Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-12-19T14:19:38Z No. of bitstreams: 1 silviahelenacardoso.pdf: 4549125 bytes, checksum: ec5aef548786ddb9a91d7c2d8c42d412 (MD5) / Rejected by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br), reason: Consertar o títulos: "Síntese de derivados..." on 2016-12-19T14:27:34Z (GMT) / Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-12-19T14:30:33Z No. of bitstreams: 1 silviahelenacardoso.pdf: 4549125 bytes, checksum: ec5aef548786ddb9a91d7c2d8c42d412 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2016-12-19T15:44:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 silviahelenacardoso.pdf: 4549125 bytes, checksum: ec5aef548786ddb9a91d7c2d8c42d412 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-19T15:44:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 silviahelenacardoso.pdf: 4549125 bytes, checksum: ec5aef548786ddb9a91d7c2d8c42d412 (MD5) Previous issue date: 2008-07-11 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O presente trabalho explorou, num primeiro momento, a síntese de derivados do 2mercaptobenzotiazol, do 2-mercaptobenzimidazol e da isoniazida condensados com carboidratos e a preparação de análogos da etionamida ligados à amino álcoois, potenciais agentes antimicrobianos. Em um segundo capítulo foi realizado um estudo sintético visando a obtenção do α-aminoácido não proteinogênico, a alloenduracididina. A primeira parte do capítulo 1 consistiu na síntese e avaliação das propriedades antimicrobianas dos derivados do 2-mercaptobenzotiazol e do 2-mercaptobenzimidazol condensados com carboidratos. Para tal foram sintetizados 10 compostos inéditos, a saber: quatro derivados do 2-mercaptobenzotiazol, três derivados do 2-mercaptobenzimidazol e três derivados poliidroxilados em rendimentos satisfatórios (47-85%). Os compostos 15, 17 e 20 foram submetidos à avaliação “in vitro” das propriedades antibacterianas e antifúgicas contra Staphylococcus aureus, Streptococcus mutans, Pseudomonas aeruginosa e Candida albicans na Faculdade de Farmácia e Bioquímica da UFJF. Os resultados mostraram que apenas um dos derivados do 2-mercaptobenzimidazol (composto 20) apresentou atividade antibacteriana contra Staphylococcus aureus com valor de MIC igual a 145 µg/mL. Os derivados benzotiazólicos 15 e 17 também foram testados contra Mycobacterium tuberculosis “in vitro” no Laboratório de Bacteriologia (IPEC) da Fundação Oswaldo Cruz FioCruz-RJ. Todavia, tais compostos não se mostraram ativos contra esse microorganismo. A segunda parte do capítulo 1 visou a síntese e a avaliação da atividade antituberculosa de 13 derivados da isoniazida (26-38), dos quais 10 são inéditos, obtidos em rendimento de (20-75%) e de 5 novos derivados da etionamida (44-48), obtidos em rendimentos de baixo a moderados (20-60%). Dentre os análogos da etionamida, a estrutura do composto 46 pode ser confirmada por difração de raio X. Os análogos da INH, foram testados quanto a sua atividade antibacteriana contra M. tuberculosis H37Rv (ATCC 27294) utilizando-se o método MABA no IPEC-FioCruz-RJ. Vários compostos exibiram atividade contra M. tuberculosis H37Rv em concentrações entre 0,31-3,12 µg/mL quando comparados com os fármacos de primeira escolha isoniazida e rifampicina. Os resultados obtidos sugerem que os derivados da isoniazida, sintetizados neste trabalho, apresentam importantes informações para a obtenção de novos fármacos no combate à tuberculose. Os derivados da vii etionamida, também estão sendo avaliados quanto as suas propriedades antituberculosas. Como parte do estágio de doutorando na França, o capítulo 2 desse trabalho consistiu no desenvolvimento de uma metodologia para a preparação do α-aminoácido não proteinogênico, a alloenduracididina. No decorrer do trabalho foram testadas 3 metodologias e 2 estratégias sintéticas diferentes visando a obtenção desse aminoácido. A metodologia desenvolvida permitiu a preparação do composto 150a, a partir do N-Boc-(R)-alilglicinato de etila, em 8 etapas, utilizando-se o método de diidroxilação assimétrica de Sharpless. Um trabalho de otimização ainda deve ser realizado a fim de melhorar a diasteroseletividade da etapa de diidroxilação assimétrica e será necessária uma melhor caracterização do composto 150a pois, até o momento, apenas análises preliminares foram realizadas. A configuração do centro assimétrico C-4 em 150a ainda permanece desconhecida, a determinação dessa configuração nos permitiria afirmar se o aminoácido 150a obtido trata-se da alloenduracididina de configuração (2R,4R) ou do seu isômero (2R,4S). A aplicação da metodologia desenvolvida no decorrer do trabalho à substratos adequados também permitiria a preparação de outros α-aminoácidos contendo a função guanidina. / The present work explored, in a first part, the synthesis of 2-mercaptobenzothiazole, 2-mercaptobenzimidazole and isoniazid derivatives condensed with carbohydrates, and the preparation of ethionamide analogues linked to amino alcohols, all potential antimicrobial agents. In a second chapter was realized a synthetic study aimed at the obtention of the nonproteinogenic α-amino acid alloenduracidine. The first part of chapter 1 relates of the synthesis and evaluation of antimicrobial properties of 2-mercaptobenzothiazole and 2-mercaptobenzimidazole derivatives condensed with carbohydrates. Ten compounds were synthesized: four derivatives of 2mercaptobenzothiazole, three derivatives of 2-mercaptobenzimidazole and three polyhydroxylated derivatives, in satisfactory yields (47-85%). Compounds 15, 17 and 20 were submitted for evaluation of antibacterial and antifungical properties at Faculdade de Farmácia e Bioquímica da UFJF. The results showed that only one derivative of 2mercaptobenzimidazole (compound 20) displayed antibacterial activity against Staphylococcus aureus with a MIC value equal to 145 µg/mL. Benzothiazole derivatives 15 and 17 were also tested against Mycobacterium tuberculosis “in vitro” at Laboratório de Bacteriologia (IPEC) of FioCruz-RJ. However, these compounds did not appear active against this microorganism. The second part of chapter 1 is aimed at the synthesis and evaluation of antitubercular activity of 13 derivatives of isoniazid (26-38), obtained in yields (20-75%), and 5 new ethionamide derivatives (44-48), obtained in low to moderate yields (20-60%). Among the analogues of ethionamide, the structure of compound 46 could be confirmed by X-ray diffraction. Analogues of INH were tested for their antibacterial activity against M. tuberculosis H37Rv (ATCC 27294) using the MABA method at IPEC-FioCruz-RJ. Several compounds exhibited activity between 0.31-3.12 µg/mL against these bacteria when compared to first choice drugs isoniazid and rifampicin. The results obtained suggest that the isoniazid derivatives synthesized in this work provide important information for the obtention of more active compounds useful for the treatment of tuberculosis. The derivatives of ethionamide synthetized are also being evaluated for their antitubercular properties. ix As part of a Ph.D traineeship, the chapter 2 of this work describes work performed in France concerning the development of a methodology for the preparation of the non proteinogenic α-amino acid alloenduracidine. During this project three methodologies and two synthetic strategies were tested for the obtention of this amino acid. The methodologies developed permitted the preparation of compound 150a from ethyl N-Boc-(R)-allylglycinate in eight steps using the Sharpless asymmetric dihydroxylation method. Optimization of the purification procedure for compound 150a must still be performed in order to allow its complete characterization. The configuration of the asymmetric centre C-4 of 150a still remains unknown. Determination of this configuration will allow us to confirm whether if the obtained amino acid 150a is alloenduracidine (2R,4R) or its isomer (2R,4S). Application of the methodology developed during the course of this study to appropriate substrates will also allow the preparation of other naturally-occuring α-amino acids containing the guanidine function.

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-02-22T12:04:28Z No. of bitstreams: 1 fernandafernandesdossantos.pdf: 1359737 bytes, checksum: adaeb451590b863f3a59b02724e66c15 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2016-02-26T13:59:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 fernandafernandesdossantos.pdf: 1359737 bytes, checksum: adaeb451590b863f3a59b02724e66c15 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-26T13:59:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 fernandafernandesdossantos.pdf: 1359737 bytes, checksum: adaeb451590b863f3a59b02724e66c15 (MD5) Previous issue date: 2014-02-12 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Entre os principais patógenos causadores da mastite bovina estão as bactérias do gênero Staphylococcus. Nas últimas décadas, a resistência à oxacilina (meticilina) neste gênero tem sido motivo de preocupação, pela possibilidade de redução da efetividade dos tratamentos da mastite, e pela possibilidade de transferência de determinantes de resistência de uma bactéria para outra. A resistência à oxacilina é mediada pela proteína PBP 2a, codificada pelo gene mecA, que confere resistência a todos os antibióticos β-lactâmicos, inclusive às cefalosporinas e carbapenemas. O gene mecA faz parte de uma ilha genômica chamada staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec), que pode incluir também outros genes de resistência. Neste trabalho, a resistência à oxacilina foi avaliada em 170 bactérias do gênero Staphylococcus isoladas de mastite subclínica, sendo 79 S. aureus e 91 Staphylococcus spp. coagulase-negativos (STACN). As bactérias foram provenientes de seis estados brasileiros, sendo quatro de Minas Gerais, 27 do Paraná, três de Pernambuco, onze do Rio Grande do Sul, 56 de Santa Catarina e 69 de São Paulo. O perfil de susceptibilidade a dez antimicrobianos utilizados na prática veterinária foi determinado pelo método E-TEST®. A caracterização fenotípica da resistência à oxacilina foi realizada através do teste de difusão com discos de oxacilina e cefoxetina, teste de diluição em ágar com oxacilina e E-TEST® com oxacilina. Em todas as amostras foi pesquisado, por PCR, o gene mecA, empregando dois pares de oligonucleotídeos iniciadores que amplificam regiões diferentes do gene. As bactérias com fenótipo de resistência à oxacilina foram identificadas através do sequenciamento de um fragmento de 536 pb do rRNA 16S. Neste grupo foi pesquisado ainda o gene mecC e o gene blaZ, que codifica para a enzima β-lactamase. Os produtos de PCR foram sequenciados para confirmação dos resultados. Foi feita a análise molecular dos genes mecA por meio da tipagem do cassete cromossômico estafilocócico mec (SCCmec) e das amostras mecA positivas através da macrorrestrição do DNA cromossômico seguida de eletroforese em campo pulsado (PFGE). Com exceção da penicilina e da oxacilina, mais de 86% das estirpes de estafilococos apresentaram susceptibilidade à cefalotina, gentamicina, clindamicina, eritromicina, enrofloxacina, sulfonamida, sulfametoxazol + trimetoprima e tetraciclina. Todas as estirpes de S. aureus foram susceptíveis à oxacilina, enquanto 29,7% das estirpes de STACN foram resistentes. STACN foram mais resistentes do que S. aureus à cefalotina e à eritromicina (p ≤ 0,01) e à gentamicina, clindamicina, e tetraciclina (p ≤ 0,05). A susceptibilidade das amostras S. aureus e de STACN foi semelhante para penicilina, enrofloxacina, sulfonamida e sulfametoxazol + trimetoprima. O teste de difusão em ágar com disco de cefoxetina apresentou maior sensibilidade e especificidade quanto à presença do gene mecA. Do total de amostras estudadas, 31 STACN foram fenotipicamente resistentes à oxacilina em pelo menos um dos testes realizados, e somente em dez foi detectado o gene mecA. As bactérias mecA positivas foram identificadas como S. epidermidis e classificadas em três pulsotipos (A, B e C) e quatro subtipos (A1, B1, B2 e B3). Entre as amostras com fenótipo de resistência à oxacilina 16 foram positivas para o gene blaZ, sendo sete mecA negativas e nove mecA positivas. Nenhuma das amostras analisadas amplificou o gene mecC e duas amplificaram o gene mecA-like de S. sciuri. Foram encontrados três tipos de SCCmec, os tipos I, IV e V. Os resultados sugerem que S. epidermidis pode ser um reservatório da resistência à oxacilina para outras espécies de estafilococos, tanto do homem quanto de animais. Estudos que gerem informações sobre o perfil fenotípico e molecular da resistência aos antimicrobianos em espécies de estafilococos devem ser realizados para o controle da disseminação da resistência e para que medidas terapêuticas sejam escolhidas adequadamente. / Among the major pathogens of bovine mastitis are bacteria of the genus Staphylococcus. In recent decades, resistance to oxacillin (methicillin) in this genus has been a matter of concern for the possibility of reducing the effectiveness of mastitis treatments, and transferring of resistance determinants. The oxacillin resistance is mediated by PBP 2a protein, encoded by the mecA gene, which confers resistance to all β-lactam antibiotics, including cephalosporins and carbapenems. The mecA gene is part of a genomic island called staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec), which may also include other resistance genes. Oxacillin resistance was studied in 170 Staphylococcus isolated from subclinical mastitis, 79 S. aureus and 91 coagulase-negative staphylococci (CNS). The bacterial strains were isolated from six Brazilian states; four from Minas Gerais, 27 from Paraná, three from Pernambuco, eleven from Rio Grande do Sul, 56 from Santa Catarina and 69 from São Paulo. The susceptibility profile to ten antimicrobial agents used in the veterinary practice was determined by E-TEST® method. Phenotypic characterization of oxacillin resistance was performed by disk diffusion test with oxacillin and cefoxitin, agar dilution test with oxacillin and E-TEST® with oxacillin. All strains were screened by PCR to detect mecA gene using two pairs of primers amplifying different regions of the gene. The strains with oxacillin resistance phenotype were identified by sequencing a 536 bp fragment of 16S rRNA gene. This group was also evaluated for the presence of the gene mecC and blaZ, which encodes for the enzyme β-lactamase. The PCR products were sequenced to confirm the results. Molecular analysis of mecA gene was carried out by the typing of staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) and the mecA-positive strains by macrorestriction of chromosomal DNA followed by pulsed field gel electrophoresis (PFGE). With the exception of penicillin and oxacillin, more than 86% of the strains presented susceptibility to cephalothin, gentamicin, clindamycin, erythromycin, enrofloxacin, sulfonamide, trimethoprim-sulfamethoxazole and tetracycline. All S. aureus strains were sensitive to oxacillin, while 29.7% of the CNS strains were resistant. The CNS were more resistant than S. aureus to cephalothin and erythromycin (p ≤ 0.01) and gentamicin, clindamycin, and tetracycline (p ≤ 0.05). The agar diffusion test with cefoxitin disc showed higher sensitivity and specificity for the presence of the mecA gene. Considering the total strains studied, 31 CNS were phenotypically resistant to oxacillin in at least one of the tests, and only in ten CNS was detected the mecA gene. mecA-positives bacteria were identified as Staphylococcus epidermidis and classified into three pulsotypes (A, B and C) and four subtypes (A1, B1, B2 and B3). Among strains with oxacillin resistance phenotype, 16 were positive for blaZ gene, seven mecA-negatives and nine mecA-positive strains. Two of the oxacillin resistant strains amplified mecA-like gene of S. sciuri and none amplified mecC. Three SCCmec types were found, types I, IV and V. The results suggest that S. epidermidis can be a reservoir of oxacillin resistance to other species of staphylococci, both of human and animals. Studies that generate information about the molecular and phenotypic profile of antimicrobial resistance in staphylococcal species should be performed for controlling the spread of resistance and selection of appropriate therapeutic measures.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-02-02T14:04:30Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-02-02T14:04:49Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-02-02T14:05:04Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-02T14:05:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) Previous issue date: 2016-07-21 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Early detection of resistance to drugs used to treat tuberculosis (TB) from Mycobacterium tuberculosis isolates, represent a challenge to Tuberculosis Control Program (TCP), because most antimicrobial susceptibility testing needs bacillus isolation in growth medium. Molecular methods have greater possibilities for rapid determination of resistance, they aim to detect mutations in M. tuberculosis genes associated with antimicrobial resistance and have promising results for Isoniazid and Rifampin, which are the major drugs of basic therapeutic regimen for TB treatment. This study evaluated the performance of PCR assay in Real Time (qPCR), directly by sputum samples and cultivation of strains isolated from patients with pulmonary tuberculosis multibacillar from Polyclinic Cardoso Fontes. 171 samples were analyzed by qPCR, targeting genes: katG, inhA and rpoB and the results were compared using the Nitrate Reductase Method (MNR). The resistance frequency for the evaluated samples was 9.36 % for Isoniazid , 5.85% for Rifampin and 4.09 % for both drugs. The katG and rpoB genes were associated with resistance to Isoniazid (p = 0.0001, 95% CI 3.61 to 21.01) and to Rifampin (p = 0.0001, 95% CI 6.34 to 51.05), respectively . The inhA gene was not associated with resistance to Isoniazid. There was acceptable agreement between phenotypic assay, MNR, and qPCR (sputum samples) for mutation detection for katG genes (kappa index: 0.4097) and rpoB (kappa index: 0.4985). The selected genes katG and rpoB were associated with resistance to Isoniazid and Rifampacina respectively, although the qPCR has had underperformed the MNR in this study. However, the molecular tests continue as promising targets for achieving faster results. In this context , optimizations in molecular testing should be performed to allow faster and more reliable diagnostics for resistance to anti -TB drugs and thus provide an appropriate treatment for the patient and reduce the transmission of TB. / A detecção precoce de resistência aos medicamentos utilizados no tratamento da tuberculose (TB), a partir de isolados de Mycobacterium tuberculosis, representa um desafio aos Programas de Controle de Tuberculose (PCT), pois a maioria dos testes de sensibilidade aos antimicrobianos necessita do isolamento do bacilo em meio de cultivo. Os métodos moleculares apresentam maiores possibilidades de determinação rápida da resistência, eles visam detectar mutações em genes de M. tuberculosis associados à resistência aos antimicrobianos e possuem resultados promissores para Isoniazida e Rifampicina, que são os principais fármacos do esquema terapêutico básico de tratamento da TB. O presente estudo avaliou o desempenho do ensaio PCR em Tempo Real (qPCR), diretamente de amostras de escarro e de isolados de cultivo de pacientes com TB pulmonar multibacilares, oriundos da Policlínica Cardoso Fontes. Foram analisadas 171 amostras por qPCR, tendo como alvo os genes: katG, inhA e rpoB e os resultados comparados com o Método de Nitrato Redutase (MNR). A frequência de resistência para as amostras avaliadas foi de 9,36% para Isoniazida, 5,85% para Rifampicina e 4,09% para ambos os fármacos. Os genes katG e rpoB foram associados a resistência a Isoniazida (p=0,0001; IC95% 3,61 a 21,01) e a Rifampicina (p=0,0001; IC95% 6,34 a 51,05), respectivamente. O gene inhA não apresentou associação a resistência a Isoniazida. Houve concordância aceitável entre ensaio fenotípico, MNR, e o qPCR (de amostras de escarro) para a detecção da mutação para os genes katG (Índice kappa: 0,4097) e rpoB (Índice kappa: 0,4985). Os genes selecionados katG e rpoB foram associados a resistência a Isoniazida e Rifampacina respectivamente, embora a qPCR tenha tido um desempenho inferior ao MNR neste estudo. Todavia, os testes moleculares continuam como alvos promissores para obtenção de resultados mais rápidos. Neste contexto, otimizações nos testes moleculares devem ser realizadas, para permitir diagnósticos mais rápidos e confiáveis para resistência aos fármacos anti-TB e, desta forma, proporcionar um tratamento adequado ao paciente e reduzir a transmissão da TB.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-14T11:15:18Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Vanda S. Q. Dini.pdf: 3327102 bytes, checksum: 159dd47f2d164189acf76615ebf5f409 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-14T11:15:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Vanda S. Q. Dini.pdf: 3327102 bytes, checksum: 159dd47f2d164189acf76615ebf5f409 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-14T11:15:51Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Vanda S. Q. Dini.pdf: 3327102 bytes, checksum: 159dd47f2d164189acf76615ebf5f409 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T11:15:51Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Vanda S. Q. Dini.pdf: 3327102 bytes, checksum: 159dd47f2d164189acf76615ebf5f409 (MD5) Previous issue date: 2016-10-04 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Introduction: Pseudomonas aeruginosa resistant to multiple antibiotics (MDR , multi-drugresistance and PDR , pan-drug-resistance ) is a frequent etiologic agent of nosocomial infections, mainly affecting immunocompromised patients, such as those admitted to the Intensive Care Unit (ICU). Objectives: (1) Detect P. aeruginosa resistant to multiple antimicrobials in patients, professionals and hospital environment; (2) Identify genetic factors that confer antibiotic resistance such as integrons, gene cassettes and genes encoding enzymes β-lactamases; and (3) Detect clonal groups among isolates MDR/PDR. Methods: Samples were collected samples from patients, professionals and structures in ICUs of Hospitals 28 de Agosto (HPS28), Francisca Mendes (HUFM) e João Lúcio Pereira Machado (HPSJL), which were isolated and identified strains of P. aeruginosa by classical and molecular microbiological methods (amplification and sequencing of the 16S rRNA gene); The antimicrobial resistance profile was determined by disk diffusion technique; The research groups was determined by clonal genetic similarity among isolates MDR/PDR by PFGE; The detection of genes that encode resistance (integrons, gene cassettes and β-lactamases enzymes) was performed by PCR and confirmed by RFLP and/or genetic sequencing. Results: The phenotypes MDR and PDR were detected, respectively, 13.3 % and 1.2 % of the isolates. In 32 (38.5%) were detected class integrons 1. Of these, three (3.6%) were also positive for integrons class intengrons 2. The presence of the isolates showed statistical correlation (P<0.05) with significant phenotypic resistance to the tested drugs. A high frequency of integrons contained no genetic cassette or carried only genes that encode resistance to aminoglycosides streptomycin and spectinomycin and trimethoprim. The β- lactamase showed the production of enzyme KPC -2 study (66,7%), VIM (8.3%) and OXA - 50 (100%) P. aeruginosa isolates MDR/PDR. Two clonal groups were detected among MDR/PDR isolates, indicating clonal intra and inter-hospital. Conclusion: The isolation of P. aeruginosa from hospitals studied shows that these pathogens, which can cause severe nosocomial infections, in particular MDR and PDR strains are spreading in a hospital environment. Moreover, it appears that the presence of genetic elements such as integrons, gene cassettes and genes encoding β-lactamases are correlated to the resistance fenótops these isolates and therefore potential genetic mechanisms that confer antimicrobial resistance. Nevertheless, further studies are needed to assess the contribution of other molecular mechanisms and the selective pressure exerted by antimicrobial agents that contribute to the development of these phenotypes. / Introdução: Pseudomonas aeruginosa resistente a múltiplos antimicrobianos (MDR, multidrug- resistance e PDR, pan-drug-resistance) é um agente etiológico frequente em infecções hospitalares, acometendo principalmente pacientes imunossuprimidos, tal como os internados em Unidade de Tratamento Intensivo (UTI). Objetivos: (1) Detectar P. aeruginosa resistente a múltiplos antimicrobianos em pacientes, profissionais e estruturas hospitalares; (2) identificar fatores genéticos que conferem resistência antimicrobiana, tais como integrons, cassetes gênicos e genes codificadores de enzimas β-lactamases; e (3) Detectar grupos clonais entre os isolados MDR/PDR. Metodologia: Foram realizadas coletas de amostras de pacientes, profissionais e estruturas de UTIs dos Hospitais 28 de Agosto (HPS28), Francisca Mendes (HUFM) e João Lúcio Pereira Machado (HPSJL), dos quais foram isoladas e identificadas cepas de P. aeruginosa por metodologia microbiológica clássica e molecular (amplificação e sequenciamento do gene 16s rRNA); O perfil de resistência aos antimicrobianos foi determinado pela técnica de disco-difusão; A pesquisa de grupos clonais foi determinada por similaridade genética entre os isolados MDR/PDR por PFGE; A detecção de genes que codificam resistência (integrons, cassetes gênicos e enzimas β-lactamases) foi realizada por PCR e confirmadas por RFLP e/ou sequenciamento genético. Resultados: Os fenótipos MDRs e PDR foram detectados em, respectivamente, 13,3% e 1,2% dos isolados estudados. Em 32 (38,5%) foram detectados integrons de classe 1. Destes, três (3,6%) também foram positivos para integrons de classe 2. A presença de intengrons nos isolados estudados demonstra correlação estatística (P<0,05) significativas com os fenótipos de resistência aos fármacos testados. Uma alta frequência de integrons não continha cassete gênico ou apenas carregava genes que codificavam resistência aos aminoglicosídeos estreptomicina e espectinomicina e ao trimetropin. A pesquisa de β-lactamases revelou a produção de enzimas KPC-2 (66,7%), VIM (8,3%) e OXA-50 (100%) por isolados de P. aeruginosa MDR/PDR. Dois grupos clonais foram detectados entre os isolados MDR/PDR estudados, indicando disseminação clonal inter e intrahospitalares. Conclusão: O isolamento de P. aeruginosa a partir dos hospitais estudados evidencia que esses patógenos, capazes de causar graves infecções nosocomiais, em especial, cepas MDR e PDR, estão se disseminando em ambiente hospitalar. Além disso, constata-se que a presença de elementos genéticos como integrons, cassetes gênicos e genes codificadores de β-lactamases estão correlacionadas aos fenótops de resistência nesses isolados, sendo, portanto, mecanismos genéticos potenciais capazes de conferir resistência antimicrobiana. Apesar disso, estudos futuros são necessários para avaliar a contribuição de outros mecanismos moleculares e a pressão seletiva exercida pelos antimicrobianos que contribuem para o desenvolvimento destes fenótipos.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-23T15:20:20Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Fabiano B. Prado.pdf: 1126403 bytes, checksum: c0f9bb60edf0feead22f8e7b9e867947 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-23T15:20:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Fabiano B. Prado.pdf: 1126403 bytes, checksum: c0f9bb60edf0feead22f8e7b9e867947 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-23T15:20:50Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Fabiano B. Prado.pdf: 1126403 bytes, checksum: c0f9bb60edf0feead22f8e7b9e867947 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-23T15:20:50Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Fabiano B. Prado.pdf: 1126403 bytes, checksum: c0f9bb60edf0feead22f8e7b9e867947 (MD5) Previous issue date: 2017-03-30 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Fungi remain one of the most important sources of bioactive compounds, among which, the genus Aspergillus predominates as an alternative for the production of secondary metabolites of industrial interest, especially as source of antimicrobials, enzymes and antioxidants. This work aimed to verify the influence of the preservation method on the activity of secondary metabolites and to select a species of Aspergillus as a source of compounds with antimicrobial activity. The antimicrobial activity against Gram-positive (Staphylococcus aureus), Gram-negative (Escherichia coli) and Candida albicans yeast was determined by agar diffusion and bioautography techniques. The viability of the fungi was performed based on the morphological characteristics and reproduction structures of the Aspergillus species. The production of the bioactive compounds was carried out in yeast extract agarose extract (YES). The organic extracts, ethanolic, ethyl acetate and hexane obtained from the cultures were tested by agar diffusion method against Staphylococcus aureus (Gram-positive bacteria), Escherichia coli (Gram-negative) and Candida albicans (unicellular fungus). The results showed that filamentous fungi continue to be one of the most important sources of bioactive compounds, among which, the genus Aspergillus predominates as an alternative for the production of metabolites of industrial interest, such as Lovastatin and other antimicrobials. The extracts that demonstrated antibiosis by agar diffusion were analyzed by agar immunoassay and subsequent determination of the minimum inhibitory concentration (MIC) using the multiwell plate dilution method. The viability of Aspergillus species predominated in cultures preserved in distilled water, the phenomenon of pleomorphism was observed in 2.5% and 7.5% of the Aspergillus species preserved in water and mineral oil, respectively. Contamination by other filamentous fungi was observed in 2.5% in both water and mineral oil preserves. The profile of the antimicrobial activity by diffusion in agar showed the activity of one to three extracts of Aspergillus cultures predominantly against S. aureus. Growth of E. coli and C. albicans was inhibited only by ethyl acetate extract of A. japonicus DPUA 613 and ethanolic extract of A. flavo furcatis DPUA 1451, respectively. In bioautography, antimicrobial activity was detected in different compounds against S. aureus, ranging from one to three zones of inhibition, in the Rf range of 0.70 to 0.81. In this test, A. flavo furcatis DPUA 1451 was the only growth inhibitory species of C. albicans, composed of Rf 0.75 constituent of the hexane extract. The data presented here showed that Aspergillus species, although preserved for different periods under in vitro conditions, synthesize compounds with antibacterial and antifungal activity capable of inhibiting the growth of S. aureus, E. coli and C. albicans. / Fungos continuam sendo uma das fontes mais importantes de compostos bioativos, entre os quais, o gênero Aspergillus predomina como uma alternativa para produção de metabólitos secundários de interesse industrial, especialmente como fonte de antimicrobianos, enzimas e antioxidantes. Este trabalho teve como objetivo verificar a influência do método de preservação na atividade de metabólitos secundários e selecionar uma espécie de Aspergillus como fonte de compostos com atividade antimicrobiana. A atividade antimicrobiana contra bactéria Gram-positiva (Staphylococcus aureus), Gram-negativa (Escherichia coli) e a levedura Candida albicans foi determinada pelas técnicas da difusão em ágar e bioautografia. A viabilidade dos fungos foi realizada com base nas características morfológicas e estruturas de reprodução das espécies de Aspergillus. A produção dos compostos bioativos foi realizada em ágar extrato de levedura sacarose (YES). Os extratos orgânicos, etanólico, acetato de etila e hexânico obtidos das culturas foram testados pelo método de difusão em ágar por poço frente a Staphylococcus aureus (bactéria Gram-positiva), Escherichia coli (Gram-negativa) e Candida albicans (fungo unicelular). Os resultados mostraram que fungos filamentosos continuam sendo uma das fontes mais importantes de compostos bioativos, entre os quais, o gênero Aspergillus predomina como uma alternativa para produção de metabólitos de interesse industrial, a exemplo da Lovastatina e outros antimicrobianos. Os extratos que demonstraram antibiose por difusão em ágar foram analisados pelo método de bioautografia por imersão em ágar e posterior determinação da concentração mínima inibitória (CMI) utilizando o método de diluição em placa multipoços. A viabilidade das espécies de Aspergillus predominou nas culturas preservadas em água destilada, o fenômeno do pleomorfismo foi observado em 2,5% e 7,5% das espécies de Aspergillus preservadas em água e óleo mineral, respectivamente. A contaminação por outros fungos filamentosos foi constatada em 2,5% tanto nos preservados em água quanto em óleo mineral. O perfil da atividade antimicrobiana por difusão em ágar mostrou a atividade de um a três dos extratos das culturas dos Aspergillus de forma predominante frente a S. aureus. O crescimento de E. coli e C. albicans foi inibido somente por extrato acetato de etila de A. japonicus DPUA 613 e extrato etanólico de A. flavo furcatis DPUA 1451, respectivamente. Na bioautografia, a atividade antimicrobiana foi detectada em diferentes compostos frente a S. aureus, variando de uma a três zonas de inibição, na faixa de Rf de 0,70 a 0,81. Neste teste, A. flavo furcatis DPUA 1451 foi a única espécie inibidora do crescimento de C. albicans, composto de Rf 0,75 constituinte do extrato hexânico. Os dados aqui apresentados mostraram que espécies de Aspergillus, ainda que preservadas por diferentes períodos, em condições in vitro, sintetizam compostos com atividade antibacteriana e antifúngica capazes de inibir o crescimento de S. aureus, E. coli e C. albicans.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-05-24T18:42:29Z No. of bitstreams: 1 Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-05-24T18:42:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-05-24T18:43:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-24T18:43:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) Previous issue date: 2015-11-19 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Nanotechnology is a science of nano-sized systems, comprised in a range of 10-9 m, which proposes to create a new organizational structure able to show different behaviors and properties of materials currently known and available. Through integration with biotechnology, the term "nanobiotechnology" may be used to define the use of microorganisms in studies concerning medical, pharmaceutical and cosmetics industries, among others. By virtue of their biotechnological potential for synthesizing antibacterial compounds, antifungal, antitumor, and antiparasitic compounds, beyond other substances of industrial interest, filamentous bacteria (actinomycetes) has potential for the development of drugs through biological synthesis of silver nanoparticles (AgNPS). This study aimed to evaluate the potential of AgNPs synthesis with antimicrobial activity against pathogenic bacteria and opportunistic fungi using as source of biomolecules species of actinomycetes. Ten samples of actinomycetes were selected from the collection Collection of Culture-DPUA and were subcultured and authenticated in ISP-2A (malt extract-yeast extract agar), based on morphological characteristics. The identification at the species level was performed by the technique of PCR (Polymerase Chain Reaction). For biogenic synthesis AgNPs, actinomycetes underwent submerged fermentation. The recovered crude extract and biosynthesized nanoparticles were used to determine the antimicrobial activity by agar diffusion method. The AgNPs that showed significant antagonistic action have been used to determine the MIC (Minimum Inhibitory Concentration), Cytotoxicity and characterized by different techniques, such as UV-Vis, DLS (Dynamic Light Scattering), XRD (diffraction X-ray) FTIR (Infrared Spectroscopy Fourier Transform), ICP-OES (Optical Emission Spectroscopy by Inductively Coupled Plasma) and TEM (Transmission Electron Microscopy). From these actinomycetes, 100% viable expressed morphological characteristics of Streptomyces. For the test of PCR the following species were identified Streptomyces parvulus (40%), Streptomyces bullii (10%), Streptomyces seoulensis (10%), Streptomyces owasiensis (10%), Streptomyces malasyensis (20%), Streptomyces lavendulae (10%). By the method agar block antimicrobial activity was confirmed and 80% of the bacteria inhibited S. aureus; 30% M. smegmatis and 40% the Candidas (albicans, atlantica and valderwaltii). Only 10% of actinomycetes inhibited the growth of E. coli. When tested across the crude extract to microorganisms test, 50% of the samples inhibited S. aureus; 30% M. smegmatis and 20% proved to be effective against C. albicans, C. atlantica and C. valderwaltii. In these tests the halo diameters varied on average 12 to 29 mm. As for the AgNPs, 100% inhibited the growth of S. aureus and E. coli with halos ranging from 12 to 34 mm. Data indicating the broad spectrum of these bioactive compounds. The AgNPs Streptomyces DPUA 1549, Streptomyces DPUA 1747 and Streptomyces DPUA 1748 showed antagonistic action for greater efficiency. Promising AgNPs showed spherical shape and sizes ranging from 1-40 nm. However, nanoparticles produced by Streptomyces sp. DPUA 1549 were the most efficient with MIC against S. aureus at low concentrations (1.95 μM). Through the images displayed in AFM was observed structural damage on cell membrane of S. aureus. In toxicity tests the AgNPs reduced the proliferation of NIH-3T3 cells. In addition, the cytotoxic activity of this nanomaterial is time dependent. These scientific evidences show the potential application of nanoparticles biosinthesyzed by Streptomyces DPUA 1549 on preparation of products for use in medical, cosmetic and pharmaceutical industries / A Nanotecnologia é uma ciência de sistemas de tamanho nano, compreendida em uma escala de 10-9 m, que propõe criar uma nova organização estrutural capaz de apresentar comportamentos e propriedades diferentes dos materiais atualmente conhecidos e disponibilizados. Por meio da integração com a biotecnologia, o termo “nanobiotecnologia” pode ser empregado para definir o uso de micro-organismos em estudos voltados as indústrias médica, farmacêutica, cosmética, dentre outras. Em virtude do seu potencial biotecnológico por sintetizarem compostos antibacterianos, antifúngicos, antitumorais, antiparasitários, além de outras subtâncias de interesse industrial, as bactérias filamentosas (actinomicetos) apresentam potencial para o desenvolvimento de medicamentos por meio da síntese biológica de Nanopartículas de Prata (AgNPs). Este estudo teve como objetivo avaliar o potencial de síntese de AgNPs com atividade antimicrobiana sobre bactérias patogênicas e fungos oportunistas, utilizando como fonte biomoléculas de espécies de actinomicetos. Dez amostras de actinobactérias foram selecionadas do acervo da Coleção de Cultura-DPUA e foram subcultivados e autenticados em ISP-2A (extrato de levedura-extrato de malte, agar), com base nas características morfológicas. A identificação em nível de espécie foi realizada pela técnica da PCR (Reação em Cadeia da Polimerase). Para síntese biogênica de AgNPs, os actinomicetos foram submetidos a fermentação submersa. O extrato bruto recuperado e as nanopartículas biossintetizadas foram utilizados na determinação da atividade antimicrobiana pelo método de difusão em ágar. As AgNPs que apresentaram ação antagônica significativa foram utilizadas para determinação do MIC (Concentração Inibitória Mínima), Citotoxicidade e caracterizadas por diferentes técnicas, como: espectroscopia de UV-Vis, DLS (Espalhamento Dinâmico de Luz), DRX (Difratometria de Raios X), FTIR (Espectroscopia de Infravermelho com Transformada de Fourier), ICP-OES (Espectroscopia Óptica de Emissão por Plasma Indutivamente Acoplado) e TEM (Microscopia Eletrônica de Transmissão). Dos actinomicetos avaliados, 100% expressaram as características morfológicas viáveis de Streptomyces. Pelo teste da PCR foram identificadas as seguintes espécies, Streptomyces parvulus (40%), Streptomyces bullii (10%), Streptomyces seoulensis (10%), Streptomyces owasiensis (10%), Streptomyces malasyensis (20%), Streptomyces lavendulae (10%). Pelo método bloco de gelose a atividade antimicrobiana foi confirmada e, 80% das bactérias inibiram S. aureus; 30% M. smegmatis e 40% as Candidas (albicans, atlantica e valderwaltii). Apenas 10% dos actinomicetos inibiram o crescimento de E. coli. Quando testado o extrato bruto frente aos micro-organismos teste, 50% das amostras inibiram S. aureus; 30% M. smegmatis e 20% mostrou-se eficiente contra C. albicans, C. atlantica e C. valderwaltii. Nestes testes o diâmetro do halo variou, em média, de 12 e 29 mm. Já para as AgNPs, 100% inibiram o crescimento de S. aureus e E. coli, com halos variando de 12 a 34 mm. Dados que indicam o amplo espectro destes compostos bioativos. As AgNPs de Streptomyces DPUA 1549, Streptomyces DPUA 1747 e Streptomyces DPUA 1748 apresentaram ação antagônica de maior eficiência. As AgNPs promissoras apresentaram forma esférica e tamanhos variando entre 1-40 nm. Contudo, nanopartículas produzidas por Streptomyces sp. DPUA 1549 foram as mais eficientes, apresentando MIC frente a S. aureus, em baixas concentrações (1,95 μM). Por meio das imagens visualizadas em AFM foi possível observar os danos estruturais da membrana celular de S. aureus. Nos testes de toxicidade, as AgNPs reduziram a proliferação de células NIH-3T3. Além disso, a atividade citotóxica deste nanomaterial é dependente do tempo. Estas evidências científicas demonstram a potencial aplicação de nanopartículas biossintetizadas por Streptomyces sp. DPUA 1549 na elaboração de produtos para utilização nas indústrias médicas, cosméticas e farmacêuticas

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-04-12T14:10:10Z No. of bitstreams: 2 Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-04-12T14:10:29Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-12T14:10:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-23 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The emergence of pathogenic agents resistant to conventional drugs has stimulated the search for new classes of antimicrobial and antiparasitic agents from natural sources. Among these, it highlights antimicrobial peptides (AMPs), which have mechanisms not dependent on the interaction with a specific receptor, providing new possibilities for the development of drugs against resistant organisms. The present study aimed to purify and characterize biochemically the peptides of B. atrox and B. jararacussu snakes venoms, as well as to evaluate the antimicrobial and antiparasitic activities of the peptides against the strains: Staphylococcus aureus (ATCC 29213), Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), Escherichia coli (ATCC 25922), Pseudomonas aeruginosa (ATCC 27853), Klebsiella pneumoniae (ATCC 13883); Leishmania amazonensis (IFLA/BR/97/PH8), and Plasmodium falciparum (clone W2, resistant to chloroquine). In this work, we carried out a comprehensive analysis of peptides presents in the venom of B. atrox and B. jararacussu using the combination of Amicon ultrafiltration of 3kDa, high performance liquid chromatography in reverse phase and mass spectrometry with electrospray ionization (Electrospray-Ion Trap-Time of Flight). Sixteen peptides were identified in both venoms, with mass range 444.17 to 1356.73 Da and primary structure between 3 to 13 residues. Among them 13 are unique sequences, including 7 peptides and 6 bradykinin-potentiating peptides (BBPs). The other peptides refer to 2 metallopeptidases inhibitor found in both peptidome venoms, but not described for these species, besides 1 BPP identified in the venom of B. atrox, the BPP-Bax12 with peptide sequence described. Some of the new peptides identified showed antibacterial activity against K. pneumoniae, P. aeruginosa and S. aureus, and low hemolytic activity, but did not demonstrate antiparasitic activity. Therefore, in this study 13 new peptides were identified from the B. atrox and B. jararacussu snake venoms, and some with relevant bacterial activities, which can assist in the development of new drugs against multiresistant microorganisms. / O surgimento de agentes patogênicos resistentes aos fármacos convencionais, têm estimulado a procura de novas classes de agentes antimicrobianos e antiparasitários a partir de fontes naturais. Dentre estes, destacam-se os antimicrobianos (AMPs), que possuem mecanismos não dependentes da interação com um receptor específico, oferecendo novas possibilidades para o desenvolvimento de medicamentos contra microrganismos resistentes. O presente estudo teve como objetivo purificar e caracterizar bioquimicamente o conteúdo peptídico dos venenos das serpentes B. atrox e B. jararacussu, além de avaliar as atividades antimicrobiana e antiparasitárias dos peptídeos frente as cepas: Staphylococcus aureus (ATCC 29213), Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA), Escherichia coli (ATCC 25922), Pseudomonas aeruginosa (ATCC 27853), Klebsiella pneumoniae (ATCC 13883); Leishmania amazonensis (IFLA/BR/97/PH8), e Plasmodium falciparum (clone W2, resistente à cloroquina). Neste trabalho realizou-se uma análise abrangente dos peptídeos presentes nos venenos de B. atrox e B. jararacussu utilizando a combinação de ultrafiltração em Amicon de 3kDa, cromatografia líquida de alta perfomance em fase reversa e espectrometria de massas com ionização por electrospray (Electrospray-Ion Trap-Time of Flight). Foram identificados 16 peptídeos em ambos os venenos, com massas moleculares de 444,17 a 1.356,73 Da e estrutura primária variando de 3 a 13 aminoácidos. Dentre os quais, 13 são sequências únicas, incluindo 7 peptídeos e 6 peptídeos potenciadores de bradicinina (BBPs). Os demais peptídeos referem-se a 2 inibidores de metalopeptidases encontrados em ambos os venenos, porém não descritos para estas espécies, além de 1 BPP identificado no veneno de B. atrox, o BPP-Bax12 com sequência peptídica descrita. Alguns dos novos peptídeos identificados apresentaram atividade antibacteriana contra K. pneumoniae, P. aeruginosa e S. aureus, e baixa atividade hemolítica, porém não demonstraram atividade antiparasitária. Portanto, neste estudo foram identificados 13 novos peptídeos a partir dos venenos de B. atrox e B. jararacussu, e alguns com atividades bacterianas relevantes, que podem auxiliar no desenvolvimento de novos fármacos contra microrganismos multirresistentes.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-05T13:27:43Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Cecília Da Cunha Camilo.pdf: 1238897 bytes, checksum: e26e3eb86bc9e96ee8e82757d4858f3e (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-05T13:28:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Cecília Da Cunha Camilo.pdf: 1238897 bytes, checksum: e26e3eb86bc9e96ee8e82757d4858f3e (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-05T13:28:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Cecília Da Cunha Camilo.pdf: 1238897 bytes, checksum: e26e3eb86bc9e96ee8e82757d4858f3e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-05T13:28:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Cecília Da Cunha Camilo.pdf: 1238897 bytes, checksum: e26e3eb86bc9e96ee8e82757d4858f3e (MD5) Previous issue date: 2012-12-06 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Mycoplasmas are microorganisms lacking cell walls with reduced ability Biosintética, which makes them extremely fastidious growth. The strength of these microorganisms to antimicrobials used in his therapy as tetracyclines, macrolides and quinolones have been reported with increased frequency. The determination of antimicrobial susceptibility is particularly difficult because not shown in broth turbidity which complicates the standardization of the inoculum and are extremely susceptible pH conditions. The method most commonly used for this purpose is based on metabolic inhibition using specific substrates. This study evaluated the susceptibility of isolates of Mycoplasma hominis and Ureaplasma sp. stored in the period from 2011 to 2012. The methodology used for the isolation comprised culture techniques, for storage and freezing of the strains we used selective broth enriched PPLO and BHI, Thawing of isolates was succeeded subculture in broth enriched selective and differential agar A7 for phenotypic characterization. Quantification, identification and antimicrobial susceptibility testing was performed using the the triage system Mycofast Evolution ® Screening (Elitech Group), whose identification is based on bacterial susceptibility by Identibiotiqué system. The susceptibility of the isolates was determined against antimicrobial agents Doxiciclina 8 μg/ml, Roxitromicina 4 μg/ml and Ofloxacina 4 μg/ml, widely used in the empirical treatment of patients with urogenital tract infections. Our study showed high level of resistance of the isolates to doxicycline and ofloxacin. This is the first study involving isolation and susceptibility profile of these agents undertaken in the Amazonia. / Micoplasmas são microrganismos desprovidos de parede celular, com reduzida capacidade Biossintética, o que os torna extremamente fastidiosos ao crescimento. A resistência destes microrganismos aos agentes antimicrobianos utilizados na sua terapia como as tetraciclinas, macrolídeos e quinolonas tem sido relatadas com frequência cada vez maior. A determinação da susceptibilidade a antimicrobianos é particularmente difícil porque não mostram turbidez em caldo o que dificulta a padronização do inóculo e são extremamente susceptíveis as condições de pH. A metodologia utilizada para este fim baseia-se na inibição metabólica utilizando substratos específicos. O presente trabalho avaliou a susceptibilidade de isolados de Mycoplasma hominis e Ureaplasma sp. arrmazenados no período de 2011 a 2012. A metodologia utilizada englobou técnicas de cultura; para a estocagem e congelamento das cepas empregou-se caldo seletivo enriquecido PPLO e BHI, O descongelamento dos isolados foi sucedido de subcultivos em caldos enriquecidos seletivos diferenciais e Agar A7 para caracterização fenotípica. A quantificação, a identificação e o teste de susceptibilidade a antimicrobianos foi realizada através do sistema de triagem Mycofast® Screening Evolution (Elitech Group), cuja identificação se baseia na susceptibilidade bacteriana pelo sistema Identibiotiqué. A susceptibilidade dos isolados foi determinada frente aos antimicrobianos doxiciclina 8 μg/ml, roxitromicina 4 μg/ml e ofloxacina 4 μg/ml, amplamente utilizados no tratamento empírico de pacientes com infecções do trato urogenital. Nosso estudo detectou alto nível de resistência dos isolados armazenados para doxiciclina e ofloxacina. Este é o primeiro estudo envolvendo isolamento e o perfil de susceptibilidade destes agentes realizado na região norte.

A presença de resíduos de antimicrobianos no leite representa um problema de saúde pública, podendo causar reações alérgicas e a seleção de bactérias resistentes aos antimicrobianos. É também um problema econômico interferindo nas culturas lácteas utilizadas na fabricação de derivados. A mastite é a causa mais freqüente para o tratamento de bovinos leiteiros com antimicrobianos. Foram objetivos deste trabalho estudar a influência do processo inflamatório no tempo de eliminação de diferentes antimicrobianos, administrados por via sistêmica ou intramamária em vacas em lactação e avaliar a presença de resíduos detectáveis em tanques resfriadores de propriedades leiteiras, correlacionando com os níveis de mastite nos rebanhos. Foi utilizado teste microbiológico comercial (Delvotest) para a avaliação da corrência de resíduos de antimicrobianos em 60 amostras de leite de tanques resfriadores de propriedades leiteiras e individualmente de 135 vacas em lactação com e sem processo inflamatório na glândula mamária. Foi verificada correlação entre a ocorrência de resíduo de antimicrobiano no tanque resfriador e o aumento da freqüência de mastite clínica (r= 1,0; teste de Spearman).O aumento do período de carência, no leite de glândulas com processo inflamatório, foi observado tanto nos animais tratados por via sistêmica quanto naqueles tratados por via intramamária, ultrapassando o período estipulado pelo fabricante do medicamento. Tal fato foi observado em relação a todos os grupos tratados com diferentes antimicrobianos (betalactâmicos, aminoglicosídeos, tetraciclinas e sulfa) variando de 11 a 60 % das amostras analisadas. Após 72 horas da aplicação de medicamento por via sitêmica, houve diferença significante (p < 0,05, Fisher) entre as amostras de animais com mastite e as de animais com ausência de processo inflamatório, indicando uma maior persistência de resíduo nas amostras de animais com mastite. Na avaliação da influência de inibidores naturais observou-se que 33% das amostras de quartos com mastite clínica e 18% das amostras de quartos com mastite subclínica apresentaram resultados positivos, sendo que na ausência de processo inflamatório todas as amostras apresentaram resultados negativos. A diferença de positividade foi estatisticamente significante, quando foram comparadas as amostras de quartos mamários com mastite clínica com as amostras de quartos mamários com ausência de processo inflamatório (p < 0,05, Fisher). Em síntese concluiu-se que houve uma correlação entre o nível de ocorrência de mastite clínica e a presença de resíduo no leite dos tanques resfriadores de propriedades leiteiras e que glândulas mamárias com processo inflamatório apresentaram maior período de eliminação de resíduos de antimicrobiano pelo leite, em relação às glândulas sem processo inflamatório, muitas vezes ultrapassando o período estipulado pelos fabricantes de medicamentos. Observou-se também que as amostras de leite de animais não tratados, analisadas sem aquecimento prévio, apresentaram positividade demonstrando a influência dos inibidores naturais, produzidos em decorrência do processo inflamatório, nos resultados dos testes microbiológicos, indicando a necessidade de aquecimento das amostras antes da realização dos testes microbiológicos para a detecção de resíduos, para evitar a ocorrência de resultados falso positivos. Como conclusão geral, a análise dos resultados obtidos no presente estudo demonstrou que a mastite interferiu na ocorrência de antimicrobianos no leite. / The presence of antimicrobial residues im milk is a public health concern, because they may cause allergic reactions and may lead to the development of resistance to antimicrobial agents by bacterial strains. It is also an economic problem because it interferes with starter cultures used in dairy products. Mastitis, the inflammatory process of the mammary gla nd, is the main reason to treat dairy cows with antimicrobial agents. The purpose of this study was to verify the influence of mastitis on the withdrawal period of several intramammary and parenteral antimicrobial agents used in lactating cows, as well as to evaluate the presence of detectable antimicrobial residues in bulk tank milk, in relation to the mastitis rates among the studied dairy farms. A total of 60 bulk tank samples of dairy farms and 135 individual samples of healthy and mastitic dairy cows were screened to verify the occurrence of antimicrobial residues with a microbiologic test (Delvotest®). A correlation was detected between antimicrobial residues in bulk tank and high clinical mastitis rates (r= 1.0; Spearman\'s test). A higher withdrawal period, exceeding that determined by the manufacturer, was observed in the milk of mammary glands presenting inflammatory processes, both in animals treated by the parenteral route, and those treated by the intramammary route. This observation ranged from 11 to 60% of the analyzed samples and was verified in all groups treated with different antimicrobial agents (betalactam, aminoglycosides, tetracycline and sulfas). Statistically significant difference was detected (p<0.05, Fisher\'s test) at seventy two hours after the parenteral treatment in samples from animals presenting inflammatory processes, in relation to samples from animals that did not present mastitis. That is, there was a higher withdrawal period in the samples from animals presenting mastitis. In the evaluation of the influence of inflammatory reaction natural inhibitors on Delvotest®, it was verified that 33% of the samples from clinical mastitis quarters and 18% from subclinical mastitis quarters were positive, and that quarter samples without inflammatory processes were negative. These differences were statistically significant (p<0.05, Fisher\'s test). Among the main onclusions, it should be pointed out that there was a correlation between high clinical mastitis rates in the dairy herd and antimicrobial residues in bulk tank milk. Another important result was that mammary glands presenting inflammatory processes exhibited higher withdrawal periods when compared with mammary glands that did not present inflammatory processes, and that sometimes this withdrawal period exceeded the period recommended by the manufacturer. It was also observed that milk samples from untreated animals, when tested without preliminary heating at 80ºC, were positive, due to the occurrence of natural inhibitors produced by the inflammatory process, showing their interference on microbiologic tests. Therefore, it was demonstrated that previous heating is helpful to avoid false positive results when microbiologic tests are used to detect antimicrobial agents residues in milk samples. As an overall conclusion, it was well demonstrated that mastitis interferes in antimicrobial residues in milk.

Lentinula edodes é um cogumelo comestível que possui qualidades nutricionais, terapêuticas e medicinais. Além disso, muitos estudos na área médica têm comprovado que o cogumelo possui efeito antibiótico sobre microrganismos patogênicos ao homem. Na área agrícola, alguns trabalhos realizados com o cogumelo demonstraram possíveis efeitos no controle de fitopatógenos. O presente trabalho teve como objetivo demonstrar a produção de substâncias antimicrobianas por L. edodes ativas sobre Colletotrichum sublineolum, agente causal da antracnose em sorgo, Alternaria solani, responsável pela pinta preta do tomateiro, Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae, agente causal da mancha bacteriana em maracujazeiro e Tobacco mosaic virus (TMV), causador de mosaico foliar em fumo. Para os testes com C. sublineolum e A. solani foram utilizados extratos aquosos de L. edodes, obtidos a partir de basidiocarpos desidratados em pó, dos isolados LE JAB-K, LE 96/22, LE 96/17 e LE 95/01. Os resultados evidenciaram que o extrato aquoso de basidiocarpos do isolado LE 96/22 inibiu o crescimento micelial in vitro e a formação de apressórios por C. sublineolum. Já os extratos dos isolados LE JAB-K e LE 95/01 apresentaram efeito inibitório na germinação de conídios e na formação de apressórios do patógeno. Em contrapartida, os extratos aquosos de basidiocarpos dos diferentes isolados de L. edodes não apresentaram efeito inibitório na germinação dos conídios e no crescimento micelial de A. solani. Por sua vez, os extratos aquosos de basidiocarpos a 20% (v/v) e o filtrado do crescimento micelial de L. edodes, misturados à suspensão de X. axonopodis pv. passiflorae, exibiram redução na multiplicação bacteriana. Todos os extratos aquosos de basidiocarpos dos diferentes isolados testados na multiplicação da bactéria mostraram-se termolábeis, quando autoclavados a 121 °C por 20 min. Em experimentos com plantas de fumo, os extratos aquosos de basidiocarpos dos isolados LE 96/17 e LE 96/22 adicionados à suspensão contendo partículas do TMV reduziram significativamente a ocorrência de lesões locais nas folhas. O extrato aquoso do isolado LE 96/22 apresentou compostos antivirais de natureza termoestável. Finalmente, o extrato aquoso de basidiocarpos do isolado LE 96/22, o qual apresentou a maior atividade antimicrobiana, foi purificado parcialmente por cromatografia de troca aniônica (CTA). O pico V apresentou efeito inibitório no crescimento micelial de C. sublineolum. Por sua vez, a multiplicação de X. axonopodis pv. passiflorae foi inibida pelos picos IV, V e VII. Já os picos I, II e III, obtidos em CTA por gradiente linear de NaCl e o pico I obtido em CTA pelo método “step wise”, reduziram significativamente a infectividade do TMV em plantas de fumo. Com base nesses resultados, evidencia-se a ação de preparações de L. edodes sobre fitopatógenos, o que demonstra o uso potencial do mesmo no controle de agentes causais de doenças infecciosas em plantas. / Lentinula edodes is an edible mushroom that has nutritious, therapeutical and medicinal qualities. Moreover, many studies in the medical area have shown that the mushroom exhibits antibiotic effects on pathogenic microorganism to the man. In the agricultural area, work carried out with the mushroom has demonstrated its possible effects to control phytopathogens. The objective of the present work was to demonstrate the productionof antimicrobial substances of L. edodes active on Colletotrichum sublineolum, causal agent of anthracnose in sorghum, Alternaria solani, responsible for the black spot of the tomato plants, X. axonopodis pv. passiflorae, causal agent of the bacterial spot in passion fruit plants and on Tobacco mosaic virus, causal agent of the mosaic in tobacco plants. For the test with C. sublineolum and A. solani aqueous extracts were obtained from dehydrated fruiting bodies from the shiitake isolates LE JAB-K, LE 96/22, LE 96/17 and LE 95/01. The results showed that the fruiting body aqueous extract from isolate LE 96/22 inhibited micelial growth and appressorium formation by C. sublineolum. The aqueous extracts of isolates LE JAB-K and LE 95/01 exhibited inhibitory effect on conidium germination and on formation of appressorium by the patogen. On the other hand, the extracts of the different isolates of L. edodes did not exhibit inhibitory effect on conidium germination and micelial growth of A. solani. The aqueous extracts of fruiting bodies at 20% (v/v) concentration and filtrate of the micelial growth of L. edodes, when mixed to the suspension of X. axonopodis pv. passiflorae, exhibited decreased on bacterial multiplication. All the aqueous extracts of fruiting bodies tested from the different isolates in the bacterial multiplication were thermobile, when heated at 121 °C for 20 min. In experiments with tobacco plants, the aqueous extracts of fruiting bodies of isolates LE 96/17 and LE 96/22 when added to the suspension of TMV reduced the amount of local lesions on the leaves. When the aqueous extracts of LE 96/22 were heated the antiviral nature was not lost. Finally, the aqueous extract of fruiting bodies from isolate LE 96/22 that presented major antimicrobial activity was partially purified by anion exchange chromatography (AEC). The peak V exhibited inhibitory effect on micelial growth of C. sublineolum. Multiplication of X. axonopodis pv. passiflorae was inhibited by peaks IV, V and VII. Regarding TMV infectivity, peaks I, II and III, obtained in CTA through linear gradient of NaCl, and peak I also obtained through CTA by the method "step wise", significantly reduced virus infectivity in tobacco plants. Based upon these results, it is shown that preparations of L. edodes can interfere whith phytopathogen multiplication, demonstrating its potential to control plant diseases.