Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 773271 bytes, checksum: 5ed57ecb4813981953390fb685f8c806 (MD5) Previous issue date: 2007-03-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Since the late 90s, experiments have shown the beneficial effects of rhizobacteria isolates obtained from the rhizosphere of seedlings of different clones of Eucalyptus grandis, Eucalyptus urophylla and their hybrids, when inoculated to the substratum with a saline suspension. To make its use operationally viable, the most promising isolates were formulated in canadian turf and in stabilizing solution, as well as morphological and molecular characterizations and tests of sensibility to antibiotics. After 24-h incubation, the colonial characteristics elevation and color of allowed the differentiation of isolates of all studied species. Besides the isolates S1, S2 and 3918 of Bacillus subtilis, MF2 and MF4 of Pseudomonas sp. and Ca of Pseudomonas fulva were differentiated by their morphological characteristics and the sensibility to antibiotics. PCR-RFLP analysis allowed the differentiation among isolates CIIb of Stenotrophomonas maltophilia, R1 of Frateuria aurantia and FL2 of Pseudomonas aeruginosa and between the groups of Bacillus isolates S1, S2 and 3918 and Pseudomonas MF2, MF4 and Ca. The efficiency of inoculants in the production of eucalyptus seedlings varied with clones, types of tested formulation and isolate. In general, clones of E. grandis (11) gave better response to rhizobacterization (Alfenas et al., 2004) than E. grandis x E. urophylla (409). The turf formulation provided larger increases for the variables rooting speed, biomass of aerial part and root system. Isolates R1, FL2, S1 and S2 stood out for showing larger rooting increase and isolated S2 for increasing the biomass of the aerial part and root system. Both the turf and the liquid formulations were shown to be efficient in inducing minicutting rooting and seedling growth, being a practical and viable alternative to be adopted in eucalyptus seedling production. / A partir de uma série de experimentos iniciados no final da década de 90, comprovaram-se os efeitos benéficos de isolados de rizobactérias, obtidos da rizosfera de mudas de diferentes clones de Eucalyptus grandis, Eucalyptus urophylla e seus híbridos, quando inoculados na forma de suspensão salina ao substrato. Para que sua utilização se tornasse operacionalmente viável, formularam-se os isolados mais promissores em turfa canadense e em solução estabilizante, e realizou-se sua caracterização morfológica, molecular e a sensibilidade a antibióticos. Após 24 horas de incubação, as características de elevação e coloração das colônias permitiram a diferenciação dos isolados de todas as espécies estudadas. Ademais os isolados S1, S2 e 3918 de Bacillus subtilis, MF2 e MF4 de Pseudomonas sp. e Ca de Pseudomonas fulva foram diferenciados por suas características morfológicas e pela sensibilidade a antibióticos. A análise de PCR-RFLP permitiu a diferenciação entre os isolados CIIb de Stenotrophomonas maltophilia, R1 de Frateuria aurantia e FL2 de Pseudomonas aeruginosa e entre os grupos dos isolados S1, S2 e 3918 de Bacillus e MF2, MF4 e Ca de Pseudomonas. A eficiência dos inoculantes na produção de mudas de eucalipto variou de acordo com o clone, tipo de formulação e isolado testado. Em geral, o clone de E. grandis (11) respondeu melhor à rizobacterização (Alfenas et al., 2004) que o de E. grandis x E. urophylla (409). A formulação turfosa propiciou maiores incrementos para as variáveis velocidade de enraizamento, biomassa da parte aérea e do sistema radicular. Os isolados R1, FL2, S1 e S2 destacaram-se por apresentarem maior incremento de enraizamento e o isolado S2 para o incremento da biomassa da parte aérea e do sistema radicular. Tanto a formulação turfosa quanto a líquida mostraram-se eficientes na indução de enraizamento de miniestacas e no crescimento de mudas, sendo seu uso uma alternativa prática e viável a ser adotada na produção de mudas de eucalipto.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-10-19T13:25:55Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1740275 bytes, checksum: dbf657dfff35fdf68a02c45937d7f4ba (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-19T13:25:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1740275 bytes, checksum: dbf657dfff35fdf68a02c45937d7f4ba (MD5) Previous issue date: 2014-08-22 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / A murcha bacteriana, causada por Ralstonia solanacearum, causa perdas diretas e indiretas na produção de várias culturas. Apesar de o uso de variedades resistentes ser a melhor opção para o manejo da doença, nãoraro encontram-se relatos de suplantação da resistência. O primeiro relato de murcha bacteriana no Brasil é antigo, porém pouco se conhece sobre os biovares, filotipos, sequevares e variabilidade genética do patógeno. Por essa razão realizou-se o presente estudo. Isolados brasileiros de R.solanacearum foram caracterizados como biovar 1, 2 e 3, filotipo II, que está disperso por todo o país e filotipo I, que encontra-se predominantemente na região Norte. Sete sequevares foram identificados: 1, 4, 18, 27, 28, 41 e 50. Além disso, nós classificamos quatro novos sequevares no filotipo IIB como sequevar 53, 54, 55 e 56. Inicialmente, utilizou-se rep-PCR para estimar a variabilidade. Obtiveram- se 282 haplótipos. Uma possível explicação para o alto número de haplótipos é a ocorrência de recombinação. Isolados das regiões Sul, Sudeste e Central formam um grande grupo genético, enquanto aqueles das regiões Norte e Nordeste formam outro grupo. Tal fato evidencia fluxo gênico entre essas regiões, provavelmente mediado pelo transporte de tubérculos e mudas contaminadas. Detectou-se diferenciação genética entre isolados de tomate e batata coletados na região Sul-Sudeste-Central. Os mecanismos evolutivos foram parametrizados a partir de análises de genealogia de genes por processo coalescente utilizando sequências parciais de sete genes. Detectou- se evidência de subdivisão dos filotipos I, IIA e IIB, mas não subdivisão por hospedeiro. O fluxo gênico é mais intenso da região Sul para a região Norte. O filotipo II é uma linhagem ancestral que teve origem no Brasil e o filotipo I foi recentemente introduzido, possivelmente por ação antropogênica. O filotipo IIA deu origem ao filotipo IIB e essa diferenciação ocorreu possivelmente devido a fatores ecológicos que precisam ser eBacterial wilt, caused by the Ralstonia solanacearum, cause direct and indirect losses in several crops. Planting of resistant varieties is the best option for disease management, but reports of resistance breakdown are commonly found in the literature. Although many years have passed after the first report of this pathogen in Brazil, information on biovars, phylotypes, sequevars and genetic variability of the pathogen is scarce. In the present study isolates were characterized as biovar 1, 2 and 3. Phylotype II is spread throughout Brazil and phylotype I is predominantly found in the North. Seven sequevars were identified: 1, 4, 18, 27, 28, 41 and 50. Moreover, we classified four new sequevars in the phylotype IIB as sequevar 53, 54, 55 and 56. Initially, we used rep-PCR to estimate the variability of the pathogen and 282 haplotypes were obtained. The high number of haplotypes could be due to the occurrence of recombination. Isolates of the South/Southeast/Central regions formed a genetically related cluster. Isolates from the North/Northeast regions formed another group. Gene flow occurs through the transportation of contaminated tubers and seedlings. Genetic differentiation was detected among isolates from tomato and potato collected in the South/Central/Southeast regions. In addition, gene genealogies based on the coalescent process were used to infer about evolutionary mechanisms. We detected evidence of subdivision of phylotypes I, IIA and IIB, but no subdivision by hosts. The gene flow is predominantly from the southern to the northern regions. We confirmed that phylotype II is an ancestral lineage that originated in Brazil and probably phylotype I was recently introduced by anthropogenic actions. Phylotype IIA originated phylotype IIB and this difference was probably due to ecological factors that need to be studied in more detail. Mutation, migration, recombination and selection occur in the population of R. solanacearum in Brazil, however mutation is more important than recombination. We conclude that the use of resistant varieties is a major challenge in all regions and hosts. studados com mais detalhes futuramente. Detectaram-se evidências de mutação, migração, recombinação e seleção na população de R.solanacearum no Brasil. Entretanto, mutação é mais importante que recombinação. Conclui-se que a utilização de variedades resistentes será uma grande desafio em todas regiões e hospedeiros. / Bacterial wilt, caused by the Ralstonia solanacearum, cause direct and indirect losses in several crops. Planting of resistant varieties is the best option for disease management, but reports of resistance breakdown are commonly found in the literature. Although many years have passed after the first report of this pathogen in Brazil, information on biovars, phylotypes, sequevars and genetic variability of the pathogen is scarce. In the present study isolates were characterized as biovar 1, 2 and 3. Phylotype II is spread throughout Brazil and phylotype I is predominantly found in the North. Seven sequevars were identified: 1, 4, 18, 27, 28, 41 and 50. Moreover, we classified four new sequevars in the phylotype IIB as sequevar 53, 54, 55 and 56. Initially, we used rep-PCR to estimate the variability of the pathogen and 282 haplotypes were obtained. The high number of haplotypes could be due to the occurrence of recombination. Isolates of the South/Southeast/Central regions formed a genetically related cluster. Isolates from the North/Northeast regions formed another group. Gene flow occurs through the transportation of contaminated tubers and seedlings. Genetic differentiation was detected among isolates from tomato and potato collected in the South/Central/Southeast regions. In addition, gene genealogies based on the coalescent process were used to infer about evolutionary mechanisms. We detected evidence of subdivision of phylotypes I, IIA and IIB, but no subdivision by hosts. The gene flow is predominantly from the southern to the northern regions. We confirmed that phylotype II is an ancestral lineage that originated in Brazil and probably phylotype I was recently introduced by anthropogenic actions. Phylotype IIA originated phylotype IIB and this difference was probably due to ecological factors that need to be studied in more detail. Mutation, migration, recombination and selection occur in the population of R. solanacearum in Brazil, however mutation is more important than recombination. We conclude that the use of resistant varieties is a major challenge in all regions and hosts.

Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-10-29T14:11:46Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1548533 bytes, checksum: 5094924f4809fb55ba1e1653ab6f4f77 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-29T14:11:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1548533 bytes, checksum: 5094924f4809fb55ba1e1653ab6f4f77 (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Designou-se, neste trabalho, o epítipo de Puccinia psidii Winter, originário de Psidium guajava para servir como referência para futuros estudos taxonômicos e moleculares do fungo. Esta ferrugem é considerada autoécia e macrocíclica, com a fase de pícnio desconhecida e com poucas informações sobre a formação, condição nuclear e o papel dos basidiósporos no ciclo vital de P. psidii. Assim, a partir de estudos citológicos, encontrou-se que após a fusão nuclear e migração do núcleo diplóide do teliósporo para o metabasídio ocorre meiose e originam-se quatro núcleos haplóides. Formam-se septos entre cada um dos quatro núcleos, os quais podem sofrer divisão mitótica e resultar em quatro basidiósporos predominantemente binucleados. A partir de inoculações de basidiósporos em folhas destacadas de Syzygium jambos, observaram-se apressórios lobados rudimentares, mas sem evidência de penetração e infecção. Em outro estudo, seis marcadores microssatélites foram utilizados para analisar a variabilidade genética de 79 isolados de P. psidii coletados em diferentes hospedeiros da Austrália, Nova Caledônia e China. Até o presente momento os isolados são geneticamente uniformes, exceto para algumas mutações pontuais em quatro isolados da Austrália. Ainda que a correlação seja pequena (p< 0.01, r= 0.061), encontrou-se associação entre variabilidade genética de isolados de P. psidii do Brasil, estimada por microssatélites, e os resultados de inoculação cruzadas em diferentes espécies de mirtáceas. Realizou-se o sequenciamento completo e uma breve análise genômica de cinco isolados P. psidii do viiiBrasil e da Austrália. A montagem de cada isolado foi comparada com o isolado VIC42496. Mais de 70% dos contigs de cada isolado que não estavam presente na montagem do isolado VIC 42496 não exibiram homologia com nenhuma sequência depositada no banco de dados do NCBI. Para aquelas sequências que apresentaram similaridade com outras sequências fúngicas, incluindo P. psidii, apenas três contigs foram similares com genes que codificam produtos envolvidos em patogenicidade. / In this study, the epitype of Puccinia psidii Winter from Psidium guajava was designed to serve as reference for future taxonomic and molecular studies of the fungus. This rust is it considered autoecious and macrocyclic, but lacking pycnium and with little knowledge about the formation, nuclear condition and the role of basidiospores in the life cycle of P. psidii. Thus, cytological studies showed that after nuclear fusion the diploid nucleus migrated into the metabasidium and underwent meiotic division resulting in four haploid nuclei. Septum was formed between each nucleus, which can undergo mitotic division and result in four basidiospores mainly binucleate. After inoculations on detached leaves of Syzygium jambos, rudimentary lobate apressoria were observed, but with no evidence of penetration and infection. In another study, six microsatellite markers were used to analyze the genetic variability of 79 isolates of P. psidii collected from different hosts in Australia, New Caledonia and China. Up to now it was found that isolates are genetically uniform, except for a few point mutations in four isolates from Australia. Although the correlation is low (p <0.01, r = 0.061), there was an association between the genetic variability of isolates of P. psidii from Brazil, estimated by microsatellites, and the results of cross-inoculation on different Myrtaceae species. Genome sequencing of five isolates of Puccinia psidii from Brazil and Australia and a brief genomic analysis among them was provided. The assembly of each isolate was compared to VIC 42496. The analysis reveled that more than 70% of the contigs of xeach isolate that was not present on assembly of VIC42496 had no significant homology (no hits) to anything currently residing in the fungal genome databases. For those contigs that displayed similar to fungal sequences, including P. psidii, only three contigs matched with genes coding for products that could be involved in pathogenicity.

Orientador: Antonio Carlos Maringoni / Banca: Silvania Helena Furlan de Oliveira / Banca: Marta Helena Vechiato / Resumo: Colletotrichum lindemuthianum (Sacc. & Magn.) Scrib. e o agente causal da antracnose do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.), doenca fungica de grande importancia para a cultura, pois pode causar perdas de ate 100% na producao, quando sao utilizadas cultivares suscetiveis e sementes infectadas, sob condicoes ambientais favoraveis ao desenvolvimento de epidemias. O presente trabalho objetivou avaliar a sensibilidade in vitro de 20 isolados de Colletotrichum lindemuthianum, provenientes de diferentes regioes do pais, a cinco fungicidas de diferentes principios ativos e algumas misturas (carbendazin, chlorothalonil, tiofanato metilico, chlorothalonil + tiofanato metilico, trifloxystrobin, propiconazol, trifloxystrobin + propiconazol), em cinco diferentes concentracoes (0, 1, 10, 100 e 1000 -Êg.mL-1) adicionados em meio de cultura batata-dextrose-agar (BDA). Os isolados cresceram por sete dias a 25 -C no meio de cultura BDA e apos esse periodo, discos de 0,5 cm de micelio do fungo, foram transferidos para placas de Petri com o meio BDA contendo as diferentes concentracoes de fungicidas. As placas foram incubadas por sete dias a 25 -C, avaliado o crescimento medio do diametro das colonias (em cm) e calculado os valores de porcentagem de inibicao do crescimento micelial dos isolados em relacao ao tratamento testemunha. Os resultados mostraram que para os fungicidas carbendazin e tiofanato metilico, 11 isolados fungicos foram totalmente ou parcialmente inibidos na concentracao de 1 ou 10 -Êg.mL-1. Chlorothalonil mostrou-se menos eficiente que os demais produtos pelo fato de inibir o crescimento micelial de apenas tres isolados na concentracao de 1000 -Êg.mL-1. A mistura de chlorothalonil e tiofanato metilico mostrou a inibicao total do crescimento micelial de quatro isolados a 1 -Êg.mL-1, e, a 1000 -Êg.mL-1, oito isolados mostraram-se sensiveis a mistura desses produtos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Colletotrichum lindemuthianum (Sacc. & Magn.) Scrib. is the causal agent of anthracnose in bean (Phaseolus vulgaris L.). This fungal disease has great importance in the crop, since it may cause yield losses of up to 100% when susceptible cultivars and infected seeds are used under environmental conditions that favor the development of epidemics. The aim of this work was to evaluate the in vitro sensitivity of 20 isolates of Colletotrichum lindemuthianum from different regions of the country, to five fungicides with different active principles and some mixtures (carbendazim, chlorothalonil, methyl thyophanate, chlorothalonil + methyl thyophanate, trifloxystrobin, propiconazole, trifloxystrobin + propiconazole), at five different concentrations (0, 1, 10, 100, and 1000 ìg.mL-1), added to potato-dextrose-agar (PDA) culture medium. The isolates were cultured for seven days at 25 °C in PDA medium, after which 0.5 cm disks of fungal mycelium were transferred to Petri dishes containing PDA medium and the various concentrations of fungicides. The Petri dishes were incubated for seven days at 25 °C. We evaluated the mean growth in diameter of the colonies (in cm) and calculated percentage values for mycelial growth inhibition of the isolates in relation to the control treatment. The results showed that 11 fungal isolates were completely or partially inhibited by the fungicides carbendazim and methyl thyophanate at concentrations of 1 or 10 ìg.mL-1. Chlorothalonil proved less effective than the other products, as it inhibited mycelial growth in only three isolates, at the concentration of 1000 ìg.mL-1. The chlorothalonil and methyl thyophanate mixture showed complete mycelial growth inhibition in four isolates at 1 ìg.mL-1, while eight isolates were sensitive to the mixture of these products at 1000 ìg.mL-1. The propiconazole and trifloxystrobin mixture was the most effective and inhibited growth... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Resumo: As cianobactérias são dotadas de grande variabilidade morfológica e plasticidade ecológica e estão adaptadas aos mais diversos ambientes e regiões geográficas. O conhecimento taxonômico do grupo no Brasil ainda é restrito e concentrado principalmente no estado de São Paulo. Lagoas e banhados costeiros constituem hábitats de interesse científico, pois podem abrigar espécies não encontradas em outras condições ambientais e fornecer informações importantes do ponto de vista taxonômico, ecológico e evolutivo. A planície costeira do Rio Grande do Sul apresenta uma forte dominância de ecossistemas de áreas úmidas, destacandose entre eles, lagoas e lagunas de água doce e banhados. O objetivo deste estudo consiste no levantamento e estudo taxonômico das cianobactérias ocorrentes em ambientes aquáticos na área da lagoa do Casamento e ecossistemas associados, assim como na área dos butiazais (formação vegetal dominada pela palmeira butiá, Butia capitata (Martius) Beccari) nos arredores da cidade de Tapes. Os resultados obtidos baseiam-se na análise de 90 amostras de plâncton e espremidos de macrófitas que foram coletadas em maio, junho, outubro, novembro e dezembro de 2003, em 28 pontos das áreas (incluindo diferentes habitats como lagoas, banhados e sangradouro). Foram identificados 92 táxons específicos de cianobactérias, pertencentes a 39 gêneros. Synechococcophycidae foi representada por 34 espécies (37%), Oscillatoriophycidae por 33 espécies (36%) e Nostocophycidae por 25 espécies (27%). Entre as espécies identificadas, 24 (26%) são novas ocorrências para o Rio Grande do Sul. Três táxons foram identificados em nível genérico e provavelmente constituirão novos táxons para a ciência. Phormidium foi o gênero que apresentou o maior número de espécies identificadas (8), seguido de Aphanocapsa, Chroococcus e Oscillatoria (7 cada um)... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Cyanobacteria have wide morphological diversity and ecological plasticity and are adapted to different environments and geographic regions. The taxonomic knowledge of the group in Brazil is still limited and it is mainly concentrated in the São Paulo State. Additionally, coastal lagoons and wetlands are habitats of scientific interest because they may harbor species not found in other environmental conditions and provide important information in terms of taxonomic, ecological and evolutionary. The coastal plain of the Rio Grande do Sul State has a strong dominance of wetland ecosystems, especially lakes and freshwater lagoons and marshes. The aim of this paper is the taxonomic study of the cyanobacteria in aquatic environments in the areas of Casamento lagoon and of the butiazais (vegetation mainly composed by the palm tree Butia capitata (Martius) Beccari) around Tapes City, as well as associated ecosystems. Results are based on the analysis of 90 samples obtained during the project "Assessment of the biodiversity of the Casamento lagoon and butiazais areas, coastal plain of Rio Grande do Sul State". Samples of plankton and squeezing submerged parts of aquatic macrophytes were collected in May, June, October, November and December 2003, in 28 sites (including different habitats such as ponds, wetlands and spillway). Ninety two specific taxa, belonging to 39 genera, were identified. Synechococcophycidae was represented by 34 species (37%), Oscillatoriophycidae by 33 species (36%) and Nostocophycidae, by 25 species (25%). Among the identified species, 24 (26%) are firstly recorded for Rio Grande do Sul State. Three taxa were identified only at generic level and are probably new to science. Phormidium was the genus which presented the highest number of identified species (8), followed by Aphanocapsa, Chroococcus and Oscillatoria (with 7 species each). Geitlerinema... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Luis Henrique Zanini Branco / Coorientador: Vera Regina Werner / Banca: Maria Teresa de Paiva Azevedo / Banca: Carlos Eduardo de Mattos Bicudo / Mestre

Orientador: Antonio Carlos Maringoni / Banca: Marcelo Agenor Pavan / Banca: Margarida Fumiko Ito / Resumo: murcha-de-curtobacterium é uma doença que acarreta sérios prejuízos na produção do feijoeiro no País e seu agente causal, a bactéria Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff), é transmitido por sementes. São indicados o uso de sementes livres do patógeno, rotação de culturas e cultivares resistentes para o manejo da doença em campo. Foi realizada a avaliação da transmissão de Cff via sementes de feijão, em três ensaios, em seis cultivares de feijoeiro (IAC Carioca, IAC Carioca Aruã, IAC Carioca Akytã, IAC Carioca Pyatã, IAC Carioca Tybatã e Pérola). Essas cultivares foram inoculadas com um isolado de Cff via punção no caule e os sintomas da doença foram avaliados com uma escala de notas. A análise da transmissão da bactéria pelas sementes foi realizada nos três ensaios, em 500 sementes das cultivares IAC Carioca, IAC Carioca Aruã, IAC Carioca Akytã, IAC Carioca Pyatã, IAC Carioca Tybatã e para a cultivar Pérola, foram analisadas 46, 155 e 87 sementes respectivamente no primeiro, segundo e terceiro ensaios. As sementes foram maceradas individualmente em água destilada e esterilizada, incubadas por 24 horas e a suspensão obtida foi semeada em placas de Petri contendo meio de cultura semi-seletivo para Cff e incubadas à temperarura de 28 a 30 oC, durante 96 a 120 horas. As colônias com características típicas de Cff, comparadas com um isolado puro padrão, foram purificadas em meio NSA + NaCl 7%, realizados testes de coloração diferencial de Gram, KOH e patogenicidade. Os isolados primeiro e segundo ensaios foram caracterizados por Microlog2TM e os do terceiro, via PCR. Os resultados mostraram que as cultivares de feijoeiro IAC Carioca Aruã, IAC Carioca Akytã, IAC Carioca Pyatã e IAC Carioca Tybatã apresentaram baixos índices de severidade da doença, indicando resistência à murcha-de-curtobacterium, já as cultivares Pérola e IAC ...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Bean bacterial wilt is a disease that cause serious losses to the Brazilian dry beans production and its causal agent, Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff), is seedtransmitted. The use of pathogen-free seeds, culture rotation and resistant cultivars are recommended for disease handling on the field. The evaluation of Cff transmission by seeds was carried out by conducting three assays in six common beans cultivars (IAC Carioca, IAC Carioca Aruã, IAC Carioca Akytã, IAC Carioca Pyatã, IAC Carioca Tybatã and Pérola). These cultivars were inoculated with a Cff isolate via a puncture on the stem and the desease symptoms were evaluated with severity index. The analysis of bacterial seed transmission was carried out in all of the three assays in 500 seeds of cultivars IAC Carioca, IAC Carioca Aruã, IAC Carioca Akytã, IAC Carioca Pyatã and IAC Carioca Tybatã. For cultivar Pérola, 46; 155 and 87 seeds were analyzed respectively on the first, second and third assays. Seeds were individually macerated in distilled and sterilized water for 24 hours and the suspension thus obtained was sown on Petri dishes with a Cff semi-selective medium and incubated at 28 - 30 °C from 96 to 120 h. Colonies with typical Cff characteristics as compared with a standard pure isolate were purified in a NSA + NaCl 7% medium, Gram, KOH and pathogenicity tests being carried out. The isolates from the first and second assays were characterized by Microlog2TM and those of the third one by PCR. Results showed that common beans cultivars IAC Carioca Aruã, IAC Carioca Akytã, IAC Carioca Pyatã and IAC Carioca Tybatã presented... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

O controle de doenças em plantas geralmente é realizado com o uso de agroquímicos, que podem desencadear efeitos maléficos ao ser humano ou ao ambiente como um todo. Diversos trabalhos mostram o potencial de plantas medicinais no controle de fitopatógenos, tanto por sua ação fungitóxica direta, inibindo o crescimento micelial e a germinação de esporos, quanto pela capacidade de ativar o metabolismo de defesa das plantas, como o acúmulo de fitoalexinas, indicando a presença de moléculas com características elicitoras. Foram desenvolvidos dois experimentos na Universidade Tecnológica Federal do Paraná – Câmpus de Dois Vizinhos, com objetivos de avaliar o pontencial de preparados de Cavalinha (Equisetum sp.) na síntese de metabólitos de defesa em cotilédones de soja (Glycine max L.) e o efeito sobre o crescimento de Rhizoctonia solani, in vitro. O delineamento experimental utilizado para os experimentos foi inteiramente casualizado em esquema fatorial 3x5 resultante da combinação de três formas de extração (extrato alcoólico, infusão e maceração) e cinco concentrações (zero; 1; 10, 20 e 40%), com 4 repetições. No primeiro experimento foi avaliada a indução de fitoalexinas em cotilédones de soja em resposta aos derivados a base de cavalinha. Sementes de soja foram semeadas em areia autoclavada e mantidas em temperatura ambiente por 10 dias. Em seguida os cotilédones das plântulas foram removidos e na face abaxial destes foram aplicados os tratamentos. Após seguir os procedimentos metodológicos da técnica de extração, obteve-se via espectofotometria a quantificação da fitoalexina gliceolina, sendo então utilizados os cotilédones para quantificação da atividade da enzima fenilalanina amônia-liase (FAL) e o teor de fenóis totais. No segundo experimento foi avaliado o potencial fungistático dos preparados sobre Rhizoctonia solani. Em placas de Petri foram adicionados no meio de cultura BDA os preparados nas diferentes concentrações. Após a solidificação foi transferido para o centro de cada placa, um disco de micélio com Rhizoctonia solani. As placas foram incubadas sob alternância de fotoperíodo de 12 horas, em temperatura de 25oC. Os preparados de extrato alcoólico, infusão e maceração de cavalinha apresentam capacidade de indução das fitoalexinas gliceolinas em cotilédones de soja, bem como, ativam o metabolismo de compostos fenólicos. Entre os preparados, o extrato alcoólico e a maceração, se sobressaem sobre a infusão. Os preparados de extrato alcoólico, infusão e maceração de cavalinha em todas as suas concentrações inibem o crescimento do fungo Rhizoctonia solani, in vitro, sendo que o extrato alcoólico apresenta maior capacidade de supressão do crescimento micelial em comparação as demais formas de obtenção dos preparados. / Usually, the plant diseases control is accomplished with the use of chemicals products that can trigger harmful effects for the people or the environment. Several studies showed the potential of medicinal plants in the control of pathogens, either by their direct fungitoxic action, inhibiting the mycelial growth and spore germination, and by ability to activate the metabolism of plant defense, such as phytoalexin accumulation, indicating the presence of molecules with characteristics elicitoras. Two experiments were carried out in the Universidade Tecnológica Federal do Paraná - Câmpus Dois Vizinhos. The aims of these works were to evaluate the potential of "cavalinha" (Equisetum sp.) prepared in the defense metabolites synthesis of soybean cotyledons (Glycine max L.) and the effect on Rhizoctonia solani growth in vitro. The experimental design used for the experiments was completely randomized in factorial 3 x 5 (extract form x concentration), with four replications. The extract forms were alcoholic extract, infusion and maceration and the concentrations tested were zero, 1, 10, 20 and 40%. In the first experiment, the phytoalexins induction in the soybean cotyledons the according with "cavalinha" prepared was evaluated. Soybean seeds were sown in autoclaved sand and kept at room temperature for 10 days. After, the plantlets cotyledons were removed and on the surface of these the treatments were applied. Then, it followed the methodological procedures of extraction technique and it was obtained via spectrophotometry the phytoalexin glyceollin quantification. The cotyledons were then used to quantify of the enzyme phenylalanine ammonia lyase (PAL) activity and total phenols contend. In the second experiment was evaluated the potential fungistatic preparations on Rhizoctonia solani. The prepared with different concentrations was added in Petri dishes with PDA culture medium. After solidification was transferred to the center of each plate, a disc with Rhizoctonia solani mycelia. The plates were incubated alternating the photoperiod in 12 hour, at 25 °C temperature. The alcoholic extract, infusion and maceration "cavalinha" prepared present glyceolin induction of phytoalexins in soybean cotyledons, as well as it to activate the metabolism phenolic compounds. Among the prepared, the alcoholic extract and maceration forms were superior in relation the infusion form. The alcoholic extract, infusion and maceration "cavalinha" prepared using all over the concentrations inhibit Rhizoctonia solani growth in vitro. The alcoholic extract had a higher capacity to suppress mycelial growth compared to other forms of production preparations.

Os fungos toxigênicos Aspergillus flavus e Fusarium verticillioides podem colonizar plantas de milho em todas as etapas do cultivo, através da contaminação fúngica presente no solo, levando a queda de produtividade e qualidade do grão. Em adição, estes fungos podem produzir micotoxinas que põem em grande risco a saúde de humanos e animais que consomem os grãos contaminados. O controle biológico é um método de controle fúngico alternativo ao uso de fungicidas químicos e o uso de bactérias provenientes do sistema radicular de plantas de milho é extremamente promissor em função da capacidade competitiva e de sobrevivência destes micro-organismos. O objetivo deste trabalho foi selecionar bactérias do sistema radicular de plantas de milho com potencial para o biocontrole de Aspergillus flavus e Fusarium verticillioides no agroecossistema de cultivo do milho. Foram isolados 1283 colônias bacterianas do sistema radicular de plantas de milho e destas 24 apresentaram atividade antifúngica e 3 foram selecionados para o restante do trabalho. Os três isolados selecionados foram identificados como Bacillus safensis RF69, B. amyloliquefaciens RP103 e B. subtilis RP242. Os isolados foram capazes de reduzir a taxa de crescimento micelial in vitro dos dois fungos, assim como foram capazes de reduzir a produção, germinação e sobrevivência de conídios. Foi detectada a produção de iturina A pelos isolados B. amyloliquefaciens RP103 e B. subtilis RP242, caracterizando este metabolito como um dos responsáveis pela atividade antifúngica. Os isolados B. amyloliquefaciens RP103 e B. subtilis RP242 demonstraram a manutenção da dominância frente a A. flavus e F. verticillioides in vitro em diferentes condições ambientais, caracterizando alta eficácia no controle fúngico em situações de stress hídrico e de térmico. A bacterização de sementes com os três isolados foi efetiva na proteção radicular frente aos dois fungos, assim como levou ao aumento do comprimento e peso das plântulas, da taxa de emergência de plântulas e na germinação de sementes. Os isolados foram capazes de reduzir drasticamente as contagens fúngicas em solo não-rizosférico e no grão de milho, reduzindo também a concentração de aflatoxina B1 e fumonisina B1 nos grãos. Os isolados demonstraram-se extremamente promissores para serem utilizados em um bioformulado objetivando o controle micotoxigênico em plantas de milho em diferentes etapas da produção de grãos. / Toxigenic fungi Aspergillus flavus and Fusarium verticillioides may colonize maize grains on the field and during storage, leading to yield and quality losses, mainly by the production of aflatoxin B1 and fumonisin B1, carcinogenic and potentially carcinogenic mycotoxins, respectively. Biological control is a promising alternative control method and the usage of soil bacteria as biocontrol agents has great potential due to survival and competitive characteristics of those microorganisms. The objective of this study was to select bacteria from maize root system with potential to biocontrol Aspergillus flavus and Fusarium verticillioides on the agroecosystem of maize. We isolated 1283 bacterial colonies from maize root system, 24 of them presented antifungal activity and three were selected for the rest of the study. Selected isolates were identified as Bacillus safensis RP69, B. amyloliquefaciens RP103 and B. subtilis RP242. The isolates were capable to reduce in vitro mycelial growth rate of both fungi and reduce conidial production, germination and survival. Iturin A production was detected by B. amyloliquefaciens RP103 and B. subtilis RP242, characterizing this metabolite as one of the responsible for the antifungal activity. Isolates B. amyloliquefaciens RP103 and B. subtilis RP242 maintained in vitro dominance towards A. flavus and F. verticillioides in different environmental conditions, characterizing high efficacy on fungal control even in water and temperature stress situations. Seed bacterization was effective on root protection towards both fungi, as well as increased seedling length and weight, emergency rate and seed germination percentage. The isolates were able to reduce fungal counts on non-rhizospheric soil and on grain, and were able to decrease aflatoxin B1 and fumonisin B1 final concentrations on maize grain. The selected isolates shown extremely promising to be used as biocontrol agents on a bioformulated product aiming mycotoxigenic control on maize plants during different steps of grain production.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Microbiana, 2014. / Submitted by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2014-10-16T19:08:21Z No. of bitstreams: 1 2014_FrancileneLopesdaSilva.pdf: 2838227 bytes, checksum: 2ba894041194431b0f5e7d4cf0cf231e (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2014-10-16T19:09:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_FrancileneLopesdaSilva.pdf: 2838227 bytes, checksum: 2ba894041194431b0f5e7d4cf0cf231e (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-16T19:09:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_FrancileneLopesdaSilva.pdf: 2838227 bytes, checksum: 2ba894041194431b0f5e7d4cf0cf231e (MD5) / Algumas espécies de Trichoderma quando em íntima associação com plantas hospedeiras podem desencadear sua resposta de defesa e, desta forma, induzir resistência contra subsequentes infecções fúngicas. No presente trabalho foi analisado a expressão dos genes codificadores de proteínas de defesa (Glu, Chit 1, LOX, PER e PAL) em feijoeiro comum, Phaseolus vulgaris, em resposta à asssociação com os isolados das espécies T. asperellum (468/02) e T. harzianum (475/2 e 303/2), após 24, 48 e 72 horas de interação; Além disso, foi analisado o secretoma da interação entre o feijoeiro comum e o isolado 303/02 visando mapear proteínas com papel na interação entre T. harzianum e feijoeiro comum em um sistema hidropônico. A presença do T. asperellum 468/02 e T. harzianum 457/02 aumentaram a expressão dos genes de defesa do feijoeiro Chit, Glu e PAL durante as primeiras 24h de interação. Um aumento mais tardio, com 72 h, foi observado na expressão desses mesmos genes de defesa em feijoeiro na presença T.harzianum 303/02. O gene PER teve sua expressão aumentada com 48 h de interação para os três isolados. O aumento na expressão do gene LOX foi baixa para os isolados 468/02 e 457/02 e não foi observado aumento para o isolado 303/02. A análise por LC-MS/MS do secretoma de T. harzianum 303/02 crescido na ausência da planta hospedeira permitiu a identificação de 185 proteínas, identificadas principalmente com enzimas hidróliticas (27 %), como as α ou β-1,3-, 1,4 e 1,6 glicanase, quitinases, e algumas poteases (16,5 %) como as serina e aspartato proteases. Uma cerato-platanina e uma alginato liase também foram identificadas nesta condição. A análise do secretoma da condição Co-cultivo (Feijoeiro comum/ T. harzianum) permitiu a identificação de 165 proteínas, sendo também a maioria formada por glicosil hidrolases (quitinase and glicanases). Estas mesmas sequências foram pareadas com o banco de dados de Phaseolus vulgaris, resultando na identificação de 7 proteínas de plantas: 2 glicosil hidrolases (famílias 17 e 18) proteínas relacionadas a patogênese e inibitores de proteases. Em ambas as condições foram encontradas muitas proteínas sem anotação no banco de dados. Não foram identificadas proteínas no secretoma da planta crescida sozinha. Os resultados obtidos sugerem que os isolados T. harzianum 457 e 303/02 e T. asperellum 468/02 agem como moduladores de resposta de defesa da planta. Provavelmente, eles desencadeiam a expressão de genes de defesa ou genes que codificam enzimas que participam da produção de compostos secundários envolvidas na resposta de defesa da planta. Estudos futuros serão realizados para confirmar a capacidade desses fungos de modular a resposta de defesa do feijoeiro comum bem como para mapear proteínas fúngicas envolvidas nesta interação. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Trichoderma species may trigger their defense responses and induce resistance against subsequent fungal infections. In the present work, the expression pattern of genes encoding defense proteins (Chit, Glu, LOX, PER and PAL) in common bean, Phaseolus vulgaris, was evaluated in response to association with T. asperellum (strain 468/02) and T. harzianum (strains 457/02 and 303/02) after 24, 48 and 72 hours of interaction. In addition, the secretome of this interaction was analyzed to mapp proteins playing a role in the association between T. harzianum and bean in a hydroponic system. The presence of T. asperellum 468/02 and T. harzianum 457/02 increased the expression of defense genes Chit, Glu and PAL in common bean during the first 24 hours of interaction. By contrast, a late increase, with 72 h, in the expression of these same defense genes in common bean was observed in the presence of T. harzianum 303/02. PER gene expression was increased with 48 h of interaction for all isolates. The increase in LOX gene expression was low for 468/02 and 457/02 strains and no increased was observed for 303/02 strain. LC-MS/MS analysis of the secretome T. harzianum 303/02 grown in the absence of the host plant led to the detection of 185 proteins, mostly identified as hydrolytic enzymes (27%), such as α or β-1,3-, 1,4 and 1,6 glucanases, chitinases, and some proteases (16.5%), such as serine and aspartate proteases. A cerato-platanin and an alginate lyase were also identified on this condition. Secretome analysis of the co-culture condition (common bean/T. harzianum 303/02 isolate) led to the detection of 165 proteins, mostly identified as glycosyl hydrolases (chitinases and glucanases). These sequences were mapped to P. vulgaris database, resulting in the identification of 7 plant proteins, 2 glycoside hydrolases (family 17 and 18), pathogenesis-related proteins and protease inhibitors. No proteins were identified when the plants were grown in the absence of T. harzianum 303/02. The results obtained suggested that T. asperellum 468/02 and T. harzianum (457/02 and 303/02) act as inducers of defense common bean. Probably, they triggered the expression of defense genes or genes encoding enzymes pertaining to secondary compounds pathways with roles in plant defense. T. harzianum 303/02 secreted mainly hydrolases (glycosyl hydrolases and proteases) in the absence or presence of the host plant. Further studies will be carried out to confirm their ability to modulate common bean defense response as well as to map fungal proteins presenting role in this association.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2014. / Submitted by Thomaz Siqueira Araujo (thomaz001.ta@gmail.com) on 2015-05-06T18:13:17Z No. of bitstreams: 1 2014_NédioRodrigoTormen.pdf: 1088713 bytes, checksum: 77829b02405687d8043add07a761209c (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2015-05-06T20:39:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_NédioRodrigoTormen.pdf: 1088713 bytes, checksum: 77829b02405687d8043add07a761209c (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-06T20:39:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_NédioRodrigoTormen.pdf: 1088713 bytes, checksum: 77829b02405687d8043add07a761209c (MD5) / A soja (Glycine max L.) é atualmente o principal produto do agronegócio brasileiro e contribui de forma expressiva para o desenvolvimento do país. A ocorrência de doenças está entre os principais fatores que limitam as maiores produtividades e algumas doenças consideradas menos severas, como a seca da haste e da vagem, têm sido ignoradas. Este trabalho objetivou avaliar o efeito do espaçamento entre linhas, cultivares de soja e fungicida sobre a incidência da seca da haste da soja causada por Diaporthe phaseolorum var. sojae e sobre a produtividade da cultura. O ensaio foi instalado em campo em duas épocas de semeadura (15/11 e 15/12/2012) em Planaltina/DF. O delineamento experimental utilizado foi de blocos completos ao acaso, em esquema de parcelas subsubdivididas, com quatro repetições. Foram testados três espaçamentos entre linhas (42, 60 e 75 cm), duas cultivares de soja (“Syn1180RR” e “Syn1080RR”) e o fungicida boscalida (500 g i.a. ha-1), aplicado nos estádios R1 e R3 da soja, além da testemunha sem controle. As variáveis mensuradas foram a estatura das plantas, número de ramos, incidência da doença em hastes e sementes de soja, peso de 100 grãos e produtividade. Os resultados obtidos permitem concluir que a ampliação do espaçamento entre linhas favoreceu a incidência da doença em hastes e sementes de soja, houve diferença de suscetibilidade entre as cultivares (“Syn1180RR” mais susceptível; “Syn1080RR” menos susceptível) e a aplicação de fungicida reduziu a incidência da doença. O terço superior foi mais afetado pela doença em comparação com o mediano e inferior. A seca da haste e da vagem reduziu a produtividade da soja. ______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Currently, soybean (Glycine max L.) represents important role on Brazilian agribusiness and contribute significantly for the economical development of Brazil. The occurrence of diseases corresponds to an important factor limiting greater yield rates and some diseases considered to be less severe, as the stem blight, have been ignored. This work aims to assess the effect of row spacing, cultivar and fungicide on the incidence of soybean stem blight and yield. The experiment was carried out under field conditions, in two seedling times (11/15/2012 and 12/15/2012) in Planaltina/DF. The treatments were arranged on randomized blocks design, with a split-split plot arrangement and four replicates. The treatments evaluated were row spacing (42, 60 and 75 cm), soybean cultivars (“Syn1180RR” and “Syn1080RR”) and the fungicide boscalid (500 g a.i ha-1), sprayed at R1 and R3 soybean growth stages, and a control plot without fungicide. The parameters evaluated were plant height, branch number per plant, disease incidence on stems and seeds, seed weight and yield. The data obtained suggests that broader row spacing induced greater disease incidence in stems and seeds, there was difference between cultivars in terms of susceptibility (“Syn1180RR” more susceptible; “Syn1080RR” less susceptible) and fungicide applications reduced the disease incidence. The stem blight incidence was higher at the top parts of the plants. The disease reduced the yield of soybean crop.