Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2012. / Submitted by Elna Araújo (elna@bce.unb.br) on 2012-06-29T22:14:08Z No. of bitstreams: 1 2012_ThiagoAlvesSantosdeOliveira.pdf: 2178317 bytes, checksum: 7bd5d4f7fc3d58c0cf01b09cc94e55b8 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-07-05T18:11:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_ThiagoAlvesSantosdeOliveira.pdf: 2178317 bytes, checksum: 7bd5d4f7fc3d58c0cf01b09cc94e55b8 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-05T18:11:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_ThiagoAlvesSantosdeOliveira.pdf: 2178317 bytes, checksum: 7bd5d4f7fc3d58c0cf01b09cc94e55b8 (MD5) / O panorama mundial da fruticultura é bastante dinâmico, influenciado, sobretudo, pelas mudanças edafoclimáticas e pelas doenças de pré e pós-colheita. O mamoeiro (Carica papaya L.) é apreciado no mundo todo e produzido nos países tropicais, principalmente nos estados brasileiros da Bahia e Espírito Santo. Os prejuízos pós-colheita são causados por doenças fúngicas, com destaque para a podridão dos frutos, causada por Phytophthora palmivora, de patossistema pouco estudado. Considerando que o controle químico geralmente é oneroso e impactante ao ambiente, procederam-se neste trabalho, estudos de componentes epidemiológicos e de controle alternativo da podridão dos frutos na pré e pós-colheita. Vinte um isolados de P. palmivora da Coleção de Phytophthora Arnaldo Gomes Medeiros do Centro de Pesquisa da Lavoura Cacaueira (CEPLAC), foram avaliados quanto ao índice e potencial de velocidade de crescimento micelial, produção e potencial de produção de esporos; influência da temperatura, período de molhamento, concentração de inóculo, método de inoculação e estádio de maturação de P. palmivora na severidade da podridão dos frutos de mamoeiro na pós-colheita, assim como o biocontrole da doença com Trichoderma spp. e o controle com fosfitos e Acibenzolar-S-Metil. Os resultados obtidos sugeriram que os isolados de P. palmivora 356 e 1060 foram os mais agressivos e mais virulentos nos estudos in vitro e in vivo. O estádio de maturação e a concentração de inóculo influenciaram no aumento das lesões causadas por P. palmivora, assim como o período de molhamento entre 60-72 horas e a temperatura entre 25-30 °C. Entre os biocontroladores testados, o isolado de Trichoderma spp. 4088 apresentou 88,64% de controle, comportamento estatisticamente semelhante ao fungicida. Já o fosfito de potássio 240 g L-1 de K2O, 340 g L-1 de P2O5 e 5% de C7H6O3 (Reforce® + Acido Salicílico) foi eficiente no controle da doença quando aplicado aos 6 Dias Antes da Colheita (DAC) reduzindo a severidade da doença por meio de retardo na maturação na fruta, diferente do Acibenzolar-S-Metil cuja eficiência foram verificadas quando aplicados depois da colheita. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The global picture of the horticulture is quite dynamic. This picture is influenced by climatic changes and the prevalence of pre and postharvest diseases. Papaya (Carica papaya L.) is produced and appreciated worldwide. This plant is cultivated in tropical countries, such as Brazil. Bahia and Espirito Santo are the most important Brazilian states in papaya production. Postharvest fungal diseases are the main cause of papaya fruit losses. Papaya fruit rot, caused by Phytophthora palmivora, is one of those important diseases. This study was conducted considering the importance of disease and the environmental and economic cost of the chemical control for this disease. Therefore, the main objectives of this work were: to understand the effects of epidemiological factors on disease development and evaluate alternative methods to chemical control. Twenty-one strains of P. palmivora [Laboratory of Phytophthora Collection, Arnaldo Medeiros, Centro de Pesquisa da Lavoura Cacaueira (CEPLAC)] were evaluated, considering the following variables: the index and speed potential of mycelial growth, spore production, production potential and growth spores, assessment of virulence through the injured area, latent period, lesion area, sporulation capacity, influence of temperature, wetness, inoculum concentration, method of inoculation of P. palmivora and fruit maturation stages in the severity of the papaya fruit rot, the effects of biocontrol by Trichoderma spp., and control by phosphites and Acibenzolar-S-Methyl (ASM). The results suggested that P. palmivora isolates 356 and 1060 were the most aggressive. Increases fruit maturation stage, pathogen concentration of inoculum, wet period from 60 to 72 hours, and temperature between 25-30 °C favored increments in disease. Trichoderma isolate 4088 showed 88.64% of disease control. Potassium phosphite 240 g L-1 de K2O, 340 g L-1 de P2O5 e 5% de C7H6O3 (Reforce® + Salicylic Acid) was effective in disease control when applied to the 6 Harvester Day Before (HDB). However, Acibenzolar-S-Methyl was effective when applied in postharvest.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-06-28T14:59:15Z No. of bitstreams: 1 2013_DianaPaolaGomezMendoza.pdf: 3302680 bytes, checksum: 30eebfba95186093786be13ff26f3486 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-06-28T15:12:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_DianaPaolaGomezMendoza.pdf: 3302680 bytes, checksum: 30eebfba95186093786be13ff26f3486 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-28T15:12:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_DianaPaolaGomezMendoza.pdf: 3302680 bytes, checksum: 30eebfba95186093786be13ff26f3486 (MD5) / Trichoderma harzianum é um fungo filamentoso capaz de secretar enzimas hidrolíticas ao meio extracelular as quais agem despolimerizando componentes da biomassa vegetal como celulose e hemicelulose. O conjunto de proteínas secretadas por uma célula é denominado de secretoma, uma subpopulação do proteoma total. Amostras correspondentes ao secretoma de T. harzianum foram obtidas por fermentação submersa (SmF) em meio sintético suplementado com 1 %(m/v) de glicose, celulose, xilana ou bagaço de cana como fonte de carbono. Os secretomas foram posteriormente submetidos à análise proteômica seguindo duas abordagens distintas, eletroforese bidimensional (2-DE) seguida de espectrometria de massas MALDI-TOF/TOF para a identificação de polimorfismos proteicos provenientes do gel, e LC-MS/MS para identificação do total de proteínas presentes em cada amostra. Os secretomas de T. harzianum foram igualmente tratados com a enzima PNGase F a fim de detectar presença de proteínas glicosiladas e mudanças no perfil bidimensional das amostras. O crescimento nas diferentes fontes de carbono resultou na identificação de diversos grupos de proteínas extracelulares que incluíram glicosil hidrolases como celulases, xilanases, pectinases e quitinases, bem como proteínas associadas à parede celular fúngica como hidrofobinas e proteínas elicitoras e um alto número de proteínas putativas, cuja expressão diferencial parece estar regulada pela natureza e complexidade da fonte de carbono utilizada na cultura. Adicionalmente este trabalho apresenta evidência sobre a ocorrência de complexos multienzimáticos no secretoma do fungo após o crescimento por SmF em bagaço de cana, graças à utilização de técnicas eletroforéticas, enzimológicas e espectrométricas como BN-PAGE, zimografia e LC-MS/MS, respectivamente. Os resultados indicam que proteínas secretadas por T. harzianum naturalmente envolvidas na desconstrução de substratos (hemi) celulolíticos e quitinolíticos formam parte de elementos oligoméricos constituídos por subunidades de diferente especificidade catalítica que aparentemente são requeridas para uma conversão eficiente e específica dos polímeros da biomassa. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Trichoderma harzianum is a filamentous fungus able to secret hydrolytic enzymes to the extracellular medium which act degrading the biopolymeric components of plant biomass such as cellulose and hemicellulose in fermentable sugars. This set of secreted proteins corresponds to the secretome, a subset of the proteome. The samples related to the T. harzianum secretome were obtained by submerged fermentation (SmF) in synthetic medium supplemented with1% (w/v) glucose, cellulose, xylan or sugarcane bagasse as a carbon source. The secretomes were explored by two different proteomic approaches, gel-based proteomics using two-dimensional electrophoresis (2-DE) followed by MALDI-TOF/TOF mass spectrometry for the identification of the protein polymorphisms from the gel, and gel-free proteomics using LC-MS/MS for identification of the total of protein present in each sample. The T. harzianum secretomes were also treated with the enzyme PNGase F in order to detect the presence of glycosylated proteins and changes in the dimensional profile of the samples. Growth on different carbon sources resulted in the identification of several groups of extracellular proteins such as glycoside hydrolases including cellulases, xylanases, pectinases, chitinases, as well as cell-wall associated hydrophobins and elicting proteins, and putative proteins whose differential expression appears to be regulated by the nature and complexity of the carbon sources used in the culture. In addition the occurrence of multienzymatic complexes in the secretome after SmF growth in sugarcane bagasse containing medium was demonstrated by means of electrophoretic, spectrometric and enzymologic techniques, such as BN-PAGE, zimography, and LC-MS/MS, respectively. The results indicate that enzymes and proteins secreted by T. harzianum naturally involved in the deconstruction of (hemi) cellulolytic and chitinolytic substrates are part of oligomeric elements composed of subunits with different catalytic specificities apparently required for specific and efficient conversion of biomass polymers.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2009. / Submitted by Allan Wanick Motta (allan_wanick@hotmail.com) on 2010-03-11T20:16:38Z No. of bitstreams: 1 2009_DianaPaolaGomezMendonza.pdf: 1719944 bytes, checksum: 7f9cd7d8e9a8ea98371da5f284ba1d63 (MD5) / Approved for entry into archive by Lucila Saraiva(lucilasaraiva1@gmail.com) on 2010-05-04T18:33:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_DianaPaolaGomezMendonza.pdf: 1719944 bytes, checksum: 7f9cd7d8e9a8ea98371da5f284ba1d63 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-05-04T18:33:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_DianaPaolaGomezMendonza.pdf: 1719944 bytes, checksum: 7f9cd7d8e9a8ea98371da5f284ba1d63 (MD5) Previous issue date: 2009 / O fungo filamentoso Trichoderma harzianum conhecido produtor de enzimas extracelulares como xilanases e celulases foi crescido em três fontes de carbono quimicamente definidas, glicose, celulose e xilana e uma fonte complexa, bagaço de cana, a fim de determinar-se as variações que cada uma geraria na atividade enzimática e na composição do secretoma do fungo. A produção enzimática de T. harzianum sobre bagaço de cana foi inicialmente avaliada durante 15 dias, evidenciando pouca variação em termos de concentração, produção de proteínas e perfis eletroforéticos ao longo do tempo. Após crescimento por 9 dias, detectou-se atividade xilanolítica (0,00610 UI/mL) e celulolítica (0,00497 UI/mL, 0,00926 UI/mL) no meio suplementado com glicose, indicando uma possível produção constitutiva das enzimas. A mais alta atividade xilanolítica(0,09514UI/mL) e celulolítica (0,03257UI/mL, 0,06353UI/mL) foram observadas quando T. harzianum foi cultivado em meio com bagaço de cana como fonte de carbono. Os secretomas foram submetidos a eletroforese bidimensional (2-DE) em faixa de pH 3-10 que mostrou perfil pouco complexo na amostra do meio com glicose e uma maior concentração de spots protéicos na região ácida dos demais géis. Foram então realizadas eletroforeses 2-DE na faixa de pH 4-7, a fim de obter melhor resolução de spots correspondentes a possíveis isoformas protéicas. Os géis bidimensionais na faixa de 4-7 foram submetidos a análise de imagens para determinar o número total de spots em cada gel assim como os spots exclusivos e os pareados entre as diferentes condições. Tentativas de identificação de spots por peptide mass fingerprinting e MS/MS mostraram baixa porcentagem de sucesso, provavelmente devido ao baixo número de sequências de T. harzianum em banco de dados e a existência de modificações pós-traducionais como glicosilações nas enzimas secretadas. Nacetil-glucosaminidase e α-L-Arabinofuranosidase, foram identificadas no secretoma obtido em meio contendo bagaço de cana. Espera-se que a conclusão dos mapas secretômicos possa contribuir na compreensão dos mecanismos de expressão e secreção de enzimas de T. harzianum e aplicações destas em processos biotecnológicos. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The filamentous fungus Trichoderma harzianum recognized producer of extracellular enzymes such as xylanase and cellulases was grown in three chemically defined carbon sources, glucose, cellulose and xylan, and a complex source, sugarcane bagasse, in order to determine the variations in enzyme activity and secretome composition of fungus. The enzyme production of T. harzianum on sugarcane bagasse, was initially evaluated for 15 days, showing little variation in terms of concentration, protein production and electrophoretic profiles over time. After 9 days of growth, xylanolytic (0,00610 UI/mL) and cellulolytic (0,00497 UI/mL, 0,00926 UI/mL) activities were detected in the medium supplemented with glucose, indicating a possible constitutive production of enzymes. The major cellulolytic (0,03257UI/mL, 0,06353UI/mL) and xylanolytic (0,09514UI/mL) activities were observed when the T. harzianum was grown in medium with sugarcane bagasse. The secretoms were subjected to two-dimensional electrophoresis (2-DE) in pH range 3-10 showed low complex profile in the sample of medium with glucose and a greater concentration of proteic spots in the acidic region of other gels. Electrophoresis were then performed 2-DE in the range of pH 4-7, to obtain greater resolution of spots corresponding to possible protein isoforms. The two-dimensional gels in the range of 4-7 were subjected to computational analysis of images that showed the total number of spots in each gel as well as exclusive and matched spots between the different conditions. Attempts to identify spots by peptide mass fingerprinting and MS / MS showed low percentage of success, probably due to the low number of sequences of T. harzianum in the database and the existence of posttranslational modifications as glycosylation in the secreted enzymes. N-acetyl-glucosaminidase and α-L- arabinofuranosidase, were identified in sugarcane bagasse secretome. It is expected that the conclusion of secretomic maps can contribute to a better understanding of the expression and secretion mechanisms of T. harzianum enzymes and their applications in biotechnological processes.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2009. / Submitted by Allan Wanick Motta (allan_wanick@hotmail.com) on 2010-06-02T18:47:05Z No. of bitstreams: 1 2009_AngelaSathikoKudo.pdf: 689847 bytes, checksum: e807c36cd632ca13f6a343e5a20aa7bf (MD5) / Approved for entry into archive by Lucila Saraiva(lucilasaraiva1@gmail.com) on 2010-07-01T15:59:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_AngelaSathikoKudo.pdf: 689847 bytes, checksum: e807c36cd632ca13f6a343e5a20aa7bf (MD5) / Made available in DSpace on 2010-07-01T15:59:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_AngelaSathikoKudo.pdf: 689847 bytes, checksum: e807c36cd632ca13f6a343e5a20aa7bf (MD5) Previous issue date: 2009 / O crestamento foliar de cercospora (Cercospora kikuchii) e a mancha olho-de-rã (C. sojina) são duas importantes doenças da soja. Devido à alta variabilidade apresentada pelos dois patógenos, a busca constante por novas fontes de resistência por métodos de controle eficientes se faz necessária. Assim, este trabalho, subdividido em cinco capítulos, teve como objetivos gerais: (a) a avaliação da reação de genótipos de soja às duas doenças; (b) o efeito de aplicações de fungicidas no controle destas; e (c) o monitoramento da quantidade aérea de conídios de C. kikuchii presentes no ar. Os capítulos 1 e 2 tiveram como objetivos específicos a reação de genótipos de soja convencional e transgênica (Roundup Ready) ao crestamento foliar e à mancha olho-de-rã, respectivamente, e o efeito da aplicação de fungicidas sobre as duas doenças em campo. Para isso foram realizados sete experimentos nas safras de 2005/06, 2006/07 e 2007/08, e foram avaliados 116 genótipos quanto a reação às doenças. Nos capítulos 3 e 4 os trabalhos tiveram como objetivos específicos a avaliação de concentrações de inóculo, a virulência de isolados e a reação de genótipos de soja em condições de casa de vegetação a C. kikuchii e a C. sojina, respectivamente. No capítulo 5 o objetivo específico foi a quantificação de conídios de C. kikuchii e sua relação com a intensidade da doença e com os fatores climáticos temperatura, umidade relativa do ar (UR), precipitação e molhamento foliar em dois períodos de safra. Para tanto, foi instalada uma armadilha coletora de esporos Burkard de sete dias e uma estação meteorológica em campo experimental com soja. No capítulo 1 houve diferença significativa entre genótipos quanto a incidência em folíolos (INC) de crestamento foliar nos experimentos 1 e 2, e quanto a porcentagem de área foliar lesionada (AFL) e área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD) no experimento 7. Nos experimentos 3, 4, 5 e 6 não houve diferença significativa entre os genótipos. No experimento 7, duas ou três aplicações de fungicida (tetraconazole) reduziram a doença. A severidade do crestamento no diversos experimentos foi baixa (AFL 0 a 1,5%), mas é interessante informar que os genótipos convencionais GT04-7439 e GT04-8114 (experimentos 1 e 4) apresentaram pouco ou não apresentaram sintomas aparentes da doença no campo. No capítulo 2 houve diferença entre genótipos no experimento 1 nas variáveis AFL, INC, NLF (número de lesões por folíolo) e AACPD, com destaque para o genótipo GT04-7470, que apresentou os menores níveis de mancha olho-de-rã. No experimento 2 houve diferença entre genótipos quanto a INC e NLF. Os genótipos GT04-7310, GT04-7781, Msoy 8866 (experimento 3) e GT04-7606 (experimento 4) não apresentaram sintomas. No experimento 6 houve diferença entre genótipos quanto a NLF, e Msoy 8787 RR apresentou os menores níveis de doença. Não houve diferença entre genótipos nos experimentos 5 e 7. Nos experimentos 3, 4, 6 e 7 os tratamentos com fungicida não diferiram entre si, embora o tratamento com três aplicações (experimento 7) tenha diferido da testemunha (sem aplicação). A intensidade da doença em todos os experimentos foi baixa (AFL inferior a 1%), indicando que os genótipos avaliados apresentaram resistência à mancha olho-de-rã. No capítulo 3 houve diferença entre as concentrações de inóculo de C. kikuchii testadas, e foi selecionada a concentração 10g de micélio/100mL. No teste de virulência houve diferença entre isolados quanto a AFL e INC (Cerc 211 e Cerc 212 mais virulentos) quando inoculados na variedade Emgopa 313, embora todos os isolados tenham apresentado algum grau de virulência. Houve diferença de reação entre os 10 genótipos nos experimentos 1 e 2 de acordo com o isolado inoculado. A variação de AFL foi de 0,231 a 1,275%, e de INC foi de 3,078 e 37,028%. No capítulo 4 houve diferença significativa entre as concentrações de inóculo testadas, e foi selecionada a concentração de 105 conídios/mL. Também houve diferença significativa entre os isolados de C. sojina no teste de virulência quanto a AFL e INC e NLF. Os isolados Cerc 214 (raça 15), Cerc 210 (raça 4) e Cerc 217 (raça 24) foram os mais virulentos quanto na AFL, INC e NLF. Houve diferença significativa entre genótipos nos experimentos 1 e 2 sobre reação de genótipos à mancha olho-de-rã nas quatro variáveis. O genótipo GT04-8901 foi o que apresentou maior resistência e diferiu significativamente de Msoy 8001, que apresentou menor resistência à ação dos isolados das raças 15 e 4 nos dois experimentos. A AFL dos 10 genótipos foi inferior a 1% nos experimentos realizados. No capítulo 5 houve maior concentração de captura de conídios no período diurno, com mais de 60% dos esporos coletados entre 8 e 15h nas duas safras. Os dados climáticos variaram de acordo com a safra, mas de modo geral em ambos os experimentos o período de maior coleta de esporos ocorreu quando houve redução da precipitação e do molhamento foliar. A UR acima de 80% e temperatura entre 20 e 24ºC foram mais favoráveis para captura de conídios e intensidade do crestamento foliar. Nos dois anos de avaliação a maior quantidade de esporos capturados ocorreu quando as plantas se apresentavam no estádio R6-R7, assim como a intensidade da doença foi maior após o início do estágio reprodutivo da soja. Apesar da quantidade de conídios capturados na safra 2006/07 ter sido maior que na safra seguinte, a variação da flutuação de destes durante o ciclo da cultura ocorreu de modo semelhante. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The cercospora leaf blight and the frogeye leaf spot are two important diseases of soybean culture. Due to the high variability of both pathogens, the search for new sources of resistance and for efficient control methods is necessary. Therefore, this work, divided into five chapters, had as general objectives: (a) the evaluation of soybean genotypes reaction to both diseases; (b) the effect of fungicide treatments on control of the diseases; and (c) the monitoring of airborne spores of C. kikuchii. On chapters 1 and 2 the specific objectives were the evaluation of the reaction of soybean genotypes (conventional and transgenic – Roundup Ready) to cercospora leaf blight and to frogeye leaf spot, respectively, and the effect of fungicide applications on the diseases in field conditions. For these purposes, seven experiments were conducted during the crop periods of 2005/06, 2006/07 and 2007/08, and a total of 116 genotypes was evaluated. On chapters 3 and 4 the studies had as specific objectives the evaluation of inoculum concentrations, the virulence of isolates and the reaction of soybean genotypes under greenhouse conditions to C. kikuchii and C. sojina, respectively. On chapter 5 the specific objective of the study was the quantification of spores of C. kikuchii and its relation to the disease intensity and to the environmental factors temperature, relative air humidity (RH), precipitation and leaf wetness period in two crop periods. To quantify the airborne conidia, a Burkard’s seven-day volumetric spore trap and a weather station were set in an experimental field with soybean culture. On chapter 1 there was significant difference among genotype reactions for the variable INC (% of foliar incidence) in the experiments 1 and 2, and for the variables AFL (% of foliar diseased area) and AUDPC (Area under the disease progress curve) in the experiment 7. On experiments 3, 4, 5 and 6 there were no significant differences among the genotypes. The cercospora leaf blight intensity was low on the experiments (AFL 0 to 1.5%), but it is interesting to report that GT04-7439 GT04-8114 (experiments 1 and 4) presented less or did not present any apparent disease symptoms. On chapter 2 there was difference among genotypes in experiment 1 using the variables AFL, INC, NLL (number of lesions by leaf) and AUDPC, and GT04-7470 showed lesser levels of frogeye leaf spot than the other genotypes. In the experiment 2 difference among genotypes was observed in INC and NLL. The genotypes GT04-7310, GT04- 7781, Msoy 8866 (experiment 3) and GT04-7606 (experiment 4) did not show any symptoms. On experiment 6 the genotypes differed among each other using NLL, and Msoy 8787 RR showed the lowest levels of disease. There was no differences among genotypes on experiments 5 and 7. On experiments 3, 4, 6 and 7 the fungicide treatments did not show difference among each other, although the three application treatment (experiment 7) was different from control (no fungicide). The disease intensity in all experiments was considered low (AFL under 1%), which may indicate that the genotypes showed resistance to the frogeye leaf spot. On chapter 3 there was difference among inoculums concentrations, and the 10g of mycelium/100mL was selected. In the virulence assay difference among isolates was verified in AFL and INC (Cerc 211 and Cerc 212 more virulent) when isolates were inoculated in the cultivar Emgopa 313, although all isolates showed some virulence degree. There was difference among the 10 genotypes reactions in the trials 1 and 2 to the isolates inoculated. The AFL variation was of 0,231 to 1,275% and INC variation was of 3,078 to 37,028%. On chapter 4 there was difference between the inoculums concentrations, and it was selected the concentration of 105 conidia/mL. There was significant difference among all C. sojina isolates on the virulence trial on the variables AFL, INC and NLF. The isolates Cerc 214 (race 15), Cerc 210 (race 4) and Cerc 217 (race 24) were the most virulent using the variables AFL, INC and NLF. To evaluate the reaction of genotypes to C. sojina, it was carried out two trials. There was significant difference among genotypes on experiments 1 and 2 to all four variables and on both isolates (Cerc 214 and Cerc 210). Genotype GT04-8901 showed lower levels of the disease and differed significantly from Msoy 8001, which showed more symptoms caused by isolates of races 15 and 4 in both trials. AFL of 10 genotypes was under 1%. On chapter 5 it was verified that most of the conidia were collected during the day, with over 60% of the spores collected between 8 and 15h in both crop periods. Climatic data varied according to the crop period, but in general in both experiments the major collection of spores occurred with reduction of precipitation and leaf wetness period. RH above 80% and temperature between 20 and 24ºC were more favorable to capture of conidia and disease intensity. In the two years of evaluation the major amount of spores were collected when plant stage was R6-R7, as well as disease intensity increased after beginning of reproductive stage of soybean. Although the number of captured conidia in the 2006/07 crop period was higher than the next year, the variation of fluctuation of spores during culture cicle occurred similarly.

Orientador: Lucia Maria Valente Soares / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-03T19:59:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kawashima_LucianeMie_D.pdf: 879628 bytes, checksum: 8a57bc71bb04a099a7a6f55633df6964 (MD5) Previous issue date: 2004 / Doutorado

Orientador : Claudio Luiz Messias / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-16T19:58:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Matos_AdmirJosafaArraisde_D.pdf: 6171342 bytes, checksum: cf3f04c36c690924ab8bb219c92f8fc0 (MD5) Previous issue date: 1988 / Resumo: Estudou-se a germinação e alguns aspectos da morfologia e fisiologia de Metarhizium anisopliae (METSCH.) SOROKIN, utilizando-se meios de cultura de diversas composições e também substâncias inibidoras de diversas naturezas. Observou-se a formação e o crescimento de tubos germinativos em conidios de linhagens selvagens, mutantes e diplóides. Verificou-se nos estudos iniciais que quando os conidios de M.anisopliae produzidos em meio mínimo, em culturas de superfície, eram expostos a ambiente ventilado, perdiam cerca de 50% de seu peso, pela evaporação da água em 6 horas. Verificou-se também que quando conídios produzidos de igual modo eram inoculados em meio completo líquido aumentavam seu volume em mais de 6 horas.Os estudos subsequentes mostraram que em 12 horas de incubação, mais de 85% de conídios germinaram nos vários meios testados, tanto sólidos como liquidas. Este tempo pode ser considerado como o tempo mínimo de germinação (TGm), para a variedade anisopliae. Os estudos também sugeriram que em meio liquido e à temperatura ambiente, uma concentração de 10_ conidios/ml, parece ser em algumas situações a mais indicada. Houve variabilidade quanto ao número de tubos germinativos em conídios de M.anisopliae num determinado tempo. A germinação e o crescimento de tubos germinativos podem ser representados por um modelo exponencial. Considerando também os vários meios de cultura testados, o meio mínimo + extrato de levedura se mostrou um meio basal para a germinação de conidios e crescimento de co1ônias. Foram ensaiadas várias substâncias inibidoras da germinação de conídios como, glicerol, polietilenoglicol, benzeno, clorofórmio, m-cresol, álcool éter + alquil-sulfato de sódio e cicloheximida, cujos efeitos permitiram em muitos casos um maior sincronismo na germinação. Algumas destas substancias além de osmoreguladoras, também produziram efeitos morfogênicos, aumentando o número de tubos germinativos dentro de um determinado tempo. Com m-cresol, o efeito morfogênico foi mais duradouro. Os mutantes da 1inhagem E9 não diferiram no modo de germinação quando comparados com a linhagem selvagem de origem, o mesmo não acontecendo com os mutantes de F84. A germinação de conídios dos diplóides, revelou cada um deles germinando de maneira diferente. O trabalho permitiu concluir que a germinação de conídios é um processo extremamente complexo, que segue um programa genético, o qual se expressa no tempo e no espaço e influenciado por diversos fatores ambientais / Abstract: Were studied on the germination of the Metarhizium anisopliae (METSCH) SOROKIN, and several aspects the morphology and physiology, utilizing culture media of various compositions and also inhibiting substances of various natures. The formation and growth of germinative tubes were observed in conidia of wild strains, mutant and diploid. The initial studies showed that when conidia the M.anisopliae produced in a minimum medium, in superficial cultures, were exposed to a ventilated environment they would loose 50% of their weight, by water evaporation in 6 hours. It was noticed also that when conidia produced in an equal manner were inoculated in a complete liquid medium they would increase their volume to more than 50% in 6 hours.The subsequent studies showed that in 12 hours of incubation more than 85% of the conidia germinated in the various tested media, such as for solids, as for liquids. This length can be considered as the minimum time for germination (TGm), for the anisopliae variety. The studies also suggested that in a liquid medium at the environmental temperature, a concentration of 10_ conidia/ml, it seems to be in some situations the most indicated. There was variability as to the number of germinative tubes in M.anisopliae conidia in a determined period of time. The germination and growth of germitiative tubes can be represented by an exponential model. Considering also the various tested culture media, the minimum + yeast extract demonstrated to be a basal medium for germination of conidia and growth of colonies. Various inhibiting substances of the conidia germination were tested, as glycerol, poliethileneglycol, benzene, chloroform, m-cresol, alcohol ether + alquil-sulphate of sodium and cicloheximide, being that the effects served in many cases to increase synchronism in germination. Some of these substances, besides being osmoregulators, also produced morphogenic effects, increasing the number of germinative tubes within a certain period of time. With m-cresol the morphogenic effect lasted longer.The mutants of strain E9 did not differ in the germination manner when compared to a wild origen, the same did not occur with the mutants F84. The germination of diploids conidia showed each of them germinating in a different manner. It was concluded by the study that the germination of the conidia is an extremely complex process, following a genetic program, which express in time and space and it is influenced by several environmental factors / Doutorado / Doutor em Ciências

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-01-22Bitstream added on 2014-06-13T18:35:04Z : No. of bitstreams: 1 silva_rb_me_botfca.pdf: 752709 bytes, checksum: 1c8874b0cf7a904e4abe6060f9ec4cc0 (MD5) / A cultura do chá na região do Vale do Ribeira está localizada ao Sul do Estado de São Paulo, onde se concentra uma grande área de Floresta Mata Atlântica do Brasil. A ‘Queima dos fios’ causada pelo fungo Rhizoctonia binucleada (Ceratobasidium spp.; sin. Pellicularia koleroga) é a principal doença que ataca a cultura. A espécie deste fungo ainda não é totalmente conhecida, bem como as informações sobre sua biologia. Deste modo, o objetivo do presente trabalho foi elucidar aspectos da biologia do fungo, realizando a caracterização citomorfológica, cultural, patogênica e molecular de Rhizoctonia binucleada associada a queima dos fios do chá no Vale do Ribeira - SP. Em uma área de cultivo do chá, rodeado por um fragmento de Floresta Mata Atlântica, realizou-se a coleta de ramos e folhas atacadas pela queima do fio e o isolamento em laboratório, obtendo cinco isolados com características específicas de Rhizoctonia spp. Verificou-se que todos os isolados apresentaram dois núcleos por célula, sendo considerados binucleados. A indução da fase teleomórfica foi realizada, mas não houve sucesso na formação completa das estruturas sexuadas de Ceratobasidium spp., porém, houve escassa formação de himênio e metabasidios por alguns isolados, nos meios de cultura Batata dextrose ágar, Agua ágar, Corn meal ágar e Czapeck dox ágar, sob maior ocorrência na condição de fotoperíodo 12h luz/12h escuro a 24°C. Todos os isolados do chá não apresentaram interação de anastomose de hifas com os isolados padrões de Rhizoctonia binucleada GA-A, GA-Bo, GA-P e GA-Q, não pertencendo a estes grupos. A compatibilidade somática entre os isolados do chá apresentaram a formação de três grupos de compatibilidade somática:... / The tea culture in the Vale do Ribeira is located in south of Sao Paulo State which concentrates the large area of Brazil Atlantic Forest. The ‘Thread blight ' caused by the fungus binucleate Rhizoctonia (Ceratobasidium spp.; Sin. Pellicularia koleroga) is the main disease that attacks the culture. The species of this fungus is not yet fully known, as well as information about its biology. Thus, the aim of this study was to elucidate the fungus biology, by the characterization of cytomorphological, cultural, molecular and pathogenic binucleate Rhizoctonia associated with the tea thread blight in the Ribeira Valley - SP, Brazil. In a area of growing tea, surrounded by a fragment of Atlantic Forest was collect branches and leaves attacked by thread blight and forwarded by laboratory isolation, obtaining five isolates with specific characteristics of Rhizoctonia spp. It was verified that all isolates showed two nuclei per cell being considered binucleate. The teleomorph induction was performed, but there was no success in the complete formation of sexed Ceratobasidium sp structures. However, there was scarce formation of hymenium and metabasidias by some isolates in culture medium Potato dextrose agar, Water agar, Corn meal agar and Czapeck dox agar, under increased occurrence in photoperiod condition 12h light /12h dark at 24 ° C. All isolates of tea showed no interaction of hyphal anastomosis with the standard isolates of binucleate Rhizoctonia GA-A, GA-Bo, GA and GA-P-Q not belonging to these anastomosis groups. The somatic compatibility among isolates of tea showed the formation of three somatic compatibility groups: GCS-1, GCS-2 and GCS-1 among the five isolates showing similarity between the microscopic and macroscopic reactions. The morphological characteristics of the colonies also allowed the... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-01-29Bitstream added on 2014-06-13T19:37:30Z : No. of bitstreams: 1 000754192.pdf: 1331701 bytes, checksum: 9e037a2c30442e3120292b8c1b097b07 (MD5) / A podridão de Sclerotinia, causada pelo fungo Sclerotinia sclerotiorum, tem ocasionado perdas significativas em culturas agrícolas de importância econômica ao redor do mundo, dentre elas a soja. Considerando que o tratamento de sementes é uma medida de manejo eficaz no controle de patógenos, é justificável o estudo de produtos químicos para esta modalidade de aplicação, visando ao controle da doença e, também, melhor desenvolvimento inicial da cultura, reduzindo o tempo de exposição a fungos e insetos presentes no solo. Assim, o presente trabalho teve como objetivo avaliar o efeito do tratamento de sementes com fungicidas e inseticida, isolados e em mistura, sobre a qualidade sanitária e fisiológica de sementes de soja infectadas por S. sclerotiorum. Foi utilizado um lote da cultivar M7908RR com 20% de infecção pelo fungo. Os tratamentos [produto químico (dosagem mL ou g p.c/100Kg de sementes)] foram compostos por: tiofanato metílico + fluazinam (180); tiofanato metílico + fluazinam + acetamipride (180 + 100); tiofanato metílico + fluazinam + acetamipride (180 + 200); tiofanato metílico + fluazinam (215); tiofanato metílico + fluazinam + acetamipride (215 + 100); tiofanato metílico + fluazinam + acetamipride (215 + 200); acetamipride (100); acetamipride (200); carbendazin + thiram (200); carboxina + thiram (300); fludioxonil + metalaxil-M (100); piraclostrobina + tiofanato metílico + fipronil (200). A testemunha foi constituída de 2 sementes não tratadas. Após o tratamento químico, as sementes foram analisadas quanto às qualidades sanitária (métodos do papel filtro e de incubação em substrato semi-seletivo – Neon) e física - fisiológica (germinação, teor de água, primeira contagem de germinação, envelhecimento acelerado, comprimento de plântulas, índice de velocidade de germinação, altura e massa seca de plantas). Também foi avaliada a incidência do fungo... / The Sclerotinia rot, caused by Sclerotinia sclerotiorum, has been caused losses significant at agricultural crops with economic importance around the world, among them soybean. Whereas seed treatment is a measure of effective management to pathogens control, it is justifiable to study chemicals for this type of application, aimed at controlling the disease and also better initial crop development, reducing of the exposure time to fungi and insects in the soil. Thus, the present study aimed to evaluate the effect of seed treatment with fungicides and insecticides, alone and in combination, on the health and physiological quality of soybean seeds infected by S. sclerotiorum. It was used a batch of variety M7908RR with 20% fungus infection. The treatments [ chemical (dose mL ou g c.p./100kg of the seed) ] were composed of: thiophanate methyl + fluazinam (180), thiophanate methyl + fluazinam + acetamiprid (180 + 100), thiophanate methyl + fluazinam + acetamiprid (180 + 200), thiophanate methyl + fluazinam (215), thiophanate methyl + acetamiprid + fluazinam (215 + 100), thiophanate methyl + acetamiprid + fluazinam (215 + 200), acetamiprid (100), acetamiprid (200), carbendazim + thiram (200); carboxin + thiram (300); fludioxonil + metalaxyl-M (100); pyraclostrobin + thiophanate methyl + fipronil (200). The witness was consisted of untreated seeds. After chemical treatment, the seeds were analyzed for their health qualities (filter methods and the incubation on semi-selective substrate - Neon) and physical - physiological (germination, moisture content, first count of the germination, senescent acceleration, seedling length, index of germination speed, height and dry matter of the plant). Also it was analyzed the incidence of the fungus in plants, at the greenhouse. The fungicides treatments, alone or in mixture with insecticide reduced the incidence of S. sclerotiorum soybean seeds; the insecticide ...

Orientador: Maurício Dutra Zanotto / Coorientador: Dartanhã José Soares / Banca: Marcelo de Almeida Silva / Banca: Sérgio Gonçalves Dutra / Resumo: A mamoneira (Ricinus communis L.) é uma oleaginosa da família das Euforbiáceas que disseminou-se por varias regiões do mundo devido a sua fácil propagação e adaptação. O principal produto negociado no mercado internacional é o óleo de rícino e o Brasil é o segundo maior fornecedor desse produto. O melhoramento vegetal visando à obtenção de novas cultivares e híbridos de mamoneira é primordial para o sucesso econômico da cultura, pois, o plantio de materiais mais produtivos, resistentes à doenças e que permitem o uso de mecanização traz maior retorno econômico para os produtores. O objetivo do presente estudo foi realizar a caracterização agromorfológica, avaliar a divergência genética e a reação ao mofo cinzento de 58 acessos de mamoneira coletados em diferentes regiões do Brasil. Realizou-se a criação de um banco de sementes de mamoneiras selvagens através de coletas em diversas regiões do Estado de São Paulo, Sul de Minas Gerais e na capital do Rio Grande do Norte. As sementes foram levadas para o Departamento de Produtividade e Melhoramento Vegetal da Faculdade de Ciências Agronômicas (FCA) em Botucatu - SP para beneficiamento e realização de testes preliminares (vigor, germinação e teor de óleo). Os acessos pré-selecionados foram semeados e caracterizados através de 31 descritores morfológicos. Foram coletados racemos desses materiais para testar a reação e a resistência ao mofo cinzento da mamoneira no Laboratório de Entomologia e Fitopatologia da Embrapa Meio Ambiente ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Castor bean (Ricinus communis L.) is an an Euphorbiaceae family oilseed that has spread to various regions of the world due to its easy propagation and adaptation. Brazil is the second largest castor oil supplier, the main product traded in the international market. Plant breeding to generate cultivars and hybrids more productive, resistant to diseases, allowing the use of mechanization of castor bean can drive this crop for the economic success, generating producer's profit. Our aim was to perform the agro-morphological characterization, evaluate genetic divergence and gray mold reaction of 58 accessions of castor bean collected in different regions of Brazil. A wild castor bean seed bank was created through collections in several São Paulo State regions, South of Minas Gerais and in the capital of Rio Grande do Norte. Processing and preliminary tests (vigor, germination and oil content) were performed at the Department of Productivity and Plant Breeding from Faculty of Agronomic Sciences (FCA) in Botucatu, SP, Brazil. Preselected accessions were sown and characterized by 31 morphological descriptors. Castor bean racemes were tested to gray mold reaction and resistance in the Laboratory of Entomology and Phytopathology, Embrapa Meio Ambiente in Jaguariúna-SP, Brazil. Variance analysis, similarity by the nearest neighbor hierarchical method and principal components analysis was performed on all data obtained. BTC5, SAP1 and SBS2 showed the highest germination percentage (98.67%). SM2, SAP4, SM1, SBS2, SJC2, BOIT1, CBJ1, BOF2, BTC5 and CJ4 were selected as the resistance source of the castor bean gray mold while BOC1 was the most divergent. SM2, SM1, SBS2, CJ4, BJC4, CJ3, CJ1, CBJ1, CJ6, SAP2, SAP1 and SAP4 have agro-morphological characteristics of commercial interest and they are promising to constitute a germplasm collection in castor bean breeding programs. / Mestre

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Curso de Pós-Graduação em Agroecossistemas / Made available in DSpace on 2012-10-17T00:32:24Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Pesquisa realizada em propriedade].Avaliação do efeitos de [associação micorrízica] em [cebola][Alliun cepa L.], cultivadas em sistemas de [manejo alternativo e convencional], e a [ação antropogênica] sobre os [fungos micorrízicos]. Avaliação do uso de insumos orgânicos e industriais sobre a colonização micorrízica de raízes, sobre a [biodiversidade], produtividade de cebola. Uso de micorrizas em [sistemas alternativos de produção de cebola], desde canteiros até o plantio definitive. [Bioensaio] .