Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-13T13:36:22Z No. of bitstreams: 1 Hailson Alves Ferreira.pdf: 643394 bytes, checksum: 8f418500344c84ed57ff01ecd2383464 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-13T13:36:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hailson Alves Ferreira.pdf: 643394 bytes, checksum: 8f418500344c84ed57ff01ecd2383464 (MD5) Previous issue date: 2009-02-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Melon bacterial blotch caused by Acidovorax avenae subsp. citrulli (Aac) is responsible for substantial yield losses in Northeastern Brazil. The research aimed at two main objectives: 1) evaluating the effects of silicon doses on the melon bacterial blotch control as a function of soil characteristics, disease epidemiological components, plant nutrition and development, and direct effect on the pathogen; and 2) evaluating the enzyme activity in melons supplied with silicon either innoculated or non-innoculated by the pathogen. Calcium silicate was added to soil at the rates 0.00; 0.25; 0.50; 1.50 e 3.00 g kg-1 SiO2. After a 20-day incubation period soil samples were taken and melon seedlings (AF 4945) were transferd to soil. The folowing characteristcs were evaluated: incubation period, disease index, area below the progress curve of the disease, and incidence at 20 days after innoculation. Analysis of plant growth and development as well as nutrients accumulation were done in 45 days-old plants. The results demonstrated that the highest Si rate promoted significant alterations in soil chemical attributes and plant nutrition and development. This rate also reduced the disease index, the area below the progress curve of the disease and the incidence, hence increasing theincubation period and controling the bacterial blotch. Silicon did not inhibit the Acidovorax avenae growth in vitro. Total proteins and superoxide dismutase isoforms were induced by Si whereas activity of peroxidade, ascorbate peroxidase, quitinase, β-1,3 glucanase, and phenylalanine ammonia-lyase were not changed by silicon. / A mancha-aquosa do meloeiro, causada pela bactéria Acidovorax avenae subsp. citrulli (Aac) ocasiona consideráveis perdas a produção. Este trabalho objetivou (1) avaliar os efeitos de diferentes doses de silício (Si) no controle da mancha-aquosa do meloeiro analisando os atributos químicos do solo, os componentes epidemiológicos da doença, a nutrição e desenvolvimento da planta e o efeito direto sobre o patógeno; (2) avaliar a atividade enzimática em meloeiros suplementados ou não com Si, inoculados e não inoculados com o patógeno O silicato de cálcio foi incorporado ao solo nas doses de 0,00; 0,25; 0,50; 1,50 e 3,00 g kg-1 SiO2. Após 20 dias de incubação, realizou-se o transplantio de mudas de meloeiro híbrido amarelo AF 4945 e análises químicas do solo. Foram avaliados período de incubação, índice de doença, área abaixo da curva de progresso da doença e incidência aos 20 dias após inoculação. Avaliações de crescimento, desenvolvimento e acúmulo de nutrientes na planta foram realizadas após 45 dias de cultivo. A maior dose de SiO2 utilizada promoveu alterações significativas nos atributos químicos do solo, na nutrição e desenvolvimento da planta, e reduziusignificativamente o índice de doença, a área abaixo da curva de progresso da doença e a incidência, aumentando o período de incubação e controlando a mancha-aquosa. O silício não inibiu o crescimento de Aac in vitro. As proteínas solúveis totais e algumas isoformas da superóxido dismutase foram induzidas pela presença do Si, enquanto as peroxidase, peroxidase do ascorbato, quitinase, β-1,3 glucanase e fenilalanina amônia liase não foram influenciadas.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-13T15:35:27Z No. of bitstreams: 1 Janaina Cortez de Oliveira.pdf: 511674 bytes, checksum: 0e608fbee62310affc8c094a69725337 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-13T15:35:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Janaina Cortez de Oliveira.pdf: 511674 bytes, checksum: 0e608fbee62310affc8c094a69725337 (MD5) Previous issue date: 2006-02-03 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The fruit blotch caused by Acidovorax avenae subsp. citrulli is the main bacterial disease of melon (Cucumis melo) in the Northeast of Brazil. In this work 49 isolates of A. avenae subsp. citrulli were studied aiming: to investigate the production of enzymes (pectinolytic, amylolytic, cellulolytic, lipolytic and proteolytic), phytohormone (indoleacetic acid), polysaccharide (levan) and toxin (syringomycin) by isolates of A. avenae subsp. citrulli and; to characterize this population based upon disease severity on seedlings, plants and fruits of melon and watermelon (Citrullus lanatus), hypersensitivity in tobacco (Nicotiana tabacum), utilization of amino acids as carbon and energy sources, and in vitro sensitivity to copper and antibiotics. All isolates of A. avenae subsp. citrulli produced lipase and indoleacetic acid, and none showed pectinolytic, amylolytic, cellulolytic and proteolytic activity nor produced levan and syringomycin. All isolatesinduced typical symptoms of fruit blotch on seedlings, plants and fruits of melon and watermelon. The Scott-Knott test (P = 0.05) separated the isolates for disease index in 5 and 7 groups respectively for melon and watermelon seedlings and 2 groups for plants of these two hosts. In fruits all isolates were separated in 3 and 10 groups for the variable diameter of extern lesion and 2 and 9 groups for lesion depth, respectively for melon and watermelon. All isolates also induced hypersensitivity in tobacco; utilized the amino acids asparagine, L-leucine and DL-acid lactic; showed sensitivity to copper oxychloride (120 μg ml-1), cuprous oxide (120 μg ml-1), copper hydroxide (138.2 μg ml-1), streptomycin sulfate (25 μg ml-1) and Agrimaicin 500 (428 μg ml-1); and resistance to kasugamycin (87 μg ml-1), agrimicin (200 μg ml-1), erythromycin (15 μg), gentamicin (10 μg), amoxicilin (10 μg), neomycin (30 μg) streptomycin (10 μg), norfloxacin (10 μg)and rifampicin (5 μg). Variability was found among the 41 isolates in relation toand rifampicin (5 μg). Variability was found among the 41 isolates in relation to / A mancha-aquosa causada por Acidovorax avenae subsp. citrulli é a principal doença bacteriana do meloeiro (Cucumis melo) no Nordeste do Brasil. Neste trabalho, foram estudados 41 isolados de A. avenae subsp. citrulli com os objetivos de: investigar a produção de enzimas (pectinolíticas, amilolíticas, celulolíticas, lipolíticas e proteolíticas), fitohormônio (ácido indol acético), polissacarídeo (levana) e toxina (siringomicina) por isolados de A. avenae subsp. citrulli e; caracterizar essa população com base na severidade da doença em plântulas, plantas e frutos de meloeiro e melancieira (Citrullus lanatus), reação de hipersensibilidade em fumo (Nicotiana tabacum), utilização de aminoácidos como fonte de carbono e energia e sensibilidade in vitro a cúpricos e antibióticos. Todos os isolados de A. avenae subsp. citrulli produziram enzimas lipolíticas e ácido indol acético, e nenhum apresentou atividade pectinolítica, amilolítica, celulolíticas e proteolítica ou produção do polissacarídeo levana e da toxina siringomicina. Em plântulas, plantas efrutos, todos os isolados induziram sintomas típicos da mancha-aquosa em meloeiro e melancieira. Pelo teste de agrupamento de Scott-Knott (P = 0,05) os isolados foram separados quanto ao índice de doença em 5 e 7 grupos, respectivamente para plântulas meloeiro e melancieira, e em 2 grupos para plantas das duas hospedeiras. Em frutos, os isolados foram separados em 3 e 10 grupos para a variável diâmetro da lesão externa e 2 e 9 grupos para profundidade da lesão, respectivamente para meloeiro e melancieira. Todos os isolados também induziram reação de hipersensibilidade em fumo; utilizaram os aminoácidos asparagina, L-leucina e DL-ácido lático; foram sensíveis a oxicloreto de cobre (120 μg ml-1), óxido cuproso (120 μg ml-1), hidróxido de cobre (138,2 μg ml-1), sulfato de estreptomicina (25 μg ml-1) e Agrimaicin® 500 (428 μg ml-1); e resistentes a kasugamicina(87 μg ml-1), agrimicina (200 μg ml-1), eritromicina (15 μg), gentamicina (10 μg),amoxicilina (10 μg), neomicina (30 μg), estreptomicina (10 μg), norfloxacina (10 μg) e rifampicina (5 μg). Foi constatada variabilidade entre os 41 isolados de A. avenae subsp. citrulli quanto a sensibilidade à tetraciclina (30 μg), sendo 41,5% resistentes, 46,32% moderadamente sensíveis e 12,2% altamente sensíveis

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T12:33:28Z No. of bitstreams: 1 Jeane Emili de Medeiros.pdf: 394630 bytes, checksum: 1eb59fc3e8a4ae913b395a21c71fbe51 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T12:33:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jeane Emili de Medeiros.pdf: 394630 bytes, checksum: 1eb59fc3e8a4ae913b395a21c71fbe51 (MD5) Previous issue date: 2007-02-26 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The objective of this work was to isolate and select bacteria for the control of Meloidogyne incognita and to evaluate the isozymatic activity of melon plants parasitized. Sixty-one rhizobacterium isolates obtained from rhizosphere soil and 56 endophytic obtained from the Culture Collection of Plant Bacteriology Laboratory - Federal Rural University of Pernambuco were tested. Melon seedlings yellow type 10 days old had their soil infested with 1000 eggs of Meloidogyne incognita race 2. Two days before soil infestation 20 mL of bacterial suspension (0,7 OD) were deposited in each pot. After 60 days fresh biomass of shoot and root , gall index, egg mass index and nematode reproduction factor were determined. Among 117 isolates the endophytic ENM7, ENM10 and ENM51 were selected because they significantly reduced egg mass index and/or gall index. However when tested again, separately or in mixtures, these isolates did not maintain their efficiency and besides they did not affect egg hatching in vitro. In order to study the activity of the isozymes α and β-esterase, peroxidase, acid phosphatase and malate dehydrogenase, plants of melon with 10 days old, had their soil infested with 500 nematode eggs per plant, and maintained in greenhouse. At 2, 4, 6, 8, 16, 24 e 32 days after soil infestation the third leaf of each plant was collected and processed for electrophoresis of isozymes in polyacrilamide gel. Only β-esterase and malate dehydrogenase showed polymorphism between bands expressed by plants parasitized by nematodes when compared to the control plants. The nematode inhibited the expression of some β-esterase genes and activated the expression of other malate dehydrogenase genes. / O objetivo dessa pesquisa foi isolar e selecionar bactérias para o controle da meloidoginose e avaliar a atividade isoenzimática de plantas de meloeiro parasitadas por Meloidogyne incognita raça 2. A partir de solo rizosférico de meloeiro foram obtidos 61 isolados de rizobactérias que juntamente com 56 isolados endofíticos pertencentes à Coleção de Culturas do Laboratório de Fitobacteriologia da UFRPE foram testados. Plântulas de meloeiro Amarelo com 10 dias tiveram o solo infestado com 1000 ovos de M. incognita raça 2. Dois dias antes da infestação do solo foram depositados 20 mL da suspensão bacteriana (0,7 A) por vaso. Decorridos 60 dias, foram determinadas as biomassas frescas da parte aérea e das raízes, os índices de galhas e de massa de ovos e o fator de reprodução do nematóide. Dos 117 isolados testados, foram selecionados inicialmente os endofíticos ENM7, ENM10 e ENM51 que reduziram significativamente o índice de massa de ovos e/ou o índice de galhas. Contudo, quando testados novamente, separadamente ou em misturas, esses isolados não mantiveram a eficiência na redução dessas variáveis e in vitro também não afetaram a eclosão dos juvenis. Para o estudo da atividade das isoenzimas α e β-esterase, peroxidase, fosfatase ácida e malato desidrogenase, plantas de meloeiro com dez dias de idade, tiveram o solo infestado com 500 ovos do nematóide por planta, sendo mantidas em casa de vegetação. Aos 2, 4, 6, 8, 16, 24 e 32 dias após a infestação do solo a terceira folha das plantas foi coletada e submetida à eletroforese de isoenzimas em gel de poliacrilamida. Apenas a β-esterase e a malato desidrogenase mostraram polimorfismo entre as bandas expressas pelas amostras das plantas parasitadas por nematóides, quando comparadas às plantas testemunhas. A presença do nematóide inibiu a expressão de alguns genes β-esterase e ativou a expressão de outros da malato desidrogenase.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T12:51:13Z No. of bitstreams: 1 Jeferson Araujo Silva.pdf: 166823 bytes, checksum: 6c389068c6abcff8459db563807d3eb8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T12:51:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jeferson Araujo Silva.pdf: 166823 bytes, checksum: 6c389068c6abcff8459db563807d3eb8 (MD5) Previous issue date: 2011-02-22 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The collar rot caused by Sclerotium rolfsii, is an important disease that causes an incidence in lima bean (Phaseolus lunatus L.) at the Northeastern of Brazil. Aiming to select genotypes with potential to be used in a disease management, there were 50 genotypes of lima bean evaluated in relation to an isolate of S. rolfsii. Plants with 10 days old were inoculated by an injury into their base and deposited the sclerotia of the pathogen. The evaluation occurred at the 10th day after the inoculating, by calculating the percentage of the number of plants with symptoms in relation to the total of plants per pot. Most part of the genotypes (58%) behaved as highly susceptible to the pathogen while 28% were classified as susceptible, 10% as moderately resistant. Only two genotypes (F-2 and F-25) behaved as extremely resistant, corresponding to 4% of the total. The stability of resistance of these two genotypes was evaluated in relation to 10 isolates of S. rolfsii. Both genotypes showed a good level of resistance, thus demonstrating the potential of its use as a strategy for management of collar rot of the lima bean crop. / A podridão do colo, causada por Sclerotium rolfsii, é uma importante doença que pode incidir em fava (Phaseolus lunatus L.) no Nordeste brasileiro. Visando selecionar genótipos com potencial de utilização no manejo da doença, foram avaliados 50 genótipos de fava, em relação a um isolado de S. rolfsii. Plantas com 10 dias de idade foram inoculadas pelo método de ferimento do colo e deposição do escleródio do patógeno. A avaliação ocorreu aos 10 dias após a inoculação pela mensuração da incidência da doença, considerando a porcentagem de plantas com sintomas em relação ao total de plantas por vaso. A maioria dos genótipos (58%) se comportou como altamente suscetível ao patógeno, enquanto que 28% foram classificadas como suscetíveis e 10% como medianamente resistentes. Somente dois genótipos (F-2 e F-25) se comportaram como altamente resistentes, correspondendo a 4% do total. A estabilidade da resistência destes dois genótipos foi avaliada em relação a 10 isolados de S. rolfsii. Ambos os genótipos apresentaram um bom nível de resistência, demonstrando potencial de utilização como estratégia de manejo da podridão do colo na cultura da fava.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T15:38:58Z No. of bitstreams: 1 Katia Cilene da Silva Felix (1).pdf: 376089 bytes, checksum: 45b421012fb39c4ea534d1182006970e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T15:38:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Katia Cilene da Silva Felix (1).pdf: 376089 bytes, checksum: 45b421012fb39c4ea534d1182006970e (MD5) Previous issue date: 2009-02-18 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Bacterial wilt caused by Ralstonia solanacearum, race 1, biovars 1 and 3 causes severe damage to pepper growth in Agreste region of state of Pernambuco in Brazil. The pathogen survival in infected tissues of stem and roots incorporated to the soil at 0, 5 and 15 cm; and at 10 different soil types of Pernambuco without host plant was studied by using a spontaneous mutant resistant to 100 mg l-1 of rifampicin (R. solanacearum A1-9Rif). Pathogen survival only showed difference (P<0.05) in relation to vegetal tissue. Pepper root tissues showed higher survival duration (DUR) (17.1 d), area under population curve (AACPOP) (430x104) and population at 7 (POP7) (5.0x104 UFC g-1 tissue) and 21 days (POP21) (3.1x104 UFC g-1 tissue) than stem tissues, which were respectively, 7.0 d; 3.8 x104; 0.35 and 3.1x104 UFC g-1 tissue. On the other hand stem tissues presented higher decomposition index (81.3%) and pH (7.7) than root tissues, respectively 68.9% and 6.8. The previous soil microbiological analysis did not finddifferences among populations of actinomycetes, copiotrophic, bacteria, total bacteria and total fungi respectively 5.02; 3.63; 5.23 and 4.19 log UFC g-1 dry soil. Populations of oligotrophyc bacteria, Bacillus spp., fluorescent Pseudomonas spp. and Trichoderma spp. were not detected. The pathogen was isolated from the soil adjacent to infected tissues of stem and roots at the three depths six weeks after experiment establishment. The analysis of AACPOP in relation to locals (counties) of soil sampling, type of soil coverage at the sampling time and soil texture was not significant by Kruskal-Wallis test (P≤0.05). Among the 10 studied soils, seven were classified as suppressive showing low intervals of DUR (42 to 49 days), AACPOP (0.77 to 4.05), POP14 (5.59 to 6.18 log UFC g-1 soil) and POP42 (5.44 to 6.31 log UFC g-1 soil). The soils S3, S4 and S6 were evaluated as conducive. Considering all soils together or only the suppressive, DUR,AACPOP and POP42 only showed significant correlation with soil physical and chemical characteristics, positive for clay, residual humidity and useful water and negative for pH. The population of copiotrophic bacteria, actinomycetes, total bacteria, total fungi (Fusarium spp., Aspergillus spp., Penicillium spp. and Rhizopus spp. were identified) and Bacillus spp. did not differ among the 10 soil types. / A murcha-bacteriana do pimentão é causada por Ralstonia solanacearum, raça 1, biovares 1 e 3 e causa grandes prejuízos à cultura desta solanácea. Este trabalho teve por objetivo estudar a sobrevivência do patógeno em tecidos infectados de caule e raiz incorporados ao solo às profundidades de 0, 5 e 15 cm; e em 10 diferentes tipos de solo na ausência da planta hospedeira. Foi utilizado um mutante resistente a 100 mg l-1 de rifampicina (R. solanacearum A1-9Rif). A sobrevivência do patógeno diferiu significativamente (P<0,05) apenas em relação aos tecidos vegetais analisados isoladamente. Desta forma, tecidos de raiz de pimentão apresentaram maior duração da sobrevivência (17,1 d), área abaixo da curva da população (AACPOP) (430x104) e população aos 7 (POP7) (5,0 x 104 UFC g-1 tecido) e 21 dias (POP21) (3,1 x 104 UFC g- 1 tecido) que os de caule, que foram respectivamente, 7,0 d; 3,8; 0,35 x104 e 0,48 x 104UFC g-1 tecido. Por outro lado, os tecidos do caule apresentaram maior índice de decomposição (81,3%) e pH (7,7) do que os de raízes, respectivamente 68,9% e 6,8. A análise microbiológica prévia deste solo não evidenciou diferenças significativas entre as populações de actinomicetos, bactérias copiotróficas, bactérias totais e fungos totais, que foram de 5,02; 3,63; 5,23 e 4,19 log UFC g-1 solo seco, respectivamente. Não foram encontradas populações de bactérias oligotróficas, Bacillus spp., Pseudomonas spp. fluorescentes, e Trichoderma spp. Entre os 10 tipos de solos estudados, sete foram classificados como supressivos por apresentarem baixas duração da sobrevivência (42 a 49 dias), AACPOP (0,77 a 4,05), POP14 (5,59 a 6,18 log UFC g-1 solo) e POP42 (5,44 a 6,31 log UFC g-1 solo). Os solos S3, S4 e S6 foram avaliados como conducivos. Neste estudo, apenas algumas características físicas e químicas apresentaram correlaçãosignificativa com duração da sobrevivência, AACPOP e POP42, considerando todos ossolos em conjunto ou apenas os supressivos, destacando-se argila, umidade residual e água disponível que apresentaram correlação positiva e o pH com correlação negativa.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T16:51:26Z No. of bitstreams: 1 Leonardo Tavares de Souza (1).pdf: 547012 bytes, checksum: 3ce24d8a338d375481b7eaa6393560c4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T16:51:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Leonardo Tavares de Souza (1).pdf: 547012 bytes, checksum: 3ce24d8a338d375481b7eaa6393560c4 (MD5) Previous issue date: 2009-02-18 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, is an important disease of tomato (Solanum lycopersicon L.) in Northeastern Brazil. Order to select genotypes with potential for use in the disease management, 60 strains were evaluated (F7 generation) from the crossing of access BHRS-2, 3 and Viradoro cultivar in relation to isolates from the physiologic races 2 and 3 of F. oxysporum f. sp. lycopersici. Seedlings 21 days old were inoculated using the method of cutting the roots and soak in the suspension of conidia of the pathogen. The evaluation was performed after 21 days, with the scale of grades ranging from 1 to 5. The genotypes were grouped into five classes of reaction. Most genotypes (73.3%) behaved as highly resistant to the race 2 isolate, while 45.0% were classified as susceptible and 28.3% as highly susceptible to the race 3 isolate. Only the L-1 strain showed high resistance reaction to both isolates. The stability of this line of resistance was evaluated on five isolates ofeach race (2 and 3). The line L-1 showed high levels of resistance to all race 2 isolates, therefore indicating high stability of resistance. However, for race 3 isolates, this strain showed three distinct classes of reaction, ranging from highly resistant to susceptible, indicating instability of resistance to this race. / A murcha-de-fusário, causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, é uma importante doença do tomateiro (Solanum lycopersicon L.) no Nordeste brasileiro. Visando selecionar genótipos com potencial de utilização no manejo da doença, foram avaliadas 60 linhagens (geração F7) oriundas do cruzamento entre o acesso BHRS-2,3 e a cultivar Viradoro, em relação a isolados das raças fisiológicas 2 e 3 de F. oxysporum f. sp. lycopersici. Mudas com 21 dias de idade foram inoculadas pelo método do corte de raízes e imersão na suspensão de conídios do patógeno. A avaliação foi realizada após 21 dias, com o auxílio de escala de notas de 1 a 5, para agrupamento dos genótipos em cinco classes de reação. A maioria dos genótipos (73,3%) se comportou como altamente resistente ao isolado da raça 2, enquanto 45,0% foram classificados como suscetíveis e 28,3% como altamente suscetíveis ao isolado da raça 3. Somente a linhagem L-1 apresentou reação de alta resistência aos dois isolados de ambas as raças. A estabilidade da resistência dessa linhagem foi avaliada em relação a cinco isolados de cada raça (2 e 3) do patógeno. A linhagem L-1 apresentou reação de alta resistência a todos os isolados da raça 2, evidenciado estabilidade da resistência. No entanto, em relação aosisolados da raça 3, essa linhagem apresentou três classes de reação distintas, variando de altamente resistente a suscetível, indicando instabilidade da resistência à essa raça.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-16T13:22:52Z No. of bitstreams: 1 Edilaine Alves de Melo.pdf: 641010 bytes, checksum: 2a8032c2676a99782e8fd581d977a950 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-16T13:22:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Edilaine Alves de Melo.pdf: 641010 bytes, checksum: 2a8032c2676a99782e8fd581d977a950 (MD5) Previous issue date: 2012-07-27 / The bacterial fruit blotch caused by Acidovorax citrulli is one of the most severe diseases of melon (Cucumis melo), and a major problem in the Northeast, the main melon producing region of Brazil. Strategies for control of bacterial blotch include chemical and physical treatments of seeds and chemical sprays of the plant canopy. Since these treatments are not efficient and resistant melon cultivars do not exist, other strategies have been studied, including biological control. Our objectives were to analyze the efficiency of yeasts in the biocontrol of this disease by protecting seedlings and plants, and by treating melon seeds; and to verify the in vitro activity against the pathogen and the growth promotion of melon plants. None of the 60 yeasts inhibited the growth of the pathogen, but the isolates LMA1 (Rhodotorula aurantiaca), LMS (R. glutinis) and CC-2 (Pichia anomala) stood out as the most effective in protecting seedlings. When tested in plants and seeds, LMA1 and CC-2 maintained effectiveness. In plants, the reductions in disease index (ID) and area under the disease progress curve (AUDPC) compared to the control reach 58.6 and 47.2%, respectively, while seed treatments reduced ID and AUDPC up to 34.3 and 45.5%. These isolates did not promote the growth of melon plants and did not produce killer toxins in vitro. R. aurantiaca (LMA1) and P. anomala (CC-2) were effective in protecting plants and seedlings and for seed treatment of melon. Therefore, the use of these yeasts jointly with other control methods, such as resistant varieties and copper compounds, is important in integrated management of bacterial fruit blotch. / A mancha aquosa causada por Acidovorax citrulli, é uma das doenças mais severas do meloeiro (Cucumis melo) e um dos principais problemas para o Nordeste, a principal região produtora de melão do Brasil. Estratégias para o controle da mancha aquosa incluem tratamentos químicos e físicos das sementes e químico da parte aérea da planta. Uma vez que esses tratamentos não são eficientes e cultivares resistentes de meloeiro inexistem, outras estratégias têm sido investigadas, dentre elas o controle biológico. Os objetivos deste trabalho foram analisar a eficiência de leveduras no biocontrole dessa doença pela proteção de plântulas e plantas e pelo tratamento de sementes de meloeiro, além de verificar a atividade in vitro contra o patógeno e a promoção do crescimento de plantas de meloeiro. Nenhuma das 60 leveduras testadas inibiu o crescimento do patógeno, porém os isolados LMA1 (Rhodotorula aurantiaca), LMS (R. glutinis) e CC-2 (Pichia anomala) destacaram-se como os mais eficientes na proteção de plântulas. Quando testadas em plantas e sementes, LMA1 e CC-2 mantiveram a eficácia. Em plantas, as reduções de índice de doença (ID) e área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD) em relação à testemunha foram de até 58,6 e 47,2%, respectivamente, enquanto que o tratamento de sementes reduziu o ID e AACPD em até 34,3 e 45,5%. Esses isolados não promoveram o crescimento do meloeiro e não produziram toxinas killer in vitro. R. aurantiaca (LMA1) e P. anomala (CC-2) foram eficazes na proteção de plântulas e plantas e no tratamento de sementes de meloeiro. Portanto, a utilização dessas leveduras junto a outros métodos de controle, tais como cultivares resistentes e utilização de compostos cúpricos, será importante no manejo integrado da mancha aquosa.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-16T14:38:17Z No. of bitstreams: 1 Elineide Barbosa de Souza.pdf: 390725 bytes, checksum: 343f1ce1b17f2c507a8bc4587f0077ac (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-16T14:38:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Elineide Barbosa de Souza.pdf: 390725 bytes, checksum: 343f1ce1b17f2c507a8bc4587f0077ac (MD5) Previous issue date: 2002-06-28 / The variability of 20 Acidovorax avenae subsp. citrulli isolates in relation to melon fruit blotch components, hypersensitive reaction, and the bacterial transmission by seeds from inoculated fruits were studied. The influence of duration (0, 6, 24 and 48 h), the onset of leaf wetness period (0, 6, 24 and 48 h after inoculation), and inoculum concentration of A. avenae subsp. citrulli (3.4 x 101 to 3.4 x 107 CFU mL-1) on severity of fruit blotch in melon plants were also evaluated. The effects of temperature (15, 20, 25, 30, 35 and 40° C), humidity (0 and 6 h of moist chamber), inoculum concentration (3.4 x 101 to 3.4 x 107 CFU mL-1) and fruit age (40, 50, 60 and 70 days) on the development of melon fruit blotch were also verified. Seeds, plants and fruits were inoculated through vacuum infiltration, atomization and sub-epidermal injection, respectively. Seedlings and plants were assessed in relation to incubation period, diseaseindex, area under disease progress curve and disease progress rate; incubation period, diameter of external lesion and lesion depth were assessed on the fruits. The data were submitted to mean comparison tests, clustering tests or regression analysis. The Euclidian distance–single linkage confirmed the variability among the A. avenae subsp. citrulli strains allowing their separation in four similarity groups. Seed transmission ranged from 30 to 64 % and all strains induced hypersensitive reaction on tobacco and tomato leaves. The regression equations for the analyzed variables in melon plants were better adjusted by the quadratic or logarithmic models. The incubation period ranged from 1.3 to 2.7 days and was higher in plants without leaf wetness, although the disease index and area under disease progress curve increased as the duration of leaf wetness increased. The beginning of the leaf wetness period at 48 h after inoculation elevatedthe incubation period and disease progress rate in relation to the other periods. The disease progress rate, disease index and area under disease progress curve increased as the inoculum concentration increases, reaching maximum values of 4.4 infection units/day, 73.7 % and 18.9 at 3.4 x 107 UFC mL-1, respectively, at 3.4 x 101 CFU mL-1. The temperature and humidity influenced significantly (P=0,05) the severity of melon fruit blotch, however, the incubation period was not affected. The larger external lesions were observed in the fruits incubated at 35 and 30° C without moist chamber, and at 30° C in moist chamber for six h. In relation to lesion depth, those lesions in fruits incubated without moist chamber were deeper at 25 and 30° C. However, with moist chamber the lesions at 30° C were deeper than the others. No disease symptoms were observed onfruits incubated at 15 and 20° C. The humidity significantly (P=0,05) influenced the development of external lesions and lesions depth at 35 and 25° C, respectively. The diameter and depth of lesions increased as the inoculum concentration was higher and were reduced as the fruit age increased. No external or internal lesions were detected on fruits with 60 and 70 days inoculated with the pathogen at 3.4 x 101 CFU mL-1. / Foi estudada a variabilidade de 20 isolados de Acidovorax avenae subsp. citrulli quanto aos componentes da mancha-aquosa do melão e reação de hipersensibilidade, e analisada a transmissão da bactéria pelas sementes dos frutos inoculados. Foi também avaliada a influência da duração (0, 6, 24 e 48 horas) e início do período de molhamento foliar (0, 6, 24 e 48 horas após a inoculação), bem como da concentração de inóculo de A. avenae subsp. citrulli (3,4 x 101 a 3,4 x 107 UFC mL-1) na severidade da mancha-aquosa em meloeiro. A influência da temperatura (15, 20, 25, 30, 35 e 40° C), da umidade (0 e 6 horas de câmara úmida), da concentração de inóculo ( 3,4 x 101 a 3,4 x 107 UFC mL-1) e da idade do fruto (40, 50, 60 e 70 dias) no desenvolvimento da mancha-aquosa em melão, foram ainda verificadas. Sementes, plantas e frutos foram inoculados pelos métodos de infiltração a vácuo, pulverização e injeção subepidérmica, respectivamente. Plântulas e plantas foram avaliadas quanto ao período de incubação,índice de doença, área abaixo da curva do progresso da doença e taxa de progresso da doença, e os frutos, quanto ao período de incubação, diâmetro da lesão externa e profundidade da lesão. Os dados obtidos foram submetidos a testes de comparação de médias, testes de agrupamento ou análises de regressão. A análise da distância Euclidiana por ligações simples, confirmou a variabilidade entre os isolados de A. avenae subsp. citrulli, permitindo a separação destes em quatro grupos de similaridade. A transmissão da bactéria por sementes variou de 30 a 64 % e todos os isolados induziram reação de hipersensibilidade em folhas de fumo e tomate. As equações de regressão para as variáveis analisadas em meloeiros foram melhor ajustadas pelos modelos quadrático ou logarítmico. O período de incubação variou de 1,3 a 2,7 dias, emaior nas plantas sem molhamento foliar, contudo o índice de doença e a área abaixo da curva de progresso da doença aumentaram com o incremento da duração do molhamento foliar. O início do período de molhamento foliar às 48 horas após a inoculação elevou o período de incubação e a taxa de progresso da doença em relação aos demais períodos. O incremento da concentração de inóculo elevou a taxa de progresso da doença, índice de doença e área abaixo da curva de progresso da doença, os quais atingiram valores máximos de 4,4 unidades de infecção/dia, 73,7 % e 18,9, respectivamente, na concentração 3,4 x 107 UFC mL-1. A temperatura e umidade influenciaram significativamente a severidade da mancha-aquosa nos frutos, embora o período de incubação não tenha sido afetado. As maiores lesões externas foram observadas em frutos incubados a 35 e 30 ° C sem câmara úmida, e a 30° C em câmaraúmida por seis horas. Com relação à profundidade, as lesões nos frutos incubados sem câmara úmida foram maiores às temperaturas de 25 e 30° C. Em câmara úmida, as lesões a 30° C foram maiores que as demais. Não foi observado desenvolvimento da mancha-aquosa em frutos incubados a 15 e 20° C. A umidade influenciou significativamente (P=0,05) o diâmetro e profundidade da lesão, exceto às temperaturas de 35 e 25° C, respectivamente. O diâmetro e profundidade das lesões aumentaram com a elevação da concentração de inóculo e foram reduzidos com o aumento da idade do fruto. Na concentração 3,4 x 101 UFC mL-1 não foi observada a presença de sintomas da doença na casca e na polp

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-17T12:25:45Z No. of bitstreams: 1 Genira Pereira de Andrade.pdf: 531734 bytes, checksum: 9dc28c82bfccaa852aa4dbc98b012e2d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T12:25:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Genira Pereira de Andrade.pdf: 531734 bytes, checksum: 9dc28c82bfccaa852aa4dbc98b012e2d (MD5) Previous issue date: 2007-03-20 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The yam (Dioscorea spp.) is affected by several diseases and pests occurring in field and/or during transport and storage. It is a crop with a high social economic importance in Northeast of Brazil, showing a good expansion potential by tuber export, especially to Europe. An evaluation of disease and pest development in important producing areas was undertaken, as well as a study on the quality of tuber seed used by the growers. Visits to seven counties of Pernambuco and three of Paraíba, totaling 30 farms were done. In order to evaluate the occurrence of diseases and the damages caused by pests under field conditions, in each field five lines of 10 plants were marked, while for virus evaluation, 30 plants were randomly selected. The plants were analyzed 30 days before and at the harvest day. The nematodes were extracted by association the Jenkins method and identified by their structures under light microscope. For fungus identification, isolation and inoculation were doneand the structures were observed under light microscope. For the viruses, observation under electron microscopy, triple antibody sandwich enzyme-linked immunosorbent assay” (TAS-ELISA), with polyclonal and monoclonal antibodies specific to Yam mosaic virus (YMV), from IITA, Nigeria, and a polymerase chain reaction (PCR) with degenerated primers for detecting badnavirus and duplex reverse transcription (RT-PCR) with specific primers to YMV and Yam mild mosaic virus (YMMV) were used. The PCR and RT-PCR products were purified and sequenced in order to validate the tests used for detecting badnavirus andidentification of the potyviruses by the comparative analyses of the sequences available in the GenBank. It was observed the leaf spot caused by Curvularia eragrostidis in all areas studied, with a higher intensity on cv. Inhame-da-Costa of D. cayennensis-D. rotundata complex, whereas the damages caused by leaf wor (Pseudoplusia oo), present in all fields, were higher on cv. São Tomé of D. alata plants. The seed tubers of both yam species, collected in five farms representative of the growing areas of Pernambuco and Paraíba, after 60 days of storage, presented serious problems of green rot caused by Penicilium sclerotigenum, mealybugs (Planoccocus sp.) and tuber worms (Araecerus fasciculatus). It was identified the potyviruses YMV and YMMV, occurring in single and mixed infections with badnavirus, consisting the first detailed report with molecular information on theseviruses in Brazil. / O inhame (Dioscorea spp.) tem sido afetado por a vários problemas fitossanitários, que se manifestam na lavoura e durante o transporte e/ou armazenamento. É uma cultura de elevada importância sócio-econômica para a região Nordeste do Brasil, inclusive com potencial de expansão via exportação de túberas, especialmente para a Europa. Foi efetuada uma avaliação do desenvolvimento de doenças e pragas em importantes áreas produtoras, bem como um estudo da qualidade do material de propagação utilizado pelos produtores. Foram visitados sete municípios de Pernambuco e três da Paraíba, totalizando 30 propriedades. Para avaliação da ocorrência das doenças da parte aérea e danos causados por lagarta, foram marcadas em cada campo, 5 fileiras de 10 plantas e mais 30 plantas, escolhidas aleatoriamente, para análise de viroses, as quais foram avaliadas um mês antes e no período da colheita. Para extração dos nematóides foi usado método de centrifugação rápida associadoao de Jenkins, os quais foram identificados por suas estruturas observadas ao microscópio ótico. Os fungos detectados foram isolados e identificados e observando-se suas estruturas reprodutivas. Para identificação dos vírus foram efetuadas observações ao microscópio eletrônico de transmissão, teste “triple antibody sandwich enzyme-linked immunosorbent assay” (TAS-ELISA), com anti-corpos policlonais e monoclonais específicos para Yam mosaic virus (YMV), obtidos do IITA, Nigéria e reaçaão de PCR (“polimerase chain reaction”) com oligonucleotídeos degenerados paradetecção de badnavírus e duplex reverse transcription (RT)-PCR com oligonucleotídeos específicos para YMV e Yam mild mosaic virus (YMMV). Os produtos de PCR e RT-PCR foram purificados e seqüenciados para validação dos testes usados na detecção de badnavírus e identificação dos potyvírus, por análise comparativa com as seqüências disponíveis no GenBank. Ficou comprovada a ocorrência de pinta preta, causada por Curvularia eragrostidis em todas as áreas estudadas, com maior intensidade na cv. Inhame-da-Costa do complexo D. cayennensis-D. rotundata, enquanto que o ataque de lagarta das folhas (Pseudoplusia oo), presente em todos os campos, teve maior severidade na cv. São Tomé de D. alata. As túberas-semente de ambas as espécies de inhame, coletadas em cinco propriedades representativas das áreas de cultivo em Pernambuco eParaíba, após 60 dias de armazenamento, apresentaram sérios problemas de Podridão Verde, causada por Penicillium sclerotigenum, cochonilhas (Planoccocus sp.) e brocas das túberas (Araecerus fasciculatus). Foram identificados os potyvírus YMV e YMMV, ocorrendo em infecção simples e mista com badnavírus, constituindose o primeiro registro detalhado com informações moleculares destes vírus no Brasil.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-17T13:55:35Z No. of bitstreams: 1 Isadora Fernandes de Franca.pdf: 1420687 bytes, checksum: 6cec52a0fb3778ca5533af6c71262265 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T13:55:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Isadora Fernandes de Franca.pdf: 1420687 bytes, checksum: 6cec52a0fb3778ca5533af6c71262265 (MD5) Previous issue date: 2011-02-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The yam (Dioscorea spp.) has great social importance for the Northeast region of Brazil, due to the excellent nutritional quality and energy of their tubers and very useful for human alimentation. Leaf-spots on white yam, caused by the fungus Curvularia eragrostidis, is responsible for damage to yam in northeast Brazil, mainly in the states of Paraíba and Pernambuco. The aim of this study was to analyze the population structure of isolates of C. eragrostidis pathogenic to yam, D. cayennensis, in the states of Alagoas, Pernambuco and Paraiba, and to study the phylogenetic relationships of these with other species in the genus Cochliobolus. In the first study, 151 isolates were obtained from leaves of yam, which were analyzed the sequences of part of the ITS region and -tubulin gene and gpd and the profiles of DNA with ISSR. It was observed that the DNA sequences had no variation, and ISSR data showed the presence of six haplotypes. The pathogen population is characterized by low genotypic diversity, predominance of one or two genotypes evenly distributed, the predominance of asexual reproduction, and the presence of genotypic flow between the regions of cultivation. In the second study, it was conducted phylogenetic analysis sequences of 81 isolates of species of the family Pleosporaceae using the methods of maximum likelihood and Bayesian inference. The 16 isolates of C. eragrostidis from yam analyzed are related to the genus Cochliobolus species which has smaller conidia and they are phylogenetically closer to the species C. clavata, C. brachyspora, C. oryzae and C. intermedia. / A cultura do inhame (Dioscorea spp.) apresenta grande importância socioeconômica para a região Nordeste do Brasil, devido à excelente qualidade nutritiva e energética de suas túberas e a utilidade para a alimentação humana. A queima das folhas, conhecida também como pinta preta, causada pelo fungo Curvularia eragrostidis, é responsável por grandes prejuízos à cultura do inhame no Nordeste brasileiro, principalmente nos Estados da Paraíba e Pernambuco, que são os maiores produtores. Este trabalho teve como objetivos analisar a estrutura populacional de isolados de C. eragrostidis patogênicos ao inhame, D. cayennensis, nos estados de Alagoas, Pernambuco e Paraíba, bem como estudar as relações filogenéticas destes com as demais espécies do gênero Cochliobolus. No primeiro estudo, foram obtidos 151 isolados, dos quais foram analisados as sequências de parte da região ITS, e dos genes -tubulina e gpd e os perfis de DNA com marcadores ISSR. Observou-se que as sequências de DNA não apresentaram variabilidade, e os dados de ISSR mostraram a presença de seis haplótipos. A população do patógeno é caracterizada por baixa diversidade genotípica, predominância de um ou dois genótipos uniformemente distribuídos, predominância de reprodução assexual, presença de fluxo genotípico entre as regiões de cultivo. No segundo estudo, foram realizadas analises filogenéticas de sequências de 81 isolados de espécies da família Pleosporaceae, através dos métodos de máxima verossimilhança e inferência bayesiana. Os 16 isolados de C. eragrostidis de inhame analisados estão relacionados com espécies do gênero Cochliobolus que apresentam conídios menores e mais próximos filogeneticamente de C. clavata, C. brachyspora, C. oryzae e C. intermedia.