e 2009, baseado em um modelo Switching Autoregressive Conditional Heteroskedasticity (SWARCH). / This work proposes an instrument able to absorb shocks in the BRL/USD rate, ensuring its holder the capability of doing foreign currency exchange at some immediate prevailing rate. The Volatility Triggered Range Forward resembles a plain-vanilla forward whose delivery price is unknown initially and will be set once a pre-determined level of volatility threshold is reached in the exchange rate along the instrument’s life. Its payoff schedule can be set for any number of periods. Pricing and risk management is based on a trinomial lattice weighted between two possible regimes of volatility. These regimes are determined after a study of the BRL/USD series for the period between 2003 and 2009, based on a Switching Autoregressive Conditional Heteroskedasticity (SWARCH) model.
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Avaliação da associação entre expressão da proteína “Kinetoplastid Membrane Protein-11” (KMP-11) e virulência de Leishmania amazonensisSantos, Elisangela Madureira dos January 2011 (has links)
Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2012-07-26T17:19:21Z
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Previous issue date: 2011 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / As leishmanioses formam um grupo de doenças que afetam 350 milhões de pessoas
atualmente, atingindo 88 países em todo o mundo com uma estimativa de 1-2 milhões de
novos casos por ano. O desfecho da infecção causada por Leishmania depende tanto de
fatores do patógeno como do hospedeiro, embora a virulência de Leishmania possa ser
modulada por fatores ambientais e genéticos relacionados aos hospedeiros mamíferos e
vetores, os determinantes moleculares são elementos-chave no estabelecimento da infecção,
ou seja, são os fatores que determinam a virulência. A KMP-11 é uma glicoproteína que está
presente em todos os cinetoplastideos. O presente estudo avaliou a expressão do gene de
KMP-11 de L. amazonensis ao nível de RNA e ao nível de proteína, durante passagens
sucessivas de promastigotas de fase estacionária através de cultivo in vitro, investigando se há
associação entre a sua expressão e a virulência dos parasitos. A avaliação da virulência dos
parasitos mantidos em cultura foi realizada através do acompanhamento da evolução da
infecção experimental murina (modelo in vivo) durante um período de dez semanas,
juntamente com a observação do surgimento de ulceração. A quantificação da carga
parasitária foi realizada nos linfonodos drenantes das lesões, através da através da técnica de
diluição limitante A avaliação também foi realizada pela infecção de macrófagos murinos
(modelo in vitro). Os resultados de medição de pata foram analisados pelo teste não
paramétrico ANOVA 2 fatores, seguido do pós-teste de Bonferroni. Além disso, foi realizada
a determinação da proporção de metacíclicas nos promastigotas de fase estacionária mantidos
em cultura, através da técnica de lise pelo complemento. Nossos resultados mostraram que há
um decréscimo da virulência dos promastigotas de fase estacionária ao longo do número de
passagens, pois os camundongos infectados com as passagens iniciais desenvolveram lesões
maiores do que aqueles com os promastigotas mantidos em cultura por mais tempo. Quanto
ao surgimento de ulcerações, na 10a semana pós-infecção, todos os animais infectados com
promastigotas de 1a passagem apresentavam lesões ulceradas, enquanto que nenhum dos
camundongos infectados com promastigotas de 20a passagem apresentava lesão ulcerada. Na
infecção in vitro, a carga parasitária nos macrófagos testados diminuiu em função do número
das subculturas, o que foi demonstrado através do decréscimo da porcentagem média de
macrófagos infectados e pela quantidade média de amastigotas a cada 100 macrófagos
infectados. A quantificação da carga parasitária foi realizada nos linfonodos drenantes da
lesão dos camundongos infectados, confirmando a diminuição da virulência dos
promastigotas. A quantificação da proporção de promastigotas metacíclicas demonstrou que a
porcentagem diminui ao longo do tempo de subcultivo. A avaliação da expressão de KMP-11
na superfície de promastigotas por citometria de fluxo demonstrou um decréscimo na
expressão da proteína proporcional ao número de subculturas. Verificou-se, portanto, uma
associação entre a expressão da proteína KMP-11 e a virulência de promastigotas de L.
amazonensis. Os resultados dos ensaios de PCR em tempo real demonstraram que não há
diferença estatisticamente significativa na quantidade de transcritos do gene da proteína
KMP-11 entre as passagens analisadas. Entretanto, a perda da virulência associada com a
diminuição da expressão da proteína KMP-11 indica que esta molécula possua uma função na
infectividade dos promastigotas de Leishmania amazonensis, atuando possivelmente como
um fator de virulência. / The leishmaniases are a group of diseases that currently, affects 350 million people reaching
88 countries throughout world with an estimated incidence of 1-2 million new cases per year.
The outcome of the infection caused by Leishmania depends on factors from the pathogen and
from the host. Although Leishmania virulence can be modulated by environmental and
genetic factors related to mammalian hosts and vectors, molecular determinants are key
elements in the establishment of infection and for the determination, of virulence. KMP-11 is
a glycoprotein which is present in all kinetoplastids. This study evaluated the gene expression
of KMP-11 in L. amazonensis at RNA level and at protein level, during successive passages
of in vitro culture, investigating a possible correlation between KMP-11 expression and
virulence of parasites. The evaluation of the virulence of cultured parasites was performed by
monitoring of the progression of the lesions in experimental murine infection (in vivo model)
during ten weeks, along with the emergence of cutaneous ulcers. The quantification of
parasite load was performed on draining lymph nodes using the limiting dilution analysis. The
assessment of parasite virulence was also performed by the infection of murine macrophages
(in vitro model). The paw measurement results were analyzed by nonparametric test ANOVA
2 way, followed by Bonferroni post-test. Furthermore, the metacyclic promastigotes
proportion in stationary growth phase from cultures with different numbers of passages was
evaluated by complement lysis. Our results showed a decrease in promastigotes of stationary
phase virulence that correlated with the increase of the number of passages, as mice infected
with the early passages developed larger lesions than those infected with promastigotes
cultured for longer periods and higher numbers of passages. Concerning the development of
ulcers, at 10th week post-infection, all animals infected with promastigotes of first passage
presented ulcerated lesions, whereas none of the mice infected mice with promastigotes of the
20th passage showed an ulcerated lesion. Analyzing the in vitro infection, the parasite burden
in macrophages decreased with the number of subcultures, as demonstrated by the decrease in
the percentage of infected macrophages and in the number of amastigotes per 100 infected
macrophages. The quantification of parasites in draining lymph nodes of the infected mice
confirmed the decrease in the virulence of promastigotes from cultures with more passages.
The estimation of the metacyclic promastigote proportions showed that the percentages
decline through the time of subculture. The evaluation of KMP-11 expression on the surface
of promastigotes by flow cytometry showed a decrease in protein expression proportional to the number of subcultures. Therefore, there was an association between the expression of KMP-11 protein and the virulence of L. amazonensis promastigotes. The results of real-time
PCR assays showed that there is no statistically significant difference in the amount of gene
transcripts of KMP-11 protein in the analyzed passages. However, the loss of virulence
associated with decreased protein expression of KMP-11 indicates that this molecule may
have a role in promastigotes infectivity of Leishmania amazonensis, possibly acting as a
virulence factor.
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PODER ESTATÍSTICO E COEFICIENTE DE VARIAÇÃO EM EXPERIMENTOS COM BOVINOS DE CORTE / STATISTICAL POWER AND COEFFICIENT OF VARIATION IN BEEF CATTLE EXPERIMENTSVaz, Marcos André Braz 29 February 2016 (has links)
This study was conducted to estimate power of tests in Analysis of Variance (ANOVA) in beef cattle experiments, determine sample size and classify the coefficient of variation. Data was collected from thesis and dissertations of the Program of Post-Graduation in Animal Science of Federal University of Santa Maria (PPGZ-UFSM) among the years of 1991 to 2012, in beef cattle production area using ANOVA. Power was estimated by assumption of non central F distribution to the alternative hypothesis in ANOVA. The number of replications for treatments was estimated by power of 80% and interval of [0,4 ; 2,0] to effect size. Classification of coefficient of variation was based on proposed by Garcia (1989) using mean and standard deviation, and Costa et al. (2002) using median and pseudo-sigma. Power of tests shows two frequency peaks of experiments with low and high power. The recommended average number of replication per treatments was among 7 and 10 replications. Classification of coefficient of variation was proposed by low, medium and high, differently from literature that considers the intervals low, medium, high and very high. / Este estudo foi realizado com o objetivo de determinar o poder do teste F em Análise de Variância (ANOVA) para experimentos com bovinos de corte, determinar o tamanho ideal de amostra e classificar o coeficiente de variação. Os dados foram utilizados de dissertações e teses publicadas do Programa de Pós-Graduação em Zootecnia da Universidade Federal de Santa Maria (PPGZ-UFSM) nos anos de 1991 à 2012, na área de bovinocultura de corte empregando ANOVA. O poder do teste foi determinado assumindo distribuição F de Fisher não central sob hipótese alternativa para a estatística de teste F na ANOVA. O número de repetições por tratamentos foi estimado com base no poder do teste de 80% e o intervalo [0,4 ; 2,0] para o tamanho do efeito. A classificação do coeficiente de variação foi baseada nas metodologias propostas por Garcia (1989) usando média e desvio padrão, e Costa et al. (2002) utilizando mediana e pseudo-sigma. As estimações de poder do teste apresentaram picos de frequências de alto e baixo poder. O número médio recomendado de repetições por tratamentos oscilou entre 7 e 10 repetições. Foi proposta a classificação do coeficiente de variação em baixo, médio e alto, diferindo da classificação da literatura que considera os intervalos baixo, médio, alto e muito alto.
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Análise dialélica das capacidades geral e específica de combinação utilizando técnicas uni e multivariadas de divergência genética em mamoneira (Ricinus communis L.)Costa, Mauro Nóbrega da 23 February 2006 (has links)
Submitted by Katiane Souza (katyane.souza@gmail.com) on 2016-04-21T21:19:52Z
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Previous issue date: 2006-02-23 / Techniques of dialell crossings and genetic divergence with application of canonical
variables and principal components have been applied with the objective of evaluating six
castor bean genotypes behaviorconsidering the variables days to flowering (FR), number of
racemes per plant (NRP), effective length of the primary raceme (CR), plant height (AP),
potential yield (PP) and oil content (TO), when choosing promising parents in breeding
programs through hybridizations. Griffing’s scheme of diallel crossings (1956) was used
when evaluating combining capacities. A randomized complete blocks design with four
replications was used and the trial was set at irrigation condition, at Embrapa-Algodão
Experimental Station – CNP, placed in the municipal district of Barbalha-CE.
Variable AP presented significance only for the effect of the general capacity of
combination (CGC), while PP showed significance only for specific capacity of combination
(CEC). Both CGC and CEC effects were significant for the other variables. However, the
quadratic components indicated predominance of non-additive genic effects for all of the
variables.
Parent BRA 4871 (1), BRS Paraguaçu (2) and BRS Nordestina (5) had been
distinguished as good general combiners for FR; BRS Nordestina (5), for NRP; BRA 2968
(4), BRA 5550 (6) and BRS Nordestina (5) for CR. For the variable plant height, the best
general combinadores were: BRA 4871 (1), BRS Paraguaçu (2) and BRA 7722 Papo-de-gia
(3). BRS Nordestina (5) and BRA 5550 (6) were pointed as good combinadores for PP, while
BRS Nordestina was configured as a good combiner for TO. Those genotypes involvement in
improvement programs in order to obtain new varieties starting from advanced selection
generations can be promising.
In a multivariate context, two principal components and two canonical variables were
enough to explain 78% and 82% of the total variance, respectively. The first principal
component (CP1) presented positive relationship with the variables NRP, AP and PP, while
the second component (CP2) presented positive relationship with FR and CR. The first
canonical variable (VC 1) turned out to be positively related to FR and CR and, on the other
hand, negatively related to NRP and PP. Instead, for the second canonical variable (VC2), a
contrast was verified among positive values for CR, PP and TO and negative values for AP.
There was an indication of genetic divergence among parents with larger
discrimination observed by the principal compounds technique. Nevertheless, low correlations
had been detected between genetic distance of parents and heterosis for both techniques.
Parent BRA 5550 (6) presented the largest positive estimate of CGC for CP1 and the best
hybrid combinations for CEC were BRA 4871 x BRA 5550 (1x4) and BRA 2968 x BRS
Nordestina (4x5). Like CP2, BRS Nordestina (5) was pointed as a good general combiner,
while the best combinations when it comes to CEC were BRA 4871 x BRA 2968 (1x4) BRS
Paraguaçu x BRA 2968 (2x4), BRA 7722 Papo-de-gia x BRA 2968 (3x4) and BRA 7722
Papo-de-gia x BRS Nordestina (3x5), with favorable contribution to (CR), while BRA 4871 x
BRA 7722 Papo-de-gia (1x3), BRS Paraguaçu x BRA 7722 Papo-de-gia (2x3) and BRS
Paraguaçu x BRS Nordestina (2x5) were pointed as favorable to FR.
Parents BRS Paraguaçu (2), BRS Nordestina (5) and BRA 4871 (1) presented good
general capacity of combination for VC1, while BRS Nordestina (5) was the only favorable
parent for VC2, because they contribute with genes to a larger effective length of the primary
raceme, yield potential and oil content, plus genes for plant high reduction.
BRA 4871 x BRA 7722 Papo-de-gia (1x3), BRA 4871 x BRA 5550 (1x6), BRS
Paraguaçu x BRA 7722 Papo-de-gia (2x3), BRS Paraguaçu x BRS Nordestina (2x5) and BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5) presented a better behavior about CEC for VC1. BRS
Paraguaçu x BRA 2968 (2x4) and BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5) were the best
combinations for VC2.
Hybrid BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5) represents the best exploration perspective
in breeding because of its favorable medium performance for all of the features and a better
heterosis behavior about VC2.
Hybrid combinations BRA 4871 x BRA 7722 Papo-de-gia (1x3), BRA 4871 x BRA
5550 (1x6), BRS Paraguaçu x BRA 7722 Papo-de-gia (2x3), BRS Paraguaçu x BRA 2968
(2x4), BRS Paraguaçu x BRS Nordestina (2x5) and BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5) could
be used in order to create a new basis-population, starting from intercrossings among them,
both for exploration through intrapopulation selection appealing and for the extraction of
lineages destined to the synthesis of hybrids able to gather precocity, larger number of
racemes per plant, lower plants height, higher yield potential and larger oil content. / Técnicas de cruzamentos dialélicos e divergência genética com aplicação de variáveis
canônicas e componentes principais foram aplicadas com o objetivo de avaliar seis genótipos
de mamona quanto às variáveis início do florescimento (FR), número de racemos por planta
(NRP), comprimento efetivo do racemo primário (CR), altura da planta (AP), potencial
produtivo (PP) e teor de óleo (TO) na escolha de parentais promissores para programas de
melhoramento por hibridações. Na avaliação das capacidades combinatórias, utilizou-se o
esquema de cruzamentos dialélicos de Griffing (1956). O delineamento estatístico utilizado
foi o de blocos casualizados com quatro repetições, e o experimento conduzido em condição
de irrigação, na Estação Experimental da Embrapa - Algodão – CNPA, localizada no
município de Barbalha-CE.
A variável AP apresentou significância apenas para o efeito da capacidade geral de
combinação (CGC), enquanto PP mostrou significância apenas para capacidade específica de
combinação (CEC). Tanto os efeitos de CGC como de CEC foram significativos para as
demais variáveis. No entanto, os componentes quadráticos indicaram predominância dos
efeitos gênicos não-aditivos para todas as variáveis.
Os parentais BRA 4871 (1), BRS Paraguaçu (2) e BRS Nordestina (5) destacaram-se
como bons combinadores gerais para FR; BRS Nordestina (5), para NRP; BRA 2968 (4),
BRA 5550 (6) e BRS Nordestina (5) para CR. Para a variável altura da planta, os melhores
combinadores gerais foram: BRA 4871 (1), BRS Paraguaçu (2) e BRA 7722 Papo-de-gia (3).
BRS Nordestina (5) e BRA 5550 (6) mostraram-se como bons combinadores para PP,
enquanto BRS Nordestina configurou-se como bom combinador para TO. O envolvimento
desses genótipos em programas de melhoramento para a obtenção de novas variedades a partir
de gerações avançadas de seleção pode ser promissor. No contexto multivariado, dois componentes principais e duas variáveis canônicas foram suficientes para explicar 78% e 82% da variância total, respectivamente. O primeiro componente principal (CP1) apresentou relação positiva com as variáveis NRP, AP e PP, enquanto que o segundo componente (CP2), apresentou relação positiva com FR e CR. A
primeira variável canônica (VC 1) mostrou-se, de um lado, relacionada positivamente a FR e
CR e, de outro, negativamente com NRP e PP. Já para a segunda variável canônica (VC2),
verificou-se um contraste entre valores positivos para CR, PP e TO e valor negativo, para AP.
Houve indicação de divergência genética entre parentais com maior discriminação
observada pela técnica de componentes principais. Contudo, correlações baixas foram
detectadas entre distância genética dos parentais e heterose, para as duas técnicas. O parental
BRA 5550 (6) apresentou a maior estimativa positiva de CGC para CP1, sendo BRA 4871 x
BRA 5550 (1x4) e BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5) as melhores combinações híbridas
quanto à CEC. Quanto a CP2, BRS Nordestina (5) apresentou-se como bom combinador
geral, enquanto as melhores combinações em relação à CEC foram: BRA 4871 x BRA 2968
(1x4) BRS Paraguaçu x BRA 2968 (2x4), BRA 7722 Papo-de-gia x BRA 2968 (3x4) e BRA
7722 Papo-de-gia x BRS Nordestina (3x5), com contribuição favorável à (CR), enquanto
BRA 4871 x BRA 7722 Papo-de-gia (1x3), BRS Paraguaçu x BRA 7722 Papo-de-gia (2x3) e
BRS Paraguaçu x BRS Nordestina (2x5) mostraram-se favoráveis à FR.
Os parentais BRS Paraguaçu (2), BRS Nordestina (5) e BRA 4871 (1) apresentaram
boa capacidade geral de combinação para VC1, ao passo que para VC2, BRS Nordestina (5)
foi o único parental favorável, uma vez que contribui com genes para maior comprimento
efetivo do racemo primário, potencial produtivo e teor de óleo e genes para redução do porte
da planta. BRA 4871 x BRA 7722 Papo-de-gia (1x3), BRA 4871 x BRA 5550 (1x6), BRS
Paraguaçu x BRA 7722 Papo-de-gia (2x3), BRS Paraguaçu x BRS Nordestina (2x5) e BRA
2968 x BRS Nordestina (4x5) apresentaram melhor comportamento quanto a CEC para VC 1.
Quanto a VC2, BRS Paraguaçu x BRA 2968 (2x4) e BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5)
foram as melhores combinações.
O híbrido BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5) representa a melhor perspectiva de
exploração no melhoramento pelo seu desempenho médio favorável para todas as
características e melhor comportamento heterótico quanto a VC2.
As combinações híbridas BRA 4871 x BRA 7722 Papo-de-gia (1x3), BRA 4871 x
BRA 5550 (1x6), BRS Paraguaçu x BRA 7722 Papo-de-gia (2x3), BRS Paraguaçu x BRA
2968 (2x4), BRS Paraguaçu x BRS Nordestina (2x5) e BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5)
poderiam ser utilizadas na formação de uma população-base a partir de intercruzamentos
entre elas, seja para exploração através da seleção recorrente intrapopulacional, seja para a
extração de linhagens destinadas à síntese de híbridos que reúnam precocidade, maior número
de racemos por planta, menor altura de plantas, maior potencial produtivo e maior teor de
óleo.
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Estudo de delineamentos experimentais no esquema fatorial duplo com um tratamento adicional / Study of experimental design in two-way factorial with an additional treatmentMarcos André Braz Vaz 28 January 2013 (has links)
O presente trabalho teve como objetivo o estudo de experimentos em delineamentos em esquema fatorial duplo com tratamento adicional do tipo testemunha. Para este esquema usa-se a notação A x B +1, em que A representa o primeiro fator com i níveis (i = 1, 2, ..., a) e B representa o segundo fator com j níveis (j = 1, 2, ..., b) com a adição do tratamento adicional. Para a análise de variância deste caso, consideraram-se os modelos lineares yijk = μ + αi + βj + γij + εijk e yh = μ + τ + εh; relacionados, em que yijk é a variável observada no i-ésimo nível do fator α com o j-ésimo nível do fator β da k-ésima repetição (k = 1, 2, ..., r), μ é a média amostral, αi é o efeito do i-ésimo nível do primeiro fator, βj é o efeito do j-ésimo nível do segundo fator, γij é o efeito da interação do i-ésimo nível do fator α com o j-ésimo nível do fator β, εijk é o erro associado independente e identicamente distribuído, εijk~N(0,σ2), yh é a variável observada na h-ésima repetição do tratamento adicional, τ é o efeito do tratamento adicional e εh é o erro associado ao tratamento adicional, independente e identicamente distribuído εh~N(0,σ2). Considerou-se os delineamentos experimentais inteiramente casualizado e blocos casualizados. Para a análise do delineamento em blocos ao acaso, a adição do efeito de blocos λv (v = 1, 2, ..., w) aos modelos, se fez necessária. Foi realizada a dedução da soma de quadrados de tratamentos e sua decomposição para os efeitos dos fatores, sua interação e o contraste com o tratamento adicional. Os graus de liberdade foram deduzidos a partir do posto da matriz núcleo da forma quadrática das somas de quadrados. A técnica do diagrama de Hasse também foi adotada para dedução das somas de quadrados e graus de liberdade. Uma ilustração do método obteve os mesmos resultados da análise de variância do pacote ExpDes no programa R. Curvas de regressão linear foram ajustadas considerando o tratamento controle como um nível de fatores quantitativos. O teste de Dunnett foi empregado para comparar as médias do fatorial com o tratamento controle. / The present study aimed to study the experiments in two-way factorial designs with additional treatment of type control. For this scheme uses the notation A x B +1, where A represents the first factor levels with i (i = 1, 2, ..., a) and B is the second factor with levels j (j = 1 , 2, ..., b) with the addition of one more treatment. For the analysis of variance of this case, we considered the linear models yijk = μ + αi + βj + γij + εijk and yh = μ + τ + εh; related, wherein yijk is the variable observed in the ith level of factor α with the jth level of factor β of k-th iteration (k = 1, 2, ..., r), μ is the sample mean, αi is the effect of the ith level of the first factor, βj is the effect of the jth level of the second factor, γij is the interaction effect of the ith level of factor α with the jth level of factor β, εijk is the error associated with independent and identically distributed, εijk~N(0,σ2), yh is the variable observed in the hth repetition of the additional treatment, τ is the effect of the additional treatment and εh is the error associated to the additional treatment, independent and identically distributed εh~N(0,σ2). It was considered the completely experimental designs and randomized block design. For the analysis of the randomized block design, the addition of blocks effect λv (v = 1, 2, ..., w) to the models, was necessary. Was performed the deduction of the sum of squares of treatments and their decomposition to the effects of the factors, their interaction and the contrast with the additional treatment. The degrees of freedom were deducted from the posto of the matrix core of the quadratic form of sums of squares. The Hasse diagram technique has also been adopted for deduction of sums of squares and degrees of freedom. An illustration of the method has obtained the same results of analysis of variance program package ExpDes in R. Linear regression analysis was fitted control treatment as a level of the quantitative factors. The Dunnett test was used to compare the means of the factorial with the control treatment.
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Simulação de dados visando à estimação de componentes de variância e coeficientes de herdabilidade / Simulation of data aiming at the estimation of variance components and heritabilityAngela Mello Coelho 03 February 2006 (has links)
A meta principal desse trabalho foi comparar métodos de estimação para coeficientes de herdabilidade para os modelos inteiramente ao acaso e em blocos casualizados. Para os dois casos foram utilizadas as definições de coeficiente de herdabilidade (h2) no sentido restrito, dadas respectivamente, por h2=4 σ2t/(σ2+σ2t) e h2=4 σ2t/(σ2+σ2t+σ2b). . Portanto, é preciso estimar os componentes de variância relativos ao erro experimental (σ2) e ao efeito de tratamentos (σ2t) quando se deseja estimar h2 para o modelo inteiramente ao acaso. Para o modelo para blocos casualizados, além de estimar os últimos dois componentes, é necessário estimar o componente de variância relativo ao efeito de blocos (σ2b). Para atingir a meta estabelecida, partiu-se de um conjunto de dados cujo coeficiente de herdabilidade é conhecido, o que foi feito através da simulação de dados. Foram comparados dois métodos de estimação, o método da análise da variância e método da máxima verossimilhança. Foram feitas 80 simulações, 40 para cada ensaio. Para os dois modelos, as 40 simulações foram divididas em 4 casos contendo 10 simulações. Cada caso considerou um valor distinto para h2, esses foram: h2=0,10; 0,20; 0,30 e 0,40; para cada um desses casos foram fixados 10 valores distintos para o σ2, a saber: σ2=10; 20; 30; 40; 50; 60; 70; 80; 90; 100. Os valores relativos ao σ2 foram encontrados através da equação dada para os coeficientes de herdabilidade, sendo que, para o modelo em blocos casualizados, foi fixado σ2b=20 para todas os 40 casos. Após realizadas as 80 simulações, cada uma obtendo 1000 conjunto de dados, e por conseqüência 1000 estimativas para cada componente de variância e coeficiente de herdabilidade relativos a cada um dos casos, foram obtidas estatísticas descritivas e histogramas de cada conjunto de 1000 estimativas. A comparação dos métodos foi feita através da comparação dessas estatísticas descritivas e histogramas, tendo como referência os valores dos parâmetros utilizados nas simulações. Para ambos os modelos observou-se que os dois métodos se aproximam quanto a estimação de σ2. Para o delineamento inteiramente casualizado, o método da máxima verossimilhança forneceu estimativas que, em média, subestimaram os valores de σ2t, e por conseqüência, tendem a superestimar o h2, o que não acontece para o método da análise da variância. Para o modelo em blocos casualizados, ambos os métodos se assemelham, também, quanto à estimação de σ2t, porém o método da máxima verossimilhança fornece estimativas que tendem a subestimar o σ2b, e e por conseqüência, tendem a superestimar o h2, o que não acontece para o método da análise da variância. Logo, o método da análise da variância se mostrou mais confiável quando se objetiva estimar componentes de variância e coeficientes de herdabilidade para ambos os modelos considerados. / The main aim of this work was to compare methods of estimation of heritability for the 1- way classification and the 2-way crossed classification without interaction. For both cases the definition of heritability (h2) in the narrow sense was used, given respectively, by h2=4σ2t/(σ2+σ2t) e h2=4σ2t/(σ2+σ2t+σ2b). Therefore, there is a need to estimate the components of variance related to the residual (σ2) and the effect of treatments (σ2t) in order to estimate (h2) for the 1-way classification. For the 2-way classification without interaction, there is a need to estimate the component of variance related to the effect of blocks (σ2b) as well as the other two components. To achieve the established aim, a data set with known heritability was used, produced by simulation. Two methods of estimation were compared: the analysis of variance method and the maximum likelihood method. 80 simulations were made, 40 for each classification. For both models, the 40 simulations were divided into 4 different groups containing 10 simulations. Each group considered a different value for h2 (h2=0,10; 0,20; 0,30 e 0,40) and for each one of those cases there were 10 different values fixed for) σ2 (σ2=10; 20; 30; 40; 50; 60; 70; 80; 90; 100). The values for σ2t were found using the equations for the heritability, and for the 2-way crossed classification without interaction, σ2b=20 for all the 40 cases. After the 80 simulations were done, each one obtaining 1000 data sets, and therefore 1000 estimates of each component of variance and the heritability, descriptive statistics and histograms were obtained for each set of 1000 estimates. The comparison of the methods was made based on the descriptive statistics and histograms, using as references the values of the parameters used in the simulations. For both models, the estimates of σ2 were close to the true values. For the 1-way classification, the maximum likelihood method gave estimates that, on average, underestimated the values of σ2t, and therefore the values of h2. This did not happen with the analysis of variance method. For the 2-way crossed classification without interaction, both methods gave similar estimates of σ2t, although the maximum likelihood method gave estimates that tended to underestimate σ2b and therefore to overestimate h2. This did not happen with the analysis of variance method. Hence, the analysis of variance method proved to be more accurate for the estimation of variance components and heritability for both classifications considered in this work.
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Efeito do deslocamento dos dutos de admissão no número de \"swirl\" e no desempenho de motor diesel. / Effect of intake ports displacement in the swirl number and diesel engine performance.Robero Antonio de Souza 18 October 2016 (has links)
O presente trabalho buscou estudar experimentalmente os efeitos do deslocamento da posição final dos dutos de admissão de um cabeçote no número de swirl e as possíveis consequências nos parâmetros de desempenho do motor diesel (torque, emissão de poluentes e consumo de combustível). Foram construídos protótipos de cabeçotes divididos em quatro grupos de deslocamentos com diferentes direções e sentidos. O valor nominal desses deslocamentos foi de 1 mm. Em seguida os cabeçotes passaram por medição de geometria para verificação da posição real dos dutos de admissão; posteriormente os cabeçotes foram ensaiados em uma máquina de medição do número de swirl. A partir dos dados de posição dos dutos de admissão e do número de swirl de cada cabeçote, foi feita uma regressão linear múltipla para se obter uma equação que correlaciona o número de swirl com os deslocamentos em X e Y dos dois dutos de admissão. Na última parte do trabalho, os cabeçotes de cada grupo de deslocamento foram montados sucessivamente em um motor diesel instalado em dinamômetro para medição dos seus parâmetros de desempenho, a saber: curva de torque; consumo específico e emissão de poluentes. / This work aimed to study experimentally the effects of intake ports displacement of a cylinder head in its swirl number and the possible consequences in the diesel engine performance parameters (torque, emissions and fuel consumption). Cylinder head prototypes were divided into four groups with different displacement directions. The nominal value of these displacements was 1 mm. The cylinder heads were measured to check the real position of their intake ports; then the cylinder heads were tested in a machine to measure the swirl number. From the intake ports position data and swirl number of each cylinder head, a multiple linear regression was performed to obtain an equation that correlates the swirl number with intake ports displacement in X and Y directions. As last step of this work, the cylinder heads of each displacement group were mounted in a diesel engine installed on a dynamometer to measure its performance parameters: torque curve; specific fuel consumption and emissions.
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Regressão não linear no desdobramento da interação em experimentos com mais de um fator / Nonlinear regression in the unfolding of the interaction in experiments with more than one factorAlessandra dos Santos 25 January 2013 (has links)
Em experimentos que envolvam um fator quantitativo e um qualitativo, é aconselhável que, se detectado efeito significativo da interação entre os fatores na análise de variância, recorra-se a análise de regressão no desdobramento da mesma, no entanto nem sempre a utilização de modelos de regressão linear é a forma mais adequada para avaliar o efeito do fator quantitativo. Neste trabalho é apresentada a forma de ajuste de um modelo de regressão não linear em um experimento com medida repetida no tempo. No experimento considerou-se o ganho de peso, em quilos, de ovinos, machos e fêmeas, da raça Santa Inês em doze idades diferentes. Conduzido como parcela subdividida, pois fator tempo não foi aleatorizado, a análise variância necessita de correção dos graus de liberdade devido à condição de esfericidade não satisfeita. A correção de Geisser e Greenhouse (G-G) foi utilizada para os efeitos da interação e do tempo. O teste F na análise de variância apresentou resultado significativo para interação entre os fatores e, no desdobramento da interação, para avaliação do efeito do fator tempo em cada nível do fator sexo foi proposto o ajuste do modelo Gompertz bem como um teste de aderência para o modelo. Após o ajuste do modelo aos dados de peso de ovinos também foi considerado no estudo a comparação dos parâmetros das curvas de machos e fêmeas. Pela análise proposta foi possível concluir que o modelo univariado, com esquema de parcelas subdivididas, pode ser utilizado em experimentos de crescimento animal, porém sua aplicação está sujeita a verificação da condição de esfericidade. Também foi verificado que incorporar, no desdobramento de interações, o ajuste do modelo Gompertz é um procedimento viável e permitiu avaliar a real qualidade de ajuste do modelo aos dados. Com a comparação dos parâmetros das curvas ajustadas verificou-se que ovinos machos e fêmeas apresentam valores estatisticamente iguais para os parâmetros α e γ, ambos relacionados com o peso ao nascer dos animais. O peso máximo esperado para fêmea (40,7kg) é estatisticamente inferior ao encontrado para os machos (57,3kg), no entanto, sua taxa de crescimento (0,011kg/dia para fêmeas) é superior (0,007kg/dia para machos), ou seja, as fêmeas atingem o peso de estabilização mais rapidamente que os machos. / In experiments involving a qualitative and a quantitative factor, it is advisable that if a significant interaction is detected between factors in the analysis of variance, one should perform regression analysis of the splitting factors. However, the use of linear regression models is not always the most appropriate way to assess the effect of the quantitative factor. This paper presents a way to fit a nonlinear regression model in an experiment with repeated measurements over time. In the experiment, the weight gain of male and female Santa Inês breed sheep, in pounds, in twelve different ages is measured. Conducted in a split-plot design, as the time factor was not randomized, the analysis of variance requires correction of the degrees of freedom, as the sphericity condition is not satisfied. The Greenhouse and Geisser correction (G-G) was used for the purposes of interaction and time. The F test in the analysis of variance showed a significant result for the interaction between the factors and the splitting of the interaction. In order to evaluate the effect of the time factor at each level of the gender factor, a Gompertz model was proposed, as well as a test of model adherence. After fitting the model to the data, a comparison study of the parameters for males and females was also made. For the proposed analysis, we concluded that the univariate model, with split-plot design, can be used in experiments of animal growth, but its application is prone to verification of the sphericity condition. They also found that the incorporation of the splitting of interactions, by adjusting the Gompertz model, is a viable procedure and allowed to evaluate the real quality of fit. By comparing the fitted parameter values, it was found that males and females have statistically identical values for the parameters α and γ, both related to the birth weight of the animals. The maximum weight expected for a female (40.7 kg) is statistically lower than that found for the males (57.3 kg), however, their growth rate (0.011 kg / day for females) is greater than the males\' (0.007 kg / day for males), i.e., females reach weight stabilization faster than males.
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