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FTIR ATR aplicado à discriminação de microalgas planctônicas verdes cocóides

Moraes, Guilherme Pavan de 30 May 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6033.pdf: 3278250 bytes, checksum: df418380338cf9e1a71904463a855d69 (MD5) Previous issue date: 2014-05-30 / Financiadora de Estudos e Projetos / This work proposes the use of the Fourier Transform Infrared (FTIR) spectroscopy as part of a polyphasic approach to assist the identification and classification of coccoid green microalgae. Attenuated Total Reflectance (ATR) technique was tested to determine if it can provide highly reproducible spectra, a primary requirement to achieve good discrimination between strains of microorganisms. It was also tested spectral window selection, in conjunction with spectra pre-treatments, to determine the best method to perform the strains discrimination. The results were evaluated by reproducibility of spectra and chemometrics analyses by principal components (PCA) and hierarchical clusters (HCA) analysis, in terms of correct discrimination and classification of closely related chlorophycean coccoid microalgae strains, compared to currently accepted classifications. ATR technique provided the reproducibility needed, verified by the excellent strains discrimination. Further, strains were positioned by HCA in clades correctly correlated to classification ranks orders and families. However, these results were obtained when using spectral windows that differ from previously reported studies, 1500 1200 cm-1 and 900 675 cm-1, excluding spectrum regions relative to storage compounds, which was found to negatively impact the analyses. It was concluded that the ATR - FTIR technique has great potential to assist traditional approaches of coccoid green microalgae identification and classification, though a careful spectrum region selection is needed. / Este trabalho propõe o uso da espectroscopia de infravermelho por transformada de Fourier (FTIR) como parte de uma abordagem polifásica para ajudar na identificação e classificação de microalgas verdes cocóides. A técnica ATR (Attenuated Total Reflectance) foi testada quanto a sua capacidade de fornecer espectros altamente reprodutíveis, requerimento primário para obter boa discriminação entre cepas de microrganismos. Testou-se a seleção de janelas espectrais, em conjunção com pré-tratamentos dos espectros, para determinar o melhor método para realizar a separação das cepas. Os resultados foram avaliados quanto à reprodutibilidade do espectro e através de análises de quimiometria por análise de componentes principais (PCA) e análise de clusters hierárquicos (HCA), em termos da correta discriminação e classificação das cepas de microalgas clorofíceas cocóides proximamente relacionadas, comparadas com as classificações atualmente aceitas obtidas da literatura. A técnica de ATR forneceu a reprodutibilidade necessária, verificada pela excelente discriminação das cepas. Adicionalmente, as cepas foram posicionadas em clusters no HCA que se correlacionam corretamente com as classificações das ordens e famílias. No entanto, para obter estes resultados usamos janelas espectrais que diferem de estudos anteriores, 1500 1200 cm-1 e 900 675 cm-1, excluindo regiões do espectro relativas a compostos de reservas, as quais influenciaram negativamente as análises. Concluímos que a técnica de FTIR ATR tem grande potencial para ajudar as abordagens tradicionais de identificação e classificação de microalgas verdes cocóides, contanto que uma cuidadosa seleção de regiões espectrais seja realizada.
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Avaliação da universalidade de primers de marcadores moleculares para aplicação na classe Chlorophyceae (Chlorophyta)

Vieira, Helena Henriques 30 May 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6126.pdf: 1329059 bytes, checksum: 59a44130f8729045ce75390394dff4ea (MD5) Previous issue date: 2014-05-30 / Financiadora de Estudos e Projetos / The polifasic taxonomy approach became indispensable in classification of living beings, especially microorganisms, such as Chlorophyceae. This class is compound of very distinct organisms most microscopic, unicellular, colonials, filamentous, and the classification and identification is many times hampered due the lack of structures observable that helps the discrimination. Some habits, reproduction, the occurrence of cryptic species are some factors that can lead to forms that make difficult the taxonomy of these organisms. Besides the traditional morphology, the molecular biology allows a robust concerning the classification of the studied organism. Associated to a better classification, the search for faster and more practical methods of identification, as DNA Barcode, became intensified and many molecular markers are available in literature to be tested. For some groups of animals, brown algae, red algae and diatoms the marker COXI is considered an official DNA Barcode. However other groups, as Chlorophycea, are under constant investigation, due the fact that molecular marker that can be used satisfactory as DNA Barcode have not been found yet. Plastid markers as tufA, rbcL and nuclear as ITS are some of the most proposed to be applied in green algae, often combined with each other or other markers. However, for act as a molecular marker, it is necessary to be amplified by primers broadly applied. The present study has tested primers for tufA, ITS and rbcL marker, available in literature and already in use in other groups, looking for universality in Chlorophyceae. We also tested proposed universal primers for Chlorophyta (UCP4). Moreover, preliminary analyses have been performed for application of the markers as barcode in the class. The primers used for tufA marker showed universality in Chlorophycea amplifying for all 22 strains tested and sequencing have failed only for Oedogonium strain. From the rbcL marker, the primer pair GrbcL has amplified 12 and sequenced 7 of 22 strains and rbcLFP which one the reverse primer was designed in this study amplified and sequenced 16 lineages. Primers from the ITS marker amplified only 5 lineages and UCP4 primers have not amplified any strain. Beside the universality found for tufA primers, Analysis with the obtained sequences showed that the tufA gene is a promising molecular marker to be applied in Chlorophyceae. / A abordagem polifásica de taxonomia se tornou indispensável na classificação especialmente de microorganismos, como os da classe Chlorophyceae. Esta classe é composta de organismos muito distintos, sendo a maioria microscópica, apresentando formação do talo unicelular, colonial e filamentosa e a classificação e identificação dos representantes desta classe são muitas vezes dificultadas pelo fato de não possuírem estruturas observáveis em microscópio usadas para discriminação. Alguns hábitos e tipos de reprodução, a ocorrência de espécies crípticas são alguns fatores que podem resultar em formas que também dificultam a taxonomia destes organismos. Associada a uma classificação mais robusta, a procura por métodos mais rápidos e práticos, como o DNA Barcode, se intensificou e muitos marcadores moleculares já se encontram disponíveis na literatura para serem testados. Para alguns grupos de animais, algas pardas, algas vermelhas e diatomáceas o marcador COXI é considerado oficial como DNA Barcode. Entretanto, outros grupos como Chlorophyceae este marcador não é aplicável devido a sua natureza conservada e, portanto, estão sob constante investigação, devido ao fato de que ainda não foram encontrados marcadores que possam ser aplicados satisfatoriamente como DNA Barcode. Marcadores plastidiais como tufA, rbcL e nucleares como o ITS são alguns dos mais aplicados em estudos com algas verdes, muitas vezes combinados entre si ou com outros marcadores. Entretanto para que figurem como marcadores moleculares devem ser amplificados por primers que possam ser aplicados de maneira ampla. Assim, o presente estudo teve como objetivo testar primers para os marcadores tufA, ITS, rbcL , disponíveis na literatura e já aplicados com outros grupos, buscando a universalidade destes primers também em Chlorophyceae. Foi testado também um par de primers proposto como universal para Chlorophyta (UCP4). Os primers para o gene tufA mostraram universalidade para a classe amplificando todas as 22 cepas testadas com falha no seqüenciamento apenas para a cepa de Oedogonium sp.Os primers para o gene rbcL, GrbcL, amplificou 12 e seqüenciou satisfatoriamente 7 cepas das 22 utilizadas, e o par rbcLFP, o qual teve um de seus iniciadores desenhado neste estudo, amplificou e seqüenciou 16 cepas. Primers para o gene ITS amplificaram 5 cepas com bom seqüenciamento de apenas 3 e o par de primers UCP4 não amplificou nenhuma cepa. Além da universalidade observada do par de primers para o gene tufA, análises com as seqüências obtidas mostraram que este gene se mostrou um promissor candidato a marcado molecular para aplicação na classe Chlorophyceae.
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Atropelamento de vertebrados silvestres em uma região fragmentada do nordeste do estado de São Paulo: quantificação do impacto e análise de fatores envolvidos.

Prada, Cristiana de Santis 15 April 2004 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissCSP.pdf: 4259828 bytes, checksum: a50db78d763141ff295d52f9af816731 (MD5) Previous issue date: 2004-04-15 / Financiadora de Estudos e Projetos / Mortality due to road kills has a great impact on natural populations. The present work had the objectives of quantifying road-killed vertebrates in a circuit of the main highways of northeastern São Paulo State, a fragmented area with several unconnected Conservation Units, and to identify factors associated with this source of mortality. For the count of road-killed animals, 52 weekly trips were performed during one year (August 19, 2002 to August 11, 2003) in a circuit of the highways SP253, SP330, SP215, SP310, SP215, SP318, SP255. The species encountered were classified in numbers of one to five, in decreasing order, according to the priority of its conservation in the area. The results from the trips were 596 animals of 81 different species: birds, 310 (52% of the total, 45 identified species); mammals, 184 (31%, 23 species); reptiles, 56 (9%, 11 species); amphibians 35 (6%, 2 species); and 11 (2%), not identified. Considering the 239,24km of the circuit 2,49 animals/km/year were killed. Considering the total effort of 12.440,48km traveled, an average of 0,048animals/km was obtained. These data were added to those supplied by other sources of information, yielding records of 746 animals: 323 birds, 266 mammals, 94 reptiles, 35 amphibians and 28 not identified. In a general way there was smaller number of road-kills in the dry period than in the rainy season, but there was great variation among some species, apparently related to their natural history. The most-frequently found species was the opossum (Didelphis albiventris), with 53 records, in other words, 28,8% of the total of mammals, 8,89% of the total of animals. The Order Carnivora had the largest number of road-killed species (4) among the mammals. There were records of threatened species at the São Paulo State such as the Maned-wolf (Chrysocyon brachyurus), Ocelot (Leopardus pardalis), Giant anteater (Myrmecophaga tridactyla) and Broad Snouted Caiman (Cayman latirostris) and of species that don't occurr naturally in the State. It was found that 70,21% of the animals of categories 1 and 2 (i.e. conservation priorities in the area) died in 47%, or 111,72km of the studied itinerary. This road segment is at a maximum distance of 10km from the nearby Conservation Units, or 5km from the river Mogí-Guaçu. Mitigatory measures were discussed, and four prioritary areas for their establishment were proposed. / A mortalidade por atropelamento é fator de grande impacto sobre populações naturais. O presente trabalho teve os objetivos de quantificar o atropelamento de vertebrados em um circuito das principais estradas da região nordeste do Estado de São Paulo, área fragmentada e com a presença de diversas Unidades de Conservação desconectas, e analisar fatores que influenciam os atropelamentos. Para a contagem de animais atropelados foram realizadas 52 viagens, uma por semana ao longo de um ano (de 19 de agosto de 2002 a 11 de agosto de 2003) fazendo um circuito pelas rodovias: SP253, SP330, SP215, SP310, SP318, SP255. Também foram colhidos dados de atropelamento de animais, fornecidos pela Polícia Militar Rodoviária, Departamento de Estradas de Rodagem de Jaboticabal-SP, ARTESP e duas empresas concessionárias de rodovias. As espécies encontradas foram categorizadas em números de um a cinco, em ordem decrescente, conforme a prioridade à sua conservação na região. O total de vertebrados atropelados registrados nas viagens de campo foi de 596 indivíduos de 81 espécies diferentes: aves, 310 (52% do total, 45 espécies identificadas); mamíferos, 184 (31%, 23 espécies); répteis, 56 (9%, 11 espécies); anfíbios 35 (6%, 2 espécies); e 11 (2%), não foram identificados. Considerando os 239,24km do percurso, foram atropelados 2,49 animais/km/ano. Considerando o esforço amostral de 12.440,48km percorridos, obteve-se a média de 0,048 animais/km percorrido. Somando-se estes dados aos fornecidos por outras fontes de informação, foram reunidos registros de 746 animais: 323 aves, 266 mamíferos, 94 répteis, 35 anfíbios e 28 não identificados. De maneira geral houve menor número de atropelamentos no período seco que no chuvoso, mas houve grande variação entre algumas espécies quanto à sazonalidade dos atropelamentos, devido, aparentemente, à bionomia das espécies. Pelos registros das viagens de campo, a espécie mais acometida foi o gambá (Didelphis albiventris), com 53 registros, ou seja, 28,8% do total de mamíferos, 8,89% do total de animais. A Ordem Carnivora foi a com maior número de espécies atropeladas (4) dentre os mamíferos. Houve registro de espécies ameaçadas de extinção no Estado de São Paulo como Lobo-guará (Chrysocyon brachyurus), Jaguatirica (Leopardus pardalis), Tamanduábandeira (Myrmecophaga tridactyla) e Jacaré-do-papo-amarelo (Cayman latirostris) e de espécies que não ocorrem naturalmente no Estado. Foi levantado que 70,21% dos animais de categorias 1 e 2, mais prioritários à conservação na região, pereceram em 47%, ou 111,72km do trajeto total estudado. Este trecho está numa área que dista no máximo 10km das Unidades de Conservação da região ou 5km do rio Mogi-Guaçu. Foram discutidas possíveis medidas mitigatórias e propostas quatro áreas prioritárias para o seu estabelecimento.
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Aspectos bionômicos de geometridae (Lepidoptera) associados a plantas de mata atlântica na reserva biológica da Serra do Japi, Jundiaí, SP

Abreu, Cássia Isabela Vilela de 04 April 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6357.pdf: 5846186 bytes, checksum: a1cb075deff388eea9318cca3491127e (MD5) Previous issue date: 2014-04-04 / Universidade Federal de Sao Carlos / Immature stages of Geometridae (Lepidoptera) and their parasitoids (Ichneumonoidea and Chalcidoidea) were recorded and collected in two areas of Serra do Japi Municipal Biological Reserve, in Jundiaí, São Paulo. Occurrence of larvae were recorded associated with 14 plant species, collected in two environments: semideciduous mesophytic forest (MS) and understory between eucalipto (SB). The sampling period was from September 2011 to September 2012 and the larvae were kept in laboratory until emergence of adult parasitoids or Geometridae. On MS were collected 143 larvae, from this total, 12 were parasitized and 131 reached the adult stage; on SB, 129 larvae were collected, 12 were parasitized and 117 reached the adult stage. The most abundant species in the MS was Eois tegularia (Geometridae, Larentiinae), with 64 larvae. Physocleora sp.1, was the specie with the highest association of parasitoids, with 6 parasitized larvae. In SB, the most abundant species were the Nephodia aff. panacea (Geometridae, Ennominae), with 32 larvae collected, and also the species with the highest number of association with parasitoids. Piper sp. (Piperaceae), showed the highest number of larvae collected in the MS and Alchornea triplinervia (Euphorbiacea) of SB. The highest number of larvae parasitized on MS were recorded and collected for Croton floribundus (Euphorbiaceae), 6 larvae; on SB, the largest number of parasitized larvae was Alchornea triplinervia. Among the parasitoids, the genus Diolcogaster (Hymenoptera, Braconidae, Microgastrinae) were the most abundant with 18 samples. It was registered a new kind of Aleiodes (Hymenoptera, Braconidae, Rogadinae), associated with Physocleora grossica. larvae and Ischnopteris sp. on MS associated Alchornea triplinervia (Euphorbiacea). From complementary collections for parasitoids, with Malaise trap, Moericke trap and vegetation sweep, the Glyptapanteles genus follow by Diolcogaster, both Hymenoptera, Braconidae, Microgastrinae that emerged from geometridae larvae were the most abundant. For parasitoids, the results indicated the importance of obtaining from host larvae in the laboratory, besides the use of the main methods of collecting adults. / Estágios imaturos de Geometridae (Lepidoptera) e seus parasitoides (Ichneumonoidea e Chalcidoidea) foram estudados na Reserva Biologica Municipal da Serra do Japi, Jundiaí, São Paulo. Foi registrada a ocorrência de larvas associadas a 14 espécies de plantas, amostradas em dois ambientes: mata mesófila semidecídua (MS) e sub-bosque nativo em meio a eucalipto (SB). O período de amostragem foi de setembro de 2011 a setembro de 2012 e as larvas foram mantidas em laboratório até emergência de adultos de Geometridae ou de seus parasitoides. Na MS foram obtidas 143 larvas, das quais, 12 estavam parasitadas e 131 atingiram o estágio adulto; no SB, 129 larvas foram obtidas, 12 estavam parasitadas e 117 atingiram o estágio adulto. A espécie mais abundante na MS foi Eois tegularia (Geometridae, Larentiinae), com 64 larvas. Physocleora sp.1 foi a espécie com maior associação com parasitoides, com 6 larvas parasitadas. No SB, a espécie mais abundante foi Nephodia aff. panacea (Geometridae, Ennominae), com 32 larvas obtidas e também a espécie com o maior número de associações com parasitoides. Piper sp. (Piperaceae), apresentou o maior número de larvas amostradas na MS e Alchornea triplinervia (Euphorbiaceae) no SB. O maior número de larvas parasitadas na MS foi registrado para Croton floribundus (Euphorbiaceae); no SB, o maior número de larvas parasitadas e coletadas ocorreu em Alchornea triplinervia. Entre os parasitoides, o gênero Diolcogaster (Hymenoptera, Braconidae, Microgastrinae) foi o mais abundante, com 18 exemplares. Foi registrada uma nova espécie de Aleiodes (Hymenoptera, Braconidae, Rogadinae), associada a larvas de Physocleora grossica e Ischnopteris sp. na MS associadas à Alchornea triplinervia (Euphorbiaceae). Das coletas complementares de parasitoides com armadilhas Malaise, de Moericke e varredura da vegetação, o gênero Glyptapanteles, seguido por Diolcogaster, ambos Hymenoptera, Braconidae, Microgastrinae foram os mais abundantes. Para os parasitoides, os resultados indicaram a importância da sua obtenção a partir de larvas hospedeiras, além da utilização de outros métodos de coleta de adultos.
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Taxonomia e diversidade dos Alysiinae (Hymenoptera: Braconidae) Neotropicais, com ênfase na fauna da Mata Atlântica, Brasil.

Arouca, Raquel Gonçalves 17 February 2005 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissRGA.pdf: 3291923 bytes, checksum: a321cbbee3dd551db1f8daf23ce1ee94 (MD5) Previous issue date: 2005-02-17 / Universidade Federal de Sao Carlos / The material studied comes from eighteen localities of Atlantic Forest from BIOTA/FAPESP Project: João Pessoa, PB; Recife, PE; Quebrangulo, AL; Santa Luzia do Itanhy, SE; Mata São João, BA; Mata da Esperança, BA: Porto Seguro, BA: Linhares, ES; Santa Teresa, ES; Santa Maria Madalena, RJ; Nova Iguaçu, RJ; Ubatuba, SP; Salesópolis, SP; Ribeirão Grande, SP; Peruíbe, SP; Morretes, PR; São Francisco do Sul, SC and São Bento do Sul, SC. Other specimens from the DCBU collection (Departamento de Ecologia e Biologia Evolutiva, Universidade Federal de São Carlos) were studies too. The material was collected using three techniques: Malaise traps, Moericke traps and sweeping vegetation. The amount of Alysiinae examined was 2.920 specimens (2.082 of BIOTA/FAPESP Project and 838 of other collection), identified in 14 genera. Dinotrema, Aphaereta e Phaenocarpa were the most frequent genera. Indices of Diversity and Equitability were used to discuss the richness and dominance of genera in each locality. The higher values of richness were recorded in Nova Iguaçu, RJ; São Bento do Sul, SC; São Francisco do Sul, SC; Santa Teresa, ES e Santa Luzia do Itanhy, SE and the lower in João Pessoa, PB; Recife, PE; Mata São João, BA; Porto Seguro, BA e Linhares, ES. These data evidenced a trend to the enrichment of the Alysiinae fauna to the Atlantic Forest areas in largest latitudes. The higher Diversity Index was recorded in Santa Luzia do Itanhy, SE and the lower in João Pessoa, PB. Linhares, ES presented the highest Equitability and Santa Teresa, ES the lower. Cluster Analysis was adopted taking as attribute the occurrence of the Alysiiinae genera. Four species of Phaenocarpa and Aphaereta confusa Wharton, 1994 female were described. Eight species were reported from Brazil for the first time: Gnathopleura carinata (Szépligeti, 1904); G. bugabensis (Cameron, 1887); G. semirufa (Brullé, 1846); Ilatha pulchripennis (Latreille, 1805); Idiasta delicata (Papp, 1969); Phaenocarpa pericarpa Wharton & Carrejo, 1999; P. cratomorpha Wharton, 1994 and Aphaereta confusa Wharton, 1994; and four new genera were identified. Those results show the importance and the need of the taxonomic and ecological studies on the subfamily Alysiinae, especially in the Neotropical region. / O material estudado provém de dezoito localidades brasileiras com remanescentes de Mata Atlântica do Projeto BIOTA/FAPESP: João Pessoa, PB; Recife, PE; Quebrangulo, AL; Santa Luzia do Itanhy, SE; Mata São João, BA; Mata da Esperança, BA: Porto Seguro, BA: Linhares, ES; Santa Teresa, ES; Santa Maria Madalena, RJ; Nova Iguaçu, RJ; Ubatuba, SP; Salesópolis, SP; Ribeirão Grande, SP; Peruíbe, SP; Morretes, PR; São Francisco do Sul, SC e São Bento do Sul, SC. Exemplares do acervo da Coleção da Universidade Federal de São Carlos, Departamento de Ecologia e Biologia Evolutiva (DCBU) também foram estudados. O material foi coletado utilizando-se: armadilha de Malaise, armadilha de Moericke e Varredura de Vegetação. Foram identificados 2.920 exemplares de Alysiinae (2.082 do Projeto BIOTA/FAPESP e 838 do acervo), distribuídos em 13 gêneros. Os gêneros mais freqüentes foram Dinotrema, Aphaereta e Phaenocarpa. Índices de Diversidade e Equitabilidade foram usados para discutir a riqueza e a dominância dos gêneros encontrados em cada localidade. Os maiores valores de riqueza foram encontrados em Nova Iguaçu, RJ; São Bento do Sul, SC; São Francisco do Sul, SC; Santa Teresa, ES e Santa Luzia do Itanhy, SE e os menores em João Pessoa, PB; Recife, PE; Mata São João, BA; Porto Seguro, BA e Linhares, ES. Estes dados evidenciaram uma tendência ao enriquecimento da fauna de Alysiinae em direção às áreas de Mata Atlântica localizadas em maiores latitudes. O maior Índice de Diversidade de gêneros foi em Santa Luzia do Itanhy, SE e o menor em João Pessoa, PB. Com relação ao Índice de Equitabilidade, a localidade de Linhares, ES apresentou o maior valor e Santa Teresa, ES o menor. Utilizando-se como atributo a abundância dos gêneros de Alysiinae nas diferentes localidades de Mata Atlântica, foi realizada uma Análise de Agrupamento. Quatro novas espécies de Phaenocarpa e a fêmea de Aphaereta confusa Wharton, 1994 foram descritas. Pela primeira vez, oito espécies foram registradas para o Brasil, são elas: Gnathopleura carinata (Szépligeti, 1904); G. bugabensis (Cameron, 1887); G. semirufa (Brullé, 1846); Ilatha pulchripennis (Latreille, 1805); Idiasta delicata (Papp, 1969); Phaenocarpa pericarpa Wharton & Carrejo, 1999; P. cratomorpha Wharton, 1994 e Aphaereta confusa Wharton, 1994; e quatro novos gêneros foram identificados. Estes resultados mostram a importância e a necessidade de estudos taxonômicos e ecológicos sobre os Alysiinae, principalmente na região Neotropical.
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Estudo dos Campopleginae (Hymenoptera, Ichneumonidae) neotropicais com ênfase na fauna da Mata Atlântica, Brasil.

Onody, Helena Carolina 25 February 2005 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissHCO.pdf: 3138785 bytes, checksum: 7a24652a64962d781cae4bffe6ff9345 (MD5) Previous issue date: 2005-02-25 / Universidade Federal de Minas Gerais / The material used in this study comes from the projects: "Biodiversidade de Isoptera e Hymenoptera" (BIOTA/FAPESP), "Diversidade da fauna de Braconidae (Hymenoptera) em diferentes altitudes em Campos do Jordão, São Paulo, Brasil (CNPq) and from brazilian collections. This work has for main objectives a survey of the Campopleginae fauna in Brazil and to know its distribution throughout latitudinal and altitudinal gradients in areas of Atlantic Forest. Using Malaise traps, Moericke traps and sweeping the vegetation were obtained a total of 7.550 specimens identified and distributed in 19 genera. The genus Enytus was for the first time cited to Brazil and a new genus was identified. Microcharops, Casinaria, Dusona and Nonnus were the most common genera. Studying the Campopleginae throughout a latitudinal gradient, in eighteen localities of Atlantic Forest, the higher values of abundance, species richness and diversity were recorded in the Brazilians regions South and Southeast. The results indicated the reduction of the abundance, diversity and species richness of this subfamily in direction the localities of lower latitudes. In the analysis of the diversity of the fauna of the Campopleginae throughout an altitudinal gradient in other area of Atlantic Forest (Campos do Jordão, SP), the higher number of specimens was evidenced in mid altitudes. The diversity and the species richness showed a strong influence of the climate. The results of this study extend the knowledge on the distribution of the Campopleginae in Neotropical region and contribute for studies on distribution of parasitoid insects throughout latitudinal and altitudinal gradients. / O material utilizado neste estudo provém de coletas realizadas pelos projetos: Biodiversidade de Isoptera e Hymenoptera (BIOTA/FAPESP), Diversidade da fauna de Braconidae (Hymenoptera) em diferentes altitudes em Campos do Jordão, São Paulo, Brasil (CNPq) e de coleções brasileiras. Este trabalho teve por objetivos principais realizar um levantamento da fauna dos Campopleginae no Brasil e conhecer sua distribuição ao longo de gradientes latitudinal e altitudinal em áreas de Mata Atlântica. Através de armadilhas de Malaise, armadilhas de Moericke e varredura da vegetação foram obtidos 7.550 exemplares identificados e distribuídos em 19 gêneros. O gênero Enytus foi pela primeira vez citado para o Brasil e um novo gênero foi identificado. Microcharops, Casinaria, Dusona e Nonnus foram os gêneros mais abundantes. Estudando os Campopleginae ao longo de um gradiente latitudinal, em dezoito localidades de Mata Atlântica, os maiores valores de abundância, riqueza e diversidade foram obtidos nas regiões sul e sudeste. Os resultados indicaram a diminuição da abundância, diversidade e riqueza desta subfamília em direção a localidades de menores latitudes. Na análise da diversidade da fauna dos Campopleginae ao longo de um gradiente altitudinal em outra área de Mata Atlântica (Campos do Jordão, SP), o maior número de indivíduos foi constatado em altitudes intermediárias. A diversidade e a riqueza se mostraram fortemente influenciadas pelo clima. Os resultados obtidos neste estudo ampliam o conhecimento sobre a distribuição dos Campopleginae em regiões Neotropicais e contribuem para estudos sobre distribuição de insetos parasitóides ao longo de gradientes latitudinal e altitudinal.
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Bioensaios de decomposição anaeróbia de macrófitas aquáticas da lagoa do Óleo (Estação Ecológica de Jataí, Luiz Antônio - SP).

Romeiro, Francisco 11 May 2005 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissFR.pdf: 1090917 bytes, checksum: bc8ea9fa796e87f27b208a4114017693 (MD5) Previous issue date: 2005-05-11 / Universidade Federal de Sao Carlos / This study aimed at investigating: i) the influence of temperature on decomposition of macrophyte detritus; ii) the importance of leaching in the dynamics of the decomposition; iii) the decomposition of different structures of aquatic plants and iv) the enzyme activity of xylanase during the decomposition. The samples of water and aquatic macrophytes were collected in the Óleo lagoon (Ecological Station of Jataí; 21º 36 S and 47º 49 W). Bioassays were performance (during 140 to 200 days) with macrophytes fragments and water samples incubated under controlled conditions. Periodically the productions of carbon dioxide (CO2) and methane (CH4) were determinate by gas chromatography and the enzymatic activities were measured from reaction mixtures (aliquots of the incubations and xylan solution) followed by reducing sugars dosage (colorimetric method). It was observed a positive correlation with temperature and detritus decomposition; once were verified greater consumption at higher temperatures. Temperature was important in the detritus fibrous fraction consumption (Q10 = 1.61) and in methanogenesis (Q10 = 3.17). The fractionating of dissolved (DOM) and particulate organic matter (POM), due to the leaching process, conduced to a increase in the consumption efficiencies of these fraction. The xylanase activity was only registered when the dissolved sugars leached from the detritus decreased. The roots were the most easily degraded structure of Scirpus cubensis; this specie was the most easily degraded, followed by Cabomba furcata; the Ludwigia inclinata was the most refractory. Overall, this study suggests that S. cubensis is one of the most important aquatic plant to the carbon cycling in the Óleo lagoon, once this specie present higher productivity and intense mineralization. / Este estudo dedicou-se à investigação da: i) influência da temperatura na decomposição de detritos de macrófita; ii) importância da lixiviação na dinâmica de decomposição dos detritos; iii) decomposição de diferentes estruturas da planta; e iv) atividade da enzima xilanase durante as decomposições. As amostras utilizadas foram coletadas na lagoa do Óleo, que está integrada no conjunto de lagoas marginais da Estação Ecológica de Jataí (21º 36 S e 47º 49 W). Montaram-se bioensaios a partir de fragmentos das macrófitas e alíquotas de água coletadas na lagoa do Óleo; permaneceram em incubadoras de 140 a 200 dias. Diariamente as produções de dióxido de carbono (CO2) e metano (CH4) foram determinadas com o uso de cromatógrafo a gás e as atividades enzimáticas foram estimadas a partir de misturas de reação que consistiram de alíquotas das incubações e solução de xilana, seguido de dosagem de açúcares redutores (método colorimétrico). A temperatura foi positivamente relacionada à decomposição dos detritos, tendo-se verificado maiores mineralizações nas temperaturas mais elevadas. Destaca-se a importância deste fator especialmente na decomposição das frações particuladas dos detritos (Q10 = 1,61) e na produção de CH4 (Q10 = 3,17). A separação da matéria orgânica dissolvida (MOD) da matéria orgânica particulada (MOP), decorrente da lixiviação dos detritos, mostrou-se um processo que pode agir de maneira a aumentar a eficiência do consumo de ambas. A atividade da xilanase foi somente registrada quando houve o decréscimo nas concentrações dos açúcares dissolvidos na lixiviação dos detritos. Dentre as partes de Scirpus cubensis, as raízes foram as mais facilmente degradadas. Esta espécie foi ainda a mais facilmente degradada, seguida por Cabomba furcata, sendo Ludwigia inclinata a mais refratária. O verificado neste estudo sugere que a espécie S. cubensis seja uma das mais importantes na ciclagem de carbono nas lagoas do conjunto da EEJ, uma vez que reúnem produtividades elevadas e intensa mineralização de seus detritos.
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Estágios imaturos de geometridae (Lepidoptera) associados à Stryphnodendron spp. (Mimosaceae) em área de cerrado no município de São Carlos, SP.

Osorio, Tereza Costa 12 September 2005 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissTCO.pdf: 56351385 bytes, checksum: 097c61e0f14050cf728e0c4451a50ab5 (MD5) Previous issue date: 2005-09-12 / Financiadora de Estudos e Projetos / Geometridae larvae feeding on two Stryphnodendron species were collected twice a month over an year in a cerrado area in São Carlos, SP, Brazil. 1062 larvae were found and reared in laboratory. Fifteen species and ten genera were recorded: Thyrinteina arnobia, Thyrinteina schadeana , Physocleora junctilinea , Iridopsis fulvitincta, Glena unipennaria , Glena subannulata , Glena brachia , Hymenomima amberia , Hymenomima conia, Macaria abydata , Macaria sp., Prochoerodes sp., Patalene sp., Scopula sp. and Leuciris sp. The latter was the most frequent species. A greater number of larvae were found on S. obovatum than on S. adstringens. Nevertheless, larvae feeding in S. adstringens were more likely to be parasitized than those feeding on S. obovatum.152 cases of parasitism were recorded due to Diptera (Tachinidae) or Hymenoptera (Ichneumonidae, Braconidae, Chalcididae e Eulophidae); Euplectrus sp. (Eulophidae) was the commonest parasitoid. The number of collect larvae was related to leafing phenologies and increased during the leaf expansion time. / Durante o período de um ano, larvas de Geometridae foram quinzenalmente coletadas sobre duas espécies de Stryphnodendron (Mimosaceae) em área de cerrado no município de São Carlos, SP. Foram obtidas 1062 larvas, distribuídas em quinze espécies, pertencentes a dez gê neros. Leuciris sp. foi a espécie mais abundante, representando 84% dos exemplares obtidos. Os demais Geometridae registrados foram: Thyrinteina arnobia , Thyrinteina schadeana , Physocleora junctilinea , Iridopsis fulvitincta , Glena unipennaria, Glena subannulata , Glena brachia , Hymenomima amberia, Hymenomima conia, Macaria abydata, Macaria sp., Prochoerodes sp., Patalene sp. e Scopula sp. O número de larvas coletadas sobre S. obovatum foi significativamente maior comparado àquele de S. adstringens. Entretanto as maiores porcentagens de parasitismo foram registradas sobre larvas obtidas em S. adstringens. Foram registrados 152 ocorrências de parasitismo causados por Diptera (Tachinidae) e Hymenoptera (Ichneumonidae, Braconidae, Chalcididae e Eulophidae). Euplectrus sp. foi o parasitóide mais freqüente. O número de larvas coletadas ao longo do ano esteve relacionado à fenologia da planta, apresentando picos na época de expansão foliar.
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Variação temporal e espacial da composição da ictiofauna demersal do infralitoral roso da baía de Paranaguá, PR, Brasil - 2004.

Nakayama, Paula 16 April 2004 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissPN.pdf: 620800 bytes, checksum: 344c796c33c71e4b6b81ad05575d3bb3 (MD5) Previous issue date: 2004-04-16 / Universidade Federal de Sao Carlos / The ichthyofauna of Paranagua bay infralittoral was studied from samples obtained from five sampling points, respectively in front of Gamboa dos Papagaios, Gamboa do Sucuriu, Gamboa do Baguaçu, Planície da Ponta do Poço and Praia do Pontal do SuI. The samples were collected monthly, from October 1999 to September 2000, with a trawl net. As a result, 6633 individuals, from 55 species and 27 families were captured, and the madamango sea catfish (bagre) Cathorops spixxi was the most abundant element with 21% of the total number. During the sample collection, the most important variable for the distribution of months was the temperature, which allowed the division of the sampling period into hot and cold months. A detected variation in groupings reflected the temporal oscillation of the ichthyofauna composition, and the variation in dissimilarity between sampling points occurred due to the differences in abundance and richness of the captured species. The highest percentages of dissimilarity between sampling points were observed during the hot months, and the high frequencies of Anisotremus surinamensis, Etropus crossotus, Genidens genidens, Micropogonias fumieri, and Sphoeroides greeleyi were also related to high temperatures. Since a great number of species present a more intense reproductive activity during high temperature periods, and some marine species use the estuary as a rearing ground, a higher number and richness of fishes could be observed during the hot months. Finally, the analysis of the ichthyofauna space variation showed differences in composition and abundance of fish communities from the studied areas. These space differences are probably related to the complexity of the habitats, which is caused by the different bottom covers found at the sampling points. / A ictiofauna do infralitoral da baía de Paranaguá foi estudada, considerando-se 5 pontos de coleta, em frente à Gamboa dos Papagaios, Gamboa do Sucuriu, Gamboa do Baguaçu, Planície da Ponta do Poço e Praia de Pontal do Sul. As amostragens foram mensais, realizadas no período de outubro de 1999 a setembro de 2000, utilizando-se rede de arrasto. Um total de 6633 exemplares de peixes, pertencentes a 55 espécies e 27 famílias foi coletado. O bagre Cathorops spixxi foi a espécie mais abundante com 21% do total da captura em número. Durante o período amostrado a temperatura foi a variável de maior importância na distribuição dos meses permitindo dividir o período de coleta em meses quentes e frios. A variação dos agrupamentos durante o período amostrado refletiu a oscilação temporal da composição da ictiofauna. As maiores porcentagens de dissimilaridade entre os pontos amostrais foram observadas nos meses quentes. A variação da dissimilaridade entre os pontos ocorreu devido às diferenças na abundância e riqueza de espécies das capturas. As altas freqüências de ocorrência das espécies Anisotremus surinamensis, Etropus crossotus, Genidens genidens, Micropogonias furnieri, e Sphoeroides greeleyi, estiveram relacionadas às temperaturas elevadas . O maior número e riqueza de peixes observados nos meses quentes devem estar relacionados com o ciclo de vida de muitas espécies, que possuem atividade reprodutiva mais intensa durante os períodos de temperatura elevada, além daquelas espécies marinhas que utilizam o estuário como área de criação. Também foi analisada a variação espacial da ictiofauna, tendo-se observado diferenças na composição e na abundância da comunidade de peixes entre as áreas de estudo. As diferenças espaciais parecem estar relacionadas com a complexidade de habitats, que se deve as diferentes coberturas de fundo encontrados nos locais de coleta.
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Características físicas do lenho em grupos fenológicos foliares de arbóreas de cerrado

Venancio, Natalia Cristina 10 October 2016 (has links)
Submitted by Alison Vanceto (alison-vanceto@hotmail.com) on 2017-08-28T14:07:07Z No. of bitstreams: 1 DissNCV.pdf: 1386182 bytes, checksum: 58b2a2b04857f39a3f3fc9209b911165 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-09-06T13:29:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissNCV.pdf: 1386182 bytes, checksum: 58b2a2b04857f39a3f3fc9209b911165 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-09-06T13:29:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissNCV.pdf: 1386182 bytes, checksum: 58b2a2b04857f39a3f3fc9209b911165 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-06T13:36:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissNCV.pdf: 1386182 bytes, checksum: 58b2a2b04857f39a3f3fc9209b911165 (MD5) Previous issue date: 2016-10-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Leaf phenological groups of cerrado tree species show significant differences not only concerning the maintenance of foliage throughout the year but also about reproductive phenology as the peak and duration of flowering. In addition to the vegetative and reproductive phenology, deciduous (DE) semideciduous (SD) and evergreen (EV) cerrado trees have canopy architecture and the type of branching and leaf production significantly different. Therefore, the structure and functionality of wood probably show significant differences in these three groups (DE, SD, and EV). We aimed to determine the physical characteristics of wood and their relationships in aerial and underground parts of DE, SD, and EV tree species of cerrado vegetation. Internal (density, porosity, and water storage capacity) and external (crown height and root depth) physical traits of wood were determined in species distributed in DE, SD, and EV in two stages of development: adult and in the initial growth. By sections of the trunk at the transition between aerial and underground portions, we obtained results from bark and trunk in studied leaf phenological groups. There was a significant difference between DE and EV in a functional gradient where we found SD species. This group showed similar values to DE or EV species or even significantly different from both groups depending on the analyzed trait. Thus, the species distributed in leaf phenological groups also differed significantly in internal and external physical characteristics of wood in branches, in the transition from aerial to aboveground part and underground portion. These results indicated species grouped by leaf phenology have several other physical characteristics significantly different. Therefore, leaf phenological groups of cerrado trees are, in fact, functional groups. It has been successfully used to show that leaf phenology is just one attribute among many others traits distributed in the canopy, stem, and root assembling tree species of cerrado in at least three functional groups. Therefore, regardless the phylogenetic relatedness in each foliar phenological group these species belong to a functional group. Adults DE species growing under natural conditions are taller and have branches less dense and with more imbibition capacity than EV species. Conversely, in early years of growth DE were still taller with a deeper root system but with branches, stem and roots less dense than EV species. The inversion of wood internal traits between DE-EV demonstrated that the strategies for the acquisition and use of resources changed during tree development. It resulted in adult individuals significantly different and these changes probably depended on the biomass accumulated (size) in cerrado trees. The identification of these functional groups of trees is useful for more efficient management of protected areas or for recovering degraded areas of cerrado vegetation. The functional groups of cerrado trees could be identified not only by a list of attributes significantly different but by the reliance among these traits. These relationships built up a particular syndrome in each functional group. Syndromes originated through compromises among characteristics result in specific skills for acquisition, use and storage resources in every tree functional group. These skills result in similar survival strategies (reproduction, growth, and defense) and responses to environmental stresses in each of these functional groups of tree species of the cerrado vegetation. / Grupos fenológicos foliares de espécies arbóreas de cerrado apresentam diferenças significativas não só com relação à manutenção da folhagem ao longo do ano, mas também em relação à fenologia reprodutiva como o pico e a duração da floração. Além da fenologia vegetativa e reprodutiva, decíduas (DE) semidecíduas (SD) e sempre verdes (SV) arbóreas do cerrado apresentam uma arquitetura da copa e um tipo de produção de ramos e folhas significativamente diferentes. Portanto, a estrutura e a funcionalidade do lenho provavelmente também apresentam diferenças significativas nesses 3 grupos. Os objetivos desse trabalho foram determinar características físicas e suas inter-relações no lenho da parte aérea e subterrânea de espécies DE, SD e SV arbóreas do cerrado. Características físicas internas (densidade, porosidade e capacidade de armazenamento de água) e externas (altura da copa e profundidade das raízes) do lenho foram determinadas em várias espécies arbóreas DE, SD e SV adultas e na fase inicial de crescimento. Por meio da obtenção de secções transversais do tronco na altura do colo da planta determinamos também características físicas da casca e do lenho nessa região de transição da porção aérea e subterrânea nos 3 grupos fenológicos foliares. Ocorreu uma significativa diferenciação entre DE e SV para a maioria das variáveis estudadas em um provável gradiente funcional onde transitam as espécies SD. Esse grupo mostrou valores similares às DE, ou às SV ou ainda significativamente diferentes de ambos os grupos dependendo da característica analisada. As espécies distribuídas nos grupos fenológicos foliares, portanto, mostraram diferenças significativas quanto às características físicas internas e externas do lenho na parte aérea, na transição da parte aérea e na porção subterrânea. Esses resultados indicam que as espécies agrupadas por meio da fenologia foliar apresentam várias outras características físicas do lenho significativamente diferentes destacando que os grupos fenológicos foliares são, de fato, grupos funcionais. Independente da proximidade filogenética entre as espécies a fenologia foliar foi usada com sucesso para demonstrar que essa característica é apenas mais um atributo entre muitos outros distribuídos na copa, no caule e na raiz que agrupam espécies arbóreas do cerrado em ao menos 3 grupos funcionais. DE adultas crescendo em condições naturais são significativamente mais altas e apresentam um lenho nos ramos mais poroso, com maior capacidade de embebição e menor densidade que as espécies SV. Nos primeiros anos de crescimento em campo as DE também se mostraram mais altas com um sistema radicular mais profundo, mas com ramos, caule na altura do colo e raízes mais densos, menos porosos e com menor capacidade de embebição que as SV. A inversão das características internas do lenho entre os grupos funcionais nas diferentes fases do ciclo de vida demonstrou que as estratégias de aquisição e uso dos recursos são alteradas durante o desenvolvimento resultando, ao final, em adultas distribuídas em grupos funcionais significativamente diferentes. Essa inversão de características entre as fases de crescimento provavelmente depende da biomassa acumulada (tamanho) do indivíduo nas arbóreas do cerrado. A identificação desses grupos funcionais de arbóreas por meio de suas estratégias de aquisição, uso e estoque de recursos pode ser utilizada para um manejo mais eficiente de áreas protegidas ou na recuperação de áreas degradas do cerrado. Os grupos funcionais de árvores do cerrado puderam ser identificados não só por uma lista de atributos significativamente diferentes, mas por inter-relações de dependência entre esses atributos. Essas relações de dependência formam síndromes características em cada grupo funcional. As síndromes originadas por meio dos compromissos entre as características resultam em competências específicas para a aquisição, uso e estoque de recursos em cada grupo funcional. Essas competências conferem estratégias de sobrevivência (reprodução, crescimento, defesa) resultando necessariamente em respostas similares aos estresses ambientais em cada um desses grupos funcionais de espécies arbóreas do cerrado.

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