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Resistência de algodoeiro a murcha de fusário: métodos de obtenção de plântulas e inoculação ;avaliação de germoplasmas ; indução de resistência e caracterização da atividade enzimática

COUTO, Erick Farias 03 March 2008 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-16T15:49:19Z No. of bitstreams: 1 Erick Farias Couto.pdf: 519238 bytes, checksum: 39bbbff610acf377a744dada09f340cf (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-16T15:49:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Erick Farias Couto.pdf: 519238 bytes, checksum: 39bbbff610acf377a744dada09f340cf (MD5) Previous issue date: 2008-03-03 / The cotton has been in the human history for ages; it is used to the confection of clothes and its subproducts are an important source of protein to the domestic animals. Because of its wide distribution in the Brazil, the ocurrence of disease has become more frequently. Among the diseases, great importance is given to the fusarium wilt of cotton (Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum) because of its potential to cause severe losses and its hard control. The present work aimed to develop alternatives to be offered to the cotton producers. The first experiment refers to the evaluation of the planting methods of cotton and the reaction of 106 cultivars in relation to the vascular wilt of fusarium. Among the methods of planting, the plastic cups was chosen because in this method the roots of the seedlings can grow more vigorously. In the water restricion method there was no ocurrence of typical simptoms of the vascular wilt. The paper towel method resulted in anormal seedlings or the seedlings were contaminated with parasites. It was possible to determinated a group with a high level of resistance among the cultivars tested. In this group, its important to say that the cultivar SP 2473-A also exhibit resistance to the ramulosis. The second experiment is reffered to the resistance induction with the abiotic inducers (acibenzolar-S-metil, metil jasmonato e fosfato de potássio) in seedlings of the cotton cultivar ‘BRS Cedro’ and the evaluation of the enzymatic activity elicited (in samples of leaves and stem) in seedlings induced (once and twice) and seedlings without the induction, inoculatedand not inoculated with Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum. The infection index was also evaluated in this treatments. The treatment with methyl jasmonate (two inoculations) in the stem showed the minor infection index (45,00). It was possible to correlate this treatment with the minor infection index and the high level of the enzyme superoxide dismutase in the stem. / O algodão tem acompanhado a história do homem desde tempos remotos, serve como matéria prima para a confecção de vestuário e ainda apresenta como subprodutos uma rica fonte de proteína para o consumo de animais domésticos. Devido a sua ampla distribuição em todo o Brasil, a ocorrência de doenças tem se tornado cada vez mais freqüente. Dentre as doenças, um grande destaque é dado a murcha de fusário (Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum), devido ao seu potencial em causar sérios prejuízos e seu difícil controle. Diante do exposto, o presente trabalho refere-se as atividades realizadas visando desenvolver uma alternativa para a cadeia produtiva do algodoeiro. O primeiro experimento refere-se a avaliação de métodos de plantio de algodoeiro e avaliação de 106 cultivares de algodoeiro em relação a murcha de fusário. Dentre os métodos de plantio avaliados, o plantio em copo plástico foi o escolhido por ter proporcionado um melhor desenvolvimento do sistema radicular das plântulas de algodoeiro. No método da restrição hídrica não ocorreu o aparecimento de sintomas característicos da murcha de fusário. O método do papel toalha resultou em plântulas anormais ou as sementes foram parasitadas com contaminantes. Entre as cultivares testadas quanto a reação a murcha de fusário foi possível estabelecer um grupo com um alto nível de resistência com destaque para a cultivar SP 2473-A, que também possui resistência contra a ramulose. O segundo experimento refere-se a indução de resistência com os indutores abióticos (acibenzolar-S-metil, metiljasmonato e fosfato de potássio) em plântulas da cultivar BRS Cedro de algodoeiro e avaliação da atividade enzimática elicitada (amostras de folhas e caule) em plantas induzidas (com uma e duas induções) e não induzidas, inoculadas e não inoculadas com Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum, sendo ainda realizada a avaliação do índice de infecção. O menor índice de infecção (45,00) foi obtido pelo tratamento com metil jasmonato (duas inoculações) no caule. Neste tratamento foi possível estabelecer a provável conexão entre o menor índice de infecção e um alto nível da enzima peroxidase nas folhas e da enzima superóxido dismutase no caule.
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Estudos sobre a transmissão do vírus da leprose dos citros e da mancha anular do cafeeiro pelo ácaro Brevipalpus phoenicis (Geijskes) (Acari: Tenuipalpidae)

COSTA, Frank Magno 28 February 2011 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-17T12:01:04Z No. of bitstreams: 1 Frank Magno da Costa.pdf: 2036897 bytes, checksum: 7498ff1cf68c11e56e2e3d7ce12c8e57 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T12:01:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Frank Magno da Costa.pdf: 2036897 bytes, checksum: 7498ff1cf68c11e56e2e3d7ce12c8e57 (MD5) Previous issue date: 2011-02-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Brevipalpus mites are vectors of several plant viruses called Brevipalpus transmitted virus –BrTV. Among these, Citrus leprosis virus C (CiLV-C) and Coffee ringspot virus (CoRSV) are important due to the damages caused in Citrus spp. and Coffea spp., respectively. The symptoms occur as localized infection on both leaves and fruits. The interactions between vector and virus are of particular interest both from the scientific perspective and on the development of control measures. However, for these and other BrTV, the mode interactions are still unknown. Preliminary study suggests that CoRSV replicates in the vector tissue, while CiLV-C is mode circulates manner. The aim of this study was to investigate the interactions established between CiLV-C and CoRSV with B. phoenicis. Adult females aviruliferous of B. phoenicis were submitted to acquisition access period of respective virus during five days. After this time they were transferred to hosts (treatments): mungbean (Canavalia ensiformis, non-host of the virus), symptomatic and healthy (citrus and coffee plants) and collected after four different periods of time: 0; 7; 14 and 21 days. The interactions were investigated by real time quantitative polymerase chain reaction (qPCR), transmission electron microscopy (TEM) and transmission assays. The qPCR revealed that there was no increase in viral load over time in all treatments for any of the virus in question. The TEM, it was not possible to detect particles of CiLV-C or CoRSV. CiLV-C transmission rate was 83, 75% and 58% for the treatments symptomatic citrus, mungbean and healthy citrus, respectively. The first symptoms of the leprosis were observed after 30±5 days after mites infestation. In the CoRSV transmission assays no symptoms of coffee ringspot were observed during a period of six months. These results suggest that a long incubation period was be necessary before CoRSV transmission by the vector. By the CiLV-C the results indicate that interaction type virus-vector is of the circulative mode. / Ácaros Brevipalpus são vetores de inúmeros vírus, comumente chamados de vírus transmitidos por Brevipalpus- VTB. Dentre esses, o vírus da leprose dos citros (Citrus leprosis virus C, CiLV-C) e o vírus da mancha anular do cafeeiro (Coffee ringspot virus - CoRSV) são importantes devido aos danos que causam em Citrus spp. e Coffea spp., respectivamente. Os sintomas ocorrem de maneira localizada em folhas e frutos. As interações entre os vírus e seus vetores apresentam particular interesse, tanto do ponto de vista científico quanto no desenvolvimento de novas abordagens para o controle das doenças por eles causadas. Entretanto, para esses e outros VTB, as interações são ainda pouco conhecidas. Estudos preliminares sugerem que o CoRSV se replica no interior do ácaro vetor, enquanto o CiLV-C apenas circula. O objetivo deste trabalho foi investigar os tipos de interações estabelecidas entre o CiLV-C e o CoRSV com B. phoenicis. Fêmeas adultas de B. phoenicis avirulíferas foram submetidas a um período de acesso para aquisição dos respectivos vírus durante cinco dias. Após esse tempo foram transferidas para hospedeiros (tratamentos): feijão-de-porco (não hospedeira dos vírus), plantas suscetíveis, sintomáticas e/ou sadias (laranja doce e cafeeiro) e coletadas após quatro diferentes períodos de tempo: 0; 7; 14 e 21 dias. As interações foram investigadas por reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR), microscopia eletrônica de transmissão (MET) e testes de transmissão. A qPCR revelou que não houve aumento da carga viral ao longo do tempo em nenhum dos tratamentos avaliados para nenhum dos vírus em questão. A MET não detectou partículas de CiLV-C e CoRSV. A taxa de transmissão do CiLV-C foi de 83; 75 e 58% para os tratamentos frutos de laranja sintomáticos, feijão-de-porco e frutos de laranja sadio, respectivamente. Os primeiros sintomas de leprose dos citros foram observados após 30±5 dias após a infestação dos ácaros. Nos testes de transmissão de CoRSV nenhum sintoma da mancha anular foi observado durante um período de seis meses. Estes resultados indicam a necessidade de longo período é necessário antes da transmissão do CoRSV pelo vetor. Para o CiLV-C os resultados indicam que o tipo de interação vírus-vetor é persistente circulativa.
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Podridão do pé do mamoeiro: infestação em solos de cultivo, controle alternativo com indutores de resistência e Trichoderma e avaliação dos mecanismos de defesa envolvidos

TAVARES, Giltembergue Macedo 10 March 2009 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-17T12:56:22Z No. of bitstreams: 1 Giltemberg Macedo Tavares.pdf: 1201827 bytes, checksum: f3dc6ee4db4cb245f2d3cd6c71898ad7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T12:56:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Giltemberg Macedo Tavares.pdf: 1201827 bytes, checksum: f3dc6ee4db4cb245f2d3cd6c71898ad7 (MD5) Previous issue date: 2009-03-10 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Brazil is the main papaya’s producer in the world (Carica papaya L.) and it occupies the first position producing 1,65 million tones, thus, it is an important production with economic and social value, and, in this meaning, Bahia stands out as the largest producing state with a Brazilian production of 724 tons. Many diseases cause damage to the crop by increasing the cost of production, in some cases limiting the exploitation of that production, among those we can highlight diseases like papaya root damage caused by Phytophthora palmivora. This present study aimed: 1) to achieve the level of infestation of P. palmivora in soils of plantations of papaya commercial in the Extreme South of Bahia, to better support the measures of control; 2) ) to evaluate the action of biotic and abiotic inducers in order to increase the root rot in seedlings of papaya inoculated with P. palmivora, in the activity of enzymes of defense, 1,3-glucanase, peroxidase and chitinase, as well as the lignin content of roots; and 3) to analyze the effect of species of Trichoderma spp. on control of P. palmivora etiologic agent of root rot of papaya. In evaluating of the results of infestation of the soil of papaya orchards, it was showed that in those 33 areas assessed, only two of them, the presence of P. palmivora was not found. There was also no significant differences (p <0.05) for incidence of that pathogen, as those varieties of papaya grown in samples soil evaluated. In all eight municipalities that had sampled orchards the presence of the pathogen was detected, and it showed its wide distribution in the Extreme South of Bahia. To evaluate the control of foot rot in papaya seedlings, it was noted that the treatments using ASM, except the dosage 0.15 g / L 6 days before inoculation, showed levels of larger control to the other inductors. Plants sprayed with ASM showed increased activity of peroxidase and -1,3-glucanase and a highest concentration of lignin in relation to the witness. However,these treatments have no effect on the activity of chitinase. The ASM is a potential inducer of resistance to P. palmivora for using it in the management of root rot of papaya. As the assessment of agents of biocontrol happened it was noted that as using 33 isolated of Trichoderma only 2 isolated (T70 - T. harzianum, T68 - T. virens) did not differ statistically from that treatment with the standard fungicide and showed the percentage of survival of 58.3 and 52.4 respectively. The effect of these two isolated of Trichoderma on increase of dry mass and fresh in seedlings of papaya was also evaluated and it was noted that those two isolates showed higher increases in these parameters when compared with witness. The isolated T70 and T68 showed an increase of fresh and dry mass total of 110, 73% and 59; 59% respectively, compared with those witnesses only planted in the soil. The isolates of T. harzianum and T. virens presented potential with biocontrol agent of P. palmivora for being used in the management of root rot of papaya. / O Brasil é o principal produtor de mamão (Carica papaya L.) do mundo ocupando a primeira posição com uma produção de 1,65 milhão de toneladas, sendo assim, uma importante cultura tanto de valor econômico como social, e a Bahia se destaca como o maior Estado produtor brasileiro com uma produção de 724 mil toneladas. Várias doenças causam danos à cultura aumentando o custo de produção, sendo em alguns casos limitantes a exploração da cultura, dentre essas doenças podemos destacar a podridão do pé do mamoeiro causada por Phytophthora palmivora. Os objetivos do presente estudo foram: 1) realizar o nível de infestação de P. palmivora em solos de plantações de mamoeiros comerciais na região Extremo Sul da Bahia, para melhor subsidiar as medidas de controle; 2) avaliar a ação de indutores biótico e abióticos na redução da podridão de raízes em mudas de mamoeiro inoculadas com P. palmivora, na atividade das enzimas de defesa, 1,3-glucanase, peroxidase e quitinase, assim como no teor de lignina dasraízes; e 3) avaliar o efeito de espécies de Trichoderma spp. sobre controle de P. palmivora agente etiológico da podridão radicular do mamoeiro. Para a avaliaçãos dos resultados de infestação do solo de pamares de mamoeiro observou-se que das 33 áreas avaliadas apenas em duas não se constatou a presença de P. palmivora. Também não houve diferenças significativas (p<0,05) para incidência do patógeno, quanto às variedades de mamoeiro plantadas nas amostras de solos avaliados. Em todos os oito municípios que tiveram pomares amostrados foi detectada a presença do patógeno, atestando sua ampla distribuição no Extremo Sul da Bahia. Para avaliação do controle da podridão do pé em mudas de mamoeiro constou-se que os tratamentos com ASM, com exceção da dosagem 0,15 g/L 6 dias antes da inoculação, apresentaram níveis de controle supeiores aos demais indutores. Plantas pulverizadas com ASM apresentaram aumento deatividade da peroxidase e 1,3-glucanase e maior concentração de lignina em relação à testemunha. No entanto, estes tratamentos não tiverem efeito sobre a atividade da quitinase. O ASM é um potencial indutor de resistência a P. palmivora para ser usado no manejo da podridão de raízes do mamoeiro. Quanto a avaliação dos agentes de biocontrole observdos ou-se que 33 isolados de Trichoderma utilizados apenas 2 isolados (T70 - T. Harzianum, T68 - T. virens) não diferiram estatisticamente do tratamento com o fungicida padrão, apresentaram o percentual de sobrevivência de 58,3 e 52,4 respectivamente. Foi avaliado também o efeito destes dois isolados de Trichoderma sobre incremento de massa seca e fresco em mudas de mamoeiro e contatou-se que dois isolados apresentaram maiores aumentos nestes dois parâmetros quando comparados com testemunha. O isolado T70 e T68 de apresentaram um incremento de massa fresca e seca total de 110; 73% e 59; 59% respectivamente, comparados com a testemunha apenas plantadas no solo. Os isolados de T. harzianum e T. virens apresentaram potencial com agente biocontroladorde P. palmivora para ser usado no manejo da podridão de raízes do mamoeiro.
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Caracterização de isolados de Xanthomonas citri subsp. malvacearum e redução da mancha-angular do algodoeiro mediada pelo silício

OLIVEIRA, Janaína Cortêz de 22 October 2010 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-17T14:39:22Z No. of bitstreams: 1 Janaina Cortez de Oliveira.pdf: 616667 bytes, checksum: 9d56953508b1cd4518224b8966b15c92 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T14:39:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Janaina Cortez de Oliveira.pdf: 616667 bytes, checksum: 9d56953508b1cd4518224b8966b15c92 (MD5) Previous issue date: 2010-10-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The bacterial blight caused by Xanthomonas citri subsp. malvacearum (Xcm) is the most important bacterial disease of cotton in the Middle-West and Northeast Regions of Brazil. The variability of a population formed by 100 Xcm strains obtained from commercial fields in the states of Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul and Bahia, Brazil, was analyzed based upon genetic and phenotypic characteristics. The enzymes amylase, lipase, cellulase and the polysaccharide levan were produced by all Xcm isolates while the caseinase was only produced by 20 strains. All strains induced hipersensitivity reaction in tomato leaves. The 100 strains were sensitive to copper oxychloride (1500 mg L-1), copper hidroxide (1614 mg L-1), oxytetracicline (600 mg L-1), oxytetracicline (90 mg L-1) + tribasic copper sulfate (1500 mg L-1) and oxytetracicline (76.6 mg L-1) + streptomycin sulfate (367.2 mg L-1), but resistant to kasugamycin (60 mg L-1). Among the eighteen tested antibiotics the strains presented variable reaction in relation to: nalidixic acid, amoxicillin, azithromycin, bacitracin, eritromicin, kanamycin, pefloxacin, tobramycin e vancomycin. Rep-PCR (REP, ERIC and BOX) showed the formation of five groups at 70% similarity level. Group I contained 98 strains, including the reference strain Xcm IBSBF1733, group II contained only two strains from Bahia and the other three groups included strains of Xanthomonas citri pv. anacardii, X. citri pv. mangiferaeindicae e X. axonopodis pv. spondiae used for comparison. This work also evaluated the effect of silicon (Si) on the bacterial blight of cotton control and the putative mechanisms involved in the resistance potentialized by this element were evaluated. Calcium silicate (CaSiO3) was incorporated into the soil at concentrations of 0.00, 0.25, 0.50, 1.50 and 3.00 g of SiO2 kg-1 soil 25 days before planting. Leaves of 33-day-old-plants were inoculated by infiltration with 0.5 mL suspension of Xcm (108 CFU ml-1). Components of resistance were evaluated every two days until 10 days after inoculation, at which point plant development and the accumulation of Si and Calcium (Ca) were also determined. H2O2 production and the activity of enzymes related to plant defenses were analyzed at 6, 12 and 24 hours after inoculation in plants +/-Si. In vitro inhibition of pathogen growth due to Si was also assessed. No significant difference was seen among the treatments regarding incubation period, disease incidence or inhibition of bacterial growth. However, with the application of 1.50 g of SiO2 kg-1 of soil, a reduction in severity (54.9%) was observed along with a reduction in the area under the disease progression curve (35.76%) and an increase in plant height (7.04%). There was no observable accumulation of Si in the cotton leaves. Levels of soluble proteins and H2O2 and activity of the enzymes SOD, APX, guaiacol peroxidase, PAL and b Glu were altered in the presence of Si (1.80 g SiO2 kg-1). Thus based on the genetic and phenotypic characteristics studied we conclude that the population of 100 Xcm strains presents low variability, and that the reduction of cotton bacterial blight severity mediated by Si is probably associated to the characteristic events of induced resistance observed. / A mancha-angular, causada por Xanthomonas citri subsp. malvacearum (Xcm), é a principal doença bacteriana do algodoeiro no Centro-Oeste e Nordeste do Brasil. A variabilidade de uma população de 100 isolados de Xcm, oriundos de plantas com sintomas típicos de mancha-angular em áreas produtoras de algodoeiro dos estados de Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul e Bahia, Brasil, foi analisada com base em características fenotípicas e genéticas. As enzimas amilase, lipase e celulase e o polissacarídeo levana foram produzidos por todos os isolados de Xcm, enquanto a caseinase foi produzida apenas por 20 isolados. Todos os isolados induziram reação de hipersensibilidade em folhas de tomateiro. Os 100 isolados foram sensíveis a oxicloreto de cobre (1500 mg l-1), hidróxido de cobre (1614 mg l-1), oxitetraciclina (600 mg l-1), oxitetraciclina (90 mg l-1) + sulfato tribásico de cobre (1500 mg l-1) e oxitetraciclina (76,6 mg l-1) + sulfato de estreptomicina (367,2 mg l-1), e resistentes a casugamicina (60 mg l-1). Dentre os 18 antibióticos testados, os isolados bacterianos apresentaram reação variável a nove: ácido nalidíxico, amoxicilina, azitromicina, bacitracina, eritromicina, kanamicina, pefloxacina, tobramicina e vancomicina. Rep-PCR (REP, ERIC e BOX) revelou a formação de cinco grupos ao nível de 70% de similaridade, sendo o grupo I constituído de 98 isolados, incluindo o isolado referência de Xcm IBSBF1733, o grupo II, formado apenas por dois isolados oriundos da Bahia e os três outros grupos por isolados de X. citri pv. anacardii, X. citri pv. mangiferaeindicae e X. axonopodis pv. spondiae utilizados para comparação. Neste trabalho também foi avaliado o efeito do silício (Si) no controle da mancha-angular do algodoeiro, e os possíveis mecanismos envolvidos na resistência potencializada por este elemento. O silicato de cálcio (CaSiO3) foi incorporado ao solo nas doses de 0,00; 0,25; 0,50; 1,50 e 3,00 g de SiO2 kg-1 de solo 25 dias antes do plantio. Plantas com 33 dias tiveram as folhas inoculadas por infiltração com 0,5 mL de suspensão de Xcm (108 UFC ml-1). Os componentes da resistência foram avaliados a cada dois dias até 10 dias após a inoculação, quando o desenvolvimento da planta e o acúmulo de Si e Ca foram também determinados. Foram ainda analisadas a atividade de enzimas relacionadas à defesa vegetal e a produção de H2O2 às 6, 12 e 24 h após a inoculação em plantas +/-Si e a inibição in vitro do crescimento do patógeno. Não foi verificada diferença significativa entre os tratamentos quanto ao período de incubação, incidência da mancha-angular e inibição do crescimento da bactéria. Com a aplicação da dose 1,50 g SiO2 kg-1 de solo, observou-se redução da severidade (54,9%), da área abaixo da curva de progresso da doença (35,76%) e aumento na altura das plantas (7,04%). Não foi verificado acúmulo de Si nas folhas de algodoeiro. Níveis de proteínas solúveis e H2O2 e atividade das enzimas SOD, APX, POX, PAL e GLU foram alterados na presença do Si (1,80 g SiO2 kg-1). Com base nas características fenotípicas e genéticas analisadas, conclui-se que a população de 100 isolados de Xcm estudada apresenta baixa variabilidade e que a redução da severidade da mancha-angular do algodoeiro mediada por Si está provavelmente associada aos eventos característicos de indução de resistência observados.
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Eficiência de indutores no manejo integrado de Meloidogyne spp. e Pratylenchus zeae em cana-de-açúcar

GUIMARÃES, Lílian Margarete Paes 27 February 2007 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-20T12:45:11Z No. of bitstreams: 1 Lilian Margarete Paes Guimaraes.pdf: 603330 bytes, checksum: b3b0fa1dea1a523d8a31a3f1c86a9715 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-20T12:45:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lilian Margarete Paes Guimaraes.pdf: 603330 bytes, checksum: b3b0fa1dea1a523d8a31a3f1c86a9715 (MD5) Previous issue date: 2007-02-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Sugarcane (Saccharum spp.) production in Northeastern Brazil is low when compared to other producing regions in the country. Among the main diseases in the fields those caused by nematodes are pointed out due to high incidence and costs. Under this point of view, four experiments were carried out for more economic, efficient and environmental sound control alternatives. The first experiment evaluated methyl jasmonate, potassium silicate and Ecolife 40® efficiency, in association or not with systemic nematicide, for integrated nematode management in sugarcane. The experiment was carried out under a split plot in completely randomized block design in a nematode naturally infested area. At planting it was evaluated nematode densities in soil; and 3, 6, and 12 months later in soil and roots. Shoots number and productive and industrial variables were evaluated at 3 and 12 months, respectively. There was significant reduction on Meloidogyne spp. density in soil in plots with inducer in association or not with nematicide, and significant correlation between root-knot nematodes and Pratylenchuszeae. Other nematodes in field were not affected by inducers or nematicide. All productive and industrial variables were not affected also, except shoot and stalk numbers, significantly higher than the control in plots with Ecolife 40® and any inducer, respectively. In the second experiment it was evaluated under greenhouse methyl jasmonate and potassiumsilicate effect on M. incognita parasitism in sugarcane variety RB863129 and the peroxidase and β-1,3-glucanase activity elicited. The effect of Methyl jasmonate and potassium silicate did not affect shoot biomass. Methyl jasmonate and potassium silicate significantly decreased eggs number per gram of roots. Seven days after application, both inducers affected β-glucanase activity in inoculated plants and, at 14 and 21 days, inducerspromoted significant variations in peroxidase e β-1,3-glucanase levels, although, inversely to peroxidase, β-1,3-glucanase activity did not differ between inoculated and non inoculated plants. The third experiment evaluated under greenhouse the effect of methyl jasmonate and potassium silicate, in different applications, on sugarcane development under P. zeae naturally infested soil. Experimental design was completely randomized with 10 treatments and five replicates, using the nematicide carbofuran and untreated plants as the controls. Inducers did not affect (P>0.05) height and biomass of the plants neither P. zeae density in soil and root, 100 days after transplanting, differing from nematicide which reduced (P≤0.05) nematode density in soil and root. The fourth experiment evaluated methyl jasmonate and potassium silicate effect on M. incognita parasitism in two sugarcane varieties RB867515 and RB92579, under greenhouse. Inducers effect on nematodes depended on sugarcane variety. Methyl jasmonate and potassium silicate did not affect shoot biomass in RB867515. Methyl jasmonate significantly decreased M. incognita eggs in RB867515, and potassium silicate in RB867515 and RB92579, although bothsignificantly decreased eggs number per gram of roots in RB867515. / A produção de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) no Nordeste do Brasil é baixa quando comparada a outras regiões produtoras no país. As fitonematoses se destacam entre as principais doenças, devido à alta incidência e aos elevados custos para o controle. Dessa forma quatro experimentos foram conduzidos buscando alternativas mais eficientes, econômicas e de menor impacto ambiental. O primeiro experimento avaliou a eficiência do metil jasmonato, silicato de potássio e Ecolife 40® aplicados isoladamente ou em associações com nematicida sistêmico em cana-de-açúcar variedade RB863129, em condições de campo. No solo, houve diminuição significativa da densidade populacional de Meloidogyne spp. nas parcelas que receberam indutores isoladamente ou em associações com nematicida, ocorrendo correlação significativa entre as densidades populacionais do parasito com Pratylenchus zeae. Os demais fitonematóides detectados não foram afetadospelos tratamentos, como também não foram todas as variáveis produtivas e industriais avaliadas, exceto o número de perfilhos e de colmos, significativamente maior do que a testemunha nas plantas com Ecolife 40® e com qualquer indutor, respectivamente. O segundo estudo avaliou o efeito de metil jasmonato e silicato de potássio sobre o parasitismo de M. incognita na variedade RB863129 de cana-de-açúcar e a atividade enzimática da peroxidase e β-1,3-glucanase elicitada, em condições de casa de vegetação. Metil jasmonato diminuiu significativamente o número de ovos por grama de raiz, mas não afetou à biomassa da parte aérea da planta. Sete dias após a aplicação, os dois indutores afetaram a atividade de β-glucanase na plantas parasitadas e, aos 14 e 21 dias, promoveram variações significativas nos níveis de peroxidase e β-1,3-glucanase, muito embora, ao contrário da peroxidase, a atividade da β-1,3-glucanase não tenha diferido entre plantasinoculadas e não inoculadas. No terceiro trabalho avaliou-se o efeito de metil jasmonato e silicato de potássio, em diferentes aplicações sobre a densidade populacional de P. zeae em solo naturalmente infestado cultivado com cana-de-açúcar e o desenvolvimento da cultura, em condições de casa de vegetação. Os indutores não afetaram (P>0,05) a altura e biomassa das plantas, nem a densidade populacional de P. zeae no solo e na raiz, 100 dias após o transplantio, diferindo do nematicida que reduziu (P≤0,05) o nível populacional do nematóide no solo e raiz. O quarto estudo avaliou o efeito de metil jasmonato e silicato de potássio sobre o parasitismo de M. incognita em duas variedades de cana-de-açúcar RB867515 e RB92579 em condições de casa de vegetação. O efeito dos indutores sobre o nematóide dependeu da variedade de cana-de-açúcar estudada. Metil jasmonato e silicato de potássio não afetaram à biomassa da parte aérea da variedade RB867515. Metiljasmonato diminuiu significativamente o número de ovos de M. incognita por planta em RB867515, e o silicato de potássio em RB867515 e RB92579, ambos reduziram significativamente o número de ovos por grama de raiz em RB867515.
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Identificação específica de Colletotrichum, caracterização da agressividade e efeito de indutores químicos no controle da antracnose em maracujá amarelo

ALMEIDA, Luis Carlos Cordeiro de 28 February 2005 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-20T15:13:40Z No. of bitstreams: 1 Luiz Carlos Cordeiro de Almeida.pdf: 752265 bytes, checksum: 0b51cc544b4a3c3490d349aa5cd97677 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-20T15:13:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luiz Carlos Cordeiro de Almeida.pdf: 752265 bytes, checksum: 0b51cc544b4a3c3490d349aa5cd97677 (MD5) Previous issue date: 2005-02-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Anthracnose, caused by Colletotrichum gloeosporioides and Colletotrichum sp., is the most important post harvest disease on the yellow passion fruit. The disease management measures have not been satisfactory ever during the pre or post harvest period. Aiming to contribute to the program of cultivar resistance, 33 isolates were obtained from three producing regions of Pernambuco State, to: i) identify specie with genetic marker (PCR primer); ii) to know the pathogen aggressiveness on post harvested yellow passion fruits; iii) aggressiveness characterization using: biochemical (extra cellular enzymatic activity on specific solid media), physiological (micelial growth on PDA) and genetic (RAPD primer)markers. Also, it was studied anthracnose control on post harvested yellow passion fruit using acibenzolar-S-methyl (ASM), DL -amine-n-butyric acid (BABA) and methyl jasmonate (MJ) chemical inducers. None DNA extracted from isolates reacted with C. gloeosporioides and C. acutatum PCR primers markers, but 18 DNAs reacted with Colletotrichum of Passiflora PCR primermarker, although isolates not identified genetically showed morphological characteristics similar to C. gloeosporioides. Yellow passion fruits inoculations showed two isolate groups for aggressiveness: high (AG-1) and low (AG-2), but aggressiveness did not correlate with origin and teleomorphic and anamorphic morphotype. The biochemical (amilolytic, celullolytic, lypolytic and proteolytic enzymatic activities) and physiological (micelial growth) markers separated isolates in groups, but they were not a satisfactory makers to aggressiveness. It was not detected pectinolytic enzymatic activity by isolates because the used method it was not appropriated. Bands produced by reaction of 33 DNAs with 18 primers showed that AG-1 isolates are more related to each other than AG-2 isolates, being possible to separate isolates in two genetic groups,which not totality related with AG-1 and AG-2 isolates. The reactions of the RAPD OPA-9 primer with isolates DNA produced bands in position 14, on agarose gel, which allowed characterization of the 85.7 % of AG-1 isolates, showing error of 15.7 % by including three isolates from AG-2 into AG-1, but without technique importance. Study with the chemical ASM, BABA e MJ inducers showed that ASM and MJ, at 12.5; 25.0, 50.0 and 100.0 ppm concentrations, and BABA, at 50, 100, 500 and 1000 ppm concentrations, did not reduce Colletotrichum conidia germination, but BABA and JM stimulate this physiological process. ASM and JM reduced mycelium growth and BABA showed contrary effect. Yellow passion fruits immersed in ASM (100ppm), BABA (1000 ppm) and MJ (100 ppm) suspension and water (control), followed by Colletotrichum inoculation 24 hours after treatment, did not show anthracnose control. / A antracnose, causada por Colletotrichum gloeosporioides e Colletotrichum sp. é uma das doenças em pós-colheita mais importantes do maracujazeiro amarelo. Apesar da existência de medidas de manejo tanto para a pré-colheita como para a pós-colheita, o controle não é satisfatório. Visando contribuir com um programa para aumentar a resistência da planta, foram coletados 33 isolados de Colletotrichum, obtidos de três regiões produtoras do estado de Pernambuco, para: i) identificação específica com marcadores genéticos primers de PCR; ii) conhecer agressividades em maracujá amarelo; iii) caracterizá-la com marcador bioquímico, pela produção de enzimas hidrolíticas extra celulares em meios sólidos específicos, fisiológico, pelo crescimento micelial em meio de BDA e genético, com primers de RAPD. Também se estudou o controle da antracnose em maracujá amarelo com uso dos indutores químicosacibenzolar-S-metil (ASM), ácido LD -amino–n–butírico (BABA) e jasmonato metílico (JM). Nenhum DNA dos isolados reagiu com os primers de PCR marcadores para C. gloeosporioides e C. acutatum, mas 18 reagiram com o primer de PCR marcador para Colletotrichum de Passiflora, embora os isolados não identificados geneticamente apresentassem características morfológicas semelhantes às de C. gloeosporioides. Inoculações em maracujá amarelo permitiram separar os isolados em dois grupos de agressividade: alta (GA-1) e baixa (GA-2), embora a agressividade não tenha se correlacionado com a origem e os morfotipos teleomorfo e anamorfo. Os marcadores bioquímico (atividade enzimática amilolítica, celulolítica, lipolítica e proteolítica) e o marcador fisiológico (crescimento micelial) separaram os isolados em grupos, mas não se mostraram satisfatórios como marcadores para agressividade. Nãofoi detectada atividade enzimática pectinolítica devido ao método ter sido inadequado.As bandas geradas pelas reações de 18 primers com os DNAs dos isolados permitiram observar que os isolados do GA-1 são mais próximos geneticamente entre si do que os isolados do GA-2, sendo possível dividi-los em dois grupos genéticos que não se relacionaram totalmente com os isolados do GA-1 e GA-2. O marcador banda na posição 14 em gel de agarose, resultante das reações dos DNAs dos isolados com o primer de RAPD OPA-9, possibilitou a caracterização de 85,7 % dos isolados do GA-1, com um erro de 15,7 % ao caracterizar como do GA-1 três isolados do GA-2, mas sem importância técnica. Os estudos com os indutores ASM, BABA e JM, evidenciaram que ASM e JM, nas concentrações 12,5; 25,0; 50,0; e 100,0 ppm, e BABA, nas concentrações 50; 100; 500; e 1000 ppm, não reduziram a germinação de conídios de Colletotrichum sp., mas BABA e JM estimularam este processo fisiológico. Os indutores ASM e JM reduziram o crescimento micelial e BABA apresentou efeito contrário. A imersão de maracujá amarelo em suspensão de ASM (100 ppm), JM (100 ppm), BABA (1000 ppm) e em água (testemunha) seguida de inoculação feita 24 h após com Colletotrichum sp. não resultou em controle da doença.
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Interação genótipo x ambiente e adaptabilidade e estabilidade de híbridos de melão Galia / Genotypic x environment interaction and adaptability and stability of Galia melon hybrids

Santos Júnior, Haroldo 26 December 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-12T19:15:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Haroldo santos junior com.pdf: 250109 bytes, checksum: d198a6a9ba6d2f9ea48f9821902b77ae (MD5) Previous issue date: 2007-12-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The diversity of environment existent in Rio Grande do Norte due to the different climate conditions and soil can interfere in the adaptability, stability and consequently, in the development of the culture of the melon plant, with reflexes in the productivity and quality of fruits, once those characteristics are influenced directly by the correlation between genotype and environments. The objectives of this work were to verify the importance of the parts simple and complex of the genotype x environment interaction and to evaluate the adaptability and stability of Galia melon hybrid. Nine Galia melon hybrids were tested (GPS 400, DRG 1531, DRG 1537, Solarbel, Solar King, Galileu, Supra, Num 1502 e Arava) in twelve environments of the Rio Grande Norte State (MO-00, MO-01, MO-02, BA-00, BA-01, BA-02, AS-00, AS-01, AS-02, AR-00, AR-01, AR-02) in the period from 2000, 2001 and 2002. The tests were conducted in randomized blocks with three replications. Data were submitted to the analysis of variance individually and jointly and the statistical methods Toler, Wrick and AMMI (Additive Main effect and Multiplicative Interaction) were used to study the adaptability and stability. The complex part is responsible for most of the genotype x environment interaction for the yield and content of solids soluble of fruits. The environments associated with Mossoró and Assu are the most suitable for evaluation of melon Galia. For being stable, productive and to have elevated content of soluble solids, the hybrid DRG 1537 is the most promising for the cultivation in Agripole Mosoró-Assu / A diversidade de ambientes existente no Rio Grande do Norte devido às diferentes condições de clima e solo podem interferir na adaptabilidade, estabilidade e conseqüentemente, no desenvolvimento da cultura do meloeiro, com reflexos na produtividade e qualidade de frutos, uma vez que essas características são diretamente influenciadas pela correlação entre genótipos e ambientes. Os objetivos deste trabalho foram verificar a contribuição das partes simples e complexa da interação genótipo x ambiente e avaliar a adaptabilidade e estabilidade de híbridos de melão Galia. Foram testados nove híbridos de melão Galia (GPS 400, DRG 1531, DRG 1537, Solarbel, Solar King, Galileu, Supra, Num 1502 e Arava) em doze ambientes do Estado do Rio Grande Norte (MO-00, MO-01, MO-02, BA-00, BA-01, BA-02, AS-00, AS-01, AS-02, AR-00, AR-01, AR-02) no período de 2000, 2001 e 2002. Os ensaios foram conduzidos em blocos casualizados com três repetições. Os dados foram submetidos à análise de variância individual e conjunta e os métodos estatísticos Toler, Wrick e AMMI (Additive Main effect and Multiplicative Interaction) foram usados para avaliar a adaptabilidade e estabilidade. A parte complexa é a maior responsável pela interação genótipo x ambiente para a produtividade e o teor de sólidos solúvel dos frutos. Os ambientes associados com Mossoró e Assu são os mais adequados para a avaliação de melão Galia. Por ser estável, apresentar alta produtividade e ter elevado teor de sólidos solúveis, o híbrido DRG 1537 é o mais promissor para o cultivo no Agropolo Mosoró-Assu
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Interação genótipo x ambiente e adaptabilidade e estabilidade de híbridos de melão Galia / Genotypic x environment interaction and adaptability and stability of Galia melon hybrids

Santos Júnior, Haroldo 26 December 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-12T19:18:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Haroldo santos junior com.pdf: 250109 bytes, checksum: d198a6a9ba6d2f9ea48f9821902b77ae (MD5) Previous issue date: 2007-12-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The diversity of environment existent in Rio Grande do Norte due to the different climate conditions and soil can interfere in the adaptability, stability and consequently, in the development of the culture of the melon plant, with reflexes in the productivity and quality of fruits, once those characteristics are influenced directly by the correlation between genotype and environments. The objectives of this work were to verify the importance of the parts simple and complex of the genotype x environment interaction and to evaluate the adaptability and stability of Galia melon hybrid. Nine Galia melon hybrids were tested (GPS 400, DRG 1531, DRG 1537, Solarbel, Solar King, Galileu, Supra, Num 1502 e Arava) in twelve environments of the Rio Grande Norte State (MO-00, MO-01, MO-02, BA-00, BA-01, BA-02, AS-00, AS-01, AS-02, AR-00, AR-01, AR-02) in the period from 2000, 2001 and 2002. The tests were conducted in randomized blocks with three replications. Data were submitted to the analysis of variance individually and jointly and the statistical methods Toler, Wrick and AMMI (Additive Main effect and Multiplicative Interaction) were used to study the adaptability and stability. The complex part is responsible for most of the genotype x environment interaction for the yield and content of solids soluble of fruits. The environments associated with Mossoró and Assu are the most suitable for evaluation of melon Galia. For being stable, productive and to have elevated content of soluble solids, the hybrid DRG 1537 is the most promising for the cultivation in Agripole Mosoró-Assu / A diversidade de ambientes existente no Rio Grande do Norte devido às diferentes condições de clima e solo podem interferir na adaptabilidade, estabilidade e conseqüentemente, no desenvolvimento da cultura do meloeiro, com reflexos na produtividade e qualidade de frutos, uma vez que essas características são diretamente influenciadas pela correlação entre genótipos e ambientes. Os objetivos deste trabalho foram verificar a contribuição das partes simples e complexa da interação genótipo x ambiente e avaliar a adaptabilidade e estabilidade de híbridos de melão Galia. Foram testados nove híbridos de melão Galia (GPS 400, DRG 1531, DRG 1537, Solarbel, Solar King, Galileu, Supra, Num 1502 e Arava) em doze ambientes do Estado do Rio Grande Norte (MO-00, MO-01, MO-02, BA-00, BA-01, BA-02, AS-00, AS-01, AS-02, AR-00, AR-01, AR-02) no período de 2000, 2001 e 2002. Os ensaios foram conduzidos em blocos casualizados com três repetições. Os dados foram submetidos à análise de variância individual e conjunta e os métodos estatísticos Toler, Wrick e AMMI (Additive Main effect and Multiplicative Interaction) foram usados para avaliar a adaptabilidade e estabilidade. A parte complexa é a maior responsável pela interação genótipo x ambiente para a produtividade e o teor de sólidos solúvel dos frutos. Os ambientes associados com Mossoró e Assu são os mais adequados para a avaliação de melão Galia. Por ser estável, apresentar alta produtividade e ter elevado teor de sólidos solúveis, o híbrido DRG 1537 é o mais promissor para o cultivo no Agropolo Mosoró-Assu
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Aspectos fisiológicos e bioquímicos da resistência do cafeeiro à ferrugem potencializados por triazol e estrobilurina / Physiological and biochemical aspects of resistance in coffee to rust potentiated by triazole and strobilurin

Honorato Júnior, Jaime 28 February 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T12:42:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1359880 bytes, checksum: 75e8020a52662b6da6545e57d6103547 (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Coffee is the most traded commodity in the world and Brazil is the largest producer. Coffee leaf rust, caused by the biotrophic fungus Hemileia vastatrix is the most important coffee disease reducing coffee yield by 35 to 50%. Too little is known about this pathosystem as well as the pathogen impacts on plant photosynthesis, defense enzymes activities, concentration of plant pigments and chlorophyll a fluorescence parameters under different fungicides sprayed treatments. To contribute with new knowledge generation, this study aimed: 1) to evaluate the Fv/Fm (Maximal photosystem II quantum yield) chlorophyll a fluorescence imaging parameter as tool to differentiate pre-symptomatic coffee leaf rust infections in plants sprayed with pyraclostrobin and epoxiconazole and 2) to investigate the relationships between photosynthetic pigments, defense enzymes activities and some chlorophyll a fluorescence parameters on leaves of coffee plants sprayed with epoxiconazole and pyraclostrobin and inoculated or non-inoculated with Hemileia vastatrix. Experiments in a completely randomized design were performed in greenhouse and coffee plants were inoculated with urediniospores. Epoxiconazole and pyraclostrobin were sprayed in coffee plants in order to study the Fv/Fm chlorophyll a fluorescence parameter, coffee leaf rust severity, defense enzymes activities, photosynthetic pigments concentration and other chlorophyll a fluorescence parameters. Results from the present study showed that the different fungicides application on soil and/or leaves of triazoles and strobilurins were efficient to control coffee leaf rust. There was a significant linear relationship between the areas of real severity and visual severity and for each additional unit in the visual severity there was an increase of 53% on the real severity. For the epoxiconazole and pyraclostrobin treatments, the coffee leaf rust symptoms decreased based on both visual and Fv/Fm images. Pustules on leaves sprayed with epoxiconazole were smaller in size than the ones on leaves of plants from the control treatment, but bigger than pyraclostrobin. Reduction on Fv/Fm values at the pustules epicenter on leaves of plants sprayed with epoxiconazole and pyraclostrobin were lower than those of the control treatment. Coffee leaf rust severity decreased until 40 days after inoculation on plants sprayed with epoxiconazole and pyraclostrobin. Catalase, peroxidases, &#946;-1,3-glucanases and chitinases activities were different among treatments with inoculated and non-inoculated plants. There was a significant reduction in pigments concentration between non-inoculated and inoculated treatments but not, in plants sprayed with epoxiconazole and pyraclostrobin. Chlorophyll a fluorescence parameters were different between non-inoculated and inoculated plants and non- sprayed and fungicides sprayed plants. Hemileia vastatrix affected the photosynthetic capacity of Coffea arabica and the Fv/Fm parameter was able to show this effect before the appearance of visual symptoms. Changes on photosynthesis were detected in non- inoculated and inoculated plants sprayed with epoxiconazole and pyraclostrobin. Also, the effect of fungicides on photosynthesis should be studied to provide more opportunities to understanding the impacts on plant defense mechanisms that lead to reduced coffee leaf rust symptoms. / O café é a commodity mais negociada no mundo sendo o Brasil seu maior produtor. A ferrugem do cafeeiro, causada pelo fungo biotrófico Hemileia vastatrix é a doença mais importante do cafeeiro e pode causar redução em sua produtividade entre 35 a 50%. Muito pouco se sabe sobre este patossistema, bem como os impactos do patógeno sobre a fotossíntese da planta, a atividade de enzimas de defesa, a concentração de pigmentos vegetais e os parâmetros de fluorescência clorofila a sob diferentes tratamentos com fungicidas. Para contribuir com a geração de novos conhecimentos, este estudo teve como objetivos: 1) avaliar a variável Fv/Fm (Rendimento quântico máximo do fotossistema II) obtida através da imagem da fluorescência da clorofila a como ferramenta para diferenciar infecções pré-sintomáticas em plantas pulverizadas com epoxiconazol e piraclostrobina e 2) investigar as relações entre pigmentos fotossintéticos, atividade de enzimas de defesa e alguns parâmetros de fluorescência da clorofila a em folhas de café pulverizadas com epoxiconazol e piraclostrobina e inoculadas ou não-inoculadas com Hemileia vastatrix. Os experimentos seguiram delineamento inteiramente casualizado e foram conduzidos em casa de vegetação. As plantas de café foram cultivadas em estufa e inoculadas com urediniósporos. Epoxiconazol e piraclostrobina foram pulverizadas sobre as plantas, a fim de estudar o parâmetro Fv/Fm de fluorescência da clorofila a, a severidade da ferrugem do cafeeiro, a atividade de enzimas de defesa, a concentração de pigmentos fotossintéticos e outros parâmetros de fluorescência da clorofila a. Houve uma relação linear significativa entre severidade real e visual das áreas foliares estimadas pelo parâmetro Fv/Fm e para cada unidade adicional na severidade visual, houve um aumento de 53% na severidade real. Para os tratamentos com epoxiconazol e piraclostrobina, os sintomas da ferrugem do cafeeiro diminuíram tomando como base as imagens visual e as geradas a partir do parâmetro Fv/Fm da fluorescência da clorofila a. Pústulas nas folhas pulverizadas com epoxiconazol foram menores nas folhas do tratamento controle mas, maiores do que piraclostrobina. A redução nos valores do parâmetro Fv/Fm no epicentro das pústulas das folhas pulverizadas com epoxiconazol e piraclostrobina foram menores do que os do tratamento controle. A severidade da ferrugem do cafeeiro diminuiu até 40 dias após a inoculação nas plantas pulverizadas com epoxiconazol e piraclostrobina. As atividades de catalase, peroxidases, &#946;-1,3-glucanases e quitinases foram diferentes entre os tratamentos com plantas inoculadas e não-inoculadas. Houve redução significativa na concentração de pigmentos entre as plantas não-inoculadas e inoculadas mas, não entre as plantas pulverizadas com epoxiconazol e piraclostrobina. Os parâmetros de fluorescência da clorofila a foram diferentes entre plantas não-inoculadas e inoculadas e não-pulverizadas e pulverizadas com fungicidas. Hemileia vastatrix afetou a capacidade fotossintética de Coffea arabica e o parâmetro Fv/Fm de fluorescência da clorofila a foi capaz de mostrar esse efeito antes do aparecimento dos sintomas visuais. Alterações na fotossíntese foram detectadas em plantas não-inoculadas e inoculadas pulverizadas com epoxiconazol e piraclostrobina. Além disso, o efeito dos fungicidas sobre a fotossíntese deve ser estudado, para proporcionar mais oportunidades para a compreensão dos impactos sobre os mecanismos de defesa da planta, que levam à redução de sintomas da ferrugem do cafeeiro.
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Identificação e análise funcional de efetores de Hemileia vastatrix, agente causal da ferrugem do cafeeiro / Indentification and funtional analysis of effectors from Hemileia vastatrix, the causal agent of the coffee rust

Maia, Thiago Andrade 27 February 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T12:42:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1536759 bytes, checksum: edfc663b086d5a927204773326c9803e (MD5) Previous issue date: 2013-02-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Coffee leaf rust, caused by the biotrophic fungus Hemileia vastatrix, is the main phytosanitary problem of the coffee plant. The disease may cause yield losses ranging from 35 to 50% if control measures are not implemented. During the interaction with the host plant, rust fungi secrete a variety of effector proteins that modify the structure and function of the host cell allowing the biotrophic interaction. Some of these effector proteins, known as avirulence proteins (Avr), are recognized by plant proteins encoded by resistance genes, which triggers a defense response against pathogen infection. At least nine dominant genes (SH1 to SH9) that confer resistance to coffee leaf rust have been genetically identified, but despite many years of research on this pathosystem, the complementary Avr genes of H. vastatrix have not yet been identified or characterized. One approach that can be used for this purpose is to conduct an transcriptome and bioinformatics analyses in order to identify candidate genes of H. vastatrix that fulfill a set of specific criteria common to effector proteins, and their validation by conducting functional assays for effector activities. Therefore, the objectives of this study were: (i) to identify genes of H. vastatrix that encode proteins secreted during the germination of urediniospores as well as during the biotrophic interaction with the coffee plant, (ii) to express the effector gene candidates from H. vastatrix in the yeast secretion trap system (YST) in order to obtain biological confirmation of the secretion prediction made by bioinformatics tools, (iii) to analyze the genomic structure of a select group of effector gene candidates, (iv) to perform expression analysis of the identified candidates during different stages of infection; and (v) to establish a protocol for transient expression of H. vastatrix secreted proteins in coffee leaves based on the Type III Secretion System of Pseudomonas syringae pv. garcae. Initially, the secretome of germinated urediniospores of H. vastatrix was characterized by constructing a cDNA library from mRNA isolated from urediniospores germinated in vitro during 16 hours. After analysis of the ESTs using bioinformatics tools, 146 ORFs that encode secreted proteins were selected. Annotation of these proteins showed that 20% of the secretome from germinated urediniospores consists of hydrolytic enzymes and that most (67%) of the identified secreted proteins have unknown function. From the latter group of sequences, 35 complete ORFs encoding proteins sharing features with effectors from filamentous fungi and named H. vastatrix effector candidates (HvECs) were selected for further analysed. The genomic sequences of 22 of these HvECs were characterized, confirming the ORFs predicted by bioinformatics. The secretion of eight selected HvECs was confirmed in yeast and their expression analysis revealed a differential expression, which possibly occurs in coordination with the morphological changes of the pathogen during the early stages of infection. The secretome of H. vastatrix during a compatible plant-rust interaction was also characterized by a combination of Sanger sequencing and 454 pyrosequencing. This integrated approach allowed the massive sequencing of a substantial number of sequence tags (ESTs) of genes expressed at four different times during the biotrophic interaction: 48 hours, 72 hours, 9 days and 12 days after inoculation of coffee leaves with H. vastatrix. After bioinformatics analyses of these ESTs, 75 HvECs were selected and an expression analyses based on RT- PCR confirmed the fungal origin for 62 of them. 22 of these HvECs are preferentially expressed during the interaction of the fungus with the coffee plant and show distinct patterns of expression along the progress of infection. Using the pEDV system and the Type III Secretion System of P. syringae pv. garcae it was established a protocol to express transiently secreted proteins from H. vastatrix in coffee leaves established. Transient expression of HvEC-016 inside the cytoplasm of coffee plants carrying the rust resistant gene SH1, triggered a plant defense response indicating that there may have occurred a recognition of the HvEC-016 effector protein mediated by the R protein encoded by SH1. The catalog of effector gene candidates for H. vastatrix expressed during both urediniospore germination and the interaction with the coffee plant and the transient assay established in this study is an important plataform to identify additional avirulence genes from Hemileia vastatrix. / A ferrugem do cafeeiro, causada pelo fungo biotrófico Hemileia vastatrix, é o principal problema fitossanitário da cafeicultura, podendo ocasionar perdas da ordem de 35 a 50% da produção se não forem implantadas medidas de controle. Durante a interação com a planta hospedeira, os fungos causadores de ferrugens secretam um arsenal de proteínas efetoras que modificam a estrutura e a função da célula hospedeira, permitindo o estabelecimento da interação biotrófica. Algumas dessas proteínas efetoras, denominadas proteínas de avirulência (Avr), são reconhecidas por proteínas codificadas por genes de resistência, o que desencadeia uma resposta de defesa da planta contra a infecção pelo patógeno. Já foram identificados geneticamente pelo menos nove genes dominantes (SH1 a SH9) que conferem resistência à ferrugem do cafeeiro, no entanto, apesar de muitos anos de pesquisa neste patossistema, os genes Avr complementares de H. vastatrix ainda não foram identificados ou caracterizados. Uma abordagem que pode ser realizada com esta finalidade é a análise do transcriptôma e de bioinformática para identificar genes candidatos de H. vastatrix que cumpram uma lista de critérios específicos em banco de dados de sequências, seguida da validação por meio de ensaios funcionais para atividades de efetores. Diante do exposto, os objetivos desse estudo foram: (i) identificar genes de H. vastatrix que codificam proteínas secretadas, expressas durante a germinação dos urediniósporos e também durante a fase biotrófica da interação com o cafeeiro; (ii) expressar genes candidatos a efetores de H. vastatrix, utilizando o sistema armadilha de secreção em levedura YST (Yeast Secretion Trap) para confirmação biológica da predição de secreção realizada por ferramentas de bioinformática; (iii) analisar a estrutura genômica dos genes candidatos a efetores selecionados; (iv) efetuar a análise da expressão temporal dos genes identificados durante as diferentes fases da patogênese; (v) estabelecer um protocolo de expressão transiente de proteínas secretadas de H. vastatrix em folhas de cafeeiro, com base no Sistema de Secreção Tipo III de Pseudomonas syringae pv. garcae. Inicialmente, caracterizou-se o secretoma de urediniósporos germinados de H. vastatrix por meio da construção de uma biblioteca de cDNA a partir de mRNA isolado de urediniósporos germinados in vitro por 16 horas. Após análises das sequências por ferramentas de bioinformática, foram selecionadas 146 ORFs que codificam proteínas secretadas. Durante a anotação dessas sequências constatou-se que 20% do secretoma de urediniósporos germinados são constituídos por enzimas hidrolíticas e que a maioria (67%) das proteínas secretadas identificadas possui função desconhecida. A partir dessas sequências foram selecionadas 35 ORFs completas que codificam proteínas com características comuns aos efetores de fungos filamentosos, denominados genes candidatos a efetores de H. vastatrix (HvECs H. vastatrix effector candidates). Desses, 22 HvECs tiveram suas sequências genômicas caracterizadas, confirmando as ORFs preditas por bioinformática. A secreção de oito HvECs selecionados foi comprovada em levedura, e sua expressão diferenciada, que possivelmente ocorre com as mudanças morfológicas do desenvolvimento do patógeno nos estágios inicias de infecção, foi comprovada por meio RT-qPCR. Posteriormente, caracterizou-se o secretoma de H. vastatrix expresso durante uma interação compatível com o cafeeiro, por meio da combinação de sequenciamento Sanger e pirossequenciamento 454. Esta abordagem integrada permitiu o sequenciamento massivo de um substancial número de etiquetas de sequências expressas (ESTs) em folhas de café infectadas com H. vastatrix, amostradas em quatro tempos diferentes durante a fase biotrófica da interação: 48 horas, 72 horas, 9 dias e 12 dias após a inoculação. Após análises de bioinformática foram selecionados 75 genes e as análises de RT-PCR confirmaram a origem fúngica de 62 genes HvECs. Desses, 22 HvECs são preferencialmente expressos durante a interação com o cafeeiro, apresentando padrões distintos de expressão durante a fase biotrófica da interação. Adicionalmente, desenvolveu-se um protocolo de expressão transiente de proteínas secretadas de H. vastatrix em folhas de cafeeiro, por meio do sistema pEDV e do Sistema de Secreção Tipo III de P. syrigae pv. garcae. A expressão transiente do gene HvEC-016 no citoplasma de cafeeiros resistentes à ferrugem, portadores do gene SH1, desencadeou uma resposta de defesa das plantas, indicando que pode ter ocorrido o reconhecimento da proteína efetora HvEC-016 mediada pela proteína R codificada pelo gene SH1. Esse sistema de expressão transiente e o catálogo de genes candidatos a efetores de H. vastatrix expressos tanto durante a germinação dos urediniósporos como na interação com o cafeeiro, disponibilizados por esse estudo, constituem uma importante plataforma para a identificação de outros genes de avirulência de Hemileia vastatrix.

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