Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Ciência dos Alimentos, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2016-09-20T04:59:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 341761.pdf: 1110760 bytes, checksum: 51e6b1236971a78dc36852eb6e4aef42 (MD5) Previous issue date: 2016 / Vibrio parahaemolyticus é um patógeno veiculado por alimento e sua infecção humana é regularmente associada com o consumo de frutos do mar crus ou mal cozidos e água contaminada. Esta pesquisa teve como objetivo identificar e quantificar Vibrio parahaemolyticus em ostras frescas (Crassostrea gigas), mexilhões (Perna perna) e água do mar provenientes de diferentes regiões de cultivo de moluscos bivalves no litoral de Santa Catarina, Brasil e otimização de um ensaio rápido de qPCR utilizando tecnologia de sondas TaqMan MGB, visando o gene da hemolisina termolábil (tl) de V. parahaemolyticus para a detecção e quantificação desta bactéria a partir de frutos do mar e amostras ambientais. As amostras foram coletadas entre outubro de 2012 e Dezembro de 2013. Foram coletadas 130 amostras de ostras (Crassostrea gigas), 215 amostras de mexilhões (Perna perna) e 222 amostras de água do mar. A ocorrência de V. parahaemolyticus em ostras e mexilhões foi baixa, 10,76% e 11,62% das amostras analisadas. Maior incidência de V. parahaemolyticus foram observados na água do mar, 18,%. A densidade de V. parahaemolyticus no verão (dezembro a março) foi significativamente maior do que nas outras 3 estações do ano (P <0,01). O ensaio qPCR e os iniciadores utilizados são altamente específicos, quando testado contra outras bactérias. O ensaio também é altamente sensível, e, é capaz de detectar V. parahaemolyticus com altos valores de coeficiente em concentrações tão baixas como 10 2 cópias / reacção de soluções puras de ADN genômico e 30 células / ml em suspensão de células diluída em série e adicionadas em amostras de tecido de ostras e mexilhões. Recomendamos que medidas de controle devem ser consideradas, incluindo o estabelecimento de uma vigilância intensiva e contínua de V. parahaemolyticus potencialmente patogênicos em todas as áreas de cultivo de moluscos bivalves, avaliação dos parâmetros ambientais, bem como a avaliação do risco para a saúde humana associado a ao consumo desses moluscos que é específica de cada região.<br> / Abstract : Vibrio parahaemolyticus is a food borne pathogen and their human infection is regularly associated with the consumption of raw or undercooked seafood and contaminated water supplies. This research aimed to identify and quantify Vibrio parahaemolyticus in fresh oysters (Crassostrea gigas), mussels (Perna perna) and seawater coming from different regions of cultivation of bivalve shellfishes in the seacoast of Santa Catarina, Brazil and the otimization of a rapid qPCR assay using TaqMan MGB probe technology, targeting the thermo labile (tl) gene of V. parahaemolyticus for the detection and enumeration of this bacterium from seafood and environmental samples. Samples were collected between October 2012 and December 2013 and there were collected 130 oysters samples (Crassostrea gigas), 215 mussels samples (Perna perna) and 222 seawater. The occurrence of V. parahaemolyticus in oysters and mussels was low, 10,76% and 11,62% of samples tested. Higher incidences of V. parahaemolyticus were observed in seawater, 18,%. The density of V. parahaemolyticus in summer (December to March) was significantly greater than those in the other 3 seasons (P < 0.01). The occurrence of pathogenic V. parahaemolyticus in oyster, mussels and seawater was very low (<10%). The qPCR assay and the primers used are highly specific, and only generated the desired amplicons with V. parahaemolyticus DNA samples against other bacteria. The assay is also highly sensitive, and, is able to detect V. parahaemolyticus with high coefficient values in concentrations as low as 102 copies/reaction for pure genomic DNA solutions and 30 cells/ml in serially diluted cell suspension and spiked samples. We recommend that control measures should be considered, including the establishment of an intensive and continuous monitoring of potentially pathogenic V. parahaemolyticus from all oyster-growing areas, the environmental parameters, and the assessment of the region-specific human health risk due to consumption of oyster.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aqüicultura, Florianópolis, 2002 / Made available in DSpace on 2012-10-20T02:43:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 275627.pdf: 804123 bytes, checksum: c8aee7660fe9d6c3ef9bad88cb1cdacf (MD5) / Este estudo avaliou a alimentação e a produção de biodepósitos do mexilhão Perna perna em duas áreas de cultivo no sul do Brasil diferenciadas pelos parâmetros do seston, em três experimentos por local. A Enseada do Brito (EB) apresentou altas concentrações de material particulado total (TPM), de matéria inorgânica particulada (PIM) e de matéria orgânica particulada (POM), mas menor fração orgânica no seston (f) em relação a Porto Belo (PB). Em geral, a alimentação e a biodeposição do mexilhão P. perna variaram de acordo com as características do seston, apresentando comportamentos similares aos observados para outras espécies de bivalves filtradores. As taxas de clareamento (CR) foram menores em EB, onde as concentrações de material em suspensão (TPM, PIM e POM) foram maiores. Já as taxas de filtração (FR), de ingestão (IR) e de ingestão orgânica (OIR) foram maiores em EB, aumentando de acordo com o incremento do seston. As taxas de absorção (AR) seguiram as mesmas tendências de FR, IR e OIR, entretanto as ARs médias foram similares entre EB e PB. A eficiência de seleção (SE) e a fração orgânica ingerida (i) aumentaram conforme incrementou o teor orgânico do seston (f), sendo maiores em PB. As eficiências de absorção (AE), por sua vez, incrementaram com SE e i, mas seus valores médios também foram similares entre os locais de estudo. O mexilhão P. perna apresentou uma alta eficiência de seleção mesmo sob condições de alta turbidez em EB, maximizando sua aquisição energética em termos de absorção de alimento (AR e AE). A produção de biodepósitos foi maior em EB do que em PB, com teor orgânico menor nos biodepósitos produzidos, em função das próprias características do seston (maior TPM e menor f), bem como da maior contribuição de pseudofezes, organicamente mais pobres que as fezes.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:11Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-09-04Bitstream added on 2014-06-13T18:54:14Z : No. of bitstreams: 1 silva_mv_me_rcla.pdf: 987805 bytes, checksum: 5d63e9cf1dae7c98ce5cfe26ce59325b (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Os ecossistemas marinhos próximos ao continente são locais muito sensíveis às mudanças ambientais. Nestas áreas, a biodiversidade é extremamente expressiva, com diversas espécies de importância econômica. A determinação de metais nos ecossistemas marinhos que se interceptam com atividades humanas é importante para avaliar as interferências e modificações que o homem causa nestes ambientes. A determinação de metais em ambientes aquáticos utilizando organismos vem sendo muito empregada, principalmente por meio de bivalves, proporcionando dados importantes sobre a biodisponibilidade destes contaminantes na água. A técnica de difusão por filmes finos em gradientes de concentração (DGT) também tem sido empregada para avaliar a concentração de metais em águas doces e marinhas, determinando a fração lábil destes potencias poluentes. Nesta pesquisa foram realizadas amostragens in situ na baía da Ilha Grande, RJ, utilizando Nodipecten nodosus (“vieira”) transplantados juntamente com dispositivos da técnica DGT para a determinação de Al, Cd, Co, Cu, Mn, Ni, Pb e Zn; visando uma comparação das duas técnicas e a obtenção de dados sobre a labilidade e biodisponibilidade destes metais. As vieiras foram obtidas de uma fazenda de criação próxima ao local de estudo. Os dispositivos DGTs foram do tipo convencional: resina Chelex-100 como ligante, gel difusivo de poliacrilamida-agarose e membrana filtrante de acetato de celulose. As vieiras e os dispositivos DGT ficaram imersos em três pontos de amostragem no interior da baía durante Julho a Setembro/2012 (Campanha de Inverno) e Dezembro/2012 a Fevereiro/2013 (Campanha de Verão). As determinações das concentrações dos metais foram feitas por espectrometria de massas com plasma acoplado indutivamente (ICP-MS) e espectrometria de emissão óptica (ICP OES)... / Marine ecosystems near to the continent are very sensitive to local environmental changes, where biodiversity is extremely important. Also in this areas, there are several species of economic importance and used for human consumption. Determination of metals in areas where the marine ecosystem and human activities are connected is important to evaluate interference and modifications that the man causes in these environments. The determination of metals in aquatic organisms has been widely used, mainly by using bivalves, providing important data on the bioavailability of these contaminants in the water. The technique of Diffusive Gradients in Thin Films (DGT) has also been employed to assess the concentration of metals in freshwater and marine water, determining the lability these potential pollutants. Aiming to compare different techniques, this research was carried out in the Ilha Grande bay, RJ, using transplanted Nodipecten nodosus (scallop) and the DGT technique for the determination of Al, Cd, Co, Cu, Mn, Ni, Pb and Zn. The scallops were obtained from a breeding farm near to the study site. The DGTs were assembled with Chelex-100 resin as binding agent, diffusion gel of agarose-polyacrylamide and membrane filter of cellulose acetate. The scallops and DGTs were immersed in three sampling points within the bay during July to September/2012 (Winter campaign) and December/2012 to February/2013 (Summer campaign). The metals were determined by inductively coupled plasma mass spectrometry (ICP-MS) and optical emission spectrometry (ICP OES). The DGT technique was successfully used to determine the concentration of most the metals, except Al, Zn and Pb when short deployment time were used. The results obtained using different porosities of diffusive gels showed no significant presence of metal organic forms... (Complete abstract click electronic access below) / FAPESP: 11/16579-2

Made available in DSpace on 2014-08-27T14:36:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-10-07Bitstream added on 2014-08-27T15:57:10Z : No. of bitstreams: 1 000731578.pdf: 4931045 bytes, checksum: 792fda30b3a4a2b259c5408130415435 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Na região de Teixeira Soares, Estado do Paraná, a porção superior da Formação Taciba (~60m), Grupo Itararé, é dominada por conglomerados matriz-suportados, maciços a laminados, representando diamictitos polimíticos ressedimentados. Este é sucedido por arenitos finos a médios, com estratificação cruzada tabular e pavimentos de conchas, interpretados como depósitos litorâneos. Acima, ocorrem siltitos laminados e intensamente bioturbados com conchas articuladas, provavelmente depositadas em ambientes de plataforma interna. Para o topo, arenitos finos a muito finos/siltitos com estratificações cruzada de baixo ângulo e hummocky, e argilitos intercalados, incluindo conchas in situ, são interpretadas como tempestitos amalgamados de plataforma interna distal. Finalmente, siltitos maciços a laminados/argilitos ou folhelhos cinza escuro são inferidos como depósitos de plataforma externa (Folhelho Passinho), o qual é sucedido por sedimentos flúvio-deltáicos da Formação Rio Bonito. Esta sucessão de granodecrescência ascendente não apresenta clastos-caídos, e está associada à transgressão pós-glacial do Paleozoico Superior. Seis assembleias de bivalves foram reconhecidas, refletindo mudanças nos parâmetros paleoambientais. Dezenove espécies foram identificadas, incluindo quatro novas. Myonia argentinensis, Atomodesma (Aphanaia) orbirugata e Heteropecten paranaensis indicaram correlação com as assembleias da Formação Bonete, Bacia Sauce Grande, Argentina, sugerindo idade asseliana–sakmariana. Membros típicos das biotas de ambientes marinhos frios, como Eurydesma–Trigonotreta, não foram registrados / At the Teixeira Soares County, Paraná State, the uppermost portion of the Taciba Formation (~60 m thick), Itararé Group, is dominated by massive to laminated, matrixsupported conglomerates, representing re-sedimented polymitic diamictites. This is succceded by fine to medium-grained sandstone with tabular cross stratification and shell pavements, interpreted as nearshore deposits. Above, laminated and intensely bioturbated siltstones with articulated shells, probably deposited in inner shelf settings occur. To the top, amalgamated, fine to very fine sandstone/siltstone with low-angle cross-stratification or hummocky cross-stratification and intercalated mudstones, including in situ shells, are interpreted as stacked storm deposits, in distal shoreface environments. Finally, massive to laminated siltstone/mudstone or gray shales are inferred as outer shelf deposits (Passinho shale), which are capped by fluvio-deltaic sediments of the Rio Bonito Formation. This finning upwards succession characteristically lacks any dropstones or ice-rafted debris, and is associated to the Late Paleozoic post-glacial transgression. Six distinct, bivalve-rich assemblages were identified, reflecting changes in paleoenvironmental parameters. Ninteen species were described, including four new. Myonia argentinensis, Atomodesma (Aphanaia) orbirugata and Heteropecten paranaensis indicate correlation with assemblages of the Bonete Formation, Sauce Grande Basin, Argentina, indicating a possible Late Asselian–Sakmarian age. Members of the icehouse-style Eurydesma– Trigonotreta biota are lacking / FAPESP: 09/17555-0

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2017-10-18T22:18:16Z No. of bitstreams: 1 0618287.pdf: 12179068 bytes, checksum: 13e44b49049afe8bbb9eb34c82a01b25 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-18T22:18:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 0618287.pdf: 12179068 bytes, checksum: 13e44b49049afe8bbb9eb34c82a01b25 (MD5) Previous issue date: 2004-03 / PETROBRÁS / O bivalve invasor Isognomon bicolor vem ocupando uma ampla faixa em costões rochosos do litoral do estado do Rio de Janeiro e tem aparentemente causado alterações nas comunidades nativas. Este trabalho determina a distribuição geográfica de I. bicolor no litoral do estado do Rio de Janeiro, comparar a sua estrutura populacional entre três áreas e relacionar a sua abundância relativa à estrutura das comunidades em cada área. Também investiga a variação temporal da abundância relativa, da distribuição vertical e da estrutura populacional de I. bicolor. As coletas foram realizadas no inverno de 2002 e no verão de 2003 na Ilha do Brandão (Angra dos Reis), na Ponta da Fortaleza (Arraial do Cabo) e na Praia Vermelha (Rio de Janeiro). Nesta última, também foi realizada uma coleta no inverno de 2003. Os indivíduos coletados na Praia Vermelha são os que possuem o maior tamanho máximo e médio, sendo os indivíduos da Ilha do Brandão, os que possuem o menor tamanho máximo e médio. Nestas duas áreas, foram encontrados menos recrutas em comparação com a Ilha do Brandão, onde a moda ficou nas classes de tamanho menores. A hipótese mais provável para explicar o maior número de recrutas na Ilha do Brandão é que Petaloconchus sp fornece um substrato que favorece o assentamento de larvas e a fixação dos indivíduos impede que estes se desprendam. Entretanto, Petaloconchus sp. parece funcionar como uma armadilha, porque apesar de mais indivíduos de I. bicolor recrutarem, poucos conseguem crescer e se desenvolver. / The exotic bivalve Jsognomon bicolor is found in large densities on the rocky shores of the Rio de Janeiro state and is apparently altering the native community. The aim of this study was to establish the geographic distribution of I. bicolor on the coast of Rio de Janeiro state, to compare population structure among three different areas and to verify the relationship of its relative abundance with the community structure in each area The temporal variation of relative abundance, vertical distribution and population structure of I. bicolor were also investigated. Samples were taken in winter (2002) and summer (2002-03) at Ilha do Brandão (Angra dos Reis), Ponta da Fortaleza (Arraial do Cabo) and Praia Vermelha (Rio de Janeiro). ln Praia Vermelha, samples were also taken in the following winter (2003). The individuals sampled at Praia Vermelha presented the highest maximum and medium sizes, whereas the individuals collected at Ilha do Brandão presented the lowest maximum and medium size. There was a lower number of recruits of L bicolor in these areas than in Ilha do Brandão, where a mode was found in the lower size classes. The most reasonable hypothesis to explain the highest number of recruits in Ilha do Brandão is that Petaloconchus sp. provides a substrate that enhances settlement of larvae and the attachment of individuals. Although Petaloconchus sp. acts as a trap. It enhances recruitment of more individuals but only a few can grow and develop within it.

Orientador: Amauri Antonio Menegário / Coorientador: Eleine Francioni de Abreu Lima / Banca: Pedro Magalhães Padilha / Banca: Gisela de Aragão Umbuzeiro / Resumo: Os ecossistemas marinhos próximos ao continente são locais muito sensíveis às mudanças ambientais. Nestas áreas, a biodiversidade é extremamente expressiva, com diversas espécies de importância econômica. A determinação de metais nos ecossistemas marinhos que se interceptam com atividades humanas é importante para avaliar as interferências e modificações que o homem causa nestes ambientes. A determinação de metais em ambientes aquáticos utilizando organismos vem sendo muito empregada, principalmente por meio de bivalves, proporcionando dados importantes sobre a biodisponibilidade destes contaminantes na água. A técnica de difusão por filmes finos em gradientes de concentração (DGT) também tem sido empregada para avaliar a concentração de metais em águas doces e marinhas, determinando a fração lábil destes potencias poluentes. Nesta pesquisa foram realizadas amostragens in situ na baía da Ilha Grande, RJ, utilizando Nodipecten nodosus ("vieira") transplantados juntamente com dispositivos da técnica DGT para a determinação de Al, Cd, Co, Cu, Mn, Ni, Pb e Zn; visando uma comparação das duas técnicas e a obtenção de dados sobre a labilidade e biodisponibilidade destes metais. As vieiras foram obtidas de uma fazenda de criação próxima ao local de estudo. Os dispositivos DGTs foram do tipo convencional: resina Chelex-100 como ligante, gel difusivo de poliacrilamida-agarose e membrana filtrante de acetato de celulose. As vieiras e os dispositivos DGT ficaram imersos em três pontos de amostragem no interior da baía durante Julho a Setembro/2012 (Campanha de Inverno) e Dezembro/2012 a Fevereiro/2013 (Campanha de Verão). As determinações das concentrações dos metais foram feitas por espectrometria de massas com plasma acoplado indutivamente (ICP-MS) e espectrometria de emissão óptica (ICP OES)... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Marine ecosystems near to the continent are very sensitive to local environmental changes, where biodiversity is extremely important. Also in this areas, there are several species of economic importance and used for human consumption. Determination of metals in areas where the marine ecosystem and human activities are connected is important to evaluate interference and modifications that the man causes in these environments. The determination of metals in aquatic organisms has been widely used, mainly by using bivalves, providing important data on the bioavailability of these contaminants in the water. The technique of Diffusive Gradients in Thin Films (DGT) has also been employed to assess the concentration of metals in freshwater and marine water, determining the lability these potential pollutants. Aiming to compare different techniques, this research was carried out in the Ilha Grande bay, RJ, using transplanted Nodipecten nodosus ("scallop") and the DGT technique for the determination of Al, Cd, Co, Cu, Mn, Ni, Pb and Zn. The scallops were obtained from a breeding farm near to the study site. The DGTs were assembled with Chelex-100 resin as binding agent, diffusion gel of agarose-polyacrylamide and membrane filter of cellulose acetate. The scallops and DGTs were immersed in three sampling points within the bay during July to September/2012 (Winter campaign) and December/2012 to February/2013 (Summer campaign). The metals were determined by inductively coupled plasma mass spectrometry (ICP-MS) and optical emission spectrometry (ICP OES). The DGT technique was successfully used to determine the concentration of most the metals, except Al, Zn and Pb when short deployment time were used. The results obtained using different porosities of diffusive gels showed no significant presence of metal organic forms... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Marcello Guimarães Simões / Banca: Maria Alejandra Pagani / Banca: Setembrino Petri / Banca: José Carneiro Castro / Banca: Luiz Carlos Weinschütz / Resumo: Na região de Teixeira Soares, Estado do Paraná, a porção superior da Formação Taciba (~60m), Grupo Itararé, é dominada por conglomerados matriz-suportados, maciços a laminados, representando diamictitos polimíticos ressedimentados. Este é sucedido por arenitos finos a médios, com estratificação cruzada tabular e pavimentos de conchas, interpretados como depósitos litorâneos. Acima, ocorrem siltitos laminados e intensamente bioturbados com conchas articuladas, provavelmente depositadas em ambientes de plataforma interna. Para o topo, arenitos finos a muito finos/siltitos com estratificações cruzada de baixo ângulo e hummocky, e argilitos intercalados, incluindo conchas in situ, são interpretadas como tempestitos amalgamados de plataforma interna distal. Finalmente, siltitos maciços a laminados/argilitos ou folhelhos cinza escuro são inferidos como depósitos de plataforma externa (Folhelho Passinho), o qual é sucedido por sedimentos flúvio-deltáicos da Formação Rio Bonito. Esta sucessão de granodecrescência ascendente não apresenta clastos-caídos, e está associada à transgressão pós-glacial do Paleozoico Superior. Seis assembleias de bivalves foram reconhecidas, refletindo mudanças nos parâmetros paleoambientais. Dezenove espécies foram identificadas, incluindo quatro novas. Myonia argentinensis, Atomodesma (Aphanaia) orbirugata e Heteropecten paranaensis indicaram correlação com as assembleias da Formação Bonete, Bacia Sauce Grande, Argentina, sugerindo idade asseliana-sakmariana. Membros típicos das biotas de ambientes marinhos frios, como Eurydesma-Trigonotreta, não foram registrados / Abstract: At the Teixeira Soares County, Paraná State, the uppermost portion of the Taciba Formation (~60 m thick), Itararé Group, is dominated by massive to laminated, matrixsupported conglomerates, representing re-sedimented polymitic diamictites. This is succceded by fine to medium-grained sandstone with tabular cross stratification and shell pavements, interpreted as nearshore deposits. Above, laminated and intensely bioturbated siltstones with articulated shells, probably deposited in inner shelf settings occur. To the top, amalgamated, fine to very fine sandstone/siltstone with low-angle cross-stratification or hummocky cross-stratification and intercalated mudstones, including in situ shells, are interpreted as stacked storm deposits, in distal shoreface environments. Finally, massive to laminated siltstone/mudstone or gray shales are inferred as outer shelf deposits (Passinho shale), which are capped by fluvio-deltaic sediments of the Rio Bonito Formation. This finning upwards succession characteristically lacks any dropstones or ice-rafted debris, and is associated to the Late Paleozoic post-glacial transgression. Six distinct, bivalve-rich assemblages were identified, reflecting changes in paleoenvironmental parameters. Ninteen species were described, including four new. Myonia argentinensis, Atomodesma (Aphanaia) orbirugata and Heteropecten paranaensis indicate correlation with assemblages of the Bonete Formation, Sauce Grande Basin, Argentina, indicating a possible Late Asselian-Sakmarian age. Members of the icehouse-style Eurydesma- Trigonotreta biota are lacking / Doutor

Orientadores: Luiz Francisco Lembo Duarte, Vera Nisaka Solferini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-15T12:02:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Aranha_TiagoPorto_M.pdf: 851406 bytes, checksum: 8a0e698a85700d7b59721c4e8167d63f (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: A quantidade de espécies envolvidas, a amplitude geográfica e a freqüência de ocorrência das invasões biológicas não conhecem precedentes. Atualmente as invasões são consideradas um processo composto de múltiplos estágios, dinâmico no espaço e no tempo. As populações invasoras podem estacionar em determinados estágios e até regredir a estágios anteriores antes de atingir a fase de clímax. As invasões são consideradas uma das grandes causas da extinção de espécies no planeta, desta forma, a compreensão dos mecanismos e fatores que influenciam o sucesso das invasões e o entendimento de seus efeitos em comunidades nativas é fundamental. O objeto de estudo do presente trabalho é o bivalve invasor Isognomon bicolor em costões rochosos do sudeste do Brasil. No capítulo I, padrões de distribuição e dominância de populações localizadas no litoral norte de São Paulo foram documentados. A situação atual da invasão de I. bicolor foi avaliada frente às populações de organismos nativos da área. No capítulo II, padrões de variabilidade e estruturação genética de populações de I. bicolor no litoral sudeste foram descritos e comparados com aqueles para populações do bivalve nativo Brachidontes solisianus. A combinação dessas duas abordagens permitiu uma maior compreensão do processo de invasão de I. bicolor e das conseqüências dessa invasão sobre as espécies nativas. Atualmente I. bicolor apresenta-se amplamente distribuído no litoral norte de São Paulo, entretanto, ao contrário de estudos anteriores, suas populações apresentam baixas porcentagens de cobertura nos costões onde ocorre. Tal fato deve-se a um evento de mortaliade em massa pelo qual a espécie passou recentemente. A alta variabilidade e baixa estruturação genética observada, semelhante à encontrada para o bivalve nativo B. solisianus, são indícios de um processo de invasão costituido por múltiplos episódios de introdução e da grande capacidade de dispersão do invasor. Esses resultados são preocupantes pois sugerem que as populações de I. bicolor estão relativamente estáveis e conectadas entre si, tornando sua exitinção na costa sudeste do Brasil improvável, mesmo após a ocorrência do evento de mortalidade em massa / Abstract: The species number, geographic scale and frequency of biological invasions are unparalleled. Currently, invasions are considered as a several stages process, dynamic in space and time. The invasive populations can remain at some stage or return to earlier stages before reaching the invasion climax. Invasions are considered one of the major causes of species extinction on the planet and thus. Understanding mechanisms and factors that influence invasion success and its effects on native communities is of primary imporatance. The present work studied the invasive Isognomon bicolor populations along the southeastern coast of Brazil. In Chapter I, the distribution and the dominance patterns of I. bicolor were documented along the northern coast of São Paulo. The population attributes of the invasive species I. bicolor were evaluated and compared to the population attributes of native organisms in the sampled area. In Chapter II, the genetic variability and the structure patterns of four I. bicolor populations on southeastern Brazilian Coast were analyzed and compared with those of the native Brachidontes solisianus populations. The combination of these two approaches has enabled a better understanding of I. bicolor invasion process and its consequences for native species. Currently, I. bicolor has become widely distributed in the northern coast of São Paulo, however, unlike previous studies, I.bicolor is not dominant in the rocky shores. This fact may be caused by a recent mass mortality event. The high variability and low genetic structure observed, similar to the genetic attibutes of the native bivalve B. solisianus populations, are evidences of an invasion process with multiple introduction events and of the large invader dispersal ability. These results are concerning as they suggest that I.bicolor populations are relatively stable and connected to each other, making its extinction in the southeastern coast of Brazil unlikely, even after the occurrence of a mass mortality event / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

A Actuopaleontologia é o ramo da Paleontologia que visa aperfeiçoar as interpretações paleoambientais e paleoecológicas através das assinaturas tafonômicas, principalmente aquelas presentes em conchas bivalves. Tais estudos tafonômicos com bivalves marinhos têm sido conduzidos em ambientes sedimentares do Holoceno, porém, no Brasil, investigações similares são ainda incipientes, tendo sua predominância no litoral norte do Estado de São Paulo. O Complexo Estuarino de Paranaguá (CEP), situado na porção centro-norte do litoral do Paraná, possui feições fisiográficas distintas das encontradas no litoral norte do Estado de São Paulo. Com o objetivo de gerar dados comparativos entre os diferentes ambientes da costa brasileira, este estudo pretende caracterizar tafonomicamente as associações de moluscos bivalves em 11 pontos de coleta ao longo do CEP. Foram coletados oito litros de sedimento com a utilização de pegador de fundo tipo Petersen, em parceria com o Laboratório de Oceanografia Geológica (LOGeo CEM/UFPR). As assinaturas tafonômicas analisadas, podendo ser de origem química, física e/ou biológica, foram: articulação, tipo de valva, fragmentação, modificação da margem da concha, corrasion, perióstraco, brilho, cor, bioerosão, incrustação e predação. A ação dessas assinaturas pode resultar em outra assinatura tafonômica aqui analisada, a alteração da textura da superficial da concha. Foram analisados 150 bioclastos de cada um dos pontos de coleta, e cada assinatura tafonômica foi classificada individualmente. Os bioclastos foram peneirados em malhas de 2 mm para que as menores classes de tamanho não fossem excluídas das análises tafonômicas. Além dos bioclastos, foram coletadas amostras da água junto ao fundo dos locais amostrados, para registro de pH, salinidade, temperatura e turbidez. Ao total, 1.438 bioclastos foram utilizados nas análises tafonômicas e, das 11 estações de coleta, apenas duas não apresentaram o n mínimo de 150 conchas. Os dados abióticos não apresentaram grandes diferenças nas diferentes estações de coleta. A análise de cluster foi feita levando-se em consideração todas as assinaturas tafonômicas estudadas, e um dendograma geral relacionou os 9 pontos de coleta em que obteve-se o mínimo de 150 bioclastos. O dendograma gerado nesta análise mostrou quais as acumulações de moluscos bivalves e seus respectivos pontos de coleta estão mais semelhantes. Há um primeiro grupo formado pelas estações 683, 336, 482, 696 e 32. Com exceção da estação 32, as estações reunidas no primeiro grupo são os pontos de coleta mais próximos às desembocaduras do CEP, região de maiores profundidades e fortes correntes de marés. O segundo grupo é formado pelas estações 607, 152, 645 e 472, sendo pontos de coleta mais internos na área do CEP, próximos a ilhas, manguezais e bancos de areia. As assinaturas alteração da cor, brilho, modificação da margem, perióstraco e corrasion não parecem ser assinaturas úteis na identificação ou para uma possível caracterização dos diferentes ambientes do CEP. Isto porque elas não são variáveis entre esses diferentes ambientes. Houve predominância de desarticulação e fragmentação das valvas em todos os ambientes estudados, sendo possível que a fragmentação esteja sobre maior influência dos danos biológicos. Bioerosão e incrustação não apareceram em frequências expressivas, porém, apenas as estações de coleta próximas a desembocadura do CEP apresentaram bioeorosão, enquanto incrustação apareceu em todas as estações. A textura superficial da concha correlacionou-se positivamente com as assinaturas corrasion e bioerosão. / Actuopaleontology is the branch of Paleontology that aims to enhance paleoecological and paleoenvironmental interpretations, through the taphonomic signatures, especially those in bivalve shells. Such taphonomic studies with marine bivalves have been conducted in sedimentary Holocene environments, however, in Brazil, similar investigations are still incipient, having its predominance in the northern coast of São Paulo. The Paranaguá Estuarine Complex (CEP), situated in the north central portion of the Paraná coast, has different physiographic characteristics of those found in the north coast of São Paulo. In order to generate comparative data between different environments of the Brazilian coast, this study aims to characterize the taphonomy of bivalve mollusk associations from 11 collection stations along the CEP. Eight liters of sediment were collected with background catcher Petersen, in partnership with the Laboratory of Geological Oceanography (LOGeo - CEM/UFPR). The taphonomic signatures analyzed, which may be of chemical, physical and/or biological origin, were: articulation, valve type, fragmentation, edge modification, corrasion, periostracum, brightness, color, bioerosion, encrustation and predation. The action of these signatures may result in other taphonomic signature analyzed here, the alteration of shell superficial texture. 150 bioclasts were analyzed from each collection point and each taphonomic signature was individually classified. The bioclasts were sieved through mesh of two millimeter, so that classes of smaller size were not excluded from the taphonomic analyzes. In addition, water samples were collected at the bottom of each station for analysis of pH, salinity, temperature and turbidity. In total, 1,438 bioclasts were used in the taphonomic analysis and only two stations did not show the minimum n of 150 shells. Abiotic data showed no great differences in the different sampling stations. The cluster analysis was performed taking into account all studied taphonomic signatures, and a general dendrogram listed the collection points that showed the minimum of 150 bioclasts. The dendrogram generated in this analysis showed which accumulations of bivalve molluscs and their respective collection points are more similar. There is a first group formed by the stations 683, 336, 482, 696 and 32. With the exception of station 32, the stations on the first group are the closest to the mouths of the CEP, region of greater depths and strong tidal currents. The second group is formed by stations 607, 152, 645 and 472, being the more internal collection points, near islands, mangroves and sandbanks. The signatures color, brightness, edge modification, periostracum and corrasion do not seem to be useful in identifying or for a possible characterization of the different environments of the CEP, because they are not variable between these different environments. There was predominance of disarticulation and fragmentation of the valves in all study sites, being possible that the fragmentation was influenced more by biological damages. Bioerosion and encrustation did not appear in expressive frequencies, however, only the stations near the mouth of the CEP presented bioeorosão, while encrustation appeared in all stations. The surface texture of the shell was correlated positively with the sigantures corrasion and bioerosion.

Orientador: Flávio Dias Passos / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-23T04:53:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Machado_FabrizioMarcondes_M.pdf: 6179757 bytes, checksum: 5fb73eff92075fe6ed70b1ce5dbb75f0 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: A conservação da biodiversidade marinha e o pouco conhecimento sobre a ecologia das espécies que habitam regiões mais profundas são temas atuais e amplamente discutidos. Com o objetivo geral de conhecer as espécies e a ecologia dos organismos marinhos bentônicos da Bacia de Campos - RJ, foi implantado o programa HABITATS- "Avaliação da Heterogeneidade Ambiental da Bacia de Campos". Apoiado pela Petrobras S.A./CENPES, o programa HABITATS foi realizado no período de fevereiro/2009 a julho/2009 e foi composto por nove transectos perpendiculares a linha da costa, localizados principalmente entre a Plataforma e o Talude Continental, totalizando 149 estações de coleta em faixas batimétricas que variaram de 25 a 3.000 metros de profundidade. O presente trabalho se baseia em espécimes obtidos a partir desse programa e tem como objetivos principais, o registro de duas famílias de bivalves (Cyamiidae e Spheniopsidae) para o Brasil, além da análise taxonômica e da descrição de três novas espécies de microbivalves. Após cerca de dois anos de triagens mais de 5.000 espécimes de bivalves provindos da Plataforma Continental foram analisados. Desse total foram identificadas 180 espécies, agrupadas em 47 famílias. Nesse trabalho foram descritas três novas espécies de microbivalves: Cyamiocardium sp. n. pertencente à família Cyamiidae; Grippina sp. n. e Spheniopsis sp. n. pertencentes à família Spheniopsidae. Ambas, devido ao tamanho diminuto (1,75 - 4,5 mm de comprimento), não puderam ter a sua anatomia descrita apenas por técnicas manuais de dissecção, sendo submetidas então a um processo de descalcificação e posteriormente a microscopia eletrônica de varredura e a histologia. Foram analisados 356 indivíduos de Cyamiocardium sp. n. sendo 25 destes com parte mole e coletados em uma faixa de 26-75m de profundidade. Para as espécies de Spheniopsidae, foram analisados 58 indivíduos de Grippina sp. n. sendo 20 com parte mole e coletados entre 21-53 m de profundidade e 189 indivíduos de Spheniopsis sp. n. sendo 2 com parte mole e coletados entre 17-148 m de profundidade. Para a família Cyamiidae cujas espécies eram até então distribuídas somente em águas australianas, neozelandesas, antárticas, subantárticas e magelânicas, o presente trabalho ampliou sua distribuição, fazendo o primeiro registro da família para águas brasileiras, além de descrever uma nova espécie. Já para a família Spheniopsidae além de um novo registro e da descrição de duas novas espécies, foi realizada a primeira descrição anatômica do grupo além de uma discussão sobre sua posição filogenética dentre os Anomalodesmata / Abstract: The conservation of marine biodiversity and little knowledge about the ecology of the species inhabiting deeper regions are current topics widely discussed. With the overall aim of knowing the species and ecology of benthic marine organisms in the Campos Basin, Rio de Janeiro, was implemented the HABITAT program "Assessment of Environmental Heterogeneity in the Campos Basin. Supported by Petrobras SA / CENPES, HABITAT program was conducted from February/2009 to July/2009 and was composed of nine transects perpendicular to shoreline, located mainly between the shelf and the continental slope, totaling 149 sampling stations in bathymetric ranges that varied from 25 to 3.000 meters deep. This study is based on specimens obtained from that program and aims general registration of two new families of bivalves (Cyamiidae and Spheniopsidae) for Brazil, besides the taxonomic analysis and description of three new species of microbivalves. After two years of triage, more than 5.000 specimens of bivalves from Continental Shelf were analyzed, of these about 180 species were identified and grouped into 40 families. In this work three new species of microbivalves were described: Cyamiocardium n. sp. belonging to the family Cyamiidae; Grippina n. sp. and Spheniopsis n. sp. belonging to the family Spheniopsidae. Because of their small size (1.75 - 4,5 mm in length), both not have their anatomy described by classical techniques of dissection and then subjected a process of descalcification and subsequent to scanning electron microscopy and histology. Were analyzed 356 individuals of Cyamiocardium n. sp. with 25 of these being soft part and collected in a range of 26-75 meters deep. To species Spheniopsidae, 58 individuals were analyzed Grippina n. sp. with 20 the soft part and collected between 21-53 meters deep and 189 individuals of Spheniopsis n. sp. with two the soft part and collected between 17-148 meters depth. For family Cyamiidae whose species were previously distributed only in Australian, New Zealand, Antarctic, Subantarctic and Magelanic waters, this study has expanded its distribution by making the first record of the family to Brazilian waters, and describe a new species. Already to the family Spheniopsidae addition of a new record and description of two new species, was held the first anatomical description of the group as well as a discussion of its phylogenetic position among Anomalodesmata / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia