abstract: The Upper Verde River of central Arizona flows through a landscape of complex geology at the meeting of seven biotic communities and three physiographic provinces. This has resulted in notably diverse flora and fauna and a hub of rare and endemic plant species. The river has sustained cultures since pre-history, however current regional water use is predicted to diminish streamflow over the next century. Prior to this project, no floristic inventory had been conducted along any section of the Verde. The purpose of this study was to develop a Flora of the Upper Verde River, with the goals of documenting rare and endemic species, the composition and abundance of wetland plants, and the factors shaping plant diversity in the region. I made a total of 1856 collections and reviewed past collections to produce a checklist of 729 vascular plant taxa in 403 genera and 98 families. The most species-rich family is the Poaceae, followed by Asteraceae and Fabaceae. The flora includes 159 wetland taxa, 47 endemics, and 26 taxa of conservation concern, eight of which are Federally listed. Several new populations were found in these categories and of rarely-collected taxa including one state record, three county records and several range extensions. I report on the local status of several endemics, wetland taxa with limited distributions, and relict populations of a tepary bean (Phaseolus acutifolius) that were likely transported to the region and cultivated by pre-Columbian cultures. I categorize thirteen distinct plant communities, the most abundant being Pinyon/Juniper Woodland, Chihuahuan/Apacherian Scrub, and Riparian Deciduous Forest. Four primary factors influence floristic diversity of the Upper Verde region: 1) a location at the junction of three physiographic and floristic provinces—represented by co-occurrence of species with affinities to the Sonoran, Intermountain and Madrean regions, 2) geologic diversity—as distinct groups of species are associated with particular geologic types, 3) topographic and habitat complexity—allowing species adapted to disparate environments to co-occur, and 4) human introductions—since over 15% of the flora is composed of introduced species from Eurasia and several taxa were introduced to the region and cultivated by pre-Columbian cultures. / Dissertation/Thesis / Masters Thesis Plant Biology 2015

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:10:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FrancinaldoLS_DISSERT.pdf: 2544554 bytes, checksum: b9889e7b0f272a12f69ccee6cb6a3d3b (MD5) Previous issue date: 2011-05-16 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / Flowering is controlled by several environmental and endogenous factors, usually associated with a complex network of metabolic mechanisms. The gene characterization in Arabidopsis model has provided much information about the genetic and molecular mechanisms that control flowering process. Some of these genes had been found in rice and maize. However, in sugarcane this processe is not well known. It is known that early flowering may reduce its production up to 60% at northeast conditions. Considering the impact of early flowering in sugarcane production, the aim of this work was to make the gene characterization of two cDNAs previously identified in subtractive cDNA libraries: scPKCI and scSHAGGY. The in silico analysis showed that these two cDNAs presented both their sequence and functional catalytic domains conserved. The results of transgenic plants containing the overexpression of the gene cassette scPKCI in sense orientation showed that this construction had a negative influence on the plant development as it was observed a decrease in plant height and leaf size. For the scPKCI overexpression in antisense orientation it was observed change in the number of branches from T1 transgenic plants, whereas transgenic T2 plants showed slow development during germination and initial stages of development. The other cDNA analyzed had homology to SHAGGY protein. The overexpression construct in sense orientation did not shown any effect on development. The only difference observed it was an increase in stigma structure. These results allowed us to propose a model how these two genes may be interact and affect floweringdevelopment. / A flora??o ? controlada por diversos fatores como condi??es ambientais e fatores end?genos que se associam em uma rede de mecanismos bastante complexos. A caracteriza??o funcional de alguns genes realizada no modelo vegetal A. thaliana tem fornecido muitas informa??es a respeito dos mecanismos gen?ticos e bioqu?micos que controlam a flora??o. Existem muitos hom?logos descritos em diversas esp?cies, inclusive em plantas de interesse agron?mico, como: arroz e milho. Em cana-de-a??car pouco se sabe sobre esse processo, embora o estudo nessa cultura seja muito importante, uma vez que a flora??o precoce pode acarretar perdas substanciais no teor de sacarose que podem chegar a at? 40% da produ??o. Com isso, o objetivo deste trabalho foi caracterizar a fun??o de dois cDNAs, identificados anteriormente em bibliotecas subtrativas scPKCI e scSHAGGY, por meio de an?lises in silico e a superexpress?o g?nica nas orienta??es senso e antisenso utilizando plantas de Nicotiana tabacum. Os resultados obtidos com a an?lise in silico permitiram observar que os dois cDNAs encontram-se bem conservados, com dom?nios catal?ticos funcionais. Os resultados das plantas transg?nicas contendo o cassete de superexpress?o do gene scPKCI na orienta??o senso mostrou que esta constru??o influenciou negativamente no desenvolvimento normal de plantas de tabaco transg?nicas acarretando a diminui??o da altura m?dia das plantas e da ?rea foliar. Para superexpress?o de scPKCI em orienta??o antissenso, foi observado altera??es no n?mero de ramifica??es das plantas transg?nicas T1, enquanto que as plantas transg?nicas T2 apresentaram o in?cio do desenvolvimento atrasado. Para o outro cDNA analisado, os resultados obtidos mostraram que a superexpress?o do cDNA scSHAGGY na orienta??o senso n?o alterou o desenvolvimento das plantas, por?m a planta apresentou um aumento no tamanho da estrutura floral do gineceu em 100% das flores analisadas (dez flores em seis plantas). Os nossos resultados juntamente com resultados existentes na literatura com outras plantas permitem propor que os cDNAs scPKCI e scSHAGGY estariam envolvidos no processo de flora??o em cana-de-a??car.

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:10:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ValeskaDSS_DISSERT.pdf: 2384968 bytes, checksum: cf4765fd0b42fd627fcb0ce0d604be1e (MD5) Previous issue date: 2011-10-18 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The flowering is a physiological process that it is vital for plants. This physiological process has been well studied in the plant model Arabidopsis, but in sugarcane this process is not well known. The transition of the shoot apical meristem from vegetative to flowering is a critical factor for plant development. At Brazil northeastern region, the transition to flowering in sugarcane has an important effect as it may reduce up to 60% its production. This is a consequence of the sugar translocation from stalks to the shoot apical meristem which is necessary during the flowering process. Therefore, the aim of this work was to explore and analyze cDNAs previously identified using subtractive cDNA libraries. The results showed that these cDNAs showed differential expression profile in varieties of sugarcane (early x late flowering). The in silico analysis suggested that these cDNAs had homology to calmodulin, NAC transcription factor and phosphatidylinositol, a SEC14, which were described in the literature as having a role in the process of floral development. To better understand the role of the cDNA homologous to calmodulin, tobacco plants were transformed with overexpression cassettes in sense and antissense orientation. Plants overexpressing the cassette in sense orientation did not flowered, while plants overexpressing the cassette in the antissense orientation produced flowers. The data obtained in this study suggested the possible role from CAM sequence, SEC14 and NAC in the induction/floral development pathway in sugarcane, this is the first study in order to analyze these genes in the sugarcane flowering process. / A flora??o ? um processo fisiol?gico que demanda um alto gasto energ?tico, e ? vital para a planta, pois ? dela que depende sua propaga??o gen?tica. Este processo fisiol?gico tem sido bem estudado no modelo vegetal Arabidopsis, mas em cana-dea??car n?o ? muito conhecido. A transi??o do meristema apical no processo de flora??o ? um fator cr?tico no ciclo de desenvolvimento da planta. No nordeste brasileiro, a transi??o para a flora??o na cana-de-a??car tem um efeito dram?tico, pois pode reduzir em at? 60% a produ??o de a??car ou etanol. Isso porque, o florescimento da cana resulta na isoporiza??o do colmo que ? caracterizado pela transloca??o do a??car presente no colmo para os ?pices meristem?ticos com a finalidade de suprir a necessidade energ?tica durante o processo de flora??o. Portanto, o objetivo desse trabalho foi de prospectar e analisar cDNAs de cana-dea??car que possam estar associados ? flora??o utilizando ferramentas de bioinform?tica e de transgenia. Os resultados mostraram que os cDNAs em estudo apontaram um perfil de express?o diferencial em variedades de cana-de-a??car. As an?lises in silico sugeriram que os cDNAs estudados apresentam similaridade para calmodulina, fator de transcri??o NAC e fosfatidilinositol, uma SEC14, as quais foram descritas na literatura como tendo um papel no processo de desenvolvimento floral. Para entender melhor o papel do cDNA hom?logo ? calmodulina, plantas de tabaco foram transformadas com cassetes de superexpress?o nas orienta??es sense e antisense contendo o promotor 35S. Plantas superexpressando o cassete na orienta??o senso n?o floresceram, enquanto que plantas superexpressando o cassete na orienta??o antissense apresentaram o desenvolvimento reprodutivo. Os dados obtidos nesse trabalho apontam para o poss?vel papel de CAM, NAC e SEC14 na via de indu??o/desenvolvimento floral em cana-de-a??car, sendo um dos primeiros trabalhos a se estudar esses genes no processo de flora??o nesse organismo

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2016-07-21T17:14:40Z No. of bitstreams: 1 AmandaLarissaMarquesDeMedeiros_TESE.pdf: 2401701 bytes, checksum: 6c9f1744f688fa158feed1ba0fad56b1 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2016-07-22T11:33:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 AmandaLarissaMarquesDeMedeiros_TESE.pdf: 2401701 bytes, checksum: 6c9f1744f688fa158feed1ba0fad56b1 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-22T11:33:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AmandaLarissaMarquesDeMedeiros_TESE.pdf: 2401701 bytes, checksum: 6c9f1744f688fa158feed1ba0fad56b1 (MD5) Previous issue date: 2015-10-16 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / A cana-de-a??car ? uma importante cultura para nosso pa?s, que contribui com quase metade de toda a produtividade mundial. Muitos desafios s?o enfrentados pelas plantas, que muitas vezes n?o atingem todo o seu potencial gen?tico devido a presen?a de estresses bi?ticos e abi?ticos. Como consequ?ncia, esses estresses podem gerar esp?cies reativas de oxig?nio, que podem danificar o material gen?tico. Outra consequ?ncia do estresse ? a flora??o precoce, que diminui tamb?m a produtividade da cana-de-a??car. Neste contexto, este trabalho apresenta como objetivos caracterizar os genes scMUTM1 e scMUTM2, duas DNA glicosilases pertencentes ? via de reparo por excis?o de base (BER), al?m de identificar transcritos potencialmente relacionados com estresse e reparo de DNA, em duas variedades com fen?tipo contrastante para flora??o. A caracteriza??o das glicosilases incluiu a constru??o de cassetes de express?o de prote?nas, para posterior purifica??o e uso em ensaios enzim?ticos; constru??o de ?rvore filogen?tica e an?lise de promotor deste gene. Com a reconstru??o filogen?tica de MUTM foi poss?vel observar que h? o agrupamento desta sequ?ncia em um ramo com monocotiled?neas e outro com dicotiled?neas. Isto sugere que a duplica??o desta sequ?ncia pode ter ocorrido depois da diverg?ncia desses dois grupos. Com a an?lise do promotor deste gene, ? sugerido que, provavelmente, o gene ScMUTM1 pode estar sofrendo subfuncionaliza??o, uma vez que a regi?o promotora do gene ScMUTM2 apresenta uma maior quantidade de sequ?ncias regulat?rias relacionadas ao estresse. Por meio das an?lises de express?o g?nica utilizando microarranjos, se observou a superexpress?o de genes relacionados ao estresse de forma marcante em uma das condi??es de an?lise relacionadas com flora??o precoce. / Sugarcane is an important culture for Brazil that holds almost half of all worldwide productivity. Plants face many challenges, because of biotic and abiotic stresses presents in the production field, which could prevent plants from reaching their genetic potential. As consequence, those stresses can generate Reactive Oxygen Species ? ROS ? that can cause damages on DNA. Another consequence of stress is the early-flowering process, which contributes for a reduction on yield. In this context, the aim of this work is to characterize ScMUTM1 and ScMUTM2, two DNA glycosylases belonging to base excision repair pathway; and identify genes potentially related to stress and DNA repair in two sugarcane cultivars with contrasting flowering phenotypes. The characterization of the DNA glycosylases included the construction of vector to over express the recombinant proteins ScMUTM1 and ScMUTM2; they will be used in a near future to purification of these proteins and use in enzymatic assays. It was also made a phylogenetic reconstruction of this gene in plants and analysis of its promoter. With the phylogenetic analysis, it is possible to observe the presence of these genes grouped inside a branch with monocots and another one with dicots. This suggests that the duplication of this gene probably occurred after the separation of these two groups. The analysis of the promotor of MUTM shows of the presence of stress-related regulatory motifs at ScMUTM2 promoter, when compared with ScMUTM1. This may suggests that ScMUTM1 might be suffering sub functionalization process. After the analysis of microarrays data, it is observed an up-regulation from some stress-related genes in one of the conditions analyzed, related to early flowering process.

Perturbações ambientais foram detectadas em sistema de turfeira no sul da Bacia do Paraná (Mina de Faxinal, Formação Rio Bonito) durante o Eopermiano (idade radiométrica 291 ± 1.3 Ma, topo do Sakmariano) sob vigência de período climático pós-glacial da Idade do Gelo do Neopaleozoico. Além da detecção de incêndios recorrentes, foi identificado um evento de incêndio autóctone/hipoautóctone em vegetação arbórea em um horizonte no carvão contendo grandes fragmentos de lenhos queimados comprimidos (21,8 x 13.4 cm). A influência de vulcanismo está registrada sob a forma de uma camada de tonstein (cinza vulcânica sedimentada) intercalada ao carvão, onde estão incluídas abundantes compressões de folhas glossopterídeas. A análise do carvão consistiu em determinação de refletância sob óleo de macerais do grupo inertinita em blocos polidos para confirmar a identificação de carvão vegetal macroscópico e ocorrência de incêndios na turfeira. Adicionalmente, a observação da matéria orgânica sob fluorescência nos blocos revelou que os incêndios não afetaram a microflora, mas alteração na fluorescência evidenciou dessecação ambiental, verificada também em lâminas palinofaciológicas. Sob microscopia eletrônica de varredura, o carvão vegetal apresentou paredes celulares homogeneizadas, indicando temperaturas de queima acima de 325ºC, mas não superiores a 400ºC devido aos baixos resultados de refletância e à preservação de tecido vegetal delicado. A preservação de floema secundário, em associação orgânica com xilema tipo Agathoxylon, é registrada ineditamente. A observação sob microscopia de luz transmitida das cutículas foliares extraídas do tonstein permitiu descrição detalhada de padrões xeromórficos que ocorrem de forma endêmica nas epidermes de glossopterídeas de Faxinal e foram atribuídos a respostas adaptativas às frequentes perturbações ambientais que afetaram a floresta turfosa, tais como incêndios recorrentes por dessecação ambiental cíclica ou influência de vulcanismo regional. Esses fatores, em conjunto ou alternativamente, garantiram a dominância monotípica de Glossopteris pubescens nom. nov. na comunidade. O conjunto de evidências indicou que os incêndios foram de superfície, em baixas temperaturas, o transporte do carvão vegetal foi praticamente inexistente no horizonte de grandes fragmentos de lenhos queimados e que os demais incêndios recorrentes tiveram pouco efeito na comunidade proximal, ocorrendo regularmente nas áreas de entorno da turfeira dado o aporte de carvão vegetal macroscópico fragmentário. Durante a fase de aquecimento pós-glacial no Permiano, os ambientes de turfeira no Gondwana eram altamente suscetíveis à ocorrência de incêndios dos quais as glossopterídeas se beneficiavam para manter sua dominância e abundância nessas comunidades, por possuírem eficiente plasticidade adaptativa para sobreviver a condições extremas em ambientes altamente perturbados. / Environmental disturbances were detected in a peat-forming environment from the southern Brazilian Paraná Basin (Faxinal Coalfield, Rio Bonito Formation) during the lower Permian (radiometric age 291 ± 1.3 Ma, late Sakmarian) under post-glacial conditions in the Late Paleozoic Ice Age. In addition to recurrent wildfires, an autochthonous/hypauthochthonous wildfire event was identified in the woody vegetation from a coal horizon containing compressed, large-sized logs (21,8 x 13.4 cm). Volcanic influence is recorded in a tonstein layer (sedimentary volcanic ash) interbedded in the coal, where abundant compressed glossopterid leaves are entombed. The coal analysis consisted of reflectance measurements in polished blocks under oil of macerals of the inertinite group to confirm the macroscopic charcoal identification and wildfire occurrence in the peatland. Additionally, the observation of the organic matter in the polished block under fluorescence showed that the microflora has not been affected by the wildfires, but altered fluorescence evidenced environmental dryness, verified in palynofacies slides as well. Under scannin electron microscopy, the charcoal showed homogenized cell walls, indicating burning temperatures higher than 325ºC, but not higher than 400ºC given the low reflectance values and the preservation of fragile plant tissue. The preservation of secondary phloem in organic association with Agathoxylon wood-type is a first paleobotanical record. Observation under transmitted light of the leaf cuticles extracted from the tonstein allowed for the detailed description of xeromorphic patterns, which have been attributed to adaptative responses to the frequent environmental disturbances affecting the peat forest, such as recurrent wildfires due to environmental dryness or regional volcanic activity. These factors, collectively or in an alternating way, ensured the monotypic dominance of Glossopteris pubescens nom. nov. in the plant community. The set of evidences indicated low temperature surface fires, virtually inexistent charcoal transport in the charcoalified log horizon and that the other wildfire events had little effect in the proximal community, occurring regularly in the surrounding areas of the peatland given the fragmentary macroscopic charcoal input. During the postglacial warming in the Permian, the Gondwanan peatlands were highly susceptible to wildfires from which the glossopterids benefited to maintain their dominance and abundance in these communities due to efficient adaptative plasticity to survive under extreme conditions in highly disturbed environments.

Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2018-05-23T13:45:08Z No. of bitstreams: 1 PDF - Thaynara de Sousa Silva.pdf: 34287017 bytes, checksum: 22416d1f2b99293f468c0308f4d7a80d (MD5) / Rejected by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br), reason: Por quê tu pediu. on 2018-05-23T13:56:59Z (GMT) / Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2018-05-23T14:06:08Z No. of bitstreams: 1 PDF - Erimágna de Morais Rodrigues.pdf: 31135497 bytes, checksum: ffe62aa00a7bcf49250eff902e02c26d (MD5) / Approved for entry into archive by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2018-05-23T16:50:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PDF - Erimágna de Morais Rodrigues.pdf: 31135497 bytes, checksum: ffe62aa00a7bcf49250eff902e02c26d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-23T16:50:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Erimágna de Morais Rodrigues.pdf: 31135497 bytes, checksum: ffe62aa00a7bcf49250eff902e02c26d (MD5) Previous issue date: 2018-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Fabaceae is one of the most numerous angiosperm families in the world, with cosmopolitan distribution; being found from the Alps to the plains. In the Caatinga biome, it is the most taxonomically diverse, even in rocky outcrops. Over the years, the family has undergone numerous changes in its classification and recent phylogenetic studies have shown that some of its genera are paraphyletic, which resulted in the establishment of six subfamilies for Fabaceae. This work aimed to present a floristic-taxonomic study of Fabaceae, in a rocky outcrop situated in the semi-arid region of Paraiba, Brazil. Biweekly collections were made throughout the rocky outcrop, through random walks, from May / 2016 to June / 2017, for the collection of botanical material in the reproductive stage. The samples obtained in the field were dried according to the conventional recommendations in vegetal taxonomy and incorporated in the Manuel Arruda Câmara Herbarium (ACAM), of the State University of Paraíba (UEPB), Campus I, Campina Grande. Taxon identifications were based on the family bibliography as well as specialist consultations. Twenty - eight species belonging to three subfamilies: Caesalpinioideae (12 spp.), Detarioideae (01 sp.) and Papilionoideae (15 spp.) were recognized. Among the species found, two of them constitute new records for the state of Paraíba, Ancistrotropis peduncularis and Crotalaria pallida. The treatment includes taxonomic descriptions, key for genera and species, flowering data and fruiting and geographic distribution, as well as photographic records of the species found. / Fabaceae é uma das mais numerosas famílias de angiospermas do globo, com distribuição cosmopolita; sendo encontrada dos Alpes às planícies. No bioma Caatinga, é a mais diversificada taxonomicamente, inclusive em afloramentos rochosos. Ao longo dos anos, a família tem passado por inúmeras mudanças no que diz respeito à sua classificação e estudos filogenéticos recentes demonstraram que alguns dos seus gêneros são parafiléticos, o que resultou no estabelecimento de seis subfamílias para Fabaceae. Este trabalho teve por objetivo apresentar estudo florístico-taxonômico de Fabaceae, em um afloramento rochoso situado no semiárido paraibano, Brasil. Foram feitas coletas quinzenais em todo o afloramento rochoso, através de caminhadas aleatórias, no período de Maio/2016 a Junho/2017, para a coleta de material botânico em estado reprodutivo. As amostras obtidas em campo foram herborizadas de acordo com as recomendações convencionais em taxonomia vegetal e incorporadas no Herbário Manuel Arruda Câmara (ACAM), da Universidade Estadual da Paraíba (UEPB), Campus I, Campina Grande. As identificações dos táxons foram baseadas na bibliografia da família, além de consultas a especialista. Foram reconhecidas 28 espécies pertencentes a três subfamílias: Caesalpinioideae (12 spp.), Detarioideae (01 sp.) e Papilionoideae (15 spp.). Dentre as espécies encontradas, duas delas constituem novos registros para o estado da Paraíba, Ancistrotropis peduncularis e Crotalaria pallida. O tratamento inclui descrições taxonômicas, chave para gêneros e espécies, dados de floração e frutificação e distribuição geográfica, além de registros fotográficos das espécies encontradas.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2018-06-28T21:45:15Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elaine Jacob da Silva Carmo - 2014.pdf: 2742268 bytes, checksum: fd6fe95f8bb324db0eecf821189064ec (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-06-29T11:52:35Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elaine Jacob da Silva Carmo - 2014.pdf: 2742268 bytes, checksum: fd6fe95f8bb324db0eecf821189064ec (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-29T11:52:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elaine Jacob da Silva Carmo - 2014.pdf: 2742268 bytes, checksum: fd6fe95f8bb324db0eecf821189064ec (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-03-21 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Ribeirão Leite is considered as one of the main sources of public water supply for the city of Goiânia and its metropolitan region. The soil in the watershed is principally used for agro-pastoral activities that may favor the supply of nutrients such as phosphorus and nitrogen for the water reservoir and consequently for the formation of blooms of microalgae and cyanobacteria. No floristic studies of cyanobacteria have been carried out for this reservoir, which is recently formed, however there has been pre-dominance of potentially toxic planktonic cyanobacteria during the filling of this reservoir, which reflects the limnological conditions of the Ribeirão Leite basin. The present study aims to identify and characterize the morphospecies of cyanobacteria and evaluate structure and dynamics of populations. The sample period comprised the date from January 2010 to January 2011, which was filling stage, with the collection of phytoplankton and limnologicals carried out twice a week until the first half of May 2010, and from this date, it was repeated weekly. Physicochemical and also qualitative and quantitative analyzes of phytoplankton were performed in water analysis laboratory of Saneago. Specimens of cyanobacteria were analyzed with microscopy “Zeiss Axiostar plus”, and micro-photographed with image capture system “Axiocam ERc5s” and also with imaging system “Axiovision”. The initial phase of filling of the reservoir demonstrated the greatest efficiency on rainy period of the year, nevertheless, the intermediate phase, which was on dry period, showed lower efficiency. The blooms were observed as characteristics of rainy periods of the year. In the first period, there was the dominance of Geitlerinema amphibium and Cylindrospermopsis raciborskii and in the second period, Aphanocapsa delicatissima was observed as dominant. It was monitored that during the filling phase, there was predominance of filamentous cyanobacteria and in the final phase, dominance was of the colonial organisms. The PCA indicated that the explanatory variables of the system were turbidity, total phosphorus and Secchi disk depth extinction coefficient (axis 1 to 31.7%). In Canonical Correspondence Analysis (CCA), sampling units were influenced on the 1º axis by the dominance of G. amphibium at the stage of filling, when the turbidity was high and Secchi depth (axis 1 to 14.8%, p <0.05; environment correlation of species 0.806) was lower. The Detrended Correspondence Analysis confirmed the distribution of taxa among different climatic periods. For the state of Goiás, 28 taxa were mentioned for the first time / Cianobactérias planctônicas do reservatório do Ribeirão João Leite (Goiás) durante a fase de enchimento: florística e floração. O Ribeirão João Leite é um dos principais mananciais de abastecimento público de água para a Cidade de Goiânia e região metropolitana. O solo da bacia hidrográfica é utilizado principalmente para atividades agropastoris, podendo favorecer o aporte de nutrientes como fósforo e nitrogênio para a água do reservatório e consequentemente a formação de florações de microalgas e cianobactérias. Não há estudos florísticos de cianobactérias para este reservatório, que é recém-formado, contudo houve predomínio de cianobactérias planctônicas potencialmente tóxicas, durante sua fase de enchimento, refletindo as condições limnológicas da bacia do Ribeirão João Leite. O presente estudo objetivou identificar e caracterizar as morfoespécies de cianobactérias e avaliar a estrutura e dinâmica de populações. O período amostral compreendeu janeiro de 2010 a janeiro de 2011, com coletas fitoplanctônicas e limnológicas realizadas duas vezes por semana até a primeira quinzena de maio de 2010 e a partir desta data, semanalmente. Foram realizadas análises físicas e químicas e quali-quantitativas do fitoplâncton no laboratório de análise de água da Saneago. Os espécimes de cianobactérias foram analisados em microscópio Zeiss Axiostar plus, e microfotografados com sistema de captura de imagem Axiocam ERc5s e sistema de imagem Axiovision. A fase inicial de enchimento do reservatório apresentou maior riqueza (período chuvoso) e a fase intermediária (período de seca), a menor riqueza. As florações foram características dos períodos chuvosos. No primeiro período ocorreu a dominância de Geitlerinema amphibium e Cylindrospermopsis raciborskii e no segundo período Aphanocapsa delicatissima. Notou-se que durante a fase de enchimento ocorreu predomínio de cianobactérias filamentosas e na fase final predomínio de organismos coloniais. A PCA indicou que as variáveis explicativas do sistema foram turbidez, fósforo total, profundidade de extinção do disco Secchi (eixo 1 – 31,7%). Na Análise de Correspondência Canônica (CCA) as unidades amostrais foram influenciadas no 1º eixo pela dominância de G. amphibium na fase de enchimento, quando a turbidez foi elevada e a profundidade de extinção do disco Secchi menor (eixo 1 – 14,8%; p<0,005; correlação espécie ambiente 0,806). A Análise de Correspondência Destendenciada confirmou a distribuição de táxons distintos dentre os períodos climáticos. Para o estado de Goiás foram citados 28 táxons pela primeira vez.

A suinocultura brasileira encontra-se atualmente em um nível técnico de destaque no contexto mundial. Entretanto, diversas estratégias são utilizadas para restringir a compra dos produtos brasileiros por países estrangeiros, em especial barreiras sanitárias. Os objetivos desse trabalho foram determinar a microbiota fúngica da pele de suínos sem lesões aparentes e estabelecer os possíveis agentes micóticos de importância nesta espécie. Foram obtidas 261 amostras de animais com 20 a 120 dias de idade, provenientes de 11 granjas do Rio Grande do Sul. As amostras foram obtidas apenas dos animais com ausência de qualquer patologia. Essas foram semeadas em Agar Sabouraud com cloranfenicol. Obteve-se o crescimento de 509 culturas, sendo 305 (59,92%) fungos filamentosos e 204 (40,08%) leveduras. A distribuição do número de diferentes colônias isoladas por amostra demonstra uma predominância de monocultura no grupo 1 (animais de 20 a 60 dias de idade) em relação ao grupo 2 (animais acima de 60 dias de idade). Dentre os fungos filamentosos septados, ocorreu predominância dos hialohifomicetos (43,03%) em relação aos feohifomicetos (10,41%), enquanto que observou-se apenas 6,48% de filamentosos asseptados. O Aspergillus (22,90%) foi o gênero de hialohifomiceto mais isolado, com predominância do A. flavus (5,70%). Dentre os feohifomicetos, o gênero Cladosporium foi o mais prevalente (9,04%). No que concerne os zygomicetos, o gênero mais isolado foi Mucor (4,13%). Em relação às leveduras, o gênero Candida foi o mais isolado (14,73%), sendo a distribuição de freqüência das espécies: C. albicans (13,56%), C. parapsilopsis (0,59%), C. famata (0,20%), C. tropicalis (0,20%) e outras espécies de Candida (0,20%). A reduzida quantidade de diferentes fungos isolados por amostra nos animais do grupo 1, em relação ao grupo 2, pode ter sido influenciada pela menor quantidade de grãos utilizada na fabricação de ração nos animais mais novos, maior freqüência de limpeza e desinfecção das instalações, bem como a não mistura de animais provenientes de diferentes origens. A alta prevalência do gênero Candida observada em suínos, um gênero normalmente comensal do trato gastrintestinal, se torna importante quando esses animais são acometidos por doenças imunossupressoras. Estudos clínicos longitudinais e/ou infecções experimentais talvez possam definir a importância destes agentes em suínos. / Brazilian pig production has reached a technical and techological level that stands out in international pig production. However, several strategies have been used to limit access of Brazilian pig products to international market, including health barriers. The objective of our work was to determine the fungal flora of the healthy pig skin and to determine possible micotic agents important for this animal species. 261 samples from 20-120 day old pigles were obtained from 11 pig farms from the State of Rio Grande do Sul, Brazil. All sampled animals were negative for any skin lesions. The samples were cultured in Sabouraud agar and cloranfenicol. Cultures were obtained from 509 materials, with 305 (59,95%) filamentous fungi and 204 (40,08%) yeasts. The distribution of different fungi isolated each simple shows a high prevalence on group 1 (20-60 days old) in relation to group 2 (more than 60 days old). Among septated filamentous fungi, there was a great preponderance of hialohifomycetes (43,03%) in relation to feohifomycetes (10,41%), while only 6,48% were aseptated filamentous. Aspergillus (22,90%) was the most isolated genus of hialohifomycetes and A. flavus (5,70%) was the more prevalent specie isolated. As to zygomycetes, the most isolated genus was Mucor (4,13%). Regarding yeasts, the genus Candida was the most prevalent (14,73%) and the species distribution was: C. albicans (13,56%), C. parapsilopsis (0,59%), C. famata (0,20%), C. tropicalis (0,20%) and other Candida species (0,20%). The little quantity isolated per sample could have been influenced by quantity of grains used in pig feed in these different stages of production, types of facilities, stress and environmental changes could be important to imbalance the flora, as well as favoring diffusion of mycosis in the herds. The limited number of different fungi isolated from animal flora on group 1 may have been influenced by the smaller use of grains in the feed mill in this stage, a better cleaning and disinfection of premises, as well as avoiding mixing pigs of different source. Clinical longitudinal studies and/ or experimental infections perhaps may help to define the importance of these fungi to that species.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-08-29T13:37:36Z No. of bitstreams: 1 Lamartine Soares Bezerra de Oliveira.pdf: 1520941 bytes, checksum: 7a290195246c423b4b3a172cd36cdcb0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-29T13:37:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lamartine Soares Bezerra de Oliveira.pdf: 1520941 bytes, checksum: 7a290195246c423b4b3a172cd36cdcb0 (MD5) Previous issue date: 2011-02-16 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The aim of this study was to evaluate the floristic composition, the successional classification, the phytosociological structure and edge effect on the arboreal component into two fragments of Atlantic Forest in the Watershed of the River Tapacurá - PE. The forest fragments evaluated were Mata da Onça and the Mata da Buchada. For collect of the data from the adult component (CBH 15 cm) were located 15 plots of 10 x 25 m arranged in three rows, each row with five equidistant plots 25 m apart. The first row bordering the edge and the other with 50 m interval, dividing the area into three sectors according to the distance from the edge. Within each plot was implemented a sub-plot of 1 x 25m for survey of the natural regeneration survey (CBH < 15 cm and height 1.0 m). In the Mata da Onça were sampled 851 individuals belonging to 31 botanical families, 48 genera and 77 species. Among these species, 82% were considered typical of Atlantic Forest in early succession. In the structure of the adult component the density was estimated at 1,184 ind.ha-1; the diversity and evenness were 3,61 nats.ind-1 and 0,87, respectively; the diameter distribution in inverted "J" and the hypsometric distribution was observed the greatest number of individuals in the first two classes. In the natural regeneration, the density was estimated at 10,853 ind.ha-1; the values of diversity and evenness were 3.45 nats.ind-1 and 0.88, respectively. In the Mata da Buchada 1,025 individuals were sampled, belonging to 26 families, 33 genera and 60 species.In this area occurs predominantly species of early sucessional, which accounted for 74%. In analyzing the structure of the adult component was found density of 1,680 ind.ha-1; the diversity and evenness were 3.06 nats.ind-1 and 0.79, respectively; 41.1% of individuals sampled are in the first class of diameter distribution and in the hypsometric distribution 45% of individuals showed height > 5 m and 10 m. In the regenerative component there was an estimated density of 10,294 ind.ha-1; the Shannon diversity was of 2.96 nats.ind-1 and the evenness of 0.76. In evaluation of edge effect was found that interactions between the anthropic environment and the fragment cause effects on the arboreal community established surrounding areas, and this effect tends to minimize when away from these areas into the interior of the fragment. These results coincided with those observed in different fragments of Atlantic Forest in Pernambuco, which has identified the current composition and structure of these fragments located in the Watershed of the River Tapacurá, as well as, the edge effect exists. Such information is of paramount importance and should be used in actions to recover and restore forest in the region. / O objetivo do presente estudo foi a avaliar a composição florística, a classificação sucessional, a estrutura fitossociológica e o efeito de borda do componente arbóreo em dois fragmentos de Floresta Atlântica na Bacia Hidrográfica do Rio Tapacurá - PE. Os fragmentos florestais avaliados foram a Mata da Onça e a Mata da Buchada. Para coleta dos dados do componente adulto (CAP 15 cm) foram locadas 15 parcelas de 10 x 25 m dispostas em três linhas, cada linha com cinco parcelas equidistantes 25 m entre si. A primeira linha margeando a borda e as demais com 50 m de intervalo, dividindo a área em três ambientes conforme a distância da borda. No interior de cada parcela foi implementada uma sub-parcela de 1 x 25 m para levantamento da regeneração natural (CAP < 15 cm e altura 1,0 m). Na Mata da Onça foram amostrados 851 indivíduos, pertencentes a 31 famílias botânicas, 46 gêneros e 76 espécies. Dentre estas espécies, 82% foram consideradas típicas de Floresta Atlântica de início de sucessão. Na estrutura do componente adulto, a densidade estimada foi de 1.184 ind.ha-1; a diversidade e a equabilidade foram de 3,61 nats.ind-1 e 0,87, respectivamente; a distribuição diamétrica em “J” invertido, e na distribuição hipsométrica foi observado o maior número de indivíduos nas duas primeiras classes. Na regeneração natural, a densidade estimada foi de 10.853 ind.ha-1; os valores de diversidade e equabilidade foram de 3,45 nats.ind-1 e 0,88, respectivamente. Para a Mata da Buchada foram inventariados 1025 indivíduos, pertencentes a 26 famílias botânicas, 33 gêneros e 60 espécies. Nesta área ocorre a predominância de espécies de início de sucessão, que representaram 74%. Na análise da estrutura do componente adulto verificou-se uma densidade de 1.680 ind.ha-1; a diversidade e equabilidade foram de 3,06 nats.ind-1 e 0,79, respectivamente; 41,1% dos indivíduos amostrados encontram-se na primeira classe da distribuição diamétrica e na distribuição hipsométrica 45% dos indivíduos apresentaram altura > 5 m e 10 m. Já no componente regenerante, foi observado uma densidade estimada de 10.294 ind.ha-1; a diversidade de Shannon-Wiener foi de 2,96 nats.ind-1 e a equabilidade observada de 0,76. Na avaliação do efeito de borda, observou-se que as interações entre o ambiente antrópico e o fragmento causam efeitos sobre a comunidade arbórea estabelecida das áreas limítrofes, e este efeito tende a minimizar quando se distancia destas áreas em direção ao interior do fragmento. Esses resultados coincidiram com o observado em diferentes fragmentos de Florestal Atlântica em Pernambuco, os quais permitiram identificar a atual composição e estrutura desses fragmentos localizados na Bacia Hidrográfica do Rio Tapacurá, bem como o efeito de borda existente. Tais informações são de fundamental importância e devem ser utilizadas em ações de recuperação e restauração florestal na região.

O Brasil, como país detentor da maior biodiversidade mundial de plantas, possui um importante papel no desenvolvimento de pesquisas que auxiliem ou viabilizem a identificação de sua diversidade vegetal, como o estudo de marcadores moleculares adequados a esta tarefa. Fabaceae, Lauraceae e Myrtaceae são as famílias mais importantes da Flora Brasileira por apresentarem grande diversidade de gêneros e espécies e serem consideradas de difícil identificação pela taxonomia tradicional. Tendo em vista o potencial do rbcL na identificação molecular de plantas, este trabalho propôs estudar a eficiência deste marcador em identificar gêneros e espécies das três principais famílias de árvores da Flora do Estado de São Paulo. Foi criado um banco de sequências de rbcL contendo 160 espécies, o qual foi testado quanto sua eficiência de identificação através de um teste cego contendo as sequências inteiras (maior que 400 pares de base) e as sequências de tamanho reduzido em 300, 200 e 100 pb. O teste cego também foi realizado no banco de sequências mundial Boldsystems. Para a análise dos resultados foi utilizado o programa BLAST que busca similaridades entre as sequências. Os resultados evidenciaram a viabilidade do método ao mostrar que o rbcL identificou 100% dos gêneros arbóreos de Fabaceae e Myrtaceae, porém não podemos dizer o mesmo para identificar gêneros de Lauraceae e nem em nível específico para qualquer uma das famílias, já o teste de identificação com as sequências reduzidas mostrou que a sequência de rbcL da espécie a ser analisada deve conter mais que 400 pares de base para não comprometer a correta identificação de gênero. / Brazil, as the country with the greatest biodiversity in the world, has an important role in the development of research to help or enables the identification of its plant diversity, such as the study of suitable molecular markers for this task. Fabaceae, Lauraceae and Myrtaceae are the most important families of the Brazilian Flora because they present a large diversity of genera and species and are considered difficult to identify by the traditional taxonomy. Considering the potential of rbcL in the molecular identification of plants, this work aims to study the efficiency of this marker in identifying genera and species of the three main tree families of São Paulo State\'s Flora. A rbcL sequence Bank containing 160 tree species was created in order to test its efficiency through a blind test with whole and reduced sequences using the BLAST program that searches for similarities between sequences. The blind identification test was also performed using the Boldsystems database. The results showed that the rbcL can´t be indicated to identify Lauraceae tree genera, but can be indicated to successfully identify tree genera of Fabaceae and Myrtaceae. The test identification with reduced sequences showed that the analized specie must have at least 400pb to not compromise the correct genera identification.