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Alguns modelos para dados de contagem resultantes de experimentos com cultura de tecidos / not available

Fioravante, Ana Maria 30 January 1996 (has links)
Em experimentos com cultura de tecidos é comum a obtenção de dados de contagem. Pode-se admitir, a princípio, que contagens seguem a distribuição de Poisson. Neste trabalho, utilizando-se o enfoque de modelos lineares generalizados, são apresentados os modelos Poisson, Poisson truncado e binomial negativo para a análise de dados de contagem resultantes de experimentos com cultura de tecidos. Esses dados, via de regra, apresentam o número de observações iguais a zero maior do que seria esperado com base no número médio de eventos que ocorrem. Outro problema que esses dados podem apresentar é a ocorrência de superdispersão. Quando essas situações se verificam, o modelo Poisson não se ajusta bem aos dados e os modelos Poisson truncado e binomial negativo são apresentados como alternativas para esse problema. Como aplicação, foram utilizados três conjuntos de dados e a variável resposta estudada foi o número de calos produzidos por explante entre os modelos Poisson e Poisson truncado. Este foi o que melhor se ajustou ao conjunto A de dados, que não apresentou superdispersão. Para o conjunto B de dados, que apresentou superdispersão, o melhor modelo foi o binomial negativo, e para o conjunto C de dados, que também não apresentou superdispersão, o modelo Poisson ofereceu um bom ajuste / not available
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Análise genética e molecular da variação somaclonal em Stylosanthes guianensis (Aubl.) Sw. (Leguminosae) / not available

Consoli, Luciano 28 August 1995 (has links)
O objetivo deste trabalho foi estudar os efeitos da cultura de tecidos em características quantitativas de interesse agronômico e também detectar possíveis alterações ao nível molecular, através da técnica de RAPD, em progênies de plantas regeneradas de Stylosanthes guianensis. Sessenta e três progênies derivadas da cultura de tecidos (R2) e 53 derivados da população original (O2) foram avaliadas para os caracteres da produção de matéria verde e seca (PMV) e produção de matéria seca (PMS). Detectou-se na população regenerada, em média, uma variabilidade genética 2,6 vezes superior à variabilidade presente na população original, para os dois caracteres. As estimativas do coeficiente de herbabilidade e do ganho esperado com seleção para os dois caracteres, também foram superiores para a população regenerada. No entanto, a população regenerada apresentou reduções significativas nas médias, para os caracteres PMV (2656,32 g/planta) e PMS (891,27 g/planta), em relação às médias da população original (PMV=2978,11 e PMS=1000,90). Apesar destas reduções, as médias esperadas da população regenerada selecionada, para os dois caracteres, foram superiores às médias esperadas da população original. Estes resultados indicam que a cultura de tecidos foi capaz de gerar uma variabilidade genética superior à variabilidade encontrada na população original, podendo ser aproveitada em programas de melhoramento. Amostras de 16 progênies de cada uma das populações original e regenerada foram analisadas através da técnica de RAPD utilizando-se 10 primers de sequência aleatória. Estes primers geraram 219 produtos de amplificação apresentando 51,6% de polimorfismo. O agrupamento das progênies pelo método UPGMA, baseado no coeficiente de similaridade Simple Matching, gerou um dendrograma no qual visualiza-se a formação de dois grupos distintos, separando as progênies originais das regeneradas. Apesar da semelhança nos valores dos coeficientes de similaridade genética observados dentro de cada população, a separação das progênies em dois grupos indica que a cultura de tecidos provocou alterações ao nível molecular, capazes de alterar os padrões de RAPDs. / not available
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Estudo de possíveis alterações agroindustriais induzidas pelo método de cultura de tecido irradiado em cana-de-açúcar variedade NA 56-79 / Study of the agroindustrial alterations induced by the irradiated tissue culture in sugar cane variety NA 56-79

Figueiredo Junior, Osmy 10 April 1991 (has links)
O método de cultura de tecido vegetal e a aplicação de radiação gama, como agentes indutores de variabilidade genética, na cana-de-açúcar variedade NA 5679, a fim de proporcionarem variações nos , teores de brix, pol, fibra, pureza, extração, fósforo, nitrogênio, açúcares redutores e nas características morfológicas, foram estudadas. Para tal os calos originados pela cultura de tecidos, foram irradiados com as seguintes doses: 20, 40 e 60 Gy. Alguns calos não sofreram irradiação (O Gy) para evidenciarem apenas o emprego da cultura de tecido. Os calas foram cultivados em laboratório até a diferenciação em plântulas, seguindo para aclimatação em casa de vegetação, onde amostras de plantas reproduzidas vegetativamente foram acrescentadas ao experimento, para servirem como plantas padrão. Após o período de crescimento no campo, foram realizadas as análises morfológicas e tecnológicas. A análise estatística dos resultados mostrou que o método de cultura de tecidos pode eventualmente propiciar aumento nos teores dos parâmetros tecnológicos e que as dosagens de irradiação não foram eficientes em tal propósito. / This research deals with the use of plant tissue culture and the application of gamma radiation as mutation inducing agents, in the sugar cane plant, variety NA 5679, in order to provide variation in the contents of brix, pol, fiber, purity, extraction, phosphorus, nitrogen, reducing sugars as well as in the morphological characteristics (features). The"callus"·obtained by the tissue culture were irradiated with the following doses: 20, 40 and 60 Gy. Some callus were not irradiated (0 Gy) to make clear the use of tissue culture only. The "callus"were cultivated in laboratory up to their seedling stage, when they were placed in a greenhouse where samplings of vegetative reproduced plants were added to the experiment for serving as pattern plants. Morphological and technological analyses were done after the growth period in the field. The statistical analysis of the results indicated that the method of tissue culture may, eventually, increase the contents of the technological parameters and that the dosages of gamma radiation were not efficient for such purpose.
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Alguns modelos para dados de contagem resultantes de experimentos com cultura de tecidos / not available

Ana Maria Fioravante 30 January 1996 (has links)
Em experimentos com cultura de tecidos é comum a obtenção de dados de contagem. Pode-se admitir, a princípio, que contagens seguem a distribuição de Poisson. Neste trabalho, utilizando-se o enfoque de modelos lineares generalizados, são apresentados os modelos Poisson, Poisson truncado e binomial negativo para a análise de dados de contagem resultantes de experimentos com cultura de tecidos. Esses dados, via de regra, apresentam o número de observações iguais a zero maior do que seria esperado com base no número médio de eventos que ocorrem. Outro problema que esses dados podem apresentar é a ocorrência de superdispersão. Quando essas situações se verificam, o modelo Poisson não se ajusta bem aos dados e os modelos Poisson truncado e binomial negativo são apresentados como alternativas para esse problema. Como aplicação, foram utilizados três conjuntos de dados e a variável resposta estudada foi o número de calos produzidos por explante entre os modelos Poisson e Poisson truncado. Este foi o que melhor se ajustou ao conjunto A de dados, que não apresentou superdispersão. Para o conjunto B de dados, que apresentou superdispersão, o melhor modelo foi o binomial negativo, e para o conjunto C de dados, que também não apresentou superdispersão, o modelo Poisson ofereceu um bom ajuste / not available
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Bioquímica do estresse, histoquímica e aspectos ultraestruturais de calos de teca (Tectona grandis L.f.) visando a indução da embriogênese somática / Biochemistry of stress, histochemistry and ultra-structural aspects of teak (Tectona grandis L.f.) calli for the induction of somatic embryogenesis

Barbosa, Renato da Silva 18 January 2019 (has links)
A teca, Tectona grandis L.f., é uma espécie arbórea originária do sudeste asiático. Com o surgimento de políticas públicas nos países de origem, bem como a deficiência em tecnologia dos tratos silviculturais, a espécie passou a ser disseminada pelo mundo, principalmente nas Américas central e do sul. O principal destino do produto final dos plantios de teca é o mercado de móveis de luxo e embarcação naval. As características da sua madeira possibilita sua inserção neste mercado, bem como proporciona um alto valor de venda. Com o mercado em constante ascenção vê-se a necessidade de uma produção de madeira com alto valor agregado. A melhor opção para manter a produção de qualidade é o uso dos plantios clonais. Para tanto, ainda existem algumas falhas nos programas clonais de teca, sendo a principal delas a clonagem de matrizes com características ótimas para o mercado. Para alcançar o sucesso no processo de clonagem de espécies lenhosas tem-se utilizado das ferramentas biotecnológicas, como a cultura de tecido. A cultura de tecidos possibilita a morfogênese vegetal a partir de tecidos vegetais somáticos. A embriogênese somática é uma técnica em desenvolvimento para as espécies lenhosas, e tem contribuido para os programas clonais através da produção em larga escala de plântulas, bem como sementes sintéticas. A embriogênese somática em teca ainda tem sido estudada, e apresenta como suas principais barreiras a escolha do explante a ser introduzido in vitro e a oxidação durante a cultura de tecidos. Diante disso, o presente trabalho objetivou estudar a bioquímica do estresse, os aspectos ultraestruturais e histoquímica de calos de teca provenientes de explantes foliares, visando propor possíveis melhorias nas técnicas de cultivo in vitro para se obter sucesso na produção de embriões somáticos. O material vegetal utilizado foram explantes foliares coletados de matrizes de teca envasadas em viveiro. O material passou por desinfestação e foi introduzido em 16 diferentes tratamentos com diferentes balanços de 2,4-D e BAP. Através de análises morfológicas visuais e teste histoquímico com Carmim acético foram selecionados o melhor e pior tratamento para produção de calos embriogênicos. Foram selecionados T08, 0,5mgL-1 de 2,4-D e 2,0mgL-1 de BAP, como melhor resultado para produção de calos embriogênicos, e T06, 0,5mgL-1 de 2,4-D e 0,1mgL-1 de BAP, como calos não embriogênicos. Os calos provenientes dos dois tratamentos foram analisados quanto sua ultraestrura, através da microscopia eletrônica de varredura, e também avaliados bioquimicamente, sendo avaliados: quantificação de proteínas, peróxido de hidrogênio, MDA, e atividade das enzimas CAT, APX e SOD. Os resultados possibilitaram confirmar a produção de estruturas pró-embriogênicas no tratamento T08 através da MEV. E a análise bioquímica evidenciou a enzima SOD como um possível marcador de resposta morfogênica. Além disso, as análises de estresse oxidativo permitiram verificar a qualidade das plantas matrizes, bem como inferir o estímulo do MDA e do peróxido de oxigênio como estimulantes a indução de embriões somáticos em calos de teca quando em baixas concentrações. Os resultados ainda possibilitaram identificar possíveis alterações no protocolo de indução da embriogênese em explantes foliares de teca. / Teak, Tectona grandis L.f., is a tree species originating in Southeast Asia. With the emergence of public policies in the countries of origin, as well as the technology deficiency of silvicultural treatments, the species began to be disseminated throughout the world, mainly in central and southern America. The main destination for the final product of teak plantations is the market for luxury furniture and naval vessels. The characteristics of its wood enable its insertion in this market, as well as provides a high value of sale. With the ever-rising market, we see the need for a high value-added wood production. The best option to maintain quality production is the use of clonal plantations. In addition, there are still some flaws in teak clonal programs, the main one being the cloning of matrices with optimal characteristics for the market. To achieve success in the process of cloning woody species has been used of biotechnological tools, such as tissue culture. Tissue culture enables plant morphogenesis from somatic plant tissues. Somatic embryogenesis is a developing technique for woody species and has contributed to clonal programs through the large-scale production of seedlings as well as synthetic seeds. Somatic embryogenesis in teak has been studied, and presents as its main barriers the choice of explant to be introduced in vitro and oxidation during tissue culture. The aim of this study was to study stress biochemistry, ultrastructural aspects and histochemistry of teak calli from leaf explants, aiming at proposing possible improvements in in vitro culture techniques to be successful in the production of somatic embryos. The plant material used was foliar explants collected from nursery potted teak matrices. The material underwent disinfestation and was introduced in 16 different treatments with different 2,4-D and BAP balances. The best and worst treatment for embryogenic callus production was selected through visual morphological analysis and histochemical test with Acetic Carmim. T08, 0.5mgL-1 of 2,4-D and 2,0mgL-1 of BAP were selected as the best result for the production of embryogenic callus, and T06, 0.5mgL-1 of 2,4-D and 0, 1mgL-1 of BAP, as non-embryogenic callus. The calluses from the two treatments were analyzed by ultrasound using scanning electron microscopy and biochemically evaluated. Protein quantification, hydrogen peroxide, MDA, and CAT, APX and SOD enzymes were evaluated. The results allowed to confirm the production of pro-embryogenic structures in the T08 treatment through SEM. And the biochemical analysis evidenced the SOD enzyme as a possible marker of morphogenic response. In addition, the oxidative stress analyzes allowed to verify the quality of the matrix plants, as well as to infer the stimulus of the MDA and the oxygen peroxide as stimulants the induction of somatic embryos in the callus when in low concentrations. The results allowed to identify possible alterations in the protocol of induction of embryogenesis in leaf explants of teak.
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Estudos de Cultura de Tecidos, In Vitro, de Macroalgas Marinhas da Espécie Gracilaria birdiae / Studies of Tissue Culture, In Vitro, in marine macroalgae Gracilaria Species birdiae

Lopes, Pedro Henrique Martins 21 January 2008 (has links)
LOPES, Pedro Henrique Martins. 2008. 94f. Dissertação(Mestrado em Engenharia de Pesca)- Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2008. / Submitted by Maria Naires Souza (marianaires@ufc.br) on 2011-12-02T23:53:58Z No. of bitstreams: 1 2008-dis-phmlopes.pdf: 1781396 bytes, checksum: c7be4fcfde5e24465e8d68b4e3b0c9ec (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Nascimento(vieiraaline@yahoo.com.br) on 2011-12-08T12:08:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008-dis-phmlopes.pdf: 1781396 bytes, checksum: c7be4fcfde5e24465e8d68b4e3b0c9ec (MD5) / Made available in DSpace on 2011-12-08T12:08:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008-dis-phmlopes.pdf: 1781396 bytes, checksum: c7be4fcfde5e24465e8d68b4e3b0c9ec (MD5) Previous issue date: 2008-01-21 / Seaweed consists in a vital resource to the economy of many countries and it has been explored all over the world thanks to its capacity of producing colloids such as agar, carrageen and sodium alginate as well as the useful aspect either in food industry, fertilizers or medicine area. Studies on induction, cultivation and callus reorganization have been shown an important issue on tissue culture technique and its usage. In different tissue experience in vitro the usage of regulating growth is so fundamental to establish the competence and necessary conditions to callus formation and regeneration. In this present study has been tested the auxin and citocinin effects in different dosages of agar in ASP 12-NTA. The indolacetic acid effect and 6- benzilalaminopurine have been tested as well in seaweed in the species Gracilaria birdiae with two separated doses, 0,5mg/L and 0,8mg/L and together in concentration of 1:5mg/L and 5;1mg/L. Regarding to agar concentration, it has been tested two concentrations with 0,5% and 0,8% in all treatments. As to sterilization process has been done with fungicide (nistatina) and antibiotic (ciprofloxacin) besides iodopovidona and the sodium hypochlorite. The complete experiment had been lead in a germination chamber with 25±2ºC and photoperiod of more or less 16 hs of light and 08hs dark and 30,2‰ saltiness, pH around 7,6 within 60 days approximately. In more or less 50 days of cultivation had been noticed callus formation and regeneration process therein. The results had been underwent by statistic analyze treatments of contingent through (x2) where many meaningful different observations had been checked in callus and regeneration and the agar levels studied, that is to say the agar level treatments in 0,8% presented a major number of regeneration / Macroalgas marinhas constituem um recurso vital para a economia de diversos países e tem sido exploradas ao redor do globo devido a sua capacidade de produção de fico colóides como o ágar, carragenina e alginatos, bem como pelo seu espectro de utilização, seja na indústria de alimentos, de fertilizantes e na medicina. Estudos sobre a indução, cultivo e reorganização de calos, tem representado um importante papel nas técnicas de cultura de tecidos e suas aplicações. Em diferentes tecidos cultivados in vitro, a utilização de reguladores de crescimento é de importância primordial para o estabelecimento da competência e determinação, condições necessárias para a formação de calos e regenerações. No presente estudo foram testados os efeitos de uma auxina e de uma citocinina, em diferentes concentrações de ágar em meio ASP 12-NTA. O efeito do ácido indolacético (AIA) e da 6-benzilaminopurina (BAP) foram testados em explantes de macroalgas de espécie Gracilaria birdiae, em separado, com duas concentrações de 0,5 mg/L e 0,8 mg/L e em conjunto, nas concentrações de 1:5 mg/L e 5:1 mg/L. Com relação a concentração de ágar, foram testadas duas concentrações, com 0,5% e 0,8% para todos os tratamentos. Para o processo de esterilização foram aplicados um fungicida (nistatina) e um antibiótico (ciprofloxacina), além de iodopovidona e hipoclorito de sódio. Todo o experimento foi conduzido em câmara de germinação, com temperatura de 25 ± 2oC e fotoperíodo de 16hs de luz e 08hs escuro, salinidade de 30 ± 2‰ e pH em torno de 7,6, durante aproximadamente 60 dias. Ao final de 50 dias de cultivo, foi observada a formação de calos e de processos de regeneração indireta dos mesmos. Os resultados foram submetidos a tratamentos estatísticos de análise de contigência através do Quiquadrado (χ2 ), onde foram observadas diferenças significativas entre a incidência de calos e regenerações e os níveis de ágar estudados. Ou seja, nos tratamentos onde foram utilizados níveis de ágar de 0,8%, apresentaram o maior número de regenerações
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Tratamento de mudas de bananeira Prata Anã com o fungo Pochonia chlamydosporia visando proteção contra o nematoide das galhas Meloidogyne javanica / Treatment of banana seedlings Prata Anã with the fungus Pochonia chlamydosporia aiming protection against the root-knot nematode Meloidogyne javanica

Barbosa, Rosana Toledo 23 February 2017 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-01-24T12:14:18Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 779866 bytes, checksum: 232c3693dbb394fcf079f5d50f5c175a (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-24T12:14:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 779866 bytes, checksum: 232c3693dbb394fcf079f5d50f5c175a (MD5) Previous issue date: 2017-02-23 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / A micropropagação de mudas de bananeira vem se tornando cada vez mais comum devido ao ganho em escala e tempo na produção, além de se evitar a disseminação de patógenos, que ocorre frequentemente na propagação natural da cultura. Além disso, as mudas micropropagadas podem ser tratadas com microrganismos benéficos, que conferem proteção e vigor extras, agregando valor ao produto. O fungo Pochonia chlamydosporia já é conhecido por sua capacidade de controlar nematoides fitoparasitas e por promover o crescimento vegetal. Sendo assim, este trabalho foram avaliados os benefícios que esse fungo endofítico pode agregar ao ser introduzido em mudas micropropagadas de bananeira durante o período de aclimatação, antes de serem expostas ao contato com o nematoide das galhas radiculares, Meloidogyne javanica. Doses do produto Rizotec®, à base do isolado Pc-10 do fungo P. chlamydosporia, a fim de gerarem concentrações de 2.000, 3.000, 4.000 e 5.000 clamidósporos.g -1 de substrato, foram comparadas quanto à capacidade de conferir proteção e promover crescimento às mudas de banana. As diferentes concentrações do fungo resultaram em redução do número de galhas e de ovos de M. javanica por grama de raiz. O número de galhas e de ovos de M. javanica.g -1 de raízes, na concentração de 5.000 clamidósporos.g -1 de substrato, foram reduzidos em até 47,6% e 67%, respectivamente, em relação ao tratamento controle. Para as variáveis de desenvolvimento da planta, a altura da parte aérea, massa da parte aérea seca, diâmetro do pseudocaule e massa fresca das raízes de bananeira houve maior incremento na concentração de 5.000 clamidósporos.g -1 de substrato quando comparado ao controle. O fungo foi detectado colonizando as raízes das plantas e o substrato ao final do experimento, mostrando sua capacidade de se instalar, multiplicar e sobreviver no ambiente da muda micropropagada, e foi eficiente na redução dos danos causados pelo nematoide e na promoção do crescimento das plântulas de bananeira. / Micropropagation of banana seedlings has become increasingly common due to the gain in scale and time in the production, as well as avoiding the spread of pathogens, which occurs frequently in the natural propagation of the crop. In addition, micropropagated seedlings may be treated with beneficial microorganisms, which provide extra protection and vigor, adding value to the product. The fungus Pochonia chlamydosporia is already known for its ability to control plant-parasitic nematodes and to promote plant growth. Thus, this work evaluated the benefits that this endophytic fungus can add if introduced in micropropagated seedlings during the acclimatization period, before they are exposed to contact with the root gall nematode, Meloidogyne javanica. Doses of the Rizotec® product, based on the P. chlamydosporia fungus Pc-10 isolate, to generate 2000, 3000, 4000 and 5000 chlamydospore.g -1 concentrations in the substrate were compared for their ability to confer protection and promote the growth of banana seedlings. The different concentrations of the fungus resulted in a reduction in the number of galls and eggs of M. javanica per gram of root. The number of root galls showed a greater reduction in the concentration of 5,000 chlamydospores.g -1 than in the other treatments, with a reduction of up to 47.6% when compared to the control treatment. The number of eggs of M. javanica.g -1 of roots obtained a reduction of 67% at the concentration of 5,000 chlamydospores.g -1 of substrate, in relation to the control treatment. The dry shoot mass increased by up to 23% to 5,000 chlamydospores.g - soil. The diameter of the pseudostem also increased with the fungus application, showing an increase of 14%. The fresh root mass of the plants was also higher in the treatments with the fungus, with a 11.4% increase in the concentration of 5,000 chlamydospores.g -1 , in relation to the control treatment. The fungus was detected colonizing the roots of the plants and the substrate at the end of the experiment, showing its ability to install, multiply and survive in the micropropagated seedling environment, and was efficient in reducing the nematode damage and in promoting banana seedling growth.
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Análise histológica de tecidos cultivados in vitro de plantas laticíferas, perfil de proteínas solúveis e ação contra fitopatógenos / Histological analysis of tissues cultured in vitro laticíferas plants, soluble protein profile and action against plant pathogens

Silva, Rayanne Farias da January 2015 (has links)
SILVA, Rayanne Farias da. Análise histológica de tecidos cultivados in vitro de plantas laticíferas, perfil de proteínas solúveis e ação contra fitopatógenos. 2015. 121 f. Dissertação (Mestrado em bioquímica)- Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2015. / Submitted by Elineudson Ribeiro (elineudsonr@gmail.com) on 2016-09-01T21:33:34Z No. of bitstreams: 1 2015_dis_rfsilva.pdf: 3566752 bytes, checksum: 60c280c36514d085ed22317cb38b6cb5 (MD5) / Approved for entry into archive by Jairo Viana (jairo@ufc.br) on 2016-09-02T21:01:35Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_dis_rfsilva.pdf: 3566752 bytes, checksum: 60c280c36514d085ed22317cb38b6cb5 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-02T21:01:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_dis_rfsilva.pdf: 3566752 bytes, checksum: 60c280c36514d085ed22317cb38b6cb5 (MD5) Previous issue date: 2015 / Laticifers plants have been studied by presenting a wide range of proteins related to plant defense in its latex. The aim of this study was to investigate, in tissue cultured in vitro, proteins and activities described for latex laticíferas two species. Tissue callus and roots of Cryptostegia grandiflora were obtained by in vitro tissues culture protocols and subjected to histological analysis for laticifers characterization. Cultured tissue of Calotropis procera were used as comparative reference in the analysis. There wasn’t any laticifer structure in callus or roots of C. grandiflora while in C. procera laticifers are formed in the roots. Soluble proteins were extracted from the cultured tissue and characterized using enzymatic assays, biochemical, immunological techniques and mass spectrometry. The presence of activity against phytopathogenic fungi was investigated and all data obtained were compared with the previously one determined for the plants studied latex. Callus and roots proteins of C. procera showed antifungal activity against pathogenic fungi. The percentage inhibition of the vegetative hyphae growth in the presence of callus and roots C. procera protein respectively were 75.5% and 82.6% for Fusarium solani, 76.7% and 57.1% for Rhizoctonia solani, 88.8% and 79.8% for Fusarium oxysporum, 93.7% and 90.2% for Colletotrichum lindemuthianum and 80.2% and 79.7% for Colletotrichum gloesporioides, however, showed no effect on Mucor sp. Callus and roots proteins of C. grandiflora showed no inhibitory effect on the hyphae growth or spores germination of assayed fungi. Through assays using fluorescent markers, it was demonstrated that proteins extracted from in vitro culture of C. procera interact with the membrane of C. gloesporioides causing leakage of cytoplasmic contents, possibly suggesting that its mechanism of action against fungi is related to the change in plasma membrane permeability. Also oxidative stress was observed in C. gloesporioides spores treated with callus and roots protein C. procera by hydrogen peroxide production. Protease inhibitors, chitinases, osmotins and proteases were detected in the C. procera callus and roots samples, however, osmotins and proteases were not observed in C. grandiflora callus and roots. The activity of antioxidant enzymes APX, G-POD and catalase were observed in tissue cultured in vitro of C. grandiflora. Considering that C. grandiflora laticifers proteases were demonstrated exert action against fungi, the results observed in this study suggest that the absence of antifungal activity in C. grandiflora cultured tissue is due to the absence of proteases in these tissues as well exclude chitinases and proteases inhibitors as antifungal proteins. The study concludes that the use of cultured tissues that do not differentiate laticifers is an interesting model to study activities associated to proteins founded in latex. Antifungal proteases present in C. grandiflora latex were not found in the tissues without laticifer formation. / Plantas laticíferas têm sido estudadas por apresentarem uma grande diversidade de proteínas relacionadas à defesa vegetal em seu látex. O objetivo deste trabalho foi pesquisar em tecidos cultivados in vitro, proteínas e atividades descritas para o látex de duas espécies laticíferas. Tecidos de calos e raízes de Cryptostegia grandiflora foram obtidos através de protocolos de cultura in vitro de tecidos e submetidos à análise histológica para caracterização de laticíferos. Tecidos cultivados de Calotropis procera foram utilizados como referencial comparativo nas análises. Não foi detectada qualquer estrutura laticífera em calos ou raízes de C. grandiflora enquanto que em C. procera laticíferos se formam nas raízes. Proteínas solúveis foram extraídas dos tecidos cultivados e caracterizadas por meio de ensaios enzimáticos, técnicas bioquímicas, imunológicas e espectrometria de massas. A presença de atividade contra fungos fitopatogênicos foi investigada e todos os dados obtidos foram comparados com dados previamente determinados para os látex das espécies estudadas. Proteínas dos calos e raízes de C. procera, apresentaram atividade antifúngica sobre fungos fitopatogênicos. Os percentuais de inibição do crescimento vegetativo de hifas na presença de proteínas de calos e raízes de C. procera, respectivamente, foram: 75,5% e 82,6% para Fusarium solani, 76,7% e 57,1% para Rhizoctonia solani, 88,8% e 79,8% para Fusarium oxysporum, 93,7% e 90,2% para Colletotrichum lindemuthianum e 80,2% e 79,7% para Colletotrichum gloesporioides, no entanto, não demonstraram nenhum efeito sobre Mucor sp. As proteínas de calos e raízes de C. grandiflora não apresentaram qualquer efeito inibitório sobre o crescimento de hifas ou germinação de esporos dos fungos avaliados. Por meio de ensaios com marcadores de fluorescência, foi possível demonstrar que as proteínas extraídas da cultura in vitro de C. procera interagem com a membrana de C. gloesporioides causando extravasamento do conteúdo citoplasmático, sugerindo que possivelmente seu mecanismo de ação contra fungos esteja relacionado à alteração na permeabilidade da membrana plasmática. Também foi observado estresse oxidativo em esporos de C. gloesporioides tratados com proteínas de calos e raízes de C. procera através da produção de peróxido de hidrogênio. Inibidores de proteases, quitinases, osmotinas e proteases foram detectados nas amostras de calos e raízes de C. procera, porém, osmotinas e proteases não foram observadas em calos e raízes de C. grandiflora. A atividade das enzimas antioxidantes APX, G-POD e catalase foram observadas nos tecidos cultivados in vitro de C. grandiflora. Considerando que proteases laticíferas de C. grandiflora foram demonstradas exercer ação contra fungos, os resultados observados nesta pesquisa sugerem que a ausência de atividade antifúngica em tecidos cultivados de C. grandiflora deve-se a ausência de proteases nestes tecidos e ainda excluem quitinases e inibidores de proteases presentes como proteínas antifúngicas. Em calos e raízes de C. procera, além de proteases, outras proteínas tais como, quitinases, inibidores de proteases e osmotinas detectadas podem estar envolvidas na atividade antifúngica observada, e/ou agir sinergicamente na defesa contra fungos. O estudo conclui que o uso de tecidos cultivados que não diferenciam laticíferos é um interessante modelo para estudar atividades associadas às proteínas encontradas no látex. Proteases antifúngicas presentes no látex de C. grandiflora não foram encontradas nos tecidos sem formação laticífera.
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Indução, isolamento e caracterização de linhagens de calos de feijão-de-corda (Vigna unguiculata). / Induction, isolation and caracterization of cowpea(Vigna unguiculata) callus lines.

Jereissati, Emmanuel de Sousa January 2008 (has links)
JEREISSATI, E. S. Indução, isolamento e caracterização de linhagens de calos de feijão-de-corda (Vigna unguiculata), 2008, 98 f. Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2008. / Submitted by Francisco Lacerda (lacerda@ufc.br) on 2015-01-15T18:45:03Z No. of bitstreams: 1 2008_dis_esjereissati.pdf: 1977738 bytes, checksum: 07766ffc1c0c530a367f7b10a522a973 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2015-01-15T20:12:51Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_dis_esjereissati.pdf: 1977738 bytes, checksum: 07766ffc1c0c530a367f7b10a522a973 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-01-15T20:12:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_dis_esjereissati.pdf: 1977738 bytes, checksum: 07766ffc1c0c530a367f7b10a522a973 (MD5) Previous issue date: 2008 / Somatic embryogenesis is the process by which somatic plant tissues gives rise to plant embryos under inductors conditions. Somatic embryogenesis represents the most commonly employed tool in commercial propagation of plants. In recent times, genes involved in the process have been identified, partucularly those involved in the maintenance of meristems and pattern formation. There are genes which, when ectopically expressed, can induce the formation of somatic embryos. In cowpea, there are few reports on somatic embryogenesis. In addition, the reports on the process recorded a very low frequency and a complicated system of regeneration involving several steps. This work attempted to isolate callus lines of cowpea and establish an ideal culture condition necessary for their maintenance. Histological analysis was conducted to characterize the isolated lines of callus anatomically. From the four lines obtained, 3 presented cells exhibiting the charactersitc embryogenic potential and of this, Line 2 actually gave rise to embryogenic structures when cultured in liquid media. The lines of callus were maintained in cultured condition for over a year without loss of their characteristics. Experiments that monitored the growth of cell suspension from the callus revealed that five days is the best period for subculture of the cells. Regeneration experiments in cowpea will find the different callus lines isolated in this work useful in the attempt to optimize the different strategies of regeneration of the crop in vitro. / Embriogênese Somática é o processo pelo qual, tecidos somáticos vegetais dão origem a embriões de plantas sob condições indutivas. A embriogênese somática é atualmente a ferramenta mais empregada para a propagação de plantas em escala comercial. Recentemente foram identificados alguns genes envolvidos no processo. Alguns desses genes estão envolvidos com a manutenção do meristema, outros estão envolvidos com a formação de padrão. Existem genes que quando expressos ectopicamente podem induzir a formação de embriões somáticos. Existem poucos trabalhos na literatura sobre a embriogênese somática em feijão-de-corda. Além disso, esses trabalhos apresentam uma freqüência de regeneração pequena e um complicado sistema de regeneração que envolve muitas etapas. O objetivo deste trabalho foi isolar linhagens de calos embriogênicos de feijão-de-corda e estabelecer as condições de cultivo ideais para estes calos. Análises histológicas foram utilizadas para a caracterização anatômica das linhagens de calos isolados. Das 4 linhagens de calos isolados três apresentam células com características de células embriogênicas, sendo que apenas a linhagem 2 deu origem a estruturas embriogênicas em suspensão celular. Essas linhagens de calos foram subcultivadas por mais de um ano sem perder as suas características. Os experimentos de crescimento das suspensões celulares mostraram que as suspensões devem ser subcultivados em períodos de 5 dias. Os próximos trabalhos que envolvam a regeneração em feijão-de-corda devem trabalhar com essa linhagem de calo facilmente isolável e altamente estável em cultura.
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Viroma de batata-doce no Brasil e limpeza clonal de cultivares ricas em beta-caroteno / Virome of sweet potato in Brazil and clonal cleaning of cultivars rich in beta-carotene

Souza, Caroline do Amaral 15 February 2018 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2018. / Submitted by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2018-07-09T17:27:04Z No. of bitstreams: 1 2018_CarolinedoAmaralSouza.pdf: 3676984 bytes, checksum: 2912b0f3aa5334b6570ce0ce5dee4d36 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2018-07-09T17:28:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2018_CarolinedoAmaralSouza.pdf: 3676984 bytes, checksum: 2912b0f3aa5334b6570ce0ce5dee4d36 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-09T17:28:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2018_CarolinedoAmaralSouza.pdf: 3676984 bytes, checksum: 2912b0f3aa5334b6570ce0ce5dee4d36 (MD5) Previous issue date: 2018-07-09 / No Brasil, o cultivo da batata-doce [Ipomoea batatas L. (Lam.)], abrange todas as regiões geográficas, sendo os maiores Estados produtores o Rio Grande do Sul, São Paulo, Sergipe, Minas Gerais e Santa Catarina. Diversas características da batata-doce, tais como: rusticidade, facilidade cultivo, baixo custo de produção e seu o papel como fonte de energia e nutrientes tornam esta espécie de elevada importância, sobretudo para a população de baixa renda. A batata-doce pode ser afetada por espécies dos quatro principais grupos de patógenos, sendo que os vírus merecem destaque devido ao número de espécies, os danos causados e a propagação vegetativa desta planta. A detecção de vírus em batata-doce tem sido realizada, tradicionalmente, por meio das técnicas de Polymerase Chain Reaction (PCR), Reverse Transcription PCR (RT-PCR) e Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA). Contudo, uma nova abordagem de detecção viral vem sendo empregada batata-doce desde 2009. Trata-se da metagenômica: uma abordagem baseada na investigação das moléculas de ácidos nucléicos de uma mistura de populações microbianas, extraídas diretamente de amostras ambientais e sequenciadas por Next Generation Sequencing (NGS). Uma vez que se tenha conhecimento das espécies virais que infectam a cultura é possível a aplicação de medidas adequadas de controle,incluindo programas de limpeza clonal (para regeneração de plantas livres de vírus). Com isso, visto a importância dos problemas fitossanitários causados por espécies virais na cultura batatadoce, os objetivos deste trabalho foram: (a) selecionar variedades de batata-doce ricas em betacaroteno, (b) identificar os vírus presentes em batata-doce, procedentes de cinco regiões do Brasil e (c) produzir material livre de vírus por meio de cultivo de meristemas. Para realização deste trabalho um total de 100 cultivares/clones da batata-doce foi obtido de Regiões Produtoras de Pernambuco (RPP), Rio Grande do Norte e Paraíba, além de acessos mantidos no Banco Ativo de Germoplasma da Universidade Federal Rural de Pernambuco – UFRPE (BAGUFRPE), do Instituto Agronômico de Pernambuco (IPA) e do BAG da Fazenda Água Limpa da Universidade de Brasília (FAL/UnB). Cem amostras de batata-doce foram enxertadas em plantas de Ipomoea setosa. Após 60 dias, realizou-se um enriquecimento de partículas virais dos 100 cultivares/clones de plantas de batata-doce, potencialmente transmitidos para I. setosa via enxertia. O mesmo procedimento foi realizado, diretamente, a partir das folhas de batatadoce, com o objetivo de comparar as espécies virais presentes nas diferentes plantas. Para tal estudo, quatro bibliotecas foram geradas sendo RNA e DNA de batata-doce e RNA e DNA de I. setosa. Um sequenciamento por NGS (em pool) foi conduzido, sendo possível detectar sequências de nove espécies virais que infectando a batata-doce: Sweet potato chlorotic stunt virus – SPCSV RNA1 e 2, Sweet potato feathery mottle virus – SPFMV, Sweet potato virus C – SPVC, Sweet potato virus G – SPVG e Sweet potato C-6 virus – SPC6V, Sweet potato leaf curl virus – SPLCV, Sweet potato mosaic virus – SPMV, Sweet potato golden vein associated virus – SPGVaV e Sweet potato symptomless virus 1 – SPSMV-1, sendo que este último ainda não havia sido detectado no Brasil. Os 100 cultivares/clones foram cultivados em campo com o objetivo de identificar usando High Performance Liquid Chromatography (HPLC), genótipos de batata-doce ricos em beta-caroteno. Quatro cultivares (‘Amélia’, ‘Beauregard’, ‘CR06’ e ‘Pérola’) apresentaram teores de beta-caroteno elevados. Estas plantas foram regeneradas por cultivo de meristemas e indexadas quanto à presença das espécies virais acima citadas, sendo possível regenerar pelo menos uma planta da cultivar ‘Amélia’ livre de vírus. Estes materiais serão usados futuramente em ensaios visando complementar os postulados de Koch para SPSMV-1. / In Brazil, the sweet potato [Ipomoea batatas L. (. Lam)] crop covers all geographic regions of the country. The States of Rio Grande do Sul, São Paulo, Sergipe, Minas Gerais, and Santa Catarina are the largest producers. Sweet potato is a very important crop due to several positive features such as rusticity, low production cost (due to low demand for agricultural inputs) as well functioning as source of food energy and nutrient supply especially for the low-income populations. Sweet potatoes can be affected by many pathogens, in special viruses. In fact, a high number of viral species have been reported infecting this crop. The problems associated with virus infection are intensified in sweet potato due to its vegetative propagation system. The virus detection in sweet potato has been carried out by Polymerase Chain Reaction (PCR), Reverse Transcription PCR (RT-PCR), and Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA). However, metagenomic, a new viral detection methodology has been also used for virus detection in sweet potatoes since 2009. This approach is based upon investigating the nucleic acid molecules from a mixture of microbial populations extracted directly from environmental samples and sequenced by Next Generation Sequencing (NGS). The knowledge about the viral species infecting sweet-potato in Brazil may allow the adoption of the appropriate control measures, including, the establishment of clonal cleaning programs via regeneration of plants free of viruses. In this context, the objectives of the present work are: (a) to select varieties of sweet potato rich in beta-carotene; (b) to assess the virus diversity in sweet potatoes in samples from five production regions of Brazil, and (c) to produce virus-free materials via meristem culture. For this work a total of 100 sweet potato accessions were obtained from Producing Regions of Pernambuco (RPP), Rio Grande do Norte, and Paraiba. In addition, a subset of clones from the germplasm bank of the Rural Federal University of Pernambuco – UFRPE, the Agronomic Institute of Pernambuco and from germplasm bank of the “Fazenda Água Limpa” of the University of Brasilia were also employed in the present work. One hundred sweet-potato samples were grafted on Ipomoea setosa. After 60 days, a viral particles enrichment strategy was performed via grafting of all clones onto I. setosa. A virus enrichment procedure was also performed directly from the sweet-potato leaves in order to compare the viral species that could be found in the different plant species. For this study, four RNA and DNA libraries of sweetpotato and I. setosa were produced. Nine viral species were detected infecting the sweet-potato samples: Sweet potato chlorotic stunt virus – SPCSV RNA1 and 2, Sweet potato feathery mottle virus – SPFMV, Sweet potato virus C - SPVC, Sweet potato virus G-SPVG and Sweet potato C-6 virus – SPC6V, Sweet potato leaf curl virus - SPLCV, Sweet potato mosaic virus – SPMV, Sweet potato golden vein virus – SPGVaV, and Sweet potato symptomless virus 1 – SPSMV1. This last virus species was detected in Brazil for the first time. A total of 100 sweet-potato accessions were grown under field conditions in order to identify (using High Performance Liquid Chromatography – HPLC) a subset of accessions with higher levels of beta-carotene. Three acessions with higher levels of beta-carotene (‘Amélia’, ‘Beauregard’, ‘CR06’, and ‘Pérola’) were regenerated via meristem culture and indexed for the presence of all nine virus species detected in previous assays. A single plant of cultivar ‘Amelia’ was identified as being free of all major viruses. These materials will be used in the future for fulfilling Koch´s postulates for SPSMV-1.

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