Tesis para optar al Grado de Magíster en Ciencias Animales y Veterinarias mención Ciencias Avícolas. / La campilobacteriosis es una enfermedad emergente transmitida por los alimentos y es la principal enfermedad gastrointestinal en seres humanos en países desarrollados. El desarrollo de resistencia de Campylobacter spp. a los antimicrobianos empleados como tratamiento en personas es un problema de salud pública que está relacionado con el uso inadecuado de estos agentes en los sistemas de salud y en la producción animal. Aún se debe esclarecer la patogenia de esta enfermedad y el mecanismo por el que actúan los factores de virulencia que no son completamente conocidos. En el mundo existe escasa información de la prevalencia de genes de virulencia de Campylobacter spp. aislados de pavos y de igual manera poca información de la susceptibilidad antimicrobiana en esta especie. El objetivo de este trabajo fue determinar los perfiles de resistencia a los antimicrobianos: Ciprofloxacino, Tetraciclina, Eritromicina y Gentamicina de 105 cepas de Campylobacter spp. aisladas de sistemas de producción de pavos, empleando la técnica de Kirby Bauer. Se obtuvieron 76 cepas resistentes a Ciprofloxacino y 42 a Tetraciclina. Ninguna cepa fue resistente a Eritromicina ni a Gentamicina. Del total de la cepas resistentes a Tetraciclina, 41 de ellas fueron multiresistentes (Ciprofloxacino y Tetraciclina). Al mismo tiempo las 105 cepas fueron analizadas por PCR en busca de genes de virulencia asociados con adherencia y colonización (cadF, racR, flaA), invasión (ciaB, pldA), producción de toxinas (cdtA, cdtC) y mimetismo del LPS (wlaN). La prevalencia de cadF fue de 64,8%, racR 45,7%, flaA 53,3%, ciaB 24,8%, pldA 36,2%, cdtA 65,7%, cdtC, 61% y wlaN 21%. Los resultados sugieren que existe un potencial patógeno de algunos de los aislamientos y demuestra la necesidad de implementar un plan de vigilancia con el fin de resguardar la Salud Pública. / Campylobacteriosis is an emerging disease transmitted by foods, it is also a main human gastrointestinal disease in developed countries. The evolvement of Campylobacter spp. resistance to antimicrobials used for treatment in humans is a public health problem, related to the inappropriate use of these agents in animal production and health systems. The pathogenesis of this human disease still needs to be elucidated, since the mechanism by which virulence factors act are not completely known. In the world there is insufficient information on the prevalence of the virulence genes of Campylobacter spp. isolated from turkeys, as well as little information on antimicrobial susceptibility in this species. The aim of this study was to determine the antimicrobial resistance profiles to Ciprofloxacin, Tetracycline, Erythromycin and Gentamicin of 105 strains of Campylobacter spp. isolated from turkey production systems using the Kirby-Bauer technique. As a result we found 76 strains resistant to ciprofloxacin, 42 to Tetracycline, moreover Erythromycin and Gentamicin had no antimicrobial resistance. Of the total tetracycline resistant strains 41 of them were multiresistant (Ciprofloxacin and Tetracycline). These 105 strains were analyzed by PCR for genes associated with virulence adhesion and colonization (cadF, racR, flaA), invasion (ciaB, pldA), toxins production (cdtA cdtC) and mimitims of LPS (wlaN). With a prevalence of 64.8% cadF,45.7% racR, 53.3% flaA, 24.8% ciaB, 36.2% pldA, 65.7% cdtA, 61% cdtC and 21% wlaN. The results suggest that there is a pathogen potential of some of the isolates and demonstrates the necessity of implementing a surveillance plan in order to protect public health.

Memoria presentada para optar al título de Químico Farmacéutico / La introducción de los antibacterianos en la práctica clínica constituye uno de los avances más grandes en la medicina moderna, ya que permitió el control de las enfermedades infecciosas que hasta ese momento eran intratables. Sin embargo, una amenaza creciente disminuye la eficacia de estos fármacos: la resistencia bacteriana frente los antibacterianos, es la capacidad de una bacteria para sobrevivir en concentraciones de antibacterianos que inhiben o matan a otras de la misma especie. Frente esta problemática, varias organizaciones internacionales entre ellas la organización mundial de la salud (OMS) han promovido el desarrollo de nuevos y mejores antibacterianos, enfatizando que si la problemática continua en aumento, la humanidad se quedara sin fármacos para combatir las infecciones bacterianas. En base a los antecedentes, en este trabajo se caracterizarán dos compuestos arilmercaptoquinonicos, diseñados a partir de la estructura de la ubiquinona, buscando intervenir en la cadena transportadora de electrones, componente esencial del metabolismo bacteriano. En estudios previos se demostró que los derivados tienen una potente actividad antibacteriana sobre cepas Gram positivas, ahora es necesario determinar la actividad antibacteriana sobre una población heterogénea de aislamientos clínicos multirresistentes, mediante la determinación de la concentración inhibitoria mínima (CIM) de cada aislamiento y con esto el calculó de parámetros estadísticos como la CIM50 y CIM90. También se determinó la concentración bactericida mínima (CBM) para poder establecer el modo de acción de los compuestos a través del cálculo de la relación CBM/CIM. Por otro parte, se determinó la CIM en presencia de suero humano y albúmina, además del porcentaje de unión a está, para evaluar la actividad de los compuestos en un entorno fisiológico y como se ve influenciada por la presencia de proteínas plasmáticas. Paralelamente, se evaluó el efecto post antibiótico (PAE) de los compuestos, el cual los clasificara en fármacos tiempo-dependiente o concentración-dependiente, y por último se evaluó su actividad en asociación a antibacterianos de uso clínico como lo son vancomicina y linezolid / The introduction of antibacterial agents in clinical practice is one of the greatest advances in modern medicine, as it allowed the control of infectious diseases that were hitherto untreatable. However, an increasing threat decreases the effectiveness of these drugs: bacterial resistance antibacterials, is the ability of bacteria to survive in concentrations of antibacterials that inhibit or kill other of the same species. Faced this problem, several international organizations including the World Health Organization (WHO) have promoted the development of new and better antibacterial, stressing that if the problem continues increasing, humanity was left without drugs to fight bacterial infections. Based on the background, in this paper two arilmercaptoquinonicos compounds, designed from the structure will be characterized ubiquinone, seeking to intervene in the electron transport chain, an essential component of bacterial metabolism. Previous studies demonstrated that derivatives have potent antibacterial activity against Gram positive strains, it is now necessary to determine the antibacterial activity of a heterogeneous population of multiresistant clinical isolates, by determining (MIC) minimum inhibitory concentration of each isolate and this calculating statistical parameters such as MIC50 and MIC90. minimum bactericidal concentration (MBC) was also determined in order to establish the mode of action of the compounds by calculating CBM / CIM relationship. On the other hand, the MIC was determined in presence of human serum albumin and also the percentage binding is to evaluate the activity of the compounds in a physiological environment and as influenced by the presence of plasma proteins. In parallel, the post antibiotic (PAE) of the compounds, which classified in drugs time-dependent or concentration-dependent, and finally its activity was evaluated in association antibacterials clinical use such as vancomycin and linezolid was evaluated / Diciembre de 2021

As bactérias Gram-negativas das famílias Enterobacteriaceae e Pseudomonadaceae são os patógenos mais comumente isolados de infecções. Devido ao crescente aparecimento de micro-organismos resistentes aos antimicrobianos disponíveis para terapêutica, a busca de novos compostos tornou-se eminente, principalmente oriundos de fontes naturais cultiváveis. Os actinomicetos são uma das principais fontes de metabólitos secundários com atividade antibacteriana. Este trabalho teve como objetivo avaliar o potencial do actinomiceto endofítico R18(6) em produzir metabólitos ativos contra bactérias Gram-negativas multirresistentes. Para isto, utilizou-se o teste de dupla camada para avaliar a capacidade de produção de metabólitos ativos pelo actinomiceto. As condições de cultivo, como fontes de carbono, temperatura, pH, modo de incubação e tempo de incubação do isolado, sob cultura submersa, foram otimizadas. A atividade antimicrobiana do isolado foi avaliada a cada 24 horas durante 10 dias utilizando a técnica de difusão em poço, na qual foram medidos os halos de inibição. O actinomiceto mostrou melhor atividade contra as bactérias Gram-negativas testadas quando cultivado em meio base contendo glicose como fonte de carbono, pH ajustado para 6.5, incubação a 30ºC sob agitação constante durante 96 horas. No ensaio de concentração inibitória mínima do extrato bruto, esta variou entre 1/32 e 1/256, e mostrou atividade bactericida ou bacteriostática de acordo com o isolado Gram-negativo. O extrato ativo foi avaliado quando à sua estabilidade térmica e enzimática, o qual se apresentou estável a altas temperaturas e instável às enzimas proteolíticas. O extrato bruto foi submetido à extração com solventes e a acetona mostrou-se eficiente como solvente extrator. A micromorfologia do isolado foi observada em microscopia óptica e de varredura, nos quais apresentou características semelhantes ao gênero Streptomyces. O actinomiceto endofítico R18(6) mostrou ser uma nova fonte promissora para a produção de compostos ativos contra bactérias Gram-negativas multirresistentes. / Gram-negative bacteria of the Enterobacteriaceae and Pseudomonadacea family are the most common pathogens isolated from infections. Due to the increase of microorganisms resistant to antimicrobial agents available for treatment, the search for new compounds, mainly from natural and culturable sources, has become an important issue. The actinomycetes are a major source of secondary metabolites with antibacterial activity. The aim of this work was to evaluate the potential production of active metabolites by the endophytic actinomycete R18(6) against Gram-negative bacteria multiresistant. For this, the double layer method was used to assess the ability of production of active metabolites by the isolate. Based on this assay the culture condition growth of the isolate in submerged culture was optimized. For that as carbon source, temperature, pH, incubation way and incubation time were tested looking for a better metabolite production. The antimicrobial activity of the isolate was evaluated every 24 hours for 10 days by the well diffusion assay, where the inhibition halo was measured. The actinomycete showed the best activity against Gram-negative bacteria when cultured in base medium supplemented with glucose, adjusted in pH 6,5, incubation temperature of 30ºC for 96 hours with agitation. In the microdilution assay the concentration of crude extract varied from 1/32 to 1/256, and it showed bactericidal or bacteriostatic activity according to Gram-negative tested isolate. The thermal and enzymatic stability of crude extract were evaluated, where it exhibited thermal stability in high temperature and it was unstable to proteolytic enzymes. The crude extract was subjected to solvent extraction and acetone was efficient as extractor solvent. The isolate showed similar characteristics of the genus Streptomyces when evaluated by optical and scanning microscopy. The endophytic actinomycete R18(6) showed to be a new and a promising source of active metabolites production against Gram-negative bacteria multidrug resistant.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-04-26Bitstream added on 2014-06-13T19:53:38Z : No. of bitstreams: 1 000737512.pdf: 448616 bytes, checksum: ca9cfa4680cedc19ad31f8680f15521b (MD5) / The florfenicol is an antibiotic used for the treatment of respiratory disease in cattle. Study and understand its pharmacokinetics are important tools for effective control of these diseases and appropriate, thereby minimizing the appearance of resistant bacterial strains. Therefore, this study aimed to determine the pharmacokinetic profile of florfenicol in bovine plasma after intramuscular injection of two doses and evaluate their effectiveness against susceptible bacteria. In the study, we used eight cattle that received two applications of florfenicol and intramuscularly at a dose of 20 mg/kg at intervals of 48 hours. The plasma concentration was determined by high performance liquid chromatography coupled to a mass spectrometer. The minimum inhibitory concentration was performed in a veterinary laboratory following the international standards of the Clinical and Laboratory Standards Institute. Pharmacokinetic parameters were calculated: Cmax = 1.21 ± 0.25 µg/mL, Tmax = 3.43 ± 2.23 h, AUC0-t = 34.16 ± 4.50 h.µg/mL, T½ = 63.46 ± 23.76 h, and Cmax = 1.17 ± 0.20 µg/mL, Tmax = 6.00 ± 0.00 h, AUC0-t = 52.37 ± 5.50 h.µg/mL, T½ = 77.74 ± 43.65 h, respectively for the first and second application. The florfenicol levels in plasma remained above the minimum inhibitory concentration for bacteria: Mannheimia haemolytica (0.75 µg/mL), Pasteurella multocida capsular type A (0.75 µg/mL) and Histophilus sommus (0.30 µg/mL). These results indicate the effectiveness of florfenicol against bacteria that cause respiratory disease of cattle

Orientador : Prof. Dr. Felipe F. Bondan Tuon / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Medicina Interna. Defesa : Curitiba, 09/12/2016 / Inclui referências : f. 46-50;63-65 / Resumo: A ceratite infecciosa e uma causa importante de morbidade ocular e de prejuízo da visão. O diagnostico microbiológico precoce e o tratamento imediato podem evitar um prognostico visual ruim. Os objetivos desse estudo foram: determinar a taxa de positividade das culturas em pacientes com ceratite infecciosa, investigar os fatores associados a culturas positivas, estabelecer as principais etiologias de ceratite em nosso meio e avaliar o grau de concordância entre a cultura e a PCR (reação em cadeia da polimerase) na pesquisa de Acanthamoeba. Pacientes com suspeita de ceratite infecciosa atendidos no serviço de emergência de dois hospitais em Curitiba/PR/Brasil, entre junho de 2014 e abril de 2016 foram selecionados para inclusão no estudo. Os pacientes que preencheram os critérios de inclusão foram submetidos a exame oftalmológico e raspado de córnea para exames laboratoriais. Dados demográficos, historia atual da doença, tratamentos em curso e historia pregressa de comorbidades oculares foram coletados. Setenta e cinco pacientes preencheram os critérios de inclusão. As culturas foram positivas em 41% (31/75) dos exames. Os agentes causadores mais encontrados foram as bactérias (54%;17/31), seguida por fungos (32%;10/31) e Acanthamoeba sp. (16%,5/31)). Os fatores associados com culturas positivas foram o uso de corticoide antes da coleta (p=0,006) e ulceras maiores que 3.62mm2 (p=0,016). Pacientes em uso de antibiótico antes da coleta tiveram maior chance de um resultado de cultura negativo [OR: 3,65 (IC95%: 1,32 - 10,07)]. Em 26 casos foi possível comparar a concordância entre os testes de cultura e PCR na pesquisa de Acanthamoeba. Houve concordância entre os testes em 96% dos casos. A taxa de positividade das culturas de raspado de córnea encontrada foi de 41%. Os agentes infecciosos mais prevalentes foram as bactérias. O tratamento com antibiótico antes da coleta diminuiu a chance de uma cultura positiva, o uso de colírio de corticoide e o tamanho da ulcera maior que 3.62mm2 estão associados a maior probabilidade de uma cultura positiva. Houve uma alta concordância entre os testes de cultura e PCR na pesquisa de Acanthamoeba. Palavras-chave: Ceratite. Ulcera da córnea. Cultura. Antibióticos. Corticosteroides. / Abstract: Infectious keratitis is an important cause of ocular morbidity and visual impairment. Prompt microbiological diagnosis and treatment can avoid a bad outcome. The purposes of this study were: to determine the rate of positive cultures in patients with infectious keratitis, investigate the factors associated with culture positivity, identify the main microorganisms responsible for keratitis in our hospitals and determine the rate of agreement between culture and polymerase chain reaction (PCR) in the identification of Acanthamoeba. Patients with suspected infectious keratitis presenting to the emergency service of two hospitals in Curitiba, PR, Brazil, between June 2014 and April 2016, were recruited for the study. Patients who met the inclusion criteria were submitted to eye examination and corneal scraping for laboratorial tests. Demographic data, current medical history, current treatments and history of ocular comorbidities were obtained. Seventy-five patients fulfilled the inclusion criteria. The culture positivity rate was 41.3% (31/75). The most frequent microorganisms identified were bacteria (54%,17/31), followed by fungi (32%,10/31), and Acanthamoeba sp. (16%,5/31). Two factors were significantly associated with positive cultures: previous treatment with corticosteroid drops (p=0.006) and ulcer size larger than 3.62 mm2 (p=0.016). Patients on topical antibiotics before corneal scraping were more likely to be culture negative [OR: 3.65 (IC95%: 1.32 - 10.07)]. In twenty-six cases the comparison between culture test and PCR test for Acanthamoeba sp. identification was realized. There was agreement between tests in 96% of the cases. The culture positivity rate of corneal scraping was 41.3%. The most frequent microorganisms identified were bacteria. Antibiotic treatment before corneal scraping decreases the probability of a positive culture, corticosteroids treatment and ulcer size larger than 3.62 mm2, are associated with positive cultures. There was a great agreement between the culture test and PCR test in the identification of Acanthamoeba sp. Keywords: Keratitis. Corneal ulcer. Cultures. Antibiotics. Corticoids.

Orientador: Antonio Carlos Ligocki Campos / Tese (doutorado) - Universidade Federal do Parana, Setor de Ciencias da Saude, Programa de Pós-Graduação em Clínica Cirúrgica / Resumo: O objetivo do presente estudo foi investigar a ocorrência de translocação bacteriana em ratos submetidos a oclusão intestinal do íleo terminal e do sigmóide, com e sem isquemia e com isquemia isolada do íleo terminal. Foram utilizados 48 ratos Wistar machos, divididos em seis grupos, com 8 ratos cada um. Os ratos foram acondicionados no ambiente de pesquisa por, pelo menos, 7 dias antes do início do experimento, e receberam ração para ratos e água ad libitum. Foi utilizada anestesia inalatória com éter comercial em todos os procedimentos cirúrgicos. Os ratos do grupo OI foram submetidos a oclusão do íleo terminal. No grupo OIA os ratos foram submetidos a oclusão do íleo em alça, com isquemia. No grupo OS, realizou-se oclusão do sigmóide distai. Nos ratos do grupo OSA foi feita oclusão do sigmóide em alça, com isquemia. No grupo isquemia, foi feita ligadura dos vasos da arcada mesentérica do íleo terminal. Os ratos do grupo controle foram submetidos a laparotomia com manipulação das alças intestinais. Após a cirurgia, os ratos foram acondicionados individualmente em gaiolas metabólicas e tiveram livre acesso a água. Todos os ratos foram sacrificados 24 horas após a operação. Para tanto, sob anestesia, eram novamente submetidos a laparotomia. Retiravam-se 5 ml de sangue da veia cava inferior para determinação da glicemia, contagem leucocitária e realização de hemocultura. Em seguida eram retirados o linfonodo, baço, fígado e intestino delgado separadamente, nesta sequência e sob estritas condições de assepsia e com jogos separados de pinças e tesouras. Obtinham-se amostras destes órgãos, as quais eram colocadas em placas de Petri previamente pesadas para determinação do peso, e enviadas para estudo microbiológico. Um fragmento de jejuno era enviado para estudo histopatológico, o mesmo acontecendo com a área da oclusão. Nos ratos do grupo OS, OSA e do grupo controle, eram também enviadas amostras de ceco para estudo microbiológico. Nenhum rato morreu durante o período de estudo. A exceção do grupo controle, havia importante distensão do íleo terminal em todos os ratos, sendo mais acentuada nos grupo OI e OIA. Nos ratos dos grupos OS e OSA, havia também importante distensão dos colons. Nos ratos do grupo isquemia havia distensão do intestino delgado e bloqueio sobre a área desvascularizada. Não ocorreu perfuração intestinal em nenhum rato. Histologicamente, observou-se, no jejuno, sinais de sofrimento neuronal focal. A nível do íleo, observou-se infiltrado inflamatório mono e polimorfonuclear intenso, alargamento das vilosidades e área de edema com necrose junto à área da ligadura. Nos grupos com isquemia, havia edema e necrose da parede intestinal nas áreas isquêmicas, tanto no íleo, quanto no sigmóide. As culturas de jejuno não apresentaram diferença significativa entre os grupos, o mesmo ocorrendo com as culturas do íleo e do ceco. Ocorreu translocação bacteriana em 33 % dos ratos de grupo OI, em 100 % no grupo OIA, em 50 % no grupo OS, em 50 % no grupo OSA, em 100 % no grupo Isquemia e em 50 % nos ratos do grupo Controle. Ocorreu translocação bacteriana em 28,12% das culturas dos órgãos dos ratos do grupo OI, 78,12% das culturas do grupo OIA, 28,12% das culturas do grupo OS, 34% das culturas do grupo OSA, 69% das culturas do grupo Isquemia e em 28,12% das culturas do grupo controle. Houve diferença significativa entre os grupos, com índices significativamente maiores de translocação nos ratos dos grupos OLA e Isquemia. O número de bactérias translocadas foi significativamente maior nestes mesmos grupos. Conclui-se que ocorre translocação bacteriana em ratos com oclusão intestinal do íleo terminal e do sigmóide a níveis semelhantes à laparotomia simples com manipulação das alças intestinais. Entretanto, a presença de isquemia do intestino delgado é um fator que aumenta significativamente o índice de translocação bacteriana em ratos, o mesmo não ocorrendo com isquemia do sigmóide. / Abstract: The aim of the present study was to investigate the occurrence of bacterial translocation in rats subjected to intestinal occlusion with or without ischemia of the terminal ileum and sigmoid or with ischemia only of the terminal ileum. Forty-eight male Wistar rats were used, divided into six groups of eight rats each. The rats were kept in the environment conditions for at least seven days before the beginning of the experiment, with free access to rat chow and water. Ether anesthesia was used for all surgical procedures. Rats of group 01 were subjected to occlusion of the terminal ileum. In the group OLA, the rats were subjected to loop occlusion of the terminal ileum, with ischemia. In the group OS, the occlusion was in the sigmoid, while in the group OSA a loop occlusion was performed in the sigmoid, with ischemia. In the group ischemia the mesenteric vessels of the distal ileum were ligated. Control rats were subjected to sham laparotomy with bowel manipulation. After the operation, the rats were kept in individual metabolic cages and had free access to water. All rats were killed 24 hours after the operation. Under ether anesthesia and with strictly aseptic technique the abdomen was opened and 5 ml of blood was withdrawn from the inferior vena cava for the determination of the blood glucose level, leukocyte count and hemoculture. The mesenteric lymph node, spleen, liver and small bowel were removed separately. Samples of these organs were obtained, weighed and used for microbiologic and histologic studies. In groups OS,OSA and in control rats samples of the cecum were also sent for microbiologic studies. All rats survived the experiment. Except for control rats in all other groups marked intestinal dilatation was observed, and it was greater in groups 01 and OIA. In the rats of groups OS and OSA the colon was dilated. In the group ischemia, the bowel was dilated and there were adhesions over the necrotic area. Bowel perforation did not occur in any rat. Histologic studies demonstrated focal intestinal neuronal degeneration. The ileum exhibited intense mono and polimorphonuclear infiltrate, enlargement of villi, edema and necrosis of the bowel wall in the ischemic areas, both in the ileum and sigmoid. Jejunum, ileum and cecum cultures did not differ significantly among the groups. Bacterial translocation occurred in 33 % of the rats of group 01, 100 % in group OIA, 50% in group OS, 50 % in group OSA, 100 % in group ischemia and 50 % in control rats. Bacterial translocation to the organs studied occured in 28.12% of the rats of group OI, 78.12% in group OIA, 28.12% in group OS, 34% in group OSA, 69% in group ischemia and in 28,12% in control rats. These differences were significantly higher in groups OIA and ischemia as compared to all other groups. The number of translocated bacteria was also higher in these groups. It is concluded that the incidence of bacterial translocation in rats subjected to occlusion of the distal ileum and sigmoid is similar to that observed with laparotomy and bowel manipulation. However, the presence of ischemia of the distal ileum, results in significantly greater incidence of bacterial translocation in rats, although ischemia of the sigmoid did not result in an increased translocation rate. x

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-08-15Bitstream added on 2014-06-13T18:46:02Z : No. of bitstreams: 1 faria_r_dr_sjc.pdf: 634063 bytes, checksum: f7c76bd8def68214cb43267b9a499d76 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O objetivo nesta pesquisa foi avaliar a infiltração bacteriana in vitro na interface entre o pilar e o implante, comparando-se três tipos de conexões protéticas: Hexágono Externo (HE), Hexágono Interno Indexado (HII) e Cone Morse (CM). Sob condições estéreis, foi inoculada colônia de Escherichia coli na porção apical do parafuso do pilar. Após, os pilares foram fixados aos implantes com torque de 20 N/cm. Foram descartadas as amostras que apresentaram contaminação externa imediata. As amostras foram colocadas em tubos de ensaios contendo 2 ml de caldo TSB estéril. Em acompanhamento diário, por 7 dias, os caldos que se apresentaram turvos foram semeados em placa de petri com TSA e incubados em estufa bacteriológica à 37oC por 24 horas, para a observação de crescimento bacteriano. Coloração Gram foi realizada tanto no caldo quanto na colônia resultante da semeadura, para comprovação da presença de E. coli (Gram-negativo). Ao final do período, todas as amostras foram separadas, o conteúdo interno foi coletado com cone de papel e solução salina e semeado em placas de petri contendo TSA, levadas à estufa bacteriológica a 37º C por, 24 horas para verificar a viabilidade das bactérias. As amostras que não continham E.coli viáveis no seu interior foram descartadas do resultado final. Após os descartes por contaminação externa e inviabilidade, obtiveram-se os seguintes números de amostra: 38 (HE), 40 (HII) e 41 (CM). Os resultados, em % de amostras com infiltração bacteriana, foram submetidos ao teste de comparações múltiplas de proporções. As curvas de sobrevivência foram analisadas pelo método de Kaplan-Meyer e comparadas pelo teste estatístico de Log-Rank. Não houve diferença entre HE (10,53%), HII (4,88%) e CM (7,50%). As curvas de sobrevivência não diferiram entre si. A infiltração bacteriana ocorreu de modo... / The aim of this study was to evaluate, in vitro, the bacterial leakage between implant and abutment comparing three kinds of implantabutments connections: extern hexagon (EH), indexed intern hexagon (IIH) and morse-taper (MT). Under sterile controlled conditions, the tip of the abutment screw was inoculated with Escherichia coli culture and then the abutment was placed in position and tightened (20N/cm). The specimen was discarded if an external contamination of the outer surface was observed. Each specimen was incubated in a glass tube containing 2mL of sterile TSB medium at 37oC. The growth of E. Coli in the medium was registered every 24h. Once the sample showed cloudy broth, it was individually plated on TSA plates and incubated in an anaerobic chamber at 37oC for 24h, in order to observe the bacterial growth. Gram test was performed both in the medium and in the culture to certify the presence of E. Coli (Gram negative). After 7 days, each test specimen was sampled using a sterile paper point which was incubated in TSA plates and incubated in anaerobic chamber at 37oC for 24h, to verify bacterial viability. Samples that did not show bacterial viability in the end of the study were eliminated from the final results. After that, there were 38 EH samples, 40 IIH samples and 41 CM samples. The results, in %, of bacterial leakage, were statistically evaluated by multiple comparisons for proportion. The survival curves were analyzed by Kaplan-Meyer method and compared by statistical test of Log-Rank. There was no statistical difference among EH (10,53%), IIH (4,88%) e MT (7,50%). The three survival curves did not differ (p>0.005). It was conclude that the bacterial leakage occurred in a similar way for the three kinds of implant-abutment interface, no matter the assembly configuration.

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:33:51Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-11. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:47:56Z : No. of bitstreams: 1 000832760_20170311.pdf: 139938 bytes, checksum: 0737e841b7271a870a44ca0eb7d96746 (MD5) Bitstreams deleted on 2017-03-17T12:37:59Z: 000832760_20170311.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-03-17T12:39:05Z : No. of bitstreams: 1 000832760.pdf: 3326019 bytes, checksum: 72ebef8783b6896ac1a2e1353815020e (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O glicerol de biodiesel pode ser utilizado para produção de 1,3 propanodiol por bactérias. Nesse estudo sobre a produção de 1,3 propanodiol por Klebsiella pneumoniae GLC29 foi possível otimizar o meio de cultura para a produção de 1,3-propanodiol utilizando técnicas estatísticas de planejamento experimental e superfície de resposta, onde foram experimentados 11 possíveis variáveis no meio de cultura e verificou-se a influência de apenas 5 (glicerol, extrato de levedura, sulfato de amônio, vitamina B12 e Fumarato). Posteriormente, verificou-se a produção desse composto em bioreatores de 0,75 litros, tanto em batelada como batelada alimentada exponencial, onde foi possível atingir 23.6 g/L de 1,3-propanodiol em batelada usando glicerol puro, 27 g/L de 1,3-propanodiol em batelada usando glicerol bruto de biodiesel e 29.9 g/L de 1,3-propanodiol usando glicerol bruto de biodiesel por batelada alimentada exponencial. Além da otimização, foi possível amplificar e clonar todos os genes responsáveis à produção de 1,3-propanodiol de Klebsiella pneumoniae GLC29 em um plasmídeo usando a técnica Gibson Assembly, um método recente de montagem isotermal. Os genes foram expressos em cepas de Escherichia coli, e foi então verificada a produção de 1,3-propanodiol em frascos e bioreatores, onde foi possível atingir 11 g/L de 1,3-propanodiol produzido por E. coli SZ63 contendo o plasmídeo pSB1C3-dhaB123TFG em batelada alimentada / Biodiesel glycerol can be used for the production of 1,3-propanediol by bacteria. In this study on the production of 1,3-propanediol by Klebsiella pneumoniae GLC29 was possible to optimize media culture the production of 1,3-propanediol using statistical experimental design techniques and response surface methodology, where 11 variables were tested and only 5 were found significant (glycerol, yeast extract, ammonium sulfate, vitamin B12 and fumarate). Subsequently, production of 1,3-propanediol was verified in 0,75 liter reactors, both in batch and exponential fed-batch. It was possible to achieve 23.6 g/L of 1,3- propanediol in batch cultures using pure glycerol, 27 g/L of 1,3-propanediol in batch cultures using biodiesel glycerol, and 29.9 g/L of 1,3-propanediol in exponential fed-batch using biodiesel glycerol. Also, it was possible to amplify and clone all the genes responsible for the production of 1,3-propanediol by Klebsiella pneumoniae GLC29 in a plasmid, using Gibson assembly, a recent isothermal assembly methodology. The genes were expressed in Escherichia coli strains, and it was then verified the production of 1,3-propanediol in flasks and bioreactors, in which it was possible to reach 11 g/L 1,3-propanediol produced by E. coli SZ63 with the plasmid pSB1C3-dhaB1234TFG in fed-batch cultures / FAPESP: 2011/01974-3 / FAPESP: 2011/21620-1

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-19Bitstream added on 2014-11-10T11:58:48Z : No. of bitstreams: 1 000773278_20180219.pdf: 476686 bytes, checksum: 6e5775b02410b85dbee6fa185b69ccfc (MD5) Bitstreams deleted on 2018-02-23T13:06:32Z: 000773278_20180219.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2018-02-23T13:07:23Z : No. of bitstreams: 1 000773278.pdf: 3882989 bytes, checksum: 75667e8c9a8c2a3a7f503d07d51be90f (MD5) / As fontes naturais de minérios sulfetados vêm se esgotando rapidamente devido à demanda por metais nas indústrias de bens de produção e de consumo. O cobre é um dos metais de maior interesse econômico. Cerca de 70% deste metal é encontrado na natureza na forma de calcopirita (CuFeS2), contudo é o mineral que possui maiores limitações em sua extração. Dentre os processos de extração têm-se a biolixiviação, que utiliza micro-organismos capazes de promoverem a solubilização de metais pela oxidação de sulfetos metálicos, apresentando vantagens em relação às técnicas já utilizadas, principalmente de cunho econômico e ambiental. Neste contexto, o presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo de avaliar a influência do potencial de óxido-redução na solubilização de cobre a partir da calcopirita. Para isso, foram realizados ensaios de oxidação de íons ferrosos na presença e ausência do mineral. A bactéria utilizada nos ensaios foi a Acidithiobacillus ferrooxidans - LR, espécie acidófila mais estudada e mais encontrada em ambientes de mina. A amostra de calcopirita, proveniente da localidade de La Chorrera, na Colômbia, foi analisada por difração de raios-X (DRX) e evidenciou a presença dominante de calcopirita. Os ensaios de oxidação foram realizados em frascos, agitados a 150 rpm, a 30ºC sob diferentes concentrações de íons ferrosos (100, 200 e 300 mmol L-1) em meio T&K. Aos sistemas foram adicionados 2,5% (m/v) de calcopirita e 5% (v/v) do inóculo fresco de A. ferrooxidans. Nas condições abióticas, em todas as concentrações de Fe2+, o potencial redox atingiu, em média, 420 mV (Ag|AgCl|KCl(sat)), e foram os sistemas que apresentaram as maiores porcentagens de recuperação de cobre, sendo elas 73%, 90% e 78%, respectivamente, após 100 dias de ensaio. Contudo, os sistemas que continham bactéria apresentaram uma recuperação ínfima de cobre, chegando a apenas 17%, em um potencial médio... / Natural sources of sulfide ores come depleting rapidly due to the demand for metal goods industries in production and consumption. Copper is a metal of greater economic interest. About 70% of this metal is found in nature in the form of chalcopyrite (CuFeS2), however it is the mineral that present a major limitations in its extraction. One of the extraction processes is bioleaching, which uses microorganisms capable of promoting the solubilization of metals by metal sulfides oxidation and presents advantages over the common techniques used, mainly for economic and environmental nature. In this context, the present work was carrying out to evaluate the influence of the redox potential in the solubilization of copper from chalcopyrite. For this, ferrous ions oxidation tests were conducted in the presence and absence of the mineral. The bacterium used in the tests was Acidithiobacillus ferrooxidans - LR, the acidophilic species most studied and most commonly found in mine environments. A sample of chalcopyrite from La Chorrera, Colombia, was analyzed by X-ray diffraction (XRD) and showed the dominant presence of chalcopyrite. Ferrous ions oxidation tests were carried out in shaken flasks at 150 rpm, at 30 ºC using different concentrations of ferrous ions (100, 200, and 300 mmol L-1) in T&K medium. The systems were supplied with 2,5% (w/v) of chalcopyrite and 5% (v/v) of A. ferrooxidans fresh inoculum. At the abiotic conditions, the redox potential achieved 420 mV (Ag|AgCl|KCl(sat)) in all ferrous ions concentrations. Besides, these systems showed the highest copper recovery concentrations, such 73%, 90% and 78%, respectively, after 100 days of testing. However, the bacterial systems showed a low copper recovery, about 17% in a redox potential of 610 mV (Ag|AgCl|KCl(sat)). The solid residues were evaluated by XRD and showed, at abiotic conditions the formation of elemental sulfur, jarositas and a significant decrease in chalcopyrite’s...

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:10:01Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2002-05-06Bitstream added on 2014-11-10T11:57:21Z : No. of bitstreams: 1 000164631.pdf: 2914434 bytes, checksum: 63a362e437b9653b359c2844495da99f (MD5) / Staphylococcus não são usualmente estudados na cavidade bucal. Quando presentes são considerados pertencentes à microbiota transitória. Indivíduos que apresentam doença periodontal representam possíveis reservatórios dessas bactérias oportunistas na cavidade bucal. O uso de antibióticos, quer seja para tratamento da doença periodontal, ou em consequência de infecções hospitalares, pode predispor o aumento do número de Staphylococcusspp. naboca, pois estes adquirem facilmente resistência aos antibióticos, podendo resultar em super-infecção. Participaram deste estudo 88 pacientes, com no mínimo 25 anos de idade e apresentando periodontite crônica, com pelo menos dois sítios com profundidade de sondagem maior ou igual a 5mm. Após anamnese e exame clínico periodontal foram feitas coletas de material da bolsa periodontal com cones de papel e da cavidade bucal por meio de bochechos. Do total de pacientes 37,50% apresentaram Staphylocaccusspp. na bolsa periodontal e 61,36% na cavidade bucal, sendo que 27,27% apresentaram a bactéria nos 2 sítios, não sendo necessariamente a mesma espécie. S. epidermidisfoi a espécie mais prevalente para bolsa periodontal (15,9%) e cavidade bucal (27,27%). Foram positivos para S. aureus na bolsa periodontal, 4,5% e para cavidade bucal 25%, sendo 3,4% positivos para os dois sítios. Não houve diferença estatística significante quanto à presença desses microrganismos entre as faixas etárias, hábito de fumar e aumento da profundidade de sondagem. A maioria das cepas de Staphylococcus isoladas mostrou resistência aos antibióticos testados, indicando que a utilização sistêmica destas drogas, como adjunto à terapia periodontal. deve ser vista com cautela / Staphylococcus are not usually studied in the oral cavity, when this happens, they are considered to belong to transitory microflora. Individuals that present periodontal disease represent possibles reservoirs of these opportunist bacteria in the oral cavity. The use of antibiotics whether for treatment of periodontal disease or due to hospital infections, may predispose the increase of the Staphylococcus spp. in the oral cavity because they easily become resistant to antibiotics, resulting in superinfection. The study was made with 88 patients, minimum age- 25 years old, presenting chronical periodontitis, with, at least, two sites having a probing pocket bigger or equal to 5mm. After anamnese and clinical periodontal examination samples were taken from the periodontal pocket using paper cones and from the oral cavity using mouth rinse. Of the total patients 37,50% presented Staphylococcus spp. in the periodontal pocket and 61,36% in lhe oral cavity; 27,27% presented bacteria in the two sites, not necessarily of the same specie. S. epidermidis was the most prevailing specie in periodontal pocket (15,9%) and oral cavity (27,27%). Positive for S. aureus in the periodontal pocket were 4,5% and for the oral cavity 25%, and 3,4% were positive for the two sites. There was not found significative statistical difference referring to the presence of the microorganisms as to age, smoking habit and increase of the probing depth. The majority of the isolated Staphylococcus samples showed resistance to the tested antibiotics, indicating that the drugs as an adjunct to periodontal therapy, must be seen with caution