Made available in DSpace on 2016-04-27T18:15:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Edinilson Quintiliano dos Santos.pdf: 3188808 bytes, checksum: 1e89bd3758b7d54483dbf3a87cff93c5 (MD5) Previous issue date: 2009-10-22 / The aim of this study is to reflect upon the concept of The Middle East so as to understand the origin of several representations related o the term as well as to verify if the Geography textbooks for Ensino Médio (EM) selected by Programa Nacional do Livro para o Ensino Médio (PNLEM) have theoretical inadequacies or show prejudiced views of the Middle East. We start from a brief reconstitution of the concept of region in the history of geographical thought, seeking to understand its influence in the Middle Eastern spatial delimitation. This reflection is necessary due to the regional connotation of expression Middle East. We investigated different sources such as sites, Para didactic books and journals to see how the Middle East is represented spatially and we established the differences and the similarities in those representations as well as contextualized the moment when the expression was created and what factors were determinants in that process. After that, we analyzed the way the Middle East was represented in the Geography textbooks for EM. The investigation highlighted territorial imprecision as well as theoretical and conceptual weaknesses in the expression. Besides that, it found the bases of those representations in Geopolitics. The study made it possible to understand that the various views of world produced since European Imperialism in XX Century created various representations of the Middle East and that the Geography textbooks reproduce them, but they do not make clear for the readers the polemics related to spatial reach of the Middle East / A pesquisa tem como finalidade estabelecer uma reflexão em torno do conceito de Oriente Médio, com o objetivo de compreender a origem das várias representações que o termo apresenta. Assim como, verificar se os livros didáticos de geografia do Ensino Médio, selecionados pelo Programa Nacional do Livro para o Ensino Médio (PNLEM), apresentam incorreções teóricas ou disseminam visões preconceituosas em relação ao Oriente Médio. Partimos de uma breve reconstituição do conceito de região na história do pensamento geográfico, buscando compreender a influência desse conceito na delimitação espacial do Oriente Médio. Essa reflexão se fez necessária, em decorrência da conotação regional que a expressão Oriente Médio comporta. Investigamos em diversas fontes sites, paradidáticos e periódicos como o Oriente Médio é representado espacialmente e estabelecemos as semelhanças e diferenças presentes nessas representações, bem como buscamos contextualizar o momento em que a expressão é criada e quais fatores foram determinantes nesse processo. Para então analisarmos de que forma esse conceito é apresentado nos livros didáticos de Geografia do Ensino Médio. A averiguação evidenciou a imprecisão territorial e a fragilidade teórica conceitual que a expressão representa além de encontrar na geopolítica as bases para essas representações. A pesquisa possibilitou compreender que as várias visões de mundo produzidas a partir do Imperialismo europeu do século XX, criaram diversas representações do Oriente Médio e que os livros didáticos de geografia reproduzem essas representações, porém não esclarecem aos seus leitores quanto à polêmica que envolve a abrangência espacial do Oriente Médio

Submitted by Lucas Jamiro Barbosa (eng.lucasjb@gmail.com) on 2018-02-21T18:50:52Z No. of bitstreams: 1 barbosa_lj_me_prud.pdf: 5180173 bytes, checksum: 561a235397d5860ed83f8776cc40f6a4 (MD5) / Approved for entry into archive by ALESSANDRA KUBA OSHIRO ASSUNÇÃO (alessandra@fct.unesp.br) on 2018-02-21T19:37:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 barbosa_lj_me_prud.pdf: 5180173 bytes, checksum: 561a235397d5860ed83f8776cc40f6a4 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-21T19:37:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 barbosa_lj_me_prud.pdf: 5180173 bytes, checksum: 561a235397d5860ed83f8776cc40f6a4 (MD5) Previous issue date: 2017-04-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O Sensoriamento Remoto tem-se mostrado, nos últimos anos, uma excelente ferramenta na aquisição de informações da cobertura da Terra. Dentre os diversos sensores remotos, o sistema de aquisição de dados por varredura LASER (Light Amplification by Stimulated Emission of Radiation) se apresenta como uma ferramenta poderosa na coleta de informações tridimensionais. A tecnologia lidar (Light Detection And Ranging), quando a bordo de aeronaves, pode ser denominada como Airborne Laser Scanning (ALS), diferente dos sistemas aerofotogramétricos de imageamento tradicionais, permite coletar, simultaneamente, pontos com coordenadas 3D sobre copas de árvores, bem como o terreno abaixo dela, em função da capacidade de registro de múltiplos retornos e da divergência do pulso. Por esta razão, esta tecnologia tem sido utilizada em diversas aplicações florestais, como manejo e recuperação florestal, silvicultura, exploração madeireira, dentre outras. Diversas pesquisas têm mostrado a possibilidade de utilização dos dados lidar na extração e delimitação de indivíduos arbóreos e, portanto, na estimativa de variáveis dendrométricas. Desta forma, o desenvolvimento de técnicas que proporcionem a automatização no delineamento das copas das árvores e na estimativa destas informações é de grande interesse. Contudo, grande parte das pesquisas relacionadas à detecção de árvores, delimitação de copa e estimativa de algumas variáveis são desenvolvidas considerando cenários homogêneos e específicos, onde a vegetação é caracterizada pela presença de árvores coníferas e/ou deciduais, ou florestas de exploração madeireira. Portanto, o objetivo desta pesquisa foi a implementação e avaliação de uma técnica que permita detectar indivíduos arbóreos e aglomerados, considerando um cenário urbano heterogêneo e complexo; e, destes indivíduos, estimar variáveis dendrométricas como área da copa; altura da árvore; e raio médio da copa. A metodologia proposta é realizada em três etapas e se baseia no uso do método de crescimento de regiões, aplicado à nuvem de pontos originais, ordenados quanto à altura. Além disso, são usados polígonos convexos visando a extração de indivíduos arbóreos e aglomerados. Para isso, são utilizados três parâmetros: distância mínima, buffer e perímetro comum. Foram realizados experimentos considerando dados reais e cenários diferentes em uma área urbana, para diferentes conjuntos de parâmetros utilizados no processo de delimitação das copas. Os mesmos foram avaliados quanto a acurácia temática, completeza e F-Score, calculados em função de referências obtidas de forma manual. Na delimitação de indivíduos arbóreos e aglomerados, simultaneamente, o maior valor de F-Score foi de 54% e na delimitação de indivíduos e aglomerados, em separado, o melhor resultado obtido foi 74% e 39%, respectivamente. Embora melhorias possam ser feitas visando aumentar estes indicadores, principalmente para aglomerados, pode-se considerar que o método proposto tem potencial de aplicação, sobretudo quando se tem por objetivo a extração de árvores individuais em ambiente urbano. / Remote Sensing has shown to be, in the last years, an excellent way of acquiring Earth’s surface data. Among all remote sensors, the system of data acquisition by LASER (Light Amplification by Stimulated Emission of Radiation) scanning has been presented as a powerful tool for three-dimensional information collection. lidar (Light Detection And Ranging) technology, when onboard of airplanes can be named Airborne Laser Scanning (ALS) and, differently from traditional photogrammetric techniques, allows the collection of simultaneously 3D points over tree crowns, as well as the ground underneath it, due to the recording capacity of multiple echoes arising from the divergence of the pulse. For this reason, this technology has been used in many different forest applications, as management and forest recovery, forestry, logging and others. Some researchers have shown the possibility of using lidar data on tree extraction and crown delineation and, therefore, on the estimation of their dendrometric variables. In this way, the development of techniques that can provide the automation of tree crowns delineation and estimation of this information has increased. However, most of the researches performed ever related to tree detection, canopy delineation and estimation of some dendrometric variables are developed considering homogeneous and specific scenarios where the vegetation is characterized by the presence of coniferous and/or deciduous trees. For this purpose, the objective of this research was the implementation and evaluation of a technique capable of detecting individual trees and clumps, considering a heterogeneous urban scenario. Additionally, from those individual trees some dendrometric variables such as crown area; tree height and average crown radius were estimated. Experiments were conducted considering different study areas in an urban environment varying the parameters used in the crown delineation process. Those experiments were evaluated in terms of thematic accuracy, completeness and F-Score, computed based on reference values obtained manually. When the simultaneous delimitation of arboreal individuals and agglomerates was performed the best F-Score was 54%. For independent processing, the best result was 74% and 39%, respectively, for individuals and agglomerates. Although improvements can be performed aiming to improve those indicators, mainly to clumps, it is possible to consider that the proposed method has potential, especially when the objective is the extraction of individual trees in an urban environment.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-11-14T11:45:49Z No. of bitstreams: 2 Tese - Tatianne Piza Ferrari Abreu Jardim - 2018.pdf: 6203462 bytes, checksum: da8fd40f0daa85798ef8b9933080b8f5 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-11-14T12:59:52Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Tatianne Piza Ferrari Abreu Jardim - 2018.pdf: 6203462 bytes, checksum: da8fd40f0daa85798ef8b9933080b8f5 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-14T12:59:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Tatianne Piza Ferrari Abreu Jardim - 2018.pdf: 6203462 bytes, checksum: da8fd40f0daa85798ef8b9933080b8f5 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-10-31 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Geological events of the Neogene and the climatic fluctuations of the Quaternary played an important role in shaping the landscape and climate of South America therefore directly influencing the evolutionary history of the organisms of this area over the last million years. These changes led to the alternation between warm and humid, cold and dry periods. Such alternation dictated the dynamics of retraction and expansion of open and forest landscapes. Species associated to these environments evolved following this dynamic, which lead to alteration in genetic conformation, lineage differentiation and even speciation. As in the past, future changes inclimate can modify the landscape causing changes in the geographical distribution of species. In addition, predicted global warming may lead to a decline in genetic diversity as well as lead to extinction due to species' low ability to adapt to drastic and quick changes. In this thesis two regions of mitochondrial DNA (Cytb and 12S) and one nuclear (RAG-1) were used together with coalescing simulations, and ecological niche modelling to access the evolutionary history of a Scinax squalirostris (Lutz, 1925), a species associated to the South American grasslands. In the first chapter, we sought to understand how Neogene and Quaternary geological or climatic events, respectively, may have shaped the current disjunct distribution and the genetic diversity pattern of S. squalirostris. The populations of S. squalirostris were found to have high genetic diversity, with no sign of current gene flow, a high genetic differentiation, and a stable demographic history over time with scattered origin in southern Brazil. Coalescence events date from Pliocene-Pleistocene, with haplotype sharing among geographically distant populations, which indicates incomplete lineage sorting. The paleodistribution models suggests that S. squalirostris lineages were widely distributed during the last glacial maximum (LGM) but afterwards contracting and changing their area of occurrence. These results indicate that the current geographic distribution and genetic diversity of S. squalirostris is due to the contraction of an area widely distributed in the past, generated by the dynamics of retraction of grasslands in warmer periods due to the loss of areas suitable for their occurrence. In the second chapter, we tested the hypothesis that the current populations of S. squalirostris could represent distinct lineages with candidate species not previously described, due to the current disjunct distribution. Using molecular and morphometric data the formation of two groups was rescued. One of them consists in a candidate species to be described, which is a lineage restricted to the Central-West region of Brazil. The other one comprises of populations from the South and Southeast Brazil, Paraguay, Uruguay and Argentina. In the third chapter, ecological niche modelling, molecular techniques and simulations of genetic groups were used to verify how future climate changes could alter the genetic diversity and distribution of S. squalirostris. Through two climatic scenarios with different temperature changes to 2100 (scenario 4.5 RCP increases 1.8 ° C and stabilizes, and scenario 8.5 increases 3.7 ° C and continues to increase), ecological niche modelling analysis indicated a decrease of suitable areas in the Central-West and Southeast regions, with a displacement towards the South of Brazil entering the central region of Argentina towards more anthropized areas. Most of the Central West and Northern Southeast populations may be extinct due to the absence of climatic suitable areas for their occurrence and low genetic diversity. In addition, it was observed that Protections Areas (PAs) currently harbors a large part of the genetic diversity of S. squalirostris. Thus, PAs in areas that will be ideal for the occurrence of S. squalirostris will be able to maintain their high levels of genetic diversity, but with losses of genetic diversity in the Midwest and Southeast regions. This work indicates that future climate changes will negatively affect this species, since the appropriate areas for its occurrence will be reduced and displaced. The loss and changes in genetic clusters may lead to a possible loss of the evolutionary potential of S. squalirostris populations in responding to future climate changes, which could result in the extinction of some populations. / Diferentes eventos, como geológicos do Neógeno e climáticos do Quaternário, tiveram um papel importante com alterações da paisagem e do clima na América do Sul, influenciando diretamente a história evolutiva dos organismos da região nos últimos milhões de anos. Essas mudanças levaram à alternância entre períodos quentes e úmidos com frios e secos, e essa alternância iniciou a dinâmica de retração e expansão de paisagens abertas e florestais. Espécies associadas a essesambientes evoluíram seguindo essa dinâmica, levando a alteração na conformação genética, diferenciação de linhagens e até a especiação. Assim como no passado, mudanças climáticas futuras podem alterar a paisagem causando mudanças na distribuição geográfica das espécies. Além disso, o aquecimento global previsto pode levar a diminuição da diversidade genética e ocasionar a extinção devido à baixa capacidade das espécies de se adaptarem as mudanças drásticas tão rapidamente. Nesta tese utilizou-se duas regiões do DNA mitocondrial (Cytb e 12S) e uma nuclear (RAG-1) juntamente com simulações coalescentes, e de Modelagem de Nicho Ecológico para acessar a história evolutiva de uma espécie de perereca Scinax squalirostris (Lutz, 1925) associada aos Campos (grasslands) Sul-Americanos. No primeiro capítulo buscou-se entender como eventos geológicos do Neógeno e climáticos do Quaternário podem ter moldado a atual distribuição disjunta e o padrão de diversidade genética de S. squalirostris. Encontrou-se que as populações de S. squalirostris possuem alta diversidade genética, com nenhum sinal de fluxo gênico atual, uma alta diferenciação genética e história demográfica estável ao longo do tempo com origem de dispersão no Sul do Brasil. Eventos de coalescência dataram do Plioceno- Pleistoceno, com compartilhamento de haplótipos entre as populações geograficamente distantes, indicando um arranjo incompleto de linhagens. A modelagem de paleodistribuição sugere que as linhagens de S. squalirostris tinham uma ocorrência de ampla distribuição no último máximo glacial (LGM) com contração e mudança de área no período pós-LGM. Tais resultados indicam que a atual distribuição geográfica e diversidade genética de S. squalirostris é devido a contração de uma área amplamente distribuída no passado, gerada pela dinâmica de retração de grasslands nos períodos mais quentes devido à perda de áreas adequadas para sua ocorrência. No segundo capítulo testou-se a hipótese de que as populações atuais de S. squalirostris poderiam representar linhagens distintas, com potencial (is) espécie(s) candidata(s) não descrita(s), devido a atual distribuição disjunta. Com a utilização de dados moleculares e dados morfométricos resgatou-se a formação de dois grupos, sendo um destes com uma espécie a ser descrita, um grupo restrito a região Centro-Oeste do Brasil, e outro grupo abrangendo populações do Sul e Sudeste do Brasil, Paraguai, Uruguai e Argentina. No terceiro capítulo utilizou-se a modelagem de nicho ecológico, juntamente com as análises moleculares e as simulações de agrupamentos genéticos para verificar o quanto as mudanças climáticas futuras poderão alterar a diversidade genética e a distribuição de S. squalirostris. Através de dois cenários climáticos com diferentes alterações na temperatura para 2100 (cenário 4.5 RCP aumenta 1.8oC e estabiliza, e o cenário 8.5 aumenta 3.7°C e continua aumentando), a análise de modelagem de nicho indicou uma diminuição de áreas adequadas na região Centro-Oeste e Sudeste, com um deslocamento em direção ao Sul do Brasil adentrando até a região central da Argentina em direção a áreas mais antropizadas. A maioria das populações do Centro-Oeste e norte da região Sudeste poderão ser extintas devido à ausência de áreas climáticas adequadas para a sua ocorrência e sua baixa diversidade genética. Além disso, foi observado que as Unidades de Conservação (UCs) detêm, atualmente, grande parte da diversidade genética de S. squalirostris. Com as mudanças climáticas previstas, as UCs em áreas que serão ideais para a ocorrência de S. squalirostris conseguirão manter altos níveis de diversidade genética, porém com perdas de diversidade na região Centro-Oeste e Sudeste. Este trabalho indica que as mudanças climáticas futuras afetarão negativamente essa espécie, pois as áreas adequadas para sua ocorrência serão reduzidas e deslocadas. A perda e as alterações nos agrupamentos genéticos, podem levar a uma possível perda do potencial evolutivo das populações de S. squalirostris em responder às mudanças climáticas futuras, o que poderia resultar na extinção de algumas populações.

Made available in DSpace on 2016-04-26T20:28:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Christiane Hessler Furck.pdf: 1312486 bytes, checksum: ca9e863534c78bd81ca049b21c9c7633 (MD5) Previous issue date: 2008-10-29 / The technological advance, the scientific progress, the industrial park and the population accumulations have caused the social-economic development, however they have increased the incidence of the patrimonial risks. Insurance contract corresponds to the social-economical development, however it does not translate one legal transaction only as it can mean an infinity of contractual relations, that involve many different people, in innumerable branches of the insurance market. It occurs that the insurance contract can be translated by contract of civil liability insurance, contract of safety from contractual guarantees, contract of residential insurance, contract of health insurance, contract of enterprise insurance, contract of bail insurance, contract of educational insurance, and the contract of vehicule insurance, the target of this study. In this context, the risk should be deeply analyzed, it will have to be declared by the insured, being certain that it is consolidated through the questionnaire of risk evaluation, which should be part of the the insurance proposal. The questionnaire of risk evaluation is also known as a clause of insured profile and its major goal is to personalise and delimit the risk so that the insurer can accept or refuse the insurance proposal and establish the prize of the insurance. This study also analyzes the positive and negative aspects of the clause of profile ahead of the rules established for the Consumer Defense Code / O avanço tecnológico, o progresso científico, o parque industrial, e os aglomerados populacionais acarretaram o desenvolvimento sócio-econômico, contudo aumentaram a incidência dos riscos sobre o patrimônio. O contrato de seguro corresponde ao desenvolvimento sócio-econômico, contudo não traduz apenas um negócio jurídico, uma vez que pode significar uma infinidade de relações contratuais, que envolvem uma diversidade de pessoas, em inúmeros ramos do mercado securitário. Ocorre que o contrato de seguro pode ser traduzido pelo contrato de seguro de responsabilidade civil, contrato de seguro de garantias contratuais, contrato de seguro residencial, contrato de seguro saúde, contrato de seguro empresarial, contrato de seguro fiança, contrato de seguro educacional e o contrato de seguro automóvel, objeto do presente estudo. Nesse contexto, impende analisar com profundidade o risco que deverá ser declarado pelo segurado, sendo certo que atualmente ele se consolida por meio do questionário de avaliação do risco, constante da proposta de seguro. O questionário de avaliação do risco é também conhecido como cláusula de perfil do segurado e tem o objetivo de individualizar e delimitar o risco, para que o segurador possa aceitar ou recusar a proposta de seguro e estabelecer o prêmio do seguro. O presente estudo analisa ainda os aspectos positivos e negativos da cláusula de perfil diante dos preceitos estabelecidos pelo Código de Defesa do Consumidor

Os camarões do gênero Atya Leach, 1816 são os maiores camarões da família Atyidae, sendo que as 13 espécies reconhecidas estão distribuídas em rios e riachos das regiões tropicais e subtropicais da América (vertentes atlântica e pacífica) e oeste da África. O primeiro relato de uma Atya ocorreu no séc. XVII e, desde então, novas espécies foram descritas e descrições prévias revisadas, produzindo um histórico de instabilidade e reclassificações. Embora ao longo do séc. XX revisões taxonômicas tenham estabilizado a sistemática do gênero, a variabilidade morfológica e distribuição geográfica trans-ístmica da espécie A. innocous gerou questionamentos. Além disso, mais recentemente trabalhos de filogenia molecular da família Atyidae que incluíram representantes de Atya suscitaram questões em relação à sistemática do gênero (possível não monofilia) e de algumas espécies como A. gabonensis, A. margaritacea e A. scabra. Visto que o uso de marcadores moleculares nunca foi empregado para a delimitação das espécies de Atya e que seu uso de forma complementar à morfologia poderia aperfeiçoar a sistemática do gênero, o objetivo do presente estudo foi avaliar por meio de dados moleculares as hipóteses taxonômicas das espécies A. gabonensis, A. innocous, A. margaritacea e A. scabra. Sequências dos genes mitocondriais 16S e Citocromo Oxidase I e gene nuclear Histona 3 foram geradas por meio de protocolos de extração e sequenciamento de DNA a partir do tecido de espécimes obtidos em empréstimos/doações. Potenciais espécies evidenciadas pelas análises de similaridade nucleotídicas (distâncias genéticas), compartilhamento de caracteres em um contexto evolutivo (reconstruções filogenéticas), Automatic Barcode Gap Discovery, Poisson Tree Processes e Generalized Mixed Yule Coalescence foram confrontadas com as hipóteses taxonômicas específicas atuais. A avaliação sistemática com dados moleculares aqui realizada, adicionalmente às informações morfológicas existentes na literatura sustentaram A. gabonensis como uma espécie de distribuição anfi-atlântica, mas não corroborou a hipótese de A. innocous como uma espécie trans-ístmica. Assim, o uso do nome A. innocous para as populações do Mar do Caribe e A. tenella para aquelas restritas ao Pacífico é sugerido. A espécie A. margaritacea, distribuída ao longo da costa pacífica da América foi considerada uma espécie válida e distinta de A. scabra, amplamente distribuída na vertente atlântica da América do Sul, África e Mar do Caribe. Contudo, é discutida a possibilidade de uma espécie críptica restrita no Golfo do México existir. Adicionalmente, o conhecimento existente e pertinente para futuros estudos de sistemática e taxonomia sobre os camarões do gênero Atya foram sumarizados e são apresentados. / The genus Atya Leach, 1816 shrimps are the largest of the Atyidae family, and the 13 acknowledge species are geographically distributed in rivers and stream in the tropical and subtropical regions of America (Atlantic and Pacific drainages) and West Africa. The first registry of an Atya was in the XVII century and since then new species were described and previous description revised in an eventful taxonomic historic. Although throughout the XX century taxonomic revisions stabilized the genus systematics, the morphological variability and the trans-isthmic geographic distribution of A. innocous caused questioning. Moreover, molecular phylogenetic studies that included Atya representatives raised doubt on the genus systematics (possibly non-monophyletism) and some species A. gabonensis A. margaritacea and A. scabra hypothesis. As molecular markers have never been used concerning Atya species delimitation complementary to the morphology and it could improve the genus systematics, the goal of this study was to evaluate with molecular markers the taxonomic hypothesis of the species A. gabonensis, A. innocous, A. margaritacea e A. scabra. Sequences of the mitochondrial genes 16S and Cytochrome Oxidase I and nuclear gene Histone 3 were generated by means of DNA extraction and sequence protocols from specimens obtained in loans/donations. Putative species evidenced by the analysis of nucleotide similarity (genetic distances), character sharing (phylogenetic reconstitutions), Automatic Barcode Gap Discovery, Poisson Tree Processes and Generalized Mixed Yule Coalescence were compared to the prevailing taxonomic hypothesis. The systematic evaluation with the molecular data of this study, in addition with the morphological information in the literature sustain A. gabonensis as an amphi-atlantic distributed species, but do not corroborated A. innocous hypothesis as an trans-isthmian species. In this sense, the use of A. innocous stricto sensu for the Caribbeans Sea populations and A. tenella to that restricted to the pacific drainage of America is suggested. Atya margaritacea, distributed along the pacific drainage of America, is considered a valid species distinct from A. scabra, widespread distributed in the Atlantic drainage of America and Africa, besides Caribbean Sea. However, the possibility of a cryptic species in the Gulf of Mexico population is discussed. Aditionally, the relevant knowledge to future systematic and taxonomy studies about the shrimps of the genus Atya were summarized and are shown.

Delimitar espécies e reconstruir a história evolutiva em complexos de espécies pode demandar grandes esforços uma vez que grupos taxonomicamente problemáticos são muitas vezes consequência de eventos de especiação recente ou de rápida especiação. O complexo \'Cattleya coccinea\', da família Orchidaceae, é composto por orquídeas com alto valor ornamental, epifíticas e rupícolas de porte pequeno. Apesar de estarem descritas com caracteres morfológicos diagnósticos claros que permitem sua identificação, a delimitação das espécies atualmente reconhecidas é problemática. Portanto, os objetivos dessa pesquisa foram revisar a delimitação de espécies do complexo e a relação entre as espécies, além de avaliar a diversidade e estrutura genética, aliadas às análises filogeográficas para testar a ocorrência de eventos demográficos históricos. Para responder tais questões foram utilizadas regiões de sequência de cpDNA e nrDNA, 11 locos microssatélites, além de inferência bayesiana e modelo coalescente somadas às estatísticas tradicionais como metodologia. Os resultados suportam o monofiletismo para o clado para as regiões de cpDNA concatenadas. Indicam também quatro grandes eventos de reticulação das espécies do clado C. coccinea com outras espécies do gênero Cattleya. Adicionalmente, suportam o reconhecimento de sete diferentes espécies para o clado C. coccinea, composto por duas principais linhagens evolutivas mais ao norte da região Sudeste: C. brevipedunculata predominante da Serra do Espinhaço e C. wittigiana do norte da Serra do Mar. E cinco espécies distribuídas ao longo da Serra do Mar e Serra da Mantiqueira (C. coccinea, C. mantiqueirae, e mais três espécies correspondentes às populações de DMES; SJPSP e CSRS/JOSC/PMPR. As análises de diversidade mostraram de moderados a altos níveis de diversidade genética e apontam que as espécies C. coccinea e C. brevipedunculata apresentam os maiores níveis de diversidade comparadas a outras espécies do clado. A estruturação genética entre populações dentro de espécies mostrou variação entre níveis baixos a altos. A análise de atribuição de indivíduos a partir de inferência bayesiana mostrou a formação de oito grupos geneticamente distintos. A análise de taxa de dispersão de fluxo gênico pólen x semente mostrou que a dispersão via pólen é aproximadamente oito vezes mais eficiente que a dispersão via sementes somente para C. coccinea. Além disso, a rede de haplótipos indicou que as espécies raramente compartilham haplótipos e que C. coccinea e C. brevipedunculata apresentam maior diversidade com eventos de expansão. A análise de estimativa de tempo de divergência demonstrou que C. brevipedunculata e C. wittigiana provavelmente se originaram entre o Plioceno e o Pleistoceno. As outras espécies do clado se diversificaram no Pleistoceno. Eventos de expansão populacional foram observados para todas as espécies em eras glaciais do Pleistoceno. Por se tratarem de espécies ameaçadas, esse estudo recomenda a conservação \"in situ\" como também a conservação \"ex situ\" de todas as espécies do clado, com atenção especial às duas espécies do Espírito Santo: C. wittigiana e a espécie da localidade DMES, além da espécie da localidade SJPSP em São Paulo. / Species delimitation and reconstruction of the evolutionary history of species complexes may require great efforts since taxonomically problematic groups are often a result of recent speciation events or rapid speciation. The \'Cattleya coccinea\' complex, of the orchid family, consists of epiphytic and small rupicolous orchids with high ornamental value. Despite being described with clear diagnostic morphological characters that allow their identification, delimitation of the currently recognized species is problematic. Therefore, the objectives of this study were to review the species delimitation of the complex and the relationship between species, and to evaluate the genetic diversity and structure, combined with phylogeographic analyzes to test the occurrence of historical demographic events. To answer such questions, cpDNA and nrDNA sequence regions, 11 microsatellite loci, and Bayesian inference and coalescent model were used, combined with traditional statistics and methodology. The results support the monophyly for the clade for concatenated cpDNA regions. They also indicate four major reticulation events of C. coccinea species clade with other species of the genus Cattleya. Additionally, results support the recognition of seven different species for C. coccinea clade, composed of two main evolutionary lineages further north in the Southeast: C. brevipedunculata predominant in the Serra do Espinhaço and C. wittigiana from northern Serra do Mar. And five species distributed along the Serra do Mar and Serra da Mantiqueira (C. coccinea, C. mantiqueirae, and three other species of the populations DMES; SJPSP and CSRS/JOSC/PMPR. The diversity analyzes showed moderate to high levels of genetic diversity and point out that the species C. coccinea and C. brevipedunculata have the highest levels of diversity compared to other species of the clade. The genetic structure of populations within species showed variation from low to high. Assigning individuals analysis from Bayesian inference showed the formation of eight genetically distinct groups. The dispersal rate analysis of pollen x seed gene flow showed that dispersal through pollen is approximately eight times more efficient than the dispersal through seeds only for C. coccinea. Furthermore, the haplotype network indicated that the species rarely share haplotypes and that C.coccinea and C. brevipedunculata present greater diversity with expansion events. The divergence time estimation analysis showed that C. brevipedunculata and C. wittigiana probably originated between the Pliocene and the Pleistocene. The other clade species have diversified in the Pleistocene. Population expansion events were observed for all species in the Pleistocene ice ages. Because they are endangered species, this study recommends the \"in situ\" conservation as well as \"ex situ\" conservation for all species of clade, with special attention for two species of Espírito Santo: C. wittigiana and the species of DMES locality, in addition to the species of SJPSP location in São Paulo.

Orientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Resumo: Thoropa Cope, 1865 (Anura: Cycloramphidae) é um gênero de rãs endêmicas do domínio Mata Atlântica e de ecótonos associados. Possui atualmente seis espécies (T. miliaris, T. petropolitana, T. taophora, T. lutzi, T. megatympanum e T. saxatilis), divididas em dois grupos morfológicos: grupo petropolitana (T. petropolitana e T. lutzi) e grupo miliaris (T. miliaris, T. taophora, T. megatympanum e T. saxatilis). Todas as espécies se reproduzem e se desenvolvem em rochas molhadas de água doce, encontradas em afloramentos rochosos, cachoeiras e riachos. Um estudo recente sobre a filogenia molecular mostrou que T. miliaris é parafilética a T. taophora, e que T. taophora, T. megatympanum e T. saxatilis são monofiléticas com alto suporte (Sabbag et al. 2018). Esse estudo também encontrou diversos clados dentro de cada uma das espécies, especialmente em T. miliaris. Porém, não foi possível estudarem molecularmente as espécies do grupo petropolitana porque existe apenas uma amostra de DNA disponível para o grupo. No presente trabalho, estudamos aspectos genéticos e morfológicos das seis espécies do gênero a fim de investigar a diversidade molecular previamente encontrada, a parafilia de T. miliaris e as características morfológicas das espécies que coincidam com a diversidade genética conhecida. Encontramos que os clados conhecidos de T. miliaris são linhagens evoluindo separadamente e que os clados conhecidos de T. taophora fazem parte de uma linhagem única. Thoropa miliaris e T. taophor... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Thoropa Cope, 1865 (Anura: Cycloramphidae) is a frog genus endemic to theAtlantic forest domain and associated ecotones. It comprises six species (T. miliaris, T. petropolitana, T. taophora, T. lutzi, T. megatympanum and T. saxatilis), divided in two morphological groups: petropolitana group (T. petropolitana and T. lutzi) and miliaris group (T. miliaris, T. taophora, T. megatympanum and T. saxatilis). All the species reproduce and develop in freshwater wet rocks that can be found in rock outcrops, waterfalls and streams. A recent study on molecular phylogeny has shown that T. miliaris is paraphyletic in respect to T. taophora and that T. taophora, T. megatympanum and T. saxatilis are monophyletic with high support. This study also found many clades inside each of those species, especially within T. miliaris. Nevertheless, it was not possible to study molecular aspects of the petropolitana group because there is only one DNA sample available for the group. In this work, we studied genetic and morphological aspects of all six species of the genus in order to investigate the molecular diversity found previously, the paraphyly found for T. miliaris, and the species morphological characteristics that coincide with the known genetic diversity. We found that the known clades of T. miliaris are separately evolving lineages and that the clades of T. taophora are part of a whole lineage. Thoropa miliaris and T. taophora are reciprocally monophyletic. We also found that the diversifica... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Fernando Fernandes Mendonça / Resumo: A atividade pesqueira desempenha um importante papel ambiental e socioeconômico, pois é fonte de renda e alimento para milhões de pessoas no mundo. Entretanto, falhas em sua gestão e lacunas nos dados biológicos para muitas espécies, tem resultado na sobreexplotação de seus estoques, o que pode impactar diversos ecossistemas marinhos. Neste contexto, os peixes-de-bico, grupo formado pelas famílias Xiphiidae e Istiophoridae, são considerados valiosos recursos pesqueiros, porém ainda não há consenso sobre o número e a validade das espécies da família Istiophoridae e também há incertezas sobre a avaliação atual de seus estoques. Sendo assim, o objetivo deste estudo é o de delimitar as espécies da família Istiophoridae e os estoques genéticos do agulhão-vela Istiophorus platypterus no Oceano Atlântico utilizando marcadores moleculares mitocondriais. Entre os resultados dos testes de delimitação de espécies, o número variou entre 6 e 12 táxons possíveis, dependendo do teste aplicado. Em relação a delimitação dos estoques genéticos de I. platypterus no Atlântico, assumindo-se apenas uma espécie no gênero Istiophorus, nossos resultados apontam a existência de alta diversidade genética, componde um único estoque genético no Atlântico (ΦST=0,01121, p=0,02438), apresentando um alto fluxo gênico. Porém, pela análise da rede de haplótipos e da inferência bayesiana observa-se a existência de diferentes linhagens mitocondriais simpátricas, que divergiram durante o Mioceno Superior e foram ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Fishing activity plays an important environmental and socio-economic role, as it is a source of income and food for millions of people worldwide. Although, shortcomings in management and gaps in biological data for many species resulted in the overexploitation of their stocks, which may impact several marine ecosystems. In this context, billfishes, a group compounded by the Xiphiidae and Istiophoridae families, are considered valuable fish resources, but there is still no consensus on the number and validity of the species of Istiophoridae family and there are also uncertainties about the current fisheries stocks assessments. Thus, the main objectives of this study are to delimit the species of the Istiophoridae family and the genetic stocks of the sailfish, Istiophorus platypterus, in the Atlantic Ocean using mitochondrial molecular markers. Among the species delimitation tests results, the number ranged from 6 to 12 possible taxa depending on the test applied. In order to determine the genetic stock of I. platypterus in the Atlantic Ocean, assuming only one species in the genus Istiophorus, our results point to the existence of high genetic diversity, comprising a single genetic stock in the Atlantic (ΦST = 0.01121, p = 0.02438), presenting a high gene flow. However, the analysis of the network of haplotypes and Bayesian inference shows the existence of different sympatric mitochondrial lines, which diverged during the Upper Miocene and were re-approximated, interrupting th... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Submitted by Oliveira Santos Dilzaná (dilznana@yahoo.com.br) on 2016-03-15T14:35:17Z No. of bitstreams: 1 Ana Carolina de Aguiar Rodrigues (tese).pdf: 7045279 bytes, checksum: e8a05978f34f04a4419e4c6154a9b2dc (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Portela (anapoli@ufba.br) on 2016-03-28T18:08:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Ana Carolina de Aguiar Rodrigues (tese).pdf: 7045279 bytes, checksum: e8a05978f34f04a4419e4c6154a9b2dc (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-28T18:08:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ana Carolina de Aguiar Rodrigues (tese).pdf: 7045279 bytes, checksum: e8a05978f34f04a4419e4c6154a9b2dc (MD5) / CAPES / No estágio atual da agenda de pesquisa sobre vínculos com a organização, esforços têm sido empreendidos para revisar conceitos que, ao longo do tempo, acumularam questões teóricas e empíricas que ameaçam a validade dos resultados encontrados. Dentro dessa tendência mais ampla, estudos têm sido voltados para a revisão do modelo tridimensional do comprometimento proposto por J. Meyer e N. Allen, guiados pelo argumento de que esse modelo reúne mais de um tipo de vínculo. Um dos principais pontos de análise tem sido a pertinência da dimensão de continuação, que apresenta base teórica e comportamento semelhante ao entrincheiramento organizacional. A presente pesquisa buscou percorrer um caminho metodológico que possibilitasse alcançar maiores compreensão, precisão e delimitação desses construtos. Após a revisão e refinamento das medidas do entrincheiramento organizacional e do comprometimento de continuação, foram comparados seus modelos explicativos. Os resultados apontaram para o mesmo padrão de relação quando confrontados os modelos do entrincheiramento e da base de continuação, evidenciando validade convergente. Confirmada a hipótese de que a base de continuação é sobreposta ao entrincheiramento, e de que ambos se distinguem do comprometimento afetivo, foram identificados e discriminados quatro grupos com diferentes níveis de entrincheiramento e comprometimento organizacional: sentinela de oportunidades (níveis medianos dos vínculos), transeunte organizacional (níveis baixos dos vínculos), cidadão livre (alto comprometimento e baixo entrincheiramento) e prisioneiro colaborativo (alto comprometimento e alto entrincheiramento). Desses grupos, foram extraídos casos representativos para uma investigação qualitativa da dinâmica dos vínculos com a organização, com base em narrativas profissionais. Após as análises detalhadas de cada caso, foi elaborado um modelo teórico que reúne variáveis pessoais e organizacionais, além das trajetórias percorridas, que contribuem para a formação das diferentes configurações de vínculo. Conclui-se que o entrincheiramento e o comprometimento são vínculos distintos, que podem ser combinados em diferentes padrões, construídos com base em características pessoais e em experiências vivenciadas na organização. Esses padrões demonstraram a capacidade de ampliar o poder explicativo dos vínculos em comparação ao seu tratamento isolado. Ao término deste estudo, verifica-se o alcance de maior delimitação teórica e empírica do comprometimento e do entrincheiramento. As estratégias metodológicas aqui empregadas poderão ser retomadas e incrementadas em estudos futuros, contribuindo para maiores avanços teóricos e aplicações práticas dos vínculos com a organização. On the current agenda of research on organizational attachments, efforts have been made in order to review concepts which have accumulated theoretical and empirical issues, therefore, threatening the validity of the results of several of these studies. Following a broader perspective, other studies have revised the three-dimensional model of commitment proposed by J. Meyer e N. Allen. These other studies have been guided by the argument that this model included more than one type of bond. One of the key issues is the pertinence of the continuance commitment, which is characterized by similar behavior and theoretical basis, if compared to organizational entrenchment. This research intended to follow a methodological pathway which would enable the researcher reach a better understanding, precision and delimitation of these constructs. After reviewing and refining the measures of organizational entrenchment and continuation commitment, their explanatory models were compared. Results indicated the same pattern of relationship between the models of entrenchment and continuance dimension, evincing a convergent validity. Therefore, not only the hypothesis that the continuance dimension overlaps entrenchment was confirmed, but also that both are distinct from affective commitment. Four groups in different levels of entrenchment and organizational commitment were identified and discriminated: sentinel of opportunities (average levels of attachment), organizational passerby (low levels of attachment), free citizen (high level of commitment and low entrenchment) and collaborative prisoner (high level of commitment and high entrenchment). Representative cases were taken from these groups for a qualitative investigation of the dynamics of bonds in the organization, based on the narratives of the professionals. After a detailed analysis of each case, a theoretical model including personal and organizational variables, and also trajectories lived - which have contributed to the formation of different settings of bonds - was elaborated. It was concluded that entrenchment and commitment are distinct bonds, which can be combined in different patterns, built based on personal characteristics and experiences lived in the organization. These patterns demonstrate the ability of this study to increase the explanatory power of bonds, when compared to their isolated treatment. At the end of this study, the significance of a major theoretical and empirical delimitation of commitment and entrenchment was verified. The methodological strategies used here may be incorporated and improved in future studies, contributing to greater theoretical advances and practical applications of attachments in the organization.

Os camarões do gênero Atya Leach, 1816 são os maiores camarões da família Atyidae, sendo que as 13 espécies reconhecidas estão distribuídas em rios e riachos das regiões tropicais e subtropicais da América (vertentes atlântica e pacífica) e oeste da África. O primeiro relato de uma Atya ocorreu no séc. XVII e, desde então, novas espécies foram descritas e descrições prévias revisadas, produzindo um histórico de instabilidade e reclassificações. Embora ao longo do séc. XX revisões taxonômicas tenham estabilizado a sistemática do gênero, a variabilidade morfológica e distribuição geográfica trans-ístmica da espécie A. innocous gerou questionamentos. Além disso, mais recentemente trabalhos de filogenia molecular da família Atyidae que incluíram representantes de Atya suscitaram questões em relação à sistemática do gênero (possível não monofilia) e de algumas espécies como A. gabonensis, A. margaritacea e A. scabra. Visto que o uso de marcadores moleculares nunca foi empregado para a delimitação das espécies de Atya e que seu uso de forma complementar à morfologia poderia aperfeiçoar a sistemática do gênero, o objetivo do presente estudo foi avaliar por meio de dados moleculares as hipóteses taxonômicas das espécies A. gabonensis, A. innocous, A. margaritacea e A. scabra. Sequências dos genes mitocondriais 16S e Citocromo Oxidase I e gene nuclear Histona 3 foram geradas por meio de protocolos de extração e sequenciamento de DNA a partir do tecido de espécimes obtidos em empréstimos/doações. Potenciais espécies evidenciadas pelas análises de similaridade nucleotídicas (distâncias genéticas), compartilhamento de caracteres em um contexto evolutivo (reconstruções filogenéticas), Automatic Barcode Gap Discovery, Poisson Tree Processes e Generalized Mixed Yule Coalescence foram confrontadas com as hipóteses taxonômicas específicas atuais. A avaliação sistemática com dados moleculares aqui realizada, adicionalmente às informações morfológicas existentes na literatura sustentaram A. gabonensis como uma espécie de distribuição anfi-atlântica, mas não corroborou a hipótese de A. innocous como uma espécie trans-ístmica. Assim, o uso do nome A. innocous para as populações do Mar do Caribe e A. tenella para aquelas restritas ao Pacífico é sugerido. A espécie A. margaritacea, distribuída ao longo da costa pacífica da América foi considerada uma espécie válida e distinta de A. scabra, amplamente distribuída na vertente atlântica da América do Sul, África e Mar do Caribe. Contudo, é discutida a possibilidade de uma espécie críptica restrita no Golfo do México existir. Adicionalmente, o conhecimento existente e pertinente para futuros estudos de sistemática e taxonomia sobre os camarões do gênero Atya foram sumarizados e são apresentados. / The genus Atya Leach, 1816 shrimps are the largest of the Atyidae family, and the 13 acknowledge species are geographically distributed in rivers and stream in the tropical and subtropical regions of America (Atlantic and Pacific drainages) and West Africa. The first registry of an Atya was in the XVII century and since then new species were described and previous description revised in an eventful taxonomic historic. Although throughout the XX century taxonomic revisions stabilized the genus systematics, the morphological variability and the trans-isthmic geographic distribution of A. innocous caused questioning. Moreover, molecular phylogenetic studies that included Atya representatives raised doubt on the genus systematics (possibly non-monophyletism) and some species A. gabonensis A. margaritacea and A. scabra hypothesis. As molecular markers have never been used concerning Atya species delimitation complementary to the morphology and it could improve the genus systematics, the goal of this study was to evaluate with molecular markers the taxonomic hypothesis of the species A. gabonensis, A. innocous, A. margaritacea e A. scabra. Sequences of the mitochondrial genes 16S and Cytochrome Oxidase I and nuclear gene Histone 3 were generated by means of DNA extraction and sequence protocols from specimens obtained in loans/donations. Putative species evidenced by the analysis of nucleotide similarity (genetic distances), character sharing (phylogenetic reconstitutions), Automatic Barcode Gap Discovery, Poisson Tree Processes and Generalized Mixed Yule Coalescence were compared to the prevailing taxonomic hypothesis. The systematic evaluation with the molecular data of this study, in addition with the morphological information in the literature sustain A. gabonensis as an amphi-atlantic distributed species, but do not corroborated A. innocous hypothesis as an trans-isthmian species. In this sense, the use of A. innocous stricto sensu for the Caribbeans Sea populations and A. tenella to that restricted to the pacific drainage of America is suggested. Atya margaritacea, distributed along the pacific drainage of America, is considered a valid species distinct from A. scabra, widespread distributed in the Atlantic drainage of America and Africa, besides Caribbean Sea. However, the possibility of a cryptic species in the Gulf of Mexico population is discussed. Aditionally, the relevant knowledge to future systematic and taxonomy studies about the shrimps of the genus Atya were summarized and are shown.