Orientador: Germano Francisco Biondi / Banca: Roberto de Oliveira Roça / Banca: Oswaldo Durival Rossi Júnior / Resumo: O presente estudo analisou a incidência de cisticercose bovina em 10 abatedouros sob o Serviço de Inspeção Federal no estado do Paraná no ano de 2005 a2009.Os dados foram obtidos através dos mapas nosográficos mensais, os quais estavam no sistema do SIGSIF; neste contém registros do número de animais abatidos, quantidade de animais positivos para cisticercose e o município de origem destes animais positivos. A incidência média no decorrer do estudo foi de 3,85 % (110.514/2.863.427) de cisticercose bovina. A partir dos resultados obtidos, conclui-se que os índices de incidência de cisticercose bovina para o estado do Paraná foram altos, o que significa que trabalhos educativos e instrutivos quanto ao problema devem ser aprimorados eintensificados / Abstract: This study examined the incidence of bovine cysticercosis in 10 slaughterhouses under Federal Inspection Service in the State of Parana in 2005 2009. The data were obtained from the monthly maps nosographic, which were in the system SIGSIF, this contains records of the number of slaughtered animals, number of animals positive for cysticercosis and city of origin of these positive animals.The average incidence during the study was 3,85% (110.514/2.863.427) of bovine cysticercosis. From the results obtained, it is conclude that the rates of incidence of bovine cysticercosis in the state of Paraná were high, which means that instructive and educational work on the problem should be enhanced and intensified / Mestre

Orientador: Katia Denise Saraiva Bresciani / Banca: Carlos Noriyuki Kaneto / Banca: Solange Maria Gennari / Banca: Sílvia Helena Venturoli Perri / Banca: Jancarlo Ferreira Gomes / Resumo: Os objetivos deste trabalho foram comparar os métodos de diagnóstico por ensaio imunoenzimático (ELISA) de captura e reação em cadeia da polimerase (nested-PCR) à análise morfológica utilizando a técnica de centrífugo-flutuação em água-éter seguida de coloração de Kinyoun modificada (microscopia) para estimar a taxa de eliminação de oocistos de Cryptosporidium spp. na população de gatos domiciliados na zona urbana do Município de Araçatuba, São Paulo. O potencial zoonótico do coccídio isolado em fezes deste hospedeiro foi investigado por meio de caracterização molecular. Um total de 138 amostras fecais foi colhido de forma aleatória simples e proporcional à população de gatos de cada uma das sete áreas censitárias pertencentes à zona urbana do município. Não houve discordância entre ELISA de captura e microscopia (p = 1,0000) nem entre nested-PCR e microscopia (p = 0,1094); entretanto, o grau de concordância variou de substancial (Kappa = 0,7948) a moderado (Kappa = 0,4647), respectivamente, entre estes métodos. Especificidade da nested-PCR e do ELISA de captura foi semelhante; entretanto, a nested-PCR apresentou menor sensibilidade, justificada pela associação entre a intensidade da densidade óptica e a amplificação da subunidade 18S do rRNA. Detectamos oocistos de Cryptosporidium spp. em 9,4% das amostras por pelo menos dois métodos diagnósticos. Com intervalo de 95% de confiança, estimamos que a taxa de eliminação de oocistos desse protozoário na população felina do município variou de 4,5% a 14,3%. Todos os isolados sequenciados apresentaram 100% de similaridade com Cryptosporidium felis. Concluímos que gatos domiciliados possam contribuir para a contaminação ambiental de um município, ainda que C. felis não seja o principal agente etiológico da criptosporidiose em seres humanos / Abstract: The aim of this work was to compare the diagnostic methods by capture enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and polymerase chain reaction (nested-PCR) to morphological analysis using the technique of flotation in water-ether followed by modified Kinyoun staining (microscopy) to estimate the shedding rate of Cryptosporidium spp. in stool samples of cats domiciled in urban area of municipality of Araçatuba, São Paulo State. Zoonotic potential of coccidian isolated in feces was investigated by molecular characterization. A total of 138 stool samples were collected random and proportionally from to cat population in each of the seven census areas belonging to the urban area. There was no disagreement between capture ELISA and microscopy (p = 1.0000) or between nested-PCR and microscopy (p = 0.1094); however, the degree of agreement varied from substantial (Kappa = 0.7948) to moderate (Kappa = 0.4647), respectively, in these diagnostic methods. Specificity of nested-PCR and ELISA capture were similar; however, the nested-PCR showed lower sensitivity, justified by the association between the intensity of the optical density and amplification of 18S rRNA subunit. We detected Cryptosporidium spp. in 9.4% of the samples by at least two diagnostic methods. With the 95% confidence, we estimate that shedding rate of Cryptosporidium oocysts ranged from 4.5% to 14.3% in the feline population of Araçatuba. All isolates sequenced showed 100% similarity with Cryptosporidium felis. We conclude that cats domiciled can contribute to environmental contamination of a municipality, although C. felis is not the primary etiologic agent of cryptosporidiosis in humans / Doutor

O vírus da diarreia viral bovina (BVDV) causa uma das doenças mais importantes de bovinos em termos de custos econômicos e sociais, uma vez que é largamente disseminado na população de gado leiteiro. Os objetivos do trabalho foram estimar a prevalência em nível de rebanho e investigar fatores associados aos níveis de anticorpos em leite de tanque através de um estudo transversal, bem como discutir e comparar diferentes técnicas de modelagem, as tradicionais como regressão e as menos usuais para este fim, como as de Machine learning (ML) como Random Forest. O estudo transversal foi realizado no estado do Rio Grande do Sul para a estimação da prevalência de doenças reprodutivas baseados em amostras de tanque de leite, partindo de uma população total de 81.307 rebanhos. Foram coletadas 388 amostras de tanque de leite, e nas propriedades selecionadas foi aplicado um questionário epidemiológico. Como resultados se identificou uma prevalência de 23,9% (IC95% = 19,8 - 28,1) de propriedades positivas. Através de análise de regressão de Poisson se identificou como fatores associados o BVDV: o exame retal como rotina para o diagnóstico de prenhes, Razão de Prevalência [PR] = 2,73 (IC 95%: 1.87-3.98), contato direto entre animais (contato via cerca de propriedades lindeiras) (PR=1,63, IC 95%: 1.13-2.95) e propriedades que não utilizavam inseminação artificial (PR=2.07, IC 95%: 1.38-3.09) Na técnica de Random Forest pôde-se identificar uma dependência na ocorrência de BVDV devido a: inseminação artificial quando realizada pelo proprietário da propriedade ou capataz, o número de vizinhos que também possuem criação de bovinos, e em concordância com os resultados da regressão quanto a dependência da ocorrência de BVDV devido a palpação retal. Como resultado, pôde-se perceber que o BVDV está distribuído no estado do RS e caso seja de interesse do poder público, o desenvolvimento de um programa de controle da doença pode ser baseado nos resultados encontrados. Por outro lado, a contribuição deste estudo vai além das tradicionais análises realizadas em epidemiologia veterinária, principalmente devido os bons resultados obtidos com a abordagem por ML neste estudo transversal. Por fim, a utilização de técnicas estatísticas mais avançadas contribuiu para elucidar melhor os fatores possivelmente envolvidos com a ocorrência de BVDV no rebanho leiteiro gaúcho. / The bovine viral diarrhea virus (BVDV) causes one of the most important disease of cattle in terms of economic and social costs, since it is widely disseminated in dairy cattle population. The objectives were to estimate the herd level prevalence at and investigate factors associated with antibody levels in bulk tank milk through a cross sectional study, discuss and compare different modeling techniques such as the traditional regression with the ones less used for this approach machine learning (ML). The cross sectional study was conducted in Rio Grande do Sul state to estimate the prevalence of reproductive diseases based on bulk tank milk samples, from a total population of 81,307 herds. Milk samples from 388 bulk tank were sampled, and an epidemiological questionnaire was applied in each farm. The prevalence was 23.9% (95% CI 19.8 - 28.1). Through the Poisson regression analysis, the following factors associated with BVDV were found: routine use of rectal examination for pregnancy (Prevalence Ratio [PR] = 2.73 (IC 95%: 1.87-3.98), direct contact between/among animals (contact over the fence of neighboring farms) (PR = 1.63, IC 95%: 1.13-2.95) and properties that did not use artificial insemination (PR = 2.07, IC 95%: 1.38-3.09). On the other hand, using ML techniques, it was identify a dependency upon the occurrence of BVDV due to: artificial insemination when carried out by the owner of the property or foreman; the number of neighbors who also have cattle, and in accordance with the regression results as the dependence of the occurrence of BVDV due to routine use of rectal examination for pregnancy. BVDV is spread across the State and if the government's interest to launch a disease control program measures should be focusing mainly on better conditions and care in reproduction. On the other hand, the contribution of this study goes beyond traditional analyzes in veterinary epidemiology, mainly due to the good results obtained with the approach by ML in this cross-sectional study. Finally, the use of advances statistics techniques it has been made progress to better elucidate the factors possibly involved in the occurrence of BVDV in state dairy herds.

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:23:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-04-24. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:29:45Z : No. of bitstreams: 1 000849387_20161231.pdf: 143497 bytes, checksum: ae5f76282e5b29080f53735526e3c528 (MD5) Bitstreams deleted on 2017-01-02T15:03:58Z: 000849387_20161231.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-01-02T15:05:11Z : No. of bitstreams: 1 000849387.pdf: 2412719 bytes, checksum: bbc7948279cd76db4344ac1e779b661c (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A mastite é a afecção que mais onera o setor leiteiro mundial, sendo ainda importante entrave para melhoria da produção. O objetivo deste estudo epidemiológico prospectivo foi desenvolver um plano de controle de mastite em um rebanho de vacas Holandesas. A propriedade foi visitada durante 18 meses para colheita de dados e instituição do plano de controle. Os primeiros quatro meses corresponderam à fase de diagnóstico, seguida de uma fase de intervenção perfazendo 14 meses. O plano de controle reduziu de 53,7% para 23,3% a mastite subclínica. A contagem de células somáticas do tanque reduziu de 1446 x 103 células/mL para 214 x 103 células/mL. A prevalência de mastite clínica foi 11,11% e a incidência média foi de 7,6%. Do total de 704 casos, 30,1% (217/704) não puderam ser avaliados quanto à cura bacteriológica, por não haver a amostras pós-tratamento, 51,3% (249/485) curaram, 49,7% (236/485) falharam e repetiram o mesmo patógeno ou falharam com isolamento de um novo patógeno. Do total de 485 casos que puderam ser avaliados quanto à cura bacteriológica 71,9% (349/485), 19% (92/485), 7,4% (36/485) e 1,6% (8/485) eram, respectivamente, referentes aos primeiros, segundos, terceiros e quartos casos de mastite clínica na mesma glândula mamária. Houve falha no tratamento em 53,65% (44/82), 47,5% (165/347) e 48,21% 27/56, severidade um, dois e três, respectivamente. O plano de controle de mastite foi eficiente em reduzir a prevalência de mastite subclínica e elucidar os índices de mastite clínica, através de medidas simples de manejo e embasada no adequado diagnóstico epidemiológico / Mastitis is a disease that more burdens the world dairy sector still major obstacle to improving production. The aim of this prospective epidemiological study was to develop a mastitis control plan in a Holstein cow herd. The property has been visited for 18 months to harvest data and control plane of the institution. The first four months corresponded to the diagnostic phase, followed by an intervention phase amounting to 14 months. The control plan has reduced from 53.7% to 23.3% subclinical mastitis. The somatic cell count of the tank reduced from 1446 x 103 cells / ml to 214 x 103 cells/ml. The prevalence of clinical mastitis was 11.11% and the average incidence was 7.6%. Of the total 704 cases, 30.1% (217/704) could not be evaluated for bacteriological cure because there is no post-treatment samples, 51.3% (249/485) healed, 49.7% (236/485) failed and repeated the same pathogen or failed to isolation of a new pathogen. Of the total 485 cases that could be evaluated for bacteriological cure 71.9% (349/485), 19% (92/485), 7.4% (36/485) and 1.6% (8/485) They were, respectively, related to the first, second, third and fourth cases of clinical mastitis in the same mammary gland. There was treatment failure in 53.65% (44/82), 47.5% (165/347) and 48.21% 27/56, severity one, two and three, respectively. The mastitis control plan was effective in reducing the prevalence of subclinical mastitis and elucidate the clinical mastitis rates through simple measures of management and grounded in proper epidemiological diagnosis / FAPESP: 2013/24973-5

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:45Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-10-05Bitstream added on 2014-06-13T20:15:35Z : No. of bitstreams: 1 000747445.pdf: 1484676 bytes, checksum: 4f564638a4c24626d700ae33fbf0f252 (MD5) / O presente estudo analisou a incidência de cisticercose bovina em 10 abatedouros sob o Serviço de Inspeção Federal no estado do Paraná no ano de 2005 a2009.Os dados foram obtidos através dos mapas nosográficos mensais, os quais estavam no sistema do SIGSIF; neste contém registros do número de animais abatidos, quantidade de animais positivos para cisticercose e o município de origem destes animais positivos. A incidência média no decorrer do estudo foi de 3,85 % (110.514/2.863.427) de cisticercose bovina. A partir dos resultados obtidos, conclui-se que os índices de incidência de cisticercose bovina para o estado do Paraná foram altos, o que significa que trabalhos educativos e instrutivos quanto ao problema devem ser aprimorados eintensificados / This study examined the incidence of bovine cysticercosis in 10 slaughterhouses under Federal Inspection Service in the State of Parana in 2005 2009. The data were obtained from the monthly maps nosographic, which were in the system SIGSIF, this contains records of the number of slaughtered animals, number of animals positive for cysticercosis and city of origin of these positive animals.The average incidence during the study was 3,85% (110.514/2.863.427) of bovine cysticercosis. From the results obtained, it is conclude that the rates of incidence of bovine cysticercosis in the state of Paraná were high, which means that instructive and educational work on the problem should be enhanced and intensified

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:51Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-10-11Bitstream added on 2014-06-13T18:48:09Z : No. of bitstreams: 1 000735855.pdf: 2456045 bytes, checksum: d4163cc3219978e13e5e6d72726e31c5 (MD5) / O vírus respiratório sincicial bovino (BRSV), agente etiológico relacionado à doença respiratória bovina, causa grandes prejuízos econômicos principalmente na criação de bezerros. O BRSV já foi relatado no Brasil com prevalências sorológicas elevadas, no entanto, ainda não foram determinados os fatores de risco envolvidos na disseminação do vírus nos rebanhos brasileiros e poucas amostras do vírus foram caracterizadas. Assim, o presente estudo teve como objetivo caracterizar a epidemiologia da infecção pelo BRSV em rebanhos bovinos leiteiros do Estado de São Paulo (SP), por meio da análise sorológica e de fatores de risco, e também pelo vírus circulante nesses rebanhos. Foram colhidas 1.243 amostras de sangue e 352 amostras de secreções nasais de bovinos em 26 propriedades rurais, divididas nas regionais de Jaboticabal, São José do Rio Preto e Catanduva, localizadas na região norte do Estado SP. Durante a colheita das amostras, foi aplicado um questionário ao proprietário sobre informações relacionadas como prováveis fatores de risco para a infecção pelo BRSV em cada propriedade. Os soros foram analisados pela técnica de virusneutralização (VN) e as amostras de secreções nasais foram examinadas para detecção do gene das proteínas F e G do BRSV pela RT-nested PCR. Os resultados da VN mostraram elevada prevalência de BRSV nos rebanhos leiteiros, com total de 79,49% de reagentes. Os resultados separados por regionais revelaram prevalências de 76,19%, 83,68% e 69,14% de soropositivos, para Jaboticabal, São José do Rio Preto e Catanduva, respectivamente. Os rebanhos da regional de São José do Rio Preto apresentaram maiores prevalências de BRSV quando comparados aos rebanhos das outras duas regionais. A análise dos fatores de risco permitiu inferir que a idade dos animais e a ocorrência de infecção concomitante pelo herpesvírus bovino tipo 1 e vírus... / Bovine respiratory syncytial virus (BRSV), agent related to bovine respiratory disease, causes large economic losses mainly in calf rearing. BRSV has already been reported in Brazil with high serological prevalence, however, the risk factors related to its dissemination were not yet determined and a few number of virus strains was characterized in Brazilian herds. Thus, the study aimed to characterize the epidemiology of BRSV infection in dairy herds of São Paulo State, using serological and risk factors analysis, and also by virus circulating in these herds. For that, 1.243 blood samples and 352 nasal secretion samples were collected of animals from 26 farms divided into Jaboticabal, São José do Rio Preto and Catanduva regional, located in the northern region of São Paulo State. During the sample collection, a questionnaire was performed to the owner for each property regarding information about possible risk factors for BRSV. Sera were analyzed using virus neutralization test (VNT), and nasal secretions were examined to detect the F and G protein gene of BRSV by RT-nested PCR. VNT results showed high BRSV prevalence in dairy herds, reaching 79.49% of reagents. The separated results by regional revealed prevalence of 76.19%, 83.68% and 69.14% for Jaboticabal, São José do Rio Preto and Catanduva, respectively. The herds in the regional of São José do Rio Preto showed the highest prevalence of BRSV when compared to the other two regional herds. The analysis of risk factors allowed deducing that the age of the animals and the occurrence of concomitant infection by bovine herpesvirus type 1 and bovine viral diarrhea are associated with the high BRSV prevalence, while calving natural lactation was identified as a protective factor. The RT-nested PCR detected a positive sample for the F protein gene, and after its sequencing, the genetic relatedness of the sample to the other ...

Made available in DSpace on 2015-04-09T12:28:10Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-02Bitstream added on 2015-04-09T12:48:05Z : No. of bitstreams: 1 000815117.pdf: 1605584 bytes, checksum: 806edb3db344e3acd66cec8448e8efae (MD5) / A febre aftosa (FA), doença altamente contagiosa que afeta os animais biungulados, é reconhecida pelos prejuízos econômicos nas propriedades e nas regiões onde é endêmica. O Estado de São Paulo não registra focos de FA desde 1996. A partir de dados oficiais obtidos de 1997 a 2012, este estudo organizou, analisou e confrontou com a literatura pertinente as taxas de vacinação contra FA nas diferentes etapas e nas diversas regiões do Estado de São Paulo; analisou os resultados do monitoramento oficial delineado para demonstrar a eficiência da vacinação contra a FA; analisou os procedimentos de vigilância passiva e de atendimento às notificações de suspeitas de doenças vesiculares no Estado de São Paulo; analisou os resultados do monitoramento oficial delineado para demonstrar a ausência de circulação viral no Estado de São Paulo; relacionou as medidas preventivas adotadas pela Coordenadoria de Defesa Agropecuária, da Secretaria de Agricultura e Abastecimento do Estado de São Paulo (CDA/SAA/SP) diante de focos de FA em outros Estados limítrofes. Finalmente, foram descritas as perspectivas de implementação de área livre sem vacinação para o Estado de São Paulo, classificação outorgada pela Organização Mundial de Saúde Animal (OIE) / Foot-and-mouth disease (FMD), a highly contagious disease that affects cloven-hoofed animals, is recognized by economic losses on properties and in the regions where it is endemic. The State of São Paulo has had no records of outbreaks of FMD since 1996. From official data from 1997 to 2012, this study organized, analyzed and confronted with relevant literature rates of FMD vaccination at different periods and in different regions of the State of São Paulo; analyzed the results of the official monitoring designed to demonstrate the efficiency of vaccination against FMD; examined the passive surveillance procedures and care to reports of suspected vesicular disease in the State of São Paulo; analysed the results of the official monitoring designed to demonstrate the absence of viral circulation in the State of São Paulo; related preventive measures adopted by Coordenadoria de Defesa Agropecuária, the Secretaria de Agricultura e Abastecimento of the Estado de São Paulo before outbreaks of FMD in other neighboring States. Finally, the prospects of implementing free zone without vaccination for the State of São Paulo, ranking granted by the World Organization for Animal Health

Made available in DSpace on 2015-08-20T17:09:38Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-01-30. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-20T17:26:44Z : No. of bitstreams: 1 000836708.pdf: 1817578 bytes, checksum: 0849a32e5b604abb3d7dc4c68e0bc37a (MD5) / A criação comercial de cães é uma atividade econômica importante no Brasil e tem aumentado, em média, 20% ao ano. Tais empresas têm se preocupado cada vez mais no aprimoramento das raças, modernização e utilização de biotecnologias da reprodução. Contudo, a performance reprodutiva é desconsiderada neste tipo de criação, apesar de perdas expressivas em vista de transtornos reprodutivos, causados por manejo sanitário inadequado, culminando em abortamentos e perdas de neonatos. Em vista disto, objetivou-se com este estudo efetuar um levantamento epidemiológico do Herpesvírus canino tipo 1, Toxoplasma gondii, Neospora caninum, Brucella canis, Leptospira spp e Ehrlichia canis em canis comerciais e correlacionar os achados com a ocorrência de transtornos reprodutivos, idade, sexo e raça. Foram colhidas amostras de sangue de 400 cães adultos com idade média 29,1 ± 8,9 meses, de canis comerciais localizados na microrregião de Ribeirão Preto, SP, para realização de testes sorológicos e moleculares. Os dados sobre manejo sanitário e reprodutivo foram colhidos em forma de entrevistas aplicados ao proprietários dos canis. O estudo foi baseado na ocorrência de Brucella canis (imunocromatografia), Toxoplasma gondii (reação de imunofluorescência indireta), Neospora caninum (imunofluorescência indireta), Leptospira spp (soroaglutinação microscópica), Herpesvírus canino (PCR), Ehrlichia canis e Ehrlichia sp (PCR). A análise estatística empregada consistiu no tratamento descritivo geral dos resultados obtidos, avaliados pelo software Epi Info 7, com a determinação das estimativas de prevalência e cálculo do intervalo de confiança das taxas de doenças na microrregião de Ribeirão Preto. Essa análise investigou o efeito simultâneo de vários fatores (doenças) em uma variável resposta (abortamento e morte neonatal). A população canina estudada foi constituída de 108 machos (27,0%, IC95%: 22,65-31,35) e... / The commercial kennel breeding is an important economic activity in Brazil and has increased, in media, on 20% per year. The breeding has given importance to concern in the improvement of breeds, modernization and use of reproductive biotechnologies. Nevertheless, the reproductive performance is overlooked in breeding of dogs, though of significant losses due of reproductive disorders caused by inadequate sanitary management, culminating in abortions and neonatal/pup losses. Thus, the aim of this study was investigated the infectious causes of abortion and neonatal/pup deaths in commercial kennels. Blood samples from 400 dogs with an average age 29.1 ± 8.9 months were collected from kennels located in the microregion of Ribeirão Preto, SP, for serological and molecular. The data regarding to health and reproductive management were collected by a questionnaire. The studied was based on prevalence of Brucella canis (imunochromatography), Toxoplasma gondii (indirect immunofluorescence reaction), Neospora caninum (indirect immunofluorescence), Leptospira ssp (microscopic soroagglutination), canine Herpesvirus (PCR), Ehrlichia canis e Ehrlichia sp (PCR). The statistical analysis was descriptive, and we used the simple and multiple linear regressions to verify the interaction between dependent variables (abortion and neonatal/pup deaths) and percent positive cases. Canine population studied consisted of 108 males (27,0%, IC95%: 22,65-31,35) and 292 females (73,0%; IC95%: 68,65-77,35). The prevalence of diseases studied was B. canis (15,0%; IC95%: 11,50-18,50), T. gondii (17,3%; IC95%: 13,55-20,95), N. caninum (30,50%; IC95%: 26,19-35,18), Leptospira spp (34%; IC95%: 29,53-38,77), Ehrlichia sp (4,5%; IC95%: 2,87-7,00) and E. canis (15,5%; IC95%: 11,95-19,05), There was no positive case of canine herpesvirus. When the variable abortion was avaliable we can got one association with T. gondii (p = 0,004260) and B. canis (p = 0,0000012). When ...

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:53Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-05-08Bitstream added on 2014-11-10T11:57:46Z : No. of bitstreams: 1 000791056.pdf: 1521345 bytes, checksum: 03c061fa4f15b07c0492cc0bf73a460a (MD5) / Os objetivos deste trabalho foram comparar os métodos de diagnóstico por ensaio imunoenzimático (ELISA) de captura e reação em cadeia da polimerase (nested-PCR) à análise morfológica utilizando a técnica de centrífugo-flutuação em água-éter seguida de coloração de Kinyoun modificada (microscopia) para estimar a taxa de eliminação de oocistos de Cryptosporidium spp. na população de gatos domiciliados na zona urbana do Município de Araçatuba, São Paulo. O potencial zoonótico do coccídio isolado em fezes deste hospedeiro foi investigado por meio de caracterização molecular. Um total de 138 amostras fecais foi colhido de forma aleatória simples e proporcional à população de gatos de cada uma das sete áreas censitárias pertencentes à zona urbana do município. Não houve discordância entre ELISA de captura e microscopia (p = 1,0000) nem entre nested-PCR e microscopia (p = 0,1094); entretanto, o grau de concordância variou de substancial (Kappa = 0,7948) a moderado (Kappa = 0,4647), respectivamente, entre estes métodos. Especificidade da nested-PCR e do ELISA de captura foi semelhante; entretanto, a nested-PCR apresentou menor sensibilidade, justificada pela associação entre a intensidade da densidade óptica e a amplificação da subunidade 18S do rRNA. Detectamos oocistos de Cryptosporidium spp. em 9,4% das amostras por pelo menos dois métodos diagnósticos. Com intervalo de 95% de confiança, estimamos que a taxa de eliminação de oocistos desse protozoário na população felina do município variou de 4,5% a 14,3%. Todos os isolados sequenciados apresentaram 100% de similaridade com Cryptosporidium felis. Concluímos que gatos domiciliados possam contribuir para a contaminação ambiental de um município, ainda que C. felis não seja o principal agente etiológico da criptosporidiose em seres humanos / The aim of this work was to compare the diagnostic methods by capture enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and polymerase chain reaction (nested-PCR) to morphological analysis using the technique of flotation in water-ether followed by modified Kinyoun staining (microscopy) to estimate the shedding rate of Cryptosporidium spp. in stool samples of cats domiciled in urban area of municipality of Araçatuba, São Paulo State. Zoonotic potential of coccidian isolated in feces was investigated by molecular characterization. A total of 138 stool samples were collected random and proportionally from to cat population in each of the seven census areas belonging to the urban area. There was no disagreement between capture ELISA and microscopy (p = 1.0000) or between nested-PCR and microscopy (p = 0.1094); however, the degree of agreement varied from substantial (Kappa = 0.7948) to moderate (Kappa = 0.4647), respectively, in these diagnostic methods. Specificity of nested-PCR and ELISA capture were similar; however, the nested-PCR showed lower sensitivity, justified by the association between the intensity of the optical density and amplification of 18S rRNA subunit. We detected Cryptosporidium spp. in 9.4% of the samples by at least two diagnostic methods. With the 95% confidence, we estimate that shedding rate of Cryptosporidium oocysts ranged from 4.5% to 14.3% in the feline population of Araçatuba. All isolates sequenced showed 100% similarity with Cryptosporidium felis. We conclude that cats domiciled can contribute to environmental contamination of a municipality, although C. felis is not the primary etiologic agent of cryptosporidiosis in humans

Orientador: Samir Issa Samara / Coorientador: Clarice Weis Arns / Banca: Sandra Possebon Gatti / Banca: Fumio Honma Ito / Banca: Fernando Rosado Spilki / Banca: Luís Guilherme de Oliveira / Resumo: O vírus respiratório sincicial bovino (BRSV), agente etiológico relacionado à doença respiratória bovina, causa grandes prejuízos econômicos principalmente na criação de bezerros. O BRSV já foi relatado no Brasil com prevalências sorológicas elevadas, no entanto, ainda não foram determinados os fatores de risco envolvidos na disseminação do vírus nos rebanhos brasileiros e poucas amostras do vírus foram caracterizadas. Assim, o presente estudo teve como objetivo caracterizar a epidemiologia da infecção pelo BRSV em rebanhos bovinos leiteiros do Estado de São Paulo (SP), por meio da análise sorológica e de fatores de risco, e também pelo vírus circulante nesses rebanhos. Foram colhidas 1.243 amostras de sangue e 352 amostras de secreções nasais de bovinos em 26 propriedades rurais, divididas nas regionais de Jaboticabal, São José do Rio Preto e Catanduva, localizadas na região norte do Estado SP. Durante a colheita das amostras, foi aplicado um questionário ao proprietário sobre informações relacionadas como prováveis fatores de risco para a infecção pelo BRSV em cada propriedade. Os soros foram analisados pela técnica de virusneutralização (VN) e as amostras de secreções nasais foram examinadas para detecção do gene das proteínas F e G do BRSV pela RT-nested PCR. Os resultados da VN mostraram elevada prevalência de BRSV nos rebanhos leiteiros, com total de 79,49% de reagentes. Os resultados separados por regionais revelaram prevalências de 76,19%, 83,68% e 69,14% de soropositivos, para Jaboticabal, São José do Rio Preto e Catanduva, respectivamente. Os rebanhos da regional de São José do Rio Preto apresentaram maiores prevalências de BRSV quando comparados aos rebanhos das outras duas regionais. A análise dos fatores de risco permitiu inferir que a idade dos animais e a ocorrência de infecção concomitante pelo herpesvírus bovino tipo 1 e vírus ... / Abstract: Bovine respiratory syncytial virus (BRSV), agent related to bovine respiratory disease, causes large economic losses mainly in calf rearing. BRSV has already been reported in Brazil with high serological prevalence, however, the risk factors related to its dissemination were not yet determined and a few number of virus strains was characterized in Brazilian herds. Thus, the study aimed to characterize the epidemiology of BRSV infection in dairy herds of São Paulo State, using serological and risk factors analysis, and also by virus circulating in these herds. For that, 1.243 blood samples and 352 nasal secretion samples were collected of animals from 26 farms divided into Jaboticabal, São José do Rio Preto and Catanduva regional, located in the northern region of São Paulo State. During the sample collection, a questionnaire was performed to the owner for each property regarding information about possible risk factors for BRSV. Sera were analyzed using virus neutralization test (VNT), and nasal secretions were examined to detect the F and G protein gene of BRSV by RT-nested PCR. VNT results showed high BRSV prevalence in dairy herds, reaching 79.49% of reagents. The separated results by regional revealed prevalence of 76.19%, 83.68% and 69.14% for Jaboticabal, São José do Rio Preto and Catanduva, respectively. The herds in the regional of São José do Rio Preto showed the highest prevalence of BRSV when compared to the other two regional herds. The analysis of risk factors allowed deducing that the age of the animals and the occurrence of concomitant infection by bovine herpesvirus type 1 and bovine viral diarrhea are associated with the high BRSV prevalence, while calving natural lactation was identified as a protective factor. The RT-nested PCR detected a positive sample for the F protein gene, and after its sequencing, the genetic relatedness of the sample to the other ... / Doutor