Made available in DSpace on 2016-08-29T15:32:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_2767_DissertaMestradoAlessandroBottiBenevides.pdf: 7146975 bytes, checksum: 81fe25bbfd7bf3f292a9b4e982bb60a5 (MD5) Previous issue date: 2009-03-13 / Nessa pesquisa, estudamos a anatomia cerebral para o entendimento dos padrões de sincronização/dessincronização relacionada a eventos que ocorrem no córtex motor primário durante a realização de tarefas mentais. Nesse intuito, foram estudados os padrões oscilatórios dos circuitos neuronais do sistema tálamo-cortical e o circuito da alça motora. Então, sugerimos um modelo baseado em dipolos elétricos para modelar as fontes cerebrais, e calculamos atenuação do campo elétrico. A partir do modelo, formamos um sistema de equações lineares para separar os sinais de EEG linearmente misturados no encéfalo. Esse método foi testado em classificadores baseados em regras, classificadores estatísticos (Análise por Discriminante Quadrático, Análise por Discriminante Linear e Análise por Discriminante Regularizado) e redes neurais artificiais durante a classificação de 3 tarefas mentais, relacionadas à imaginação de movimento das mãos direita/esquerda e a geração de palavras começando com uma mesma letra qualquer.

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:33:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_4083_.pdf: 853634 bytes, checksum: 128833f0f7dbbf4105fe8e92f379f1ab (MD5) Previous issue date: 2012-01-30 / Mineração de dados é uma área chave para diversos campos da ciência e engenharia. Neste contexto, um método de aprendizado estatístico, conhecido como máquinas de vetores suporte tem se apresentado como um método promissor para solucionar classificação de dados. Geralmente, o problema de máquinas de vetores suporte (inglês: Support Vector Machines - SVM) é formulado como um problema de otimização não-linear sujeito a restrições. Técnicas de otimização convencionais que utilizam a abordagem Lagrangiana são usadas para solucionar este tipo de problema. No caso de classificação de dados ruidosos as técnicas convencionais apresentam deterioração de desempenho, já que o problema de otimização resultante é multidimensional e pode apresentar muitos mínimos locais. Neste trabalho, é proposto o algoritmo Evolução Diferencial combinado com uma técnica de busca local, uma hibridização de busca tabu com o método Nelder-Mead, para encontrar os parâmetros ótimos dos classificadores SVM aplicados a dados ruidosos.

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:33:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8868_HENRIQUE-DISSERTAÇÃO-FINAL20150710-134005.pdf: 857469 bytes, checksum: 4f5d70e5670ed471fc2f22a88ae1201e (MD5) Previous issue date: 2015-04-14 / Desde seu surgimento as redes sociais virtuais como Twitter têm alcançado exorbitante quantidade de usuários em todo o mundo, tornando-se um ambiente de imensurável potencial para pesquisas sociais, econômicas, culturais e etc. Cada vez mais pesquisadores têm voltado sua atenção para a grande massa de dados gerada diariamente nesse meio. Entretanto, lidar com grandes quantidades de dados é uma tarefa custosa quando realizada manualmente. O objetivo desta pesquisa é propor um conjunto de ferramentas e metodologia tal que possa diminuir o esforço humano gasto na organização de grandes massas de dados provenientes de redes sociais. Para atingir tal objetivo é proposto um modelo de trabalho iterativo, que explora ao máximo o conhecimento existente em uma pequena porção de dados manualmente analisada por especialistas. O modelo de trabalho combina técnicas de recuperação de informação como algoritmos de classificação e agrupamento com objetivo de tornar o resultado do processo mais parecido ao que o especialista obteria caso o realiza-se completamente manualmente. O modelo proposto foi colocado a prova com uso de dois conjuntos de dados extraídos do Twitter e manualmente classificado muito antes da realização desta pesquisa. Os resultados mostraram-se promissores.

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:33:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_6773_Andrea Barbieri.pdf: 20570043 bytes, checksum: 769ed01364e25e152117b9ad71402484 (MD5) Previous issue date: 2013-08-29 / Haltichellini tem distribuição mundial e é composto por 29 gêneros e 376 espécies. a maioria de seus gêneros apresneta problemas básicos de definição e delimitação, o que tem gerado instabilidade na classificação de suas espécies e dificuldades de identificação. Neste estudo é apresentado pela primeira vez uma análise cladística da tribo e baseada em uma amostra representativa da fauna mundial, que buscou avaliar os gêneros e propor uma classificação genérica de acordo com as relações cladísticas entre suas espécies. Foi avaliada a monofilia de 24 dos 29 gêneros válidos, com base em 97 caracteres morfológicos, sendo 54 inéditos. Os resultados obtidos indicam que: Belaspidia é monofilético e externo à Haltichellini; dos 14 gêneros estudados com mais de uma espécie, sete foram indicados como monofiléticos (Aphasganophora, Aspirrhina, Euchalcis, Neochalcis, Tainaniella, Tanycoryphus e Uga); Allochalcis foi indicado como parafilético; e 6 foram indicados como polifiléticos (Antrocephalus, Haltichella, Hockeria, Kriechbaumerella, Oxycoryphe e Rhynchochalcis). Com base nessas relações, foi constatada a necessidade dos seguintes ajustes nomenclaturais: proposição de um gênero novo; proposição de dez sinonímias genéricas; duas revisões de status genérico; 41combinações novas; e revalidação de outras 5. Vinte e um gêneros são redefinidos. São apresentadas descrição e chave de identificação para os gêneros estudados, e ilustrações para os caracteres analisados.

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:36:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8653_Resumo da Dissertação - Bárbara Zani Agnoletti.pdf: 5780 bytes, checksum: fd3b0c08ae38d2eb23657deba764a9f6 (MD5) Previous issue date: 2015-08-07 / As espécies de café de maior importância econômica cultivadas no Brasil são Coffea arabica e Coffea canephora. O café cru de ambas as espécies é comercializado e valorizado de acordo com a qualidade dos grãos. A qualidade do produto final depende de vários fatores, tais como: a espécie, a forma de realização da colheita, o beneficiamento do grão, o armazenamento, a torrefação e a moagem. Para determinar a qualidade da bebida do café é realizada a análise sensorial, onde indivíduos treinados provam o café e lhe atribuem uma nota ou classificação. Poucos trabalhos relacionando as propriedades físico-químicas e a qualidade da bebida de café são encontrados na literatura. Neste contexto, o objetivo do presente estudo foi analisar as propriedades físico-químicas de café arábica e conilon, relacionando-as com a qualidade da bebida; verificar as diferenças entre as espécies; além da influência da torra sobre essas propriedades. As propriedades físico-químicas determinadas foram: umidade, perda de massa, cor do café torrado, pH, acidez total titulável, açúcares totais (redutores e não redutores), sólidos solúveis, teor de compostos fenólicos totais, condutividade elétrica, lixiviação de potássio, cafeína, trigonelina e ácido clorogênico. Não foram verificadas diferenças quanto às propriedades físico-químicas, entre os tratamentos (classificações) de cada espécie (arábica e conilon), tanto para as amostras de grãos crus como de grãos torrados, para as variáveis teor de sólidos solúveis, condutividade elétrica, lixiviação de potássio e ácido clorogênico. Foram verificadas diferenças quanto às propriedades físico químicas entre os tratamentos para as variáveis pH, acidez total titulável e açúcares. O teor de compostos fenólicos totais, trigonelina e cafeína, foram as propriedades físico-químicas que melhor discriminaram as duas espécies de café. As propriedades físico-químicas do café são dependentes da torra. Observou-se a diminuição do teor de sólidos solúveis, pH, açúcares, compostos fenólicos totais, ácido clorogênico e trigonelina, após a torra, enquanto que, a acidez titulável total aumentou e a cafeína se manteve estável. Através do teste de correlação de Pearson foram observadas correlações significativas entre as propriedades físico-químicas analisadas com a nota sensorial. Correlações positivas foram verificadas para a umidade e acidez do café torrado, ao passo que, correlações negativas foram verificadas para sólidos solúveis e pH do café torrado, condutividade elétrica e lixiviação de potássio, no café cru.

Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação. Departamento de Ciência da Computação, Instituto de Ciências Exatas e Biológicas, Universidade Federal de Ouro Preto. / Submitted by giuliana silveira (giulianagphoto@gmail.com) on 2016-04-26T19:09:32Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_HcaimMétodoDiscretização.pdf: 1165161 bytes, checksum: c41e0ba430aa7de59107de0fadd0e570 (MD5) / Approved for entry into archive by Maurílio Figueiredo (maurilioafigueiredo@yahoo.com.br) on 2016-04-28T12:21:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertacao_HcaimMétodoDiscretização.pdf: 1165161 bytes, checksum: c41e0ba430aa7de59107de0fadd0e570 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-28T14:06:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_HcaimMétodoDiscretização.pdf: 1165161 bytes, checksum: c41e0ba430aa7de59107de0fadd0e570 (MD5) Previous issue date: 2016 / A discretização de dados, como uma etapa da fase de pré-processamento, tem sido alvo de pesquisas em diversos trabalhos no contexto de classificação plana. Apesar da importância dos métodos de discretização para a tarefa de classificação, até onde se tem conhecimento, para problemas de classificação hierárquica, não existem na literatura propostas de métodos de discretização supervisionados que possam ser utilizados em conjunto com classificadores hierárquicos globais. Desse modo, neste trabalho é proposto um método de discretização supervisionado para o contexto de classificação hierárquica. Este método, denominado HCAIM (Hierarchical CAIM), corresponde a uma adaptação do método de discretização CAIM proposto para o contexto de classificação plana. A avaliação do método proposto foi realizada utilizando-se o método de classificação hierárquica Global Model Naive Bayes – GMNB. Os experimentos computacionais realizados com 8 bases de dados de bioinformática mostraram que o método HCAIM, para a maioria das bases, permitiu ao GMNB alcançar desempenho preditivo superior àqueles alcançados quando a base de dados foi pré-processada pelos métodos não supervisionados EqualWidth e EqualFrequency. ____________________________________________________________________________________________________________________ / ABSTRACT : The discretization of data such as a stage of pre-processing stage has been the subject of research in various studies in the context of flat classification. Despite the importance of discretization methods for the classification task, as far as is known, for hierarchical classification problems, there are proposals in the literature of supervised discretization methods that can be used in conjunction with global hierarchical classifiers. Thus, in this paper we propose a discretization method for supervised hierarchical classification context. This method, called HCAIM (Hierarchical CAIM), corresponding to an adaptation of CAIM discretization method proposed for the flat classification context. The evaluation of the proposed method was performed using the hierarchical classification method Global Model Naive Bayes - GMNB. Computational experiments with 8 bioinformatics databases showed that HCAIM method for most bases allowed GMNB achieve superior predictive performance to those obtained when the database is preprocessed by the methods Unsupervised EqualWidth and EqualFrequency.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2015 / Made available in DSpace on 2016-02-09T03:15:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 337161.pdf: 1491998 bytes, checksum: 63fd33c3720b988200a0202995d42f61 (MD5) Previous issue date: 2015 / Os fungos entomopatógenos (Hypocreales, Ascomycota), conhecidos de modo geral como Cordyceps s.l., utilizam diferentes espécies de artrópodes como hospedeiros, onde desenvolvem parte do seu ciclo de vida. São responsáveis pelo equilíbrio de populações de insetos, contaminam os insetos hospedeiros e utilizam seus corpos como substrato para a produção de estruturas reprodutivas sexuais e ou assexuais. Os estudos sobre Cordyceps s.l. no Brasil são antigos ou escassos para uma diversidade potencialmente grande. Com o objetivo de contribuir para o conhecimento desses fungos no Brasil e na região Neotropical, foram estudados aspectos sobre ecologia, morfologia e molecular de Cordyceps s.l. com foco em um táxon em especial, pertencente ao gênero Ophiocordyceps. Ophiocordyceps nutans (Pat.) G.H. Sung, J.M. Sung, Hywel-Jones & Spatafora é morfologicamente caracterizado por apresentar estipe filiforme, preto, com a região fértil bem delimitada, intumescida, vermelha. Foi descrita a partir de espécimes do Japão e é comumente encontrado na Coréia em meio à serapilheira, parasitando obrigatoriamente insetos da ordem Hemiptera. No Brasil espécimes morfologicamente relacionados vêm sendo coletados, parasitando a mesma ordem de insetos, e sendo assim previamente determinados como o táxon asiático, O. nutans. A fim de confirmar se o táxon que ocorre no Brasil representa a mesma espécie coletada no Japão foram coletados mais de 100 espécimes com morfologia semelhante a O. nutans. Foram realizadas análises morfológicas e moleculares, bem como a obtenção de culturas, os dados ecológicos também foram considerados neste estudo. No capítulo 1, são apresentadas evidências de que o táxon corresponda a um complexo de espécies crípticas, composto por duas linhagens Asiáticas e uma linhagem Neotropical. No capítulo 2, com base na filogenia gerada a partir de sequências ITS de DNA ribossomal, provenientes de espécimes Asiáticos e Brasileiros, foram observadas as três linhagens mencionadas, sendo, por tanto, proposta a espécie nova, Ophiocordyceps neonutans sp. nov. ad int. No capítulo 3 é apresentada uma possível nova espécie de Ophiocordyceps, que parasita insetos da ordem Hemiptera, no entanto da subordem Homoptera. Os peritécios ovoides e os esporos fusoides são as principais características diagnósticas desta espécie. Por fim, considerando o apresentado, os registros de O. nutans para o resto do mundo precisam ser revisados. Além disso, novas coletas e análises moleculares (multiloci) deste complexo se fazem necessárias, principalmente considerando as evidências ecológicas (hospedeiro e distribuição geográfica) para o entendimento das linhagens como espécies a serem descritas.<br> / Abstract : The entomopathogenic fungi (Hypocreales, Ascomycota), broadly known as Cordyceps s.l, use different arthropod species as hosts, where they develop part of their life cycle. Responsible for the balance of insect populations, they infect specific hosts contaminating their bodies using it as a substrate for production of sexual or asexual reproductive structures. Under the research project MICOLAB / UFSC which aims to contribute to the knowledge of these fungi in Brazil and in the Neotropics were studied aspects of ecology, morphology and molecular in Cordyceps s.l. focusing on a taxon in particular belonging to Ophiocordyceps genre. Ophiocordyceps nutans (Pat.) G.H. Sung, J.M. Sung, Hywel-Jones & Spatafora 2007 is morphologically characterized by having threadlike stipe, black, with a fertile region well delimited swollen, red. It was described from Japan specimens and is commonly found in Korea amid the leaf litter, necessarily parasite insects of the order Hemiptera. In Brazil morphologically related specimens have been collected, parasitizing the same order of insects, so they were predetermined as the Asian taxon, O. nutans. In order to confirm if the taxon that occurs in Brazil is the same species collected in Japan, were collected in Brazilian field expeditions more than 100 specimens with similar morphology to O. nutans. Morphological and molecular analyzes were performed, as well as obtaining cultures, ecological data were also considered in this study. In Chapter 1, evidence were presented that the taxon corresponds to a complex of cryptic species, composed of 2 Asian lineages and one geographically distinct Neotropical lineage of Ophiocordyceps nutans. In chapter 2, based on the phylogeny generated from ribosomal DNA ITS sequences, from Asian and Brazilian specimens. Three distinct lineages were observed, and was proposed a new species. Ophiocordyceps neonutans sp. nov. Ad int. parasitizing Pentatomidae (Hemiptera) in Brazilian territory. Chapter 3 presents a possible new species of Ophiocordyceps that parasitizes insects of the Hemiptera order, however in the suborder Homoptera. Perithecia ovoid and fusiform spores are the main diagnostic features of this species. Finally, considering the presented, O. nutans records for the rest of the world need to be reviewed. In addition, new collections and molecular analyzes (multiloci) of this complex are necessary, especially considering the ecological evidence (Host and geographical distribution) to understand the lineages as species to be described.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2016-04-19T04:12:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 337932.pdf: 2390116 bytes, checksum: 30038e57b21fee52eab77f33b1446cb0 (MD5) Previous issue date: 2015 / Ophiocordyceps representa o maior e mais variado táxon de Ophiocordycipitaceae, tanto morfologico quanto ecologicamente. Ophiocordyceps dipterigena foi descrito por Berkeley e Broome (Cordyceps dipterigena), em 1875, a partir de um material coletado em uma mosca adulta no Sri Lanka (Ceilão). Atualmente o táxon, apresentando distribuição pantropical, é caráterizado morfologicamente pelos estromas filiformes, capitados, marrom alaranjados a amarelados, região fértil terminal, hemisférica e bem definida. Apresenta uma ampla variedade de hospedeiros (moscas adultas) e atualmente possui seis sinônimos heterotípicos. Apesar das evidências de um complexo taxonômico, nenhum estudo mais aprofundado (morfológico e molecular) foi realizado com este táxon até o momento. Este trabalho apresenta aspectos taxonômicos, ecológicos e filogenéticos sobre O. dipterigena, a partir de análises morfológicas (macro, micro e ultraestruturais) e de biologia molecular. Ao todo, foram revisados 84 materiais parasitas de moscas adultas de espécimes morfologicamente e ecologicamente próxima de O. dipterigena. Uma filogenia (ITS) do complexo O. dipterigena é apresentada, assim como uma discussão geral sobre diferentes possíveis novos táxons existentes. Novos caráteres relevantes para a interpretação de hipóteses de espécies são apresentados. O nome Cordyceps muscicola é resgatado da sinonímia de O. dipterigena sendo caráterizada por parasitar moscas grandes, geralmente aderidas na superfície abaxial, mas sempre com micélio recobrindo todo hospedeiro, até o momento ocorrente na Floresta Ombrófila Densa do território Catarinense. Além da lectotipificação do desenho do protólogo de C. muscicola e da epitipificação de um espécime da localidade do tipo (Blumenau) a espécie é combinada em Ophiocordyceps, O. muscicola. Outras três espécies (Ophiocordyceps sp. 1, sp. 2 e sp. 3), que se diferenciam no complexo O. dipterigena, são apresentadas, são caráterizadas pela combinação de caráteres morfológicos e ecológicos. Outras possíveis espécies novas são discutidas. Este trabalho demonstra uma grande diversidade no complexo O. dipterigena e prevê o elevado potencial de revelar uma diversidade maior ainda com pesquisas futuras.<br> / Abstract : Ophiocordyceps is the largest and most varied taxon of Ophiocordycipitaceae, both morphologically and ecologically. Ophiocordyceps dipterigena was described by Berkeley and Broome (as Cordyceps dipterigena) in 1875 from material collected on an adult fly in Sri Lanka (Ceylon). Currently, the taxon presents pantropical distribution and is morphologically characterized by having filiform, capitate, orange-brown to yellowish stromata and a terminal, hemispheric, well defined fertile region. Ophiocordyceps dipterigena occurs on a wide variety of hosts (adult flies) and currently has six heterotypic synonyms. Despite the evidence of a possible taxonomic complex, no detailed investigation into the possibility of cryptic species has yet been conducted. This work offers the first comprehensive taxonomic, ecological and phylogenetic treatment of the O. dipterigena complex, supported by morphological and molecular analyses. In all, eighty-five collections morphologically and ecologically related to O. dipterigena were examined. A phylogeny (ITS) of the O. dipterigena complex is presented, as well as a general discussion on potentially new taxa in the complex. New characters relevant to the interpretation of species hypotheses are presented. The name Cordyceps muscicola is recovered from synonymy with O. dipterigena, characterized by a thoroughly myceliated host which often adheres to the abaxial surface of leaves, until the moment occurring in the Ombrophilous Dense Forest territory of Santa Catarina. In addition to the lectotypification of the protologue drawing of C. muscicola and epityfication of a specimen from the type locality (Atlantic rainforest of Blumenau), the species is recombined in Ophiocordyceps as O. muscicola. Three additional species are described (Ophiocordyceps sp. 1, sp. 2 and sp. 3) which differ in the O. dipterigena complex on the basis of morphological and ecological characters. Other possible new species are discussed. This work demonstrates both a greater diversity within O. dipterigena complex than previously considered, and forecasts the high potential for revealing greater diversity with further research.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Filosofia e Ciências Humanas. Programa de Pós-Graduação em Filosofia. / Made available in DSpace on 2012-10-26T11:15:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 310440.pdf: 3442278 bytes, checksum: ee966030d04ec43a7351f510d2d70e4a (MD5) / Este trabalho pretende responder à pergunta: como é possível que os nomes dos táxons biológicos sejam usados para se referir às entidades a que se referem? Para tanto, começamos, no capítulo 1, pela análise do conceito de linhagem biológica, argumentando que ele deve ser primordialmente entendido no sentido monofilético, isto é, o de que uma linhagem é um grupo formado por um ancestral e todos seus descendentes. Apresentamos então a ideia de que os táxons são, contemporaneamente, concebidos como linhagens e, portanto, seu estatuto ontológico não é o de classes naturais, mas sim o de entidades históricas individuais. Essa tese foi famosamente defendida por Ghiselin e Hull, mas o mais importante para os propósitos deste trabalho é o lugar central que ela ocupa na teoria da sistemática filogenética proposta por Willi Hennig. Comentamos alguns dos aspectos da ontologia que embasa a teoria de Hennig, e, no final do capítulo, levantamos algumas consequências da tese da individualidade. Uma dessas consequências, a ideia de que os nomes dos táxons são próprios, é apresentada por Ghiselin e Hull em associação com a teoria causal da referência, na tentativa de argumentar que os táxons não têm propriedades definitórias (essências). Desse modo, no capítulo 2, analisamos as duas principiais teorias da referência para nomes próprios - descritivista e causal-histórica - e o modo como elas são defendidas por diferentes autores. De acordo com a visão descritivista, a relação entre um nome próprio e seu portador é mediada por um componente epistemológico, em geral entendido como um conjunto de representações (de natureza linguística ou não) do portador. Para a teoria causal-histórica, por outro lado, um nome próprio se refere a seu portador em todos mundos possíveis, ou seja, independentemente do conhecimento que tenhamos das propriedades ou feitos do portador. Há, no entanto, um problema para uma defesa da teoria causal no caso dos nomes dos táxons biológicos. Trata-se do conhecido "problema qua": se não houver a mediação de um critério de identidade para o objeto nomeado, o referente do nome não pode ser identificado de modo inequívoco. Assim, no capítulo 3, defenderemos uma teoria da referência híbrida para os nomes de táxons, segundo a qual há dois elementos que compõem os sentidos desses nomes: critérios de aplicação e critérios de identidade. No sistema nomenclatural lineano, atualmente aceito, os critérios de aplicação são associados aos nomes por efeito dos códigos de nomenclatura. Os critérios de identidade, por outro lado, são contribuídos pelo contexto teórico circundante. Comparamos esse sistema com o PhyloCode, uma proposta recente de sistema nomenclatural na qual os nomes dos táxons seriam definidos filogeneticamente, isto é, em função de sua posição relativa na árvore da vida. Argumentaremos que a rejeição do PhyloCode por parte da comunidade de biólogos se deve ao fato de que esse código transforma critérios de identidade em critérios de aplicação, o que é heuristicamente indesejável para a sistemática filogenética. Entretanto, isso não implica que a ideia de que é possível estabelecer critérios de identidade deva ser rejeitada. Pensamos que a visão mínima de que é possível fornecer critérios de identidade para táxons pode ser apropriadamente chamada de essencialismo sobre táxons biológicos, e nossa defesa dela constitui uma segunda linha de argumentação do capítulo 3. O ponto é que se costuma entender a tese da individualidade das espécies como tendo refutado definitivamente o essencialismo. Entretanto, argumentaremos que essencialismo e antiessencialismo são posições sobre critérios de identidade, e não sobre o estatuto ontológico, das entidades. A tese da individualidade, pensamos, é insuficiente para a refutação do essencialismo. Para tanto, seria necessário defender que é impossível estabelecer critérios de identidade para os táxons. Terminamos com algumas respostas a essa objeção. / The object of this work is to answer the question: how is it possible that the names of biological taxa refer to the entities that they do refer to? In order to address the question, we begin the first chapter by analyzing the concept of biological lineage, arguing that it should be understood in a monophyletic sense, that is, a lineage is a group constituted by an ancestor and all of its descendants.We then present the idea that taxa are contemporarily construed as lineages; therefore, their ontological status is that of individual historical entities, and not of natural kinds. This thesis was famously defended by Ghiselin and Hull, but, for our present purposes, its meaningfullness lies in the fact that it plays a prominent role in Willi Hennig's theory of phylogenetic systematics. We present some of the aspects of Hennig's ontology and then, towards the end of the chapter, address some consequences of the individuality thesis. One of these consequences, namely, the idea that the names of biological taxa are proper, is presented by Ghiselin and Hull in association with the causal theory of reference, in an attempt to argue that taxa have no defining properties (i.e., essences). In chapter 2, we present the two main philosophical theories of reference for proper names - the descriptivist and causal-historical theories. According to the descriptivist view, the relation of reference is mediated by an epistemological component, generally understood to be a set of representations of the name-bearer. For the causal-historical theory, on the other hand, a proper name refers to its bearer in all possibile worlds, independently of any knowledge we may have about the properties or doings of the bearer. The causal theory, when held for proper names of taxa, faces a well-known difficulty, the so-called qua-problem: if reference is a direct relation, unmediated by at least a criterion of identity for the namebearer, it cannot be inequivocally identified. Thus, in chapter 3, we attempt to provide a hybrid theory of reference that is designed to address the qua-problem. According to this theory, taxon names have Fregean senses composed of two elements: a criterion of application and a criterion of identity. Criteria of application are provided by the nomenclatural codes when at reference-fixing events.Criteria of identity are contributed by the surrounding theoretical context. From the viewpoint of the theory thus provided, we compare current nomenclatural codes with the PhyloCode. We argue one of the main reasons for the lack of acceptance towards the PhyloCode may be the fact that it converts identity criteria into criteria of application. This conversion is undesirable for the heuristics of phylogenetic systematics. Nonetheless, one should not conclude that it is impossible to establish identity criteria for biological taxa. We construe essentialism as a position concerning identity criteria, not ontological status. That consitutes a second line of argument taken up in chapter 3. The point is that the adoption of the individuality thesis does not automatically refute essentialism. In order to do so, one must defend that criteria of identity for biological taxa are unavailable.We conclude by addressing that possibility, in the version presented by Ereshefsky.We defend that the objection is untenable on the grounds that (1) it rests on an unreasonable demand for identity criteria and (2) it brings the qua-problem back.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2013-12-06T00:08:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 319753.pdf: 1321186 bytes, checksum: 340974d0e6666e16b102c1f24db09682 (MD5) Previous issue date: 2013 / Políporos é um dos principais grupos de fungos decompositores de madeira, contudo, o conhecimento sobre sua diversidade ainda é escasso. Em Santa Catarina, a sinopse sobre a diversidade dos macromicetos apresenta 247 espécies de fungos, destas, 143 são poliporoides, principalmente da região insular. Para a continuidade e o avanço do conhecimento sobre a diversidade de fungos poliporoides que ocorrem na Mata Atlântica de Santa Catarina, foram estudados aspectos sobre a ecologia de comunidades fúngicas, particularmente de uma área pouco explorada, bem como um complexo taxonômico que ocorre na região. Primeiramente foi avaliada e caracterizada a comunidade de políporos em uma área de Floresta Ombrófila Densa do Parque Nacional da Serra do Itajaí, em termos de riqueza, abundância e funcionalidade. Entre os 152 espécimes coletados 58 espécies foram identificadas. Polyporus dictyopus, Perenniporia martia e Fuscoporia walhbergii foram as espécies dominantes. Com base nas frequências relativas nos diferentes tipos e substratos foram encontrados cinco grupos funcionais, dos quais dois formados por Phylloporia spathulata (em raízes vivas no solo) e Phylloporia chrysita (em lianas vivas) e os outros três constituídos por espécies saprofíticas, sendo cada grupo caracterizado pela presença de uma das espécies dominantes citadas. Finalmente, Phellinus piptadeniae é apresentada como um complexo taxonômico, em processo de especiação, a partir de evidências ecológicas (hospedeiro e distribuição geográfica) e filogenéticas. <br> / Abstract : Polypores is one of the most important groups of wood-decay fungi; however, its diversity knowledge is still scarce. In Santa Catarina state, a synopsis of macrofungi diversity presented 247 species, of which 143 are polypores, mainly from insular region. In order to continue and improve the knowledge about the diversity of polypores, wich are occurring in the Atlantic Forest of Santa Catarina, ecological aspects of fungal communities were studied, in an unexplored area, as well as a complex taxonomy that occurs in the region. Firstly, was described the community of wood-decaying polypores in the Atlantic Rain Forest of Parque Nacional da Serra do Itajai, characterizing the community in terms of richness, abundance and functionality. Among 152 specimens collected 58 species were identified. Polyporus dictyopus, Perenniporia martia and Fuscoporia walhbergii were the dominant species. Based on the relative frequency in the different types of substrates where five functional groups were recognized. Two of them were formed by Phylloporia spathulata (on live roots in the ground) and Phylloporia chrysita (on live trunks); and three other functional groups, consisting of saprophytic species, each of them was characterized by the presence of one of the dominant species. Finally, Phellinus piptadeniae is presented as a taxonomic complex, in a speciation process, evidenced by the existence of two phylogenetic and ecological (host and geographic distribution) lineages.