Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The present study as conducted to examine semiquantitative gene expression of annexin II (ANEII) during all follicular phases of folliculogenesis in bovine, in preantral follicles and oocytes of antral follicles too in different size (<3mm, 5-8mm e >9mm in diameter). It was investigated the gene expression of ANEII influenced by retinol during oocyte maturation. In addition we examine annexin II (ANEII) presence during embryonic development and regulation of gene expression to ANEII by retinol and insulin like growth factor (IGF-I) was availed. Bovine ovaries from adults and fetal females was collected in abattoir and cumulus-oocyte complexes and preantral follicles were recovered. mRNA extraction and cDNA formation was carried out to produce ANEII amplification by polymerase chain reaction. Bovine embryos were used at initial phases of development from in vitro production in SOF medium or retinol and/or IGF-I supplemented. Bovine embryos were submitted to mRNA extraction and cDNA formation and ANEII amplification was obtained by polymerase chain reaction (PCR). Preantral follicles at secondary stages presented gene expression to ANEII. Oocytes from different follicular sources in germinal vesicle (GV) stage were significantly different (p<0,05) in gene expression. Gene expression to ANEII in oocytes of larger 8mm follicles were significantly higher than those from 3mm and 5-8mm (p<0,05). The similar results were obtained in metaphase II (MII) phase. However difference was not observed between oocytes from 3mm and 5-8mm follicles. Oocytes from follicles larger 8mm presented higher ANEII expression than those from 3mm follicles, but difference was not observed to the oocytes from 5-8mm (p<0,05). The ANEII gene expression was increase with retinol supplementation during maturation process in contrast to control group (p<0,05). The ANEII was present during early embryonic development except in 16 cells. The rate of embryo production was increased by supplementation with retinol in culture medium (p<0,05) in contrast with control and IGF-I group. The control group (20,5%; 24/117) was similar with IGF-I group (25,8%; 24/93) and both were significantly lower than retinol (37,8%; 45/119). Semi quantitative analyses of ANEII gene expression was significantly higher in control group than retinol or IGF-I embryo treated (p<0,05). However retinol and IGF-I were not different. ANEII have more expression in oocytes in capacitating process. Retinol increases the mRNA availability to ANEII and could be involved in oocyte competence. In conclusion, in vitro embryo production is increased by retinol supplementation and could be regulating the gene expression of ANEII during embryo development. Decrease in gene expression to ANEII determines a qualitative and quantitative increase in in vitro embryo production. / O objetivo do presente estudo foi determinar o perfil de expressão de anexina II (ANEII) em folículos pré-antrais, oócitos e desenvolvimento embrionário bovino, e sua regulação pelo retinol e fator de crescimento semelhante à insulina-I (IGF-I). Expressão de ANEII foi verificada em folículos primordial, primário e secundário, em oócitos de folículos antrais de diferentes tamanhos (<3mm, 5-8mm e >8mm de diâmetro), em embriões de 2, 4, 8, 16 e 32 células e em blastocisto e blastocisto expandido. Além disso, foi investigada a influência do retinol sobre a expressão de ANEII em oócitos e no desenvolvimento embrionário e, neste último, também foi estudada a participação do IGF-I na expressão dessa proteína. Ovários de fêmeas bovinas adultas e de fetos foram coletados em abatedouro e submetidos a punção folicular ou isolamento de folículos pré-antrais. Complexos cumulus-oócito e folículos préantrais foram processados para extração de RNAm, obtenção de cDNA e realizado reação da polimerase em cadeia (PCR) com oligonucleotídeos específicos para ANEII. Foram utilizados embriões bovinos produzidos in vitro em diferentes estádios de desenvolvimento em meio SOF e também suplementados com retinol e IGF-I. Os embriões foram processados para extração de RNAm, obtenção de cDNA e realizada a reação da polimerase em cadeia (PCR) com oligonucleotídeos específicos para ANEII. Apenas folículos préantrais secundários apresentaram expressão de ANEII. Em estádio de vesícula germinativa (VG), os oócitos oriundos de diferentes tamanhos foliculares diferiram entre si (p<0,05) quanto à expressão de ANEII, onde oócitos de folículos <3mm e de 5-8mm foram significativamente inferiores aos oócitos de folículos >8mm. Em metáfase II (MII), oócitos de folículos <3mm apresentaram menor expressão de ANEII em relação à oócitos de folículos >8mm (p<0,05) e não diferiram de oócitos de folículos de 5-8mm. No entanto, oócitos de folículos de 5-8mm foram similar na expressão de ANEII aos oócitos de folículos >8mm. O retinol utilizado no período de maturação promoveu um incremento na expressão de ANEII quando comparado ao controle (p<0,05). A ANEII está presente em todos os estádios de desenvolvimento embrionário precoce, com exceção em embriões de 16 células. A utilização de retinol durante o desenvolvimento embrionário, promoveu um incremento significativo (p<0,05) na produção de blastocisto, avaliados no dia 6 após a fecundação, em relação ao grupo controle e ao grupo IGF-I. No grupo controle foi obtido um percentual de 20,5% (24/117) de blastocistos sobre o número total de oócitos cultivados, não diferindo do grupo IGF-I, onde se obteve um índice de 25,8% (24/93) de blastocistos. No grupo retinol, o percentual de blastocisto foi significativamente superior com 37,8% (45/119). Na avaliação semiquantitativa da expressão de ANEII em embriões produzidos em meio suplementado com IGF-I (10ng/ml de meio) ou retinol (0,1ng/ml de meio), foi observado uma menor expressão de ANEII quando estas substâncias estavam presentes no meio em relação ao controle (p<0,05). A expressão semiquantitativa de ANEII não diferiu entre os grupos retinol e IGF-I. A ANEII tem uma maior expressão em oócitos capacitados e o retinol aumenta a disponibilidade de RNAm para ANEII, podendo estar envolvido na regulação da competência oocitária por diminuir a tradução ou evitar a degradação. A produção de embriões in vitro é incrementada na presença de retinol que atua modulando a expressão de ANEII durante o desenvolvimento embrionário. A diminuição na expressão de ANEII na embriogênese de bovinos determina um aumento qualitativo e quantitativo na produção in vitro de embriões.

The use of micro minerals in farm animals is widely studied in order to enhance the production and the reproductive performance of these animals. However, considering small ruminants, information about minerals metabolism is scant. Thus, the aim of this study was to evaluate the metabolism of chrome and its effect in the ruminal fauna of lambs. A total of four male lambs 4 months old and with a mean weight of 28 Kg were used in this study. Animals were maintained in metabolic cages during a period time of 20 days (i.e., 15 days of adaptation period and 5 days of experimental period). The mineral was administered through infusion of one milligram of yeast rich in chrome (Sacharomices cerevisae), in the rumen during whole study period. It were evaluated the dry matter (DM) rate of the animals diet and feces in order to estimate the ingestion, digestibility and fecal production. Blood, feces and urine samples were collected every 24 hours during the experiment to determine the chrome excretion. The ruminal fluid was collected at different time points, i.e., day 0, +3 and +5 after begin of the experiment. No alterations were observed in the chrome excretion in the urine, at the same time, it was not detected the mineral (i.e., chrome) in the plasma, being this excretion basically fecal. Animals from treated group presented a higher excretion of chrome than those belong to the control group at day 0 and +3. The utilization of organic chrome allowed an increase in the ingestion of dry matter (DM) at day 0 (P < 0.05). The fecal production of DM in the supplemented group was higher than those observed in the control group in the days 1, 2, 3 and 4 (P ˂ 0.05). It was not detected difference in the digestibility, DM ingestion and ruminal fauna during the study. In conclusion, lambs supplemented with organic chrome did not absorb this mineral, consequently, no alteration was observed in the ruminal fauna. / A utilização de microminerais em animais de produção é tema de estudo de diversos pesquisadores que buscam com esses elementos potencializar o desempenho produtivo e reprodutivo de rebanhos. Porém, ainda são poucos os trabalhos relacionados ao metabolismo de minerais em ovinos, o que dificulta muitas vezes, a adequada interpretação de resultados obtidos em pesquisas. Nesse contexto, o objetivo desse estudo foi de avaliar o metabolismo do cromo orgânico e seu efeito sobre a concentração de protozoários ruminais. Para tanto, foram utilizados quatro cordeiros machos com quatro meses de idade e 28 quilos. Os animais foram alocados em gaiolas metabólicas por um período de adaptação de quinze dias e mais cinco dias de período experimental, totalizando 20 dias em dois momentos com tratamentos invertidos totalizando quatro animais por grupo. O mineral foi administrado mediante a infusão de um miligrama da levedura rica em cromo (Sacharomices cerevisae), via intraruminal, durante todo o período adaptativo e experimental. Foram avaliados os índices de matéria seca (MS) da dieta e das fezes dos animais para estimar o consumo, a digestibilidade e a produção fecal. Sangue, fezes e urina foram coletados, a cada 24 horas, durante o período experimental para determinar a excreção de cromo. As coletas de suco de rúmen foram realizadas nos dias zero, três e cinco do experimento. Não houve detecção de teores de cromo na urina dos animais tratados e não foi detectado resquícios do mineral no plasma sanguíneo. A excreção foi basicamente fecal. Os cordeiros do grupo tratado apresentaram maiores teores de cromo nas fezes do que os animais do grupo controle nos dias zero e 3. O uso do cromo orgânico promoveu um acréscimo no consumo de MS nos animais no dia zero (P < 0,05). A produção fecal de MS do grupo suplementado foi maior que aquela observada nos animais do grupo controle nos dias 1, 2, 3 e 4 (P ˂ 0,05). Não houve diferença na digestibilidade, no consumo de MS e na concentração de protozoários ruminais, entre os grupos, durante o período experimental. Observou-se alta correlação positiva entre digestibilidade e produção MS (r = 0,82). O cromo orgânico (1 mg) suplementado na dieta de cordeiros não foi absorvido e não causou efeito sobre a fauna ruminal.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The common bean is the main food of many Brazilians and it is produced in the whole national territory, wich means that this spcies cultivated in variety of meteorological conditions. In spite of its great importance, the national production of this legume fluctuates, because it is, in most of the cases, cultivated with low technology land during times of the year with risks as a complete knowledge of the predominant meteorological conditions during the growing season lacks. The objective of this study was determine the growing seasons with smallest risk for the bean production determining deficiency and surplus of soil water and the probability of its occurrence, for different phases of the developmental cycle of common bean, and the frequency of daily maximum air temperature greater then or equal to 30ºC during the flowering, in Santa Maria - RS. The water balance of the soil was calculated to determine the deficiencies and surpluses of soil water for 29 growing seasons, during the safra and safrinha. Data were collected in a climatological station in Santa Maria, RS from August of 1968 to July of 2004. The different levels of occurrence of surplus and deficiency of soil water were analyzed through the fit of a parametric distribution and related to the levels of occurrence of the surplus and deficiency of water indicators with the occurrence probability to each growing season. The fitted parametric distribution curves used were Gama, Lognormal and Exponential. The tests used to verify the goodness of fit of the parameters and to choose the function that show better adjustment were Anderson-Darling, Cramér-von Mises, Chi-square and Kolmogorov-Smirnov. The empiric frequency was determined to show the growing season in that there is greatest risk of damage caused by elevated air temperature, i. e., the number of days in that the maximum air temperature is greater then or equal to 30ºC in relation to the total number of days of the period between the beginning of the flowering and 20 days after, being considered every year of the database and all the growing seasons. In most cases there was adjustment of at least one of the parametric distribution curve, prevailing the Gama curve. In some cases, it was not possible to adjust any function being used the empiric frequency to analyze the risk of damages. Considering the methodology used in this work, the greatest risk of damage is when water deficiency takes place during the periods from sowing to germination and from the beginning of flowering to 20 days after and when water surplus takes place during the period 20 days after the beginning of the flowering and the physiologic maturity and when elevated air temperature occurs during the period from the beginning of the flowering to 20 days after, the results allowed to conclude that the recommended growing seasons are 15/Ago to 15/Set and 01/Fev to 10/Fev. / O feijão é o principal alimento de muitos brasileiros e é produzido em todo o território nacional, em variadas condições climáticas e de cultivo. Apesar de sua grande importância, a produção nacional dessa leguminosa é flutuante, pois, na maioria dos casos, é cultivado em áreas com baixo nível de tecnologia e por não haver um completo conhecimento das condições meteorológicas predominantes durante as épocas de cultivo. O objetivo deste trabalho foi determinar as épocas de semeadura com menor risco para a produção de feijão através da determinação dos níveis de deficiência e excesso de água no solo e sua probabilidade de ocorrência, para diferentes subperíodos do ciclo de desenvolvimento do feijoeiro, e a freqüência empírica de ocorrer temperatura máxima do ar diária maior ou igual a 30ºC durante a floração do feijoeiro, em Santa Maria - RS. As deficiências e os excessos de água no solo foram determinados pelo cálculo do Balanço Hídrico diário do solo para 29 épocas, durante a safra e safrinha, em que foi simulado a semeadura e o desenvolvimento do feijoeiro em todos os anos do banco de dados meteorológicos para cada época de semeadura. Os dados meteorológicos foram coletados na estação climatológica principal de Santa Maria desde agosto de 1968 a julho de 2004. Os diferentes níveis de ocorrência de excesso e deficiência hídrica foram analisados por meio do ajuste de distribuição de freqüência e relacionados com a probabilidade de ocorrência em cada época de semeadura. As funções de distribuição de freqüência utilizadas foram as, Gama, Lognormal e Exponencial. Para verificar a qualidade do ajustamento dos parâmetros e escolher a função de melhor ajuste foram utilizados os testes de Anderson-Darling, Cramér-von Mises, Chi-Quadrado e Kolmogorov-Smirnov. Para determinar as épocas de semeadura em que há maior riscos de xvii dano, causado por temperatura do ar elevada, foram determinadas as freqüências empíricas, ou seja, o número de dias em que a temperatura máxima do ar é maior ou igual a 30ºC em relação ao número total de dias do subperíodo compreendido entre o início da floração e 20 dias após o início da floração, considerando-se todos anos do banco de dados e todas as épocas de semeadura. Na maioria dos casos houve ajuste de pelo menos uma das funções de distribuição de freqüência, predominando a função Gama. Em alguns casos não foi possível o ajuste de nenhuma função sendo utilizado a freqüência empírica para analisar o risco. Considerando-se a metodologia utilizada nesse trabalho e que há maior risco de redução de rendimento, quando ocorre deficiência hídrica durante os subperíodos: semeadura emergência, início da floração 20 dias após o início da floração, quando ocorre excesso hídrico durante o subperíodo compreendido entre 20 dias após o início da floração e a maturação fisiológica e quando ocorre temperatura do ar elevada durante o subperíodo compreendido entre o início da floração e 20 dias após o início da floração, constatou-se que as melhores épocas para a semeadura do feijoeiro na região central do Rio Grande do Sul os períodos de 15/Ago a 15/Set para a safra e de 01/Fev a 10/Fev para a safrinha.

One hundred and twenty eight genotypes of common bean (Phaseolus vulgaris L.) divided into local varieties, cultivars and lines both from meso-america and andean gene pool, were evaluated in 2003 and 2004. Several experiments were conducted at Universidade Federal de Santa Maria, State of Rio Grande do Sul, Brazil. Host genetic structure was studied based on reaction on juvenile resistance (V1/V2) to 12 physiological races of Colletotrichum lindemuthianum. Also, the relation among three phonological stages (V1/V2; R4/R5 and R5/R6) of 26 germplasm and the reaction to four races of Colletotrichum lindemuthianum was characterized. The plant reaction, virulence and resistance index were obtained from a 1 to 9 scale. The phenetic analysis was generated from virulence data considering incompatible reaction (0) and compatible reaction (1). Common bean germplasm variability was not coherent to decade of release, origin and gene pool. Higher diversity was observed among local genotypes than commercial ones. Variability of common bean lines was not related to population structure of the pathogen. The absence of Mexican genes (Co-4 and Co-5) was observed in genotypes with resistance index higher that 80%. Higher frequency of resistant genotypes was observed from 1980 to 1990. However, such result was not applied to the wide spread virulence genes. Phenetic data analysis showed that intrinsic diversity was observed among local genotypes of common bean. Specific interactions between genotypes and races were observed as growth stage evolved. / Nos anos de 2003 e 2004, na Universidade Federal de Santa Maria, foram avaliados cento e vinte e oito genótipos de feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.) locais, cultivares comerciais e linhagens de origem meso-americana e andina, com o objetivo de caracterizar sua estrutura genética quanto à resistência a 12 raças fisiológicas de Colletotrichum lindemuthianum, no estádio juvenil (V1/V2). Destes genótipos, vinte e seis foram selecionados e inoculados em 3 estádios fenológicos (V1/V2; R4/R5 e R5/R6), com 4 raças fisiológicas de C. lindemuthianum, sendo avaliada a proporção de reações resistentes de acordo com a idade da planta. Reações caracterizadas com base em uma escala de notas de severidade de 1 a 9, permitiram calcular os índices de resistência dos genótipos e da virulência das raças. A análise fenética dos dados de virulência foi obtida a partir da construção de uma matriz, considerando as reações incompatíveis (0) e as reações compatíveis (1). A variabilidade em germoplasma de feijão não se mostrou coerente com a década de lançamento, local origem e pool gênico. Não foi observado aumento significativo na proporção de genótipos resistentes entre as décadas de 80 e 90, assim como não houve incremento de alguns genes de virulência especialmente dispersos e abundantes. Genótipos que apresentaram índice de resistência superior a 80% não continham genes Mexicanos (Co-4 e Co-5). Variabilidade em linhagens não se mostrou ligada à estrutura populacional de C. lindemuthianum. A análise fenética mostrou que maior diversidade intrínseca foi observada entre os genótipos locais de feijoeiro comum. Para interações específicas entre genótipos e raças, foi observada variação na resistência relacionada com o envelhecimento da planta.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The present work was the objective to evaluate grains and byproducts used on animal feeding, based on carbohydrates fractionate for a best potential utilization of this feeds like energetic. Were determinate the fractions: simples sugars (SS), digestible starch (DS), resistant starch (RS), total fiber (FT), neutral detergent fiber (FDN) and soluble fiber (FS) of energetic concentrates corn and sorghum grain, citric pulp, wheat bran, middling wheat and rice bran, classified by the multivariate analysis in groups of the according with the carbohydrates constitute principal fractions. The variations in teors of simples sugars, digestible starch, resistant starch, total fiber, neutral detergent fiber and soluble fiber analysed left to establish the feeds energetic concentrate, being possible to get at least three energetic groups with characteristics in compose in carbohydrates similars and differents between themselves. On the group first, corn, sorghum, middling wheat show the higher values of AS and RS and lower to SS, FT, FDN and FS; on the second, formed by the citric pulp predominated the superior teors of SS, TF and FS; medium of FDN and lowers of DS and RS; and the last group correspond to the higher values of FDN, intermediate of TF, FS and DS and lowers of RS and SS grouping the wheat mill and rice bran. The obtain results, allied the good repeatability of the used methods to the partitioning realization and the multivariate analysis live the used of this to identify the carbohydrates components who compose the feeds, mainly the byproducts and contributing of a best potential utilization of this feeds like energetic in diets of the different animal species. / O presente trabalho teve como objetivo principal avaliar grãos e subprodutos rotineiramente utilizados na alimentação animal através do fracionamento de carboidratos, para um melhor aproveitamento da potencialidade destes alimentos como energéticos. Foram determinadas as frações: açúcares simples (AS), amido disponível (AD), amido resistente (AR), fibra total (FT), fibra em detergente neutro (FDN) e fibra solúvel (FS) dos concentrados energéticos grãos de milho e sorgo, polpa cítrica, farelo de trigo, triguilho e farelo de arroz integral, classificados através da análise multivariada de agrupamento de acordo com as frações de carboidratos analisadas. As variações nos teores de açúcares simples, amido disponível, amido resistente, fibra total, fibra em detergente neutro e fibra solúvel analisados através da análise multivariada, permitiu classificar os alimentos concentrados energéticos em, pelo menos três grupos, com características de composição em carboidratos semelhantes dentro de si e distintas entre si. No primeiro grupo, milho, sorgo e triguilho apresentaram os maiores valores de AD e AR e menores de AS, FT, FDN e FS; no segundo, formado pela polpa cítrica predominou os teores superiores de AS, FT e FS; medianos de FDN e inferiores de AD e AR; e o último grupo correspondeu aos valores mais altos de FDN, intermediários de FT, FS e AD e baixos de AR e AS agrupando os farelos de trigo e arroz. Os resultados obtidos aliados à boa repetibilidade das técnicas adotadas para o fracionamento e à análise multivariada permitem a utilização do mesmo para melhor identificar os componentes dos carboidratos que compõem os alimentos, principalmente os subprodutos e um melhor aproveitamento dos alimentos avaliados como energéticos nas dietas das diferentes espécies animais.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Mining areas and constantly receiving addition of industrial waste are subject to increased levels of copper in the soil. Copper when in high amounts in the soil can adversely affect vegetation preventing the cultivation of contaminated areas. The aim of this study was to allow the formation of ectomycorrhiza and assess their influence on the development of native tree in soil contaminated with copper. Accordingly, an experiment was established to evaluate the behavior of mimosa, grapia and bracatinga seedlings in copper contaminated soil. Following, another experiment was conducted to evaluate in vitro the influence of eucalyptus essential oil in the establishment of ectomycorrhizal association in bracatinga and grapia seedlings. We evaluated also the influence of eucalyptus essential oil and Pisolithus microcarpus inoculation on growth of bracatinga seedlings in soil contaminated with copper. The results indicate that grápia was less affected by increasing doses of copper applied to the soil and angico that showed lower translocation to leaf area. The bracatinga ectomycorrhizal association formed without the addition of essential oil, however, the presence of oil increased the percentage of ectomycorrhizal colonization, grápia required stimulus eucalyptus essential oil to form ectomycorrhizal association. No effect of inoculating Pisolithus microcarpus was observed in seedling growth bracatinga in soil contaminated with copper, however, we observed a higher altitude at a dose of 180 mg kg - 1 with the application of 40 l L- 1 essential oil eucalyptus . Copper doses from 180 mg kg - 1 inhibit the formation of ectomycorrhiza on seedlings bracatinga . / Áreas de mineração e as que recebem constantemente adição de resíduos industriais estão sujeitas ao aumento dos teores de cobre no solo. O cobre quando em quantidades elevadas no solo pode interferir negativamente na produção vegetal. O objetivo desse trabalho foi possibilitar a formação de ectomicorriza e avaliar a sua influência no desenvolvimento de arbóreas nativas em solo contaminado com cobre. Nesse sentido, foi estabelecido um experimento para avaliar o comportamento de mudas de angico, bracatinga e grápia em solo contaminado por cobre. Na sequência foi conduzido outro experimento IN VITRO avaliando a influência de óleo essencial de eucalipto no estabelecimento de associação ectomicorrízica em mudas de bracatinga e grápia. E avaliou-se a influência do óleo essencial de eucalipto e da inoculação de Pisolithus microcarpus no crescimento de mudas de bracatinga em solo contaminado com cobre. Os resultados indicam que a grápia foi menos influenciada pelas doses crescentes de cobre aplicadas ao solo e o angico foi a espécie que teve menor translocação de cobre para a parte aérea. A bracatinga apresentou manto fúngico ao redor das raízes sem a adição de óleo essencial, no entanto, na presença do óleo, aumentou o percentual de pelos colonizados. A grápia necessitou de estímulo do óleo essencial de eucalipto para formar associação ectomicorrízica. Não foi observado efeito da inoculação de Pisolithus microcarpus no crescimento das mudas de bracatinga em solo contaminado com cobre, no entanto, observou-se maior altura na dose de 180 mg kg-1 com a aplicação de 40 μL L-1 de óleo essencial de eucalipto. Doses de cobre a partir de 180 mg kg-1 inibem a formação de ectomicorriza nas mudas de bracatinga.

The family Caulimoviridae comprises viruses with semicircular double-stranded DNA genomes encapsulated into isometric or bacilliform particles, being divided into eight genera. The genus Badnavirus is the most important due to its high number of species reported infecting cultivated plants worldwide. The present study aimed to evaluate the taxonomic/phylogenetic positioning and population genetic variability into the genus Badnavirus. Initially, a data set comprising badnavirus full-length genome sequences was obtained from the non-redundant GenBank database. Multiple nucleotide sequence alignments were obtained for the data sets: complete genome; ORF III; full (1020pb) and partial (579pb) RT/RNaseH. Pairwise sequence comparisons, phylogenetic and recombination analyses were performed for all data sets. A total of 127 isolates were obtained, representing 53 badnavirus species. Nucleotide pairwise comparisons for the data sets RT/RNaseH and ORF III showed that a number of distinct badnavirus species shared up to 82,5% of identity, higher than the 80% threshold currently used for species demarcation in the genus. Bayesian phylogenetic trees showed four well supported clusters, with clusters 1 and 3 being sister groups comprising predominantly isolates infecting sugarcane and banana. Non-tree-like evolution evidenced a complex pattern of recombination, and at least 23 independent events were detected with recombination breakpoints occurring predominantly in the ORF III and in the intergenic region. By the analysis of nucleotide diversity of the partial RT/RNaseH region in 12 badnavirus population, a high genetic variability was observed. These results showed that mutation and recombination are important evolutionary mechanisms acting on the diversification of badnaviruses, and that the partial RT/RNaseH sequence is sufficient to determine the taxonomic placement of most viral species described in this genus. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A família Caulimoviridae compreende fitovírus com genomas semicirculares de DNA de fita dupla encapsidados em partículas isométricas ou baciliformes, sendo dividida em oito gêneros. O gênero Badnavirus é o mais importante devido ao seu alto número de espécies relatadas infectando plantas cultivadas em todo o mundo. O presente estudo teve como objetivo avaliar a variabilidade genética de populações e o posicionamento taxonômico/filogenético de espécies de badnavírus. Inicialmente, sequências completas para o genoma das espécies de badnavírus foram obtidas a partir do banco de dados não-redundante GenBank. Alinhamentos múltiplos das sequências nucleotídicas foram obtidos para os seguintes conjuntos de dados: genoma completo, ORFIII, RT/RNaseH completa (1020nt) e parcial (579nt). Comparações pareadas de sequências, análises filogenéticas, de recombinação e variabilidade genética foram realizadas para os conjuntos de dados. Um total de 127 isolados foram obtidos, representando 53 espécies de badnavírus. As comparações de sequências de nucleotídeos para o conjunto de dados RT/RnaseH (completa e parcial) mostraram que algumas espécies de badnavírus relatadas como distintas apresentam entre 57,1-82,5% de identidade, superior ao limite de 80,0% atualmente utilizado para a demarcação de espécies em Badnavirus. Resultados similares foram observados para os dados da ORFIII e genoma completo, reforçando que sequências parciais do domínio RT/RNaseH são suficiente para determinar o posicionamento taxonômico da maioria das espécies descritas neste gênero. Quatro grupos (clusters 1-4) bem suportados foram observados nas árvores filogenéticas para genoma completo e ORFIII, com os cluster 1 e 3 formando grupos irmãos compreendendo espécies/isolados infectando predominantemente cana-de-açúcar (Saccharum spp.) e banana (Musa spp.). Análise de evolução em rede evidenciou alguns possíveis eventos de recombinação afetando a diversificação de espécies de badnavírus, com pelo menos 23 eventos independentes sendo detectados com pontos de recombinação ocorrendo predominantemente na ORFIII e região intergênica. Finalmente, altos índices de diversidade nucleotídica foram observados para a região RT/RnaseH parcial em populações de 12 espécies distintas de badnavírus. Estes resultados mostram que mutação e recombinação são mecanismos importantes atuando na evolução dos badnavírus.

The dairy cattle is a source of income for thousands of producers in Brazil, with growing production data, especially in the Northeast, making it essential that they be encouraged to create sustainable processes, causing producers to be competitive, earning profits and quality of life in a responsible manner. In this sense, monitoring the remnants of the protein intake in the diet of lactating cows, allows a rational use of concentrate supplementation, promoting a reduction in production costs, and prevent loss of nitrogen to the environment. The concentration of plasma urea nitrogen (PUN) can be an important auxiliary tool in the implementation and adjustment of feeding strategies, because it reflects the nutritional protein, the efficiency of nitrogen utilization by the animal and the ruminal balance between nitrogen (N) and energy. Its use as a routine, can help professionals in rural technical assistance, the ease of performing the examination in any laboratory animal or human clinical analysis, and can be used in non-lactating animals and other animal categories. The aim of this study was to evaluate the concentration of plasma urea nitrogen (PUN) in different dairy herds in order to obtain a diagnosis of levels of dietary protein utilization of lactating cows and to relate these levels with economic and productive aspects. The experiment was conducted in 25 farms with the exploitation of dairy cattle in the town of Nossa Senhora da Glória (SE), where blood samples were collected in five cows per farm, every 30 days over a period of three consecutive months, to determination of the PUN. Then, we selected 10 properties, valued between 25 and showing greater zootechnic control, to analyze possible PUN associations with nutritional parameters, productive and reproductive, as well as assess the commitment of the income of milk with concentrate supplementation. The experimental design was completely randomized split plot in time, obtaining variations of PUN between 6.97 and 29.2 mg / dL (P <0.05) and overall average of 15.46 mg / dL between the properties, where only 37.33% of them presented PUN within the patterns, and found that increasing levels of crude protein (CP) in the diet resulted in elevated values of PUN and reduced reproductive efficiency. It was also observed, that the mean of a 38.17% of income from milk, with the use of concentration between the properties. Under the conditions of this diagnosis, it appears that the present levels of PUN is not standard in most properties, possibly influenced by crude protein (CP) in the diet, resulting in higher production costs of dairy. / A bovinocultura leiteira representa uma fonte de renda para milhares de produtores no Brasil, apresentando dados produtivos crescentes, principalmente no Nordeste, tornando-se fundamental que sejam estimulados processos de criação sustentáveis, fazendo com que os produtores sejam competitivos, auferindo lucros e qualidade de vida, de forma responsável. Neste sentido, o monitoramento das sobras da proteína ingerida na dieta das vacas em lactação, permite uma utilização racional da suplementação concentrada, promovendo uma redução nos custos de produção, além de evitar perdas de nitrogênio para o meio ambiente. A concentração do nitrogênio ureico no plasma (NUP) pode ser uma ferramenta auxiliar importante, na implantação e ajustes de estratégias de alimentação, pois reflete o estado nutricional protéico, a eficiência da utilização do nitrogênio pelo animal e o equilíbrio ruminal entre nitrogênio (N) e energia. Seu uso como rotina, pode auxiliar profissionais da assistência técnica rural, pela facilidade da realização do exame em qualquer laboratório de análise clínica humana ou animal, além de poder ser utilizado em animais não lactantes e em outras categorias animais. O objetivo dessa pesquisa foi avaliar a concentração de nitrogênio uréico no plasma (NUP) em diferentes rebanhos leiteiros, de modo a obter um diagnóstico dos níveis de aproveitamento protéico dietético de vacas em lactação e relacionar esses níveis, com aspectos produtivos e econômicos. O experimento foi conduzido em 25 propriedades rurais com exploração de bovinocultura leiteira, no município de Nossa Senhora da Glória (SE), onde foram realizadas coletas de sangue em cinco vacas por propriedade, a cada 30 dias, num período de três meses seguidos, para determinação do NUP. Em seguida, foram selecionadas 10 propriedades, entre as 25 avaliadas, que apresentavam maior controle zootécnico, para analisar possíveis associações do NUP com parâmetros nutricionais, produtivos e reprodutivos, além da avaliar o comprometimento da renda do leite (CRL) com a suplementação concentrada. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado, em parcelas subdivididas no tempo, obtendo variações de NUP entre 6,97 e 29,2 mg/dL (P<0,05) e média geral de 15,46mg/dL entre as propriedades, onde apenas 37,33% delas apresentou NUP dentro dos padrões, sendo verificado que níveis crescentes de proteína bruta (PB) na dieta resultaram na elevação dos valores de NUP e redução da eficiência reprodutiva. Foi observado também, um comprometimento médio de 38,17% da renda do leite (CRL), com a utilização de concentrado, entre as propriedades. Nas condições desse diagnóstico, verifica-se que os níveis de NUP apresentam-se fora dos padrões na maioria das propriedades, possivelmente influenciados pela proteína bruta (PB) na dieta, repercutindo num maior custo de produção da atividade leiteira.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2018-11-23T15:47:37Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Versão Entregue Final.pdf: 2040128 bytes, checksum: a0234ca7762f3c4daa96acd37dffd8c2 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-11-23T18:55:55Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Versão Entregue Final.pdf: 2040128 bytes, checksum: a0234ca7762f3c4daa96acd37dffd8c2 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-23T18:55:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Versão Entregue Final.pdf: 2040128 bytes, checksum: a0234ca7762f3c4daa96acd37dffd8c2 (MD5) Previous issue date: 2017-07-21 / A oliveira é uma cultura que ganhou destaque dentro da cadeia agrícola mundial, concentrando-se basicamente em dois produtos, a azeitona e o azeite de oliva. No entanto, o desenvolvimento da oliveira está relacionado às propriedades do solo onde é cultivada. O principal problema do cultivo em solos ácidos é a toxicidade do alumínio que resulta em alterações nos processos fisiológicos e bioquímicos nas plantas e consequentemente na produtividade. As informações sobre o cultivo de oliveira em solos ácidos ainda são escassas. Nesse contexto, o objetivo do trabalho foi avaliar as respostas morfofisiológicas, com determinações de estatura de planta, diâmetro do caule, teor de clorofila e nutrientes foliares de mudas de oliveira ‘Arbequina’ submetida a diferentes níveis de pH no solo. Para as avaliações de estatura de planta, diâmetro do caule e teor de clorofila, o delineamento experimental utilizado foi completamente casualizado arranjado em parcelas subdivididas. O fator alocado nas parcelas principais foi constituído pelo tempo (0, 30, 60, 90, 120 e 150) dias após o transplante (DAT) e, o fator arranjado nas subparcelas foi composto pelo pH (2,9; 3,1; 3,9; 4,3; 5,0 e 6,3). Na determinação do teor de nutrientes foliares (nitrogênio, fósforo, potássio, cálcio, magnésio, enxofre, cobre, zinco, ferro, manganês, alumínio e boro) seguiu-se o mesmo delineamento, porém, somente foi testado o pH. Pela otimização matemática, as condições ótimas foram 76,63 cm de estatura de planta com pH de 4,7 em 15,2 DAT; 7,17 mm de diâmetro do caule em pH 5,7 e 107 DAT; e, teor de clorofila de 78,45 em pH 4,8 com 118,8 DAT. O crescimento das plantas de oliveira ‘Arbequina’, avaliado pela estatura de plantas, diâmetro dos caules e teor de clorofila, não são prejudicados pelos pHs ácidos até 150 DAT. Para os diferentes níveis de pH testados os teores foliares de nitrogênio, fósforo, potássio, cálcio, magnésio, enxofre, cobre, zinco, ferro, manganês e boro estão adequados à faixa de suficiência preconizada para a cultura da oliveira, exceto o nitrogênio no pH 2,9. As plantas de oliveira ‘Arbequina’ suportam adequadamente pHs ácidos mesmo com acréscimos acentuados no teor de alumínio foliar. A evidência indica que as plantas de oliveira em solos ácidos evoluíram várias estratégias para superar o estresse por Al3+, sendo que seus mecanismos bioquímicos e moleculares ainda não foram investigados. / The olive tree is a culture that has gained prominence within the world agricultural chain, concentrating basically on two products, the olive and olive oil. However, the development of the olive tree is related to the properties of the soil where it is cultivated. The main problem of cultivation in acid soils is the toxicity of aluminum that results in changes in physiological and biochemical processes in plants and consequently in productivity. Information on olive cultivation on acid soils is still scarce. In this context, the objective of this work was to evaluate the morphophysiological responses, with determinations of plant height, stem diameter, chlorophyll content and leaf nutrients of 'Arbequina' olive seedlings submitted to different soil pH levels. For the evaluations of plant height, stem diameter, chlorophyll content the experimental design was completely randomized arranged in subdivided plots. The factor allocated to the main plots consisted of the time (0, 30, 60, 90, 120 and 150) days after transplantation (DAT) and the factor arranged in the subplots was composed of pH (2.9, 3.1, 3.9, 4.3, 5.0 and 6.3). The determination of leaf nutrient content (nitrogen, phosphorus, potassium, calcium, magnesium, sulfur, copper, zinc, iron, manganese, aluminum and boron) followed the same design, however, only pH was tested. By the mathematical optimization the optimal conditions were 76.63 cm of height of plant with pH of 4.7 in 15.2 DAT; 7.17 mm stem diameter at pH 5.7 and 107 DAT; and, chlorophyll content of 78.45 at pH 4.8 with 118.8 DAT. The growth of 'Arbequina' olive plants, evaluated by plant stature, stem diameter and chlorophyll content, are not affected by acid pHs up to 150 DAT. For the different pH levels tested, nitrogen, phosphorus, potassium, calcium, magnesium, sulfur, copper, zinc, iron, manganese and boron levels were adequate for the recommended range for olive cultivation, except nitrogen at pH 2.9. The 'Arbequina' olive plants adequately support acidic pHs even with accentuated additions to the aluminum leaf content. Evidence indicates that olive plants in acid soils have evolved several strategies to overcome Al3+ stress, and their biochemical and molecular mechanisms have not yet been investigated.

Made available in DSpace on 2016-05-02T13:53:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Wellington Ferrari da Silva Dissertacao.pdf: 903968 bytes, checksum: b8d0aa507c24eb3fd423bd067a8b8585 (MD5) Previous issue date: 2013-07-09 / The metropolitan region of Belo Horizonte is characterized by the cultivation of tuberous vegetables, herbs and fruits, and is considered one of the green belts of the state of Minas Gerais in production and marketing. Thus, in order to make a diagnosis under the current situation of producers in this region, analyzing aspects of production, marketing and grower characteristics, we applied a questionnaire in order to meet a growing demand for information that develop in the area. The interviews were made "in situ", and the producers were identified through visits and productive areas by telephone. The data were treated in a quantitative manner and made available through charts and tables. After the analysis of responses identified that in metropolitan vegetable growers have age varied with the degree of elementary education, besides having the lettuce as the main vegetable. Producers sell in their own metropolitan area directly to the final consumer. Thus, the study contributed to broaden the understanding of how is the production, the marketing of vegetables produced and the process of decision making. For future studies, it is suggested to expand this universe, comparing the results between different regions of the state of Minas Gerais. / A região metropolitana de Belo Horizonte caracteriza-se pelo cultivo de hortaliças tuberosas, herbáceas e frutos, sendo considerada um dos cinturões verdes do estado de Minas Gerais em produção e comercialização. Assim, com o objetivo de realizar um diagnóstico sobre a situação atual dos produtores dessa região, analisando aspectos de produção, comercialização e características dos produtores, aplicou-se um questionário com vistas a atender uma demanda crescente de informações desenvolvidas na área. As entrevistas foram feitas "in loco" e os produtores foram identificados por meio de visitas nas áreas produtivas e por contato telefônico. Os dados foram tratados de forma quantitativa e disponibilizados por meio de gráficos e tabelas. Após a análise das respostas, identificou-se que os produtores de hortaliças da região metropolitana possuem idade variada, com grau de escolaridade fundamental, e produzem a alface como principal hortaliça. Os produtores vendem suas hortaliças na própria região metropolitana, diretamente ao consumidor final. Desse modo, o estudo contribuiu para ampliar a compreensão de como é feita a produção, a comercialização das hortaliças produzidas e o seu processo de tomada de decisão. Para estudos futuros, sugere-se expandir esse universo, comparando os resultados entre diferentes regiões do estado ampliando o conhecimento acerca do processo de tomada de decisão dos produtores rurais de hortaliças.