Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003-01Bitstream added on 2014-06-13T20:37:48Z : No. of bitstreams: 1 nozaki_dn_me_botfca.pdf: 633380 bytes, checksum: bdc6e8491f4a3d0e89a675dd36415ae2 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O mal-do-panamá causado por Fusarium oxysporum Schlecht. f. sp. cubense (E. F. Smith) Snyder & Hansen é um dos problemas fitossanitários mais sérios da bananicultura mundial. Devido a esta doença, um dos manejos culturais recomendados para o cultivo da bananeira, é a formação da cultura em locais onde o patógeno ainda não foi detectado. Visando fornecer subsídios para futuros programas de manejo da cultura, este trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade genética entre isolados monospóricos do gênero Fusarium sp., presentes em tecidos de plantas e em diferentes tipos de solo do norte de Minas Gerais. Foram utilizados 19 isolados de tecidos de bananeira, tomateiro, coqueiro e tamareira, e 63 isolados obtidos de solo. Também foram incluídos neste trabalho, 5 isolados de F. oxysporum de diferentes formae speciales (2 isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense, 1 de Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum, 1 de Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli e 1 de Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici) e 4 de F. solani de feijoeiro. Através de polimorfismo do DNA amplificado ao acaso (RAPD) e análise das seqüências de nucleotídeos dos espaços transcritos internos (ITS1/ITS2) do DNA ribossomal (5.8S rDNA), avaliou-se a variabilidade genética dos isolados. Foi utilizado o método RAPD com a combinação de sete “primers”, o que resultou 72 bandas polimórficas. Através desta análise foi possível obter 3 grupos geneticamente distintos, com ponto de ramificação superior a 50% de similaridade. No sequenciamento, os produtos de PCR foram realizados com os “primers” ITS4 e ITS5 para o rDNA, obtendo fragmentos de 550 a 600 pb em todos os isolados. A análise do consenso das seqüências da região ITS e do gene 5.8S do rDNA foram comparadas com seqüências do GenBank. Os dendrogramas gerado por agrupamento UPGMA com os de RAPD e... . / Panamá disease caused by Fusarium oxysporum Schlecht. f. sp. cubense (E.F. Smith) Snyder & Hansen is one of the most serious phytosanitary problems of banana culture worldwide. Due to this disease, culture formation in locals where the pathogen has not been detected yet is one of the culture management recommended for banana plant culture. Aiming at providing subsidies for future culture management programs, this work evaluated the genetic variability among monosporous isolate of Fusarium sp. present in plant tissues and in different types of soil in north of Minas Gerais state. Nineteen tissue isolates of banana plant, coconut tree and date palm, and 63 isolates of soil were used. It was also included in this work 5 isolates of F. oxysporum of different formae speciales (2 isolates of F. oxysporum f. sp. cubense, 1 of F. oxysporum f. sp. vasinfectum, 1 of F. oxysporum f. sp. phaseoli and 1 of F. oxysporum f. sp. lycopersici) and 4 of F. solani of bean plant. Through polymorphism of DNA amplified at random (RAPD) and nucleotides sequence analysis of ribossomal DNA (5.8SrDNA) internal transcripted spaces (ITS1/ITS2), isolates genetic variability was assessed. It was used the RAPD method with combination of seven primers, what resulted in 72 polymorphic ribbons. Through such analysis, it was possible to obtain 3 genetically different groups, with ramification point over 50% of similarity. In the sequence, PCR products were carried out with the primers ITS4 and ITS 5 for rDNA, obtaining fragments of 550 to 600 pb in all isolates. Sequences analysis of ITS region and gene rDNA 5.8S was compared to GenBank sequences. The dendrographs generated by UPGMA grouping with the RAPD ones and those of nucleotides sequences were much similar. There was no correlation of the groups formed in the dendrographs concerning geographic location and host plant... (Complete abstract, click electronic address below).

Tese(doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-graduação em Farmacologia, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T08:38:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 276905.pdf: 3456327 bytes, checksum: 49a7176bc65eb2b5be2041d6eeb09f45 (MD5) / Um intercruzamento entre as linhagens isogênicas de ratos Lewis (LEW) e espontaneamente hipertensos (SHR) possibilitou a identificação de um QTL (Quantitative Trait Locus) chamado Ofil1 (no cromossomo 4) com influência na locomoção central do campo aberto (CA), um índice experimental de ansiedade (RAMOS et al., 1999). O objetivo deste trabalho foi a construção de uma linhagem congênica para o locus Ofil1 utilizando a linhagem LEW como doadora e a linhagem SHR como receptora, para confirmar a localização desse QTL e investigar sua expressão em um arcabouço genético SHR e sua influência sobre fenótipos associados com a ansiedade. A cada geração (N3 a N10), animais heterozigotos e homozigotos SHR para Ofil1 foram avaliados no teste do CA e da caixa branca e preta (CBP). Além dessa estratégia, três linhagens semicongênicas para o Ofil1 também foram produzidas, sendo duas a partir da geração N3 (homozigotos LEW e homozigotos SHR - grupos controle), avaliadas em diferentes testes de ansiedade, de depressão e de consumo de álcool, e uma terceira, proveniente da geração N6 (homozigotos LEW), comparada com linhagens puras LEW e SHR, grupos controle, e submetidas somente a testes de ansiedade. Animais homozigotos LEW também foram produzidos a partir da geração N10. Os resultados dos animais heterozigotos (N3 a N10) mostraram uma tendência desses animais a exibirem menores índices de emocionalidade em comparação aos homozigotos SHR, na maioria das gerações. Entretanto, diferenças significativas relacionadas ao fator genótipo, na medida de locomoção central, somente foram observadas na geração N6, e foram marginalmente significativas nas gerações N3 e N10, sendo que os animais heterozigotos exibiram menores índices de emocionalidade do que os animais homozigotos SHR, como esperado. Apesar do efeito de Ofil1 não ter apresentado resultados estatisticamente significantes em todas as dez gerações, efeitos significativos foram encontrados a partir de uma análise simultânea com os animais de todas as gerações (N3 a N10), análise esta que também revelou menores índices de emocionalidade dos animais heterozigotos em comparação aos animais homozigotos SHR. Os resultados dos animais semicongênicos das gerações N3 e N6 mostraram que Ofil1 influencia medidas comportamentais de ansiedade e exibe um efeito pleiotrópico em medidas de diferentes testes. Nos animais homozigotos LEW da geração N3, fatores ambientais como o período do teste e a intensidade de iluminação interagiram com o locus Ofil1 e promoveram modificações no efeito do genótipo sobre as medidas do CA, sendo estas dependentes do sexo e do período em que o teste foi realizado. Os animais homozigotos LEW da geração N10 também exibiram menores índices de emocionalidade do que os SHR puros em relação ao tempo gasto no centro do CA, medida esta também considerada um índice de emocionalidade.

Um dos maiores objetivos na ciência atual é poder relacionar alterações nos genes a mudanças nas morfologias de organismos multicelulares. Além disso, é importante poder determinar se estas modificações foram obras do acaso ou se a seleção natural teve um papel central moldando a forma e o tamanho das criaturas vivas. A busca por nutrientes e sua utilização é uma das questões mais básicas para a sobrevivência de uma espécie. Em mamíferos a diversificação e especialização dos dentes para triturar, rasgar e mastigar diferentes tipos de comida possibilitou um incremento na geração de energia e representou uma inovação chave para a sobrevivência deste grupo. No presente estudo foi investigado o gene PAX9, que codifica um fator de transcrição chave no desenvolvimento da dentição de mamíferos. Para 125 indivíduos de origem ameríndia foi seqüenciado o exon 3 (138 pb), conjuntamente com as regiões intrônicas flanqueadoras 5´e 3´(232 pb e 220 pb, respectivamente) e os dados integrados com a informação disponível para a mesma região de 115 indivíduos de diferentes origens geográficas. Além disso, os exons 2, 3 e 4 (627 pb, 138 pb e 240 pb respectivamente) foram seqüenciados do DNA de 25 espécies de mamíferos e agrupados com os dados disponíveis de mais 29 espécies. Em humanos, o polimorfismo Ala240Pro possui uma distribuição variada entre os Ameríndios da América do Sul e está presente em Esquimós, Asiáticos e Europeus, mas não está presente entre os Afro-Americanos. O panorama que surge é que provavelmente a partir da saída da África a freqüência da mutação Ala240Pro aumenta, sendo possivelmente selecionada positivamente, o que pode estar relacionado à agenesia do terceiro molar, ou ainda, estar associado a genes conectados a adaptações ao frio. Com a chegada dos Ameríndios a regiões equatoriais, outro cenário parece dominar a evolução do exon 3, seja pela perda inicial da possível vantagem adaptativa, ou por causa da ação da deriva genética amplamente documentada nestas populações. Provavelmente em algum momento na história destas populações, fatores casuais poderiam ter sido preponderantes às restrições funcionais da proteína. Em geral, há uma maior variabilidade em nível de aminoácidos no exon 3 considerando todos os mamíferos estudados quando comparada com a do exon 2, ficando o exon 4 numa posição intermediária. O exon 3 seria um exemplo notável de uma situação que conferiria “evolvabilidade” ao PAX 9. / One of the main goals in science today is to establish the relation between gene changes and variations in the morphologies of multicellular organisms. In addition, it is important to determine if these changes were randomic or whether natural selection had a central role shaping the form and size of living beings. Searching for nutrients and its use is one of the most basic issues for a species survival. In mammals teeth diversification and specialization to grind, tear and chew different types of food were a key innovation that allowed an increase in the generation of energy and in the survival of this group. In this study an investigation was performed in the Paired box gene 9 (PAX9), which codes for a transcription factor that was a key factor in the development of mammal dentition. A total of 125 persons from Amerindian populations were studied by sequencing the PAX9 gene exon 3 (138 base pairs) as well as its 5´and 3´flanking intronic segments (232 bp and 220 bp, respectively) and the data integrated with the information available for the same genetic region from 115 individuals of different geographical origins. Moreover, exons 2, 3 and 4 (627 bp, 138 bp and 240 bp, respectively) were sequenced from DNA of 25 mammalian species and the results combined with the data available from other 29 additional species. In humans, the Ala240Pro polymorphism has a varied distribution among the South American Amerindians and is present in Eskimos, Asians and Europeans, but it is not present among Afro-Americans. The pattern that emerges is that probably starting with the out-Africa migration, and possibly as a result of positive selection, the Ala240Pro mutation frequency increased, that could be related to third molar agenesis or an associated gene connected to cold adaptation. With the Amerindian arrival again in equatorial regions, another pattern seems prevalent in exon 3 evolution, either due to the loss of a possible initial adaptive advantage, or to the action of genetic drift, widely documented in these populations. Probably at some point in the history of these populations, random factors could have been dominant despite the protein functional restrictions. In a general way, there is a greater variability at the amino acid level in exon 3 of all mammals considered when compared to exon 2, exon 4 occupying an intermediary position. Exon 3 would be a remarkable example of a condition that would confer PAX9 evolvability.

Peroxidases são enzimas amplamente distribuídas nos organismos, sendo de fundamental importância para o seu desenvolvimento. Atuam reduzindo o peróxido de hidrogênio à água, minimizando, assim, o dano celular em condições de estresse e modulando as respostas celulares que utilizam o peróxido de hidrogênio como molécula sinalizadora. Através de análises em bancos de depósito de genomas, uma provável nova heme-peroxidase (ascorbate peroxidase-related ou APx-R) foi identificada. APx-R é uma proteína exclusiva de plantas e está presente desde organismos basais, como algas, até angiospermas. Diferentemente de outras peroxidases, geralmente codificadas por pequenas famílias gênicas originadas a partir de eventos de duplicação, APx-R se apresenta como um gene cópia-única em todos os genomas de plantas já sequenciados e disponibilizados. Apesar de haver grande similaridade de estrutura proteica entre APx e APx-R, APx-R possui um grande número de substituições conservadas em domínios críticos, sugerindo que esta proteína provavelmente se originou de algum membro da família das ascorbato peroxidases, mas acumulou mutações suficientes de forma que não pode mais ser considerado um membro desta família. Para verificar a localização subcelular de APx-R, protoplastos de arroz foram transfectados com uma construção de fusão traducional APx-R::YFP, sob o controle do promotor 35S. A visualização da florescência foi feita através de microscopia confocal e revelou que APx-R é uma proteína de dupla-localização, a qual pode localizar-se tanto nas mitocôndrias quanto nos cloroplastos. Análises de BiFC mostraram que APx-R pode interagir com as APx presentes nos mesmos compartimentos subcelulares, indicando que estas proteínas podem estar atuando de forma sinérgica no metabolismo de detoxificação do peróxido de hidrogênio. Para caracterizar APx-R funcionalmente, mutantes de arroz superexpressando RNA de interferência objetivando silenciar o gene OsAPx-R foram obtidos através de transformação via Agrobacterium tumefaciens. As plantas RNAi-OsAPx-R apresentaram alterações no metabolismo do peróxido de hidrogênio quando comparadas às plantas não-transformadas, mostrando diferenças nas atividades de SoD. Cat e APx, suportando a provável participação de APx-R na defesa contra o estresse. Assim, estes resultados mostraram que OsAPx-R codifica uma proteína funcional, a qual está relacionada com o sistema antioxidante e é requerida na resposta a estresses, provavelmente atuando na proteção dos cloroplastos e mitocôndrias, ambas organelas com intensa formação de espécies reativas de oxigênio. / Peroxidases are widely distributed in all organisms, being of fundamental importance for their development. These enzymes act reducing hydrogen peroxide into water, minimizing cellular damage in stressful conditions and modulating cell responses through hydrogen peroxide signaling. From analysis in public genomic databases, a putative new heme-peroxidase (ascorbate peroxidase-related or APx-R) was identified. APx-R is exclusive of plants and present from basal to vascular organisms. Unlike other peroxidases, usually encoded by large genic families originated from duplication events, APx-R is present as a single-copy gene in all available plant genomes. Despite the high structure similarity between APx and APx-R proteins, APx-R presents a great number of conserved substitutions in critical domains, suggesting that this protein probably emerged from the family of ascorbate peroxidases, but accumulated enough mutations so it cannot be grouped in this family anymore. To access subcellular localization, rice protoplasts were transfected with a translational fusion of yellow fluorescent protein (YFP) to APx-R protein under the control of the 35S promoter. Fluorescence visualization was performed by confocal microscopy and revealed that APx-R is a dual-target protein targeted to chloroplasts and mitochondrias. BiFc analysis showed that APx-R can interact with APx proteins which are present in the same subcellular compartments, indicating that these proteins may be acting synergistically in hydrogen peroxide scavenging metabolism. To further characterize APx-R in antioxidant metabolism, rice mutants expressing interference RNA for APx-R gene were obtained through Agrobacterium tumefaciens transformation. RNAi-silenced plants presented a disturbed hydrogen peroxide metabolism in comparison to non-transformed plants, with differences in SoD, Cat and APx activity, supporting the participation of APx-R in stress defense. Altogether, these results showed that OsAPx-R encodes a functional protein, which is related to the antioxidant system and required in stress response, probably acting in chloroplast and mitochondria protection, both organelles with intense reactive oxygen species formation.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:02Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-25Bitstream added on 2014-06-13T18:53:56Z : No. of bitstreams: 1 roxo_ff_me_botib.pdf: 4492015 bytes, checksum: 64d4acdcf86b743022114254d49de6c4 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Estudos morfológicos e moleculares direcionados a indivíduos da família Loricariidae, popularmente conhecidos com cascudos, têm revelado incertezas nos padrões de relacionamentos de algumas de suas subfamílias. Baseado nestes questionamentos foi realizado uma análise filogenética incluindo representantes de todos os gêneros da subfamília Neoplecostominae. Tal análise, baseada em Máxima Parcimônia, Análise Bayesiana e Análise de Distancia Genética (Neighbor-joining) foi executada em uma matriz de 4676 caracteres com sequências parciais dos genes COI, CytB, 16S rRNA, 12S rRNA e F-4 Reticulon. Nesta matriz 1155 caracteres apresentaram-se informativos nas análises de parcimônia. Como grupos externos foram utilizadas as espécies Hemipsilichthys gobio e Hemipsilichthys papilatus, subfamília Delturinae, amostras de Hypostomus nigromaculatus (subfamília Hypostominae), Hypoptopoma inexpectatum (subfamília Hypoptopomatinae) e Corumbataia cuestae (subfamília Otothyrinae). Segundo proposta recente de relações na família Loricariidae o gênero Pseudotocinclus foi incluído nas análises. Os resultados mostraram que a subfamília Neoplecostominae é monofilética, com sua atual composição, incluindo Pseudotocinclus. Três subgrupos foram reconhecidos no grupo interno. O primeiro é formado pelas espécies Pareiorhina carrancas, uma nova espécie de Pareiorhina (Pareiorhina sp. 1), um novo gênero de Neoplecostominae e as espécies do gênero Neoplecostomus exceto Neoplecostomus ribeirensis. O segundo pelos gêneros... / Morphological and molecular studies of samples of the family Loricariidae revealed that the relationship between it members are not well resolved. Based on this fact, in the present work we realized an analysis including samples of all genera of the subfamily Neoplecostominae. The analysis based in Maxima Parsimonious, Bayesian Analysis and Genetic Distance (Neighbor-joining) in a matrix of 4676 characters with partial sequences of the genes COI, CytB, 16S rRNA, 12S rRNA and F-4 Reticulon. In this matrix 1155 characters was parsimonious informative. We used as outgroups samples of the species Hemipsilichthys gobio and Hemipsilichthys papilatus (subfamily Delturinae), Hypostomus nigromaculatus (subfamily Hypostominae), Hypoptopoma inexpectatum (subfamily Hypoptopomatinae), and Corumbataia cuestae (subfamily Otothyrinae). Following recent results about the relationship of the family Loricariidae the genus Pseudotocinclus was included in the present analysis. The results showed that the subfamily Neoplecostominae is monophyletic, including Pseudotocinclus. Three subgroups were recognized. The first one is composed by the species Pareiorhina carrancas, Pareiorhina sp. 1 (new species), a new genus of Neoplecostominae and all species of Neoplecostomus genus except Neoplecostomus ribeirensis. The second group is composed by Kronichthys, Isbrueckerichthys and Pareiorhaphis genera and the species Neoplecostomus ribeirensis. Kronichthys formed sister group with Pareiorhaphis and these two formed sister group with Isbrueckerichthys plus Neoplecostomus ribeirensis. The third group is the most basal found in the subfamily Neoplecostominae, composed by the species Pareiorhina rudolphi, Pareiorhina sp. 2, Pseudotocinclus juquiae and Pseudotocinclus tietensis. Thus, the genera Pareiorhina and Neoplecostomus do not appeared monophyletic, and we found ... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:14Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-06-26Bitstream added on 2014-06-13T19:21:41Z : No. of bitstreams: 1 chiachio_mc_dr_botib.pdf: 6789971 bytes, checksum: 12de89f30c69a02247c54be3362098d0 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A subfamília Hypoptopomatinae, considerada monofilética desde a sua descrição, incluí cerca de 100 espécies distribuídas em 17 gêneros que se dividem atualmente em duas tribos, Hypoptopomatini e Otothyrini. A tribo Hypoptopomatini é composta pelos gêneros Acestridium, Hypoptopoma, Oxyropsis, Niobichthys, Nannoptopoma e Otocinclus e a tribo Otothyrini por Corumbataia, Eurycheilichthys, Epactionotus, Hisonotus, Microlepidogaster, Otothyris, Otothyropsis, Parotocinclus, Pseudotocinclus, Pseudotothyris e Schizolecis. Os Hypoptopomatinae apresentam tamanho pequeno a moderado e geralmente compartilham uma fisionomia adulta distinta para Loricariidae. Diferentes estudos realizados nos últimos anos apontam a necessidade de novas reconstruções filogenéticas para a subfamília, devido a evidências levantadas por diferentes metodologias de análises que não corroboram o monofiletismo para o grupo em questão. Baseado nesses questionamentos, o presente trabalho objetivou realizar uma análise filogenética baseada em caracteres moleculares englobando o maior número de gêneros da subfamília Hypoptopomatinae, e de seus gêneros diretamente relacionados, a fim de se testar o monofiletismo para o grupo. Nossos resultados, baseados em sequências parciais do gene nuclear F-Reticulon4 e dos genes mitocondriais Citocromo oxidase I e 16S rRNA, não corroboram a hipótese de que Hypoptopomatinae é um grupo monofilético, quando os dados foram analisados por Máxima Parcimônia e Análise Bayesiana, devido a inclusão dos representantes de Neoplecostominae entre as duas tribos Otothyrini e Hypoptopomatini. Analisando as topologias obtidas para as tribos de Hypoptopomatinae, evidenciamos o monofiletismo para Hypoptopomatini, tendo Otocinclus como gênero basal para o grupo. 0 mesmo não pôde ser encontrado para Otothyrini devido à exclusão do gênero Pseudotocinclus que aparece mais relacionado à Neoplecostominae em todas as análises realizadas. / not available

Orientadora : Profª. Drª. Lupe Furtado-Alle / Coorientadora : Drª Luciane Viater Tureck / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba, 31/03/2017 / Inclui referências : f. 85-88 / Resumo: A maioria dos casos de obesidade e de dislipidemias possui origem complexa, pois é resultante da interação entre fatores genéticos e ambientais. Diversos genes têm sido relacionados com a susceptibilidade a estas doenças, incluindo variantes alélicas dos genes FTO, ABCA1, ABCA7 e ABCG1. Desse modo, o objetivo deste trabalho foi verificar se há influência de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) destes genes em variáveis relacionadas à obesidade e ao perfil lipídico em mulheres obesas e avaliar o efeito destes SNPs na mudança destas variáveis em resposta a uma dieta de restrição calórica. Para isso, foi coletado sangue de 211 mulheres obesas para análises bioquímicas (níveis de triglicerídeos - TG, colesterol total - CT, HDL-c, LDL-c e VLDL) e genotípicas, além de medidas antropométricas (índice de massa corporal - IMC, circunferência da cintura - CC, e circunferência abdominal - CA), antes e depois de uma dieta com redução de 600Kcal por dia. As amostras foram genotipadas por ensaio de discriminação alélica TaqMan® e posteriormente foram feitas análises estatísticas. Como resultado, as mulheres portadoras do alelo A do SNP rs9939609 (FTO) apresentaram uma menor redução de CA e maior redução dos níveis de HDL-c em resposta à dieta. As portadoras do alelo A do SNP rs1800977 (ABCA1) perderam menos IMC após a intervenção do que as não portadoras. As portadoras do genótipo TT do SNP rs2230806 (ABCA1) reduziram mais seus níveis de CT em resposta a dieta do que as portadoras do genótipo GG. Além disso, o alelo T foi mais frequente que o alelo C no grupo de mulheres com níveis de HDL-c maiores e níveis de LDL-c menores. As portadoras do genótipo GG do SNP rs2279796 (ABCA7) apresentaram níveis de CT e LDL-c maiores. Além disso, o alelo G foi mais frequente no grupo de mulheres com nível de CT e LDL-c maiores. Na resposta a intervenção dietética, as portadoras do genótipo GG aumentaram os níveis de TG e VLDL. As portadoras do alelo G do SNP rs692383 (ABCG1) apresentaram IMC maior, menor redução da CA em resposta a dieta e, em contrapartida, níveis de TG e VLDL menores e uma redução menor nos níveis de HDL-c. As portadoras do alelo A do SNP rs3827225 (ABCG1) tiveram uma maior redução de CA que as não portadoras, porém apresentaram um aumento maior nos níveis de LDL-c após a intervenção dietética. Esses resultados são indicativos de que possivelmente o alelo T do SNP rs2230806 (ABCA1) está associado com o efeito de proteção contra doenças cardiovasculares, pelos seus efeitos nos níveis de lipídeos séricos. Outrossim, o alelo G do SNP rs2279796 (ABCA7) pode estar conferindo um risco para doenças cardiovasculares, assim como o alelo A do SNP rs9939609 (FTO) sobre uma maior dificuldade em reduzir a CA e pela maior perda de HDL-c. Palavras-chave: Obesidade. Mulheres obesas. Intervenção dietética. Perfil lipídico. Gene FTO. Transportadores ABC. Estudo de associação. / Abstract: Obesity and dyslipidemias, in the majority of cases, have complex origin, as they result from the interaction between genetic and environmental factors. Many genes have been related to the susceptibility for these diseases, including FTO, ABCA1, ABCA7 and ABCG1 gene variants. Thus, the aim of this study was to verify if single nucleotide polymorphisms (SNPs) of these genes influence variables related to obesity and lipid profile in obese women and evaluate the effect of these SNPs in the variation of the variables in response to a calorie restriction diet. Thereunto, blood of 211 obese women was collected for biochemical (triglycerides - TG, total cholesterol - TC, HDL-c, LDL-c and VLDL levels) and genotypic analyses, besides anthropometric measures (body mass index - BMI, waist circumference - WC and abdominal circumference - AC), before and after a dietetic intervention with reduction of 600kcal per day. The samples were genotyped by allelic discrimination assay TaqMan® and analyzed statistically. As result, women carrying rs9939609 SNP (FTO) allele A had a lower AC reduction and a greater reduction of HDL-c levels in response to diet. A allele carriers of rs1800977 SNP (ABCA1) lost less BMI after intervention than non-carriers. TT genotype carriers of rs2230806 SNP (ABCA1) reduced more their TC levels than GG genotype carriers in response to diet. In addition, the T allele was more frequent than C allele in the group of women with higher HDL-c levels and lower LDL-c levels. GG genotype carriers of rs2279796 SNP (ABCA7) had higher TC and LDL-c levels. In addition, the G allele was more frequent in the group of women with higher TC and LDL-c levels. In response to dietary intervention, GG genotype carriers increased TG and VLDL levels. G allele carriers of rs692383 SNP (ABCG1) had higher BMI and lower AC reduction in response to diet but, on the other hand, lower TG and VLDL levels and a lower reduction in HDL-c levels. A allele carriers of SNP rs3827225 SNP (ABCG1) had a greater reduction in AC than non-carriers, but they had a higher increase in LDL-c levels after dietary intervention. These results are indicative that possibly T allele of rs2230806 SNP (ABCA1) is associated with the protective effect against cardiovascular diseases by their effects on serum lipid levels. In addition, the G allele of rs2279796 SNP (ABCA7) possibly is conferring a risk for cardiovascular diseases, as well as the A allele of rs9939609 SNP (FTO) on a greater difficulty in reducing AC and the greater loss of HDL-c. Keywords: Obesity. Obese women. Dietetic intervention. Lipid profile. FTO gene. ABC transporters. Association study.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-27Bitstream added on 2014-06-13T20:46:49Z : No. of bitstreams: 1 martinez_erm_dr_botib.pdf: 2208347 bytes, checksum: 6ce93d7fd93f449f221e0de7034254b3 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / A família Loricariidae, uma das maiores famílias de peixes do mundo com cerca de 690 espécies, tem sido objeto de vários estudos taxonômicos e sistemáticos, o que tem auxiliado na compreensão da diversidade e dos padrões gerais de relacionamento entre seus gêneros e espécies. Todavia, dada à ampla diversidade do grupo, muitos dos problemas da família ainda não foram resolvidos. Os estudos genéticos ainda podem ser considerados incipientes para o grupo, apesar de que vários dados importantes já tenham sido descritos. Dentro de Loricariidae o gênero Hypostomus é o mais numeroso (121 espécies descritas), com ampla distribuição, com grande incidência na maior parte das bacias hidrográficas brasileiras e um dos que se apresenta, também, menos resolvidos. Assim, o objetivo do presente trabalho foi realizar uma análise ampla de cunho citogenético e de sistemática molecular de Hypostomus, procurando levantar novos dados para o estabelecimento dos padrões de relacionamento entre as espécies deste gênero. As análises citogenéticas mostraram que sete populações de Hypostomus ancistroides das bacias dos rios Paraná, Paranapanema e Tietê, apresentaram número diplóide 2n=68, mas com uma variação morfológica dos cromossomos e com NORs variando entre dois e três pares nos cromossomos. H. regani da bacia do rio Mogi- Guaçu, apresentou 2n=72 cromossomos, com NOR em dois pares de cromossomos. Hypostomus sp. da bacia do rio Mogi-Guaçu, apresentou 2n=68 cromossomos, com NOR em dois pares de cromossomos. H. aff. agna da bacia Costeira Oriental, apresentou 2n=74 cromossomos, com NOR em dois pares de cromossomos. H. cf. heraldoi da bacia do rio Mogi-Guaçu, apresentou 2n=72 cromossomos, com NOR em um par de cromossomos. H. cf. strigaticeps da bacia do rio Mogi-Guaçu, apresentou 2n=74 cromossomos, com NOR em dois pares de cromossomos. H. cf. topavae da bacia do rio... / Not available

Um dos maiores objetivos na ciência atual é poder relacionar alterações nos genes a mudanças nas morfologias de organismos multicelulares. Além disso, é importante poder determinar se estas modificações foram obras do acaso ou se a seleção natural teve um papel central moldando a forma e o tamanho das criaturas vivas. A busca por nutrientes e sua utilização é uma das questões mais básicas para a sobrevivência de uma espécie. Em mamíferos a diversificação e especialização dos dentes para triturar, rasgar e mastigar diferentes tipos de comida possibilitou um incremento na geração de energia e representou uma inovação chave para a sobrevivência deste grupo. No presente estudo foi investigado o gene PAX9, que codifica um fator de transcrição chave no desenvolvimento da dentição de mamíferos. Para 125 indivíduos de origem ameríndia foi seqüenciado o exon 3 (138 pb), conjuntamente com as regiões intrônicas flanqueadoras 5´e 3´(232 pb e 220 pb, respectivamente) e os dados integrados com a informação disponível para a mesma região de 115 indivíduos de diferentes origens geográficas. Além disso, os exons 2, 3 e 4 (627 pb, 138 pb e 240 pb respectivamente) foram seqüenciados do DNA de 25 espécies de mamíferos e agrupados com os dados disponíveis de mais 29 espécies. Em humanos, o polimorfismo Ala240Pro possui uma distribuição variada entre os Ameríndios da América do Sul e está presente em Esquimós, Asiáticos e Europeus, mas não está presente entre os Afro-Americanos. O panorama que surge é que provavelmente a partir da saída da África a freqüência da mutação Ala240Pro aumenta, sendo possivelmente selecionada positivamente, o que pode estar relacionado à agenesia do terceiro molar, ou ainda, estar associado a genes conectados a adaptações ao frio. Com a chegada dos Ameríndios a regiões equatoriais, outro cenário parece dominar a evolução do exon 3, seja pela perda inicial da possível vantagem adaptativa, ou por causa da ação da deriva genética amplamente documentada nestas populações. Provavelmente em algum momento na história destas populações, fatores casuais poderiam ter sido preponderantes às restrições funcionais da proteína. Em geral, há uma maior variabilidade em nível de aminoácidos no exon 3 considerando todos os mamíferos estudados quando comparada com a do exon 2, ficando o exon 4 numa posição intermediária. O exon 3 seria um exemplo notável de uma situação que conferiria “evolvabilidade” ao PAX 9. / One of the main goals in science today is to establish the relation between gene changes and variations in the morphologies of multicellular organisms. In addition, it is important to determine if these changes were randomic or whether natural selection had a central role shaping the form and size of living beings. Searching for nutrients and its use is one of the most basic issues for a species survival. In mammals teeth diversification and specialization to grind, tear and chew different types of food were a key innovation that allowed an increase in the generation of energy and in the survival of this group. In this study an investigation was performed in the Paired box gene 9 (PAX9), which codes for a transcription factor that was a key factor in the development of mammal dentition. A total of 125 persons from Amerindian populations were studied by sequencing the PAX9 gene exon 3 (138 base pairs) as well as its 5´and 3´flanking intronic segments (232 bp and 220 bp, respectively) and the data integrated with the information available for the same genetic region from 115 individuals of different geographical origins. Moreover, exons 2, 3 and 4 (627 bp, 138 bp and 240 bp, respectively) were sequenced from DNA of 25 mammalian species and the results combined with the data available from other 29 additional species. In humans, the Ala240Pro polymorphism has a varied distribution among the South American Amerindians and is present in Eskimos, Asians and Europeans, but it is not present among Afro-Americans. The pattern that emerges is that probably starting with the out-Africa migration, and possibly as a result of positive selection, the Ala240Pro mutation frequency increased, that could be related to third molar agenesis or an associated gene connected to cold adaptation. With the Amerindian arrival again in equatorial regions, another pattern seems prevalent in exon 3 evolution, either due to the loss of a possible initial adaptive advantage, or to the action of genetic drift, widely documented in these populations. Probably at some point in the history of these populations, random factors could have been dominant despite the protein functional restrictions. In a general way, there is a greater variability at the amino acid level in exon 3 of all mammals considered when compared to exon 2, exon 4 occupying an intermediary position. Exon 3 would be a remarkable example of a condition that would confer PAX9 evolvability.

Orientador: Eiko Eurya Kuramae / Resumo: O mal-do-panamá causado por Fusarium oxysporum Schlecht. f. sp. cubense (E. F. Smith) Snyder & Hansen é um dos problemas fitossanitários mais sérios da bananicultura mundial. Devido a esta doença, um dos manejos culturais recomendados para o cultivo da bananeira, é a formação da cultura em locais onde o patógeno ainda não foi detectado. Visando fornecer subsídios para futuros programas de manejo da cultura, este trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade genética entre isolados monospóricos do gênero Fusarium sp., presentes em tecidos de plantas e em diferentes tipos de solo do norte de Minas Gerais. Foram utilizados 19 isolados de tecidos de bananeira, tomateiro, coqueiro e tamareira, e 63 isolados obtidos de solo. Também foram incluídos neste trabalho, 5 isolados de F. oxysporum de diferentes formae speciales (2 isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense, 1 de Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum, 1 de Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli e 1 de Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici) e 4 de F. solani de feijoeiro. Através de polimorfismo do DNA amplificado ao acaso (RAPD) e análise das seqüências de nucleotídeos dos espaços transcritos internos (ITS1/ITS2) do DNA ribossomal (5.8S rDNA), avaliou-se a variabilidade genética dos isolados. Foi utilizado o método RAPD com a combinação de sete "primers", o que resultou 72 bandas polimórficas. Através desta análise foi possível obter 3 grupos geneticamente distintos, com ponto de ramificação superior a 50% de similaridade. No sequenciamento, os produtos de PCR foram realizados com os "primers" ITS4 e ITS5 para o rDNA, obtendo fragmentos de 550 a 600 pb em todos os isolados. A análise do consenso das seqüências da região ITS e do gene 5.8S do rDNA foram comparadas com seqüências do GenBank. Os dendrogramas gerado por agrupamento UPGMA com os de RAPD e... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo). / Abstract: Panamá disease caused by Fusarium oxysporum Schlecht. f. sp. cubense (E.F. Smith) Snyder & Hansen is one of the most serious phytosanitary problems of banana culture worldwide. Due to this disease, culture formation in locals where the pathogen has not been detected yet is one of the culture management recommended for banana plant culture. Aiming at providing subsidies for future culture management programs, this work evaluated the genetic variability among monosporous isolate of Fusarium sp. present in plant tissues and in different types of soil in north of Minas Gerais state. Nineteen tissue isolates of banana plant, coconut tree and date palm, and 63 isolates of soil were used. It was also included in this work 5 isolates of F. oxysporum of different formae speciales (2 isolates of F. oxysporum f. sp. cubense, 1 of F. oxysporum f. sp. vasinfectum, 1 of F. oxysporum f. sp. phaseoli and 1 of F. oxysporum f. sp. lycopersici) and 4 of F. solani of bean plant. Through polymorphism of DNA amplified at random (RAPD) and nucleotides sequence analysis of ribossomal DNA (5.8SrDNA) internal transcripted spaces (ITS1/ITS2), isolates genetic variability was assessed. It was used the RAPD method with combination of seven "primers", what resulted in 72 polymorphic ribbons. Through such analysis, it was possible to obtain 3 genetically different groups, with ramification point over 50% of similarity. In the sequence, PCR products were carried out with the "primers" ITS4 and ITS 5 for rDNA, obtaining fragments of 550 to 600 pb in all isolates. Sequences analysis of ITS region and gene rDNA 5.8S was compared to GenBank sequences. The dendrographs generated by UPGMA grouping with the RAPD ones and those of nucleotides sequences were much similar. There was no correlation of the groups formed in the dendrographs concerning geographic location and host plant... (Complete abstract, click electronic address below). / Mestre