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Caracterização de resistência a quinolonas em Salmonella enterica isoladas de materiais de origem avícola do sul do Brasil

Drescher, Guilherme January 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-18T02:01:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000462080-Texto+Completo-0.pdf: 649282 bytes, checksum: e7c3e58982f8ce80fba84600f84c532c (MD5) Previous issue date: 2013 / Salmonella enterica is considered an important zoonotic pathogen that can be responsible by losses in animal production, especially in poultry husbandry. Different classes of antimicrobials have been used as a prophylactic and/or therapeutic in poultry production, highlighting the quinolones, which also are indicated for human use. The wide use of these antimicrobials may contribute to the selection of microorganisms resistant to these drugs. Resistance to quinolones has been assigned to mutations in genes encoding DNA gyrase and topoisomerase IV, in addition to being associated with the presence of plasmid-mediated quinolone resistance (PMQR), especially encoded by qnr and aac(6')-Ib-cr genes. Thus, the aim of this study was to evaluate the presence of efflux pump systems involved in the resistance to quinolones using the efflux pump inhibitor carbonyl cyanide m-chlorophenylhydrazone (CCCP), and identify the presence of resistance determinants to quinolones in isolates of S. enterica from poultry-related material. For this, 36 S. enterica strains resistant to quinolones were used. The reduction of the activity of efflux pump systems was detected in 66. 7% of isolates tested for nalidixic acid and ciprofloxacin with addition of CCCP. Mutation in DNA gyrase was determined by sequencing and analysis of the gyrA gene, and qnr (A, B, D and S) and aac(6')-Ib-cr genes were detected by PCR. Analysis of the gyrA gene sequences in isolates phenotypically resistant to quinolones identify the presence of mutation leading to the alteration Ser83→Phe and Asp87→Gly, Asn or Tyr in 38,9% and 22,2%, respectively. Plasmid profile analysis showed nine profiles with plasmids that ranged from ~2 kb to ~50 kb, and PMQR genes were found in 22. 2% of S. enterica isolates. qnrA and qnrB genes were detected in 11. 1% and 5. 5% of isolates, respectively, and qnrS was found in 2. 7%. None qnrD gene was found in the isolates tested. aac(6')-Ib-cr gene was detected in 8. 3% of the isolates. To our knowledge, this study reports for the first time mutations in gyrA in S. Worthington from poultry, as well as this is the first report of the presence of qnrA, qnrS and aac(6')-Ib-cr in S. enterica isolated from samples related to poultry production chain in Brazil. The presence of resistance determinants to quinolones in S. enterica isolates from poultry leads to concern regarding to potential resistance selection due to the use of these antimicrobials in animal production. / A Salmonella enterica é considerada um importante patógeno zoonótico que pode ser responsável por perdas na produção animal, especialmente na criação de aves. Diferentes classes de antimicrobianos têm sido utilizadas de forma profilática e/ou terapêutica na produção avícola, entre elas destacam-se as quinolonas, que também têm indicação para uso humano. A ampla utilização destes antimicrobianos pode contribuir para a seleção de microrganismos resistentes a estes fármacos. A resistência a quinolonas tem sido atribuída a mutações nos genes da DNA girase e da topoisomerase IV, além de estar associada à presença de determinantes de resistência carreados por plasmídeos (PMQR), especialmente aqueles codificados pelos genes qnr e aac(6’)-Ib-cr. Desta forma, o objetivo do presente trabalho foi avaliar a presença de sistemas de bombas de efluxo envolvidos na resistência a quinolonas utilizando o inibidor Cianeto de Carbonila Clorofenilhidrazona (CCCP), bem como identificar determinantes de resistência a quinolonas em isolados de S. enterica de origem avícola. Para tanto, foram utilizados 36 isolados de S. enterica resistentes quinolonas. A redução na atividade dos sistemas de bombas de efluxo foi observada em 66,7% dos isolados testados para o ácido nalidíxico e para a ciprofloxacina com adição do CCCP. Mutações na DNA girase foram determinadas por sequenciamento e análise do gene gyrA, e os genes qnr (A, B, D e S) e aac(6’)-Ib-cr foram detectados através de PCR. A análise das sequências do gene gyrA nos isolados fenotipicamente resistentes a quinolonas identificou a presença de mutação levando à alteração Ser83→Phe e Asp87→Gly, Asn ou Tyr em 38,9% e 22,2%, respectivamente.A análise do perfil plasmidial revelou nove perfis com plasmídeos que variaram de ~2 kb até ~50 kb e os genes PMQR foram encontrados em 22,2% dos isolados de S. enterica. O gene qnrA e o qnrB foram detectados em 11,1% e 5,5% dos isolados, respectivamente, e o gene qnrS em 2,7%. O gene qnrD não foi encontrado em nenhum dos isolados testados. O gene aac(6’)-Ib-cr foi detectado em 8,3% dos isolados. Até onde se sabe, este trabalho relata pela primeira vez mutações no gene gyrA em S. Worthington de origem aviária, bem como, este é o primeiro relato da presença dos genes qnrA, qnrS e aac(6’)-Ib-cr em cepas de S. enterica isoladas de amostras relacionadas com a cadeia produtiva de frangos no Brasil. A presença de determinantes de resistência a quinolonas em isolados de S. enterica de origem aviária alerta para a possível seleção de resistência pelo uso destes antimicrobianos na produção animal.
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Biologia reprodutiva e seleção dos sítios de nidificação de Emberizoides ypiranganus (aves: passeriformes) em campos de altitude no sul do Brasil

Chiarani, Eduardo January 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-24T01:01:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000462157-Texto+Completo-0.pdf: 2932621 bytes, checksum: df35aa42aa9e48a0e2ee46ce77f834dc (MD5) Previous issue date: 2014 / We studied the breeding biology of the Lesser Grass-finch (Emberizoides ypiranganus), a bird little known regarding your life history, in upland grassland of Mata Atlântica Biome in southern Brazil. We collected data over two breeding seasons (from October to March of 2012-2013 and 2013-2014) in the Parque Estadual do Tainhas (29º 5’ 58” S, 50° 21’ 50” W), in northeastern of Rio Grande do Sul State, Brazil. We monitored 93 nests and assessed several aspects related to reproduction of the species such as territoriality, breeding chronology, characteristics of nests, eggs and nestlings, clutch size, incubation, hatching rate, parental care, reproductive success and habitat features (structure and floristic composition) important in the nest site selection. Breeding begins at the first week of October, peaks in late November, and lasts until early March. The average size of reproductive territories was 1. 1 ± 0. 5 ha. Burned areas had smaller territories and a smaller density of reproductive pairs in comparison with unburned areas. Nests were built in transition zones between dry and wet habitats (49. 5%) or in dry grasslands (48. 4%). Only 2. 1% of nests were built in dense marshes. The structure and floristic composition of nest sites analysis showed that the species selects sites to build nests with higher abundance of grass clumps such as Andropogon lateralis, Schizachyrium tenerum e Sorghastrum setosum. Nests are cup-shape and are built only by female in 3-7 days, at 36. 2 ± 11. 6 cm above the ground. The clutch size is three (67. 3%) or two eggs. The incubation, which is performed by the female, lasts 13 to 14 days and is synchronic. The hatching rate was 93. 5%. Nestlings remain in the nest between nine and 12 days. In most nests the nestlings are feed by both male and female (biparental care).The frequency visits to the nest to feed young did not differ with the nestling ages, but the length of visits was longer when nestlings were one to five days old. The apparent nest success was 41. 9%, while the Mayfield success was 39. 3% and MARK 35%. Predation was the main cause of loss clutches, affecting 76% of the unsuccessful nests. The best model to nest survival includes time-specific factors (nest age and year) and nest site features (nest height and habitat). The daily survival rates decrease through the nest cycle, falling sharply after hatch, on nestling stage. In successful nests the nestling survival was 0. 83 ± 0. 24 and the average productivity 2 ± 0. 76 fledglings/nests. Considering successful and unsuccessful nests, the productivity was 0. 84 ± 1. 11 fledgling/nests. Up to four nest attempts, performed by the same female, were observed in a breeding season. The renesting interval after nest failure was 2. 7 ± 1. 3 days and the average distance among consecutive attempts was 104. 2 ± 60. 2 m. Although there is few available information in literature about the reproduction of Lesser Grass-finch, some basic parameters found are similar to those described. However, many results of this study are unpublished for the species such as territoriality, reproductive success and nest site selection. / Estudamos a reprodução do canário-do-brejo (Emberizoides ypiranganus), uma ave com uma história de vida pouco conhecida, nos campos de altitude do Bioma Mata Atlântica, no sul do Brasil. Coletamos dados durante duas temporadas reprodutivas (de outubro a março de 2012-2013 e 2013-2014) no Parque Estadual do Tainhas (29º 5’ 58” S, 50° 21’ 50” O), no nordeste do Estado do Rio Grande do Sul, Brasil. Monitoramos 93 ninhos e avaliamos diversos aspectos ligados à reprodução da espécie, tais como territorialidade, cronologia da nidificação, características dos ninhos, ovos e ninhegos, tamanho das ninhadas, incubação, taxa de eclosão, cuidado parental, sucesso reprodutivo e características dos habitats (estrutura e composição florística) importantes na seleção dos sítios de nidificação. A reprodução começa na primeira semana de outubro, tem um pico de ninhos ativos na segunda quinzena de novembro, e dura até o início de março. Os territórios reprodutivos têm um tamanho médio de 1,1 ± 0,5 ha. Área onde ocorrem queimadas possuem territórios menores e uma menor densidade de pares reprodutivos em comparação a áreas sem fogo. Ninhos foram construídos em áreas de transição entre ambientes secos e úmidos (49,5%) ou em áreas de campo seco (48,4%). Apenas 2,1% dos ninhos foram construídos em áreas de banhado denso. A análise da estrutura e composição florística dos sítios de nidificação mostrou que a espécie seleciona locais para construção dos ninhos onde há grande abundância de touceiras de gramíneas como Andropogon lateralis, Schizachyrium tenerum e Sorghastrum setosum. Os ninhos têm formato de taça e são construídos apenas pela fêmea em 3-7 dias, a uma altura média 36,2 ± 11,6 cm do solo. A ninhada é de três (67,3%) ou dois ovos. A incubação, que é realizada apenas pela fêmea, dura de 13 a 14 dias e é sincrônica. A taxa de eclosão dos ovos foi 93,5%. Os ninhegos permanecem no ninho entre nove e 12 dias. Na maioria dos ninhos os ninhegos são alimentados pelo macho e pela fêmea (cuidado biparental). A frequência de visitas ao ninho para alimentar os ninhegos não diferiu com suas idades, mas a duração das visitas foi maior no início (ninhegos de 1-5 dias de vida). O sucesso aparente dos ninhos foi 41,9%, enquanto o sucesso calculado pela estimativa de Mayfield foi 39,3% e pelo programa MARK foi 35%. A predação foi a principal causa de perda das ninhadas, afetando 76% dos ninhos insucesso. O melhor modelo para a sobrevivência dos ninhos inclui fatores tempo-específicos (idade do ninho e temporada reprodutiva) e características do local do ninho (altura e habitat). As taxas de sobrevivência diária diminuem ao longo do ciclo de nidificação, caindo bruscamente após a eclosão, na fase de ninhego. Em ninhos sucesso a sobrevivência de ninhegos foi 0,83 ± 0,24 e a produtividade média 2 ± 0,76 filhotes/ninho. Considerarmos ninhos sucesso e insucesso, a produção anual de filhotes foi 0,84 ± 1,11 filhote/ninho. Até quatro tentativas de nidificação foram realizadas por uma fêmea na mesma temporada reprodutiva.O intervalo médio entre a perda de um ninho e uma nova tentativa foi 2,7 ± 1,3 dias e a distância média entre ninhos subsequentes em um território foi 104,2 ± 60,2 m. Embora haja pouca informação disponível na literatura sobre a reprodução de E. ypiranganus, alguns parâmetros básicos encontrados são semelhantes aos já descritos. No entanto, muitos resultados deste estudo são inéditos para a espécie, a exemplo da territorialidade, sucesso reprodutivo e seleção dos sítios de nidificação.
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Efeito de condicionadores químicos sobre a qualidade da cama de frango

Bordignon, Leonardo André Fialkowski 09 July 2013 (has links)
A produção avícola vem crescendo em grandes proporções em todo o Brasil ao longo dos anos, especialmente na região sul do país, sendo uma atividade produtora de resíduos, como a cama de aviário, merecendo grande atenção nas pesquisas na área. O experimento foi desenvolvido em aviário comercial de frango de corte localizado nas dependências da UTFPR Câmpus Dois Vizinhos, onde foram avaliados cinco condicionadores químicos, cal hidratada, gesso agrícola, sulfato de alumínio, super fosfato simples e calcário calcítico, com diferentes formas de parcelamento/aplicação da dose: aplicação única (realizada apenas no primeiro lote) aplicação dividida em duas vezes (primeira parte realizada no primeiro lote e a segunda realizada no quinto lote) e aplicação dividida em três vezes (aplicações realizadas no primeiro, quarto e sétimo lote) e seu desempenho no que se refere à liberação de amônia e CO2 para o ambiente, bem como a composição química do substrato. A aplicação dos tratamentos foi realizada no intervalo entre lotes, onde foram instalados 64 quadros de madeira (boxes) com dimensões de 0,5 m (largura) x 1,0m (comprimento) x 0,10 (altura) , que ficaram alocados na área de pinteiro, e cada quadro representou uma unidade experimental. Após aplicação dos tratamentos foram coletados cerca de 200g de amostra por quadro, que foram utilizadas para realização das análises químicas (pH, teor de nutrientes, umidade, amônia volatilizada e CO2 respirado). Utilizou-se o delineamento inteiramente casualizado em esquema fatorial (16X5) e quatro repetições, sendo o fator “A” composto por 16 tratamentos (cinco condicionadores químicos e três formas de aplicação, mais uma testemunha) e fator “B” composto por cinco lotes avaliados. O teste utilizado foi de comparação de médias, Scott Knott a 5% de probabilidade de erro. Dentre os condicionadores testados e formas de aplicação da dose utilizadas, o sulfato de alumínio apresentou os melhores resultados para diminuição do pH e volatilização de amônia, principalmente quando aplicado de forma parcelada, seguido do superfosfato simples, já a cal hidratada e o calcário não contribuíram para diminuição da volatilização de amônia, resultando em comportamento semelhante ao da testemunha. O gesso agrícola contribui para diminuição na emissão de dióxido de carbono quando aplicado de forma única e parcelada. Nenhum dos condicionadores, na quantidade e formas de aplicações testadas, possui capacidade para alterar o teor de umidade do substrato, sendo que o teor de umidade não foi diferente do manejo usual do aviário, sem utilização de condicionadores. Para os teores de nutrientes da cama, não foram observados ganhos significativos na composição química final, quando avaliado N e K da cama com o uso de condicionadores químicos e diferentes formas de aplicação, quando analisado a cama do ultimo lote. Porém os tratamentos contendo superfosfato simples foram observadas diferença significativa na média, quando comparado com outros tratamentos, devido a composição do superfosfato simples. / Poultry production has grown in large proportions in Brazil over the years, especially in the southern region of the country, being an activity that produced the waste, such as poultry litter, deserving great attention in the research area. The experiment was conducted on avian commercial broiler located on the premises of UTFPR Campus Dois Vizinhos were evaluated in five chemical conditioners: hydrated lime, gypsum, aluminum sulphate, single super phosphate and limestone, with different forms of installment or application rate; i) single (performed only in the first batch) ii) application divided twice (first performed in the first batch and the second held in the fifth batch) and iii) divided into three application times (applications made in the first, fourth and seventh batch) and their performance with regard to the release of CO2 and ammonia to the environment as well as the chemical composition of the substrate. The spraying was performed in the interval between batches, which were installed 64 wooden frames (boxes) with dimensions of 0.5 m (width) x 1.0 m (length) x 0.10 (height), which were allocated in brooding area, and each table represented an experimental unit. After application of the treatments were collected about 200g sample per frame, which were used for the chemical analyzes (pH, nutrient content, moisture, ammonia volatilized and respired CO2). Was used a completely randomized factorial (16x5) and four replicates, where the factor "A" consists of 16 treatments (five and three chemical conditioners application forms, plus a control) and Factor "B" consists of five lots evaluated. The test was used to compare means, Scott Knott at 5% probability. Among conditioners and tested ways of applying the dose used, aluminum sulfate showed the best results for lowering the pH and ammonia volatilization, particularly when applied in a piecemeal manner, followed by superphosphate, as hydrated lime and limestone did not contribute to decrease in ammonia volatilization, resulting in behavior similar to the witness. The gypsum contributes to reduction in the emission of carbon dioxide when applied in a unique way and parcels. None of the conditioners, the amount and types of applications tested, has the capacity to change the moisture content of the substrate, while the moisture content was not different from the usual management of the aviary, without the use of conditioners. For the nutrient content of the poultry litter was not observed significant gains in final chemical composition, where N and K to the estimated poultry litter with the use of chemical conditioners and different forms of application, where the last analyzed poultry litter batch. However superphosphate containing treatments were observed significant difference in average, when compared with other treatments due to the composition of superphosphate.
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Comparação de três diferentes modelos animais para avaliação de patogenicidade de cepas de Pasteurella multocida isoladas de aves e suínos, e associação da patogenicidade a diferentes grupos moleculares

Pilatti, Roberta Marmitt January 2018 (has links)
Apesar de ser uma bactéria que compõe a microbiota respiratória, sob algumas circunstâncias pode manifestar-se como um agente patogênico primário ou secundário, causando doença em aves e outros animais. Como agente primário, P. multocida leva a grandes perdas econômicas, causando cólera em aves, rinite atrófica em suínos e septicemia hemorrágica em bovinos e bubalinos. P. multocida é uma espécie heterogênea e a patogenicidade dos isolados pode ser amplamente variável. A suscetibilidade do hospedeiro a essas cepas varia consideravelmente entre espécies. Inoculações experimentais em camundongos e aves são comumente usadas para avaliar a patogenicidade de diferentes cepas, mas os resultados são geralmente subjetivos e pouco mensuráveis. O objetivo deste trabalho foi estabelecer uma nova metodologia para classificar a patogenicidade de cepas de P. multocida, através da formulação de um índice padrão. Para determinar esse índice, foram selecionadas 97 amostras de P. multocida, isoladas de cólera em aves e rinite em suínos. Cem microlitros de uma cultura bacteriana contendo 103 UFC/mL de cada isolado de P. multocida, foram inoculados pela cavidade córioalantoide, em 3 ovos embrionados. Além da mortalidade causada pela infecção, o tempo de morte e as lesões macroscópicas foram avaliados. Diferenças significativas foram observadas entre isolados de aves e suínos em relação aos índices de patogenicidade. O número de lesões e o percentual de bactérias recuperadas dos embriões inoculados também variaram de acordo com a origem do isolado. A partir dos índices observados, os isolados foram distribuídos em três classes de patogenicidade: alta, média e baixa. A avaliação dos diferentes índices de patogenicidade, estudados neste trabalho, permitem o estabelecimento de novos modelos de avaliação de patogenicidade de isolados de P. multocida e podem ser uma alternativa aos modelos subjetivos até então utilizados. A comparação dos índices de patogenicidade obtidos nos diferentes modelos analisados nos permite afirmar que a variação esperada para os diferentes modelos não pode ser observada. A análise dos diferentes perfis genéticos obtidos para as cepas de origem aviária, a partir da clivagem do gene ompH e da técnica de PCR-RFLP também não revelou diferença estatística entre os perfis obtidos e suas respectivas patogenicidades obtidas no modelo experimental de camundongos. / Although it is a bacterium that makes up the respiratory microbiota, under some circumstances it may manifest itself as a primary or secondary pathogen, causing disease in birds and other animals. As a primary agent, P. multocida leads to severe economic losses, causing cholera in birds, atrophic rhinitis in pigs and hemorrhagic septicemia in cattle and buffaloes. P. multocida is a heterogeneous species and the pathogenicity of the isolates can be widely variable. The susceptibility of the host to these strains varies considerably between species. Experimental inoculations in mice and birds are commonly used to evaluate the pathogenicity of different strains, but the results are generally subjective and poorly measurable. The objective of this work was to establish a new methodology to classify the pathogenicity of P. multocida strains by formulating a standard index. To determine this index, 97 samples of P. multocida, isolated from cholera in birds and rhinitis in swine, were selected. One hundred microliters of a bacterial culture containing 103 CFU / mL of each P. multocida isolate were inoculated by the chorioallantoic cavity in 3 embryonated eggs. In addition to infection mortality, time of death and macroscopic lesions were assessed. Significant differences were observed between isolates of birds and pigs in relation to pathogenicity indexes. The number of lesions and the percentage of bacteria recovered from the inoculated embryos also varied according to the origin of the isolate. From the observed indices, the isolates were distributed in three pathogenicity classes: high, medium and low. The evaluation of the different pathogenicity indexes, studied in this work, allows the establishment of new pathogenicity evaluation models of P. multocida isolates and may be an alternative to the subjective models previously used. The comparison of the pathogenicity indices obtained in the different models analyzed allows us to state that the variation expected for the different models can not be observed. The analysis of the different genetic profiles obtained for the strains of avian origin, from the cleavage of the ompH gene and the PCR-RFLP technique also did not reveal statistical difference between the profiles obtained and their respective pathogenicities obtained in the experimental model of mice. Key words: Pasteurella multocida, pathogenicity index, embryonated eggs, mice, chicks.
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Avaliação da equidade e eficiência dos contratos de integração celebrados na avicultura de corte do Distrito Federal

Teixeira, Leisy Mikaelly Alves 23 March 2012 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronegócios, 2012. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2012-09-27T11:17:38Z No. of bitstreams: 1 2012_LeisyMikaellyAlvesTeixeira.pdf: 1696450 bytes, checksum: d6604d78cec7cffadde36672846628c2 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2012-10-02T13:52:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_LeisyMikaellyAlvesTeixeira.pdf: 1696450 bytes, checksum: d6604d78cec7cffadde36672846628c2 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-10-02T13:52:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_LeisyMikaellyAlvesTeixeira.pdf: 1696450 bytes, checksum: d6604d78cec7cffadde36672846628c2 (MD5) / A cadeia produtiva de aves no Distrito Federal tem demonstrado expressivos resultados ao longo das ultimas décadas devido a avanços nos sistemas agroindustriais e organizacional, o que torna o ambiente produtivo extremamente complexo e influencia o surgimento de novas formas de gestão das cadeias produtivas do agronegócio. A estrutura de governança dominante que tem papel formalizador na relação entre a agroindústria e o produtor rural no setor de aves é o contrato de integração vertical, que se apresenta como estratégia de um lado para garantir o fornecimento de aves em escala e padrão de qualidade exigida pelo mercado e do outro como garantia de segurança de mercado para os produtores. As relações contratuais têm se tornado mais sofisticadas e hoje os contratos se apresentam como estruturas que tentam abranger todas as dinâmicas relacionadas à produção e comercialização das aves. Tais relações têm sinalizado a necessidade de uma nova dinâmica na coordenação das cadeias produtivas. Este trabalho tem como objetivo avaliar o modelo de Integração entre a agroindústria e os produtores de aves de corte no Distrito Federal. Para tanto foi realizado um estudo do discurso dos principais atores envolvidos no cenário de tramitação do Projeto de Lei 8023/10, bem como dos produtores integrados, agroindústria e representantes do ambiente institucional e organizacional. A análise dos conteúdos verbalizados pelos participantes foi feita por meio do Alceste(Analyse de LexémesCoocurrentdans lês EnnoncésSimple d’unTexte- Análise Lexical Contextual de um Conjunto de Segmentos de Texto), em que foi possível identificar as principais variáveis que influenciam e/ou afetam os contratos de parceria. Algumas categorias de análise emergiram a partir do discurso dos participantes e os resultados foram organizados e interpretados à luz dos quadros referenciais da Teoria de Custos de Transação. Com isso, observou-se que os contratos são percebidos como pouco equitativos e com concentração de poder de determinação econômica, estratégica e administrativa na agroindústria. Havendo assim a necessidade de regulamentação dos contratos de integração no agronegócio, em especial na avicultura, como forma de garantir a equidade e eficiência desta cadeia produtiva. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The productive chain of birds in Distrito Federal has demonstrated expressive results throughout the last decades due to some advances in the agro-industrial and organizational systems, making the productive environment extremely complex and influencing the beginning of new ways of coordination of the productive chains. The structure of the current government that has a main role in the relation between the agro-industry and the agricultural producer in the sector of birds is the contract of vertical integration, that presents itself as a strategy to guarantee supply of birds in scale and standard of quality demanded for the agro-industry and as a pledge of security of market for the producers. These contractual relations have become more sophisticated and today such contracts build structures that try to enclose allthe dynamic related to the production and commercialization of the birds. Such relations have signaled the necessity of a new dynamics in the coordination of the productive chains.This work aims to evaluate the model of integration between the agro-industry and the producers of birds in Distrito Federal. To do that were made analysis of contracts of integration of the effective poultry in Distrito Federal and the study of the speech of the people involved in the transaction of the Project of Law n º 8,023/10, as integrated producers, integrating agro-industry and representatives of the institutional and organizational environment.The analysis of the contents mentioned by the participants was made through the Alceste (Analyse de LexémesCoocurrentdanslêsEnnoncés Simple d’un Texte- Contextual Lexical Analysis of a Set of Segments of a Text), where it was possible to identify the main factors that influence and/or affect contracts of partnership and the perception of these actors on the Project of Law of the study.Later, the manual analysis of content was carried through, as Bardin and some categories of analysis had emerged from the speech of the participants. The results were organized and interpreted to the light of the pictures of the Theory of Costs of Transaction. This wayit was observed that the contracts are perceived as little equitable and with concentration of powers of economic determination, strategical and administrative of the agro-industry. Thus there is the need of regulation of contracts of integration in the agro-business, especially in the poultry in order to guarantee the equity and efficiency of this productive chain.
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Uso de modelos para avaliar a influência da matriz de paisagens fragmentadas sobre aves do Cerrado e da Mata Atlântica

Goulart, Fernando Figueiredo 16 August 2012 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Ecologia, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2012. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-01-31T11:11:44Z No. of bitstreams: 1 2012_FernandoFigueiredoGoulart.pdf: 11227341 bytes, checksum: 3eeb3d5a59bfdcbf0a390a4e6fd4e174 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-02-01T12:43:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_FernandoFigueiredoGoulart.pdf: 11227341 bytes, checksum: 3eeb3d5a59bfdcbf0a390a4e6fd4e174 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-02-01T12:43:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_FernandoFigueiredoGoulart.pdf: 11227341 bytes, checksum: 3eeb3d5a59bfdcbf0a390a4e6fd4e174 (MD5) / CAPÍTULO 1: Resumo A maximização do potencial de conservação de médio a pequenos fragmentos florestais é tônica para a manutenção das espécies da Mata Atlântica, onde manchas de habitat são relativamente pequenas e as populações que as habitam são suscetíveis à extinção local. Uma estratégia para fazer isso é por meio da restauração da matriz da paisagem com da implantação de sistemas agroflorestais. Foi construído um modelo para identificar as regiões em que a restauração da matriz tem maior efeito sobre a conectividade funcional para aves florestais endêmicas. As hipóteses testadas são de que (1) a eficácia da restauração da matriz é afetada pelo grau de isolamento da paisagem, e que (2) em graus intermediários de isolamento a eficiência de restauração para a conectividade é máxima. Modelamos a conectividade funcional usando o Índice Integral de Conectividade de quatro espécies de aves endêmicas (Chiroxiphia caudata, Sclerurus scansor, Xiphorhynchus fuscus e Pyriglena leucoptera) em três tipos de matrizes em paisagens da Mata Atlântica. Foram ajustados modelos aditivos generalizados mistos para analisar a influência do isolamento sobre a conversão da matriz. Além disso, foi testado se métrica de isolamento seria o melhor preditor da eficácia da restauração de matriz. A primeira hipótese foi corroborada pelo modelo mas, por outro lado, a segunda hipótese foi confirmada por apenas um único cenário de um total 12. Geralmente a eficácia da restauração está negativamente associada ao isolamento, de modo que uma maior eficácia é encontrada em paisagem em que manchas têm mario área e estão mais próximas umas das outras. Apesar disso, houve uma grande variação na resposta, aspecto que dificultou a generalização dos resultados. A média do índice de proximidade foi melhor preditor da eficiência de restauração do que a média do vizinho mais próximo. O modelo pode ser utilizado para tomadores de decisões e gestores definirem áreas prioritárias para a restauração agroflorestal. _____________________________________________________________________________________________ / CAPÍTULO 2: Resumo Compreender como os diferentes tipos de manejo da matriz de paisagem afetam organismos que habitam manchas de habitat natural é crucial para a conservação biológica. Tal fato se dá uma vez que a maior parte da biodiversidade terrestre habita sistemas agrícolas ou fragmentos de habitat inseridos em uma matriz agrícola. Considerando que a maior parte dessas paisagens agrícolas é composta por sistemas intensivos, ou que correm risco de sofrer intensificação agrícola, uma questão relevante para o manejo é: como a intensificação da matriz agrícola afeta a dinâmica populacional de pássaros habitando fragmentos florestais inseridos nesta matriz? O presente capítulo descreve um modelo qualitativo baseado em Teoria Qualitativa dos Processos e implementado através do software Garp3 para responder esta questão. O modelo descreve uma paisagem composta por um fragmento fonte resistente à extinção e um fragmento alvo no qual eventos populacionais estocásticos podem ocorrer. Se a permeabilidade da matriz exceder um dado limiar espécie específico, propágulos provenientes da fonte alcançam o fragmento alvo. A intensificação agrícola afeta a estrutura espacial da matriz e reduz a permeabilidade da mesma para as aves florestais, reduzindo assim o efeito resgate. Além disso, assume-se que algumas espécies podem usar a matriz como um habitat complementar para a alimentação e que o manejo da matriz pode afetar a base de recursos para essas espécies. Os resultados da simulação sugerem que, se a intensificação da agricultura continuar a ocorrer no domínio Mata Atlântica, as populações de espécies sensíveis que habitam pequenas manchas florestais (situação em que se encontra a maioria das populações que habitam remanescentes florestais) serão altamente suscetíveis à extinção local sem futuros eventos de recolonização. _____________________________________________________________________________________________ / CAPÍTULO 3: Resumo Uma parte significativa da biodiversidade terrestre do mundo utiliza manchas de habitat naturais inseridas em uma matriz agrícola. Neste capítulo, é apresentado um modelo de raciocínio qualitativo para comparar os impactos da agricultura intensiva e do manejo tradicional em comunidades de aves que habitam um mosaico de savana-floresta na ecorregião do Cerrado brasileiro, através da exploração não-numérica e representação explícita do conhecimento das relações causais. As espécies foram agrupadas com base em seu uso distinto do mosaico floresta-savana: especialistas florestais, generalistas florestais e não-florestais. O modelo qualitativo foi desenvolvido utilizando o programa Garp3. Nossos resultados sugerem que a agricultura intensiva leva ao declínio das aves florestais especialistas e espécies não-florestais, enquanto generalistas florestais se mantêm estáveis. Por outro lado, o manejo tradicional pode levar a uma diminuição ou a manutenção das espécies não-florestais e manutenção de ambos os grupos florestais. A substituição do manejo tradicional pela agricultura intensiva pode afetar negativamente as aves do Cerrado.
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Estado de conhecimento e padrões de variação de história de vida de fluvicolinae (Tyrannidae) no novo mundo

Heming, Neander Marcel 07 August 2012 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2012. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-04-24T13:10:15Z No. of bitstreams: 1 2012_NeanderMarcelHeming.pdf: 4497537 bytes, checksum: c62a0d779607594874ab500cd1c761df (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-04-25T12:54:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_NeanderMarcelHeming.pdf: 4497537 bytes, checksum: c62a0d779607594874ab500cd1c761df (MD5) / Made available in DSpace on 2013-04-25T12:54:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_NeanderMarcelHeming.pdf: 4497537 bytes, checksum: c62a0d779607594874ab500cd1c761df (MD5) / A biologia reprodutiva das aves tem um papel fundamental no desenvolvimento da teoria de história de vida. As estratégias de história de vida das aves da região Neotropical diferem notavelmente de seus correspondentes da região Neártica. A América Austral e Neotropical (AAN) possui mais de 30% de toda a diversidade de aves mas a falta de estudos detalhados sobre a biologia das espécies dificulta o teste de hipóteses. Por meio de uma extensa revisão de literatura buscamos registros de tamanho de ninhada, medidas de ovos, massa de ovos e períodos de incubação e de ninhego de todas as espécies de Fluvicolinae. Esta é a segunda maior subfamília dentre os tiranídeos, com 132 espécies. A subfamília Fluvicolinae possui a distribuição mais ampla dentre todos os tiranídeos, ocorrendo desde o extremo sul da América do Sul até o extremo norte da América do Norte além de outras características que fazem desta subfamília um grupo ideal para comparações geográficas e ecológicas. No primeiro capítulo testamos se a quantidade de informação existente é explicada por características dos países e das espécies. Procuramos dados reprodutivos de Fluvicolinae em cerca de 2500 publicações, sendo que 302 publicações, desde 1838 até 2012, continham dados desta subfamília. A quantidade de publicações por país foi positivamente relacionada com o número de universidades, riqueza de espécies de Fluvicolinae e área de cada país e negativamente relacionada com a riqueza total de espécies de cada país. As publicações continham registros de 4751 tamanhos de ninhada, 3952 medidas de ovos, 1152 massas de ovos, 349 períodos de incubação e 285 períodos de ninhego em todo o Novo Mundo. A quantidade de registros de tamanho de ninhada das espécies foi positivamente relacionada com o potencial de amostragem das espécies (porcentagem da área total de distribuição da espécie em cada país multiplicada pelo número de instituições de ensino superior existente no país) e o tamanho da área reprodutiva. Soluções para que se consiga reverter este quadro estão no aumento do número de 2 instituições acadêmicas ao longo da AAN, estabelecimento e melhora de redes de cooperação e pesquisa internacionais e da distribuição de recursos para a educação de forma mais uniforme em todas as regiões. Nos dois capítulos seguintes testamos hipóteses relacionadas com os padrões geográficos de número e volume de ovos. A observação de que as ninhadas aumentam com a latitude levou à formulação de hipóteses relacionando o padrão com a disponibilidade de alimento e a predação de ninhos. Entretanto, a variação latitudinal no tamanho de ninhada ainda é uma questão não resolvida por três razões principais. Primeiro, após o surgimento da hipótese de sazonalidade a hipótese da duração do dia raramente foi testada e a limitação de alimento por meio da densidade populacional foi amplamente aceita como o mecanismo para a variação no tamanho de ninhada. Segundo, embora a limitação de alimento seja amplamente aceita como o maior determinante de tamanho de ninhada, a evidência é basicamente baseada em populações locais. Terceiro, muitos dos padrões de história de vida são baseados no conhecimento biológico do hemisfério norte, que possui menos de 25% de toda a biodiversidade de aves do planeta. Desse modo, analisamos o tamanho de ninhada de Fluvicolinae em ampla escala geográfica com os objetivos de: (1) testar as hipóteses de Lack (1947) e Ashmole (1963) lado a lado, e (2) comparar os hemisférios sul e norte das Américas para testar quais fatores influenciam o tamanho de ninhada ao longo de cada um dos hemisférios. A hipótese de duração do dia e sazonalidade (DDS) explicou 28% da variação total no tamanho de ninhada e ambas as variáveis foram significativas (p < 0,05). De acordo com a regressão parcial a variação explicada compartilhada pelas duas variáveis foi de 17%. A duração do dia explicou 25% no total e 8% sozinha de toda a variação no tamanho de ninhada. A sazonalidade explicou 20% no total e 3% sozinha de toda a variação no tamanho de ninhada. O modelo com as variáveis ecológicas e ambientais explicou 44% da variação total no hemisfério norte e apenas 17% no hemisfério sul. Além disso o tamanho de ninhada teve um aumento menos pronunciado no hemisfério sul do que no hemisfério norte. É notável que o mecanismo de duração do dia proposto por Lack (1947) 3 não tenha sido investigado pela maior parte dos pesquisadores. Além disso, a grande quantidade de variação não explicada no hemisfério sul da América reforça a visão de que os mecanismos precisam ser revisitados para melhorar nossa compreensão sobre como as estratégias de histórias de vida são moldadas. O fato de as aves dos dois hemisférios estarem sujeitas a condições ambientais antagônicas, com a relação latitude e tamanhos de ninhada ser menor no hemisfério sul em relação ao hemisfério norte, é uma grande oportunidade para compreender melhor as estratégias de história de vida. No terceiro capítulo analisamos a variação no volume de ovos, pois o tamanho de postura da maioria das espécies de aves varia muito pouco ao longo de toda a América Austral e Neotropical (AAN). Sabendo-se que vários fatores podem estar relacionado com o volume dos ovos das aves, a investigação deste parâmetro reprodutivo é uma alternativa interessante para se entender as estratégias de história de vida destes organismos. Neste capítulo avaliamos a variação geográfica no volume de ovos de Fluvicolinae e testamos as hipóteses de relacionadas com variáveis ecológicas. Obtivemos 762 registros dos quais 437 foram geo-referenciados, pertencentes a 86 espécies e 31 gêneros das 132 espécies e 38 gêneros de Fluvicolinae. O volume dos ovos tendeu a aumentar em direção ao sul da América do Sul e o padrão foi mantido após controlar pela massa corporal. O modelo explicou 87,4% de toda a variação no volume dos ovos, sendo que o tamanho corporal explicou 83,9% da variação no volume dos ovos. Dos 16,1% da variação residual no volume de ovos (não explicados pela massa corporal), 21,7% (3,5% do total) foram explicados pelos preditores ecológicos utilizados na análise e 78,3% (12,6% do total) não foram explicados. A tendência de aumento no volume de ovos em direção ao sul da América do Sul é um padrão bastante interessante. O número de ovos por ninhada tende a aumentar em direção ao norte do hemisfério norte e este padrão tem sido amplamente discutido. No entanto, este padrão não se repete no hemisfério sul, o que tem chamado a atenção dos pesquisadores. Portanto, considerando-se o tamanho de ninhada menos variável nos passeriformes da América Austral e 4 Neotropical em relação aos da região Boreal, o tamanho dos ovos pode explicar outra fração das estratégias de história de vida no hemisfério sul. Levando em conta a baixa quantidade de variação explicada pelos preditores utilizados neste estudo, a coleta de informações sobre períodos de desenvolvimento poderá ajudar a responder algumas das questões sobre as estratégias de história de vida das aves da América Austral e Neotropical. Portanto, para promover o desenvolvimento da ornitologia da América Austral e Neotropical, os pesquisadores desta região tem um grande número de parâmetros de história de vida de várias espécies para documentar. Além disso, se os parâmetros forem colocados dentro do contexto teórico, além de contribuir para o desenvolvimento da ornitologia Neotropical, os pesquisadores na AAN tem uma oportunidade única de promover o avanço da teoria de história de vida.
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Diferenças na seleção de hospedeiros de Fluvicolinae (Tyrannidae) por Molothrus ater e Molothrus bonariensis (Icteridae)

Souza, Nelma Martelli Toledo de 21 March 2013 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2013. / Submitted by Guimaraes Jacqueline (jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-05-06T12:50:14Z No. of bitstreams: 1 2013_Nelma Martelli Toledo de Souza.pdf: 636292 bytes, checksum: 0a8f5c84ad69bd2ad76b49f7c93091b3 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-05-06T12:50:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_Nelma Martelli Toledo de Souza.pdf: 636292 bytes, checksum: 0a8f5c84ad69bd2ad76b49f7c93091b3 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-06T12:50:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_Nelma Martelli Toledo de Souza.pdf: 636292 bytes, checksum: 0a8f5c84ad69bd2ad76b49f7c93091b3 (MD5) / O parasitismo interespecífico de ninhada é uma estratégia reprodutiva em que a ave parasita coloca seus ovos no ninho de outras espécies e estas realizam todo o cuidado parental. As interações dos parasitas e seus caracterizam uma relação de coevolução, em que cada parte envolvida responde à pressão seletiva imposta pela outra. Molothrus ater (Chupim-de-cabeça-castanha) e Molothrus bonariensis (Vira-bosta) são parasitas obrigatórios de ninhos de aves e estão distribuídos, sendo a ocorrência de M. ater na América do Norte e M. bonariensis na América do Sul, América Central insular e região sul da Flórida nos Estados Unidos. Ambas são generalistas e parasitam mais de 250 espécies cada. Baseando-se em dados existentes na literatura, o objetivo deste trabalho foi testar a hipótese de que a seleção de hospedeiros da subfamília Fluvicolinae (Tyrannidae) por ambos os parasitas se dá de acordo com as características dos ninhos e dos ovos dos hospedeiros. Nossos resultados mostraram que existe diferença na seleção de hospedeiros pelos parasitas, com M. bonariensis considerando as tribos de Fluvicolinae, as características dos ninhos e dos ovos e com M. ater considerando apenas as características dos ovos. Explicações para estas diferenças podem estar relacionadas à frequência de determinados tipos de ninho no ambiente, aos processos coevolutivos resultantes das interações entre as espécies parasitas e hospedeiras e a quanto um ovo torna um ninho mais conspícuo. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Interspecific brood parasitism is a breeding strategy in which the avian parasite lays its eggs in the nests of other species which thereafter provide all parental care. The interactions between parasites and hosts characterize coevolutionary associations, with each involved part responding to selective pressures imposed by the other. Molothrus ater (Brown-headed Cowbird) and Molothrus bonariensis (Shiny Cowbird) are obligate brood parasites. M. ater are distributed in North America and M. bonarineis in South America, Islands of Central America, South Florida in United States. Both species are generalists parasiting more than 250 species each. Based on literature data, the goal of this work is to test the hypothesis that each parasite selects its Fluvicolinae (Tyrannidae) host based on nest and egg traits. Our results show that there is a difference in host selection between brood parasites, since M. bonariensis selects its hosts considering Fluvicolinae tribe, nest and egg traits, and M. ater only egg traits. Explanations for these differences could be related to frequency of some kinds of nest in the environment, coevolutionary processes that result from interactions between brood parasites and hosts and how much an egg highlights a nest.
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Avaliação clínica, laboratorial e detecção de Chlamydophila psittaci em calopsitas (Nymphicus hollandicus) do Distrito Federal, Brasil

Silva, Stela Sampaio 15 February 2013 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Programa de Pós-Graduação em Saúde Animal, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-07-17T12:31:38Z No. of bitstreams: 1 2013_StelaSampaioSilva.pdf: 4584380 bytes, checksum: 258c41c6aa3b8715b3cac80fc95038bf (MD5) / Approved for entry into archive by Leandro Silva Borges(leandroborges@bce.unb.br) on 2013-07-18T21:05:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_StelaSampaioSilva.pdf: 4584380 bytes, checksum: 258c41c6aa3b8715b3cac80fc95038bf (MD5) / Made available in DSpace on 2013-07-18T21:05:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_StelaSampaioSilva.pdf: 4584380 bytes, checksum: 258c41c6aa3b8715b3cac80fc95038bf (MD5) / Psitacídeos, como as calopsitas (Nymphicus hollandicus), são frequentemente criados como animais de estimação. A ordem Psittaciforme é reconhecida como um dos principais reservatórios da bactéria Chlamydophila psittaci, causadora de uma zoonose. Essa bactéria por ser necessariamente intracelular, possui um diagnóstico difícil, normalmente sendo este por métodos sorológicos ou molecular, como a reação em cadeia da polimerase (PCR). A PCR é considerada o método de maior sensibilidade e especificidade para detecção da clamídia. Essa pesquisa visou analisar a ocorrência de C. psittaci em calopsitas de criadores e proprietários do Distrito Federal, através de técnicas de biologia molecular (PCR). Para tal, foram coletadas amostras de sangue e swabs oral e cloacal de 106 aves. Análises sanguíneas foram realizadas para tentar caracterizar eventuais efeitos da infecção sobre a saúde dos animais. Na amostra analisada a ocorrência foi de 0,9%, resultante de apenas uma calopsita positiva. Este animal apresentava diarreia, e escore corporal baixo, sinais clínicos que podem caracterizar infecção por C. psittaci. Não houve alterações hematológicas e bioquímicas na ave positiva, quando comparado com os valores das demais aves analisadas. Ao analisar os valores de hemograma, leucograma e bioquímica sérica das aves negativas para clamídia, quando avaliados fatores: peso, faixa etária, sexo e interação entre esses dois fatores, foi possível notar diferenças estatística em algumas variáveis. As variáveis enzimáticas (FA, AST, proteína total) e heterófilos absolutos são influenciadas pelo sexo, e o hematócrito, hemoglobina e eosinófilos pela faixa etária. A baixa ocorrência de clamídia encontrada pode ser explicada pela boa qualidade sanitária dos locais de origem dessas aves. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Psittacines such as cockatiel (Nymphicus hollandicus) are often raised as pet birds. The Order Psittaciforme is recognized as one of the main reservoirs of the Chlamydophila psittaci bacteria, the ethiological agent of a repiratory zoonosis. This bacteria is an obligate intracellular, usually diagnosed by serological or molecular methods, i.e. Polimerase Chain Reaction (PCR). The PCR is considered the test with the best sensitivity and specificity for chlamydia detection. The purpose of this dissertation is to analyse the C. psittaci occurence in cockatiels from commercial and non commercial breeders in Distrito Federal, through molecular technique (PCR). For this objective 106 birds were screened by oral and cloacal swab and blood sample. Blood analysis were performed to try to characterize haematological alterations effects on infected birds health. On this sample the prevalence found is 0.9%, from one positive tested cockatiel. The positive bird showed diarrhea, low body score, clinical signs that may characterize infection for clamydia. No haematological alterations were found on the positive bird in comparison to the other tested birds. The hemogram, leukogram, and serum biochemical on the chlamydia negative birds when compared with weight, age groups, sex and age-sex interation in some variables shown statistical difference. The enzimatic variables alkaline phostatase (ALP), aspartate transaminase (AST), total protein, absolute neutrophil count (ANC) are influenced by sex, haematocrit (HCT), haemoglubulin and eosinophils by age. The ocurrence of chlaymdia found may be explained by the good sanitary condition of the breeders facilities.
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Lesões típicas da Doença de Chagas em aves com genoma alterado por integração de seqüências de minicírculos de kDNA de Trypanosoma cruzi

Cardoso, Clever Gomes January 2006 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, 2006. / Submitted by Fernanda Weschenfelder (nandaweschenfelder@gmail.com) on 2009-10-15T16:32:13Z No. of bitstreams: 1 2006_Cléver Gomes Cardoso.pdf: 3825807 bytes, checksum: fa425243c1f9587505e90174fef1191a (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Maia(luanna@bce.unb.br) on 2009-12-03T13:02:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2006_Cléver Gomes Cardoso.pdf: 3825807 bytes, checksum: fa425243c1f9587505e90174fef1191a (MD5) / Made available in DSpace on 2009-12-03T13:02:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006_Cléver Gomes Cardoso.pdf: 3825807 bytes, checksum: fa425243c1f9587505e90174fef1191a (MD5) Previous issue date: 2006 / Acredita-se que a origem e evolução dos seres vivos foram antecedidas por uma complexa rede de interações entre moléculas, microrganismos e células em metazoários. Nesse processo, inúmeros eventos de rearranjo e transferência gênica teriam concorrido para o aumento da complexidade do genoma dos seres hoje existentes. O acúmulo de moléculas de DNA no núcleo das células eucariontes aumentou progressivamente a complexidade da herança genética, configurando um ponto chave na evolução dos organismos. Neste contexto, as evidências trazidas pela pesquisa relatada aqui mostram que os genomas continuam a receber um fluxo de DNA mediante a transferência gênica horizontal (TGH), seguida da herança das novas moléculas pela progênie. Acumulam-se as evidências mostrando que vários genes nos organismos eucariontes são oriundos de procariontes. Até recentemente a TGH era considerada evento raro que teria acontecido apenas em épocas remotas, visto que só era conhecida pela presença de ortólogos em genomas de procariontes e eucariontes. Entretanto, a pesquisa desenvolvida no nosso laboratório mostra que TGH é um evento esperado toda vez que o T. cruzi infecta uma célula eucarionte. O nosso modelo sugere que a barreira refletia apenas a dificuldade de flagrar tal evento entre seres vivos filogeneticamente distantes. Portanto, a noção que TGH seja um processo já extinto ou, na melhor hipótese, de muito baixa freqüência, não foi confirmada. A evidência em favor desta conclusão se encontra nos nossos achados prévios de TGH em coelhos, humanos e aves, onde a transferência de DNA de eucarionte para eucarionte foi documentada. O trabalho apresentado aqui documenta a integração de minicírculos de kDNA de T. cruzi no genoma de aves (TGH) e a sua transmissão vertical (TGV) para a progênie. As galinhas são susceptíveis ao T.cruzi somente nos primeiros dias de desenvolvimento embrionário. Após o oitavo dia de incubação a infecção intra-ovo é eliminada pela imunidade inata do embrião. Verificamos que no período crucial da infecção e do desenvolvimento do embrião ocorre a infecção da célula tronco pelo T. cruzi – ambos em acelerado processo de multiplicação – quando, então, ocorre a TGH. A demonstração de TGH (seqüências de minicírculos de kDNA do T. cruzi) para o genoma da galinha refratária à infecção representa, portanto, um modelo biológico limpo para o estudo da integração de kDNA que gera alterações genotípicas e patologia semelhante àquela da doença de Chagas humana. Indo além, foi documentada TGV pelo cruzamento de aves kDNA-positivas, permitindo a produção de progênie também kDNA-positivas, nas gerações F1, F2 e F3. A comprovação da TGV foi feita pela documentação da integração do kDNA no genoma de espermatozóides e de óvulos das aves kDNA-positivas. As aves kDNA-positivas (F0, F1, F2 e F3) desenvolveram sinais típicos da doença de Chagas: lesões nos músculos estriados cardíaco e esquelético, músculos lisos e gânglios parassimpáticos foram documentadas. Nas galinhas com kDNA integrado em seu genoma (portanto, sem a infecção) observou-se unidades mínimas de rejeição, caracterizadas por infiltrados mononucleares e lise da célula alvo. A confluência de unidades mínimas de rejeição reproduz a miocardite difusa típica da doença letal em hospedeiros mamíferos. Os achados deste estudo sugerem que a alteração genômica causada pela inserção de kDNA possa desencadear reação auto-imune no organismo hospedeiro. De fato, as lesões severas da doença de Chagas em aves com kDNA do parasito em seus genomas são sugestivas de que o T. cruzi é vetor de doença genética. A continuação do estudo que mostra integração de DNA do T. cruzi no hospedeiro, livre do parasito e alterações patológicas oriundas dessa mutação, pode contribuir para a elucidação dos mecanismos patogênicos que associam auto-imunidade com as lesões típicas da doença de Chagas. / It has been said that origin and evolution of live organisms were anticipated by network interactions among molecules, microorganisms and cells into complex metazoa. It appears, in this process took place countless events of horizontal transfer of DNA (HGT) amongst species far distant in the phylogenetic tree, thus promoting increasing complexity of the existing organism genomes. The accumulation of DNA molecules in the eukaryote cell nucleus led to sustainable genetic inheritance, thus portraying a main pathway for the evolution of species. Within this framework, the research reported herein is consistent with the idea that genomes from eukaryotes can receive continuous flow of DNA by HGT. Furthermore, it has also been shown that HGT molecules can be inherited vertically (VGT) by the progeny. These observations are in keeping with previous evidence showing prokaryote orthologues that would have been inherited by eukaryotes. Although until recently HGT had been considered a rare event that took place in early epochs, as suggested by the evidence recently found in the vertebrate’s genome sequencing databank, the research carried out in our Laboratory shows that HGT is indeed a mostly expected event, which could be consistently demonstrated in vitro and in vivo. This demonstration does not confirm a previous concept describing HGT as a rare event, which would occur at a rather low frequency. The data reported here shows that HGT can be detected in each host cell undergoing T. cruzi infections and, therefore HGT was shown in a high ratio of chicks born from T. cruzi–infected eggs. In conjunction, our previous studies have shown a gamut of HGT in different in vitro and in vivo models depicting DNA transfer from eukaryote to eukaryote. The work presented here shows sequences of kDNA minicircles from T. cruzi integrated (HGT) within the chicken genome. Furthermore, crossings of kDNA-positive birds resulted in the transfer of the kDNA integrations (VGT) to progeny. The chickens are refractory to the T. cruzi infections, although the infections could get established in early stages of the embryos; after ten days of incubation the T. cruzi infection could be eliminated by the embryo innate immune response. We verified that in the crucial early period of the infection and embryo development the chick stem cells can be T. cruzi-infected. Thereafter host cell and parasite undergoing accelerated multiplication created the grounds for HGT. The demonstration of HGT of sequences of minicircles of kDNA to the chicken genome represents a clean biological system, since birds are refractory to T. cruzi. Accordingly, the chicken model allowed the study of the kDNA-integration that generate genotype alterations and pathology similar to those described in human Chagas disease. Besides, we have demonstrated VGT by the crossings of kDNA-positive birds, which yielded kDNA-integrated progeny. The kDNA-positive F1, F2 e F3 birds were obtained and proved to carry VGT through the kDNA integrations in male and female gametes. The kDNA-integrated birds (F0, F1, F2 e F3) developed clinical signals typical of Chagas disease: destructive lesions were documented in the striated skeletal and heart muscles, in the smooth muscles and in the parasympathetic ganglia. In the kDNA-integrated but parasite-free birds there were minimal rejection units characterized by the immune system mononuclear cell infiltrates and lyses of the host’s self target cells. The confluence of a gamut of minimal rejection units did reproduce a typical diffuse myocarditis hallmark of Chagas disease affecting mammal hosts. These results show that genomic alterations stemming form kDNA insertion-mutation can provoke auto-immune rejection of host tissues. In fact, the documentation of severe Chagas lesions in kDNA-integrated birds is consistent with our hypothesis that the T. cruzi is vector of a genetic disease. Further studies are required to unravel the practical consequences resulting from the T. cruzi kDNA integration in the parasite-free host organism. Such demonstrate could ultimately show much such kDNA integrations contribute to the development of pathological lesions typical of Chagas disease. Moreover, these studies could elucidate the molecular mechanisms of pathogenesis calling forth auto-immunity in Chagas disease.

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