Desde o surgimento dos sistemas de informação, o problema de integração de dados tem sido alvo de pesquisas na comunidade científica e tecnológica. Vários trabalhos foram publicados propondo alternativas que vão desde integração manual até arquiteturas elaboradas e divididas em camadas. Uma limitação encontrada nessas abordagens é uma deficiência no tratamento da heterogeneidade semântica dos dados no momento da integração, fazendo-o de forma manual e até mesmo intuitiva, formalizando apenas o tratamento das heterogeneidades sintáticas e estruturais. Este trabalho propõe uma abordagem para integração de dados baseada em confederação de ontologias, visando suprir as limitações das arquiteturas e abordagens atuais no tratamento das heterogeneidades semânticas dos dados. Composta de seis camadas, a abordagem integra as bases de dados de forma evolutiva em cinco etapas, tendo como resultado final a base de dados integrada. Para verificação, são apresentados três experimentos, um deles real, feito na CSN - Companhia Siderúrgica Nacional. Como benefício, espera-se expandir as possibilidades de integração de dados, preparando-as para a web semântica e para a crescente fusão de empresas do mesmo ramo de atuação.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-08-05T19:33:36Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Flávio de Assis Vilela - 2015.pdf: 4909033 bytes, checksum: 3266fed0915712ec88adad7eec5bfc55 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-08-08T14:30:29Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Flávio de Assis Vilela - 2015.pdf: 4909033 bytes, checksum: 3266fed0915712ec88adad7eec5bfc55 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-08T14:30:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Flávio de Assis Vilela - 2015.pdf: 4909033 bytes, checksum: 3266fed0915712ec88adad7eec5bfc55 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-10-08 / The increase in quantity and variety of data available on the Web contributed to the emergence of NOSQL approach, aiming at new demands, such as availability, schema flexibility and scalability. At the same time, relational databases are widely used for storing and manipulating structured data, providing stability and integrity of data, which is accessed through a standard language such as SQL. This work presents a method for integrating data stored in heterogeneous sources, in which an input query in standard SQL produces a unified answer, based in the partial answers of relational and NOSQL databases. / O aumento da quantidade e variedade de dados disponíveis na Web contribuiu com o surgimento da abordagem NOSQL, visando atender novas demandas, como disponibilidade, flexibilidade de esquema e escalabilidade. Paralelamente, bancos de dados relacionais são largamente utilizados para armazenamento e manipulação de dados estruturados, oferecendo estabilidade e integridade de dados, que são acessados através de uma linguagem padrão, como SQL. Este trabalho apresenta um método de integração de dados armazenados em fontes heterogêneas, no qual uma consulta de entrada em SQL produz uma resposta unificada, baseada nas respostas parciais de bancos de dados relacionais e NOSQL. Palavras–chave

O projeto e manutenção de bancos de dados é um importante desafio, tendo em vista as frequentes mudanças de requisitos solicitados pelos usuários. Para acompanhar essas mudanças o esquema do banco de dados deve passar por alterações estruturais que muitas vezes prejudicam o desempenho e o projeto das consultas, tais como: relacionamentos desnecessários, chaves primárias ou estrangeiras criadas fortemente acopladas ao domínio, atributos obsoletos e tipos de atributos inadequados. A literatura sobre Métodos Ágeis para desenvolvimento de software propõe o uso de refatorações para evolução do esquema do banco de dados quando há mudanças de requisitos. Uma refatoração é uma alteração simples que melhora o design, mas não altera a semântica do modelo de dados, nem adiciona novas funcionalidades. Esta Tese apresenta um novo processo para aplicar refatorações ao esquema do banco de dados. Este processo é definido por um conjunto de tarefas com o objetivo de executar as refatorações de uma forma controlada e segura, permitindo saber o impacto no desempenho do banco de dados para cada refatoração executada. A notação BPMN foi utilizada para representar e executar as tarefas do processo. Como estudo de caso foi utilizado um banco de dados relacional, o qual é usado por um sistema de informação para agricultura de precisão. Esse sistema, baseado na Web, necessita fazer grandes consultas para plotagem de gráficos com informações georreferenciadas. / The development and maintenance of a database is an important challenge, due to frequent changes and requirements from users. To follow these changes, the database schema suffers structural modifications that, many times, negatively affect its performance and the result of the queries, such as: unnecessary relationships, primary and foreign keys, created strongly attached to the domain, with obsolete attributes or inadequate types of attributes. The literature about Agile Methods for software development suggests the use of refactoring for the evolution of database schemas when there are requirement changes. A refactoring is a simple change that improves the design, but it does not alter the semantics of the data model neither adds new functionalities. This thesis aims at proposing a new process to apply many refactoring to the database schema. This process is defined by a set of refactoring tasks, which is executed in a controlled, secure and automatized form, aiming at improving the design of the schema and allowing the DBA to know exactly the impact on the performance of the database for each refactoring performed. A notation BPMN has been used to represent and execute the tasks of the workflow. As a case study, a relational database, which is used by an information system for precision agriculture was used. This system is web based, and needs to perform large consultations to transfer graphics with geo-referential information.

O monitoramento de forma integrada pode se tornar complexo em ambientes com bancos de dados heterogêneos, devido às particularidades na sintaxe e em ferramentas disponíveis. Em particular, bancos de dados ativos permitem o desenvolvimento de mecanismos e a automação de processos que envolvam os dados ou objetos. Este trabalho propõe o desenvolvimento de uma arquitetura para identificar e monitorar eventos DDL (Data Definition Language), utilizando a abordagem de banco de dados ativos e recomendação. As aplicações desta arquitetura variam desde o simples monitoramento de eventos DDL em um ou mais bancos de dados, até a recomendação de possíveis configurações ou mudanças que podem ser realizadas no banco de dados monitorado. Neste contexto, essa dissertação propõe: (i) uma arquitetura integrada de banco de dados ativos e recomendação; (ii) a adaptação de um algoritmo de recomendação; e (iii) a validação dos conceitos aplicados através de um protótipo. / Integrated environments monitoring can become complex with heterogeneous databases, due to the particularities in the language syntax and available tools. In particular, active databases allow developing mechanisms and automation of processes involving data or objects. This work proposes the development of an architecture to identify and monitor DDL (Data Definition Language), exploring the active databases and recommendations approach. This architecture could be explored in several ways: simple monitoring of DDL events in one or more databases, or recommendation of future DDLs or settings within the monitored database. In this context, this work proposes: (i) an integrated architecture of active databases and recommendation; (ii) the adaptation of a recommendation algorithm; and (iii) the validation of concepts through a prototype.

Made available in DSpace on 2016-03-18T12:15:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 marcia_bezerra_ioc_dout_2012.pdf: 3641805 bytes, checksum: 551d726828aba255caeef4c323eae9ee (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-04-14 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Esta tese descreve o projeto conceitual do sistema de banco de dados ProteinWorldDB (PWDB). Um ponto importante da proposta do PWDB é permitir a construção de consultas e procedimentos no domínio da genômica comparativa sem a necessidade de comparação de sequências. Além disso, o PCG comparou milhões de sequências de proteína, incluindo o conjunto proteico total de centenas de genomas completos, utilizando programação dinâmica, e não um método heurístico, para os cálculos de similaridade. A estratégia do PCG, assim como a genômica, está fundamentada no conhecimento de que sequências biológicas por si só são pouco informativas; elas precisam ser analisadas a partir de um enfoque comparativo para a inferência de homologia. A comparação de sequências de diferentes organismos introduz uma perspectiva evolutiva ao processo, e o estudo comparativo de genomas completos pode ampliar a escala do conhecimento de um único processo biológico para o de sistemas biológicos complexos em células e organismos. Para responder eficientemente questões dessa natureza, o esquema conceitual apresentado associa bases de dados biológicos de referência aos índices de similaridade já pré-calculados e armazenados pelo PCG Utilizando um formato gráfico de fácil compreensão para representar conceitos e relacionamentos (diagrama ER), o esquema foi proposto para facilitar o planejamento de consultas e procedimentos por pesquisadores da área de genômica (sem conhecimento de linguagens de bancos de dados), assim como guiar o desenvolvimento e a implementação física do PWDB por profissionais da área de computação. Alguns exemplos são apresentados com o objetivo de demonstrar a utilização do esquema conceitual para a especificação de consultas e procedimentos, mesmo antes da existência de um esquema lógico. O esquema pode ser facilmente estendido. Módulos anexos podem ser inseridos/removidos para incluir outros projetos, baseados em comparação de sequências de proteína, que se beneficiem das informações fornecidas pelo módulo central do esquema e novas bases de dados, específicas de diferentes áreas (-ômicas, por exemplo), podem ser integradas ao esquema / This thesis describes the conceptua l design of the database system ProteinWorldDB (PWDB) . An important point of the PWDB p roposal is to allow the construction of queries and procedures in the field of comparative genomics without the need for sequence comparison . Moreover , the PCG compared millions of protein sequences, including the entire set of proteins from hundreds of complete genomes using dynamic programming , rather than a heuristic method , for calculating similarity PCG‘s strategy, like that of genomic studies in general, is grounded in the knowledge that biological sequences alone are uninformative. They need to be analyzed from a comparative approach to infer homology. The comparison of sequences from different organisms introduces an evolutionary perspective to the process and the comparative study of complete genomes can expand our knowledge from a single biological process all the way to complex biological systems in cells and organisms. To efficiently answer questions of this nature, the conceptual schema links selected internati onal reference biological databases to similarity indexes already precomputed and stored by the PCG . By using an easily understandable graphic format to represent concepts and relationships (ER diagram), the schema was proposed to help the design of querie s and procedures by genomic researchers (who may not have knowledge of database languages) as well as to guide the development and physical implementation of the system by developers. Some e xamples are presented to demonstrate the use of the conceptual sch ema for specifying queries and procedures, even before the existence of a logical schema. The schema can be easily extended. Additional modules can be inserted/removed to include other protein sequences comparisons projects that may benefit from the inform ation provided by the schema ́s central module. Likewise, new databases specific to different areas ( - omics, for example) can be cross - referenced to the schema / This thesis describes the conceptua l design of the database system ProteinWorldDB (PWDB) . An important point of the PWDB p roposal is to allow the construction of queries and procedures in the field of comparative genomics without the need for sequence comparison . Moreover , the PCG compared millions of protein sequences, including the entire set of proteins from hundreds of complete genomes using dynamic programming , rather than a heuristic method , for calculating similarity PCG‘s strategy, like that of genomic studies in general, is grounded in the knowledge that biological sequences alone are uninformative. They need to be analyzed from a comparative approach to infer homology. The comparison of sequences from different organisms introduces an evolutionary perspective to the process and the comparative study of complete genomes can expand our knowledge from a single biological process all the way to complex biological systems in cells and organisms. To efficiently answer questions of this nature, the conceptual schema links selected internati onal reference biological databases to similarity indexes already precomputed and stored by the PCG . By using an easily understandable graphic format to represent concepts and relationships (ER diagram), the schema was proposed to help the design of querie s and procedures by genomic researchers (who may not have knowledge of database languages) as well as to guide the development and physical implementation of the system by developers. Some e xamples are presented to demonstrate the use of the conceptual sch ema for specifying queries and procedures, even before the existence of a logical schema. The schema can be easily extended. Additional modules can be inserted/removed to include other protein sequences comparisons projects that may benefit from the inform ation provided by the schema ́s central module. Likewise, new databases specific to different areas ( - omics, for example) can be cross - referenced to the schema

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:05:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissRMM.pdf: 1170334 bytes, checksum: 9c5a734da9b30f546e6fb7fe544c6394 (MD5) Previous issue date: 2003-08-11 / A process for the database management system (DBMS) choice in the forward engineering stage, in an object-oriented reengineering is presented. The process was instanced for two particular DBMSs Jasmine and Caché, which a forward engineering case study was developed. The legacy system taken as example was submitted to the reengineering process being used the Sybase relational database management system. This same system was used following the process described in this work and having the Jasmine and Caché DBMSs to data persistence. Of this way, three versions could be obtained for a same system. A comparative analysis of three versions also consists of this work. / Um processo para a escolha do sistema gerenciador de banco de dados (SGBD) na etapa de engenharia avante, em um processo de reengenharia orientada a objetos, é apresentado. O processo foi instanciado para dois sistemas gerenciadores de bancos de dados particulares Jasmine e Caché, com os quais um estudo de caso foi desenvolvido. O sistema legado tomado como exemplo foi submetido ao processo de reengenharia sendo utilizado o sistema gerenciador de banco de dados relacional Sybase. Esse mesmo sistema foi utilizado seguindo o processo descrito neste trabalho tendo os SGBDs Jasmine e Caché para persistência de dados. Dessa forma, três versões puderam ser obtidas para um mesmo sistema. Uma análise comparativa das três versões também consta deste trabalho.

The usage of specific databases for certain application does not allow the replacement of database or sharing information with other databases by user, without rebuilding the entire application, turning non-trivial the application of the solutions proposed in the literature. This reduces the interoperability among different suppliers of present biomedical data. This paper describes the design and development of a system for interface and management of biomedical signals databases. The system s features includes the use of different databases and the storage of the data for further analysis and was designed using the object-oriented technique, plug-ins and reflection technique, leading to create an application capable of connecting with the different databases. The developed system has capability of storage biomedical information, through the use of adaptive systems and plug-ins, reducing the problems of lack of compatibility between data banks, difficulties in maintenance and integration among them. The experiment results showed that the framework is able to collect patients biomedical data, that may be registered with their clinical features, and interact with differentdatabases. / A utilização de bancos de dados específicos para determinado aplicativo não permite ao usuário a substituição do banco de dados ou o compartilhamento com outras bases de informações sem a reconstrução de todo o aplicativo, tornando não trivial a aplicação das soluções propostas na literatura. Isso reduz a interoperabilidade entre os aplicativos de software de diferentes fornecedores de equipamentos biomédicos existentes. Este trabalho descreve o projeto e o desenvolvimento de um framework para interface e gerenciamento de bancos de dados utilizados em aplicações biomédicas. O sistema se caracteriza por permitir que diferentes bancos de dados possam ser utilizados para diferentes aplicativos a fim de armazenar os dados para posteriores análises. O sistema foi projetado utilizando a técnica de orientação a objetos, plug-ins e reflexão, permitindo criar aplicativos capazes de conectarem-se com os diferentes bancos de dados. Os resultados demonstram que o framework permite a coleta e o armazenamento de informações biomédicas por meio de sistemas adaptativos e de plug-ins, minimizando os problemas de falta de compatibilidade entre bancos, as dificuldades de manutenção e melhorando a integração dos mesmos. / Mestre em Ciências

Submitted by Franciele Moreira (francielemoreyra@gmail.com) on 2018-01-26T12:51:05Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Walisson Pereira de Sousa - 2017.pdf: 2525793 bytes, checksum: 0717fb8c52cc2e89d38f1e7c4a763ec1 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-01-29T10:41:52Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Walisson Pereira de Sousa - 2017.pdf: 2525793 bytes, checksum: 0717fb8c52cc2e89d38f1e7c4a763ec1 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-29T10:41:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Walisson Pereira de Sousa - 2017.pdf: 2525793 bytes, checksum: 0717fb8c52cc2e89d38f1e7c4a763ec1 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-12-11 / Retrieving information using words from a natural language is a simple and already consolidated way to access data on the Web. It would be highly desirable that a similar method could be used to submit queries on databases, thereby freeing the user from learning a query language and knowing the searched database structure. In this sense, a great research effort has been dedicated by the database community in order to develop more efficient query keywords techniques for database access. However, a keyword query can result in a large number of SQL interpretations, most of them irrelevant for the initial query. This work carry out a study of different query interpretations ranking techniques and, finally, proposes a ranking methodology that maximizes the amount of relevant results for keyword queries submitted to relational databases. / Recuperar informações utilizando palavras de uma linguagem natural é uma maneira simples e já consolidada para acessar dados na Web. Seria altamente desejável que um método semelhante fosse utilizado para executar consultas em bancos de dados, liberando assim o usuário do aprendizado de uma linguagem de consulta e o conhecimento da estrutura do banco de dados a ser consultado. Nesse sentido, um grande esforço de pesquisa vem sendo dedicado pela comunidade de Banco de dados, a fim de desenvolver técnicas de consultas com palavras-chave mais eficientes para acesso a bancos de dados. No entanto, uma consulta com palavras-chave pode originar uma grande quantidade de interpretações SQL, boa parte delas resultando em dados irrelevantes para a consulta inicial. Este trabalho realiza um estudo de diferentes técnicas para ranqueamento de interpretações de consultas e, ao final, propõe uma metodologia de ranqueamento que maximiza a quantidade de resultados relevantes para consultas com palavras-chave submetidas a bancos de dados relacionais.

[pt] Este trabalho apresenta uma proposta para utilizar a tecnologia de banco de dados para o armazenamento e a gerência de objetos de aprendizado em uma federação de banco de dados (banco de dados distribuído). A crescente evolução no uso de aprendizado eletrônico trouxe o foco para a produtividade na elaboração e gerência do conteúdo dos módulos educacionais. Este conteúdo compreende hoje de vídeos, áudios e de outros dados relacionados, além de textos. Este material é normalmente armazenado pelos instrutores sem maiores preocupações quanto ao compartilhamento. Como membro do projeto PGL (Partnership in Global Learning) - uma organização virtual voltada para pesquisa, desenvolvimento e disseminação do aprendizado através de novas tecnologias - o laboratório de banco de dados da PUC-Rio - TecBD, tem pesquisado a adoção do enfoque de banco de dados para a gerência de objetos de aprendizado (Learning Objects) armazenados em locais interligados formando um ambiente de banco de dados heterogêneos distribuído. Este trabalho visa: 1) utilizando produtos de BD comercialmente disponíveis; 2) adotando os atuais padrões existentes para definição de objetos de aprendizado; 3) considerando objetos de aprendizado armazenados em locais separados e autônomos; 4) desenvolver uma aplicação (protótipo) com esses objetos de aprendizado. O modelo de dados adotado estabelece uma estrutura de objetos de aprendizado compostos, via relacionamentos com elementos atômicos e também com elementos compostos. Diferentes abordagens como, por exemplo, Web Services, Java/Servlets e Web Application Servers, foram estudadas para o problema da autonomia e distribuição geográfica. Um protótipo foi construído utilizando o produto IBM DB2 com seus recursos suplementares tais como extensores para dados de áudio, vídeo, imagens, XML e suporte para gerenciamento federado. A exploração dos dados armazenados, via navegador (browser), foi realizada utilizando a camada IBM Net.Data que embora não obrigatória, permitiu realizar a tarefa de um modo simples e disponibilizou uma solução bem integrada com o IBM DB2 e seus complementos. / [en] This work presents a proposal to utilize database technology for storing and managing learning objects in a database federation (distributed database). The evolution of e-learning has brought the focus over the productivity to make and to manage the content of learning modules, which today comprises videos, audio, among other related data, besides the text data. Instructors normally store this material without worry about sharing. As a member of PGL - Partnership in Global Learning - a virtual organization for research, development and dissemination of learning through new technologies - TecBD - the PUC-Rio`s Database Laboratory is researching the use of database approach for managing learning objects stored on interconnected sites composing a heterogeneous distributed database environment. This work intends: 1) using market ready DB products; 2) adopting the actual standards for defining of learning objects; 3) considering learning objects stored on separated and autonomous sites; 4) to develop an application (a study case) with these learning objects. The learning object`s model establishes a structure for composing learning objects by linking atomic elements and also linking composed elements. Different approaches as Web Services, Java/Servlets and Web Application Servers were considered for the geographically distributed problem. A study case was build using the product IBM DB2 with the provided extenders for audio, video, image, XML data and the Federated System Support. The web browser`s explore of the stored data was build using the IBM Net.Data software. Although not exclusive, it provided an easy way to perform this task and also enabled an easy integration with IBM DB2 and its extenders.

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:48:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RenataFV.pdf: 2026641 bytes, checksum: d5edf169c543491b121577470ede0141 (MD5) Previous issue date: 2006-07-13 / Geographic Information System (GIS) are computational tools used to capture, store, consult, manipulate, analyze and print geo-referenced data. A GIS is a multi-disciplinary system that can be used by different communities of users, each one having their own interest and knowledge. This way, different knowledge views about the same reality need to be combined, in such way to attend each community. This work presents a mechanism that allows different community users access the same geographic database without knowing its particular internal structure. We use geographic ontologies to support a common and shared understanding of a specific domain: the coral reefs. Using these ontologies' descriptions that represent the knowledge of the different communities, mechanisms are created to handle with such different concepts. We use equivalent classes mapping, and a semantic layer that interacts with the ontologies and the geographic database, and that gives to the user the answers about his/her queries, independently of the used terms / Sistemas de Informa??o Geogr?fica (SIG) s?o ferramentas computacionais usadas para capturar, armazenar, consultar, analisar e imprimir dados geo-referenciados. Os SIG s?o sistemas multidisciplinares, ou seja, podem ser utilizados por diferentes comunidades de usu?rios, cada uma com seus interesses e conhecimentos pr?prios, Desta forma, diferentes vis?es de conhecimento sobre uma mesma realidade precisam ser combinadas de modo a atender ?s necessidades de cada comunidade. Este trabalho apresenta um mecanismo que permite que diferentes comunidades de usu?rios acessem o mesmo banco de dados geogr?fico sem ter conhecimento de sua estrutura interna. Utilizamos ontologias geogr?ficas para permitir um conhecimento comum e compartilhado a estes diferentes usu?rios sobre um dom?nio espec?fico: os recifes de corais. Usando as descri??es das ontologias, que representam o conhecimento de diferentes comunidades, mecanismos s?o criados para tratar tais diferentes conceitos. Definimos uma camada sem?ntica que faz um mapeamento entre as classes equivalentes das antologias e interage com o banco de dados geogr?fico, retornando ao usu?rio as respostas ?s suas consultas, independente dos termos utilizados