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INTERAÇÃO GENÓTIPOS POR AMBIENTES E DIVERGÊNCIA GENÉTICA EM GENÓTIPOS DE FEIJOEIRO (Phaseolus vulgaris L.) / INTERACTION GENOTYPES IN ENVIRONMENTS AND DIVERGENCE GENETIC BEAN GENOTYPES (Phaseolus vulgaris L.)

Correa, Agenor Martinho 22 February 2008 (has links)
Submitted by Cibele Nogueira (cibelenogueira@ufgd.edu.br) on 2016-08-29T20:03:12Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) AGENORCORREA.pdf: 4200877 bytes, checksum: 9bbd91a7ee4fb6d49631c8ad58345c05 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-29T20:03:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) AGENORCORREA.pdf: 4200877 bytes, checksum: 9bbd91a7ee4fb6d49631c8ad58345c05 (MD5) Previous issue date: 2008-02-22 / In this work were studied two main aspects of the common bean breeding: a) - Genotype by environment interaction (Chapter 1) and; b) – Genetic divergence (Chapter 2). The trials were carried out at the experimental Campus at the Universidade Estadual de Mato Grosso do Sul, in Aquidauana and at the Universidade Federal da Grande Dourados, in Dourados-MS, in the period from 2000/2001 to 2005/2006, in the “dry” and “rain” harvest, composing a total of 12 environments, where each environment was characterized by the combination of local x year x crop season. There were thirteen genotypes of common bean assessed in randonized blocks, with three replications per treatment, where each genotype became a treatment. In the study of the genotype by environment interaction the parameters of adaptability and stability of the genotypes were estimated by traditional and multivariate analysis methods, in each trial experimental environment, searching to compare results and efficiency of these methodologies in discrimination of genotypes face to variation of the environment. The pattern analysis was used to identify and group genotypes with similar responses in all environments as well as environments that discriminate similarly the genotypes. The study allowed discriminate genotypes whit high performance, broad adaptation and good predictability of response that may be recommended to favorable and unfavorable environment, in general, and genotypes of less predictability behaviour, whith specific adaptation to certain environments. Multivariate analysis techniques were also used in the study of genetic divergence aiming the formation of genotypes groups based on the genetic distance among them. The study of genetic divergence identified dissimilar groups of genotypes that based on agronomic characters of interest, may be employed in hybridizations, in breeding programs, that are designated to acquisition of hybrids with heterosis, which in combination, can generate populations of broad genetic base. / Neste trabalho foram estudados dois aspectos fundamentais do melhoramento genético do feijoeiro: a) Interação genótipos por ambientes (Capítulo 1) e b) Divergência genética (Capítulo 2). Os ensaios foram desenvolvidos nas áreas experimentais da Universidade Estadual de Mato Grosso do Sul, Unidade Universitária de Aquidauana, e da Universidade Federal da Grande Dourados, em Dourados, durante os anos agrícolas 2000/2001 a 2005/2006, nas épocas de cultivo “da seca” e “das águas”, perfazendo um total de 12 ambientes sendo cada ambiente caracterizado pela combinação de local x época de cultivo x ano agrícola. Foram avaliados 13 genótipos de feijoeiro comum no delineamento experimental de blocos ao acaso, com três repetições para cada tratamento, constituindo-se cada genótipo num tratamento. No estudo da interação genótipos por ambientes os parâmetros de adaptabilidade e estabilidade dos genótipos foram estimados por técnicas tradicionais e técnica de análise multivariada, em cada um dos ambientes experimentais, procurando-se comparar resultados e eficiência dessas metodologias na discriminação de genótipos face às variações de ambientes. A análise de padrões foi empregada para identificar e agrupar genótipos com respostas similares em todos os ambientes e ambientes que discriminam de forma semelhante os genótipos. O estudo permitiu discriminar genótipos com bom desempenho, ampla adaptação e previsibilidade de comportamento que poderão ser recomendados, de forma generalizada, para os locais e épocas de cultivos avaliados e, genótipos de comportamento menos previsível, com adaptação específica para certas condições de cultivo. Técnicas de análise multivariada foram também empregadas no estudo da divergência genética objetivando a formação de grupos de genótipos com base na distância genética entre eles. Este estudo permitiu identificar grupos dissimilares de genótipos que, em função dos caracteres de interesse agronômico, poderão ser empregados em hibridações em programas de melhoramento que visem obter híbridos com maior efeito heterótico, que, em combinações, possam gerar populações de base genética ampla.
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Utilização de técnicas multivariadas na análise da divergência genética via modelo AMMI com reamostragem \"bootstrap\" / Use of multivariate techniques in the analysis of genetic diversity through ammi model with bootstrap resampling

Priscila Neves Faria 01 October 2012 (has links)
Em estudos de divergência genética por métodos multivariados, a distância euclidiana é a medida de distância mais amplamente utilizada e essa distância é a mais recomendada quando as unidades de cálculos são escores de componentes principais, como é o caso da análise AMMI (additive main effects and multiplicative interaction analysis). Tal análise permite a obtenção de estimativas mais precisas das respostas genotípicas e possibilita a análise da divergência genética por métodos aglomerativos. A análise dos modelos AMMI combina, num único modelo, componentes aditivos para os efeitos principais (genótipos e ambientes) e componentes multiplicativos para os efeitos da interação genótipos × ambientes. Os melhoristas de plantas compreendem que a interação genótipos × ambientes é de suma importância para a obtenção de variedades superiores e as estimativas de dissimilaridade atendem aos objetivos do melhorista, por quantificarem e informarem sobre o grau de semelhança ou de diferença entre pares de indivíduos. Entretanto, quando o número de indivíduos é grande, torna-se inviável o reconhecimento de grupos homogêneos pelo exame visual das estimativas de distância. Portanto, é importante proceder à análise de agrupamentos, obter dendrogramas por meio de métodos hierárquicos e posteriormente, analisar os grupos formados. A fim de determinar e classificar os grupos formados na clusterização hierárquica foram utilizados comandos específicos do programa computacional R que desenha no dendrograma os retângulos de cada grupo e os numera. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi analisar a divergência genética via modelo AMMI, utilizando-se de técnicas multivariadas e reamostragem \"bootstrap\". / In studies of genetic diversity using multivariate approaches, the Euclidean distance is the most common measure used. This method is recommended when data are scores of principal components, such as in AMMI analysis (additive main effects and multiplicative interaction analysis). The AMMI method allows obtaining more precise estimates for genotypic results and also permits the use of genetic diversity analysis by using agglomerative approaches. Furthermore, this method combines additive components for the main effects (genotypes and environments) and multiplicative components for genotypes x environment interaction effects in a unique model. Plant breeders understand the importance of genotype and environment interaction to obtain superior varieties and the dissimilarity estimation meets breeders\" objectives since it quantifies and determines the similarity or the divergence between pairs of individuals. However, when the number of individuals is large it is unfeasible to recognize the group homogeneity by using a visual analysis of the distances estimation. Therefore, is important to use cluster analysis to obtain dendograms based on hierarchical methods and then analyze the groups obtained. In order to determine and classify the obtained groups from hierarchical cluster analysis specifics commands in the R software were used which shows in the dendrogram rectangles and numbers for each group. In this way, the objective of this work was to analyze the genetic divergence through AMMI model, by using multivariate approaches and \"bootstrap\" resampling.
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Avaliação de linhagens de soja derivadas de dois cruzamentos com diferentes níveis de divergência genética / Evaluation of soybean lines derived from two crosses with different levels of genetic divergence

Fernando Hoshino Shirahige 05 September 2014 (has links)
Existem poucas informações relacionadas com a comparação de populações de soja derivadas de cruzamentos com diferentes níveis de divergência genética (DG). Os objetivos deste trabalho foram comparar o desempenho de duas populações de soja derivadas de genitores com baixa e alta DG. Foram realizados dois cruzamentos com genitores diferindo quanto à divergência genética baseada em marcadores moleculares AFLP: baixa DG (IAC-12 x IAC-100) e alta DG (EMBRAPA-60 x EMGOPA-315). Para cada cruzamento foram obtidas 100 progênies F2:3, que foram avaliadas experimentalmente em três ambientes e, posteriormente, selecionadas as 25 progênies mais produtivas. Em seguida foram obtidas 10 linhas puras F5:7 de cada uma das 25 progênies, originando aproximadamente 250 linha puras de cada cruzamento. No ano agrícola 2012/13 foram conduzidos os experimentos de avaliação, utilizando um delineamento em parcelas subdivididas, onde as progênies foram alocadas nas parcelas e as linhas puras dentro de progênies nas subparcelas, e as parcelas arranjadas em um látice balanceado 5x5 (seis repetições). As subparcelas foram constituídas de linhas de 2 m, espaçadas de 0,5 m, contendo 30 plantas após o desbaste. Os caracteres avaliados foram: número de dias para a maturação (DM), altura das plantas na maturação (AM), acamamento (AC) e produção de grãos (PG). A partir da análise de variância foram estimados os seguintes parâmetros para cada cruzamento: média geral, amplitude de variação das médias das linhas puras dentro de progênies, variância genética entre linhas puras dentro de progênies (?^2l/p ), variância fenotípica entre médias de linhas puras dentro de progênies (?^2/ F (l/p) ), coeficiente de herdabilidade entre médias de linhas puras (h ^2/X(l/p) ) e resposta esperada com seleção (Rs). Para todos os caracteres, as médias gerais foram maiores para o cruzamento de maior DG. Para PG, AM e DM as estimativas das variâncias genéticas entre linhas puras dentro de progênies F5:7 foram maiores no cruzamento de maior DG, bem como as amplitudes de variação das médias das linhas puras. Consequentemente, a resposta esperada com seleção entre médias de linhas puras dentro de progênies para PG foi 47,6% maior, em média, bem como a proporção de linhas puras de alta produção, para o cruzamento de maior DG. Os resultados deste trabalho indicam que o uso das medidas de divergência baseada em marcadores moleculares AFLP na escolha de genitores para cruzamentos pode ser uma ferramenta útil para reduzir o número de cruzamentos e, consequentemente, aumentar a eficiência da seleção para produção de grãos em soja. / There is limited information in relation to comparison of populations derived from crosses with different levels of genetic divergence (DG) in soybeans. This work was carried out to compare the performance of two soybean populations derived from parents with low and high DG. From two two-way crosses of soybeans with different levels of AFLP molecular marker genetic divergence (DG): low DG (IAC-12 x IAC-100) and high DG (EMBRAPA-60 x EMGOPA-315), one hundred F2:3 progenies were evaluated in three environments and then selected the 25 high yielding progenies. Ten inbred lines were derived in the generation F5:7 from each of 25 high yielding progeny giving rise to approximately 250 inbred lines for each cross. Evaluation trials were carried out in the 2012/13 growing season, using a split plot design, where progenies were allocated in the plots and inbred lines within progenies in the subplots, and plots arranged according to a 5x5 balanced lattice (six replications). Subplots consisted of 2 m rows spaced by 0.5 m, with 30 plants after thinning. The following traits were recorded: number of days to maturity (DM), plant height at maturity (AM), lodging (AC) and grain yield (PG). The following parameters were estimated: general mean, amplitude of variation of inbred lines within progenies means, genetic variance of inbred lines within progenies ( ?^2 l/p ), phenotypic variance on inbred lines within progenies mean basis ( ?^ 2 F(l/p) ), heritability coefficients on inbred line mean basis ( h ^2 X(l/p) ) and expected response to selection (Rs) on inbred line mean basis. For all traits, general means were higher for the high DG cross. For PG, AM and DM, genetic variance among inbred lines within F5:7 progenies were higher for the high DG cross, as well as the amplitude of variation of inbred line means. As a result, expected response to selection for grain yield (PG) was 47.6% higher, on average, as well as the proportion of high yielding inbred lines for the high DG cross. General results indicate that the use of genetically divergent parents based on AFLP molecular markers for choosing parents for crossings can be useful to reduce the number of crossings, and thus, to improve the efficiency of selection for grain yield in soybeans.
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Caracterização molecular por AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) de acessos de pinhão manso (Jatropha curcas L.) / Molecular Characterization by AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) in accessions of physic nut (Jatropha curcas L.)

Redondo, Mariana Letícia Costa 09 June 2011 (has links)
O pinhão-manso (Jatropha curcas L.) é uma planta versátil e com diversos usos potenciais em especial para produção de biodiesel. O óleo obtido de suas sementes é seu produto mais rentável e atualmente desperta grande interesse econômico em diversos setores. A caracterização molecular e a avaliação do potencial reprodutivo dos acessos de pinhão-manso são aspectos ainda pouco abordados no Brasil, sendo necessária a caracterização de acessos brasileiros e suas potencialidades. Os objetivos do presente trabalho foram analisar a diversidade genética e a divergência genética em acessos comerciais de pinhão-manso, coletados no estado de São Paulo (Alvinlândia, Lins, Itatinga e Jales), Minas Gerais (Janaúba) e Mato Grosso do Sul (Dourados). Primeiramente, foram comparadas as técnicas de RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), RAPD-RFLP (Restrinction Fragment Length Polymorphism a partir do RAPD) e AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism), quanto à potencialidade de detectar polimorfismos dentro dos acessos e entre os acessos. Posteriormente, os acessos foram caracterizados através de AFLP. Além disso, este trabalho visou detectar se há diferença nas estruturas e no desenvolvimento floral e na taxa de viabilidade polínica dos acessos de São Paulo (Alvinlândia), Minas Gerais e Mato Grosso do Sul. Nessa parte do estudo, foram analisadas e identificadas as estruturas dos órgãos florais e do grão de pólen através das técnicas de microscopia de luz, eletrônica de varredura e transmissão. Na comparação entre as técnicas moleculares, apenas AFLP permitiu a detecção de polimorfismos, com base em um acesso escolhido para os testes (Alvinlândia, SP). As análises de todos acessos através de AFLP mostraram considerável polimorfismo, que foi refletido nas estimativas de diversidade genética de Nei e Índice de Shannon. Na análise de agrupamento, as amostras de cada acesso foram agrupadas coerentemente. Os acessos de Dourados e de Itatinga formaram um grupo separado, apresentando cerca de 76% de similaridade com o segundo grupo (Alvinlândia, Jales, Lins, Janaúba). Dentro deste último, os acessos de São Paulo ficaram agrupados (com cerca de 84% de similaridade), enquanto que Janaúba mostrou-se separado, com 82% de similaridade genética. Estes resultados indicam que os acessos de São Paulo provavelmente tenham origem a partir de Janaúba. No entanto, Itatinga provavelmente tenha origem a partir de Dourados. Quanto à morfologia floral, não foi observada nenhuma diferença a nível microscópico na formação e nas estruturas dos órgãos florais. Quando comparada a viabilidade polínica entre os dois acessos coletados em campo (Minas Gerais e Mato Grosso do Sul), notou-se que há diferença significativa na taxa de viabilidade, mesmo os valores sendo muito próximos (Mato Grosso do Sul - 81,91% e Minas Gerais - 77,20%), mostra que tanto os acessos de Minas Gerais como os de Mato Grosso do Sul podem ser utilizados como parentais masculinos em programas de melhoramento genético. A divergência genética moderada e a baixa variabilidade morfológica sugerem que coletas de materiais em poucos locais poderiam representar a diversidade genética da espécie. Estudos mais aprofundados, empregando técnicas como de microssatélites e mais acessos, são 11 necessários para o conhecimento da diversidade e estrutura genética do pinhão-manso no Brasil / Physic nut (Jatropha curcas L) is a very versatile plant with several potential uses especially for the production of biodiesel. The oil obtained from its seeds is the most profitable product of this specie and it is currently attracting great interest in various economic sectors. Molecular characterization and evaluation of reproductive potential of the accessions of pysic nut have still little attention in Brazil, it still need the characterization of Brazilian accessions and its potenciality. The ains of this study were: to analyze the genetic diversity and genetic divergence in commercial accessions of physic nut, from the States of São Paulo (Alvinlândia, Lins, Jales and Itatinga), Minas Gerais (Janaúba)and Mato Grosso do Sul (Dourados). Firstly we compared the RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) RAPD-RFLP (Fragment Length Polymorphism Restriction from RAPD) and AFLP (Amplified Fragment Length Polymprphism) regarding the potencial to detect polymorphism within the accessions and among accessions. Subsequently, the accessions were characterized by AFLP. Moreover this work aimed to detect whether there are differenced on flower structures and development and the rate of pollen viability on the accessions of São Paulo (Alvinlândia), Minas Gerias and Mato Grosso do Sul. On this part of the study were analysed and identified the structures of the floral organs and pollen grain through the techniques of, light microscopy, scanning electron and transmission microscopy. Comparing the molecular techniques, only AFLP allowed the detection of polymorphisms based on the accession chosen for testing (Alvinlândia, SP). Analyses of all accesses by AFLP showed considerable polymorphism, wich was reflected in estimates of genetic diversity index of Nei and Shannon. In cluster analysis, samples of each accessions were grouped consistently. The accessions of Dourados and Itatinga formed a separated group, with approximately 76% similarity with the second group (Alvinlândia, Jales, Lins, Janaúba). Within the last, accessions of São Paulo werte grouped (about 84% similarity), while Janaúba showed p separately, with 82% of genetic similarity. These results indicates that the accessions of São Paulo probably originates from Janaúba. However Itatinga probably originates from Dourados. As floral morphology, we observed no difference at microscope level on the formation and on the structures of floral organs. When compared the pollen grain viability between the two accessions collected in the field (Minas Gerais and Mato Grosso do Sul), it was noted that the viability rated were significantly different, even though the values being very close (Mato Grosso do Sul Minas Gerais 81,91% - 77,20%), shows that both the accessions of Minas Gerais as the Mato Grosso do Sul can be used as male parental in breeding programs. The moderate and low genetic divergence suggests that morphological variability collections of materials in a few locations could represent the genetis diversity of the species. Further studies employing techniques such as microsatellite and more accessions are required for an understanding of diversity and genetic structure of physic nut in Brazil
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Análises multivariadas aplicadas na seleção de famílias nas fases iniciais do melhoramento genético de cana-de-açúcar

SOUZA, Amanda Emanuella Rocha de 28 February 2011 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-06T15:06:17Z No. of bitstreams: 1 Amanda Emanuella Rocha de Souza.pdf: 766052 bytes, checksum: e66d6d097fb12f1804e1c7916b3dd834 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-06T15:06:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Amanda Emanuella Rocha de Souza.pdf: 766052 bytes, checksum: e66d6d097fb12f1804e1c7916b3dd834 (MD5) Previous issue date: 2011-02-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The aim of this study was to evaluate sib families with potential sugarcane production and earliness in maturity, in order to select individuals for use in breeding and commercial. The experimental design was randomized blocks with four blocks and ten families of sugar cane. The experiment was carried out in the agricultural area in sugar mill São José - Igarassu/PE, during the agricultural year 2009/2010. Were evaluated the characters mean number of culms (NMC), mean diameter culms (DMC), mean height of culms (AMC), mean weight of culms (PMC), tons of cane per hectare (TCH), tons per hectare of pol (TPH), brix tons per hectare (TBH), pol in cane (PC), brix in sugar cane (BC), % cane fiber (FIB), total recoverable sugar (ATR) and pure cane (PUR). The analysis of variance was performed for all the characters and the means were grouped by Scott and Knott test (1974), 5% of probability (p<0.05). The multivariate analysis was used to quantify the genetic divergence. The Mahalanobis distance was used as dissimilarity measure. Were applied the hierarchical method of the average linkages (UPGMA) and the optimization method of Tocher. Were estimated the phenotypic path analysis. Families FA-2, FA-3, FA-5, FA-8 and FA-9, can be selected for production of sugarcane and sugar. The results based on brix families indicated FA-4 FA-5 FA-6 FA-10 and with a tendency to early maturity. The use of pairs of different families can be recommended for use in improving opportunities to provide new combinations with success in the selection. Indirectly, the selection of families for the production of cane and sugar can be done by the average number of culms. / Objetivou-se com este trabalho avaliar famílias de irmão germanos com potencial de produção de cana e precocidade na maturação, visando a seleção de indivíduos para uso no melhoramento e comercial. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos ao acaso com quatro blocos e dez famílias de cana-de-açúcar. O experimento foi conduzido na área agrícola da Usina São José - Igarassu/PE, durante o ano agrícola de 2009/2010. Foram avaliados os caracteres número médio de colmos (NMC), diâmetro médio de colmos (DMC), altura média de colmos (AMC), peso médio de colmos (PMC), toneladas de cana por hectare (TCH), toneladas de pol por hectare (TPH), toneladas de brix por hectare (TBH), pol na cana (PC), brix na cana (BC), fibra % cana (FIB), açúcar total recuperável (ATR) e pureza na cana (PUR). A análise de variância foi realizada para todos os caracteres e as médias foram agrupadas pelo teste de Scott e Knott (1974), a 5% de probabilidade (p<0,05). A análise multivariada foi utilizada para quantificar a divergência genética. A distância generalizada de Mahalanobis foi utilizada como medida de dissimilaridade. Foram aplicados o método hierárquico de ligações médias (UPGMA) e o método de otimização de Tocher. Estimaram-se as análises de trilha fenotípicas. As famílias FA-2, FA-3, FA-5, FA-8 e FA-9, podem ser selecionadas para produção de cana e açúcar. Os resultados com base no brix indicaram as famílias FA-4, FA-5, FA-6 e FA-10 com tendência para maturação precoce. O uso dos pares de famílias mais divergentes podem ser recomendadas para uso no melhoramento com possibilidades de proporcionar novas combinações com êxito na seleção. Indiretamente, a seleção de famílias para produção de cana e açúcar pode ser feita através do número médio de colmos.
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Caracterização agronômica e estimativa de parâmetros genéticos de Heliconia bihai L. e Heliconia stricta Huber para flor de corte

LIMA, Taciana Leite de Andrade 22 February 2012 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-22T13:55:03Z No. of bitstreams: 1 Taciana Leite de Andrade Lima.pdf: 1340293 bytes, checksum: 65b48cb5084fc7dd8f71ef97d3b4f55f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-22T13:55:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Taciana Leite de Andrade Lima.pdf: 1340293 bytes, checksum: 65b48cb5084fc7dd8f71ef97d3b4f55f (MD5) Previous issue date: 2012-02-22 / The cultivation and commercialization of tropical flowers in Pernambuco are increasing mainly of species of the Heliconia genus. Due to the great diversity of species and cultivars marketed, studies are necessary to provide information regarding the production and flower stem characteristics to use as an ornamental plant and cut flower. The objective of this study was to characterize and estimate the genetic parameters for cut flower in Heliconia bihai and Heliconia stricta of Federal Rural University of Pernambuco Heliconia Germoplasm Collection (CGH/UFRPE). The CGH/UFRPE is located in Camaragibe-PE, in full sun and distributed in a randomized block design with four replications. Were selected and evaluated four genotypes of Heliconia bihai (Hb1and; Hb2; Hb3 and HbNY) and Heliconia stricta (Hs1; HsFB, Hs3 and HsT) and the following agronomic characters: yield per plant, early flowering, number of days for emission of the first inflorescence, number of leaves on flowering stem, number of days to emission the inflorescence, number of days to harvest the inflorescence; productive cycle of the plant, inflorescence length and width, flower stem length and diameter, flower stem mass and post-harvest durability of the inflorescence. The genotypes of Heliconia HB1and Hb3 bihai were the most precocious and productive (260 and 311 days after planting; 45.08 and 42.31 flower stem/clump. year, respectively) and had shortest production cycle (204 and 211 days respectively) and floral stem mass (209 and 210 g, respectively). Regarding Heliconia stricta, HS1 genotype had the shortest production cycle (214.67 days) and floral stem mass (116 g). However the HST was most starting flowering 390 days after planting, and more productive (38.44 flower stem/clump. year). All the characters had heritability above 78% and demonstrate significant positive correlation between the number of days to harvest the inflorescence and post-harvest durability. For the graphical plot analysis, the characters days to inflorescence emission, the production cycle of plant, flower stem length and width of the inflorescence could be removed. The results indicate that there is variability between among genotypes Heliconia bihai and Heliconia stricta genotypes. Genotype Hb1could be indicated for the commercial cultivation of cut flower. / O cultivo e comércio de flores tropicais têm expressão econômica em Pernambuco, sendo espécies do gênero Heliconia algumas das mais comercializadas. Devido a grande diversidade de espécies e cultivares comercializadas, tornam-se necessários estudos que forneçam informações quanto à produção e às características da haste floral para utilização como planta ornamental e flor de corte. O objetivo deste trabalho foi caracterizar e estimar os parâmetros genéticos no uso para flor de corte em Heliconia bihai e Heliconia stricta da Coleção de Germoplasma de Helicônia da Universidade Federal Rural de Pernambuco (CGH/UFRPE). A CGH/UFRPE está localizada em Camaragibe-PE, a pleno sol e distribuída sob delineamento em blocos casualizados com quatro repetições. Foram selecionados e avaliados quatro genótipos de Heliconia bihai (Hb1; Hb2; Hb3 e HbNY) e de Heliconia stricta (Hs1; HsFB; Hs3 e HsT) quanto as seguintes características agromorfológicas: produtividade por touceira; início do florescimento, período em dias para a emissão da primeira inflorescência; número de folhas na haste floral; número de dias para emissão da inflorescência; número de dias para a colheita da inflorescência; ciclo produtivo da planta; comprimento da inflorescência; largura da inflorescência; comprimento da haste floral; diâmetro da haste floral; massa fresca da haste floral e a durabilidade pós-colheita das inflorescências. Os genótipos Hb1 e Hb3 de Heliconia bihai foram os mais precoces e produtivos (260 e 311 dias após o plantio; 45,08 e 42,31 hastes florais/touceira/ano, respectivamente) e apresentaram menor ciclo produtivo (204 e 211 dias, respectivamente) e massa fresca da haste floral (209 e 210 g, respectivamente). Em relação à Heliconia stricta, o genótipo Hs1 obteve o menor ciclo produtivo (214,67 dias) e massa fresca da haste floral (116 g), entretanto o HsT foi o mais precoce, iniciando o florescimento 390 dias após o plantio, e o mais produtivo (38,44 hastes florais/touceira/ano). Todos os caracteres obtiveram herdabilidade acima de 78% e houve correlação positiva e significativa entre o número de dias para colheita da inflorescência e a durabilidade pós-colheita. Pela análise de dispersão gráfica, foi indicado o descarte dos caracteres número de dias para emissão da inflorescência, ciclo produtivo da planta, comprimento da haste floral e largura da inflorescência. Os resultados obtidos indicam que há variabilidade entre os genótipos de Heliconia bihai e entre os genótipos de Heliconia stricta, sendo o genótipo Hb1 indicado para o cultivo comercial de flor de corte.
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Caracterização molecular por AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) de acessos de pinhão manso (Jatropha curcas L.) / Molecular Characterization by AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) in accessions of physic nut (Jatropha curcas L.)

Mariana Letícia Costa Redondo 09 June 2011 (has links)
O pinhão-manso (Jatropha curcas L.) é uma planta versátil e com diversos usos potenciais em especial para produção de biodiesel. O óleo obtido de suas sementes é seu produto mais rentável e atualmente desperta grande interesse econômico em diversos setores. A caracterização molecular e a avaliação do potencial reprodutivo dos acessos de pinhão-manso são aspectos ainda pouco abordados no Brasil, sendo necessária a caracterização de acessos brasileiros e suas potencialidades. Os objetivos do presente trabalho foram analisar a diversidade genética e a divergência genética em acessos comerciais de pinhão-manso, coletados no estado de São Paulo (Alvinlândia, Lins, Itatinga e Jales), Minas Gerais (Janaúba) e Mato Grosso do Sul (Dourados). Primeiramente, foram comparadas as técnicas de RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), RAPD-RFLP (Restrinction Fragment Length Polymorphism a partir do RAPD) e AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism), quanto à potencialidade de detectar polimorfismos dentro dos acessos e entre os acessos. Posteriormente, os acessos foram caracterizados através de AFLP. Além disso, este trabalho visou detectar se há diferença nas estruturas e no desenvolvimento floral e na taxa de viabilidade polínica dos acessos de São Paulo (Alvinlândia), Minas Gerais e Mato Grosso do Sul. Nessa parte do estudo, foram analisadas e identificadas as estruturas dos órgãos florais e do grão de pólen através das técnicas de microscopia de luz, eletrônica de varredura e transmissão. Na comparação entre as técnicas moleculares, apenas AFLP permitiu a detecção de polimorfismos, com base em um acesso escolhido para os testes (Alvinlândia, SP). As análises de todos acessos através de AFLP mostraram considerável polimorfismo, que foi refletido nas estimativas de diversidade genética de Nei e Índice de Shannon. Na análise de agrupamento, as amostras de cada acesso foram agrupadas coerentemente. Os acessos de Dourados e de Itatinga formaram um grupo separado, apresentando cerca de 76% de similaridade com o segundo grupo (Alvinlândia, Jales, Lins, Janaúba). Dentro deste último, os acessos de São Paulo ficaram agrupados (com cerca de 84% de similaridade), enquanto que Janaúba mostrou-se separado, com 82% de similaridade genética. Estes resultados indicam que os acessos de São Paulo provavelmente tenham origem a partir de Janaúba. No entanto, Itatinga provavelmente tenha origem a partir de Dourados. Quanto à morfologia floral, não foi observada nenhuma diferença a nível microscópico na formação e nas estruturas dos órgãos florais. Quando comparada a viabilidade polínica entre os dois acessos coletados em campo (Minas Gerais e Mato Grosso do Sul), notou-se que há diferença significativa na taxa de viabilidade, mesmo os valores sendo muito próximos (Mato Grosso do Sul - 81,91% e Minas Gerais - 77,20%), mostra que tanto os acessos de Minas Gerais como os de Mato Grosso do Sul podem ser utilizados como parentais masculinos em programas de melhoramento genético. A divergência genética moderada e a baixa variabilidade morfológica sugerem que coletas de materiais em poucos locais poderiam representar a diversidade genética da espécie. Estudos mais aprofundados, empregando técnicas como de microssatélites e mais acessos, são 11 necessários para o conhecimento da diversidade e estrutura genética do pinhão-manso no Brasil / Physic nut (Jatropha curcas L) is a very versatile plant with several potential uses especially for the production of biodiesel. The oil obtained from its seeds is the most profitable product of this specie and it is currently attracting great interest in various economic sectors. Molecular characterization and evaluation of reproductive potential of the accessions of pysic nut have still little attention in Brazil, it still need the characterization of Brazilian accessions and its potenciality. The ains of this study were: to analyze the genetic diversity and genetic divergence in commercial accessions of physic nut, from the States of São Paulo (Alvinlândia, Lins, Jales and Itatinga), Minas Gerais (Janaúba)and Mato Grosso do Sul (Dourados). Firstly we compared the RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) RAPD-RFLP (Fragment Length Polymorphism Restriction from RAPD) and AFLP (Amplified Fragment Length Polymprphism) regarding the potencial to detect polymorphism within the accessions and among accessions. Subsequently, the accessions were characterized by AFLP. Moreover this work aimed to detect whether there are differenced on flower structures and development and the rate of pollen viability on the accessions of São Paulo (Alvinlândia), Minas Gerias and Mato Grosso do Sul. On this part of the study were analysed and identified the structures of the floral organs and pollen grain through the techniques of, light microscopy, scanning electron and transmission microscopy. Comparing the molecular techniques, only AFLP allowed the detection of polymorphisms based on the accession chosen for testing (Alvinlândia, SP). Analyses of all accesses by AFLP showed considerable polymorphism, wich was reflected in estimates of genetic diversity index of Nei and Shannon. In cluster analysis, samples of each accessions were grouped consistently. The accessions of Dourados and Itatinga formed a separated group, with approximately 76% similarity with the second group (Alvinlândia, Jales, Lins, Janaúba). Within the last, accessions of São Paulo werte grouped (about 84% similarity), while Janaúba showed p separately, with 82% of genetic similarity. These results indicates that the accessions of São Paulo probably originates from Janaúba. However Itatinga probably originates from Dourados. As floral morphology, we observed no difference at microscope level on the formation and on the structures of floral organs. When compared the pollen grain viability between the two accessions collected in the field (Minas Gerais and Mato Grosso do Sul), it was noted that the viability rated were significantly different, even though the values being very close (Mato Grosso do Sul Minas Gerais 81,91% - 77,20%), shows that both the accessions of Minas Gerais as the Mato Grosso do Sul can be used as male parental in breeding programs. The moderate and low genetic divergence suggests that morphological variability collections of materials in a few locations could represent the genetis diversity of the species. Further studies employing techniques such as microsatellite and more accessions are required for an understanding of diversity and genetic structure of physic nut in Brazil
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Divergência genética entre progênies de meios-irmãos de cajueiro anão precoce / Genetic divergence among half-sib progenies precocious dwarf cashew

Frota Júnior, José Itamar January 2012 (has links)
FROTA JUNIOR, José Itamar. Divergência genética entre progênies de meios-irmãos de cajueiro anão precoce. 2012. 106 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, Rede Nordeste de Tecnologia, Fortaleza-CE, 2012. / Submitted by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-05-24T13:27:22Z No. of bitstreams: 1 2012_tese_jifrotajunior.pdf: 7557129 bytes, checksum: 6c9f0d978e3d8d53df85c9c6cfa07a24 (MD5) / Approved for entry into archive by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-05-24T13:29:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_tese_jifrotajunior.pdf: 7557129 bytes, checksum: 6c9f0d978e3d8d53df85c9c6cfa07a24 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-24T13:29:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_tese_jifrotajunior.pdf: 7557129 bytes, checksum: 6c9f0d978e3d8d53df85c9c6cfa07a24 (MD5) Previous issue date: 2012 / The present work was developed in order to characterize and evaluate the genetic diversity of dwarf cashew progenies from Embrapa Agroindústria Tropical using molecular and morphological markers as well as the indication of divergent materials to the breeding program. It was used 50 dwarf cashew progenies from Embrapa Agroindústria Tropical collection located in the Experimental Center of Pacajus, Ceará. In the molecular analysis, each progeny was sampled by collecting leaves from two plants per plot and then analyzed at Embrapa´s molecular biology lab. It was performed DNA´s extractions based on CTAB (Cetyltrimethylammonium bromide) method, adapted by Cavalcanti (2004). ISSR´s markers (Inter Simple Sequence Repeat) were used. Jaccard´s coefficient and UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) cluster analysis were applied in the group analysis. Cluster analysis allowed the division into fourteen groups of genetic similarity being the most divergent progenies CNPAT 92-56, 92-62 and 92-385, and the most similar ones CNPAT 92-331 and 92-335. Variables such as plant height, diameter, number of nuts and production, were used in the quantitative analysis. Euclidian distance was used in the genetic distance analysis. UPGMA method were used in cluster analysis. The variable with highest relative contribution to genetic divergence was production, with 97,80%. The UPGMA cluster analysis allowed the division into eleven groups. The most divergent material was CNPAT 92-331 coming from Capisa farm in Piauí state. The most similar materials formed the subgroup I of group I, CNPAT 92-54 and 92-58 with 95% similarity. There is genetic variability, however no direct relationship between molecular and quantitative analysis was found / O presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo de caracterizar e avaliar a diversidade genética de progênies de meios-irmãos de cajueiro anão precoce da Embrapa Agroindústria Tropical por meio de marcadores moleculares e morfológicos, assim como, a indicação dos materiais divergentes para o programa de melhoramento genético. Foram utilizadas 50 progênies instaladas no Campo Experimental de Pacajus, CE. Na análise molecular, cada progênie foi amostrada coletando-se folhas de duas plantas/parcela e analisadas no laboratório de Biologia Molecular da Embrapa Agroindústria Tropical. Foram realizadas extrações de DNA baseadas no método CTAB (brometo de cetiltrimetilamônio) ajustado por Cavalcanti (2004) e utilizados marcadores do tipo ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Utilizou-se o coeficiente de Jaccard e análise de agrupamento UPGMA (Método de Média Aritmética Não Ponderada) para análise dos grupos. Doze iniciadores ISSR geraram 71 bandas das quais 27 foram polimórficas. A análise de agrupamento permitiu a divisão em quatorze grupos de similaridade genética, onde as progênies mais divergentes foram CNPAT 92-56, CNPAT 92- 62 e CNPAT 92-385 e as mais similares foram CNPAT 92-331 e CNPAT 92-335. Na análise quantitativa foram utilizadas as seguintes variáveis: altura da planta, diâmetro da copa, número de castanhas e produção. Foi utilizada a Distância Euclidiana para análise da distância genética e UPGMA para a análise de agrupamento. A produção foi a variável que obteve maior contribuição relativa para a divergência genética com 97,80%. A análise de agrupamento UPGMA possibilitou a distribuição de 11 grupos. O material mais divergente foi o CNPAT 92-331 oriundo da Fazenda Capisa (Piauí). Os mais similares formaram o subgrupo I do grupo I, CNPAT 92-54 e CNPAT 92-58 com 95% de similaridade. Há variabilidade genética, no entanto não foram encontradas relações diretas entre a análise molecular e a quantitativa
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Parâmetros genéticos em populações de soja derivadas de cruzamentos simples e múltiplos, conduzidas por três diferentes métodos de avanço de gerações

Sordi, Daniel de [UNESP] 30 July 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-07-30Bitstream added on 2014-06-13T18:54:08Z : No. of bitstreams: 1 sordi_d_me_jabo.pdf: 1556944 bytes, checksum: 276e45c56ee2b5db2a921fe5c600f370 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A variabilidade genética é um dos fatores mais importantes para o melhoramento de plantas, a partir do qual será conduzido todo o processo seletivo. Essa variabilidade pode ser ampliada através da utilização de cruzamentos múltiplos e melhor explorada sob diferentes métodos de condução das populações segregantes. O objetivo do presente trabalho foi detectar variabilidade através de estimativas de parâmetros genéticos em genótipos derivados do avanço de gerações por três diferentes métodos de condução: Single Seed Descent (SSD), Single Pod Descent (SPD) e Genealógico (Pedigree). O experimento foi conduzido em casa de vegetação climatizada e na área experimental do Departamento de Produção Vegetal da Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Unesp-Jaboticabal. O delineamento utilizado foi o de blocos aumentados, onde foram avaliados 324 genótipos de soja na geração F7 previamente desenvolvidos no Programa de Melhoramento de Soja da FCAV/UNESP, oriundos de cruzamentos biparentais, quádruplos e óctuplos. Foram obtidas estimativas de variâncias, herdabilidades e ganhos genéticos para os três tipos de cruzamentos nos três métodos. Pela análise de divergência foram agrupados os genótipos mais similares para cada método. Os métodos SSD e SPD foram os mais promissores para aumentos de variabilidade nos três tipos de cruzamentos. O método genealógico promoveu as maiores estimativas de herdabilidade e os maiores ganhos genéticos. Os genótipos de cruzamentos quádruplos foram os que mais se agruparam / Genetic variability is one of the most important factors for plant breeding, which lead the selective process. This variability can be enlarged by multiple crosses and explored under different breeding methods on segregate populations. Thus, the aim of this work was to detect variability using genetic parameters estimates in genotypes obtained by different methods: Single Seed Descent (SSD), Single Pod Descent (SPD) e Pedigree. The experiment was conducted in a greenhouse, under controlled conditions, and in the experimental field of Crop Production Department at Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Unesp-Jaboticabal. Augmented blocks was used as the experimental design. 324 soybean genotypes in generation F7 from FCAV Soybean Breeding Program, derived from 2-way, 4-way and 8-way crosses, were evaluated. Variance, heritability and genetic gains estimates were obtained for the three types of crosses on three methods. By divergence analysis, most similar genotypes were grouped for each method. SSD and SPD methods were the most promising for variability increases. Pedigree method has promoted the higher estimates for heritability and genetic gains. Genotypes from four-way crosses were highly grouped
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Descrição morfológica e análise da variabilidade genética para caracteres de frutos, sementes e processo germinativo associado à produtividade de óleo em matrizes de Carapa guianensis Aublet., uma meliaceae da Amazônia

Pantoja, Tammya de Figueiredo [UNESP] 23 November 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:09Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-11-23Bitstream added on 2014-06-13T18:29:34Z : No. of bitstreams: 1 pantoja_tf_me_jabo.pdf: 1016487 bytes, checksum: 2ab47057725d5333457f8d9c11a51f60 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O objetivo do presente trabalho foi caracterizar a morfologia de frutos, sementes e desenvolvimento pós-seminal e estudar a divergência genética entre árvores matrizes de Carapa guianensis Aublet., em duas populações naturais no Amapá, uma em Mazagão e outra em Macapá, por meio de caracteres biométricos de frutos e sementes, processo germinativo, desenvolvimento inicial de plântulas e teor de óleo. Na descrição morfológica utilizou-se estereomicroscópio para observação das características externas dos frutos, sementes e plântulas nas diversas fases de desenvolvimento pós-seminal. A divergência genética foi avaliada pela análise de agrupamento, através do algoritmo de Tocher e do método UPGMA (Unweighted Pair Group Using an Arithmetic Average), obtido a partir da matriz de dissimilaridade pela Distância Euclidiana. Para verificação da importância relativa de cada variável para a divergência genética utilizou-se a análise de Componentes Principais. Os frutos de C. guianensis são cápsulas septífragas, secas, deiscentes, pluriloculares, polispérmicas e subglobosas. As sementes são grandes, angulosas e convexas na região dorsal. A germinação é do tipo hipógea-criptocotiledonar e as plântulas apresentam metáfilos paripinados, hipocótilo pequeno, epicótilo glabro, sublenhoso, com duas a seis gemas axilares protegidas por catáfilos. Nos dois métodos de agrupamento as 25 árvores matrizes foram distribuídas em cinco e seis grupos, respectivamente, em Mazagão e Macapá. Oito (50%) e 12 (75%) dos 16 caracteres avaliados, repectivamente, em Mazagão e Macapá, foram considerados de pequena importância para a divergência. Dos caracteres mais importantes para a divergência, a massa de sementes, a largura de frutos e o teor de óleo foram comuns nas duas localidades. Há grande variabilidade entre as árvores matrizes de C. guianensis... / The objective of the work was the morphological characterization of the fruits, the seeds, the post-seminal development and to evaluate the genetic divergence among mothers trees of Carapa guianensis of two natural populations located in Amapá, one in Mazagão and another in Macapá, through biometric traits of fruits and seeds, oil production, germination process and formation of the seedlings. To morphological description, the external characteristics of the fruits, the seeds and the seedlings in various stages of postseminal development were observed in a stereomicroscopy. The genetic divergence was evaluated using clusters analysis, by the algorithm of Tocher and method of UPGMA (Unweighted Pair Group Using an Arithmetic Average), obtained by the Euclidian Distance. To verify the relative importance of each variable for divergence was applied the analysis of Principal Components. The fruit of C. guianensis is a septicidal capsule, drought, dehiscent, plurilocular, polyspermic and subglobose. The seeds are large, angulate and convex in the back. The germination is hypogeal cryptocotilar and the seedlings have pinnate metaphylls, small hipocotyl, glabrous epicotyl, subwoody, with two or six axillary buds protected by cataphylls. In clusters analysis the 25 mother trees were distributed in five and six groups, respectively, in Mazagão and Macapá. Eight (50%) in Mazagão and 12 (50%) in Macapá of 16 characters evaluated were considered of presented lower importance for genetic divergence. The more important characters to the study of genetic divergence were the fresh mass of the seeds, fruit width and oil content, common in both locations. The great variability among mother trees of C. guianensis and the genetic divergence studies can xvii possibility the identification of mother trees to seed collection for use in conservation and improvement programs.

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