A Mucopolissacaridose tipo VI é uma doença genética rara caracterizada pela deficiência da atividade da enzima n-acetilgalactosamina-4-sulfatase ocasionando um acúmulo dos glicosaminoglicanos sulfato e dermatan e de condroitin em diversos órgãos e tecidos. O diagnóstico é feito a partir da excreção aumentada de sulfato de dermatan na urina e da demonstração da atividade reduzida da enzima citada. Há basicamente duas formas clínicas, mais grave e menos grave, mas não há um consenso na literatura em como classificar as formas clínicas, o que seria útil para definições sobre o manejo do paciente, assim como para monitorização de tratamento. O objetivo deste trabalho é identificar fatores associados à gravidade da Mucopolissacaridose tipo VI e, secundariamente, caracterizar o envolvimento do sistema nervoso central e alterações radiológicas em mãos e coluna lombar desses indivíduos. Foram incluídos 25 pacientes com diagnóstico confirmado de Mucopolissacaridose tipo VI que realizaram avaliação clínica, física, testagem de quoficiente de inteligência, ressonância magnética de cérebro, RX de mãos e coluna lombar e dosagem de glicosaminoglicanos urinários. Foram estudadas as seguintes variáveis: idade, idade de início dos sintomas, idade de diagnóstico bioquímico, consangüinidade, primeiros sintomas, peso e déficit de peso, altura e déficit de altura, QI total, potencial cognitivo, presença de atrofia cerebral, presença de megacisterna magna, presença de espaços perivasculares dilatados, hidrocefalia, lesão de substância branca, volume cerebral, volume ventricular, volume de líquor, tamanho de metacarpos, tamanho de vértebras lombares, alterações em vértebras lombares, giba lombar, ângulo radio-ulnar e dosagem de glicosaminoglicanos urinários. Os 25 pacientes eram oriundos de 20 famílias, das quais 4 (20%) eram consangüíneas. No momento da avaliação, a média de idade foi de 10,6 ± 4,5 anos, com mediana de idade de início de sintomas de 0,5 anos sendo que o primeiro sintoma mais citado foi giba lombar. A média de idade ao diagnóstico foi de 4,8 ± 3 anos. Os pacientes apresentaram uma média de déficit de peso de39,5±18,4% e de déficit de altura de 27,5±9,7%. A média de QI total da amostra foi de 75,3 ± 16,7, sendo que 31,2% da amostra apresentam retardo mental (QI total <70). Todos os pacientes que fizeram ressonância magnética de cérebro (n=21/25) apresentavam exame alterado, sendo a alteração mais freqüente a lesão de substância branca (n=21/21). Todos os pacientes que fizeram RX de mãos e coluna lombar (n=24/25) apresentaram exame alterado, sendo as principais alterações o encurtamento de metacarpos (n=24/24) e a presença de aumento da concavidade posterior dos corpos vertebrais (n=24/24). A giba lombar esteve presente em 16/24 (66%) pacientes e o aumento da angulação rádio-ulnar em 17/23 (74%) pacientes. A média dos níveis de glicosaminoglicanos urinários foi de 343,5 ± 200,1 μg/mg de creatinina. Encontramos correlação positiva entre idade e: idade de aparecimento dos sintomas, déficit de peso, déficit de altura, volume cerebral normalizado e lesão de substância branca normalizada. Não houve correlação entre excreção de glicosaminoglicanos na urina e as demais variáveis, nem diferença entre as variáveis considerando os grupos com (n=10/25) e sem (n=15/25) Terapia de Reposição Enzimática. A partir dos nossos dados concluímos que esta é uma amostra de pacientes possivelmente com a forma mais grave da doença já que tem idade precoce de aparecimento dos sintomas, elevada excreção de glicosaminoglicanos na urina e alta freqüência de alterações relacionadas com formas graves (encurtamento de metacarpos, giba lombar). É possível que devido a este motivo e pelo tamanho da amostra, não tenha sido encontrada correlação das variáveis estudadas com os níveis de glicosaminoglicanos na urina. Apesar disto, acreditamos que, para a construção de um possível escore de gravidade, esta variável deva ser considerada, assim como os déficits de altura e peso, idade de início, idade, se possível a realização de ressonância magnética, considerar também o volume cerebral normalizado e a lesão de substância branca normalizada. / Mucopolysaccharidosis type VI is a rare genetic disease characterized by the deficiency of the activity of the n-acetylgalactosamine-4-sulfatase enzyme causing an accumulation of glycosaminoglycans as well as of dermatan and chondroitin sulfate in several organs and tissues. Diagnosis is established based both on the increased excretion of dermatan sulfate in the urine and on the decreased enzyme activity. There are essentially two clinical forms: the most severe and the less severe form; however, there is no consensus in the literature as to how to classify clinical forms, which would be useful to define patient management and to monitor treatment. The main objectives of the present work were to identify factors associated to the severity of Mucopolysaccharidosis (MPS) type VI and to characterize the involvement of central nervous system and radiological alterations in hands and lumbar spine of MPS VI patients. Study participants were 25 patients with a confirmed diagnosis of MPS type VI who underwent a clinical and physical evaluation, as well as intelligence quotient testing, brain magnetic resonance, X-ray of hands and lumbar spine, and dosage of urinary glycosaminoglycans. The following variables were studied: age, age at onset of symptoms, age at biochemical diagnosis, consanguinity, early symptoms, weight, weight deficit, height, height deficit, total QI, cognitive potential, presence of cerebral atrophy, presence of megacisterna magna, presence of dilated perivascular spaces, hydrocephaly, white matter lesion, cerebral volume, ventricular volume, liquor volume, size of metacarpi, size of lumbar vertebrae, alterations in lumbar vertebrae, lumbar gibbus, radius-ulnar angle, and dosage of urinary glycosaminoglycans. The 25 patients came from 20 families; 4 (20%) of whom were consanguineous. At evaluation, mean age was 10.6 ± 4.5 years, and median age of onset of symptoms was 0.5 years; the most frequent early symptom was lumbar gibbus. Mean age at diagnosis was 4.8 ± 3 years. Mean weight deficit was 39.5±18.4%, and height deficit was 27.5±9.7%. Mean total IQ of the sample was 12 75.3 ± 16.7; 31.2% had mental retardation (total IQ <70). All the patients who underwent brain magnetic resonance (n=21/25) had altered exams, and the most frequent alteration was white matter lesion (n=21/21). All the patients who performed X-ray of hands and lumbar spine (n=24/25) had altered exams; the most frequent alterations were shortening of metacarpi (n=24/24) and the presence of increased posterior concavity of the vertebral bodies (n=24/24). Lumbar gibbus was found in 16/24 (66%) patients, and increased radius-ulnar angle was found in 17/23 (74%) patients. Mean level of urinary glycosaminoglycans was 343.5 ± 200.1 μg/mg of creatinine. Positive correlations were found between age and the following: age at onset of symptoms; weight deficit; height deficit; normalized cerebral volume and normalized white substance lesion. No correlation was found between the excretion of urine glycosaminoglycans and the remaining variables; no difference was found between variables considering groups receiving (n=10/25) or not (n=15/25) enzyme replacement therapy. From the data collected we concluded that the present sample included patients with possibly the most severe form of the disease, who showed early age of onset of symptoms, high excretion of glycosaminoglycans in the urine, and high frequency of alterations related to the severe forms of the disease (shortening of metacarpi, lumbar gibbus). It is possible that due to the above mentioned reason and the sample size, no correlation was found between the variables studied and the levels of urinary glycosaminoglycans. Nevertheless, it is our understanding that for the construction of a possible score of severity, this variable should be considered, just as height and weight deficits, age at onset, age, and if magnetic resonance is performed, normalized cerebral volume and normalized white matter lesion.

Submitted by Alessandra Portugal (alessandradf@ioc.fiocruz.br) on 2013-09-17T14:26:07Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao Simone Teves.pdf: 4150601 bytes, checksum: 89bd0ef04e4182d928bde044d1f2019f (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-17T14:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Simone Teves.pdf: 4150601 bytes, checksum: 89bd0ef04e4182d928bde044d1f2019f (MD5) Previous issue date: 2012 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / O estado do Tocantins, endêmico para a doença de Chagas, carece de estudos sobre a fauna triatomínica silvestre presente em seu bioma predominante, o Cerrado, que, ao lado da mata Atlântica, constitui um dos biomas de maior biodiversidade do planeta. No estudo de monitoramento entomológico realizado no município de Paranã –TO, em parceria entre o Laboratório de Transmissores de Leishmanioses IOC – FIOCRUZ e a ENERPEIXE SA foram capturados espécimes de triatomíneos do gênero Triatoma não passíveis de identificação taxonômica específica pela morfologia clássica sugerindo um novo morfotipo. Uma abordagem multidisciplinar, abrangendo caracterização morfológica e molecular foi realizada para verificar se estes espécimes sustentam a hipótese de um novo status específico. Os espécimes de estudo juntamente com T. costalimai foram capturados em afloramentos rochosos nos municípios de Paranã e Aurora do Tocantins – TO, respectivamente. A morfologia foi estudada por morfometria clássica de estruturas de valor taxonômico, abrangendo a genitália externa de fêmeas por microscopia eletrônica de varredura e a morfometria geométrica das asas. A filogenia molecular foi estabelecida com base em sequências de DNA mitocondrial. Para fins de comparação foram utilizados espécimes de Triatoma williami, espécie afim de T. costalimai, e de Triatoma sordida, assim como seqüências Rhodnius stali e Rhodnius prolixus, utilizados como grupo externo, obtidas no Genebank. Triatoma sp. diferenciou-se de T. costalimai e T. williami quanto ao tamanho, coloração geral do corpo e mancha do conexivo. A morfometria clássica mostrou que machos e fêmeas de Triatoma sp. são menores que os de T. costalimai. O estudo da genitália externa de fêmeas mostrou diferenças de Triatoma sp. em relação a T. costalimai e T. williami e possibilitou a descrição de cerdas e espinhos nunca estudados nestes grupos. Pela morfometria geométrica das asas tanto o tamanho quanto a conformação, separou os espécimes de estudo das demais espécies. As relações morfométricas não foram de encontro com as filogenéticas. A variação de tamanho de Triatoma sp. pode ser uma expressão da plasticidade gênica, diante das variações ambientais. Entretanto, as variações morfológicas observadas nas diferentes abordagens estão associadas à composição gênica de cada inseto. Apesar das semelhanças morfológicas, verficou-se a separação de Triatoma sp. e T. costalimai no estudo filogenético. Os resultados são consistentes para inferir que Triatoma sp. trata-se de uma nova espécie. O encontro recente de Triatoma sp. em domicílio no município de Paranã ressalta a importância de mais estudos sobre a biologia desta nova espécie. / O estado do Tocantins, endêmico para a doença de Chagas, carece de estudos sobre a fauna triatomínica silvestre presente em seu bioma predominante, o Cerrado, que, ao lado da mata Atlântica, constitui um dos biomas de maior biodiversidade do planeta. No estudo de monitoramento entomológico realizado no município de Paranã –TO, em parceria entre o Laboratório de Transmissores de Leishmanioses IOC – FIOCRUZ e a ENERPEIXE SA foram capturados espécimes de triatomíneos do gênero Triatoma não passíveis de identificação taxonômica específica pela morfologia clássica sugerindo um novo morfotipo. Uma abordagem multidisciplinar, abrangendo caracterização morfológica e molecular foi realizada para verificar se estes espécimes sustentam a hipótese de um novo status específico. Os espécimes de estudo juntamente com T. costalimai foram capturados em afloramentos rochosos nos municípios de Paranã e Aurora do Tocantins – TO, respectivamente. A morfologia foi estudada por morfometria clássica de estruturas de valor taxonômico, abrangendo a genitália externa de fêmeas por microscopia eletrônica de varredura e a morfometria geométrica das asas. A filogenia molecular foi estabelecida com base em sequências de DNA mitocondrial. Para fins de comparação foram utilizados espécimes de Triatoma williami, espécie afim de T. costalimai, e de Triatoma sordida, assim como seqüências Rhodnius stali e Rhodnius prolixus, utilizados como grupo externo, obtidas no Genebank. Triatoma sp. diferenciou-se de T. costalimai e T. williami quanto ao tamanho, coloração geral do corpo e mancha do conexivo. A morfometria clássica mostrou que machos e fêmeas de Triatoma sp. são menores que os de T. costalimai. O estudo da genitália externa de fêmeas mostrou diferenças de Triatoma sp. em relação a T. costalimai e T. williami e possibilitou a descrição de cerdas e espinhos nunca estudados nestes grupos. Pela morfometria geométrica das asas tanto o tamanho quanto a conformação, separou os espécimes de estudo das demais espécies. As relações morfométricas não foram de encontro com as filogenéticas. A variação de tamanho de Triatoma sp. pode ser uma expressão da plasticidade gênica, diante das variações ambientais. Entretanto, as variações morfológicas observadas nas diferentes abordagens estão associadas à composição gênica de cada inseto. Apesar das semelhanças morfológicas, verficou-se a separação de Triatoma sp. e T. costalimai no estudo filogenético. Os resultados são consistentes para inferir que Triatoma sp. trata-se de uma nova espécie. O encontro recente de Triatoma sp. em domicílio no município de Paranã ressalta a importância de mais estudos sobre a biologia desta nova espécie.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-06-30T09:37:25Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1858851 bytes, checksum: a6477a410b09da81003e6b4fc109e794 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-30T09:37:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1858851 bytes, checksum: a6477a410b09da81003e6b4fc109e794 (MD5) Previous issue date: 2001-02-22 / Fundação de Amparo a Pesquisa de Minas Gerais / O clima é o fator ambiental que exerce maior influência na distribuição da vegetal. Esta distribuição está também condicionada a outros fatores, como os edáficos (relacionados com o tipo de solo), bióticos (relacionados com os microrganismos do solo) e fisiográficos (relacionados com o relevo). Dada a elevada importância do clima na distribuição vegetal, para que as atividades agrícolas e de reflorestamento alcancem melhores resultados, é imprescindível que a inter-relação clima-vegetação seja bem compreendida. O presente es tudo procurou definir uma classificação climática para Minas Gerais por meio da análise dos componentes principais e de agrupamento e do enquadramento das “zonas de vida” de Holdridge. O trabalho consistiu das seguintes etapas: a) agrupamento das zonas de clima homogêneas; b) definição das “zonas de vida” por meio da metodologia proposta por HOLDRIDGE (1947); e c) enqua- dramento das zonas ecológicas à classificação climática do Estado, por meio da sobreposição (soma e produto) dos resultados das duas metodologias consideradas. Consideraram-se as médias anuais da temperatura do ar e do total de precipitação; para uma capacidade de água disponível à plantas de s 100 mm, foram consideradas as médias das evapotranspirações potencial e real e dos excedentes e das deficiências hídricos, extraídos das Normais Climatológicas do Instituto Nacional de Meteorologia e de uma série mínima de 30 anos da Agência Nacional de Energia Elétrica para 302 localidades mineiras. As “zonas de vida” foram definidas dentro do diagrama de Holdridge, com as medidas das médias anuais da temperatura do ar e da precipitação total; foram confirmados ainda os pisos altitudinais e as regiões latitudinais do Estado, respectivamente por meio do diagrama de pisos altitudinais e do quadro das regiões latitudinais. Na classificação climática, os dados originais foram submetidos ao método estatístico dos componentes principais. Em seguida, estes componentes foram rotacionados por meio da rotação varimax normalizada, com a extração dos índices “climáticos” (IC), por meio da somatória do produto entre as variáveis e os respectivos pesos (≥0,70), com a similaridade dos ICs estimada por meio da distância euclidiana média. Após definidas as áreas climaticamente homogêneas, estas foram agrupadas com o recurso da otimização de Tocher. A classificação climática resultou em nove classes de clima, e a ecológica, em seis “zonas de vida” e quatro áreas de transição. Para expressar melhor os resultados encontrados, estes foram plotados no mapa do Estado, por meio do sistema de informações geográficas ArcView 3. / Climate is the most important environmental factor for the distribution of vegetation around the world. This distribution is also conditioned to other factors, such as edaphic (related to soil type), biotic (related to soil microorganisms) and physiographic conditions (related to relief). Given the great importance of climate for plant distribution so that farming and reforestation activities obtain better results, it is indispensable that climate-plant interrelation be well understood. This study attempted to define a climatic classification for Minas Gerais by means of principal components analysis, as well as clustering and fitting Holdridge’s “life zones”. The work consisted of the following stages: a) clustering homogeneous climate zones; b) defining “life zones” by the methodology proposed by HOLDRIDGE (1947); and c) fitting ecological zones in the climatic classification of the state, by the superposition (sum and product) of the results of both methodologies. The annual average of air temperature and total precipitation were accounted for a soil water balance using 100 mm of water availability to the plants; for potential and actual evapotranspirations; and for the water surpluses and deficits, extracted from the Climatologic Normals of the “Instituto Nacional de Meteorologia” and from a 30-year minimum series of the “Agência Nacional de Energia Elétrica” for 302 Minas Gerais localities. The “life zones” were defined according to the Holdridge diagram, with the annual average values of air temperature and total rainfall; the state’s altitude levels and latitudinal regions were also used, respectively, through the altitudinal level diagram and the latitudinal region table. For the climatic classification, the original data were submitted to the statistical method of principal components analysis. These components were then rotated by means of the normalized varimax rotation, by extracting “climatic” indexes (CI) using the sum of the product of the variables and respective weights (> 0.70), with the CI similarity being estimated through the average Euclidian distance. After the definition of climatically homogenous areas, these were grouped by the Tocher optimization method. The climatic classification resulted in nine climate classes and the ecological classification in six “life zones” and four transition areas. To better express the results found, these were plotted in the state map, using the Geographic Information System, ArcView 3. / Não foi localizado o CPF do autor.

TCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro Tecnológico. Ciências da Computação. / Submitted by José Victor Feijo de Araujo null (victor.feijo@ufsc.br) on 2017-12-12T00:28:08Z No. of bitstreams: 1 TCC_JOSE_VICTOR_FEIJÓ.pdf: 18256303 bytes, checksum: 6f566a4daec3603fa7cc31bf1d8da5c8 (MD5) / Approved for entry into archive by Renato Cislaghi (renato.cislaghi@ufsc.br) on 2017-12-13T21:10:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TCC_JOSE_VICTOR_FEIJÓ.pdf: 18256303 bytes, checksum: 6f566a4daec3603fa7cc31bf1d8da5c8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-13T21:10:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TCC_JOSE_VICTOR_FEIJÓ.pdf: 18256303 bytes, checksum: 6f566a4daec3603fa7cc31bf1d8da5c8 (MD5) / A proposta sugerida por este trabalho foi de analisar o impacto de um modelo de classificação, seguido de técnicas de PDI e OCR para extração de texto em cupons fiscais, classificando-os em subgrupos. Técnicas selecionadas de PDI foram aplicadas para cada grupo com suas devidas características, por fim extraindo texto dessas imagens através de um algoritmo de OCR. Foi realizado um estudo sobre os algoritmos clássicos de classificação na área de aprendizado de máquinas, com foco nos algoritmos de “clusterização” e sua correlação com a classificação de imagens em um modelo de aprendizado não supervisionado. Também foi feita uma análise sobre as características das imagens de cupons fiscais e das possíveis técnicas de PDI que podem ser aplicadas. Em relação ao OCR, também foi realizado um estudo para verificar possíveis soluções na extração de texto e entender seu comportamento, possibilitando desta maneira implementar a arquitetura proposta. Sendo assim, foram desenvolvidos métodos para classificar as imagens em clusters utilizando algoritmos de “clusterização”. Também foram propostas três técnicas de PDI, a primeira aplicando uma série de realces, a segunda uma binarização adaptativa e a terceira técnica utilizando a compressão de dados JPEG. Essas imagens foram enviadas para o serviço de OCR do Google Vision, onde foi possível extrair o texto das imagens em formato de blocos. Os resultados do modelo desenvolvido foram avaliados comparando a taxa de acerto do OCR com os valores de texto reais presentes nos cupons fiscais, onde foi possível analisar a precisão de cada técnica proposta e da arquitetura como um todo. Foram obtidos resultados positivos utilizando o modelo desenvolvido, melhorando a extração do valor total da compra em aproximadamente 6%. Além disso, os resultados da compressão JPEG melhoraram também a extração de outros dados do cupom fiscal, como por exemplo o CNPJ e a data da compra.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2014-08-06T17:50:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 323101.pdf: 5463378 bytes, checksum: 1c6eb8d937cfd4eb3a8800de90f97364 (MD5) Previous issue date: 2013 / Realizou-se a análise anatômica da folha e ramicaule em quinze espécies de orquídeas epífitas pertencentes à subtribo Pleurothallidinae, sendo três espécies do gênero Anathallis Barb. Rodr. (Anathallis dryadum (Schltr.) F. Barros, Anathallis linearifolia (Cogn.) Pridgeon & M. W. Chase, Anathallis sp.); oito espécies do gênero Octomeria (R. Br.) Pridgeon & M. W. Chase (Octomeria crassifolia Lindl., Octomeria diaphana Lindl., Octomeria gracilis Lodd. ex Lindl., Octomeria grandiflora Lindl. Octomeria sp1, Octomeria sp2, Octomeria brevifolia Cogn., Octomeria warmingii Rchb.f.,); uma Pabstiella fusca Lindl.; duas espécies de Specklinia Lindl.(Specklinia podoglosa (Hoehne) Luer e Specklinia punctatifolia (Barb.Rodr.) Luer) e uma Trichosalpinx montana (Barb.Rodr.) Luer, afim de se diagnosticar caracteres que possam ser utilizados na distinção entre os gêneros e/ou espécies fornecendo subsídios à taxonomia do grupo. Utilizou-se como caracteres morfo-anatômicos para distinção entre os gêneros: Presença ou ausência de idioblastos contendo algum tipo de cristal prismático, ornamentação na cutícula, presença ou ausência de barras de espessamento, presença ou ausência de tricomas em depressão na epiderme, disposição do mesofilo, presença ou ausência de feixes diferenciados no bordo foliar, morfologia da folha e ramicaule em secção transversal, formato de células epidérmicas, presença e ausência de hipoderme no ramicaule. Tendo em vista, que o número de espécies estudadas para os gêneros Anathallis, Specklinia, Pabstiella e Trichosalpinx foi relativamente baixo, algumas das características anatômicas levantadas para estas espécies podem ser consideradas próprias da família ou do gênero, consequentemente, não podem ser utilizadas para fins taxonômicos. Entretanto, em algumas espécies do gêneros Octomeria, foi possível identificar caracteres específicos, como a ocorrência de ráfides, presença de parênquima paliçádico, ausência de tricomas em depressão e ausência de células epidérmicas com parede periclinal plana na face abaxial, são características importantes na identificação de cada uma delas.<br>

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2014-08-06T17:53:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 325242.pdf: 3637864 bytes, checksum: 0ee3a47dd4cef3e28e4e38a685b72625 (MD5) Previous issue date: 2013 / As algas calcárias não articuladas compreendem cerca de 600 espécies e estão amplamente distribuídas em todos os oceanos, desde regiões tropicais até regiões polares e encontram-se da zona entre marés até 268m de profundidade. Muitas espécies são reconhecidas por ter uma ampla distribuição. Contudo, o uso de epítetos para espécimes morfologicamente semelhantes provenientes de localidades distantes, deve ser utilizado com cautela. Barreiras impostas à dispersão pela distância e condições ecofisiológicas, ou ainda, morfologias semelhantes como resultante de convergência evolutiva podem ter levado ao surgimento de espécies crípticas entre as Hapalidiaceae. No presente estudo, uma nova espécie de Mesophyllum é descrita para a província tropical brasileira e duas novas espécies de Lithothamnion para o estado do Espírito Santo, com base em dados morfológicos e moleculares. M. cf. incisum e M. cf. engelhartii também foram identificadas. Contudo, as divergências encontradas para os marcadores psbA e rbcL, quando comparadas a sequências disponíveis no GenBank, sugere a existência de espécies distintas sob o mesmo epíteto. Os espécimes brasileiros, incluindo a localidade tipo de M. erubescens, foram caracterizados morfologicamente e molecularmente. Após exaustiva comparação morfoanatômica, não foram observadas características diagnósticas de eventuais diferenças intra ou interespecíficas. Por outro lado, os dados de DNA plastidial indicam que as características morfológicas utilizadas na delimitação de M. erubescens não refletem a diversidade do taxa, este que deverá ser subdividido em pelo menos 12 novas espécies. Dessa forma, o uso da técnica de DNA Barcoding como uma ferramenta é fundamental na determinação de espécies e, eventualmente, de representantes deste complexo em outras regiões do planeta.<br> / Abstract : Non-geniculate coralline algae comprise about 600 species and are widely distributed in all oceans, from the tropics to the polar regions and are found from the intertidal zone to 268m depth. Many species are recognized to have a wide distribution. However, using epithets to morphologically similar specimens from distant localities should be used with caution. Barriers imposed to dispersal by distance and ecophysiological conditions, or even similar morphologies as the result of convergent evolution may have led to the emergence of cryptic species among Hapalidiaceae. In the present study, a new species of Mesophyllum is described for the Tropical Brazilian Province and two new species of Lithothamnion for the Espírito Santo state based on morphological and molecular data. Mesophyllum cf. incisum and Mesophyllum cf. engelhartii were also identified. However, the differences found for the markers psbA and rbcL compared to sequences available in GenBank, suggesting the existence of distinct species under the same epithet. Brazilian specimens, including the type locality of M. erubescens, were characterized morphologically and molecularly. After exhaustive morphological and anatomical comparison, diagnostic features were not found of any intra or interspecific differences. Plastidial DNA data indicate that morphological characteristics used in the delimitation of M. erubescens do not reflect the diversity of the taxa, which must be subdivided into at least 12 new species. In so doing, the use of DNA Barcoding is critical in determining species and eventually representatives of this complex in other regions of the world.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2014-08-06T18:08:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 326354.pdf: 3198757 bytes, checksum: 56434bf89de770ca5875a57e0d968a3d (MD5) Previous issue date: 2014 / O conhecimento sobre os fungos boletoides nas regiões tropicais e subtropicais do hemisfério sul ainda é bastante limitado, havendo escassez de dados acerca da diversidade e distribuição dos mesmos. Com o objetivo de contribuir para o conhecimento de Boletaceae foram estudados materiais coletados em diferentes regiões do Brasil. Quatorze táxons foram identificados em cinco gêneros (Austroboletus, Boletellus, Chalciporus, Fistulinella e Tylopilus), sendo que sete são espécies novas: F. alboaurantiaca (RN), F. conduruensis (BA), F. rhytidocystidiata (ES), T. dimorphicus (AM), T. nigrostipitatus (PB), T. pygmaeus (BA) e T. versiformis (PB). Tylopilus balloui foi registrado pela primeira vez para o Brasil. Fistulinella cinereoalba foi registrada pela primeira vez para o Brasil. Chalciporus trinitensis var. amazonicus foi registrado pela primeira vez para o Espírito Santo e A. festivus é o primeiro registro para Santa Catarina. Boletellus ananas e B. cf. lepidospora foram recoletados nas florestas brasileiras. Para todos os táxons são apresentadas fotografias dos basidiomas, descrições macro e micromorfológicas com ilustrações e microscopia eletrônica de varredura (MEV) dos basidiosporos. Os resultados mostraram uma diversidade pouco conhecida de Boletaceae nas florestas brasileiras e uma indicação de que ainda há mais novidades para a ciência no que diz respeito a essa família. O incremento no conhecimento dos táxons de Boletaceae e a importância ecológica da família devido à associação com plantas hospedeiras dá subsídios importantes para planos de conservação em áreas onde esses táxons ocorrem.<br> / Abstract : Knowledge about boletoid fungi in tropical and subtropical regions of the southern hemisphere is still quite limited and few data regarding their diversity and distribution are available. In order to contribute to the knowledge of the diversity of Boletaceae, specimens from different regions of Brazil were studied. A total of 14 taxa belonging to five genera (Austroboletus, Boletellus, Chalciporus, Fistulinella and Tylopilus) have been identified, from which seven are new species: F. alboaurantiaca (RN), F. conduruensis (BA), F. rhytidocystidiata (ES), T. dimorphicus (AM), T. nigrostipitatus (PB), T. pygmaeus (BA), and T. versiformis (PB). Tylopilus balloui was registered for the first time for Brasil. Fistulinella cinereoalba was registered for the first time for Brazil. Chalciporus trinitensis var. amazonicus was registered for the first time for Espírito Santo, and A. festivus is a new record for Santa Catarina. Boletellus ananas and B. cf. lepidospora were recollected in the Brazilian forests. Photographs of the basidiomes, fully macro and microscopic descriptions with illustrations, and Scanning Electron Microscopy (SEM) of the basidiospores are presented for each species. The results showed that the diversity of Boletaceae in Brazilian forests is still not very well known and indicates that there are more new species for science to be described. The increase in the knowledge about the Boletaceae and the ecological importance of the family due to the association with plants provides data to build conservation plans in areas where these taxa grow.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-02-05T20:39:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 328006.pdf: 3134045 bytes, checksum: 0c529b95db533c6fce2e97dff34a4b67 (MD5) Previous issue date: 2014 / Phellinus s.l., um agrupamento artificial e heterogêneo, compreende muitas espécies e complexos taxonômicos. Um dos casos mais clássicos é o complexo Phellinus rimosus, táxon que em um senso morfológico amplo compreende espécimes com basidiomas ungulados, superfície rimosa e negra, 3-5 poros/mm, ausência de setas e esporos subglobosos e marrons. A partir desta ampla delimitação morfológica o táxon é considerado também de ampla distribuição geográfica. Entretanto, alguns autores sugerem que a espécie apresenta uma distribuição restrita a regiões semiáridas da América do Norte e Central, África e Ásia. Sendo improvável inclusive a sua ocorrência na América do Sul. Nesse contexto, registros de outras regiões representariam outras espécies. No entanto, espécimes com morfologia semelhante, encontrados nas regiões semiáridas neotropicais, ainda são tradicionalmente determinados como P. rimosus. No presente trabalho, com intuito de realizar uma revisão taxonômica do táxon, foram estudados espécimes oriundos de regiões semiáridas da região Neotropical (Caatinga no Brasil, Bosques Tropicais Estacionalmente Secos do Peru e Chaco Argentino) e comparados com materiais Tipos e/ou de táxons próximamente relacionados ao complexo (Phellinus robiniae, P. coffeatoporus, P. resinaceus, P. merrillii e P. piptadeniae). Dos 102 materiais estudados, dos caracteres morfológicos analisados em detalhe, foram observados um sistema hifal monomítico no contexto e dimítico nos tubos, assim como a reação xantocroica dos esporos. Ainda, todos os espécimes apresentaram estados de caracter que os distanciaram do lectótipo de P. rimosus na Análise de Componentes Principais, representando inclusive grupos morfológicos distintos entre si. Além disso, a análise filogenética (nucLSU e ITS) dos materiais apresenta clados em/ou próximos a Fomitiporella, Fulvifomes e Inocutis. Também, foi observada a correlação de espécimes/espécies com hospedeiros em particular e/ou agrupamentos relacionados a uma distribuição geográfica mais restrita. Entre as espécies relacionadas ao complexo P. rimosus, P. piptadeniae é caracterizada principalmente por apresentar uma evidente linha negra no contexto e os espécimes morfologicamente semelhantes, coletados em diferentes hospedeiros de leguminosas no Peru, ampliam a distribuição do táxon para além da Mata Atlântica e Caatinga. Por fim, dentre os materiais estudados, procedentes das regiões semiáridas neotropicais, há espécies distintas, que representam inclusive novidades científicas (espécies e/ou gêneros), e nenhuma delas necessariamente corresponde à P. rimosus.<br> / Abstract : Phellinus s.l., an artificial and heterogeneous group of many species and taxonomic complex. Phellinus rimosus complex is a classic case that in a broad morphological sense comprises specimens with ungulate basidiomata, black and rimose upper surface, 3-5 pores/mm, absence of setae and subglobose and brown reddish spores. In this context is also considered a widely distributed taxon. However, some authors suggest that the species has restricted distribution for semiarid regions of North and Central America, Africa and Asia, being its occurrence probably not possible for South America and records from other regions represent other species. However, specimens with similar morphology, found in neotropical semiarid regions, are still traditionally determined as P. rimosus. In the present work, in order to review taxonomic this taxon, specimens from semi-arid regions of the Neotropics were studied (Caatinga in Brazil, Seasonally Tropical Dry Forests of Peru and Chaco in Argentina) and compared with type and/or related taxa material (Phellinus robiniae, P. coffeatoporus, P. resinaceus, P. merrillii and P. piptadeniae). Morphological analysis in detail of 102 materials reveled for all specimens a monomitic hyphal system in the context and dimitic in the trama of tubes, as well as xanthocroic spores. Still, all specimens present different character states of the P. rimosus lectotype on Principal Component Analysis, including representatives and distinct morphological groups among them. Furthermore, phylogenetic analysis (nucLSU and ITS) present clades in/or near Fomitiporella, Inocutis and Fulvifomes. The correlation of specimen/species with particular hosts and/or groups related to a geographical distribution was also observed. Among the species related to P. rimosus complex, P. piptadeniae is characterized mainly by presenting a distinct black line in the context and morphologically similar specimens, collected in different legume hosts in Peru, extend the distribution of the taxon beyond the Atlantic Forests and Caatinga biome. Finally, among the studied materials from neotropical semiarid regions, there are different species, some of them are new (species and/or genera) and none necessarily correspond to P. rimosus.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-02-05T21:19:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 328456.pdf: 1966427 bytes, checksum: 77c8c494fb6f3bed0000a38e7d9c2cef (MD5) Previous issue date: 2014 / Amauroderma é um gênero de macrofungos poliporoides de Ganodermataceae caracterizado por apresentar basidiomas sésseis a estipitados, com coloração em diferentes tons de marrom, sistema hifal dimítico, basidiósporos globosos, elipsoides a oblongos, hialinos a amarelados e com dupla parede, onde o endósporo é ornamentado (uma espécie apresenta endósporo liso). O gênero está distribuído em regiões tropicais e subtropicais, geralmente associados a raízes de árvores vivas ou mortas, mas também ocorrendo em troncos mortos. Apesar de bem delimitado morfologicamente, nenhuma análise filogenética do gênero foi realizada até o momento e suas relações em Ganodermataceae são assumidas por apenas três espécies. Este trabalho apresenta aspectos taxonômicos e filogenéticos sobre Amauroderma, a partir de análises morfológicas (macro, micro e ultraestrurais) bem como filogenéticas moleculares. Ao todo, foram revisados 144 espécimes (coletas e coleções de herbário), representando 17 espécies de Amauroderma e cinco de gêneros relacionados. Dentre estes, duas novas espécies são propostas, Amauroderma calcitum Ad int. com morfologia intermediária a A. partitum e A. calcigenum, e A. opacaespitosa Ad int., caracterizada por apresentar hábito cespitoso, basidiomas opacos com contexto marrom, sem linhas e esporos amplamente elipsoides. Também é proposta a sinonimização de A. omphalodes em A. camerarium, bem como são apresentados novos registros para o domínio fitogeográfico do Cerrado e para a Argentina. Por fim, é apresentada uma filogenia (ITS, LSU e ITS+LSU) com a proposição de um gênero novo (Foraminisporus Ad int.) e uma nova combinação (F. sprucei Ad int.), caracterizados por apresentar colunas endospóricas ocas, sendo esta uma sinapomorfia dos táxons. Ainda, Amauroderma é considerado um táxon polifilético. A partir dos resultados apresentados aqui, nota-se a eminente possibilidade de novidades científicas, tanto a nível específico quanto a nível genérico, bem como a necessidade de estudos que envolvam análises morfológicas (macro, micro e ultraestrutural) e moleculares com múltiplos marcadores.<br> / Abstract : Amauroderma is a polypore macrofungi genus oin theGanodermataceae characterized by sessile to stipitate basidiomata, dimitic hyphal system, and globose, ellipsoid to oblong, hyaline to yellowish, double-walled basidiospores with ornamented endospore (one species presents smooth endospore). Amauroderma occurs in tropical and sub-tropical regions, usually associated with roots of living or dead trees, also occurring in dead trunks. Despite its well morphological circumscription Amauroderma is phylogenetically understudied and its relationship in Ganodermataceae is based on few species. A taxonomic and phylogenetic approach of Amauroderma is presented, based on morphological (macro, micro and ultrastructure) and molecular analysis. Around 144 specimens (collections and herbarium material), representing 17 species of Amauroderma and five of related genera were studied. Two new species are proposed, Amauroderma calcitum Ad int. with intermediate morphology of A. partitum and A. calcigenum, and A. opacaespitosa Ad int., characterized by caespitose habbit, dull basidiomata with brown context without bands and broadly ellipsoid basidiospores. Furthermore, the synonym of A. omphalodes in A. camerarium is also proposed, as well as new records for Brazilian Cerrado and for Argentina. Finally, in a preliminary phylogenetic point of view Amauroderma is considered polyphyletic. Considering the results presented here is possible to observed that there are many scientific novelties among the Ganodermataceae (specific and generic level) and some of them are possible to see only using a detailed morphology combined with molecular studies.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2015-10-20T03:11:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 334839.pdf: 1729721 bytes, checksum: a3bf14567c43d3b7e79df1a52480079d (MD5) Previous issue date: 2015 / Leucoagaricus Locq. ex Singer é caracterizado morfologicamente pela margem do píleo inteira a finamente estriada mas nunca formando pregas, lamelas livres, presença de anel, além da ausência de fíbulas e de pseudoparáfises. De acordo com estas características, são incluídas 90 espécies no gênero. Este é um dos gêneros saprotróficos que ocupam o solo mais representativos nas regiões tropicais e subtropicais. Porém, algumas regiões ainda permanecem pouco estudadas e poucos dados sobre a diversidade e distribuição de Leucoagaricus estão disponíveis. Com o objetivo de contribuir para a ampliação do conhecimento sobre a diversidade, distribuição e taxonomia de Leucoagaricus, foi realizado um estudo dos táxons do gênero com base em coletas realizadas na Mata Atlântica Subtropical do Sul do Brasil. Foram identificados 21 espécimes correspondendo a um total de 10 táxons : Leucoagaricus aurantiacus Heinem., Leucoagaricus brunneocingulatus (P. D. Orton) Bon, Leucoagaricus caerulescens (Peck) J. F. Liang et al., Leucoagaricus georginae (W. G. Sm.) Candusso, Leucoagaricus glabridiscus (Sundb.) Wuilb., Leucoagaricus goossensiae (Beeli) Heinem., Leucoagaricus griseus Heinem., ?Leucoagaricus melanotrichus f. citrifolius? Courtec. (nom. inval.), ?Lepiota besseyi? H. V. Sm. & N. S. Weber e ?Lepiota roseolivida? Murrill. São apresentadas fotografias ou desenhos dos basidiomas de todos os todos os táxons tratados, além de descrições macro e micromorfológicas com ilustrações.<br> / Abstract : Leucoagaricus Locq. ex Singer is morphologically characterized by entire or softly striate but not plicate pileus margin, free lamellae, presence of a ring, and absence of clamp connections and pseudoparaphyses. According to these features, 90 species are included in the genus. This is one of the most representative saprotrophic genera that colonized soil in tropical and subtropical forests. However, some regions are still understudied and few data regarding their diversity and distribution are available. In order to improve the knowledge about the diversity, distribution and taxonomy of Leucoagaricus from the subtropical Atlantic Forest in Southern Brazil. Twenty-one specimens were identified corresponding to a total of ten taxa: Leucoagaricus aurantiacus Heinem., Leucoagaricus brunneocingulatus (P. D. Orton) Bom, Leucoagaricus coerulescens (Peck) J. F. Liang et al., Leucoagaricus georginae (W. G. Sm.) Candusso, Leucoagaricus glabridiscus (Sundb.) Wuilb., Leucoagaricus goossensiae (Beeli) Heinem., Leucoagaricus griseus Heinem. ?Leucoagaricus melanotrichus f. citrifolius? Courtec. (nom. inval.), ?Lepiota besseyi? H. V. Sm. & N. S. Weber and ?Lepiota roseolivida? Murrill. Photographs or drawings of the basidiomes and macro and microscopic descriptions are presented for the taxa.