Made available in DSpace on 2016-08-29T15:34:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_7873_DISSERTAÇÃO DE MESTRADO FINAL - PEDRO SOUSA - UFES.pdf: 20585042 bytes, checksum: 4b1415b005638d59aa55ec0281442c5d (MD5) Previous issue date: 2014-07-22 / A baciloscopia é o principal método diagnóstico da tuberculose (TB) em razão do seu baixo custo, rapidez e facilidade de execução. Porém sua sensibilidade é baixa, principalmente nas formas paucibacilares da doença. Nesse sentido, novas metodologias que resultem no aumento da sensibilidade da baciloscopia tornam-se absolutamente necessárias. Neste estudo, nos propusemos a aprimorar e padronizar o sistema de filtração BacFil e avaliar sua performance e acurácia em amostras paucibacilares (lavado broncoalveolar). Para alcançar esses objetivos desenvolvemos o estudo em duas fases. Na primeira fase, foram realizados ensaios para definir: 1) utilização de membranas brancas para visualização de BAAR corados por Auramina-O; 2) aumento do volume de NALC, utilização de pérolas de vidro no processo de digestão das amostras e mudança no sistema do suporte do pré-filtro; 3) meios de fixação da membrana de filtração na lâmina de microscopia; 4) limite de detecção da técnica; 5) aumento do volume de NaOCl e a influência desse aumento na visualização de BAAR na membrana. Verificou-se que: a membrana de policarbonato branca tem a mesma eficiência da membrana de policarbonato preta na visualização de BAAR fluorescentes; o método modificado utilizando maior concentração de NALC, pérolas de vidro e sistema de pré-filtro baseado em orifícios obteve 98% de passagem das amostras pelo sistema; a melhor forma de fixação da membrana na lâmina foi obtida por intermédio da utilização de fita dupla face; o limite de detecção da técnica de filtração utilizando o sistema BacFil versão 6.0 foi de 2 a 9 BAAR por mililitro de suspensão bacteriana com D.O de 0,250 ± 0,01 a 625nm; o aumento da concentração de NaOCl para 10% ajuda na passagem de um maior volume de amostra pelo sistema, porém ocasiona a diminuição da quantidade BAAR na membrana de filtração após o período necessário para todo o processo. Na segunda fase foi avaliado acurácia da técnica padronizada em 101 amostras de lavado broncoalveolar (LBA) de pacientes com suspeita de TB provenientes do Hospital Universitário Cassiano Antônio de Moraes. Observou-se que a sensibilidade da técnica de filtração (BacFil versão 6.0) foi de 76% e especificidade de 95%. A sensibilidade obtida foi significativamente maior do que a observada na baciloscopia após centrifugação que foi de 59% (p = 0,001). No entanto, constatou-se uma diminuição de especificidade na técnica de filtração (95%) em relação a técnica de 8 centrifugação (99%). Concluímos que as modificações realizadas nos sistema de filtração permitiu sanar os problemas técnicos apresentados nas versões anteriores e aumentar a sensibilidade da baciloscopia de amostras paucibacilares (lavado broncoalveolar) para o diagnóstico da TB pulmonar.

Made available in DSpace on 2015-04-20T12:31:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese Final Luciana Botinelly.pdf: 2352589 bytes, checksum: 2dfaff58148566cdae4e7f8988cc79f7 (MD5) Previous issue date: 2010-10-27 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / In almost all Tuberculosis control programs in the world, sputum smear analyze is the first choice diagnosis tool of the disease. The World Health Organization estimates that 150 million people, between the years 2002 and 2020, would have Tuberculosis, and this would be the minimum number of sputum smears to be performed during this period. The most widely stain used in smear staining is Ziehl-Neelsen s, described for over 125 years. This stain is based on the property that mycobacterias have, including Mycobacterium tuberculosis main causing tuberculosis, to withhold a dye solution composed of fuchsin and phenol (carbolfuchsin) in its cell wall, even after washing with acid-alcohol solution. However, carbolfuchsin is recognized as a carcinogenic substance in rodents, when introduced into diet. There is reference to danger of great harm to human health by prolonged exposure, with irreversible consequences. It is flammable, but heating is recommended for implementation of main coloring technique, which releases combustion gases and vapors hazardous if inhaled. No other less toxic substance was proposed yet. Thus, experimental study of evaluation of twelve alternate dyes on coloring smears was carried out, aimed at implementing in clinical samples suspected of Tuberculosis. In-test dyes solutions were prepared, at different concentrations and without phenol addition. For testing, positive acid-fast bacilli sputum smears and clinical isolate of M. tuberculosis smears were stained without heating, for 5 minutes, bleached with alcohol-acid solution for 1 minute, and counterstained with methylene blue, for 1 minute. The microscopic readings were held in transmitted light and in fluorescence (three filters), at immersion objective (100 x). The most promising dye was the alkaloid from vegetable species (AEV), which allowed fluorescence reading, at green and blue filters, without excessive aggregation to background cells and/or to mucous material present in sputum samples. Sensitivity and specificity tests, and comparison with current bacteriological method confirmed the potential use of AEV. Optimization tests for traditional microscopy reading were made with no success, a fact that indicates other testing. Three purified alkaloids and four alkaloids fractions from amazonian plant species were tested and considered promising for use in mycobacterial stain. They could be added to AEV, providing the ideal dye for Tuberculosis diagnosis, allowing both traditional and fluorescence microscopy. / Em quase todos os programas mundiais de controle da Tuberculose, a avaliação baciloscópica é adotada como primeira opção de exame diagnóstico da doença. A Organização Mundial de Saúde estima que 150 milhões de pessoas, entre os anos de 2002 e 2020, adoecerão por Tuberculose, e este seria o número mínimo de baciloscopias a serem realizadas neste período. A coloração mais utilizada na baciloscopia é a de Ziehl-Neelsen, descrita há mais de 125 anos. Tem como princípio a propriedade que as micobactérias possuem, incluindo o Mycobacterium tuberculosis principal causador da Tuberculose, de reter uma solução corante composta por fucsina básica e fenol (carbolfucsina) em sua parede celular, mesmo após lavagem com solução álcool-ácida. Entretanto, a carbolfucsina é considerada indutora de tumores em roedores, quando introduzida em sua dieta, e há referência a perigo de grande dano para saúde humana em caso de exposição prolongada, com possíveis efeitos irreversíveis. É produto combustível, que em caso de aquecimento, como o recomendado para a execução da principal técnica de coloração, forma gases de combustão e vapores perigosos para inalação. Nenhuma opção de substituto menos tóxico que a carbolfucsina foi até o momento proposto. Desta forma, foi realizado estudo experimental de avaliação de doze corantes alternativos na execução de coloração baciloscópica para micobactérias, visando aplicação em amostras clínicas submetidas ao diagnóstico laboratorial da Tuberculose. Para tanto, foram preparadas soluções dos corantes em teste - em diferentes concentrações e sem adição de fenol. Para os testes, baciloscopias positivas para BAAR, obtidas a partir de amostras de escarro e de isolado clínico de M. tuberculosis, foram coradas sem aquecimento, por 5 minutos, descoradas com solução álcool-ácido por 1 minuto, e contra-coradas com azul de metileno, por 1 minuto. As leituras microscópicas foram realizadas em campo claro e em fluorescência (três filtros), objetiva de imersão (aumento de 100x). O corante mais promissor foi o alcalóide de espécie vegetal (AEV), o qual permitiu visualização bacilar, em microscopia de fluorescência, filtros azul e verde, sem agregação excessiva às células de fundo e/ou à secreção mucóide presente em amostras de escarro. Testes de sensibilidade de detecção bacilar, de especificidade, e comparativo com método bacteriológico tradicional confirmaram o potencial de utilização do AEV. Testes de otimização visando sua utilização para leitura em microscopia tradicional foram realizados, sem obter sucesso, fato que indica a realização de novos testes. Três alcalóides purificados e quatro frações alcaloídicas de possíveis fontes amazônicas do AEV foram testados e considerados como promissores para uso na coloração de micobactérias. Estes podem ao serem agregados ao AEV, propiciar o corante ideal para o diagnóstico da Tuberculose, permitindo visualização tanto à microscopia tradicional, quanto à de fluorescência.

Made available in DSpace on 2015-04-22T22:14:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Final Ligia Fernandes.pdf: 2811593 bytes, checksum: 312a7e1d62749a702608b0cc76ff30c0 (MD5) Previous issue date: 2010-06-24 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Objective: to verify through bacteriological examination and polymerase chain reaction (PCR) the presence of M. leprae in periodontium, saliva and skin slit smears of the leprosy patients. Methodology: A case detection transversal study took place in a leprosy reference center in the Amazon State. Results: The study included 48 leprosy patients being 15 multibacilary (MB) cases and 33 paucibacilary (PB) cases. The diagnosis of MB patients was confirmed through bacteriological examination and PCR of the skin slit smears, while, 16 (33%) of PB patients were positive in PCR and none in bacteriology examination of the skin smears. Four PB patients with negative PCR skin smears were PCR positive in the periodontium and saliva, 1 positive in saliva and 2 in the periodontium. No sample of periodontium and saliva had positive bacteriological results. A prevalence of 58,3% of periodontal disease (DP) was observed. Conclusion: there was no correlation between DP and the presence of M. leprae; bacteriological examination did not proved to be an efficient technique for analysis of saliva and periodontium; the skin smears PCR technique proved to be most efficient method for to diagnosis PB patients than bacteriological examination; PCR positivity for detection of M. leprae in PB patients can be increase by collecting slit skin smears, periodontium and saliva. / Objetivo: verificar através da Baciloscopia e da Reação em cadeia da polimerase (PCR) a presença do M. leprae no periodonto, saliva e raspados intradérmicos de pacientes com hanseníase. Metodologia: realizou-se um estudo transversal do tipo detecção de casos numa instituição referência de hanseníase no Amazonas. Resultados: O trabalho foi composto por 48 pacientes sendo 15 multibacilares (MB) e 33 paucibacilares (PB). Os pacientes MB tiveram o diagnóstico confirmado pela baciloscopia e PCR de raspados intradérmicos, enquanto que, 16 (33,3%) dos PB foram positivos na PCR e nenhum na baciloscopia. Quatro pacientes PB negativos na PCR de raspados intradérmicos foram positivos no periodonto e na saliva, 1 positivo na saliva e 2 no periodonto. Nenhuma amostra do periodonto e da saliva foi positiva na baciloscopia. Verificou-se uma prevalência de doença periodontal (DP) de 58,3%. Conclusões: não houve relação entre a DP e a presença do M. leprae; a baciloscopia não mostrou ser uma técnica eficiente para análise da saliva e periodonto; a técnica de PCR de raspado dérmico mostrou ser um método mais eficaz no diagnóstico dos PB do que a baciloscopia; a positividade da PCR para detecção do M. leprae nos PB pode ser aumentada coletando raspado intradérmico, periodonto e saliva.

Made available in DSpace on 2016-12-23T13:56:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao de CARLOS GUSTAVO VIEIRA DE MORAIS Mestrado.pdf: 1404624 bytes, checksum: af980fd6a0eace35ef57ef3976406694 (MD5) Previous issue date: 2009-02-16 / Microscopy smear is the primary method for diagnosing pulmonary tuberculosis (TB). The method is fast, inexpensive, and specific for Mycobacterium tuberculosis. However, its sensitivity is relatively low, especially in patients with paucibacillary disease which emphasizes the need for improving and/or development of new methodologies. In this context, the aim of this study was to standardize and assess the accuracy of smear microscopy using polycarbonate membranes after centrifugation of sputum samples by filtration (BacFil System) in TB diagnosis. First, we evaluated the system components and established its operating conditions. Then, to assess the system performance, a total of 450 spontaneous sputum samples from 331 patients suspected of having TB was submitted to direct smear and, after that, digested with NALC and divided into two aliquots. One aliquot was concentrated and submitted to smear microscopy and culture, while the other was treated with a solution containing sodium hypochlorite, ethanol and Triton and filtered through 13mm membranes with 0,8μm pore size in the BacFil System. After filtering, the membranes were transferred to slides, stained and a microscopic semi-quantitative analysis was done. The BacFil System showed a sensitivity of 90,8% (82,7 95,9) compared to 64,4% (53,4 74,3) and 59,5% (43,3 74,4) for the centrifugation method and direct smear, respectively. The method demonstrated a highly significant enhancement in sensitivity, operational safety, low cost and also spares the use of a centrifuge. Although BacFil is a very promising method for early diagnosis of TB, we consider it must be improved and evaluated in a multicentric study (Phase III) before its use in a laboratory routine / A baciloscopia é o principal método para o diagnóstico da Tuberculose (TB), em razão de sua simplicidade, rapidez e baixo custo. Porém sua sensibilidade é baixa, principalmente nas formas paucibacilares da doença o que corrobora a necessidade de aprimoramento ou desenvolvimento de novas metodologias. Diante deste fato, nos propusemos padronizar e avaliar a acurácia do exame de baciloscopia em membrana de policarbonato após concentração de amostras de escarro por filtração (Sistema BacFil), para o diagnóstico da tuberculose pulmonar. Na primeira fase do estudo foram avaliados os componentes do protótipo do sistema e estabelecido suas condições operacionais. Na segunda fase, para avaliação do sistema, um total de 450 amostras de escarro espontâneo de 331 pacientes com suspeita clínica de TB foi submetido à confecção de esfregaços diretos, em seguida, digerido com NALC e dividido em duas alíquotas. Uma alíquota foi concentrada e submetida ao exame de cultura para micobactérias e ao exame de baciloscopia. A segunda alíquota foi tratada com uma solução contendo hipoclorito de sódio, etanol e Triton e em seguida filtrada através de membranas de 13 mm com poros de 0,8m pelo Sistema BacFil. Após o procedimento de filtração as membranas foram transferidas para lâminas, coradas e examinadas semi-quantitativamente no microscópio. Ao analisarmos os resultados deste estudo verificamos que o Sistema BacFil proporcionou uma sensibilidade de 90,8% (82,7 95,9) e especificidade de 100% quando comparado ao exame de cultura. Superior as sensibilidades de 64,4% (53,4 74,3) e 59,5% (43,3 74,4) encontrados respectivamente pelos métodos de concentração por centrifugação e esfregaço direto. Ao avaliarmos criticamente a performance deste método constatamos ainda que o mesmo apresenta segurança operacional, elevada acurácia para o diagnóstico, baixo custo econômico e dispensa o uso de centrifuga. Apesar de reunir estas características que o credencie como um método promissor para o diagnóstico rápido da tuberculose, consideramos ainda que este protótipo (BacFil) deva ser aperfeiçoado e submetido a um estudo multicêtrico (Fase III) para validar a sua performance no diagnóstico da tuberculose pulmonar em condições de rotina

Submitted by Heitor Rapela Medeiros (heitor.rapela@ufpe.br) on 2015-03-06T12:50:43Z No. of bitstreams: 2 TESE_DE_ISABELLA_COIMBRA_DIGITAL-2.pdf: 3431542 bytes, checksum: 554f82f99da3985176c6e73016cd6cbe (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-06T12:50:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE_DE_ISABELLA_COIMBRA_DIGITAL-2.pdf: 3431542 bytes, checksum: 554f82f99da3985176c6e73016cd6cbe (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012-03-15 / O diagnóstico e tratamento da tuberculose (TB) em pacientes infectados pelo HIV representam um importante desafio para a saúde publica, particularmente nos países em desenvolvimento, sendo a principal causa de morte em indivíduos coinfectados. Esta tese, apresentada no formato de dois artigos, teve como objeto de investigação participantes de uma coorte de indivíduos infectados pelo HIV, em investigação (artigo 2) ou tratamento (artigo 1) para tuberculose em dois serviços de referencia para HIV em Pernambuco. Os objetivos dos estudos foram identificar os fatores associados ao atraso no início do tratamento de tuberculose pulmonar em indivíduos infectados pelo HIV e avaliar a acurácia do sistema de pontos adotado pelo Ministério da Saúde do Brasil para o diagnóstico de tuberculose pulmonar em crianças e adolescente adaptado para adultos com suspeita de tuberculose pulmonar e baciloscopia do escarro negativa, em relação ao padrão-ouro do estudo. Esses estudos foram conduzidos a partir de uma coorte de indivíduos adultos infectados pelo HIV, atendidos em dois serviços de referência para HIV, em Pernambuco, no período de julho de 2007 a dezembro de 2010. O primeiro artigo (fatores associados ao atraso no inicio do tratamento para tuberculose pulmonar, em indivíduos infectados pelo HIV), é um estudo de caso controle aninhado à coorte descrita acima, cuja população de estudo foi composta por 242 pacientes participantes da coorte diagnosticados com tuberculose pulmonar. O período entre o aparecimento da tosse e o inicio do tratamento para tuberculose teve mediana de 41 dias, tendo sido esta última definida como ponto de corte para atraso no início do tratamento. Os fatores associados ao atraso foram: astenia, dor torácica, uso de drogas ilícitas e baciloscopia do escarro negativa. O segundo artigo (avaliação da acurácia de um sistema de pontos para o diagnóstico de tuberculose pulmonar com baciloscopia negativa em indivíduos infectados pelo HIV) é um estudo de validação fase III cuja população de estudo foi constituída de 1.276 indivíduos participantes da coorte e que foram suspeitos de tuberculose pulmonar com baciloscopia negativa pelos critérios do estudo, sendo que 128 foram diagnosticados com a doença pelo padrão-ouro do estudo. As variáveis associadas ao diagnóstico de tuberculose foram: tosse, perda de peso, febre, desnutrição, radiografia do tórax e teste tuberculínico reator. Foram testadas três versões do sistema de pontos. O melhor desempenho diagnóstico ocorreu com uma nova pontuação proposta e com ponto de corte ≥ 40, com sensibilidade = 81,2% (74,5 – 88%), especificidade = 78% (75,6 – 80,4%), RV + 3,7, RV- 0,24, VPP = 29,2% (24,5 – 33,9) e VPN = 97,4% (96,4 – 98,4%). Em relação ao atraso no inicio do tratamento os resultados apontaram para a necessidade de uma maior discussão sobre: (1) o papel da astenia e da dor torácica como fatores que podem estar presentes nos pacientes com tuberculose pulmonar em indivíduos infectados pelo HIV, (2) o papel da baciloscopia negativa na coinfecção TB/HIV, (3) a melhor abordagem a ser usada para os usuários de drogas nesta população. Quanto à validação do sistema de pontos, os resultados evidenciaram que a acurácia do sistema de pontos do Ministério da Saúde utilizado para o diagnóstico de tuberculose em indivíduos infectados pelo HIV com baciloscopia negativa limita o seu uso na prática clínica, porém o sistema de pontos com nova pontuação apresentou, na população estudada, uma acurácia semelhante à de outros instrumentos testados, e uma boa capacidade em discriminar pacientes quem não tem tuberculose pulmonar, sendo necessários novos estudos com a aplicação deste sistema de pontos para validá-lo, avaliando assim a sua utilidade no diagnóstico de tuberculose pulmonar em indivíduos infectados pelo HIV com baciloscopia negativa.

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:32:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo8114_1.pdf: 1876927 bytes, checksum: 127c34212ad8cade97feef03b3ca788d (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2006 / A Organização Mundial de Saúde recomenda, em países endêmicos para hanseníase, a classificação operacional baseada no número de lesões para alocação do paciente na poliquimioterapia. Nessa classificação são considerados paucibacilares os pacientes com até cinco lesões cutâneas, e multibacilares, aqueles com mais de cinco. O objetivo desse estudo foi validar a classificação operacional admitindo-se como padrão-ouro a baciloscopia de esfregaços da pele. Por meio de estudo prospectivo, tipo validação de testes diagnósticos, foram analisados 154 casos novos de hanseníase, atendidos no Complexo Hospitalar Clementino Fraga, João Pessoa, Paraíba, Brasil, no período de junho a dezembro de 2005. Consideraram-se as características sócio-demográficas, contato prévio com portadores de hanseníase, tempo de início dos sintomas, número e características clínicas das lesões cutâneas, formas clínicas segundo a classificação de Ridley e Jopling e resultado da baciloscopia. Calcularam-se sensibilidade, especificidade, valores preditivo positivo e negativo da classificação operacional e coeficiente de concordância entre as classificações operacional e baciloscópica. Dos 154 casos, 42 pacientes apresentavam baciloscopia positiva e 112, negativa. Das positivas, 16 (38,1%) apresentavam até cinco lesões cutâneas e, das negativas, 12 (10,7%) apresentavam mais de cinco. A sensibilidade, a especificidade, o valor preditivo positivo e o valor preditivo negativo foram 61,9%, 89,3%, 68,4% e 86,2%, respectivamente. A concordância entre as classificações foi significantemente regular (Kappa=0,528 ± 0.080, p<0,001). Concluiu-se que a classificação operacional apresentou limitações que não invalidam sua operacionalidade. Todavia deve ser, sempre que possível, associada a exames complementares como a baciloscopia, visto a possibilidade de sub-tratamento das formas multibacilares infectantes

Made available in DSpace on 2015-04-22T22:00:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Almir Kimura.pdf: 2106464 bytes, checksum: 9a89064d469c89f8d361f410b4461b20 (MD5) Previous issue date: 2010-10-06 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Tuberculosis is considered a world-wide political issue. It has been known that a third of the world population is infected with the Mycobacterium Tuberculosis bacillus and consequently can develop the disease. The finding of the disease is carried by bacilloscopy, which consists of the counting of bacilli in 100 different fields of a slide with sputum sample smear. This type of work demands a lot of training and has a high false negative rate. In order to increase the performance of the bacilloscopy, the development of an automated system to perform the counting of the bacilli is necessary. Our work is based on the study of initial stage of the automated process, emphasizing the autofocus (AF). We investigated nine autofocus functions (Brenner gradient, energy Laplace, wavelet transformation, variance, normalized variance, autocorrelation, standard-deviation-based correlation, variance of log histogram and entropy), widely used in literature, in order to define the best function for images of bacilloscopy of conventional microscopy stained with Kinyoun method. In order to identify the focus functions that had the best performance the focus curve was evaluated by five criteria (accuracy, range, number of false maxima, width and execution time) with two types of analysis (semiquantitative and quantitative). This methodology was performed on images with high and low density of contents, as well as on images with a lot and few amount of bacillus. The total images for the experiment was 1800. Through this study, it was determined that the best function for this type of image is based on Variance. In order to deepen the results, we performed the same study for Kinyoun images without the final step of staining, because it results in a background image more uniform, which can be used for future applications for the automation of counting of bacilli. For these types of images, the function that showed the best performance was based on Entropy. / A tuberculose é considera um problema público mundial. Estima-se que um terço da população mundial está infectado com o bacilo Mycobacterium Tuberculosis, podendo assim desenvolver a doença. A detecção da doença pode ser realizada pela baciloscopia, que consiste na contagem de bacilos em 100 campos distintos de uma lâmina contendo amostra de secreção pulmonar do paciente. A realização dessa tarefa exige muito treinamento e atenção do executor e, via de regra, apresenta taxa de falsos negativos alta. Para aumentar o desempenho da baciloscopia busca-se desenvolver um sistema automático de contagem de bacilos. O trabalho proposto fundamenta-se no estudo da etapa inicial do processo de automação, qual seja, o foco das imagens de campos das lâminas. Com o intuito de identificar qual métrica é mais adequada para avaliação do foco das imagens de baciloscopia de tuberculose em microscopia convencional, coradas pelo método de Kinyoun, foram investigadas nove métricas de autofoco (gradiente de Brenner, energia do Laplaciano da imagem, transformada de wavelet, variância do nível de cinza, variância normalizada pela média de intensidade, autocorrelação, correlação baseada em desvio padrão, variância do logaritmo do histograma e entropia), amplamente utilizadas na literatura. Para a definição da melhor métrica, curvas de foco foram obtidas e avaliadas utilizando cinco critérios (acurácia, faixa, picos falsos, largura e tempo) e duas análises (semiquantitativa e quantitativa). Essa metodologia foi aplicada a um conjunto representativo de 1800 imagens (- com alta densidade de conteúdo, com baixa densidade de conteúdo assim como em imagens com alta quantidade de bacilos e com baixa quantidade de bacilos). Esse estudo evidenciou que a métrica de melhor desempenho foi a variância do nível de cinza da imagem. A definição da casuística permitiu ainda a avaliação das métricas em imagens provenientes de lâminas preparadas sem o uso do contra corante azul de metileno. Para esse tipo de imagem a métrica que apresentou o melhor desempenho foi a baseada em Entropia.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-01-28T09:47:26Z No. of bitstreams: 2 Tese - Bruna Daniella de Souza Silva - 2015.pdf: 3849700 bytes, checksum: 267d28b0d91fc274ddb5bfd83ed08e5b (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-01-28T09:49:33Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Bruna Daniella de Souza Silva - 2015.pdf: 3849700 bytes, checksum: 267d28b0d91fc274ddb5bfd83ed08e5b (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-28T09:49:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Bruna Daniella de Souza Silva - 2015.pdf: 3849700 bytes, checksum: 267d28b0d91fc274ddb5bfd83ed08e5b (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-02-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Millions of people die every year due to tuberculosis (TB), an infectious disease that have effective treatment, can be prevented and is curable. One of the greatest problems faced by this disease is the latent infection (LTBI), where individuals do not manifest clinical symptoms, is a reservoir of the causing agent, Mycobacterium tuberculosis (Mtb), and can reactive the disease at any time during their life span. Moreover, TB can affect any organ in the body, such as the skin, causing extrapulmonary TB, a rare form of TB, the TB skin. Some of these forms may be more severe than pulmonary TB, causing serious consequences to the patient, contributing to the high mortality rate of this disease. In this context, understanding the immunological events related to the interaction between pathogen and host the development of active disease or latent infection is a crucial point that can contribute to the control of TB. Thus, the objectives of this study were to evaluate the specific immune response of CD8+ T cells and cytokines in cutaneous tuberculosis, latent and active pulmonary TB. Thirty six patients with pulmonary TB, one patient with cutaneous TB and 36 healthy controls, classified as LTBI (N = 13) or negative (TST-, N = 23) by the tuberculin skin test were recruited and the peripheral blood mononuclear cells, plasma and sera from those individuals were collected to perform flow cytometry, ELISA and multiplex bead array analysis. It was observed that patients with active pulmonary TB presented TCD8+ cells with a regulatory profile, expressing IL-10 and TGF-β in a direct relation to the bacillary load. The same profile was observed in the individual with cutaneous TB, an extra-pulmonary form of TB. The findings observed in this studyco nclude that Mtb can modulate CD8+ T cell response in lung and skin tuberculosis, demonstrating the importance of studies assessing the immune interaction between the pathogen and the host. / A tuberculose (TB) é uma doença causada por Mycobacterium tuberculosis, principal agente etiológico da TB humana. Milhões de pessoas morrem todo ano em decorrência da TB, doença infecciosa que tem prevenção, tratamento e cura. Um dos maiores problemas enfrentados com essa doença é a infecção latente (TBIL), onde o indivíduo não manifesta os sintomas clínicos e constitui um reservatório da bactéria, podendo desenvolver a doença ativa em qualquer momento. Além disso, a TB pode afetar qualquer órgão do corpo, como por exemplo, a pele, causando uma forma rara de TB extrapulmonar, a TB cutânea. Algumas dessas formas podem ser mais severas que a TB pulmonar, trazendo consequências graves ao paciente, contribuindo para o alto índice de mortalidade dessa enfermidade. Nesse contexto, entender os eventos imunológicos relacionados à interação entre patógeno e o hospedeiro no desenvolvimento da doença ativa ou da infecção latente é um ponto crucial que pode contribuir para o controle da TB. Diante disso, os objetivos desse trabalho foram avaliar a resposta imune específica de células TCD8+ e citocinas na tuberculose cutânea, latente e pulmonar ativa. Para isso, foram recrutados 36 pacientes com TB pulmonar ativa, 01 paciente com TB cutânea e 36 controles sadios classificados quanto à prova tuberculínica em indivíduos com infecção latente (TBIL = 13) ou não (PT-=23). Foram obtidas, de todos os pacientes, as células mononucleares do sangue periférico, o plasma e o soro para realização dos ensaios de citometria de fluxo e ELISA. Foi observado que os pacientes com TB pulmonar ativa apresentam um perfil regulador de células TCD8+ específicas, com expressão de IL-10 e TGF-β relacionados com a carga bacilar quando comparado aos indivíduos com TBIL e controles sadios PT negativa. Esse mesmo perfil também foi observado e descrito no caso clínico do paciente com TB cutânea. Diante de todos os achados observados nesse trabalho podemos concluir que Mtb pode modular a resposta de células TCD8+ na tuberculose pulmonar e cutânea, demonstrando a importância de estudos que avaliem a interação imunológica entre o patógeno e o hospedeiro tais como este.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-05-20T22:15:19Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_AvaliacaoExternaQualidade.pdf: 1231478 bytes, checksum: 697938e34b15b55d42339ba30568141f (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-05-21T15:40:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_AvaliacaoExternaQualidade.pdf: 1231478 bytes, checksum: 697938e34b15b55d42339ba30568141f (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-21T15:40:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_AvaliacaoExternaQualidade.pdf: 1231478 bytes, checksum: 697938e34b15b55d42339ba30568141f (MD5) Previous issue date: 2010 / A baciloscopia de escarro é o exame mais difundido para o diagnóstico e controle da Tuberculose (TB), por ser um método de simples execução e de baixo custo, porém possui baixa sensibilidade e especificidade. Para que a eficácia e eficiência deste método sejam atingidas, é necessário o estabelecimento e aplicações de normas padrão de execução e leitura de lâminas. Nesse sentido, é fundamental conhecer a qualidade do exame baciloscópico disponível em uma rede de laboratórios. O objetivo deste estudo foi avaliar a qualidade das baciloscopias para diagnóstico e controle da TB realizadas nas Unidades Laboratoriais (UL) pertencentes à rede pública de laboratórios do município de Belém, Pará, no ano 2007, 2008 e 2009. A avaliação foi dividida em três etapas, correspondentes ao ano de confecção das lâminas. Participaram 18 UL que enviaram, regularmente, ao Laboratório Central do Pará, todas as lâminas de baciloscopia confeccionadas por elas para a Avaliação Externa da Qualidade da Baciloscopia (AEQB), que utiliza o método de releitura cega dos esfregaços. Este método compreende uma avaliação técnica dos esfregaços, classificando-os como “Adequados” e “Inadequados”, além da análise de discordância de resultados Falso positivo (FP) e Falso negativo (FN). No período do estudo, 4.117 lâminas foram processadas pelas UL. Na 1ª etapa de avaliação, todas as 18 UL apresentaram lâminas que foram classificadas como inadequadas, sendo que este número diminuiu para 12 UL na 2ª etapa de avaliação e para seis UL na 3ª etapa. Em relação às discordâncias, 03 UL apresentaram discordâncias de FP e 03 UL de FN. Os resultados obtidos no estudo reforçam a necessidade de manter e expandir a AEQB para todas as UL que realizam baciloscopia na rede de laboratórios. / The sputum examination is the most widely used for diagnosis and control of tuberculosis (TB), as a method of simple execution, low cost, but has low sensitivity and specificity. For the effectiveness and efficiency of this method are met, it is necessary for the establishment and application of standard rules of execution and reading of slides. Thus, it is essential to know the quality of smear microscopy available in a laboratory network. The aim of this study was to evaluate the quality of sputum for diagnosis and control of TB conducted in Units Laboratory (UL) belonging to the public laboratories in Belém, Pará, in 2007, 2008 and 2009. The evaluation was divided into three stages, corresponding to the year of manufacture of the sputum blades. Participants UL 18 that sent regularly to the Central Laboratory of Para, all smear slides prepared by them for External Quality Assessment of Smear (AEQB), which uses the method of blind rereading of smears. This method involves a technical evaluation of the smears, describing them as "Adequate" and "Inappropriate", besides the analysis of discrepant results False Positive (FP) and false negative (FN). During the study period, 4117 samples were processed by UL. In the first stage of evaluation, all 18 UL had blades that were classified as inadequate, and this number decreased to 12 UL in the 2nd stage of evaluation and UL for six at the 3rd step. Regarding disagreements, disagreements had 03 UL 03 UL FP and FN. The results obtained in this study reinforce the need to maintain and expand AEQB for all UL performing smear in the network of laboratories.

Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-07-15T14:04:04Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Clahildek Matos Xavier.pdf: 23017599 bytes, checksum: f3e0230fd866c0a784966606404bb807 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-15T18:37:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Clahildek Matos Xavier.pdf: 23017599 bytes, checksum: f3e0230fd866c0a784966606404bb807 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-15T18:47:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Clahildek Matos Xavier.pdf: 23017599 bytes, checksum: f3e0230fd866c0a784966606404bb807 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-15T18:47:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Clahildek Matos Xavier.pdf: 23017599 bytes, checksum: f3e0230fd866c0a784966606404bb807 (MD5) Previous issue date: 2012-07-02 / Não Informada / Tuberculosis (TB) is a contagious disease caused by Mycobacterium tuberculosis that primarily affects the lungs and reaches over 8.8 million people worldwide. Although the number of cases of TB disease and deaths has fallen over the past years, this disease still remains a serious health problem in developing countries. Currently, as initial tests for the diagnosis of TB are used methods of smear bright field and fluorescence. The first is used mostly in developing countries, due to low cost, the second is the preferred method in developed countries to be more sensitive. Among the many challenges for the control of this disease is the development of a rapid, efficient and low cost for the diagnosis of tuberculosis. The process of diagnosis of smear-field course is time consuming, manual and error-prone, so that there is a high rate of false negatives. Various techniques for pattern recognition in the image smear bright field microscopy have been designed to recognize and count of the rods. This paper describes a new method for segmentation of tubercle bacilli in sputum bright field. The method proposed in this dissertation uses a classifier consisting of a support vector machine. The differential method is proposed in the variables selected for the input of the classifier. They were selected from four color spaces: RGB, HSI, YCbCr and Lab used to both individual characteristics such as subtractions of characteristics of the same color space and different color spaces. We investigated a total of 30 features. The best features were selected using the selection technique scalar features. With the proposed method was reached a sensitivity of 94%. However, further steps for noise reduction are required to minimize the classification errors. / A tuberculose (TB) é uma doença contagiosa causada pelo Mycobacterium tuberculosis que afeta, principalmente, os pulmões e atinge mais de 8,8 milhões de pessoas em todo o mundo. Embora o número de casos de doenças e mortes por TB tenham caído ao longo dos últimos anos, essa doença ainda continua sendo um grave problema de saúde nos países em desenvolvimento. Atualmente, como exames iniciais para o diagnóstico da TB são usados os métodos de baciloscopia de campo claro e baciloscopia de fluorescência. O primeiro é mais usado em países em desenvolvimento, devido ao baixo custo; o segundo é o método preferencial em países desenvolvidos por ser mais sensível. Entre os vários desafios para o controle dessa doença, está o desenvolvimento de um método rápido, eficiente e de baixo custo para o diagnóstico da TB. O processo de diagnóstico de baciloscopia de campo claro é demorado, manual e propenso a erros, fazendo com que haja uma alta taxa de falsos negativos. Várias técnicas de reconhecimento de padrão em imagens baciloscópicas de microscopia de campo claro têm sido desenvolvidas para o reconhecimento e contagem dos bacilos. Este trabalho descreve um novo método para segmentação de bacilos da tuberculose em baciloscopia de campo claro. O método proposto utiliza um classificador constituído por uma máquina de vetores de suporte. O diferencial do mesmo em relação a outros trabalhos está nas variáveis selecionadas para a entrada do classificador. Essas variáveis foram selecionadas a partir de quatro espaços de cor: RGB, HSI, YCbCr e Lab. Investigou-se tanto características individuais, como subtrações de características de um mesmo espaço de cor e de espaços de cores diferentes, num total de 30 características. As melhores características foram selecionadas utilizando-se a técnica de seleção escalar de características. Alcançou-se uma sensibilidade de 94%. No entanto, novas etapas para a redução de ruído são necessárias para minimizar os erros de classificação.