Cette thèse traite de l'analyse et de la reconnaissance de documents administratifs. L'arrivée continue des documents nous a conduit à choisir une méthodologie prenant en compte les expériences précédentes. Aussi, nous avons opté pour le raisonnement à partir de cas. A partir d'une structuration de base du document représentant ses éléments comme les adresses, les zones de montants et les tableaux, un modèle du document est construit sous forme d'un graphe. Il correspond au problème à résoudre. Ce problème est ensuite comparé à une base de cas de documents en utilisant le sondage de graphes. Si un cas de document similaire existe, alors il est adapté pour analyser et interpréter le cas courant. Sinon, une analyse structure par structure est effectuée en utilisant une base de cas de structures élémentaires de documents. L'arrivée continue des données impose un mode d'apprentissage incrémental, qui peut être fait au fur et à mesure du traitement. Nous avons donc proposé une amélioration d'un réseau de neurone incrémental existant appelé Incremental Growing Neural Gas. L'amélioration proposée consiste à prendre en compte uniquement le voisinage local du neurone le plus proche lors de la phase de création d'un nouveau neurone. Le réseau proposé a été testé avec succès aussi bien sur des documents (factures, formulaires) que sur des données synthétiques. Cette thèse étant effectuée en collaboration avec l'entreprise ITESOFT, nous avons testé toutes les étapes de notre approche sur des cas réels.

Ces dernières années, de nouvelles formes de couplage entre art et entreprise ont émergé et les travaux économiques et gestionnaires se sont multipliés sur ces questions. En particulier, un nombre croissant d'auteurs observe que la créativité des « industries culturelles » repose en réalité sur une nébuleuse de petites entreprises, dont les logiques de croissance mettent à l'épreuve les doctrines gestionnaires classiques. Pourtant, malgré des avancées, typologies et leviers d'action managériaux classiques semblent limités pour prendre en compte de nouvelles logiques entrepreneuriales en art. À ce titre, cette thèse vise à montrer qu'une forme singulière d'entrepreneuriat artistique, que nous appelons les entreprises à prestations artistiques (EPA), est restée jusqu'ici difficile à identifier et à gérer, notamment faute d'une compréhension précise des spécificités de l'activité artistique elle-même. Aussi, à partir d'une analyse de travaux académiques portant sur les rapports entre art et entreprise, ainsi que d'une recherche empirique approfondie au sein d'une entreprise opérant dans la création de « jardins artistiques », notre travail commence par exposer les spécificités des EPA, suggère de nouveaux types de crises à prévoir, ainsi que de nouveaux actes de gestion pour les surmonter. En révélant qu'une logique du « détail signifiant » en art implique de repenser les modèles classiques de management, cette étude nous conduit ensuite à mener un examen détaillé des processus de signification artistique. À cet effet, nous mobilisons les travaux du philosophe analytique, Nelson Goodman et nous introduisons la notion de densification pour caractériser finement la dynamique signifiante de l'activité artistique. Nous montrons alors que la gestion des processus de densification est au coeur d'un nouvel agenda incombant aux managers des EPA. Une proposition d'agenda « étendu » est alors testée sur quatre cas d'études complémentaires dans les secteurs du cinéma, de la scénographie, du théâtre et du graphisme. Tout en élargissant la portée de nos résultats, cet effort de généralisation nous permet finalement d'établir les fondements d'une théorie contingente du management des EPA.

L'approche basée sur les ressources (Resource Based View), longtemps critiquée au sujet de son caractère tautologique, son tri parmi les ressources et de sa difficile actionnabilité, se revigore désormais grâce à une série de travaux portant sur la gestion praxéologique des capacités organisationnelles. Cette thèse s'inscrit dans ce courant, par le biais d'une étude de cas. L'expérience est d'autant plus probante que l'entreprise étudiée a inventé, expérimenté et déployé un dispositif formalisé de pilotage du progrès et ce n'est qu'ensuite qu'il a été qualifié par nous chercheurs qui accompagnions et analysions l'expérience, comme dispositif de gestion des capacités. Cette étude de cas, sur une entreprise pionnière, nous permet de revenir à une discussion sur le concept même de capacité, ainsi mis à l'épreuve de l'actionnabilité. Elle nous permet d'explorer les propriétés structurantes de la capacité organisationnelle comme « objet de gouvernement », dans l'objectif de mieux cerner sa « gestion », et faire des hypothèses sur la nature de l'avantage concurrentiel qui peut en découler.

Ce travail de recherche était basé dans le laboratoire CRC des Mines ParisTech, financé par la FonCSI et avait pour terrain de recherche sanofi-aventis (la direction centrale HSE et les sites pharmaceutiques core solid français). Le but de ce travail était de comprendre et d'aider à mieux gérer les signaux faibles sur nos terrains de recherche, dans le domaine des risques d'accidents de travail et de maladies professionnelles. Cette thèse propose une vision holistique des signaux faibles en les observant tout au long de leur vie, au travers des différents groupes d'acteurs, de la hiérarchie et des outils. Les méthodes de travail sont basées sur la grounded theory, en extrayant du terrain le modèle que nous proposons et en travaillant à base d'études de cas. Nous avons donc extrait un modèle permettant de mieux définir les signaux faibles : le « modèle DPTP » : un signal faible est un signal pouvant annoncer un évènement majeur (accident majeur, accident du travail ou maladie professionnelle) et restant faible aux différentes étapes de sa vie (détection, pertinence, transmission, priorisation). Pour chacune des étapes de notre modèle nous avons cherché dans la littérature quelles étaient les connaissances nécessaires à l'avancement de notre travail. Ensuite, nous sommes retournés sur le terrain afin de mener différentes études de cas pour valider et préciser chacune de ces étapes. Au terme de ce travail, nous pouvons proposer le modèle DPTP comme un modèle permettant l'aide à la gestion des signaux faibles.

Se situant dans le champ de la stratégie, la thèse porte sur le concept de capacité, définie comme l'aptitude d'une firme à étendre la gamme de ses activités. La thèse soutient que la capacité, du fait de l'ambiguïté causale, est du domaine du non observable et doit être étudiée en tant que tel. A partir des activités de la firme (observables), les acteurs font des conjectures entremêlant discours et actions et cherchent à identifier par tâtonnements la capacité de la firme (non observable), qui anticipe sur le développement d'activités futures. Le chercheur, avec ses outils propres, développe un processus d'abduction analogue. La thèse étudie les cinq premières firmes américaines de défense (Boeing, General Dynamics, Lockheed Martin, Northrop Grumman, Raytheon) dans la période 1990-2007 au cours de laquelle ont eu lieu deux changements majeurs, une vague de concentration et l'apparition de systèmes de systèmes. Ces derniers ont donné lieu à une controverse touchant à la relation au client, objet du marketing industriel, la question étant de savoir si une capacité nouvelle devait être déployée. Des narrations structurées par des templates retracent les trajectoires stratégiques des firmes et sont complétées par une étude financière et comptable. Elle établit qu'il peut y avoir cohérence stratégique sans cohérence capacitaire ; qu'une firme peut se trouver dans une contradiction capacitaire ; qu'il est possible de contraster deux dynamiques, l'adaptation capacitaire et le développement d'une nouvelle capacité, dans la mesure où cette dernière perturbe les marchés existants et entraîne une redéfinition des relations de coopétition avec les clients, concurrents et fournisseurs.

Cette thèse, fruit d'une collaboration LORIA / INRA, porte sur l'étude du raisonnement à partir de cas pour aider à l'interprétation d'organisations spatiales agricoles. Les agronomes effectuent des enquêtes auprès d'exploitants agricoles, afin d'appréhender les relations entre structure spatiale et fonctionnement des exploitations. Des modèles graphiques, appelés chorèmes d'exploitations, permettent de synthétiser ces données d'enquêtes. Sur la base de ces chorèmes, nous avons modélisé l'organisation spatiale des exploitations par des graphes bipartites aux sommets et aux arc étiquetés par des concepts. A certains sous-graphes, décrivant des structures spatiales intéressantes, sont adjoints des explications, décrivant l'organisation fonctionnelle, pour constituer des cas. La modélisation conjointe a abouti à la reconception des chorèmes et à la constitution d'une base de cas et de hiérarchies de concepts du domaine. Le système de RàPC ROSA permet de proposer des explications de fonctionnement à un graphe d'organisation spatiale en utilisant les cas enregistrés. La comparaison des graphes s'appuie sur le mécanisme des logiques de description : étant donné un graphe d'exploitation cible, on lui associe des graphes sources de la base de cas au moyen d'opérations de généralisation et de spécialisation.

<p>Integrins are heterodimeric cell surface receptors, composed of an α and a β subunit, mainly binding for extracellular matrix proteins. lntegrin subunit β1 can combine with at least 12 a subunits and thus form the biggest subfamily within the integrin family. In this thesis, functional properties of the splice variant β1Β, and the effects of several mutations in the cytoplasmic tail of integrin subunit β1Α were studied. In addition, the border between the transmembrane and cytoplasmic domains of several integrin subunits was determined.</p><p>The β1Β splice variant has been reported to have a dominant negative effect on functions of β1Α integrins. In this study, it was studied if the expression of β1Β had similar negative effects on the αvβ3 integrin functions since the β3 subunit is structurally similar to β1Α. The β1Β subunit was expressed in an integrin β1-deficient cell line and it was found that the presence of β1Β does not interfere with adhesion or signaling of endogenous αvβ3</p><p>The border between the cytoplasmic domain and the C-terminal end of the transmembrane domain of integrin α and β subunits has been unclear. This question was experimentally addressed for integrin subunits β1, β2, α2 and α5. It was found that integrin subunits contain a positively charged lysine, which is embedded in the membrane in the absence of interacting proteins.</p><p>The functional importance of the lysine in integrin transmembrane domains was investigated by mutating this amino acid to leucine in β1Α. The mutation affected cell spreading and tyrosine phosphorylation of the adapter protein CAS. The activation of focal adhesion kinase and tyrosine phosphorylation of paxillin was not affected. Furthermore, the mutation of two tyrosines to phenylalanines in the β1Α cytoplasmic tail was found to reduce the capability of β1Α integrins to mediate cell spreading and migration. Activation of focal adhesion kinase in response to the later β1Α mutant was shown to be impaired as well as tyrosine phosphorylation of adapter proteins paxillin and tensin whereas overall tyrosine phosphorylation of CAS was unaffected. These data suggests the presence of focal adhesion kinase-dependent and -independent pathways for tyrosine phosphorylation of CAS after integrin β1Α-mediated adhesion. </p>

Integrins are heterodimeric cell surface receptors, composed of an α and a β subunit, mainly binding for extracellular matrix proteins. lntegrin subunit β1 can combine with at least 12 a subunits and thus form the biggest subfamily within the integrin family. In this thesis, functional properties of the splice variant β1Β, and the effects of several mutations in the cytoplasmic tail of integrin subunit β1Α were studied. In addition, the border between the transmembrane and cytoplasmic domains of several integrin subunits was determined. The β1Β splice variant has been reported to have a dominant negative effect on functions of β1Α integrins. In this study, it was studied if the expression of β1Β had similar negative effects on the αvβ3 integrin functions since the β3 subunit is structurally similar to β1Α. The β1Β subunit was expressed in an integrin β1-deficient cell line and it was found that the presence of β1Β does not interfere with adhesion or signaling of endogenous αvβ3 The border between the cytoplasmic domain and the C-terminal end of the transmembrane domain of integrin α and β subunits has been unclear. This question was experimentally addressed for integrin subunits β1, β2, α2 and α5. It was found that integrin subunits contain a positively charged lysine, which is embedded in the membrane in the absence of interacting proteins. The functional importance of the lysine in integrin transmembrane domains was investigated by mutating this amino acid to leucine in β1Α. The mutation affected cell spreading and tyrosine phosphorylation of the adapter protein CAS. The activation of focal adhesion kinase and tyrosine phosphorylation of paxillin was not affected. Furthermore, the mutation of two tyrosines to phenylalanines in the β1Α cytoplasmic tail was found to reduce the capability of β1Α integrins to mediate cell spreading and migration. Activation of focal adhesion kinase in response to the later β1Α mutant was shown to be impaired as well as tyrosine phosphorylation of adapter proteins paxillin and tensin whereas overall tyrosine phosphorylation of CAS was unaffected. These data suggests the presence of focal adhesion kinase-dependent and -independent pathways for tyrosine phosphorylation of CAS after integrin β1Α-mediated adhesion.

The enteropathogenic bacterium Yersinia pseudotuberculosis binds to β1 integrins on a host cell via its surface protein invasin. This event stimulates signal transduction to the actin cytoskeleton of the eukaryotic cell, which allows the cell to engulf the bacterium that is attached to its surface. However, the pathogen Y. pseudotuberculosis can evade such phagocytosis by injecting virulence effectors that interfere with the antipathogenic machinery of the host cells. One of these virulence effectors is the tyrosine phosphatase YopH. Through its enzymatic activity, YopH blocks phagocytosis by affecting the signalling that is associated with cytoskeletal rearrangements. Cas is a substrate of YopH in both professional and non-professional phagocytes. We showed that YopH binds to the central substrate domain of Cas and that this interaction is required for YopH to target focal adhesion structures in host cells. We also demonstrated that YopH binds another substrate, FAK, through Cas. Moreover, we suggested that targeting of Cas is necessary for the cytotoxic effects mediated by YopH. The protein Fyb is specific to immune cells, and it has been identified as a substrate of YopH in macrophages. We discovered that both the N-terminal substrate-binding domain and the C-terminal catalytic region of YopH bind Fyb in a phosphotyrosine-dependent manner. Moreover, we observed that both the substrate-binding domain and the phosphatase activity of YopH are essential for the effects of this protein on macrophages, which include dephosphorylation of Fyb, blocking of phagocytosis, and cytotoxicity. The role of Fyb in macrophages is largely unknown, although there is evidence that this protein is involved in integrin-linked actin organization. We identified a novel interaction partner of Fyb, mAbp1, which is a protein that binds to F-actin. Studies in vitro indicated that mAbp1 binds to the N terminus of Fyb via a C-terminal SH3 domain. We also found that both Fyb and mAbp1 co-localize with F-actin at the leading edges of macrophages. Further studies suggested that mAbp1 influences the spreading of macrophages and the antiphagocytosis mediated by pathogenic Yersinia. These results support a role for Fyb in signalling that affects F-actin dynamics, and they also provide additional insight into the mechanisms involved. Fyb has been shown to form a complex with SKAP-HOM, another substrate of YopH in macrophages. Our data implied that the level of SKAP-HOM protein depends on the presence of Fyb, but the function of the Fyb/SKAP-HOM complex in macrophages has not been determined. However, since Fyb is the only known haematopoietic-specific substrate of YopH, it is possible that Fyb is involved in other antimicrobial functions.

En France, le virus de l'hépatite E (VHE) est responsable de cas d'hépatites aigües sporadiques dont les origines et les modes de transmission sont incertains. Or, le VHE est le seul virus des hépatites à infecter d'autres espèces animales que l'homme. Les objectifs de cette thèse ont été d'évaluer le risque de transmission zoonotique du VHE porcin pour l'Homme. Une première étude d'épidémiologie moléculaire a montré une circulation active du VHE entre les populations porcines et humaines, préférablement par voie alimentaire. Une deuxième étude par séquençage haut-débit a montré l'adaptation totale du génome consensus et de la quasiespèce du VHE lors de la transmission inter-espèce. Une troisième étude de trois nouveaux génomes complets porcins comparé aux génomes VHE humains déjà disponibles n'a pas révélé de déterminants majeurs de restriction d'hôte au sein du génotype 3. Par contre cette étude a mis en avant le besoin de revoir la classification en sous-types du VHE au vu des nouvelles séquences disponibles. Enfin, un système de génétique inverse a été mis en place afin de permettre l'étude phénotypique de nouvelles souches humaines et porcines du VHE dans des lignées hépatocytaires. Ces travaux ont permis de montrer le risque zoonotique du VHE du porc consommé en France et son adaptation génomique complète à ses deux espèces hôtes. Le VHE est un virus zoonotique à ARN particulier dont la variabilité génétique dépend de son épidémiologie singulière, qui inclue la possibilité de transmissions alimentaires à partir d'un réservoir animal domestique. Ce travail permet enfin de poser les perspectives d'études phénotypiques du VHE