FERNANDES, César Rodrigues. Espectroscopias Raman e infravermelho em cristais de aminoácidos : os casos da L-valina e do ácido L-glutâmico. 2015. 264 f. Tese (Doutorado em Física) - Programa de Pós-Graduação em Física, Departamento de Física, Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2015. / Submitted by Edvander Pires (edvanderpires@gmail.com) on 2015-04-09T21:07:04Z No. of bitstreams: 1 2015_tese_crfernandes.pdf: 8055322 bytes, checksum: 64f46f4716b7bda3f85f0cf3a7bab81d (MD5) / Approved for entry into archive by Edvander Pires(edvanderpires@gmail.com) on 2015-04-10T20:43:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_tese_crfernandes.pdf: 8055322 bytes, checksum: 64f46f4716b7bda3f85f0cf3a7bab81d (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-10T20:43:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_tese_crfernandes.pdf: 8055322 bytes, checksum: 64f46f4716b7bda3f85f0cf3a7bab81d (MD5) Previous issue date: 2015 / Estudar o comportamento dos aminoácidos quando sujeitos a condições extremas de temperatura é o objetivo principal dessa tese. Na L-valina (C_5 H_11 NO_2) foram realizados experimentos de absorção infravermelha, enquanto que experimentos de espalhamento Raman foram realizados nas fases α e β do ácido L-glutâmico (C_5 H_9 NO_4). Para a L-valina, o experimento de infravermelho foi realizado em duas regiões espectrais: na primeira o intervalo analisado foi de ~10 a ~700 cm-1 (englobando a região do infravermelho distante – FAR-IR); na segunda, o intervalo analisado foi de 370 a 4000 cm-1 (englobando a região conhecida como infravermelho médio: MID-IR). Nos experimentos Raman no ácido L-glutâmico, o intervalo espectral entre ~15 e ~4000 cm-1 foi estudado. Nos experimentos de infravermelho, o parâmetro termodinâmico temperatura assumiu valores de 100 K até 300 K espaçados por 20 K. Nos experimentos Raman conseguiu-se um espaçamento de 50 K com a temperatura variando de 18 a 300 K, tanto para a fase α como para a fase β. Na fase β, diversas geometrias de espalhamento foram utilizadas, enquanto que para a fase α somente uma geometria de espalhamento foi analisada. Da análise dos espectros da L-valina foram observados surgimentos e desaparecimentos de modos na região do infravermelho distante (FAR-IR). Um modo de rede localizado em 103 cm^(-1), desdobra-se em dois modos de maneira rápida, e diferente do que seria esperado pela evolução espectral ω x T. Situação inversa, ocorre quando dois modos colapsam em 163 cm^(-1) e, interessantemente, à mesma temperatura que no desdobramento: ~120K. Nas mesmas condições outros dois modos, em ~211 cm^(-1) e em ~216 cm^(-1) se reduzem a um único modo em ~214 cm^(-1). Um pico em ~190 cm-1 desaparece no intervalo 100-120 K. Nesse intervalo também podemos verificar grandes desvios da linearidade das frequências dos modos em 147 cm^(-1), 196 cm^(-1), 225 cm^(-1) e 305 cm^(-1). Mais ainda, os modos vibracionais em 154cm^(-1) e 214 cm^(-1) apresentam descontinuidade (nesse caso, verificadas entre 120 e 160 K). Isso sugere não se tratar de simples mudanças conformacionais, posto que tais ocorrências (desdobramentos, desaparecimentos e fortes não linearidades dos modos) se dão num intervalo particular de temperatura. Pode-se concluir daí que o cristal sofre uma transição de fase estrutural a partir de 120 K, se completando a 100 K. Observe-se que para a região MID, a L-valina não apresenta alterações espectrais significativas: as frequências dos modos no geral são lineares, constantes e sem descontinuidades. As medidas Raman na forma β do ácido L-glutâmico resultaram num número constante de modos de vibração na região dos modos da rede durante todo o resfriamento, o que foi interpretado como estabilidade do material. Entretanto, houve colapso (eg.:~500 cm-1, 200 K, Z(XX)Z; três bandas tornaram-se duas) e surgimento (eg.: ~930 cm-1, 120 K, Z(XX)Z; uma banda torna-se duas) de bandas em outras regiões do espectro. Tais ocorrências foram interpretadas como alteração do ambiente da molécula (~930 cm-1), efeito de “aliasing” dificultando o ajuste por lorentzianas (eg.: ~1070 cm-1), e mudança de conformação. Por não estarem associados a levantamentos nem incrementos de degenerescência, tais comportamentos sugerem estabilidade do ácido L-glutâmico na forma β. Os espectros Raman obtidos para a fase α do ácido L-glutâmico se apresentaram completamente regulares: modos lineares, sem descontinuidades nas frequências nem mudança no número de modos. A partir de todos os resultados obtidos, procurou-se entender que fatores determinam a estabilidade de um cristal de aminoácido. A análise do comportamento desta família de materiais mostra três “níveis” de estabilidade (i) estáveis (e.g.: ácido L-glutâmico e L-isoleucina), (ii) microtransições conformacionais (complexo comportamento vibracional, e.g.: L-alanina) e (iii) cristais que sofrem transição de fase estrutural (e.g.: L-valina e L-leucina). Fatores como ordenamento de cadeias laterais, forças de van der Waals e comprimento médio das ligações de hidrogênio (d ̅_LH) podem influenciar na estabilidade destas estruturas cristalinas. Entretanto, observando somente os comprimentos médios das ligações de hidrogênio (d ̅_LH) foi possível inferir uma relação entre esse valor e a estabilidade: L-valina e taurina sofrem transição (〖d ̅_LH〗_(L-val)=2.92 Å, 〖d ̅_LH〗_tau=2.90 Å), L-alanina ⇒ micro-transição conformacional (〖d ̅_LH〗_(L-ala)=2.83 Å) e ácido L-glutâmico estável (〖d ̅_LH〗_(L-glu(α))=2.771 Å, 〖d ̅_LH〗_(L-glu(β))=2.798 Å). Nota-se que: 〖d ̅_LH〗_(L-glu(α,β))<〖d ̅_LH〗_(L-ala)<〖d ̅_LH〗_(L-val),〖d ̅_LH〗_tau. A L-treonina constitui exceção, pois é estável embora possua 〖d ̅_LH〗_(L-treo)=2.86 Å. Outras técnicas experimentais (e.g.: difração e espalhamento de nêutrons) são sugeridas para serem utilizadas futuramente na abordagem deste problema.

SILVA, Eder Nascimento. Propriedades Vibracionais de Perovskitas Complexas Ordenadas. 2008. 181 f. Tese (Doutorado em Física) - Programa de Pós-Graduação em Física, Departamento de Física, Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2008. / Submitted by Edvander Pires (edvanderpires@gmail.com) on 2015-05-04T19:23:25Z No. of bitstreams: 1 2008_tese_ensilva.pdf: 7886254 bytes, checksum: baaeb81edf0f9b9bff1c7ee1c5ae7c79 (MD5) / Approved for entry into archive by Edvander Pires(edvanderpires@gmail.com) on 2015-05-07T16:52:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_tese_ensilva.pdf: 7886254 bytes, checksum: baaeb81edf0f9b9bff1c7ee1c5ae7c79 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-07T16:52:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_tese_ensilva.pdf: 7886254 bytes, checksum: baaeb81edf0f9b9bff1c7ee1c5ae7c79 (MD5) Previous issue date: 2008 / The A2B0B00O6 double perovskites can crystallize in at least 12 different space groups, where the B0O6 and B00O6 octahedra (1:1 order) alternate along the three crystallographic axis. Four perovskites with this order are studied in this work, to know: Sr2CoWO6 (I4/m), Ca2CoWO6, Ca2CoTeO6 and Sr2CoTeO6 (P21/n). In many cases, total or partial disorder due to the random distribution of the B0 and B00 cations in the B sites of the ABO3 perovskites can be observed. An example of compound with total disorder is Pb(Fe1/2Nb1/2)O3 (Cm), where the Fe3+ and Nb5+ cations possess an occupation factor 1/2 in the octahedral sites of the perovskite structure. The compounds: (i) Ba2In(In1/3U2/3)O6, Ba2In(In1/3W2/3)O6 (Fm¯ 3m), Sr2In(In1/3U2/3)O6, Sr2(In0,87W0,13)(In0,46W0,54)O6 (P21/n) and (ii) a2(Fe0,73W0,27)(Fe0,60W0,40)O6 (P21/n) and Sr2(Fe0,79W0,21)(Fe0,54W0,46)O6, Sr2(Fe0.90Te0.10)(Fe0.57Te0.43)O6 (I4/m) possess partial disorder in the sites of the B0 and/or B00 cations, but nevertheless they exhibit 1: 1 order. In the present work, the phonon spectra of the above-mentioned perovskites are studied through the Raman scattering and infrared transmittance and/or diffuse reflectance. To analyze the phonon spectra of these compounds, theory group methods are used based on three ion sub-lattices, to know: A, B0 and B00O6. The vibrational freedom degrees of the 12 ordered perovskites are described in terms of the internal vibrations of the B00O6 octahedron and of the translational modes of the A and B0 cations. This model is valid when the vibrations of the B0O6 octahedron are negligible compared with the one of the B00O6 octahedron. We used crystallographic information to discuss the processes behind the changes in the phonon energies based on the internal modes of the octahedra. Besides, our results of Raman scattering of low temperature in Pb(Fe1/2Nb1/2)O3 ceramic, reveal pronounced anomalies in the phonon spectra around N´eel temperature TN∼150 K. We attributed these anomalies to the magnetoelectric effect in this compound.

Nos últimos anos, a espectroscopia no infravermelho (IR) ganhou grande aceitação em diversas áreas de pesquisa por ser uma técnica rápida, simples e não destrutiva que permite a quantificação de diversos componentes químicos em amostras. Apesar de a IR resultar em valores de absorbância que auxiliam na caracterização da amostra, tal técnica acaba por gerar bancos de dados compostos por centenas, ou até milhares, de variáveis altamente correlacionadas e ruidosas, comprometendo o resultado de diversas técnicas de análise multivariada. Dentro deste cenário, esta Tese apresenta novas metodologias para seleção de variáveis, também chamada de seleção de comprimentos de onda quando aplicados em dados de IR, com o intuito de auxiliar o reconhecimento de padrões para o controle de qualidade em diversas áreas. Tais metodologias são apresentadas em três artigos onde as proposições visam à solução de problemas específicos: no primeiro artigo, amostras de erva mate são categorizadas de acordo com seu país de origem através de uma nova metodologia para seleção de variáveis Para tanto, um problema de Programação Quadrática, combinado com a Informação Mútua entre as variáveis, é utilizado para reduzir a redundância entre as variáveis retidas e maximizar sua relação com o local de origem da amostra; por sua vez, o segundo artigo adequa as proposições do primeiro artigo para um problema de predição, onde o objetivo é determinar a concentração de cocaína e adulterantes em amostras de cocaína laboratoriais e apreendidas; por fim, o terceiro artigo utiliza a estatística do teste de Kolmogorov-Smirnov para duas amostras em uma abordagem de seleção de intervalos de comprimentos de onda com o intuito de identificar falsificações em medicamentos para disfunção erétil. A aplicação dos métodos em bancos de dados com distintas características e a validação dos resultados corrobora a adequabilidade das proposições desta tese. / Over the last few years infrared (IR) spectroscopy gained wide acceptance in many research fields as a quick, simple and non-destructive technique allowing the quantification of many chemical compounds. Although IR provide many absorbance values that helps the sample characterization, this technique also generate databases comprised by hundreds, or even thousands, of highly noisy and correlated wavenumbers, jeopardizing the results of many multivariate analysis techniques. Under such scenario, this thesis presents new variables selection methodologies (also called wavenumber selection when applied in IR data) aimed to recognize patterns for quality control in many areas. Such methodologies are presented in three papers where the propositions are tailored for the solution of specific problems: on the first paper, yerba mate samples are categorized according to their country of origin through a novel variable selection methodology. Thereunto a quadratic programming problem, combined with the Mutual Information among variables, is utilized to reduce the redundancy among variables and increase their relationship with the samples’ place of origin; the second paper adequate the first paper propositions for a prediction method which aims to determine cocaine and adulterants concentration in laboratorial and seized cocaine samples; lastly, the third paper uses the two-samples Kolmogorov-Smirnov statistic in an wavenumber interval selection method aimed for the identification of counterfeit erectile dysfunction medicines. The application of the methods in databases with distinct characteristics and the results validation corroborates the suitability of this thesis propositions.

Submitted by Morgana Andrade (morgana.andrade@ufes.br) on 2016-05-31T19:24:19Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) tese_5419_KEROLY ALAIDE PASCOAL COLATI.pdf: 4264545 bytes, checksum: 77a64ba251d996b0d90ae6b537019ee2 (MD5) / Approved for entry into archive by Patricia Barros (patricia.barros@ufes.br) on 2016-06-15T13:39:47Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) tese_5419_KEROLY ALAIDE PASCOAL COLATI.pdf: 4264545 bytes, checksum: 77a64ba251d996b0d90ae6b537019ee2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-15T13:39:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) tese_5419_KEROLY ALAIDE PASCOAL COLATI.pdf: 4264545 bytes, checksum: 77a64ba251d996b0d90ae6b537019ee2 (MD5) / CAPES

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2012-10-26T11:52:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 302794.pdf: 1629810 bytes, checksum: f0c4943e3530bd914f93ffb8f74f1203 (MD5) / As sementes maduras de A. angustifolia perdem rapidamente sua qualidade após a colheita. Conhecer os fatores ligados a esse processo é necessário para promover a disponibilidade de sementes com qualidade por período prolongado após a safra anual e facilitar as ações de restauração de áreas e a conservação da espécie. Desta forma, este estudo foi desenvolvido buscando analisar as alterações fisiológicas associadas à perda da viabilidade e do vigor das sementes de A. angustifolia e relacioná-las às alterações bioquímicas durante o armazenamento. As sementes foram coletadas no município Painel (SC) e submetidas às condições de armazenamento em ambiente sem controle térmico, refrigerador (5 oC) e freezer (-18 oC), por 180 dias, sendo avaliadas quanto à viabilidade, vigor, teor dos principais metabólitos de reserva do megagametófito e metabólitos dos embriões, as mudanças no perfil protéico, atividade enzimática e integridade do DNA. A germinação das sementes após a colheita foi de 90% e manteve-se em 64% na condição de refrigerador por 180 dias, mas ocorreu perda total de viabilidade das sementes armazenadas nas demais condições. Apesar da perda total de viabilidade e elevada taxa de condutividade elétrica, as sementes armazenadas em freezer não manifestaram grandes alterações bioquímicas em relação ao teor de proteínas no embrião, teor de carboidratos solúveis e amido no megagametófito, atividade da enzima superóxido dismutase e peroxidação lipídica. Associando-se as alterações fisiológicas e bioquímicas, constatou-se que, em função da elevada viabilidade das sementes, estabilidade no perfil protéico, poucas alterações nos metabólitos presentes no megagametófito e embrião, atividade da SOD e peroxidação lipídica, o armazenamento das sementes de A. angustifolia em refrigerador é uma alternativa viável pelo período de 180 dias.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:31Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-27Bitstream added on 2014-06-13T20:08:28Z : No. of bitstreams: 1 moreno_lx_me_rcla.pdf: 866555 bytes, checksum: e922570809d1a900c522fddbdbcc835f (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Em função do chamado aquecimento global, diversos setores da sociedade vêm se mobilizando em busca da compreensão e uma possível solução para este problema. A comunidade cientifica internacional tem sua atenção voltada para este fato já há algumas décadas e, por meio deste esforço, a sociedade civil tem sido alertada a cerca da importância da adoção de medidas para a contenção dos chamados gases de efeito estuda, em especial o CO2. Além de medidas para a contenção da emissão, a administração de reservas florestais e a melhoria de técnicas de manejo e uso do solo tem recebido especial atenção, pois estes podem atuar como sumidouros ou vertedouros de CO2. Dentro deste contexto, a quantificação do CO2 emitido pelos mais diferentes solos do planeta, é parte fundamental para o entendimento deste processo como um todo. Assim, no presente trabalho buscamos desenvolver um sistema de medidas para a quantificação dos fluxos de CO2 provenientes da respiração do solo. Este sistema foi desenvolvido a partir de um analisador de gás infravermelho (IRGA), modelo LI-840 produzido pela companhia Li-Cor, acoplando a uma câmara dinâmica por meio de uma bomba de circulação. Este sistema representa com vantagens, uma alternativa aos diversos sistemas comerciais disponíveis para este fim. Dentre estas vantagens podemos destacar; o baixo custo total e de manutenção do sistema, a possibilidade de controle automático ou remoto via internet, a possibilidade de troca do detector para medidas de outros gases e de medida simultânea de outros parâmetros como, por exemplo, unidade, temperatura, pressão e velocidade do ar no local da amostragem. Testes preliminares indicaram que o sistema desenvolvido é muito eficiente para a determinação dos fluxos de CO2, representando uma alternativa possível e de baixo custo que pode ser aplicada em estudos avançados de respiração de solo / Due to the so-called global warming, various sectors of society have been mobilized to understand and search a possible solution to this problem. The international scientific community has turned its attention to this fact for some decades, and through this effort, the civil society has been advised about the importance of adopting actions to contain the so-called greenhouse gases, especially the CO2. In addition to procedures to contain the CO2 emission, the administration of forest and improvement of management techniques of soil has received special attention, because they can act as CO2 emitters or traps. Inside this context, the quantification of the emitted CO2 by the different soils of the planet is the key to understand this process as a whole. In the present work we develop a measurement system for the quantification of CO2 fluxes from the soil. This system was developed from an infrared gas analyzer (IRGA), model LI-840 produced by the company Li-Cor, coupled to one dynamic camera through a circulation pump. This system represents with advantages, an alternative to several commercial systems available for purpose. Among these advantages we can highlight; the low total cost and maintenance, the possibility of automatic or remote control via internet, the possibility of exchanging of the detector for measures of other gases and simultaneously measuring other parameters as, for example, humidity , temperature, pressure and air velocity at the site of sampling. Preliminary tests indicated that the developed system is very efficient for the determination of CO2 fluxes, representing a possible alternative of low cost that can be applied in advanced studies of soil respiration

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:33Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-05-22Bitstream added on 2014-06-13T19:12:25Z : No. of bitstreams: 1 menegazzo_lm_me_ilha.pdf: 652340 bytes, checksum: 7cd3c65c7db0577bbe66236ac50269ff (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Este trabalho propõe o estudo do grau de conversão e de dureza de três resinas fotoativadas Fill Magic, TPH Spectrum e Te-Econom, em função do tempo de exposição e do tipo de fonte de luz. Foram utilizadas quatro fontes diferentes, sendo duas halógenas e duas baseadas em LED. O grau de conversão foi avaliado de espectros de absorção no infravermelho próximo e a dureza através de testes Vickers. Cinco amostras de 10 mm de diâmetro e 2 mm de espessura foram preparadas para cada tempo de exposição e tipo de fonte. Após exposição à luz, todas as amostras foram mantidas durante 7 dias em ambiente escuro antes de serem utilizadas para obtenção de espectros e serem submetidas ao teste de dureza. Os espectros foram obtidos em um espectrômetro Nexus 670 da Nicolet e a microdureza Vickers foi obtida com um microdurômetro HMV - 2T da Shimadzu. Os resultados mostraram que o grau de conversão aumenta com o tempo de exposição para fontes com densidade de potência menor que 233 mW/cm2. Não foi observada diferença significativa no grau de conversão nas amostras irradiadas com fontes halógena e LED, ambas com densidade de potência maior que 233 mW/cm2. Não foi possível estabelecer uma relação entre dureza e o tempo de exposição ou a densidade de potência. Entre as resinas, a FM é a que apresentou melhores valores de grau de conversão e a Te-Econom de dureza. / The aim of this study was to evaluate the degree of conversion and hardness of three photo-activated composites (Fill Magic, TPH Spectrum and Te-Econom) as a function of exposure time and type of light source. As visible light source were utilized four different units, two halogen and two light-emitting diodes (LED). The conversion degree was evaluated by near-infrared spectroscopy and the hardness by Vickers tests. Five samples of 10 mm diameter and 2 mm thickness were prepared for each exposure time and light source. The spectra were obtained in a Nexus 670 Nicolet spectrometer and the hardness in a HMV - 2T micro hardness tester (Shimadzu). These measurements were performed after 7 days dark storage. The results showed that the degree of conversion increases with the exposure time for the light units with power density smaller than 233 mW/cm2. No significant differences were observed in degree of conversion in samples irradiated with halogen and LED units, both with power density larger than 233 mW/cm2. There is not correlation between the conversion degree and the micro hardness for all studied composites. The highest values for conversion degree and hardness were obtained with the Fill Magic and Te-Econom composites, respectively.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-24Bitstream added on 2014-06-13T18:43:21Z : No. of bitstreams: 1 ozatojunior_t_dr_sjrp.pdf: 1586824 bytes, checksum: dea85cc33a334b628fea61b143707b14 (MD5) / A expressão de proteínas recombinantes em Escherichia coli produz proteínas que se acumulam como agregados insolúveis conhecidos como corpos de inclusão (CI). As proteínas na forma de CI são biologicamente ativas e com estrutura semelhante à proteína nativa quando a expressão é induzida a baixa temperatura. Estas características e a facilidade em purificar os CIs podem representar uma possibilidade de utilização dos CIs como antígenos para a produção de anticorpos policlonais. O gene da proteína capsidial (CP) do Southern bean mosaic virus (SBMV), um Sobemovirus, foi clonado no vetor pET 28a e a proteína expressa em E. coli a 25 º C. Uma análise comparativa entre a CP recombinante presente na forma de corpos de inclusão e a proteína nativa presente nas partículas virais purificadas foi realizada utilizando a técnica de espectroscopia de infravermelho (FT-IR). Os conteúdos de estruturas secundárias identificados diferiram nos percentuais de folha-β enquanto os percentuais hélices-α foram preservados. Uma estrutura tridimensional foi gerada por modelagem molecular por homologia e comparada com os dados obtidos nas análises de FT-IR. Os percentuais obtidos por FT-IR da CP nativa foram condizentes com os dados gerados por modelagem molecular por homologia. Mesmo com algumas diferenças nos conteúdos de folha- β da CP recombinante foi possível verificar um estado conformacional semelhante à proteína nativa. Os corpos de inclusão contendo a proteína recombinante expressa foram utilizados como antígenos para a imunização de coelhos. O antissoro obtido mostrou ser específico e compatível a um antissoro previamente preparado com partículas virais purificadas do SBMV na detecção do vírus em extratos de feijoeiros infectados utilizando imunoensaios por Western blot, PTA-ELISA, Dot Blot e Tissue Printing... / The production of recombinant proteins in Escherichia coli yields proteins that accumulate as insoluble aggregates known as inclusion bodies (IBs). Biologically active with native-like structure is trapped inside IBs when the expression is induced at low temperature. These features, and the facility to purify the IBs, can represent a possibility to use the IBs as an antigen for the production of polyclonal antibodies. The coat protein gene of Southern bean mosaic virus, a Sobemovirus, was cloned in the vector pET 28a and expressed in Escherichia coli at 25 ºC. The inclusion bodies containing the recombinant protein were isolated and purified. A comparative analysis between recombinant protein present in the form of inclusion bodies and native coat protein present in the purified virus particles was performed using Fourier transform infrared spectroscopy (FT-IR). The secondary structure contents identified differences in the percentage of β-sheets while α-helices content was much preserved. The three-dimensional structure was generated using molecular modeling and was compared to the data obtained from FT-IR analysis. The percentages obtained from FT-IR analyses of the native CP were consistent with the structure generated through homology molecular modeling. Nevertheless, some differences were present on the content of β-sheets structure of the recombinant CP indicating that the protein conformational state is found in a native like condition. The IBs containing the expressed protein were used as an antigen to immunize rabbits. The antiserum obtained showed to be specific and comparable to one previously prepared with purified SBMV particles, in the virus detection in leaf extracts of infected bean plants using Western blot, PTA-ELISA, Dot Blot and Tissue Printing assays. So, the use of IBs containing recombinant viral proteins to immunize rabbits is a new, easy and very... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:34:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseGBA.pdf: 7751002 bytes, checksum: 6ec58a5eabb6147b50170358eceefa09 (MD5) Previous issue date: 2007-02-02 / This present work describes the chemotaxonomic analysis of lichens through the utilization of NMR spectroscopic techniques, HR-MAS and NMR in solution, and IR allied with chemometrics methods. This analysis were carried out with eleven species set of lichens divided in two families and six genera. The HR-MAS NMR spectra together the chemometric, obtained from intact vegetal material, present the discrimination between the families, genera and species and the classification percentage was much satisfactory (70,8%). The analyzed substances include the carbohydrates class of low molecular-weight, the polyols. The NMR in solution analysis, corresponding to crude extracts, present the discrimination between genera and species and the classification was excellent (88,9%). In this analysis, where the secondary metabolites of lichens are evaluated, was realized the identification of some substances in mixture. The analysis by infrared spectroscopy (IR), also obtained from intact material, was detached by the excellent power of samples classification (100% of correct prediction), with discrimination between genera and species. The comparative application of this techniques confirm the results obtained separately, and point for a great potentiality of IR in chemotaxonomic analysis of lichens, due its quickness and low price, however the NMR techniques are more attractive when desire the circumstantial analysis of spectral profile. / O presente trabalho descreve a análise quimiotaxonômica de liquens, a partir da utilização das técnicas espectroscópicas de RMN, HR-MAS e em solução, e IV aliadas aos métodos quimiométricos. As análises foram efetuadas empregando-se um conjunto de onze espécies de liquens, distribuídas em duas famílias e seis gêneros. Os espectros de RMN HR-MAS, obtidos a partir do material vegetal intacto, apresentou, juntamente com a quimiometria, a discriminação entre as famílias, gêneros e espécies e ainda um percentual de classificação muito satisfatório (70,8%). As substâncias analisadas compreendem a classe dos carboidratos de baixa massa molecular, os polióis. As análises de RMN em solução, correspondentes aos extratos brutos, apresentaram a discriminação de gêneros e espécies e a classificação foi excelente (88,9%). Nessa análise, a qual os metabólitos secundários de liquens são avaliados, foi realizada a identificação em mistura de algumas substâncias. A análise por espectroscopia na região do infravermelho (IV), obtidas também a partir do material intacto foi destacada pelo seu excelente poder de classificação de amostras (100% de predições corretas), com discriminação entre os gêneros e espécies. A aplicação comparativa dessas técnicas espectroscópicas corrobora os resultados obtidos separadamente, e aponta para uma grande potencialidade do IV em análises quimiotaxonômicas de liquens, dado a sua rapidez e baixo custo, embora as técnicas de RMN sejam muito atrativas quando se deseja uma análise minuciosa do perfil espectral.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:36:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2235.pdf: 5552662 bytes, checksum: 5e280bcc60373b565cfac1c3f26cb7ec (MD5) Previous issue date: 2009-02-06 / Universidade Federal de Minas Gerais / The importance of medicinal plants and their use in industrial purposes is increasing. Among the herbal drugs being commercialized there are "quebra-pedras". According to the the Brazilian Pharmacopoeia, the recognized officially species as medicinal plants having the attributed pharmacological properties to "quebra-pedras" are: Phyllanthus niruri and Phyllanthus tenellus. Other species of this genus, such as P. urinaria, P. amarus and P. caroliniensis, are also known. Usually, due to their morphoanatomyc similarities, the different species end up consumed without any discretion. In this context, this study evaluated the use of spectroscopic techniques, such as IR, 1H HR-MAS NMR and aqueous and ethanolic 1H NMR extracts, combined with chemometrics analyses, for inquiry commercial samples of "quebra-pedras". Through PCA and HCA analyses obtained from the data of these techniques, the taxonomic distinction among the studied Phyllanthus species (P. niruri, P. tenellus, P. amarus, P. urinary and P. caroliniensis) was successfully reached. Among the techniques evaluated, the 1H NMR extracts was the most appropriate for presenting greater reproducibility and have enabled, through analysis of their spectra, their additional experiments and comparisons with literature data, the identification of some primary metabolites (Lvaline, L-alanine, L-threonine, acid-4-aminebutanoic, D-sucrose, &#945;- and &#946;-Dglucose) in aqueous extracts and the compound phyllantin in the ethanolic extract. All seventeen built models using the KNN, SIMCA and PLS-DA methods had a good reliability. Working with a limited number of pattern samples (five, one of each specie) the classifications were different in some cases, but most of them showed that probably many of the commercial samples were not belonging to any of the studied Phyllanthus species, or to mixtures of them. However, the study of aqueous 1H NMR extracts, recorded to a higher number of patter plants, showed a great and a large variability data set, such as seasonal and regional factors, which are fundamental to building the models. The importance of the aromatic range in the aqueous extracts analyses was also examined. The signs in this range, although minority, are derived from secondary metabolites, and these are essential in the plants differentiation. In this context, considering the most representative classifications obtained from the aromatic range for the aqueous 1H NMR extracts, it is possible to concluded that 75% of analyzed commercial samples are P. tenellus, although in their labels were described as P. niruri. Also it was concluded that the evaluated spectroscopic techniques have a great potential in the investigation of complex matrices such as herbal drugs studied and the aqueous 1H NMR extracts has been the best results of them. It is important to mention that a representative data set is essential to the success of the employment of classification methods. / A importância das plantas medicinais e do seu uso com fins industriais é cada vez maior. Dentre as drogas vegetais que estão sendo comercializadas encontra-se a quebra-pedra . De acordo com a Farmacopéia Brasileira, as espécies oficialmente reconhecidas como as plantas medicinais com as propriedades farmacológicas atribuídas à quebra-pedra são: Phyllanthus niruri e Phyllanthus tenellus. Outras espécies deste gênero, tais como a P. urinaria, P. amarus e P. caroliniensis, são conhecidas e, na maioria das vezes, dada as semelhanças morfoanatômicas da planta como um todo consome-se as diferentes espécies sem nenhum critério. Ciente disto, o presente trabalho avaliou o emprego de técnicas espectroscópicas, tais como o IV, a RMN HR-MAS de 1H, a RMN de 1H dos extratos aquosos e etanólicos, em conjunto com a quimiometria, para a investigação de amostras comerciais de quebra-pedra . Através das análises por PCA e por HCA dos dados provenientes dessas técnicas, a diferenciação taxonômica entre as espécies de Phyllanthus estudadas (P. niruri, P. tenellus, P. amarus, P. urinaria e P. caroliniensis) foi obtida com sucesso por todas elas. Dentre as técnicas avaliadas, a RMN de 1H dos extratos se mostrou a mais adequada por ter apresentado uma maior reprodutibilidade, além de ter possibilitado, através das análises de seus espectros, de seus experimentos complementares e comparações com dados da literatura, a identificação de alguns metabólitos primários como: Lvalina, L-alanina, L-treonina, ácido-4aminobutanóico, D-sacarose, &#945;- e &#946;-D-glucose nos extratos aquosos e da substância filantina no extrato etanólico. Todos os modelos construídos empregando os métodos KNN, SIMCA e PLS-DA mostraram uma boa confiabilidade. Quando se trabalhou com um número restrito de amostras padrão (cinco, uma de cada espécie) as classificações dadas foram divergentes em alguns casos, mas a maioria delas mostrou que provavelmente muitas das amostras comerciais não seriam pertencentes a alguma das espécies de Phyllanthus aqui estudada, nem às misturas das mesmas. No entanto, o estudo por RMN de 1H dos extratos aquosos, realizado para uma maior quantidade de padrões, evidenciou que um grande conjunto de dados e a variabilidade do mesmo, relacionada a fatores sazonais e regionais, são fundamentais na construção dos modelos. Verificou-se ainda, a importância da região aromática nas análises dos extratos aquosos. Os sinais presentes na mesma, embora minoritários, são provenientes de metabólitos secundários e estes são imprescindíveis na diferenciação de plantas. Nesse contexto, considerando as classificações mais representativas, obtidas a partir da região aromática dos dados de RMN de 1H dos extratos aquosos, concluiu-se que 75% das amostras comerciais analisadas são P. tenellus, embora em seus rótulos fossem descritas como P. niruri. Dessa forma, concluiu-se que as técnicas espectroscópicas avaliadas, apresentam um grande potencial na investigação de matrizes complexas como a droga vegetal estudada, sendo a RMN de 1H dos extratos aquosos, a melhor delas. Cabe ressaltar que um conjunto de dados representativo é essencial para o sucesso do emprego de métodos de classificação.