Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:32Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-20Bitstream added on 2014-06-13T19:44:24Z : No. of bitstreams: 1 rocha_lb_dr_jabo_prot.pdf: 6975580 bytes, checksum: 02ebdfaf49b41f3ea78cb0bfdae5765d (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Os bovinos são divididos em dois grandes grupos, taurinos e zebuínos, cuja divergência genética é de aproximadamente 250 mil anos. Apesar da proximidade filogenética, os grupos respondem de maneira diferente ao teor de energia da dieta. No presente estudo objetivou-se validar o uso do microarranjo BLO+ para estudos de expressão gênica em zebuínos e comparar a expressão gênica no músculo LD de NEL e ANG alimentados com a dieta AE e BE. Oito ANG e oito NEL foram divididos em duas baias e receberam a dieta BE por 28 dias e na seqüência a dieta AE pelo mesmo período. Após cada período, coletou-se amostras do músculo LD, das quais extraíu-se o RNA para os estudos de expressão gênica usando microarranjos. Foram expressos 9.552 e 8.664 genes em ANG e NEL, sendo que 98% dos genes expressos em NEL também foram expressos em ANG, indicando uma alta similidaridade entre as sondas do microarranjo e os transcritos de NEL. Identificaram-se 546 genes DE para ANG e 440 para NEL. Realizou-se a análise funcional desses conjuntos de genes e observou-se diferenças nas categorias funcionais mais representativas entre as raças entre as dietas. A dieta AE estimula de forma mais acentuada a expressão de genes envolvidos no crescimento e desenvolvimento muscular em ANG, enquanto a dieta BE estimula de forma mais acentuada a expressão de genes que codificam proteínas relacionadas à captação de nutrientes endógenos em NEL. Os resultados obtidos sugerem que o microarranjo BLO+ pode ser usado em estudos de expressão gênica com zebuínos e indicam que o nível nutricional da dieta afeta diferentemente a expressão gênica no músculo LD de taurinos e zebuínos. / Bovines are divided in two large groups, taurine and zebuine, whose genetic divergence is estimated as 250,000 years before present. Despite of phylogenetic proximity, these groups respond differently to diet energy level. The current study aimed to validate the BLO+ microarray use in zebuine gene expression experiments and evaluate gene expression in LD muscle from NEL and ANG fed with AE and BE diets. Eight ANG and NEL animals were separated in two pens and received BE diet during 28-days period; following animals were fed with AE diet for the same period. After each period, samples from LD muscle were collected, of which RNA was extracted to proceed with gene expression experiment using microarrays. Were expressed 9,552 and 8,664 genes in ANG and NEL, where 98% of expressed genes in NEL were also expressed in ANG, indicating a high similarity between microarray probes and NEL transcripts. Statistical analysis identified 546 genes differentially expressed for ANG and 440 for NEL. These gene groups were submitted to functional analysis and differences in overrepresented functional categories were observed between breeds and diets. AE diet stimulates further the expression of genes related to muscle growth and development in ANG, while BE diet stimulates further the expression of genes involved in endogenous nutrients uptake in NEL. The results obtained suggest that BLO+ microarray can be used in zebuine gene expression studies and indicate that nutritional level of diet affects the differential gene expression in LD muscle from taurine and zebuine beef cattle.

Submitted by Automação e Estatística (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-07-26T17:31:41Z No. of bitstreams: 1 CarlosAdrianGarciaRodriguez_TESE.pdf: 3108960 bytes, checksum: f9ec4b57e52d1de6dc85e3e388df477c (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-07-27T19:55:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 CarlosAdrianGarciaRodriguez_TESE.pdf: 3108960 bytes, checksum: f9ec4b57e52d1de6dc85e3e388df477c (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-27T19:55:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CarlosAdrianGarciaRodriguez_TESE.pdf: 3108960 bytes, checksum: f9ec4b57e52d1de6dc85e3e388df477c (MD5) Previous issue date: 2018-05-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / As áreas de montanha do mundo cobrem menos de 15% da superfície terrestre; no entanto, elas concentram cerca de 90% dos hotspots de diversidade de espécies e 40% dos hotspots de endemismo. As evidências sugerem que fatores como a complexidade topográfica, a heterogeneidade climática e sua dinâmica histórica nas montanhas podem desempenhar um papel importante na evolução e manutenção de suas ricas biotas. Nesta tese, pretendi avaliar o papel de tais fatores tanto em escala macro (ou seja, nos padrões globais de especiação) quanto em escalas microevolutivas (ou seja, intraespecíficas de divergência genética e de traits) usando anfíbios como sistema de estudo. No primeiro capítulo, contrastei as taxas de especiação entre regiões de alta e baixa complexidade topográfica. Para este fim, usei uma filogenia quase completa de anfíbios contendo 7238 espécies (>90% da diversidade existente) para rodar uma Análise Bayesiana de Misturas Macroevolutivas (BAMM) que permite estimar as taxas de especiação. Posteriormente, projetei na geografia essa informação usando os mapas de distribuição disponíveis, para explorar padrões geográficos de especiação em anfíbios e avaliei sua associação com terrenos complexos, estimando um índice global de complexidade topográfica. Encontrei que, globalmente, as taxas de especiação são mais rápidas em regiões de alta complexidade topográfica independentemente da latitude. Desconstruí esse padrão repetindo as análises nas regiões Zoogeográficas de Wallace - levando em consideração as histórias evolutivas regionais independentes - e encontrei a mesma tendência em oito dos 11 reinos zoogeográficos. No segundo capítulo, avalio o papel relativo de diferentes componentes da paisagem na promoção da diversificação da linhagem na complexa topografia da América Central Ístmica (ACI: Costa Rica e Panamá), uma região geologicamente jovem, mas altamente biodiversa. Aqui usei DNA mitocondrial para estimar a divergência genética dentro de 11 espécies de anfíbios (9 anuros e 2 salamandras) com diferentes atributos ecológicos que ocorrem conjuntamente na região. Então, utilizei análises de Matriz Múltipla de Regressão com Randomização e Modelagem de Dissimilaridade Generalizada para quantificar o papel relativo do isolamento por distância, ambiente e resistência (topografia e adequação) na modelagem de padrões geográficos de estrutura genética dentro de cada espécie. Encontrei respostas idiossincráticas que podem refletir aspectos específicos de suas histórias de vida e poderiam dar uma visão sobre o papel da ACI como motor da especiação. No terceiro capítulo, testei se as barreiras climáticas e topográficas podem influenciar a variação dos sinais acústicos de duas espécies de sapos do gênero Diasporus. Este é um traço comportamental importante que possui características particulares que permitem o reconhecimento intra-específico e podem desempenhar um papel importante como mecanismo de isolamento reprodutivo. Para este capítulo, gravei vocalizações de anúncio de 170 machos de duas espécies de sapos do gênero Diasporus distribuídos na Costa Rica. Eu realizei gravações em 21 locais em todo o país, desde o nível do mar até 2800 metros de altitude. Com essa informação realizei análises bioacústicas para documentar a variação geográfica e análises correlativas de matrizes múltiplas para testar se a distância geográfica, as barreiras físicas ou climaticas entre populações, ou adaptação às condições locais podem moldar tais padrões. Para esse fim, eu incorporei análises espaciais (modelos de nicho, estimativas de rugosidade do terreno e teoria dos circuitos) para estimar níveis de isolamento das populações e ajustar um modelo de dissimilaridade generalizada para abordar esta questão. Nas duas espécies, encontrei altos níveis de variação acústica, assim como de isolamento entre populações, gerado pelos fatores testados. No entanto, somente as barreiras topográficas explicaram significativamente a variação acústica em D. diastema. Entretanto, a dissimilaridade climática e distância geográfica só possui associação marginal com os padrões de variação acústica encontrados. Em conclusão, consideramos forças que operam em uma escala local e de forma independente (por exemplo a seleção sexual, o deslocamento de caracteres ou mesmo deriva genética) poderiam então ser mais determinantes na evolução desses sinais nas espécies de estudo. / Mountain areas around the world cover less than 15% of global land surface; nevertheless, they concentrate around 90% of the hotspots of species diversity and 40% of the hotspots of endemism. Available evidence suggest that ecological factors such as landscape features (i.e topographic complexity, climatic heterogeneity and their historical dynamics) of mountains may play an important role in the evolution and maintenance of rich biotas at such regions. In my dissertation I aim to evaluate the role of such factors in both macro (i.e global speciation patterns) and microevolutionary (i.e intra-specific genetic and trait divergence) processes using amphibians as study system. In the first chapter, we tested in a global scale the Montane Pumps hypothesis, which proposes that speciation rates are faster in mountains explaining higher diversities in those regions. To this end we used a near complete Amphibian phylogeny containing 7238 species (>90% of the group’s extant diversity) and conducted a Bayesian Analysis in Macroevolutionary Admixtures (BAMM) to estimate speciation rates. Then we combined this information with available range maps to explore Amphibian geographic patterns of speciation and evaluated its association with complex terrains (mountains) by estimating a global index of topographic complexity. We found that globally, speciation rates are faster in regions of high topographic complexity independently of latitude. We repeated our analyses using the Wallace’s Zoogeographic regions, taking into account regional independent evolutionary histories, and found the same pattern in eight out of the total 11 zoogeographical realms. In a second chapter, we assess the relative role of different components of the landscape in promoting lineage diversification across the roughed topography of Isthmian Central America (Costa Rica & Panama), a geologically young but highly biodiverse region. Here we use available mitochondrial DNA to estimate genetic divergence within 10 amphibian species (8 anurans and 2 salamanders) with different biologies that co-occur in the region. Then, we use a Multiple Matrix of Regression with Randomization to assess the relative role of isolation by distance, by environment and by resistance (topography, current climate, and LGM paleoclimate) in shaping the geographic patterns of genetic structuration within each species. So far, we have not found a general force that explains genetic divergence in all studied species. Instead, we have found idiosyncratic responses that may reflect specific aspects of their life histories, such as dispersal capabilities, range size or reproductive potential. In the third chapter, we test how climatic and topographic barriers may influence variation in an important behavioral trait such as are advertisement calls. In anurans, such calls has species-specific features that play an important role in recognition. Then, variation in spectro-temporal features between populations has been proposed as a mechanism of reproductive isolation that may promote speciation in the long term. For this chapter I recorded advertisement calls of 170 males from 2 species of Diasporus frogs distributed in Costa Rica. I made recordings at 21 sites in all the country ranging from sea level to 2800 meters elevation. We use such information we conduct bioacoustics analyses to first document geographic variation and then test if the geographic distance, physical or ecological barriers between populations, or adaptation to local conditions could shape such patterns. To this end, we incorporate spatial analyses (niche models, terrain roughness estimations and circuit theory) to generate levels of population isolation and apply Generalized Dissimilarity Matrix test to address this question. In both species, I found high levels of acoustic variation and among population isolation derived by the tested factors. However, only topography significantly explained acoustic divergence in D. diastema while climatic dissimilarity and geographic distance are only marginally associated with the patters of acoustic variation in D. hylaeformis. In conclusion, other forces operating independently in the local scale -such as sexual selection, character displacement or genetic drift- may be more determinant in the evolution of acoustic signals in these species

Submitted by Katiane Souza (katyane.souza@gmail.com) on 2016-04-21T21:19:52Z No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 1926496 bytes, checksum: bebf1c4ec785a14c3ca91a4e8501a035 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-21T21:19:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 1926496 bytes, checksum: bebf1c4ec785a14c3ca91a4e8501a035 (MD5) Previous issue date: 2006-02-23 / Techniques of dialell crossings and genetic divergence with application of canonical variables and principal components have been applied with the objective of evaluating six castor bean genotypes behaviorconsidering the variables days to flowering (FR), number of racemes per plant (NRP), effective length of the primary raceme (CR), plant height (AP), potential yield (PP) and oil content (TO), when choosing promising parents in breeding programs through hybridizations. Griffing’s scheme of diallel crossings (1956) was used when evaluating combining capacities. A randomized complete blocks design with four replications was used and the trial was set at irrigation condition, at Embrapa-Algodão Experimental Station – CNP, placed in the municipal district of Barbalha-CE. Variable AP presented significance only for the effect of the general capacity of combination (CGC), while PP showed significance only for specific capacity of combination (CEC). Both CGC and CEC effects were significant for the other variables. However, the quadratic components indicated predominance of non-additive genic effects for all of the variables. Parent BRA 4871 (1), BRS Paraguaçu (2) and BRS Nordestina (5) had been distinguished as good general combiners for FR; BRS Nordestina (5), for NRP; BRA 2968 (4), BRA 5550 (6) and BRS Nordestina (5) for CR. For the variable plant height, the best general combinadores were: BRA 4871 (1), BRS Paraguaçu (2) and BRA 7722 Papo-de-gia (3). BRS Nordestina (5) and BRA 5550 (6) were pointed as good combinadores for PP, while BRS Nordestina was configured as a good combiner for TO. Those genotypes involvement in improvement programs in order to obtain new varieties starting from advanced selection generations can be promising. In a multivariate context, two principal components and two canonical variables were enough to explain 78% and 82% of the total variance, respectively. The first principal component (CP1) presented positive relationship with the variables NRP, AP and PP, while the second component (CP2) presented positive relationship with FR and CR. The first canonical variable (VC 1) turned out to be positively related to FR and CR and, on the other hand, negatively related to NRP and PP. Instead, for the second canonical variable (VC2), a contrast was verified among positive values for CR, PP and TO and negative values for AP. There was an indication of genetic divergence among parents with larger discrimination observed by the principal compounds technique. Nevertheless, low correlations had been detected between genetic distance of parents and heterosis for both techniques. Parent BRA 5550 (6) presented the largest positive estimate of CGC for CP1 and the best hybrid combinations for CEC were BRA 4871 x BRA 5550 (1x4) and BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5). Like CP2, BRS Nordestina (5) was pointed as a good general combiner, while the best combinations when it comes to CEC were BRA 4871 x BRA 2968 (1x4) BRS Paraguaçu x BRA 2968 (2x4), BRA 7722 Papo-de-gia x BRA 2968 (3x4) and BRA 7722 Papo-de-gia x BRS Nordestina (3x5), with favorable contribution to (CR), while BRA 4871 x BRA 7722 Papo-de-gia (1x3), BRS Paraguaçu x BRA 7722 Papo-de-gia (2x3) and BRS Paraguaçu x BRS Nordestina (2x5) were pointed as favorable to FR. Parents BRS Paraguaçu (2), BRS Nordestina (5) and BRA 4871 (1) presented good general capacity of combination for VC1, while BRS Nordestina (5) was the only favorable parent for VC2, because they contribute with genes to a larger effective length of the primary raceme, yield potential and oil content, plus genes for plant high reduction. BRA 4871 x BRA 7722 Papo-de-gia (1x3), BRA 4871 x BRA 5550 (1x6), BRS Paraguaçu x BRA 7722 Papo-de-gia (2x3), BRS Paraguaçu x BRS Nordestina (2x5) and BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5) presented a better behavior about CEC for VC1. BRS Paraguaçu x BRA 2968 (2x4) and BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5) were the best combinations for VC2. Hybrid BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5) represents the best exploration perspective in breeding because of its favorable medium performance for all of the features and a better heterosis behavior about VC2. Hybrid combinations BRA 4871 x BRA 7722 Papo-de-gia (1x3), BRA 4871 x BRA 5550 (1x6), BRS Paraguaçu x BRA 7722 Papo-de-gia (2x3), BRS Paraguaçu x BRA 2968 (2x4), BRS Paraguaçu x BRS Nordestina (2x5) and BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5) could be used in order to create a new basis-population, starting from intercrossings among them, both for exploration through intrapopulation selection appealing and for the extraction of lineages destined to the synthesis of hybrids able to gather precocity, larger number of racemes per plant, lower plants height, higher yield potential and larger oil content. / Técnicas de cruzamentos dialélicos e divergência genética com aplicação de variáveis canônicas e componentes principais foram aplicadas com o objetivo de avaliar seis genótipos de mamona quanto às variáveis início do florescimento (FR), número de racemos por planta (NRP), comprimento efetivo do racemo primário (CR), altura da planta (AP), potencial produtivo (PP) e teor de óleo (TO) na escolha de parentais promissores para programas de melhoramento por hibridações. Na avaliação das capacidades combinatórias, utilizou-se o esquema de cruzamentos dialélicos de Griffing (1956). O delineamento estatístico utilizado foi o de blocos casualizados com quatro repetições, e o experimento conduzido em condição de irrigação, na Estação Experimental da Embrapa - Algodão – CNPA, localizada no município de Barbalha-CE. A variável AP apresentou significância apenas para o efeito da capacidade geral de combinação (CGC), enquanto PP mostrou significância apenas para capacidade específica de combinação (CEC). Tanto os efeitos de CGC como de CEC foram significativos para as demais variáveis. No entanto, os componentes quadráticos indicaram predominância dos efeitos gênicos não-aditivos para todas as variáveis. Os parentais BRA 4871 (1), BRS Paraguaçu (2) e BRS Nordestina (5) destacaram-se como bons combinadores gerais para FR; BRS Nordestina (5), para NRP; BRA 2968 (4), BRA 5550 (6) e BRS Nordestina (5) para CR. Para a variável altura da planta, os melhores combinadores gerais foram: BRA 4871 (1), BRS Paraguaçu (2) e BRA 7722 Papo-de-gia (3). BRS Nordestina (5) e BRA 5550 (6) mostraram-se como bons combinadores para PP, enquanto BRS Nordestina configurou-se como bom combinador para TO. O envolvimento desses genótipos em programas de melhoramento para a obtenção de novas variedades a partir de gerações avançadas de seleção pode ser promissor. No contexto multivariado, dois componentes principais e duas variáveis canônicas foram suficientes para explicar 78% e 82% da variância total, respectivamente. O primeiro componente principal (CP1) apresentou relação positiva com as variáveis NRP, AP e PP, enquanto que o segundo componente (CP2), apresentou relação positiva com FR e CR. A primeira variável canônica (VC 1) mostrou-se, de um lado, relacionada positivamente a FR e CR e, de outro, negativamente com NRP e PP. Já para a segunda variável canônica (VC2), verificou-se um contraste entre valores positivos para CR, PP e TO e valor negativo, para AP. Houve indicação de divergência genética entre parentais com maior discriminação observada pela técnica de componentes principais. Contudo, correlações baixas foram detectadas entre distância genética dos parentais e heterose, para as duas técnicas. O parental BRA 5550 (6) apresentou a maior estimativa positiva de CGC para CP1, sendo BRA 4871 x BRA 5550 (1x4) e BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5) as melhores combinações híbridas quanto à CEC. Quanto a CP2, BRS Nordestina (5) apresentou-se como bom combinador geral, enquanto as melhores combinações em relação à CEC foram: BRA 4871 x BRA 2968 (1x4) BRS Paraguaçu x BRA 2968 (2x4), BRA 7722 Papo-de-gia x BRA 2968 (3x4) e BRA 7722 Papo-de-gia x BRS Nordestina (3x5), com contribuição favorável à (CR), enquanto BRA 4871 x BRA 7722 Papo-de-gia (1x3), BRS Paraguaçu x BRA 7722 Papo-de-gia (2x3) e BRS Paraguaçu x BRS Nordestina (2x5) mostraram-se favoráveis à FR. Os parentais BRS Paraguaçu (2), BRS Nordestina (5) e BRA 4871 (1) apresentaram boa capacidade geral de combinação para VC1, ao passo que para VC2, BRS Nordestina (5) foi o único parental favorável, uma vez que contribui com genes para maior comprimento efetivo do racemo primário, potencial produtivo e teor de óleo e genes para redução do porte da planta. BRA 4871 x BRA 7722 Papo-de-gia (1x3), BRA 4871 x BRA 5550 (1x6), BRS Paraguaçu x BRA 7722 Papo-de-gia (2x3), BRS Paraguaçu x BRS Nordestina (2x5) e BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5) apresentaram melhor comportamento quanto a CEC para VC 1. Quanto a VC2, BRS Paraguaçu x BRA 2968 (2x4) e BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5) foram as melhores combinações. O híbrido BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5) representa a melhor perspectiva de exploração no melhoramento pelo seu desempenho médio favorável para todas as características e melhor comportamento heterótico quanto a VC2. As combinações híbridas BRA 4871 x BRA 7722 Papo-de-gia (1x3), BRA 4871 x BRA 5550 (1x6), BRS Paraguaçu x BRA 7722 Papo-de-gia (2x3), BRS Paraguaçu x BRA 2968 (2x4), BRS Paraguaçu x BRS Nordestina (2x5) e BRA 2968 x BRS Nordestina (4x5) poderiam ser utilizadas na formação de uma população-base a partir de intercruzamentos entre elas, seja para exploração através da seleção recorrente intrapopulacional, seja para a extração de linhagens destinadas à síntese de híbridos que reúnam precocidade, maior número de racemos por planta, menor altura de plantas, maior potencial produtivo e maior teor de óleo.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-11-01T15:06:18Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Karla da Silva Carneiro - 2017.pdf: 3925004 bytes, checksum: 34919ba64c10b1240fa3e19cf38d927a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-11-01T15:53:42Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Karla da Silva Carneiro - 2017.pdf: 3925004 bytes, checksum: 34919ba64c10b1240fa3e19cf38d927a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-01T15:53:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Karla da Silva Carneiro - 2017.pdf: 3925004 bytes, checksum: 34919ba64c10b1240fa3e19cf38d927a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-12-21 / Financiadora de Estudos e Projetos- Finep / In Brazil, the history of sugarcane is related to the social, economic and politic country development. Sugarcane cultivation is considered as the first organized economic activity in the country. The main purpose of sugarcane cultivation is for sugar and biofuel production, but in recent years the energy production from its biomass has also been explored, increasing the attention for this crop. Modern cultivated sugarcane varieties are hybrids from interspecific crosses between S. officinarum and S. spontaneum. The genetic breeding has given many contributions to sugarcane production and exploration, by the development of superior genotypes. The main sources of variability used in breeding programs are the germplasm banks. However, to explore these resources efficiently it is necessary to have basic information on the available levels of genetic diversity and on its structure, to support decisions on how they can be used in breeding programs. The purpose of this work was to characterize the genetic diversity and structure of a base population from the Ridesa/UFG sugarcane breeding program. A sample of 160 sugarcane clones were genotyped using 37,914 SNP markers. The population showed medium levels of genetic diversity. The average Nei’s gene diversity index was estimated to be 0,173, while the medium observed heterozygosity was a little higher (0,236). The genetic divergence, estimated by Roger’s modified distance varied from 0,20 to 0,30. SNP markers were efficient to identify individuals that are genetic divergent or similar, even without genealogy information. The population structure analysis, performed with the software Structure, suggested the existence of two clusters. Each clone had a fraction of its genome inside these two clusters, corroborating the fact that modern sugarcane cultivars are essentially hybrids. Our results suggest that, given the low level of genetic structure among clones, from the breeding programs standpoint, the evaluated population can be managed as weakly structured, although some small groups, including a small number of clones, had been detected. Among the evaluated clones, the least divergent pairs were those formed by the genotypes 023 and 011, and 066 and 036. The most divergent pairs were formed by the clones 131 and 084, and 131 and 063. / A história da cana-de-açúcar está intimamente relacionada com o desenvolvimento social, econômico e político do Brasil, sendo considerada por muitos como a primeira atividade economicamente organizada no país. A cana-de-açúcar é matéria prima para a produção de açúcar e etanol, tendo sido também utilizada nos últimos anos para a produção de energia. As modernas variedades de cana-de-açúcar são híbridos poliploides decorrentes do cruzamento interespecífico entre S. officinarum e S. spontaneum. O melhoramento genético tem contribuído de maneira importante para o setor, pelo desenvolvimento de genótipos superiores. O ponto de partida destes programas de melhoramento são os bancos de germoplasma. Para que esse recurso seja explorado de forma eficiente é preciso que as informações básicas, que irão permitir o dimensionamento da magnitude da diversidade genética disponível, sejam geradas. O presente trabalho teve como objetivo realizar a caracterização genética molecular de uma população base do programa de melhoramento genético da Ridesa/UFG, representada por uma amostra de 160 clones, pela utilização de 37.914 marcadores SNPs. A diversidade genética revelada por estes marcadores, em que a dosagem de cada alelo não é detectável em cada genótipo, em decorrência da poliploidia, foi de magnitude intermediária, com índice de diversidade genética de Nei estimado em 0,173. A estimativa de heterozigosidade média observada apresentou valor mais elevado 0,236. As estimativas de divergência genética obtidas pela distância de Rogers modificada por Wright variaram entre 0,20 e 0,30. Na análise de agrupamento foram identificados sete grupos de clones. O uso de SNPs foi eficiente em identificar pares de indivíduos geneticamente divergentes, mesmo sem dispor de informações de genealogia. A análise de estruturação genética pelo software Structure sugeriu, a princípio, a existência de dois grupos. Cada clone, no entanto, se revelou constituído por uma mistura relativamente homogênea dos dois grupos identificados, confirmando a natureza híbrida das cultivares modernas de cana-de-açúcar. Estes resultados sugerem que, dada o reduzido nível de estruturação da diversidade genética ao nível de clones, do ponto de vista de melhoramento, a população possa ser considerada como um grupo fracamente estruturado, com a presença de poucos grupos envolvendo pequeno número de genótipos. Entre os clones avaliados, os pares menos divergentes são constituídos pelos genótipos 023 e 011, e 066 e 036. Os pares mais divergentes são constituídos pelos clones 131 e 084, e 131 e 063.

Made available in DSpace on 2014-07-29T14:52:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_UFG_Keyla_ORibeiro.pdf: 2021366 bytes, checksum: 719945fe498cc8ef7b6d15b1343d35dd (MD5) Previous issue date: 2011-04-26 / Soybean is currently the most prominent crop in the Brazilian production of grains. Its main products include oil and meal, which have been used for the production of food and animal feed. The high protein contents represent the main attraction of soybean use in diet. Furthermore, soybean oil has also been used in the production of biodiesel. These industrial segments demands cultivars with similar profiles of fatty acids, in which case the oil guarantees a better oxidative stability. This profile corresponds to oils with low polyunsaturated acids contents, associated to high contents of monounsaturated fatty acids. For that, it becomes essential the chemical characterization of grains in cultivars, which could be extended to the genetic resources preserved in germplasm collections, with the purpose of breeding soybean in these traits. Nowadays the characterization of these resources is still deficient, mainly regarding special traits such as those previously mentioned. In this context, the objective of this study was to characterize a sub-collection of 527 accessions of soybean from the germplasm bank of Secretaria de Agricultura, Pecuária e Abastecimento do Estado Goiás (SEAGRO-GO), based on the physicochemical traits of the grain, including protein and oil contents in the meal, and the main fatty acids contents of the oil. The grains were obtained through a field trial carried out at the experimental unit of SEAGRO-GO (16°43 S; 49°7 W; 765 m), county of Senador Canedo - GO, in the 2007-2008 growing season. The experimental design was augmented blocks (blocks of Federer), with two check cultivars (Conquista and Monsoy 6101). The plots were constituted by one row of plants (5.0 m x 0.5 m). The protein contents were quantified by the Kjeldahl method, the oil by the Soxhlet method, and the fatty acids (palmitic, stearic, oleic, linoleic and linolenic) by FAME method (Fatty Acid Methyl Esters). To assess the genetic divergence among accessions the multivariate analyses used were: canonical variables, principal components and cluster analysis. The last one was performed by the hierarchical clustering method using UPGMA criteria. Canonical discriminant analysis was also performed on established similarity groups and on maturity groups of the accessions (early, intermediate and late). In the principal components analysis it was needed three components to retain 78% of the total variance, whereas in the canonical variables analysis only two of these variables captured 81.2% of this variation. About the phenotypic variation, it was observed that the studied sub-collection presents a relatively lowl variability among its accessions, in protein content (from 35.7% to 44.0%) and oil content (from 14.8% to 18.5%). For fatty acids, the germplasm showed a relatively wide variation, although characteristics of industrial interest such as high contents of oleic acid (greater than 40%) and low contents of polyunsaturated acids (less than 40%) are restricted to few accessions. Regarding the polyunsaturated acids, the germplasm presents satisfactory variability to the linoleic oil (omega-6), however, low variability to the linolenic acid (omega-3), especially in its upper limit. By cluster analysis they were established five similarity groups (A, B, C, D, and E) with the formation of subgroups in some them. The accessions of groups A and B present the largest oil and protein contents, respectively. The accessions of group C outstood with the best profile of oil quality (oxidative stability), and they were followed by the accessions of E and B groups. Among the germplasm with the best profiles of oil oxidative stability, it was still possible to identify in this collection five divergent groups of accessions with significant differences in fatty acids contents. The polyunsaturated and saturated fatty acids are the most relevant variables in the structuring of genetic diversity of this germplasm. / A soja é atualmente a cultura de maior destaque na safra brasileira de grãos. Entre seus principais produtos estão o óleo e o farelo, os quais têm sido matéria-prima para a produção de alimentos e ração animal. O elevado teor de proteína representa o principal atrativo do uso da soja na alimentação. Além disso, o óleo de soja tem sido também utilizado na produção de biodiesel. Esses segmentos industriais buscam cultivares com perfis semelhantes de ácidos graxos, cujo óleo garanta melhor estabilidade oxidativa. Isto corresponde a óleos com baixos teores de ácidos poli-insaturados, associados a elevados teores de ácidos graxos monossaturados. Para isso, torna-se indispensável a caracterização de atributos relacionados à qualidade do grão dos cultivares comerciais; o que pode ser estendido, para os propósitos de melhoramento da soja nesses atributos, aos recursos genéticos preservados em bancos de germoplasma. Atualmente a caracterização desses recursos ainda é deficiente, sobretudo quando se tratam de caracteres especiais como aqueles anteriormente mencionados. Nesse contexto, o objetivo deste trabalho foi caracterizar uma subcoleção de 527 acessos de soja do banco de germoplasma da Secretaria de Agricultura, Pecuária e Abastecimento do Estado de Goiás (Seagro-GO), com base nos teores de proteína, óleo e dos principais ácidos graxos no óleo. Os grãos foram obtidos de ensaio de campo conduzido na Unidade Experimental da Seagro-GO (16°43 S; 49°7 W; 765 m), município de Senador Canedo-GO, na safra 2007/2008. O delineamento experimental foi em blocos aumentados (blocos de Federer), com duas cultivares testemunhas (Conquista e Monsoy 6101) e parcela constituída de uma fileira de plantas (5,0 m x 0,5 m). Os teores de proteína foram quantificados pelo método Kjeldahl; de óleo, por Soxhlet; e os de ácidos graxos (palmítico, esteárico, oleico, linoleico e linolênico), pelo método FAME (Fatty Acid Methyl Esters). Para a avaliação da divergência genética entre os acessos, utilizaram-se as análises multivariadas de variáveis canônicas, de componentes principais e de agrupamento. Esta última foi realizada pelo método hierárquico aglomerativo, associado ao critério de ligação UPGMA. Também se realizaram análises discriminantes canônicas entre os grupos de similaridade identificados e entre os ciclos de maturação dos acessos (precoce, médio e tardio). Na análise de componentes principais foram necessárias três componentes para explicar 78% da variância total, ao passo que na análise de variáveis canônicas, apenas duas destas variáveis explicaram 81,2% dessa variação. Em relação à variação fenotípica, observou-se que a subcoleção apresenta variabilidade relativamente baixa entre os acessos, em seus teores de proteína (de 35,7% a 44,0%) e óleo (de 14,8% a 18,5%). Para os ácidos graxos, o germoplasma apresenta variação relativamente ampla, embora características de interesse industrial como elevados teores de ácido oleico (maiores que 40%) e baixos teores de ácidos poli-insaturados (menores que 40%) sejam restritas a poucos acessos. Quanto aos ácidos graxos poli-insaturados, o germoplasma apresenta variabilidade satisfatória para o ácido linoleico (ômega-6), porém, baixa variabilidade para o ácido linolênico (ômega-3), sobretudo em seu limite superior. Pela análise de agrupamento foram estabelecidos cinco grupos de similaridade multivariada (A, B, C, D e E), com formação de subgrupos em alguns deles. Os acessos dos grupos A e B apresentam os maiores teores de óleo e de proteína, respectivamente. Os acessos do grupo C destacam-se com os melhores perfis em qualidade do óleo (estabilidade oxidativa). Mesmo selecionando apenas o germoplasma com melhor perfil em estabilidade oxidativa do óleo, ainda foi possível identificar nessa coleção cinco grupos de acessos significativamente divergentes nos teores de ácidos graxos. As variáveis que se mostraram mais relevantes na estruturação da divergência genética desse germoplasma foram os teores de ácidos graxos poli-insaturados e saturados.

Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2017-08-30T10:51:56Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tatianne Piza Ferrari Abreu - 2014.pdf: 3603386 bytes, checksum: a40d79ec7974327b452379ba2fc94097 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-09-15T13:17:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tatianne Piza Ferrari Abreu - 2014.pdf: 3603386 bytes, checksum: a40d79ec7974327b452379ba2fc94097 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-15T13:17:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tatianne Piza Ferrari Abreu - 2014.pdf: 3603386 bytes, checksum: a40d79ec7974327b452379ba2fc94097 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-03-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Micrurus lemniscatus is a South American coral snake species, popularly known as “coral verdadeira”. It is widely distributed in Seasonally Dry Forests (SDF), Gallery Forests and Rainforests. The Tertiary events and the climatic oscillations of the Quaternary affected the distribution of these ecosystems altering, in turn, the distribution of animals associated to these habitats. We hypothesize that the forest expansion and contraction cycles caused by climate fluctuations may have influenced the current distribution and genetic structure of M. lemniscatus. This study aimed to study the evolutionary relationships and patterns of divergence among M. lemniscatus lineages and infer the historical biogeographic events that influenced the distribution and genetic variation. Twenty-nine individuals of M. lemniscatus were sampled from 16 localities in the states of Tocantins, Bahia, Goiás, Alagoas, Mato Grosso, Maranhão, Pará and Amazônia. Three mitochondrial regions (COI, 16S and ND4L) were sequenced, and together generated a fragment of 1595 bp and 23 different haplotypes. The analyses showed a very ancient lineage divergence ~ 4.5 Myr and high genetic differentiation among localities (FST=0.932; p<0.01), suggesting a limited gene flow among geographical regions. The demographic analyzes and neutrality tests indicated that there is no sign of expansion and that populations have constant size (Tajima’s D = 0.521; p = 0.763 and Mismatch distribution = 0.009; p= 0.779). In the analysis of the evolutionary relationship between haplotypes (by median-joining network method), no relationship between lineage and geographical space was found, suggesting incomplete lineage sorting. The results corroborate and give evidence that populations of M. lemniscatus were distributed in a more continuous region in the past, and the current distribution of this species may be the result of the reduction and separation of the geographical scope of their distribution, rather than having itself been an expansion event. This may be the result of cycles expansion of SDF and retraction of the rainforests during the cool and dry phases of the Quaternary. / Micrurus lemniscatus é uma espécie de cobra coral verdadeira sul-americana. Essa espécie possui uma ampla distribuição, ocorrendo em vários tipos de hábitats, incluindo Floresta Estacional Decidual e Semidecidual (FED), Matas de Galeria e Florestas Úmidas. No passado, os eventos do Terciário e as oscilações climáticas no Quaternário provavelmente influenciaram o padrão de distribuição dessas florestas, alterando a distribuição dos organismos associados à esses habitats. Hipotetiza-se que, os ciclos de expansão e retração florestal causados pelas flutuações climáticas podem ter influenciado a atual distribuição e estruturação genética de M. lemniscatus. Este trabalho teve por objetivo avaliar os padrões e relações evolutivas das linhagens genéticas de M. lemniscatus e compreender quais foram os eventos históricos biogeográficos que influenciaram a distribuição e a variação genética atual. Foram utilizados 29 amostras de indivíduos de M. lemniscatus de 16 localidades dos Estados de Tocantins, Bahia, Goiás, Alagoas, Mato Grosso, Maranhão, Pará, e Amazônia. Três regiões mitocondriais (COI, 16S e ND4L) foram sequenciadas, e juntas geraram um fragmento de 1595 pb e 23 diferentes haplótipos. As análises evidenciaram uma divergência bem antiga de linhagens, ~4,5 milhões de anos atrás e uma alta diferenciação genética entre as localidades (FST=0,932; p<0,01), o que sugere um fluxo gênico limitado entre essas regiões. As análises demográficas e testes de neutralidade indicaram que não há sinal de expansão e que as populações possuem tamanho constante (D de Tajima= 0,521; p= 0,763 e Distribuição de Mismatch= 0,009; p= 0,779). Na análise de relação evolutiva entre os haplótipos (pelo método median-joining network), não foi encontrada relação entre as linhagens e o espaço geográfico, sugerindo arranjo incompleto de linhagens. Os resultados corroboram e dão evidências de que as populações de M. lemniscatus eram distribuídas em uma região mais contínua no passado, e a atual distribuição desta espécie pode ser o resultado da redução e separação da abrangência geográfica de sua distribuição, ao invés de ter ocorrido propriamente um evento de expansão. Isso pode ser resultado dos ciclos de expansão das FED e retração das florestas úmidas durante as fases mais frias e secas do Quaternário.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-15T13:45:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Rodrigues Feitosa Ramos - 2015.pdf: 5145646 bytes, checksum: 488fb72c7846f0fe96bae9cbfed74b2a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-15T13:46:24Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Rodrigues Feitosa Ramos - 2015.pdf: 5145646 bytes, checksum: 488fb72c7846f0fe96bae9cbfed74b2a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-15T13:46:24Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Rodrigues Feitosa Ramos - 2015.pdf: 5145646 bytes, checksum: 488fb72c7846f0fe96bae9cbfed74b2a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-09-15 / The success of plant breeding programs depends on the choice of progenitors capable of producing progeny with desired characteristics, which are the raw material for the genetic selection. This study aimed to evaluate the combining ability of two groups of genitors, composed of 12 genotypes of rice, selected based on the high grain yield performance in each location (Goiania and Boa Vista), and their respective crosses, through complete diallel cross scheme without reciprocals, in two generations (F2 and F7). The experimental design was a randomized blocks, and it were evaluated the traits grain yield (PG) and days to flowering (DF), and estimated the varietal effect ( ̂), the average heterosis, varietal heterosis ( ̂ ) and specific heterosis ( ̂ in every generation, and for each group, the general combining ability ( ̂ ) of the parents. Significant differences were detected among the parents of both groups, for both traits, and were considered the most promising for the selection of new inbred lines, the combinations involving genitors with the highest values and positive effects of ̂ For PG trait in Goiânia, it were identified Canela Curta, Maninjau, Epagri 108 and Diamante, and in Boa Vista, the best genotypes were BRS Jaburu, BG90-2, Mearim, BRS Biguá and Chililica. For the DF trait in Goiânia, the genitors showing a decrease in the number of days to flowering and increased ̂ were Araguaia, CT11632, IRAT 122, Pratinha Branco and TOx 503, while for Boa Vista it were TOx 514, BRS Jaburu, Itaqui , BG90-2, BRS Biguá and IR54R. The use of SSR markers to infer the potential success of a certain hybrid combination, both in F2 and F7 generation, has not been indicated for the group of genitors evaluated. / O sucesso de programas de melhoramento de plantas autógamas depende da escolha de genitores capazes de produzir progênies com características desejadas. Dessa forma, este estudo teve como objetivo avaliar o potencial de dois grupos, de Goiânia e Boa Vista, com 12 genitores de arroz, e seus respectivos cruzamentos, por meio de cruzamentos dialélico completo sem os recíprocos, em duas gerações (F2 e F7), quanto às características agronômicas, em delineamento em blocos ao acaso. Para a os caracteres produção de grãos (PG) e dias até o florescimento (DF), foram avaliados: o efeito varietal ( ̂), a heterose média, a heterose varietal ( ̂ ) e a heterose específica ( ̂ em cada geração, e para cada grupo, obteve a estimativa da capacidade geral de combinação (gi) dos genitores. Foram detectadas diferenças significativas entre os genitores, de ambos os grupos, quanto às características agronômicas avaliadas, e foram consideradas mais promissoras, para a seleção de novas linhagens, as combinações envolvendo os genitores com as maiores magnitudes e efeitos positivos de ̂ para o caráter PG, em Goiânia foram Canela Curta, Maninjau, Epagri 108 e Diamante, além de serem os genitores mais produtivos. Para o caráter DF, os genitores que apresentaram as estimativas no sentido de diminuir o caráter, isto é, os mais precoces foram Araguaia, CT11632, IRAT 122, Pratinha Branco e TOx 503. Para o dialelo de Boa Vista teve como destaque os genitores BRS Jaburu, BG90-2, Mearim, BRS Biguá e Chililica, os quais apresentaram maiores magnitudes ̂ e efeitos positivos para o caráter PG. Quanto ao efeito ̂ para o caráter DF, os genitores TOx 514, BRS Jaburu, Itaqui, BG90-2, BRS Biguá e IR54R apresentaram efeitos negativos, reduzindo o caráter

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-30T15:17:06Z No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-30T15:17:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-30T15:17:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-30T15:17:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The guaraná (Paullinia cupana var. Sorbilis (Mart.) Ducke) is a native plant valued by Amazonian peoples, especially by Sateré-Maue tribe in northern Amazon region on the border with the state of Pará. Research shows that guaraná has stimulating and therapeutic properties that make it an important input for chemical refrigerants, pharmaceutical, and cosmetics. The aim of the study was to evaluate genetic, estimate variance components for morphological characteristics, and production of guaraná progenies. In the experiment conducted in the city of Maués-Am / EMBRAPA were evaluated 36 progenies brothers guaraná means in experimental design of randomized blocks with two replications and six plants per plot for agronomic characters and fruit yield (g.plant-1.year-1) arranged in two rows of three plants, spaced 5 m x 5 m. The analysis of quantitative character production (g.plant-1.year-1) was based on the average production over six years. The average of the best individual production was 28,355 g.plant-1.year-1, which is ten times higher than the state average productivity. Progenies have enough genetic diversity for selection of progeny and senior individuals with controlled crossings or intercross could generate a base population with high productivity and sufficient genetic diversity increases the likelihood of recovery of superior genotypes. / O guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis (Mart.) Ducke) é uma planta nativa valorizada pelos povos Amazônicos, especialmente pela tribo Sateré- Maué no norte da região Amazônica, na fronteira com o estado do Pará. As pesquisas mostram que o guaraná tem propriedades estimulantes e terapêuticas o que o tornam um importante insumo para as indústrias químicas de refrigerantes, farmacêuticas, e cosméticos. O objetivo do estudo foi avaliar valores genéticos, estimar componentes de variância para caracteres morfoagronômicos, e da produção de progênies de guaranazeiro. No experimento conduzido na cidade de Maués-Am/EMBRAPA, foram avaliadas 36 progênies de meios irmãos de guaranazeiro em delineamento experimental de blocos ao acaso com duas repetições e seis plantas por parcela para os caracteres agronômicos e produção de frutos (g.planta-1.ano-1) dispostas em duas fileiras de três plantas, no espaçamento de 5 m x 5 m. A análise do caráter quantitativo Produção (g.planta-1.ano-1) foi baseado na média da produção ao longo de seis anos. A média da produção do melhor indivíduo foi de 28.355 g.planta-1.ano-1, que é dez vezes maior do que a produtividade média estadual. As progênies apresentam diversidade genética suficiente para a seleção de progênies e de indivíduos superiores que com cruzamentos controlados ou intercruzamentos poderiam gerar uma população base com alta produtividade e diversidade genética suficiente aumentando a probabilidade de recuperação de genótipos superiores.

A obtenção de híbridos de milho está relacionada com o aumento de produtividade dessa cultura. Para isso, normalmente são realizados cruzamentos entre linhagens de diferentes grupos heteróticos, que são determinados pelos melhoristas de forma que seja maximizada a divergência entre eles. A escolha dos genitores a serem cruzados pode ser facilitada pelo uso de cruzamentos dialélicos. Os modelos usados para a análise dos dialélicos permitem a estimação de parâmetros úteis para a seleção dos genitores e o estabelecimento de grupos heteróticos, sendo que os efeitos genéticos normalmente podem ser considerados como aleatórios. A forma tradicional de análise inclui tais efeitos na matriz de incidência dos efeitos fixos e emprega o método dos mínimos quadrados ordinários, o que impossibilita a análise usando a metodologia dos modelos mistos. Os objetivos deste trabalho foram comparar os resultados das análises dialélicas obtidas considerando o modelo fixo e o modelo misto e avaliar a eficiência do melhor preditor linear não viesado (BLUP) para predição de cruzamentos não realizados entre linhagens de milho, utilizando informações de marcadores moleculares RFLP para a estimação da matriz de parentesco. Foram considerados dados de 80 híbridos interpopulacionais e 20 testemunhas comerciais, avaliados em um látice 10 x 10 em três locais. Esses híbridos foram obtidos pelo cruzamento entre 8 linhagens do grupo heterótico BR-105 e 10 do grupo BR-106, as quais foram genotipadas com marcador RFLP. A análise dialélica foi realizada segundo a metodologia que considera o modelo genético como fixo e usa o método dos mínimos quadrados ordinários, e também usando a metodologia de modelos mistos, assumindo que a capacidade geral de combinação (CGC) dos dois grupos heteróticos e a capacidade específica de combinação (CEC) representam efeitos aleatórios. Além disso, foi avaliada a predição de híbridos simples não realizados, com base na matriz de covariâncias genéticas entre o híbrido não realizado e os híbridos preditores, usando as informações do marcador RFLP. Como todos os híbridos foram obtidos, foi simulada a retirada de cada um deles do conjunto, sendo sua performance predita a partir dos 79 restantes. Os resultados mostraram que, na comparação entre as análises dialélicas obtidas com as duas metodologias, embora os valores da CGC das linhagens da população BR-106 e da CEC tenham baixa correlação entre as duas metodologias (r=-0,11 e r=-0,06, respectivamente), a classificação dos híbridos mais produtivos sofre poucas alterações (r=0,99) e não causa dificuldades na seleção. A eficiência do BLUP para predição de cruzamentos não realizados entre linhagens de milho, utilizando informações de marcadores moleculares para a estimação da matriz de parentesco, mostrou a existência de moderada correlação entre os valores dos BLUP’s da produção de grãos e os valores preditos a partir dos híbridos observados restantes (r=0,35), o que indica que essa metodologia tem capacidade em predizer a estimativa de valores não observados, porém com alguma imprecisão. Os mesmos resultados foram observados entre as capacidades específicas de combinação observadas e as preditas (r=0,30). Conclui-se que a metodologia de modelos mistos pode ser usada, desde que com ressalvas, dada as correlações moderadas. / The obtainment of maize single crosses is related with increasing in productivity. To do so, inbred lines derived of different heterotic groups are crossed. These groups are established in such a way that the genetic divergences among them are maximized. Using diallel crosses can facilitate the choice of the inbred lines to be crossed. The models used to perform these analyses allow estimating genetic parameters that are useful in the selection of parental lines and in determining the heterotic groups. In these models, generally, the genetic effects are considered as random. However, these analyses are usually performed considering these effects in the matrix of fixed effects, and obtaining the parameter estimates according to the ordinary least squares method, making impossible using mixed linear models theory. The aims of this research were to compare the results of diallel analyses obtained by using fixed and mixed models, and evaluate the efficiency of the best linear unbiased predictor (BLUP) in predicting non-realized single crosses. Eighty interpopulation hybrids and twenty commercial checks were evaluated in a 10 x 10 lattice design with two replications located in three environments. These single crosses were obtained by crossing eight and ten inbred lines from BR-105 and BR-106 heterotic groups, respectively. These eighteen lines were genotyped by using RFLP molecular markers and then the coefficient of parentage among them was estimated. The genetic parameters general (GCA) and specific (SCA) combining abilities were estimated through diallel analyses, considering the linear model as fixed and using the ordinary least squares as the estimation method. Besides, GCA and SCA were predicted using BLUP and assuming the genetic effects as random. Besides, the prediction of non-realized single crosses was evaluated. To do so, each one of the 80 realized hybrids was predicted based on information of the others 79 single crosses and using the genetic variance-covariance matrix estimated using RFLP information. According to the results, it was found poor correlation between estimatives and predictions obtained considering the model as fixed or mixed, for GCA within BR-106 population (r=-0.11) and for SCA (r=-0.06). However, the ranking of the single crosses for productivity did not change (r=0.99) and did not make selection process more difficult. The efficiency of BLUP in predicting unrealized single crosses was moderated since the correlation between observed and predicted values was r=0.35, indicating some imprecision in these predictions. Similar results were obtained when comparing observed and predicted SCAs (r=0.30). It was possible to conclude that BLUP can be useful in diallel analyses and in prediction of single crosses, but some caution have to be account since the correlations presented moderate values.

This study had as objective to estimate the genetic divergence among sugarcane genotypes by means of morphoagronomical characters and molecular markers, and to verify the relation between these procedures. An experiment was conducted in Rio Largo, AL, using a randomized block design with four repetitions. The multivariated analysis of Principal Components, the genetic divergence based on the Mahalanobis 2 ii' D Generalized Distance, and the Average Euclidean Distance Standardized were used for the analysis of the quantitative characters. Based on these distances, a grouping analysis was performed by the More Distant Neighbor method and the UPGMA method, besides Tocher for 2 ii' D . Jaccard coefficient and UPGMA grouping were used in the evaluation of the genetic divergence by molecular markers and morphologic characters. The inconsistency as to formation of different groups between the Standardized Average Euclidean Distance and 2 ii' D of Mahalanobis characterize these two estimates as measures of different dissimilarity. In the same way, the grouping techniques by the More Distant Neighbor method and by UPGMA show graphical dispersions that are not coincident, with differences in relation to the number of groups and in the grouping pattern, while the grouping by UPGMA and obtained by Tocher showed the same agreements. The 2 ii' D Distance of Mahalanobis corresponded to the Principal Components technique, by showing the same groups made by Tocher and UPGMA, obtained from 2 ii' D . However, these techniques did not indicate agreement with the Standardized Average Euclidean Distance. The correlation between the genetic divergence through morphologic characters and estimated by molecular markers was significant, however, from average magnitude (r = 0,47), indicating to be complementary measurements. There was not significant correlation for the divergence obtained through quantitative characteristics with the morphologic characters and molecular markers obtained by the different estimators, as well as between Standardized Average Euclidean Distance and the Mahalanobis 2 ii' D , which indicates clearly that there is no relation between these estimates. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este trabalho teve como objetivos a estimação da divergência genética entre genótipos de cana-de-açúcar, por meio de caracteres morfoagronômicos e marcadores moleculares, e verificar a relação entre esses procedimentos. Foi conduzido um experimento em Rio Largo, AL, utilizando o delineamento em blocos casualisados com quatro repetições. Para a análise dos caracteres quantitativos foi utilizada a análise multivariada de Componentes Principais, divergência genética a partir da Distância Generalizada 2 ii' D de Mahalanobis e Distância Euclidiana Média Padronizada. Com base nestas distâncias, realizaramse análise de agrupamento pelo método Hierárquico do Vizinho mais Distante e método UPGMA, além de Tocher para 2 ii' D . Na avaliação da divergência genética por meio de marcadores moleculares e caracteres morfológicos, utilizou-se o coeficiente de Jaccard e agrupamento UPGMA. As inconsistências quanto à formação de diferentes grupos entre a Distância Euclidiana Média Padronizada e a Distância 2 ii' D de Mahalanobis caracterizam estas duas estimativas como medidas de dissimilaridade distintas. Da mesma forma as técnicas de agrupamento pelo método do Vizinho mais Distante e por UPGMA evidenciam dispersões gráficas não coincidentes, com diferenças quanto ao número de grupos e ao padrão de agrupamento, ao passo que o agrupamento por UPGMA e obtido por Tocher apresentaram a mesma concordância. A Distância 2 ii' D de Mahalanobis correspondeu à técnica de Componentes Principais, por apresentarem os mesmos grupos formados por Tocher e UPGMA, obtidos a partir de 2 ii' D . No entanto, estas técnicas não indicaram concordância com a Distância Euclidiana Média Padronizada. A correlação entre a divergência genética através de caracteres morfológicos e a estimada por marcadores moleculares foi significativa, porém, de média magnitude (r = 0,47), indicando serem medidas complementares. Não houve correlação significativa para a divergência obtida por meio de características quantitativas com os caracteres morfológicos e marcadores moleculares, obtida pelos diferentes estimadores, assim como, entre a Distância Euclidiana Média Padronizada e a 2 ii' D de Mahalanobis, o que indica claramente não existir qualquer relação entre estas estimativas.