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Detecção de impressões digitais falsas no reconhecimento biométrico de pessoas /Silva, Murilo Varges da. January 2015 (has links)
Orientador: Aparecido Nilceu Marana / Coorientador: Alessandra Aparecida Paulino / Banca: Maurilio Boaventura / Banca: Neucimar Jerônimo Leite / Resumo: Nos últimos anos, diversas características biométricas têm sido propostas para a identificação de pessoas, dentre as quais destacam-se a face, a íris, a retina, a geometria da mão. Entretanto, a impressão digital ainda é a característica mais utilizada, tanto em aplicações comerciais quanto governamentais. Dentre as principais aplicações que utilizam impressões digitais podemos citar a identificação de eleitores por meio de urnas eletrônicas biométricas, o controle de fronteiras e imigração por meio dos passaportes, o acesso aos serviços bancários por meio de caixas bancários eletrônicos biométricos, entre outros. Com o aumento da utilização destes sistemas, as tentativas de ataque também aumentam. Dentre os tipos de ataques que um sistema biométrico baseado em impressões digitais pode sofrer, a apresentação de um dedo falso ao sensor é a técnica mais utilizada por pessoas mal intencionadas. Este trabalho tem como objetivo propor um método robusto para detecção de impressões digitais falsas, por meio da incorporação de informações dos poros sudoríparos. O método proposto foi avaliado utilizando-se uma base de dados própria denominada UNESP Fingerprint Spoof Database (UNESP-FSDB). A análise considerou alguns fatores que podem influenciar na detecção de impressões digitais falsas, tais como: (i) resolução da imagem da impressão digital; (ii) utilização de características de terceiro nível (poros); (iii) pressão do dedo sobre a superfície do sensor; (iv) tempo de aquisição da imagem da impressão digital; (v) umidade presente no dedo no momento da captura da impressão digital. Os resultados dos experimentos realizados mostraram que: (i) a utilização de informações de poros pode aumentar a acurácia em até 9%; (ii) a aplicação de uma maior pressão contra o sensor no momento da captura melhora a performance; (iii) a umidade presente no dedo influencia na qualidade da imagem e... / Abstract: In recent years, many biometrics traits have been proposed to biometric identification of people, among which stand out the face, iris, retina, hand geometry. However, fingerprint is still the most used feature in both commercial and government applications. The main applications we can mention are the identification of voters through electronic voting machines, border control and immigration through passports, access to banking services through biometric Automated Teller Machine (ATM), among others. With the increased use of these systems, attempts to attack also increase. Among the types of attacks that a biometric system based on fingerprint may suffer, presenting a false finger to the sensor is the most used technique by malicious people. This work aims to propose a robust method to detect fake fingerprints by incorporating information from the sweat pores. The proposed method was assessed on own database named UNESP Fingerprint Spoof Database (UNESP-FSDB), the analysis considered some factors that may influence method performance as: (i) fingerprint image resolution ; (ii) use of third-level characteristics (pores); (iii) finger pressure on the sensor surface; (iv) fingerprint image acquisition time; (v) finger moisture present in the moment of capture fingerprint. The results of the experiments showed that: (i) incorporating information of pores can increase the accuracy up to 9%; (ii) using increased pressure at the time of capture improves the performance; (iii) the moisture present in the finger can influence the image quality and accuracy of the proposed method / Mestre
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Tecnologia de sementes de jurema-de-embira (Mimosa ophthalmocentra Mart. ex Benth / Seed technology jurema-of-embira (Mimosa ophthalmocentra Mart. ex BenthFreitas, Narjara Walessa Nogueira de 15 January 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-01-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The germination, as well as the expression of the effect of a seed lot, depends both on intrinsic factors of the seed (dormancy and speed of water absorption) as extrinsic factors (appropriate temperature, range suitable substrate, quantity and quality of water), being extremely important to know the factors that influence the germination of a given species. In this sense, four experiments were conducted with jurema-de-embira, in order to characterize morphologically fruits and seeds, evaluate the process of soaking seeds, set the best pre-germination treatment to overcome dormancy, determine appropriate procedures for the germination test and verify the effects of drought and salt stress on germination and early seedling development of jurema-de-embira under different temperatures. The experiments were conducted at the Seed Analysis Laboratory (LAS) of the Federal Rural University of the Semi-Arid (UFERSA). The statistical design was completely randomized (DIC). In experiment 1, for the characterization, we evaluated the biometric parameters of 100 fruits and 100 seed lots harvested in the years 2013 and 2014. For the characterization of the seed hydration, the process was carried out soaking curve of seed lots with and without lopping. We also evaluated nine pre-germinating treatments to overcome seed dormancy: control; cutting with scissors and escaficação with sandpaper 80, at the opposite end to the hilum; Hot water at 80 ° C for 3, 6 and 12 minutes and sulfuric acid (H2SO4) for 3, 6 and 12 minutes. In experiment 2, the substrates used were rolled paper, on paper, from vermiculite and sand, at temperatures of 25, 30 and 35 °C and alternated 20-30 °C, photoperiod of eight hours. In Experiment 3, we evaluated the osmotic potential of 0.0; -0.1; -0.2; -0.3; -0.4; -0.5 and -0.6 MPa at constant temperatures of 25, 30 and 35 ºC and alternated 20-30 °C. In the experiment 4, the evaluated salt concentrations were 0.0; 4.0; 8.0; 12.0; 16.0; 20.0; 24.0 and 28.0 dS m-1 under constant temperatures of 25, 30 and 35 °C and alternated 20-30 °C. The seeds of jurema-de-embira have low variation for biometric features and the larger variations occur from plant materials. Seed germination starts after 19 hours of imbibition, regardless of plant material. The scarification with sandpaper 80 or emerges with scissors at the opposite end to the hilum are the methods set out to overcome dormancy in seed jurema-of-embira. For the germination test in seed jurema-of-embira, the most favorable temperatures are 25 and 20-30 °C in the paper roll substrates and between sand. The water affects the germination of jurema-of-embira and early development of seedlings from the potential of -0.2 MPa, the most obvious effect in temperature of 35 °C; alternating temperature of 20-30 °C allows greater tolerance to drought stress. The effect of salinity varies with temperature, being more evident at the temperature of 35 °C. The jurema-of-embira is tolerant to salt stress and may be classified as a halophyte species / A germinação, bem como a expressão do vigor de um lote de sementes, depende tanto de fatores intrínsecos à semente (dormência e velocidade de absorção de água), como de fatores extrínsecos (faixa adequada de temperatura, substrato adequado, quantidade e qualidade da água), sendo de extrema importância o conhecimento dos fatores que influenciam a germinação de determinada espécie. Neste sentido, foram realizados quatro experimentos com jurema-de-embira, com o objetivo de caracterizar morfologicamente frutos e sementes, avaliar o processo de embebição das sementes, definir o melhor tratamento pré-germinativo para superação da dormência, determinar os procedimentos adequados para a condução do teste de germinação e verificar os efeitos do estresse hídrico e salino sobre a germinação e desenvolvimento inicial das plântulas de jurema-de-embira sob diferentes temperaturas. Os experimentos foram conduzidos no Laboratório de Análise de Sementes (LAS) da Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA). O delineamento estatístico utilizado foi o inteiramente casualizado (DIC). No experimento 1, para a caracterização, foram avaliados os parâmetros biométricos de 100 frutos e 100 sementes de lotes, colhidos nos anos de 2013 e 2014. Para a caracterização do processo de hidratação das sementes, foi realizada a curva de embebição dos lotes de sementes, com e sem desponte. Também foram avaliados nove tratamentos pré-germinativos para superação da dormência das sementes: testemunha; desponte com tesoura e escaficação com lixa 80, na extremidade oposta ao hilo; água quente a 80 ºC por 3, 6 e 12 minutos e ácido sulfúrico (H2SO4) por 3, 6 e 12 minutos. No experimento 2, os substratos utilizados foram rolo de papel, sobre papel, sobre vermiculita e entre areia, nas temperaturas de 25, 30 e 35 °C e alternada de 20-30 °C, sob fotoperíodo de oito horas. No experimento 3, foram avaliados os potenciais osmóticos de 0,0; -0,1; -0,2; -0,3; -0,4; -0,5 e -0,6 MPa nas temperaturas constantes de 25, 30 e 35 °C e alternada de 20-30 °C. No experimento 4, as concentrações salinas avaliadas foram as de 0,0; 4,0; 8,0; 12,0; 16,0; 20,0; 24,0 e 28,0 dS m-1 sob temperaturas constantes de 25, 30 e 35 °C e alternada de 20-30 °C. As sementes de jurema-de-embira apresentam baixa variação para os aspectos biométricos e as maiores variações ocorrem entre materiais vegetais. A germinação das sementes escarificadas inicia-se após 19 horas de embebição, independentemente do material vegetal. A escaficação com lixa 80 ou o desponte com tesoura na extremidade oposta ao hilo são os métodos indicados para superação de dormência em sementes de jurema-de-embira. Para a condução do teste de germinação em sementes de jurema-de-embira, as temperaturas mais favoráveis são 25 e 20-30 ºC, nos substratos rolo de papel e entre areia. O hídrico afeta a germinação de sementes de jurema-de-embira e o desenvolvimento inicial das plântulas a partir do potencial de -0,2 MPa, sendo o efeito mais evidente sob temperatura de 35 ºC; a temperatura alternada de 20-30 ºC permite maior tolerância ao estresse hídrico. O efeito da salinidade varia de acordo com a temperatura, sendo mais evidente na temperatura de 35 ºC. A jurema-de-embira é tolerante ao estresse salino, podendo ser classificada como espécie halófita
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Biometria de frutos e sementes, estresses abióticos na germinação e produção de mudas de mofumbo (Combretum leprosum Mart.) / Biometry of fruits and seeds, abiótic stresses in the production of mofumbo chips (Combretum leprosum Mart.)Leal, Caio César Pereira 23 February 2017 (has links)
Submitted by Lara Oliveira (lara@ufersa.edu.br) on 2017-04-27T22:01:49Z
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Previous issue date: 2017-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The mofumbo (Combretum leprosum Mart. (Combretaceae)) is a shrub used for medicinal purposes, reforestation and recovery of degraded areas, with the objective of obtaining information about biometry, germination and seedling production of this species on the influence of abiotic stresses. Therefore, four research actions were developed at the Federal Rural Semi-Arid University, Mossoró - RN, from August 2014 to December 2015. For the action I, the biometric characterization was performed with a sample of 100 mature fruits of mofumbo, individually evaluated for length and thickness (fruit and seed), fresh matter mass and hectolitric weight of the seeds. The seeds were still classified according to the physical aspect in: a) intact (normal, without apparent damage); B) damaged by insect and c) malformed. In the second action, the effect of water stress on seed germination was analyzed. For this, the paper towel substrate was moistened with solutions of polyethylene glycol at osmotic potential levels: 0.0; -0.1; -0.2; -0.3 and -0.4 and -0.5 MPa under the temperatures of 25, 30, 35 and 20-30 ° C. The following characteristics were analyzed: germination, germination speed index, root and hypocotyl length, root and hypocotyl dry mass. For action III, the effect of salinity on seedling emergence, using coconut fiber as substrate and aqueous solutions of sodium chloride (NaCl), calcium chloride (CaCl2) and potassium chloride (KCl), was analyzed. In the following electrical conductivities: 0,5, 1,5; 2.5; 3.5; 4,5; 5.5 and 6.5 dSm-1. The variables analyzed were germination, germination speed index, root length and dry mass of the root and hypocotyl. The experimental design for Actions II and III was the completely randomized, with four replicates of 25 seeds each. In the research action IV, the production of seedlings with different percentages of water retention capacity of the substrate constituted by 100, 80, 60, 40 and 20% was evaluated using a randomized block with 4 replicates of 12 plants. The seedlings were submitted to water regimes 40 days after sowing (DAS). At the end of 90 days, the following evaluations were made: stem diameter, plant height, dry mass of plants, leaf area, height / diameter ratio and Dickson index. The decrease of the water potential has a negative effect for all variables analyzed, with a maximum tolerance level of -0.4Mpa, for all temperatures studied. Mofumbo seedlings show sensitivity to the three types of salts studied, with a moderate tolerance to saline solutions of CaCl2. The field capacity of around 70% was more efficient for the production of mofumbo seedlings as well as the use of field capacity below 40% and above 80% drastically reduces the development of plants / O mofumbo (Combretum leprosum Mart. (Combretaceae) é um arbusto utilizado para fins medicinais, reflorestamento e recuperação de áreas degradadas. Objetivou-se obter informações referentes à biometria, germinação e a produção de mudas dessa espécie sobre a influência de estresses abióticos. Para isso foram desenvolvidas quatro ações de pesquisa na Universidade Federal Rural do Semi-Árido, Mossoró - RN, de agosto de 2014 a dezembro de 2015. Para a ação I realizou-se a caracterização biométrica com uma amostra de 100 frutos maduros de mofumbo, avaliados individualmente quanto ao comprimento e espessura (fruto e semente), massa de matéria fresca e peso hectolítrico das sementes. As sementes ainda foram classificadas quanto ao aspecto físico em: a) íntegra (normais, sem dano aparente); b) danificadas por inseto e c) mal formadas. Na segunda ação, analisou-se o efeito do estresse hídrico na germinação das sementes. Para isso, umedeceu-se o substrato papel toalha com soluções de polietilenoglicol, nos níveis de potencial osmótico: 0,0; -0,1; -0,2; -0,3 e -0,4 e -0,5 MPa sob as temperaturas de 25, 30, 35 e 20-30 °C. Foram analisadas as seguintes características: germinação, índice de velocidade de germinação, comprimento da raiz e do hipocótilo, massa seca da raiz e do hipocótilo. Para a ação III, analisou-se o efeito da salinidade na emergência de plântulas, utilizando-se fibra de coco como substrato e soluções aquosas de cloreto de sódio (NaCl), cloreto de cálcio (CaCl2) e cloreto de potássio (KCl), nas seguintes condutividades elétricas: 0,5, 1,5; 2,5; 3,5; 4,5; 5,5 e 6,5 dSm-1. As variáveis analisadas foram a germinação, índice de velocidade de germinação, comprimento e massa seca da raiz e do hipocótilo. O delineamento experimental para as ações II e III foi o inteiramente casualisado, com quatro repetições de 25 sementes cada. Na ação de pesquisa IV avaliou-se a produção de mudas com diferentes porcentagens de capacidade de retenção de água do substrato constituídos por 100, 80, 60, 40 e 20%, utilizando-se blocos casualizados com 4 repetições de 12 plantas.As mudas foram submetidas aos regimes hídricos com 40 dias após a semeadura (DAS). Ao final de 90 dias foram feitas as seguintes avaliações: diâmetro do colo, altura de plantas, massa seca de plantas, área foliar, relação altura/diâmetro e índice de Dickson. A diminuição do potencial hídrico acarreta efeito negativo para todas as variáveis analisadas, com nível de tolerância máximo em -0,4Mpa, para todas as temperaturas estudadas. As plântulas de mofumbo apresentam sensibilidade aos três tipos de sais estudados, com uma moderada tolerância a soluções salinas de CaCl2. A capacidade de campo em torno de 70% se mostrou mais eficiente para a produção de mudas de mofumbo bem como o uso da capacidade de campo abaixo de 40% e acima de 80% reduz drasticamente o desenvolvimento das plantas / 2017-04-27
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Morfoanatomia e composi??o centesimal de sementes de gergelim e c?rtamo / Morphoanatomy and composition centesimal of sesame seeds and safflowerValeriano, Filipe Rodrigues 05 August 2016 (has links)
?rea de concentra??o: Produ??o vegetal. / Submitted by Jos? Henrique Henrique (jose.neves@ufvjm.edu.br) on 2017-04-10T18:09:21Z
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Previous issue date: 2016 / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do Estado de Minas Gerais (FAPEMIG) / Objetivou-se com este trabalho realizar o estudo anat?mico e determinar a composi??o centesimal das sementes de gergelim e c?rtamo, visando identificar as estruturas e constituintes presentes. Os trabalhos foram realizados no Laborat?rio de Sementes do Departamento de Agronomia, no Laborat?rio de Biomassas do Cerrado do Departamento de Nutri??o e no Laborat?rio de Anatomia Vegetal do Departamento de Ci?ncias Biol?gicas da Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri ? UFVJM, Diamantina, MG. Foram utilizadas sementes de gergelim das cultivares CNPA G2 (lote 1) da safra 2010, CNPA G3 (lote 2) da safra 2010, CNPA G4 (lote 3) da safra 2014 e BRS Seda (lote 4) da safra 2015, fornecidas pela Embrapa Algod?o ? Para?ba e gr?os de c?rtamo adquiridos da empresa Terra dos P?ssaros, safra 2015. Para a caracteriza??o dos perfis de lotes de gergelim e c?rtamo, foram analisadas as vari?veis grau de umidade, germina??o, primeira contagem da germina??o, ?ndice de velocidade, emerg?ncia, estande inicial, ?ndice de velocidade de emerg?ncia. Para averiguar a qualidade sanit?ria dos lotes, realizou-se o teste de sanidade. Realizou-se tamb?m a determina??o da composi??o centesimal das sementes de gergelim e c?rtamo. Para a caracteriza??o morfol?gica de semente e pl?ntulas foram avaliados os aspectos biom?tricos e analisadas as caracter?sticas de suas estruturas. Al?m disso, realizaram-se os estudos de an?lise de imagem de sementes, a caracteriza??o anat?mica. Al?m disso, realizaram-se os estudos de an?lise de imagem com aux?lio do sistema SAS e a caracteriza??o anat?mica. Conclui-se que os lotes de sementes de gergelim apresentaram qualidade fisiol?gica semelhante e que parte da qualidade fisiol?gica pode ter sido afetada pela presen?a de pat?genos nos lotes. A composi??o centesimal permitiu confirmar a esp?cie como oleaginosa. A an?lise de imagem permitiu verificar caracter?sticas para a distin??o entre os lotes de sementes de gergelim. As an?lises anat?micas entre os lotes foram semelhantes. Verificou-se que a baixa taxa de germina??o de gr?os de c?rtamo deve-se ? qualidade sanit?ria. Verificou-se que os gr?os de c?rtamo s?o ricos em fibras. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Produ??o Vegetal, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2016. / The objective of this work was to perform an anatomical study and to determine the centesimal composition of sesame and safflower seeds, aiming to identify the structures and constituents present. The work was carried out in the Seed Laboratory of the Agronomy Department, in the Cerrado Biomass Laboratory of the Department of Nutrition and in the Laboratory of Plant Anatomy of the Department of Biological Sciences of the Federal University of the Jequitinhonha and Mucuri Valleys - UFVJM, Diamantina, MG. Seeds of CNPA G2 (lot 1) from the 2010 crop, CNPA G3 (lot 2) from the 2010 crop, CNPA G4 (lot 3) from the 2014 crop and BRS Silk (lot 4) from the 2015 harvest were used, provided by Embrapa Algod?o ? Para?ba and safflower grains purchased from the company Terra dos P?ssaros, harvest 2015. To characterize sesame and safflower seedlings, analysis was conducted for the variables moisture level, germination, first germination count, speed index, emergence, initial booth, emergence speed index. In order to ascertain the sanitary quality of the lots, a sanitary test was performed. The determination of the centesimal composition of the sesame and safflower seeds was also carried out. For the morphological characterization of seed and seedlings the biometric aspects were evaluated and the characteristics of their structures were analyzed. In addition, the studies of seed image analysis, the anatomical characterization, were carried out. In addition, the studies of image analysis were carried out with the help of the SAS System and the anatomical characterization. It was concluded that the sesame seed lots presented similar physiological quality and that part of the physiological quality may have been affected by the presence of pathogens in the lots. The centesimal composition confirmed the species as oleaginous. The image analysis allowed to verify characteristics for the distinction between the lots of sesame seeds. Anatomical analyzes between batches were similar. It was verified that the low rate of germination of safflower grains is due to sanitary quality. It has been found that safflower grains are high in fiber.
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Proposta metodológica para aquisição de dados biotelemétricos em tempo real / Lucas Alberto Bodaczny ; orientador, Osíris Canciglieri JúniorBodaczny, Lucas Alberto January 2007 (has links)
Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2007 / Bibliografia: f. 119-126 / Este trabalho apresenta uma proposta metodológica para a aquisição de dados biométricos através da telemetria, baseando-se na pesquisa-ação e estudo de caso para seu desenvolvimento. Atualmente, tornou-se necessária a utilização de dispositivos específico / This work presents a methodological proposal for the acquisition of biometric data through telemetric, basing on the research-action and case study for its development. Now, it is necessary the use specific devices of obtaining of biometric signs for prof
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Biometria de sementes, morfologia de plântulas e crescimento inicial de cinco espécies frutíferas que ocorrem no Nordeste brasileiro / Seed biometrics, morphology seedlings and species of five initial growth fruit that occur in Northeastern BrazilSilva, Tatiana Maria da January 2014 (has links)
SILVA, Tatiana Maria da. Biometria de sementes, morfologia de plântulas e crescimento inicial de cinco espécies frutíferas que ocorrem no Nordeste brasileiro. 2014. 102 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências Agrárias, Departamento de Fitotecnia, Programa de Pós-Graduação em Agronomia / Fitotecnia, Fortaleza-CE, 2014 / Submitted by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-08-19T12:05:58Z
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Previous issue date: 2014 / Brazilian native fruits are among the most tasty and nutritious in the world, being known only by the local population. The knowledge of the morphology of seeds and seedlings is useful in understanding the development of native species, being fundamental in the study of germination in species identification in the juvenile stage, the interpretation of tests of germination and differentiation of congeners. The study of the initial growth of plants is important for establishing standards of seedlings produced in nurseries. The objective of this work was to obtain information on biometrics seed, seedling morphology and early growth of American ximenia L, Genipa americana L., Ziziphus joazeiro Mart., Talisia esculenta Raldk and Crataeva tapia L. The experiments were conducted at the Center for Teaching and Research in Urban Agriculture (NEPAU), Department of Plant Science in CCA / UFC, Fortaleza-CE. Biometrics seeds was performed on a sample of 100 diaspores of each species. To study the morphology of seedlings made up planting 100 seeds in tubes of 288cm ³ s filled with vermiculite and humus in the volume ratio 2:1, except Juazeiro whose endocarps previously scarified, were sown in beds tire containing 2 offish 1 humus (v/v). We carried out daily photographic records of germination and seedling establishment process. The initial growth analysis was performed in two environments (full sun and greenhouse) during seven periods in a split plot design with six replications, in a randomized design, except for jujube plum mad and whose evaluations were performed only at home vegetation. The length values observed in ‘ameixa-brava’, ‘genipapo’, ‘juazeiro’, ‘pitomba’ and ‘trapiá’ were 14.98; 9.64; 8.74; 18.25 and 7.72 mm respectively. ‘Ameixa-brava’ and ‘pitomba’ presented hypogeal cryptocotyledonary germination, while the genipap ‘juazeiro’ and ‘trapiá’ and were characterized as phanerocotylar epigeal. Trapiá plants kept in the greenhouse showed better development. Seedlings ‘genipapo’ and ‘pitomba’ full sunlight exhibited greater development. The pattern of seedling plum mad at 109 days: 12.13 cm, 19.02 cm root length, 3.52 mm diameters and 7.1 leaves. The ‘juazeiro’ seedlings with 138 days exhibited the following pattern: height - 41.33 cm; root length - 37.84; stem diameter - 4.13 mm and number of leaves - 43.05. / As frutas nativas brasileiras estão entre as mais saborosas e nutritivas do mundo, sendo conhecidas apenas pela população local. O conhecimento da morfologia de sementes e plântulas é útil na compreensão do desenvolvimento das espécies nativas, sendo fundamentais no estudo da germinação, na identificação de espécies na fase juvenil, na interpretação dos testes de germinação e diferenciação de espécies congêneres. O estudo do crescimento inicial das plantas é importante para o estabelecimento de padrões de qualidade de mudas produzidas nos viveiros. Objetivou-se neste trabalho obter informações sobre biometria de sementes, morfologia de plântulas e crescimento inicial de ameixa-brava (Ximenia americana L.), jenipapo (Genipa americana L.), juazeiro (Ziziphus joazeiro Mart.), pitomba (Talisia esculenta Raldk) e trapiá (Crateva trapia L.). Os experimentos foram desenvolvidos no Núcleo de Ensino e Pesquisa em Agricultura Urbana (NEPAU), do Departamento em Fitotecnia CCA/UFC, em Fortaleza-CE. A biometria das sementes foi realizada em uma amostra de 100 diásporos de cada espécie. Para o estudo dos aspectos morfológicos das plântulas efetuou-se o plantio de 100 sementes em tubetes de 288cm³ preenchidos com s vermiculita e húmus na proporção volumétrica 2:1, exceto para juazeiro cujos endocarpos, previamente escarificados, foram semeados em canteiros de pneu contendo 2 arisco : 1 húmus (v/v). Efetuaram-se registros fotográficos diários do processo de germinação e estabelecimento da plântula. A análise de crescimento inicial foi realizada em dois ambientes (sol pleno e casa de vegetação) durante sete períodos num esquema de parcelas subdivididas com seis repetições, seguindo um delineamento inteiramente casualizado, exceto para ameixa-brava e juazeiro cujas avaliações foram realizadas apenas em casa de vegetação. Os valores do comprimento observados em ameixa-brava, jenipapo, juazeiro, pitomba e trapiá foram 14,98; 9,64; 8,74; 18,25 e 7,72mm respectivamente. Ameixa-brava e pitomba apresentaram germinação hipógea criptocotiledonar, enquanto o jenipapo, juazeiro e trapiá caracterizaram-se como epígea fanerocotiledonar. As plantas de trapiá mantidas em casa de vegetação apresentaram melhor desenvolvimento. As mudas de jenipapo e pitomba desenvolveram-se mais sob sol pleno. As mudas de ameixa-brava com 109 dias de idade apresentaram 12,13cm de altura, 19,02cm de comprimento de raiz, 3,52mm de diâmetro do colo e 7,1 folhas. As mudas de juazeiro com 138 dias exibiram o seguinte padrão: altura – 41,33cm; comprimento da raiz – 37,84; diâmetro do colo – 4,13mm e numero de folhas – 43,05.
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Análise de dados de RNA-Seq com diferentes números de fatores e repetições / Analysis of RNA-Seq data with different numbers of factors and replicatesSouza, Vladimir Barbosa Carlos de 22 July 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-07-22 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / A tecnologia RNA-Seq mostrou-se ser revolucionária para o estudo de expressão gênica. Porém, mais estudos na literatura sobre a análise de dados de RNA-Seq são necessários, até mesmo porque se trata de um método de elevado custo. Devido a este alto custo, é importante o aproveitamento das amostras disponíveis para concluir sobre mais fatores e suas interações. Este trabalho tem como objetivo realizar um comparativo do desempenho da análise de identificação de DEGs (genes diferencialmente expressos) em experimentos com diferentes números de fatores e repetições, mas todos com o mesmo número de amostras, ou seja, com o mesmo custo. Para as análises, foram simulados conjuntos de dados provenientes de experimentos com diferentes números de fatores e repetições. Para a realização dessas simulações foi utilizado o pacote TCC, desenvolvido para o software livre R, para a normalização dos dados também foi utilizado o TCC, e para a identificação dos DEGs foi utilizado o pacote DESeq, também desenvolvido para o R. Por último, o desempenho das análises de cada experimento foi calculado utilizando-se curvas ROC (Receiver Operating Characteristics), usando-se o pacote ROCR, também disponível para o R. Após o cumprimento da metodologia, pôde-se observar que, na ausência de interação entre fatores, não ocorre perda de desempenho das análises ao adicionar mais fatores, e, quando existe interação entre fatores, ocorre essa perda. Portanto, o uso de mais fatores, ao custo de se ter menos repetições, pode ser vantajoso. / The RNA-Seq technology show to be revolutionary for gene expression studies. However, more studies in literature about the analysis of RNA-Seq data are necessary, even because it is a costly method. Because of that high cost, it is important to take the full advantage of the available samples to conclude about more factors and its interactions. The aim of this work is to perform a comparative of the performance of DEGs (differential expression genes) identification analysis in experiments with different numbers of factors and replicates, but all of them with the same number of samples, or, in other words, with the same cost. For the analysis, was simulated a dataset from experiments with different numbers of factors and replicates. The package TCC, developed to the free software R, was used to perform that simulation. For the normalization of the data, TCC was also used, and for the DEGs identification the package DESeq was used, also developed to R. Finally, the performance of the analysis of each experiment was calculated with the use of ROC (Receiver Operating Characteristics) Curves, using the package ROCR, also available for R. After the implementation of the methodology, it was possible to observe that, when absence of interactions between factors, do not occur loss of analysis's performance when more factors are added, and, when there are interactions of factors, that loss happens. Therefore, the use of more factors, to the cost of having less replicates, may be advantageous.
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Abordagem matemática na análise de dados de área aplicada à variável malária em Moçambique / Mathematical approach in the area of data analysis applied to the variable malaria in MozambiqueChipenete, Cláudio Francisco 07 October 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-10-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Ao se analisar os dados de área, um dos principais interesses é entender sua estrutura ou distribuição no espaço e, se existe alguma dependência ou estrutura bem definida entre as diversas áreas na região em estudo. Para mensurar essa dependência fez-se uma análise de padrões utilizando a autocorrelação espacial. O principal objetivo do trabalho foi abordar no enfoque matemático, as técnicas e procedimentos estatísticos na análise espacial de dados de área utilizando o método tradicional para o cálculo do índice de Moran e o método de três passos. Buscou-se também verificar e analisar a existência de algum padrão espacial definido em Moçambique associado a variável malária. A malária tem sido uma das principais causas de internamento nos hospitais e centros de saúde nos últimos anos, igualmente, das mortes da população. Analisar sua distribuição e relacionamento entre diferentes distritos do país poderá contribuir para minimizar os efeitos dessa doença. Os dados foram obtidos do Inquérito Demográfico e de Saúde de Moçambique (IDS) realizado em 2011. Na análise estatística foi possível identificar regiões cujos distritos se assemelhavam por possuírem taxas médias baixas de malária, formando agrupamentos, a saber, nas regiões sul, extremo sul, e norte de Moçambique. Para os demais distritos, verificou-se uma distribuição aleatória de casos da malária. No entanto, foi possível identificar distritos representados pelas cidades de Maputo, Matola e Beira com maior taxa de malária em relação aos demais. / In the area of data analysis, the main interest is to understand how these data are distributed in space and if there is any relationship or dependency between the various areas in the study area for a given phenomenon. To measure this dependence became a pattern analysis using the spatial autocorrelation. The main objective was to address the mathematical approach of the technical and statistical procedures in the area spatial analysis of data using the traditional method for calculating the Moran index and the three-step method. It sought to verify and analyze the existence of a spatial pattern set in Mozambique variable associated with malaria. Malaria has been a major cause of hospitalization in hospitals and health centers in recent years, also the deaths of the population. Analyze their distribution and relationship between different districts of the country could help to minimize the effects of this disease. Data were obtained from the Demographic and Health of Mozambique (DHS) conducted in 2011. Statistical analysis was possible to identify regions whose districts were similar because they have average rates of malaria low, forming groupings, namely, in the south, far south and northern Mozambique. For other districts, there is a random distribution of cases of malaria. However, it was possible to identify districts represented by the cities of Maputo, Matola and Beira with the highest malaria rates in relation to the other.
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Número de repetições na identificação de genes diferencialmente expressos em experimentos de RNA-Seq / Number of repetitions in identifying differentially expressed genes in RNA-Seq experimentsAmaral, Regiane Teodoro do 27 February 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-02-27 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Um dos principais desafios da biologia molecular é medir e avaliar os perfis de expressão gênica em diferentes tecidos biológicos com o objetivo de entender os mecanismos de transformação molecular. O método RNA-Seq usa transcriptoma a partir de tecnologias de sequenciamentos de nova geração (SNG), utilizados para sequenciar cDNA que é derivado de uma amostra de RNA, e, assim, produzir milhões de sequenciamentos de leitura. Porém, apesar do custo dessas tecnologias vir diminuindo, é comum realizar experimentos com pouca ou nenhuma repetição. Assim, torna-se necessária a descoberta e o aprimoramento de metodologias estatísticas eficientes para a otimização das análises de dados gerados em plataformas de sequenciamento de genomas. O objetivo geral desse trabalho consistiu na comparação de metodologias estatísticas a fim de estudar o padrão de expressão gênica relacionado à quantificação desses genes conforme determinadas condições/tratamentos, em experimentos de RNA-Seq. Para a realização das análises utilizou-se um conjunto de dados simulados através do pacote TCC do R, com diferentes cenários, para comparar os métodos estatísticos DESeq e baySeq. Foram exploradas tecnologias de RNA-Seq do perfil de expressão gênica de um banco de dados contendo 1000 genes em duas condições, nos cenários com cinco repetições, três repetições, 2 repetições e sem repetição. Em um primeiro momento, tais dados foram analisados pelos dois métodos separadamente, comparando-se o efeito do número de repetições dentro de cada um. Em seguida, foi realizada a comparação entre os métodos, levando em conta também o número de repetições em cada cenário. De acordo com os resultados gerados nas análises não podemos afirmar que um método, entre os avaliados, é ótimo em todas as circunstâncias, pois o método de escolha para uma situação em particular depende das condições experimentais. No entanto, sob as condições utilizadas no desenvolver do experimento, o método abordado pelo baySeq foi o que apresentou um bom desempenho, nas combinações ocorridas entre os métodos e os tipos de genes analisados, ou seja, esse foi o método que obteve uma maior capacidade de identificação dos genes diferencialmente expressos. / One of the main challenges of molecular biology is to measure and assess the gene expression profiles in different biological tissues in order to understand the molecular mechanisms of transformation. The method uses RNA Seq transcriptome from Young generation sequencing technologies (NGS), used to sequence the cDNA which is derived from an RNA sample, and thus produce millions of reading sequencing. However, despite the cost of these technologies come decreasing, it is common experiment with little or no repetition. Thus, it becomes necessary discovery and improvement of efficient statistical methods to optimize the data analysis generated genome sequencing platforms. The aim of this study was to compare statistical methodologies to study the pattern of gene expression related to the quantification of these genes as certain conditions / treatments in RNA-Seq experiments. To carry out the analysis used a set of simulated data via the R TCC package with different scenarios to compare the statistical methods DESeq and baySeq. RNA-Seq technology of gene expression profile of a database containing 1000 genes were explored in two groups, in scenarios with five repetitions, three replicates, 2 repetitions and without repetition. At first, these data were analyzed by two methods separately, comparing the effect of the number of repetitions within each. Then, the comparison between the methods was carried out, taking into account also the number of repetitions in each scenario. According to the results generated in the analyzes can not be said that a method, among the evaluated, is great in all circumstances, as the method of choice for a particular situation depends on the experimental conditions. However, under the conditions used in developing the experiment, the method was approached by baySeq which performed well, in combinations that occurred between the methods and the types of genes analyzed, that is, that was the method that obtained a greater capacity Identification of differentially expressed genes.
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Estudo do tempo de eficiência das insulinas de DNA recombinante via modelos para testes de vida acelerados / A study of the efficiency rate of recombinant DNA insulin through models for accelerated life testing / Etude du temps de efficacité des insulines de ADN recombinant par les modêles de testes de vie accélérésSousa, Patrícia de 30 July 2015 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-01-20T13:50:37Z
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Previous issue date: 2015-07-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Nesta pesquisa, estudamos o tempo de eficiência das insulinas de DNA recombinante via modelos para os testes de vida acelerados. Para isso, foi avaliada, periodicamente, a perda de potência dessas insulinas, submetidas às condições de temperatura de 8ºC, 25ºC e 37ºC, inseridas num contexto de ensaios acelerados. Essa proposta envolveu a utilização da metodologia para os testes de vida acelerados em estudos de dados reais através dos softwares R e Minitab. Ela teve como objetivos: o estudo da influência da temperatura no tempo da perda de potência das insulinas; a aplicação de técnicas gráficas e do teste da razão de verossimilhança para escolha do modelo que melhor se ajuste aos dados; a extrapolação das estimativas obtidas em momentos de estresse para as condições normais de uso e a apresentação ao mundo acadêmico de uma aplicação desses testes aos dados reais da engenharia genética. A análise, de abordagem classica, tomou como referência os estudos de alguns pesquisadores que, para tratar a censura intervalar presente nos dados, passaram a considerar os intervalos censurados como tempos exatos de falha. Os resultados mostraram que, por meio dos testes de vida acelerados, os fabricantes não só serão capazes de produzir insulinas com mais qualidade e confiabilidade, em tempo recorde, bem como poderão ter os prejuízos minimizados por calcular o prazo de garantia e a validade desses produtos com estimativas de tempos de falha confiáveis, oferecendo, assim, produtos com mais eficiência. / Dans cette recherche, nous étudions la durée (le temps) de éfficacité de lºinsuline dºADN recombinant par les modeles de testes de vie accélérés. Raison pour laquelle a été avaliée, périodiquement, la perte de lºefficacité de ces insulines que sont sumises a des conditions de température de 8ºC, 25ºC et 37ºC, inserées dans un contexte de testes accélérés. Cette proposition a impliquée lºutilisation de la méthodologie par les testes de vie accélérés et les études de données réelles par moyen softwares R et Minitab. Ayant ainsi pour objectifs: lºétude de lºinfluence de la temperature au moment de la perte dºefficacité des insulines; lºapplication de techniques graphiques et du teste de la raison de vraissemblance pour le choix du modele que mieux sºajuste aux données; lºextrapolation des estimatives obtenues au moment du stress (tension) pour les conditions normales dºusage et la présentation au monde académique dº une application de ces testes aux données réelles de lº ingénierie génétique. Lºanalyse, de lºapproche classique, a pris pour référence les études de quelques chercheurs qui pour traiter la censure entre intervale présent dans les données, sont passés a considérer les intervales censurées comme temps exacte de faille. Les résultats ont montré que, par moyen de testes de vie accélérés, les fabricants ne seront pas seulement capables de produire des insulines de bonnes qualités et fiables, en temps record, mais aussi aurons leurs préjudices assez minimisés en ce qui concerne le délai de validité de ces produits avec les estimatives de la durée de faille confiable, tout en offrant ainsi, de produits plus efficace. / We have studied in the present research the efficiency rate of recombinant DNA insulin through models for accelerated life testing. For this purpose, we have periodically assessed the power loss for this type of insulin when it is subjected to temperature conditions of 8ºC, 25ºC, and 37ºC, and inserted in a context of accelerated life testing. This plan involved the use of a methodology for accelerated life testing and real data study by means of the softwares R and Minitab. This research had as its objectives: the study of the influence of temperature on the rate of insulin power loss; the application of graphical techniques and of likelihood-ratio testing in choosing the best suited model for the data; the extrapolation of estimations made in moments of stress to include normal usage conditions, and the presentation to academia of an instance of application of these tests to a real data from genetic engineering. The analysis, which was made in a classical approach, had as reference the research of a number of researchers-who, in order to cope with the interval censoring in the data, started to consider the censored intervals to be exact failure times. The results show that by means of the accelerated life tests not only the manufacturers will be able to produce insulin in record time with greater quality and reliability, but they will also manage to incur minimized losses, given that they will have the ability to calculate their products” dates of expiration and warranty periods based on reliable failure times and, therefore, to provide more efficient products. / Sem lattes
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