Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-23T16:00:00Z No. of bitstreams: 1 Waleria Guerreiro Lima.pdf: 1037853 bytes, checksum: 76b8dc4974744a728c0fae8cae99709c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-23T16:00:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Waleria Guerreiro Lima.pdf: 1037853 bytes, checksum: 76b8dc4974744a728c0fae8cae99709c (MD5) Previous issue date: 2007-02-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Colletotrichum gossypii South. var. cephalosporioides Costa is the causal agent of one of the most important cotton diseases, the ramulosis. The disease is characterized by necrotic lesions on leaves and petioles mainly on young leaves. As the disease progresses, shortening of the internódios, apical death and overbudding are also observed. The main way of fungal dissemination is through the seeds, but also able to be externally propagated, in the form of conidia, or internally, by dormant mycelia. The pathogen control has been achieved through the use of healthy seeds, use of resistant cultivars and chemical control. However, some of these control practices not only of limited efficiency, but also cause unwanted side in natural environments. The use of the biological activity of secondary compounds obtained from plant crude extracts and their essential oils can be an effective way to control plant diseases. Preliminary tests toevaluate the fungistatic and fungicidal effect of these products are essential for revealing new alternatives of control. The effect of different oil dosages (0, 500, 1000, 1500, 2000 and 2500 ppm) prepared from leaves of Hibiscus cannabinus, Cymbopogus nardus, Eucalptus citriodora, Pipper marginatum, Malpighia glabra, and Lippia gracillis were evaluated in the inhibition of C. gossypii var. cephalosporioides mycelia growth, conidia germination, and apressorium formation. The oils of Pipper marginatum, Lippia gracillis and Cymbopogus nardus presented the greatest mycelia growth inhibition effects. The oils of citronela, lípia, and eucalipto showed significant control when conidial germination and apressorium formation were analyzed. When the mycelia growth inhibition was evaluated, piper oil presented lower DL50, followed by the lípia oil. The best results in the inhibition of apressorium formation were presented bycitronela and eucalipto with lower DL50 in relation to other oils. The kenaf oil did notpresent any effect on the micelial growth, conidial germination and apressorium formation. In a second experiment it was evaluated the curative and preventive effect of citronela oil on the control of the cotton ramulosis based on epidemiological components. The Area Below the Curve of Disease Progress and Rate of Disease Progress, showed significant differences when compared with the control treatment. However, the parameter Index of Disease Final in the curative treatment did not differ significantly from control treatment. When the variables Area Below the Curve of Disease Progress, Index of Disease Final, and Rate of Disease Progress were analyzed, it was observed that the preventive treatments that used citronela oil and fungicide differed significantly from the control, showing that citronela oil had an excellent preventive effect on the cotton ramulosis under greenhouse conditions. / Colletotrichum gossypii South. var. cephalosporioides Costa é o agente causal de uma das mais importantes doenças do algodoeiro. Caracteriza-se pelo surgimento de manchas necróticas nas folhas e pecíolos, com predominância nas folhas mais jovens. Ao longo do tempo, também são observados encurtamento dos internódios, morte do broto apical e superbrotamento. A principal via de disseminação do fungo é a semente, podendo ser veiculado externamente, na forma de conídios, ou internamente, na forma de micélio dormente. O controle do patógeno tem sido feito através do uso de sementes sadias, cultivares resistentes e controle químico. Entretanto, em função da ineficácia desses métodos de controle e dos malefícios provocados pelo uso dos pesticidas na natureza, a exploração da atividade biológica de compostos secundários, presentes no extrato bruto ou óleos essenciais de plantas, pode constituir uma forma efetiva de controle de doenças em plantas cultivadas. Testes preliminares para avaliar o efeitofungistático e fungicida desses produtos são imprescindíveis para descobertas de novas alternativas de controle. Foram avaliados os efeitos de diferentes dosagens (0, 500, 1000, 1500, 2000 e 2500 ppm) dos óleos essenciais extraídos de folhas de kenaf (Hibiscus cannabinus), citronela (Cymbopogus nardus), eucalipto (Eucalptus citriodora), Pipper marginatum, acerola (Malpighia glabra), e lípia (Lippia gracillis) na inibição do crescimento micelial, germinação dos conídios e formação do apressório de C. gossypii var. cephalosporioides. Os óleos de piper, lípia e citronela foram os que apresentaram maior efeito na inibição do crescimento do fungo que o de acerola. Os óleos de eucalipto e acerola tiveram comportamento intermediário e semelhantes de inibição de crescimento, apesar do óleo de eucalipto ter apresentado um melhor controle do fungo. Em relação à germinação dos conídios e formação de apressórios, os óleos de citronela, lípia e eucalipto ocasionaram um significativo controle do fungo. Verificou-seque, para a inibição do crescimento micelial, o óleo de piper foi o que apresentou a menor DL50, seguido pelo óleo de lípia. Para a formação de apressórios, verificou-se que os valores das DL50 dos óleos de citronela, eucalipto foram os menores em relação aos outros óleos. O óleo de kenaf não apresentou nenhum efeito no crescimento micelial, germinação dos conídios e formação de apressórios. Em um segundo experimento, objetivou-se avaliar o efeito curativo e preventivo do óleo de citronela para controle da ramulose do algodoeiro com base em componentes epidemiológicos, contribuindo assim para redução dos níveis de poluição ambiental decorrentes do uso de agrotóxicos. No que diz respeito à Área Abaixo da Curva de Progresso das Doença (AACPD) e Taxa de Progresso da Doença (TPD), houve diferença significativa quando comparada ao tratamento testemunha. Entretanto, ao avaliar os parâmetros índice de Doença Final (IDF) sob o efeito do tratamento curativo, observa-se que o mesmo não diferiu significativamente da testemunha. Ao analisar as variáveis AACPD, IDF, PI e TPD, observou-se que os tratamentos preventivo do óleo de citronela e fungicida diferiram significativamente da testemunha, verificando assim, que o óleo de citronela apresentou um ótimo efeito preventivo da ramulose do algodoeiro sob condições de casa de vegetação.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-24T12:47:24Z No. of bitstreams: 1 Maria Zilderlania Alves.pdf: 802465 bytes, checksum: 50bccde0568d4d4f957001a618583593 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-24T12:47:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maria Zilderlania Alves.pdf: 802465 bytes, checksum: 50bccde0568d4d4f957001a618583593 (MD5) Previous issue date: 2009-03-06 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The black rot of pineapple fruit (Chalara paradoxa), is considered the main postharvest disease in the world. In this work we analyzed the influence of the inoculation method (disc and suspension), temperature (10, 15, 20, 25, 30 and 35 ºC), period of exposure to humidity (0, 6, 12, 24, 36 hours), and of the inoculums concentration (10, 102, 103, 104, 105, 106 and 107 conidia/mL) of three isolates of C. paradoxa (CFM-1183, CFM-1188 and CFM-1029) on the severity of the disease. It was also evaluated the effect of plant extracts in terms of physical and chemical changes. Three treatments were applied (plant extracts, Ecolife® and a fungicide) in concentrations of 25% (D1), 50% (D2), 75% (D3) and 100% (D4) for the plant extracts and 50, 100, 150, 200, 300 μL.mL-1 for the Ecolife® (citric extract) and a fungicide. Healthy pineapples were disinfected and immersed in a solution of the different treatments for five minutes. After 24 hours, inoculation with wounding on pineapple fruit with suspension of C. paradoxa in the concentration of 106 conidia/mL. After inoculation, fruits were kept in a moist chamber for 24 h. The severity was evaluated 5 days after inoculation. The diameter of the lesion in two diametrically opposite directions was measured. For the physiochemical factors of the treated fruits, it was evaluated tenors of vitamin C (mg of ascorbic acid.100 mg-1), titratable acidity(ATT), total soluble sugars (SST) and pH. Before the results obtained all isolates were found to be pathogenic. No significant differences in the method of inoculation and area of inoculation of the pineapple (stalk and equatorial), inoculated with wounds were observed. There was a significant influence of the inoculums concentration of C. paradoxa in the severity of the disease, being larger in the concentrations 106 and 107 conidia /mL. The establishment of the disease, may occur under 25 °C and 24 h of humidity period. All tested extracts showed fungitoxic properties. The treatments caused no significant changes in levels of TSS and TTA. There was a significant reduction in levels of vitamin C and pH compared to the control but remained within an acceptable for commercialization. / A podridão negra do fruto do abacaxizeiro é considerada a principal doença pós-colheita do abacaxizeiro no mundo, respondendo por perdas elevadas em frutas destinadas ao consumo in natura e a industria. Neste trabalho foi analisada a influência do método de inoculação (disco de micélios e suspensão de conídios), da temperatura (10, 15, 20, 25, 30 e 35 o C), do período de molhamento (0, 6, 12, 24, 36 horas em câmara úmida) e da concentração de inóculo (10, 102, 103, 104, 105, 106 e 107 conídios/mL) de três isolados de C. paradoxa (CMM-1183, CMM-1188 e CMM-1029) sobre a severidade da doença, assim como ensaios para avaliar o efeito de extratos vegetais no controle da doença e as alterações físico-químicas das frutas. Os extratos de alho, cebola, melão-de-São-Caetano, alecrim, gengibre e da polpa e casca do abacaxi foram aplicados nas concentrações de 25%, 50%, 75%, e 100% para os extratos vegetais e 50; 100; 150; 200; 300 μL.mL-1 para o Ecolife® (extrato cítrico) e para o prochloraz. As frutas foram desinfestadas e submetidas à imersão em solução dos tratamentos por um período de cinco minutos. Após 24 horas foi realizada inoculação com ferimento sobre o abacaxi com suspensão de C. paradoxa na concentração de 106 conídios/mL. A testemunha constou de frutas imersas em água destilada. Após a inoculação, as frutas foram mantidas em câmara úmida por 24 h. A severidade foiavaliada cinco dias após a inoculação. O diâmetro da lesão foi medido em dois sentidos opostos. Para os fatores físico-químicos da fruta tratada foram avaliados teores de ácido ascórbico (vitamina C), acidez total titulável (ATT), sólidos solúveis totais (SST) e pH. Diante dos resultados obtidos verificou-se que todos os isolados de C. paradoxa testados mostraram-se patogênicos ao abacaxi cv. Perola. Os isolados de C. paradoxa não apresentaram diferença significativa quanto aos métodos de inoculações (disco e suspensão) e às regiões de inoculação no abacaxi (peduncular e equatorial). Houve uma influência significativa quanto à concentração do inóculo de C. paradoxa na severidade da doença, sendo maior nas concentrações 106 e 107 con./mL. Quanto às condições ótimas para o estabelecimento da doença, estas se situam em 25 °C e 24 h de período de molhamento. Todos os extratos testados demonstraram propriedades antifúngicas. Os tratamentos com extratos vegetais não causaram alteração nos teores de SST e ATT. Ocorreu uma redução significativa nos teores de vitamina C e pH quando comparados com as testemunhas, permanecendo, no entanto dentro da faixa aceitável para a comercialização.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-24T13:59:01Z No. of bitstreams: 1 Marilia Wortmann Marques.pdf: 1506911 bytes, checksum: 4d0a22b2b791255d8d7c2170ea10a2e9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-24T13:59:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marilia Wortmann Marques.pdf: 1506911 bytes, checksum: 4d0a22b2b791255d8d7c2170ea10a2e9 (MD5) Previous issue date: 2013-02-22 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Dieback and stem-end rot are diseases caused by species of Botryosphaeriaceae have been associated with serious yield losses to mango culture in northeastern Brazil and worldwide. Considering the increasing importance of these diseases and recent discovery of several species of Botryosphaeriaceae, the objective of this study was (i) to identify species of Botryosphaeriaceae associated with dieback and stem-end rot of mango in the semi-arid region of northeastern Brazil and (ii) compare the species in relation to mycelial growth, pathogenicity and virulence. A total of 235 isolates of Botryosphaeriaceae were identified using morphological and DNA sequence data (ITS and EF1-α). The following species were found: Botryosphaeria dothidea, B. mamane, Lasiodiplodia crassispora, L. egyptiacae, L. hormozganensis, L. iraniensis, L. pseudotheobromae, Lasiodiplodia sp., L. theobromae, Fusicoccum fabicercianum, Neofusicoccum parvum, Neofusicoccum sp., Neoscytalidium dimidiatum e Pseudofusicoccum stromaticum. Only B. dothidea, L. theobromae, N. parvum and P. stromaticum had been previously reported, while the other species represent the first report associated with the mango diseases in this country. L. theobromae, B. dothidea and P. stromaticum were the most frequently isolated species. There were significant differences in mycelial growth rates among the Botryosphaeriaceae species and also in the optimum temperature for growth. The optimum temperature and mycelial growth rates for species Lasiodiplodia vary from 28.2 to 31.1 ºC and from 36.4 a 49.1 mm/day, respectively. While in the other species, the variation was from 25.4 to 30.8 ºC and 19.7 to 41.2 mm/day. All species were pathogenic in mango fruit. There were significant differences in virulence among the species. L. hormozganensis and Lasiodiplodia sp. were the most virulent. For the other species within the Botryosphaeriaceae family, N. dimidiatum and N. parvum were the most virulent species, B. mamane, L. crassispora e L. viticola are reported for the first time associated with mango diseases worldwide. / A morte descendente e a podridão peduncular são doenças causadas por espécies de Botryosphaeriaceae e vêm causando sérios prejuízos à cultura da mangueira no Nordeste do Brasil e do mundo. Tendo em vista a importância crescente dessas doenças e as descobertas recentes de novas espécies de Botryosphaeriaceae, o presente trabalho teve como objetivos: (i) identificar espécies de Botryosphaeriaceae associadas à morte descendente e podridão peduncular na cultura da mangueira no Nordeste do Brasil e (ii) comparar as espécies em relação ao crescimento micelial, patogenicidade e virulência. Um total de 235 isolados de Botryosphaeriaceae foram identificados a partir de características morfológicas e dados de sequências de DNA (ITS, BT e EF1-α), sendo encontradas as seguintes espécies: Botryosphaeria dothidea, B. mamane, Lasiodiplodia crassispora, L. egyptiacae, L. hormozganensis, L. iraniensis, L. pseudotheobromae, Lasiodiplodia sp., L. theobromae, Fusicoccum fabicercianum, Neofusicoccum parvum, Neofusicoccum sp., Neoscytalidium dimidiatum e Pseudofusicoccum stromaticum. Somente L. theobromae, N. parvum, B. dothidea e P. stromaticum tinham sido relatadas em mangueira no Brasil, enquanto as outras espécies representam o primeiro relato associadas à esta cultura no país. L. theobromae, B. dothidea e P. stromaticum foram as espécies prevalentes. Houve diferenças significativas na taxa de crescimento micelial entre as espécies de Botryosphaeriaceae e também em relação à temperatura ótima para o crescimento. A temperatura ótima e a taxa de crescimento micelial para as espécies de Lasiodiplodia variaram de 28,2 a 31,1 ºC e de 36,4 a 49,1 mm/dia, respectivamente. Nas demais espécies, a variação foi de 25,4 a 30,8 ºC e de 19,7 a 41,2 mm/dia. Todas as espécies foram patogências em manga. Houve diferenças significativas na virulência entre as espécies. Em relação às espécies de Lasiodiplodia, L. hormozganensis e Lasiodiplodia sp. foram as mais virulentas. Nas demais espécies dentro da família Botryosphaeriaceae, N. dimidiatum e N. parvum foram as espécies mais virulentas. B. mamane e L. crassispora representam o primeiro relato dessas espécies na cultura da mangueira no mundo.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-27T15:03:54Z No. of bitstreams: 1 Sarah Jacqueline Cavalcanti da Silva.pdf: 1503583 bytes, checksum: c734d13d83c04a3ed6233a8268b3bee8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-27T15:03:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sarah Jacqueline Cavalcanti da Silva.pdf: 1503583 bytes, checksum: c734d13d83c04a3ed6233a8268b3bee8 (MD5) Previous issue date: 2011-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The incidence and severity of diseases caused by begomoviruses has increase rapidly in many areas of the world, including Brazil, where they are limiting factors to tomato and common bean production. Begomoviruses are also associated with a wide range of weed plants which in some cases act as inoculum sources for cultivated plants. It is believed that begomoviruses infecting weed hosts can be horizontally transferred to crop plants and that in the new host they will rapidly evolve by recombination and pseudorecombination, giving rise to novel species. Acting as reservoirs these plants can play a relevant role in viral epidemics in several crops species. The study of plant virus epidemics is greatly facilitated when a population genetics approach is employed. The first step to study viral population is to define their genetic structure, which refers to their degree of variability. Knowledge of the dynamics of genetic variability is essential to understand the potential of the population to evolve, which directly affects the durability of disease management strategies based on the deployment of resistance genes. Studies to understand the genetic structure and dynamics of begomovirus populations in wild reservoirs and the possible effects on epidemics in crop species are scarce. Thus, the aim of this study was to determine the species diversity and population genetic structure of begomoviruses infecting weeds in Northeastern Brazil, as a step towards assessing their role as begomovirus reservoirs. Weed samples belonging to the family Fabaceae and Capparaceae displaying typical symptoms of begomovirus infection were collected in Alagoas (AL), Bahia (BA), Paraíba (PB), Pernambuco (PE) and Sergipe (SE) states from May/2005 to July/2010. A total of 59 leguminous weeds including 42 samples of Macroptilium spp. and 23 samples of Cleome affinis (fam. Caparaceae) were collected. Total DNA was extracted from the samples and full-length begomovirus genomes were amplified and cloned by rolling circle amplification. Clones were completely sequenced and the sequences were used for comparisons with previously described begomoviruses, for phylogenetic analysis and for the determination of the genetic structure of viral populations. Sequence comparisons indicated the presence of six begomoviruses in leguminous weeds (five in Macroptilium spp.), four of them representing novel species. Sequence features indicate that all four novel species are typical New World, bipartite begomoviruses which clustered with Brazilian begomoviruses in the phylogenetic tree. In contrast, only one begomovirus was found infecting C. affinis, suggesting low species diversity in this host phylogenetic reticulate analysis was used to detected possible recombination events in begomovirus populations in leguminous weeds and C. affinis. Putative recombination events were confirmed by RDP3 package analysis. We detected recombination events in Macroptilium yellow spot virus (MaYSV) and Cleome leaf crumple virus (ClLCrV) populations. Analysis of the genetic structure of these virus populations indicates a high degree of genetic variability in both cases. Mutation and recombination are important processes involved in the high genetic variability found in MaYSV and ClLCrV populations. Together, these results suggest that Macroptilium spp. and Cleome affinis can be important begomovirus reservoirs. / A incidência e severidade de doenças causadas por begomovírus (família Geminiviridae) têm aumentado rapidamente em muitas áreas do mundo, incluindo o Brasil, onde são fatores limitantes à produção de feijão e tomateiro. Begomovírus são também associados a uma ampla gama de plantas daninhas e silvestres, as quais em alguns casos podem atuar como fonte de inóculo para plantas cultivadas. Acredita-se que begomovírus que infectam plantas daninhas podem ser transferidos horizontalmente para plantas cultivadas, e que no novo hospedeiro eles podem evoluir rapidamente por meio de recombinação e pseudo recombinação, dando origem a novas espécies. Atuando como reservatórios, estas plantas podem desempenhar um importante papel nas epidemias virais em várias culturas. O estudo de epidemias de vírus de plantas é grandemente facilitado quando uma abordagem baseada em genética de populações é empregada. O primeiro passo para estudar populações virais é definir sua estrutura genética, o que se refere ao seu grau de variabilidade genética. O conhecimento da dinâmica da variabilidade genética é essencial para entender o potencial das populações para evoluir, o que afeta diretamente a durabilidade de estratégias de manejo da doença baseadas na resistência do hospedeiro. Estudos para entender a estrutura genética e dinâmica de populações de begomovírus em plantas daninhas e possíveis efeitos sobre epidemias em espécies cultivadas são escassos. Dessa forma, o objetivo desse estudo foi determinar a diversidade e estrutura genética de begomovírus que infectam plantas daninhas no Nordeste do Brasil, como passo para avaliar seu papel como reservatório de begomovírus. Plantas daninhas pertencentes às famílias Fabaceae e Capparaceae com sintomas típicos de infecção por begomovírus foram coletadas nos estados de Alagoas (AL), Bahia (BA), Paraíba (PB), Pernambuco (PE) e Sergipe (SE) de maio de 2005 a julho de 2010. Um total de 59 amostras de fabáceas, incluindo 42 amostras de Macroptilium spp., e 23 amostras de Cleome affinis (fam. Capparaceae) foram coletadas. DNA total foi extraído a partir das amostras e genomas completos dos begomovírus foram amplificados e clonados por amplificação por círculo rolante. Os clones foram completamente sequenciados e as sequências foram usadas para comparações com begomovírus previamente descritos, para análise filogenética e para determinação da estrutura genética das populações virais. Comparações de sequências indicaram a presença de seis begomovírus em fabáceas (cinco em Macroptilium spp.), incluindo quatro representando novas espécies. As características das sequências indicam que todas as novas espécies são begomovírus bissegmentados típicos do Novo Mundo que agruparam com begomovírus brasileiros na árvore filogenética. Em contraste, apenas uma espécie de begomovírus foi encontrada infectando plantas de Cleome affinis, sugerindo um baixo grau de diversidade de espécies nessa hospedeira. Filogenia reticulada foi usada para detectar possíveis eventos de recombinação nas populações begomovírus em fabáceas e em C. affinis. Esses prováveis eventos de recombinação foram confirmados por análise no programa RDP3. Foram detectados eventos de recombinação ocorrendo naturalmente nas populações de Macroptilium yellow spot virus (MaYSV) e Cleome leaf crumple virus (ClLCrV). A análise da estrutura genética das populações de MaYSV e ClLCrV indica um alto grau de variabilidade genética em ambos os casos. Mutação e recombinação são importantes processos envolvidos na alta variabilidade genética encontrada nas populações desses vírus. Em conjunto, os resul

Submitted by MARCOS LEANDRO TEIXEIRA DE OLIVEIRA (marcosteixeira@ufv.br) on 2018-09-18T13:05:15Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1544966 bytes, checksum: 2d7c99e531dd25f2d0e04968d8f3fedf (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-18T13:05:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1544966 bytes, checksum: 2d7c99e531dd25f2d0e04968d8f3fedf (MD5) Previous issue date: 2018-02-19 / Sclerotinia sclerotiorum, agente causal do mofo branco ou podridão de sclerotinia, infecta espécies de interesse agronômico, tais como aquelas destinadas à produção de grãos, fibras e hortaliças. Este estudo foi conduzido para avaliar: a variabilidade genética do patógeno; a sensibilidade aos fungicidas tiofanato-metílico (TM), fluazinam e procimidone de 238 isolados de S. sclerotiorum coletados em diferentes hospedeiros e regiões no Brasil; e a estabilidade fenotípica de isolados resistentes. Os marcadores microssatélites (SSR) e os grupos de compatibilidade micelial foram utilizados para acessar a estrutura genética da população. Vinte e dois MCGs e 53 genótipos foram identificados. A maioria dos isolados (67,7 %) foi classificado como MCG 1 ou 2. Sete grupos genéticos foram identificados. A população foi estruturada por MCG e não houve evidência de acasalamento aleatório. A população como um todo possui estrutura genética clonal. A sensibilidade aos fungicidas TM, fluazinam e procimidone foi avaliada com doses discriminatórias. O crescimento micelial de nove isolados resistentes e um isolado sensível ao TM foi avaliado durante 10 gerações. A taxa de crescimento de seis isolados resistentes reduziu com o passar das gerações. Não houve resistência a fluazinam ou procimidone. Treze isolados coletados na cultura do feijoeiro nos municípios de Cabeceira Grande (8 isolados) e Unaí (5 isolados), Minas Gerais, foram resistentes ao TM. A resistência ao TM foi causada pela substituição de leucina por fenilalanina no códon 240 do gene da β- tubulina (L240F). Isolados resistentes a TM foram encontrados apenas em uma região. Isolados resistentes coletados em Cabeceira Grande têm adaptabilidade reduzida. Em síntese, no Brasil predominam clones de S. sclerotiorum fortemente determinados por MCG, constataram-se isolados resistentes ao TM e para manejo do mofo branco, recomenda-se o uso de fungicidas com diferentes modo de ação. / Sclerotinia sclerotiorum causes white mold or sclerotinia stem rot and affects important crops such as grains, fibers and vegetables. This study was conducted to assess the genetic variability; the sensitivity to thiophanate-methyl (TM), fluazinam and procymidone of 238 isolates of S. sclerotiorum from different hosts and regions in Brazil; and the phenotypic stability of fungicide resistant isolates. Microsatellites (SSR) and mycelium compatibility groups (MCG) markers were used to assess the genetic structure of the population. Twenty-two MCGs and 53 multilocus genotypes (MLG) were identified. Most isolates (67.7 %) were distributed in either MCG 1 or 2. Seven genetic groups were detected. The population has a clonal structure largely determined by MCGs and there was no evidence of random mating. Fungicide sensitivity was assessed using the discriminatory doses for TM, fluazinam and procymidone. The stability of nine isolates TM-resistant and one sensitive was assessed after 10 transfers in culture medium without fungicide. Mycelial growth rate of six TM-resistant isolates reduced with successive transfers. There was no evidence of resistance to fluazinam or procymidone. Thirteen isolates collected in common bean fields in the municipalities of Cabeceira Grande (8 isolates) and Unaí (5 isolates), Minas Gerais state, were resistant to TM. The resistance was associated with the L240F mutation in the β-tubulin gene. Resistance to TM seems to be localized; and there is evidence for a fitness cost in resistant isolates.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-09-18T14:11:27Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1374908 bytes, checksum: fdd5dbffd013f92a4375592a131835fd (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-18T14:11:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1374908 bytes, checksum: fdd5dbffd013f92a4375592a131835fd (MD5) Previous issue date: 2018-03-23 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Clonostachys rosea é eficaz no biocontrole de várias doenças fúngicas. Ao longo dos anos, constatou-se a eficiência de isolados obtidos no Brasil no biocontrole do mofo cinzento do tomateiro, causado por Botrytis cinerea. Há evidências de que o isolado NCR61/F produza compostos supressivos ao patógeno, mas desconhecia-se a bioatividade e a natureza desses compostos. Assim, estudou-se a bioatividade de compostos de filtrados e extratos do cultivo de C. rosea em meio líquido a B. cinerea e se caracterizaram os metabólitos secundários produzidos. Filtrados e extratos do crescimento do isolado inibiram o crescimento micelial e a germinação de conídios de B. cinerea. O antagonista produziu 51 metabólitos, como peptaibols, glisopreninas e bissorbicilinoides e alguns inderterminados, principalmente após 10 dias de cultivo. Clonostachys rosea é adaptado a diferentes ecossistemas e pode colonizar tecidos de raízes e folhas, mas a dinâmica de sobrevivência nesses tecidos é pouco compreendida. Estudou-se a sobrevivência do isolado NCR61/F como epífita em folhas, na rizosfera e no rizoplano de tomateiros, até 48 dias após a aplicação. A sobrevivência do antagonista diminuiu ao longo do tempo nas superfícies foliares e radiculares, mas sua população permaneceu estável na rizosfera de tomateiros. Um aspecto fundamental e inédito quanto a aplicações de C. rosea é seu efeito na microbiota de folhas de tomateiro, o que foi, também, estudado. O efeito deletério de C. rosea no microbiota foi de curta duração e transiente. O efeito foi maior nas comunidades epifítica e endofítica de fungos, com maior redução em diversidade e riqueza de comunidades até 3 dias após a aplicação. A abundância de filos e alguns gêneros, como Cladosporium e Alternaria, e Cercospora foi menor nas plantas tratadas com o antagonista que nas não tratadas. Em bactérias epifíticas, houve maiores alterações na diversidade aos 3 e 12 dias, e gêneros como Bacillus, Arthrobacter and Enterobacter foram menos abundantes nos dias iniciais após a aplicação. Ao final das avaliações (24 dias), houve resiliência da microbiota foliar de plantas tratadas com o antagonista e aumento gradual das populações. Em conclusão, constatou-se que C. rosea produz compostos inibitórios a B. cinerea, pode sobreviver em folhas e raízes e rizosfera de tomateiro e altera de forma transitória as comunidades fúngicas e bacterianas da solanácea. As informações aqui geradas são relevantes para compreender os mecanismos de antagonismo de C. rosea NCR61/F, sua capacidade de sobrevivência e o efeito perturbador da sua aplicação no microbiota do tomateiro. O conhecimento gerado é importante para traçar estratégias de uso do antagonista e, até mesmo, para validar o seu uso sustentável como agente de biocontrole. / Clonostachys rosea is effective in biocontrol of several fungal diseases. Over the years, we studied the efficiency of isolates obtained in Brazil in the biocontrol of gray mold of tomato, caused by Botrytis cinerea. There is evidence that the C. rosea isolate NCR61/F produces compounds suppressive to the pathogen, but the bioactivity and nature of these compounds was unknown. Thus, the bioactivity of filtrate compounds and extracts of C. rosea culture in liquid medium against B. cinerea was studied and the secondary metabolites produced were characterized. Filtratess and extracts from the growth of the isolate inhibited the mycelial growth and conidial germination of B. cinerea. The antagonist produced 51 metabolites, such as peptaibols, glisoprenins and bissorbicilinoids and some undetermined, mostly after 10 days of culture. Clonostachys rosea is adapted to different ecosystems and can colonize tissues of roots and leaves, but the dynamics of survival in these tissues is little understood. The survival of the isolate NCR61/F isolate was studied as epiphyte in leaves, rhizosphere and rizoplane of tomato plants, up to 48 days after application. The survival of the antagonist decreased over time on leaf and root surfaces, but its population remained stable in the tomato rhizosphere. A fundamental and new aspect of the applications of C. rosea is its effect on the microbiota of tomato leaves, which was also studied. The deleterious effect of C. rosea on the microbiota was transient. The effect was higher in the epiphytic and endophytic communities of fungi, with greater reduction in diversity and richness of communities until 3 days after application. The abundance of phyllum and some genera, such as Cladosporium, Alternaria and Cercospora was lower in plants treated with the antagonist than in plants not treated. Regarding epiphytic bacteria, there were major changes in diversity at 3 and 12 days, and genera such as Bacillus, Arthrobacter and Enterobacter were less abundant in the initial days after application. At the end of the evaluations (24 days), there was resilience of the foliar microbiota of plants treated with the antagonist and gradual increase of the populations. In conclusion, it was found that C. rosea produces inhibitory compounds to B. cinerea, can survive in leaves, roots and rhizosphere of tomato and transiently changes the fungal and bacterial communities of tomato plants. The information generated here is relevant to understand the mechanism of antagonism of C. rosea NCR61/F, its ability to survive and the disturbing effect of its application on the tomato microorganism. The generated knowledge is important to draw strategies of antagonist use and even to validate its sustainable use as biocontrol agent.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-11-16T17:29:40Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 536096 bytes, checksum: ef28acbd4ebc8e3f4d2b3939b50658fb (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-16T17:29:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 536096 bytes, checksum: ef28acbd4ebc8e3f4d2b3939b50658fb (MD5) Previous issue date: 2018-07-17 / A ferrugem do cafeeiro causada pelo fungo Hemileia vastatrix vem causando grandes perdas na cafeicultura ao longo dos anos. O controle químico envolvendo fungicidas sistêmicos e protetores tem sido uma ferramenta importante, visando controle eficiente e evitando o surgimento de mutantes resistentes, na população do fungo aos fungicidas sistêmicos. Dentro os produtos mais utilizados, destacam-se os fungicidas cúpricos, preventivamente por sua eficiência, na inibição da germinação dos esporos; quando a incidência atinge 5 %, nos anos de alta carga de frutos pendentes nas plantas, torna-se necessário a utilização de fungicidas sistêmicos. A ocorrência de chuva tem efeito direto no sucesso do controle, pois pode alterar a dinâmica dos fungicidas na superfície foliar. Neste trabalho foi avaliado os efeitos e ocorrências de chuvas após aplicação de fungicidas sistêmicos e protetores, em folhas de cafeeiro, no controle da ferrugem. Foram realizados dois experimentos em casa de vegetação, onde as folhas destacadas de Coffea arabica var. Caturra foram submetidas a uma chuva de 30 mm. No primeiro teste avaliou-se fungicidas sistêmicos (epoxiconazole + piraclostrobina), hidróxido de cobre, sulfato de zinco e ácido bórico, misturados e sozinhos, utilizando a dose comercial. As folhas foram atomizadas e em seguida submetidas a chuva. No primeiro experimento aguardou-se 30 minutos para a aplicação da chuva. Os melhores resultados foram aqueles que continham (epoxiconazole + piraclostrobina) + hidróxido de cobre, onde a severidade foi praticamente zero Independiente do tempo de chuva após pulverização dos tratamentos. Concluiu-se que a aplicação destes fungicidas, mesmo após serem submetidos a chuva, teve controle eficiente da doença. No segundo experimento foi avaliado o oxicloreto de cobre adicionado adjuvantes. Com ocorrência de chuva de 30 mm após os tempos zero, 30, 120 e 480 minutos, depois da pulverização. Os tratamentos mais eficientes foram onde houve a mistura de oxicloreto de cobre 3,0 kg há -1 + OM a 0,75%, demostrando maior retenção na superfície da folha e maior controle da doença. Os menos eficientes foram aqueles que tinham oxicloreto de cobre + PAFE a 0,10% e 0,20%. Conclui-se que o uso de adjuvantes, pode favorecer a tenacidade e eficiência dos produtos, tendo em consideração a formulação do fungicida. / Coffee rust, caused by the fungus Hemileia vastatrix, has been causing significant yield losses of coffee crop over the years. Chemical control involving systemic curative and protective fungicides have been considered important tools, aiming the effective control and avoiding the emergence of resistant mutants in the fungal population to systemic fungicides. Among the most commonly used products, copper fungicides are prominent due to their preventative and efficient mode of action in inhibiting spore germination; when the incidence reaches 5% in the years of high pending fruits’ load, the use of systemic fungicides becomes necessary. In addition, rain has a direct impact on the management success due to the removal of deposits of products on the leaf surface. Thus, the objective of this study was to evaluate the retention time of systemic and protective fungicide residues on coffee leaves submitted to rain, aiming the control of rust. Two experiments were carried out, in which leaves of Coffea arabica var. Caturra were subjected to a 30-mm rainfall treatment. The first assay employed systemic fungicides (epoxiconazole + pyraclostrobin), copper hydroxide, zinc sulfate, and boric acid, mixed and alone, using the commercial dose. The leaves were atomized and then exposed to precipitation regime. In the first experiment, we allowed 30 minutes before the rainfall application. The best results were those containing (epoxiconazole + pyraclostrobin) + copper hydroxide, in which the severity was practically zero. Therefore, the application of these fungicides, even after being submitted to rain, showed effective control over the disease. Copper oxychloride added to the OM and PAFE was used in the second trial. 30-mm rainfall was applied after the times zero, 30, 120, and 480 minutes, respectively after spraying. The most efficient treatments were the mixture of copper oxychloride + OM at 0.75 %, showing greater retention at the leaf surface and greater control of the disease. The least efficient were those having copper oxychloride + 0.10% and 0.20% PAFE. To conclude, the use of mineral oil adjuvant may favor the tenacity and efficiency of the product, taking into account the formulation of the fungicide. / Currículo lattes e agência de fomento não encontrada.

FundaÃÃo Cearense de Apoio ao Desenvolvimento Cientifico e TecnolÃgico / The cashew crop is one of the most important agribusiness activity in northeastern Brazil, mainly due to its social and economic impact in that region. Nevertheless, severe outbreaks of gummosis and black branch dieback, both caused by the fungus Lasiodiplodia theobromae have imposed great losses under semi-arid conditions. Presently, these diseases are the most important ones over semi-arid conditions in Northeast Region. However, the limited amount of basic knowledge about population biology, genetic structure and pathogen, host and environment interaction are likely to hinder the efforts to manage this pathogen. This study was developed in order to establish a L. theobromae population associated with cashew plant from different ecological regions in the northeastern Brazil, to determine the survival endophytic ability of this fungus in cashew tissues and to characterize this population by using microsatellite markers. Initially, samples of cashew stems were gathered from three natural ecosystems in Brazil in order to isolate L. theobromae. A population of 41 isolates associated with cashew was obtained. Bioassays aiming to determine the surviving ability of this fungus in non infected tissues close to gummosis lesions were conducted using sampled stems. A subpopulation of 15 isolates of L. theobromae was used for DNA extraction followed by polimerase chain reaction (PCR) using 15 oligonucleotides primers designed to amplify microsatellites regions. PCR products were observed on agarose gel in ethidium bromide electrophoresis and analyzed by the unweighted pair-group method with arithmetic mean (UPGMA) by the Nei and Li similarity coefficient. L. theobromae was successfully isolated from cashew tissues as far as 90 cm from the border of the gummosis lesion in both up and down directions. This result confirms the endophytic behavior of this fungus in cashew plant. A great genetic variability of L. theobromae population was observed as determined by 16 similarities groups varying from 91% to 5%. None isolate achieved 100% similarity. The greatest similarity was found between pathogenic and endophytic isolates. / A cultura do cajueiro representa uma das mais importantes atividades agroindustriais do Nordeste do Brasil, sobretudo pelo seu carÃter social e econÃmico para esta regiÃo. Entretanto, a ocorrÃncia epifÃtica de doenÃas como a resinose e a podridÃo-preta-da-haste, ambas causadas pelo fungo Lasiodiplodia theobromae, tÃm produzido severas perdas principalmente nas regiÃes semi-Ãridas. Essas jà assumem a posiÃÃo de principais doenÃas em algumas regiÃes do semi-Ãrido nordestino. Entretanto, os conhecimentos bÃsicos sobre a biologia populacional, constituiÃÃo genÃtica e interaÃÃo do patÃgeno com as plantas hospedeiras, por exemplo, sÃo reduzidos e superficiais, nÃo permitindo significativos avanÃos no manejo dessas enfermidades. Este estudo teve como objetivos estabelecer uma populaÃÃo de isolados L. theobromae associados ao cajueiro em diferentes micro-regiÃes do nordeste brasileiro, determinar a capacidade deste fungo sobreviver endofiticamente em tecidos de cajueiro e caracterizar geneticamente essa populaÃÃo usando marcadores microssatÃlites. Inicialmente, foram coletadas amostras de caules de cajueiro em trÃs ecossistemas naturais brasileiros visando isolar o patÃgeno. Foi estabelecida uma populaÃÃo de 41 isolados de L. theobromae associados ao cajueiro. Bioensaios visando a determinaÃÃo da sobrevivÃncia do fungo em tecidos nÃo infectados, mas prÃximos Ãs lesÃes foram desenvolvidos a partir de amostras de caules com resinose. Uma sub-populaÃÃo de 15 isolados de L. theobromae foi usada na extraÃÃo de DNA e posterior submissÃo a reaÃÃes de polimerase (PCR) em cadeia usando 15 primers flanqueadores de regiÃes contendo seqÃÃncias simples repetidas (microssatÃlites). Os produtos amplificados do PCR foram observados em gel de eletroforese corados com brometo de etÃdio e analisados pelo mÃtodo de agrupamento nÃo balanceado baseado na mÃdia aritmÃtica (UPGMA), estimando-se as similaridades genÃticas pelo coeficiente de Nei e Li. L. theobromae foi isolado de tecidos do caule do cajueiro atà 90 cm de distÃncia da extremidade da lesÃo caracterÃstica de resinose nos dois sentidos (ascendente e descendente) em relaÃÃo à lesÃo, confirmando o comportamento endofÃtico desse fungo em cajueiro. Uma grande variabilidade genÃtica da populaÃÃo avaliada, representada por 16 grupos de similaridade variando de 91% a 5%, foi observada. Nenhum isolado foi igual (100% similaridade). As maiores similaridades (91%) foram observadas entre isolados comprovadamente patogÃnicos e supostamente endofÃticos.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-11-11T14:40:30Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2597471 bytes, checksum: d356a04cdee8348ea7e9d4ca548e8b79 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-11T14:40:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2597471 bytes, checksum: d356a04cdee8348ea7e9d4ca548e8b79 (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A associação de Aphelenchoides besseyi a sementes de gramíneas forrageiras tem implicações quarentenárias que limitam a sua comercialização para muitos dos países importadores das sementes brasileiras. Como várias outras espécies de Aphelenchoides sem importância econômica são relatadas em associação a sementes de forrageiras, é imprescindível a identificação precisa de A. besseyi. Deste modo, realizaram-se as caracterizações morfológica, morfométrica e molecular de populações de A. besseyi associadas a sementes de forrageiras cultivadas no Brasil, comparando-as com populações de A. besseyi provenientes da Costa Rica, Espanha e Japão. Primers e sondas específicos foram desenhados, a partir da região LSU rDNA, e testados usando PCR em tempo real. A caracterização das regiões SSU, LSU e COI comprovaram a ocorrência de uma espécie geneticamente distante de A. besseyi associada às sementes de forrageiras no Brasil. De acordo com as análises filogenéticas das regiões SSU e COI, esta outra espécie, trata-se de A. fujianensis. Foi possível desenvolver e usar os ensaios diagnósticos para a detecção de A. besseyi e A. fujianensis. Com o uso dos primers/sonda específicos foi possível detectar o DNA alvo extraído a partir de um único nematoide. Ainda, foram identificadas duas sequências distintas na região LSU em uma população de A. besseyi, constituindo o primeiro relato da ocorrência de variabilidade intraindividual na região LSU do rDNA nesta espécie. Em adição, a alta identidade de uma destas sequências à A. fujianensis reforçou a proximidade filogenética destas espécies e a necessidade de uma extensiva investigação para se estimar a frequência deste fenômeno. / The association Aphelenchoides besseyi gramineous forage seed has quarantine implications that limit their marketing for many of the importing countries of these seeds. As many other Aphelenchoides species with no economic importance are reported in association with forage seeds, it is essential an accurate identification of A. besseyi. Thus, morphological, morphometric and molecular characterizations was undertaken using A. besseyi populations associated with gramineous forage seeds grown in Brazil, comparing to populations of A. besseyi from Costa Rica, Spain and Japan. Specific primers and probes were designed from LSU rRNA gene, and tested using real time PCR assays. The characterization of SSU, LSU, and COI proved the occurrence of a species genetically distinct from A. besseyi associated with gramineous forage seeds in Brazil. According to the phylogenetic analyzes of SSU and COI regions, this species is A. fujianensis. It was possible to develop diagnostic assays and use them to detect A. besseyi and A. fujianensis. The primers and probes were able to detect the DNA target extracted from a single nematode. Furthermore, two different sequences were identified in the LSU gene in one of A. besseyi populations studied, constituting the first report of intra-individual variation in LSU rDNA for this species. In addition, the high identity of one of these sequences with A. fujianensis reinforced the phylogenetic proximity of these species and the need for extensive research to estimate the frequency of this phenomenon.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2015-11-13T14:38:18Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 977977 bytes, checksum: 5bc34ca996c2d5f549156130af1ded39 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-13T14:38:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 977977 bytes, checksum: 5bc34ca996c2d5f549156130af1ded39 (MD5) Previous issue date: 2013-10-10 / Spiroplasma citri Saglio et. al é o agente causal de Citrus Stubborn Disease - CSD, doença observada primeiramente em pomares cítricos na Califórnia, EUA, em 1915. A doença tem provocado reduções significativas de produtividade em muitos países produtores de citros e, não ocorrendo no Brasil, representa um risco potencial à citricultura nacional, devido à ampla gama de hospedeiros e à eficiência da transmissão pelas cigarrinhas vetoras. São vetores de S. citri: Circulifer tenellus, Circulifer haematoceps e Scaphytopius nitridus. Os principais hospedeiros de expressão econômica são espécies cítricas, como toranja, limão siciliano, tangerina, laranja doce, laranja azeda, pomelo, lima-da-pérsia, C. limonia, C. madurensis, limoeiro rugoso, satsumas e tangelos, Fortunella spp. e porta-enxertos híbridos, como citranges. Muitas outras plantas nativas ou cultivadas são consideradas hospedeiras na região sudoeste dos Estados Unidos, e provavelmente há muitos outros hospedeiros deste organismo. A ocorrência de S. citri já foi relatada em países do continente europeu, na Ásia, África, América do Norte e Oceania. No estado da Califórnia, EUA, estima-se que de 5 a 10% das árvores estejam infectadas pela bactéria. Devido à grande importância que o setor citrícola tem para a economia brasileira, e considerando ainda os impactos econômicos que a introdução desta praga pode acarretar, S. citri está listada como praga quarentenária ausente para o Brasil e foi escolhida como objeto de elaboração de um plano de contingência, visando a execução de ações de contenção, supressão e erradicação. / Spiroplasma citri is the causal agent of Citrus Stubborn Disease-CSD, first observed in citrus orchards in California, USA, in 1915. The disease has caused significant reductions in productivity in many citrus producing countries and represents a potential risk to Brazilian citrus orchards, due to the wide range of hosts and transmission efficiency by leafhoppers. The vectors of S. citri are: Circulifer tenellus, Circulifer haematoceps (synonym of Neoaliturus haematoceps) and Scaphytopius nitridus. The main economic expression hosts are citrus species, such as grapefruit, lemon, tangerine, sweet orange, sour orange, pomelo, Citrus limettioides, C. limonia, C. madurensis, rough lemons, satsumas and tangelos, Fortunella spp. and hybrid rootstocks as citranges. Many other native or cultivated plants are considered hostesses in the southwestern region of the United States, and probably many other hosts of this organism. The occurrence of S. citri has already been reported in countries of Europe, Asia, Africa, North America and Oceania. In the State of California, USA, it is estimated that 5 to 10% of the trees are infected by the bacteria. Because of the great importance that the citrus fruit sector represents for Brazilian economy, and also considering the economic impacts that the introduction of this pest may cause, S. citri is listed as a quarantine pest and was chosen in order to develop a contingency plan. / Não foi encontrado a URL do currículo lattes do autor e nem documento de identificação.