Submitted by Claudia Rocha (claudia.rocha@udesc.br) on 2018-02-23T14:35:18Z No. of bitstreams: 1 PGPV16MA192.pdf: 957637 bytes, checksum: 97f795d2bfa5bbcfdfd15778233312bb (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-23T14:35:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV16MA192.pdf: 957637 bytes, checksum: 97f795d2bfa5bbcfdfd15778233312bb (MD5) Previous issue date: 2016-07-15 / FAPESC / The main causes of reduction in bean crop productivity are the abiotic stresses such as drought stress, low availability of nutrients in the soil and unfavorable temperatures. The selection of bean cultivars with a larger root distribution is an excellent strategy to improve nutrient absorption capacity in soils with low nutrient availability, and also genotypes with more developed root system has increased tolerance to drought stress. So it is very important to analyze the distribution of the root bean system in breeding programs, as cultivars with larger root profile are more productive and resistant to biotic and abiotic factors. Thus, this study aimed to: i) estimate the phenotypic correlation and its direct and indirect effects of the aerial part of the components that are associated with root distribution, facilitating the indirect selection for this character; ii) evaluate the genetic variability and association of root distribution in relation to the growth habit in bean lines. The experiments were conducted in the experimental area of IMEGEM, arranged in a randomized block design. To evaluate the root system was used Bohm method, when the genotypes full flowering were perpendicular profiles open the line of sowing, a rectangle with dimensions of 0.5 m wide by 0.3 m high, with checkered 0 05 m side was willing and a photo was taken. The determination of the root distribution in binary (presence denomination (1) and absence (0) of the root in each square) was performed using photo analysis. The measurement of characteristic root distribution of the determination of simple events (presence = 1 and absence = 0). In addition, it evaluated the root angle through Shovelomics method and also measured the aboveground parts. The results revealed the importance of stem diameter characters, leaf area index, the first pod insertion and root angle, since it had the highest positive correlation with root distribution to assist in indirect selection of this character. The residual effect was greater than the coefficient of determination indicating that the independent characteristics are not fully influence on the root distribution and low values of correlation coefficients are attributed to the effects of environment, competition for nutrients and different physiological mechanisms that control the expression multiple genes with minor effects. The results revealed that genetic variability exists in the root system of the analyzed strains. All contrasts involving the particular growth habit showed significant difference, indicating that the habit indeterminate genotypes are promising for use in crossing blocks, when the aim is the selection of cultivars with good root distributions / As principais causas de redução na produtividade da cultura do feijão são os estresses abióticos, como deficiência hídrica, baixa disponibilidade de nutrientes no solo e temperaturas desfavoráveis. A seleção de cultivares de feijão com uma maior distribuição radicular é uma excelente estratégia para melhorar a capacidade de absorção de nutrientes, em solos com baixa disponibilidade de nutrientes, e também, genótipos com sistema radicular mais desenvolvido possuem maior tolerância ao estresse hídrico. Por isso, é de grande importância a análise da distribuição do sistema radicular do feijão em programas de melhoramento, já que cultivares com maior perfil radicular se mostram mais produtivas e com resistência a fatores bióticos e abióticos. Sendo assim, este trabalho teve como objetivos: i) estimar a correlação fenotípica e seus efeitos diretos e indiretos dos componentes da parte aérea que estão associados com a distribuição radicular; ii) avaliar a variabilidade genética e associação da distribuição radicular em relação ao hábito de crescimento em linhagens de feijão. Os experimentos foram realizados na área experimental do IMEGEM, arranjados em delineamento de blocos casualizados. Para avaliação do sistema radicular foi utilizado o método de Bohm, quando os genótipos apresentaram pleno florescimento foram abertos perfis perpendiculares a linha de semeadura, onde um retângulo com dimensões de 0,5 m de largura por 0,3 m de altura, quadriculado com 0,05 m de lado foi disposto e uma foto foi capturada. A determinação da distribuição radicular no sistema binário (denominação de presença (1) e ausência (0) das raízes em cada quadrícula) foi realizada por meio da análise da foto. A mensuração da característica distribuição radicular a partir da determinação de eventos simples (presença=1 e ausência=0). Além disso, foi avaliado o ângulo de raiz através do método de Shovelomics e também mensurado os componentes da parte aérea. Os resultados revelaram a importância dos caracteres diâmetro de caule, índice de área foliar, inserção do primeiro legume e ângulo de raiz, uma vez que apresentaram as maiores correlações positivas com a distribuição radicular, podendo auxiliar na seleção indireta desse caráter. O efeito residual foi superior ao coeficiente de determinação, indicando que as características independentes não têm total influência na distribuição radicular, e os baixos valores dos coeficientes de determinação estão atribuídos a efeitos do ambiente, competição por nutrientes e a diferentes mecanismos fisiológicos que controlam a expressão de vários genes com efeitos menores. Os resultados revelaram que existe variabilidade genética no sistema radicular das linhagens analisadas. Todos os contrastes envolvendo o hábito de crescimento determinado apresentaram diferença significativa, evidenciando que os genótipos de hábito indeterminado são promissores para utilização em blocos de cruzamentos, quando a finalidade é a seleção de cultivares com boas distribuições radiculares

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV09MA068.pdf: 554535 bytes, checksum: 429ba843791c8286f5d93bc31c7b1fc9 (MD5) Previous issue date: 2009-06-08 / This work aimed to estimate the reduction in soybean production caused by the whitefly and to study control tactics for its management. The trials were carried out under greenhouse conditions and in the field area from Embrapa Arroz e Feijão, and in crops from the cities of Itauçú and Goiânia, state of Goiás. The control level was evaluated in the field in three infestation levels and a non-infested control. The number of nymphs/leaflet was evaluated weekly, and after harvesting, the production and weight of 100 seeds per treatment were also evaluated. It was observed that infestations above 20 nymphs/leaflet reduce grain production, and 59 nymphs/leaflet reduce grain weight. The efficiency of insecticides to control whitefly and selectivity to the parasitoids Encarsia sp., Trichogramma pretiosum and Telenomus remus were tested in field and greenhouse trials. In the field, under natural insfestation, the number of eggs and whitefly nymphs on 10 leaflets/plot were counted after the insecticide application. In the greenhouse, the application was performed one and three days after artificial infestation and the evaluations were done by counting the number of whitefly eggs and nymphs after 10 days. To evaluate the selectivity on natural enemies, the trials were conducted separately to each parasitoid species and development stage. In the trial with pupae, the lepidopteran host postures glued separately in white cardboards and parasitized by T. pretiosum and T. remus, and, whitefly nymphs parasitized by Encarsia sp., were immersed for five seconds in the insecticides solutions and packed in plastic bags up to parasitoid emergency when the number of parasitized eggs or nymphs and parasitoid emergency were evaluated. To the trials with T. remus and T. pretiosum adults, the treatments were sprayed on glass plates and the adults liberated on them in cages padronized by IOBC. Parasitism was evaluated one and two days after spraying. The treatments buprofezin 150 g a.i. ha-1 + mineral oil 0,2% v/v and piriproxifen 100 g. a.i. ha-1 showed better efficiency in controlling the whitefly and higher selectivity to the parasitoids. The use of Organic Neem® and its association with the fertilizer Sili-k® in the control of B. tabaci were evaluated by their application on soybean plants before and after artificial infestation. Those products did not show control efficience. The oviposition preference and colonization of B. tabaci in soybean genotypes were evaluated with two different tests. In the chance of choice trial the tested genotypes were: IAC 17, IAC 19, IAC Holambra Stwart, BABR01-0492, BABR01-0173, BABR01-1259, BABR01-1576, BABR99-4021HC, BABR99-4021HP, Barreiras, Conquista, Corisco, BRS Gralha, PI274454, PI227687 and PI171451. In the greenhouse, plants of each genotype was disposed in circles equidistant from the infested plant. In the test without chance of choice, the evaluated genotypes were: Barreiras, Corisco, IAC 19, IAC Holambra Stwart, BRS Gralha, BABR01-1576. Plants from each genotype were confined with two hundred adult in cages with iron frame covered with voil fabric. The results showed that, in both tests, the most resistant genotype, when compared to the others, was Barreiras / Objetivou-se com este trabalho estimar a redução na produção de soja causada pela mosca branca e estudar táticas de controle para seu manejo. Os experimentos foram conduzidos em casa de vegetação e área de campo da Embrapa Arroz e feijão e em lavouras de Itauçú e Goiânia, GO. O nível de controle foi avaliado a campo em três níveis de infestação com testemunha sem infestação. Semanalmente contou-se o numero de ninfas/folíolo e no final do ciclo avaliou-se a produção e o peso de 100 sementes por tratamento. Observou-se que infestações acima de 20 ninfas/folíolo reduzem a produção de grãos e 59 ninfas/folíolo reduzem o peso dos grãos. A eficiência de inseticidas contra a mosca branca e seletividade aos parasitóides Encarsia sp., Trichogramma pretiosum e Telenomus remus foi testada a campo e em casa de vegetação. No campo, sob infestação natural, contou-se o número de ovos e de ninfas de mosca branca em 10 folíolos/parcela, após a aplicação dos inseticidas. Em casa de vegetação sob infestação artificial a aplicação de inseticidas foi realizada em diferentes períodos. Dez dias após o tratamento contando-se o número de ovos e ninfas de mosca branca. A seletividade dos inseticidas sobre os inimigos naturais foi testada separadamente para cada espécie e estágio de desenvolvimento do parasitóide. Pupas e posturas dos lepidópteros hospedeiros coladas em cartolina e parasitadas por T. pretiosum e T. remus e ninfas de mosca branca parasitadas por Encarsia sp. foram imersas por cinco segundos nas caldas com inseticidas e acondicionadas em sacos plásticos. Foi avaliado o número de ovos ou ninfas parasitados e a emergência dos parasitóides. Adultos de T. remus e T. pretiosum foram expostos a placas de vidro impregnadas com inseticidas em gaiolas padronizadas pela IOBC. O parasitismo foi avaliado ate dois dias após a aplicação. Os tratamentos buprofezina 150 g i.a. ha-1 + óleo mineral 0,2% v/v e piriproxifem 100 g. i.a. ha-1 controlaram eficientemete a mosca branca e foram seletivos aos parasitóides. O uso de Organic Neem® associado ao fertilizante Sili-k® no controle de B. tabaci, foi avaliado pela aplicação em plantas de soja antes e após a infestação artificial. Estes produtos não apresentaram eficiência de controle. A preferência de oviposição e colonização de B. tabaci em genótipos de soja foram avaliadas com diferentes testes. Para os testes com chance de escolha foram utilizados os genótipos: IAC 17, IAC 19, IAC Holambra Stwart, BABR01- 0492, BABR01-0173, BABR01-1259, BABR01-1576, BABR99-4021HC, BABR99-4021HP, Barreiras, Conquista, Corisco, BRS Gralha, PI274454, PI227687 e PI171451. Em casa de vegetação, plantas de cada genotipo ficaram dispostas em forma de círculo eqüidistante da planta infestada. No teste sem chance de escolha os genótipos avaliados foram: Barreiras, Corisco, IAC 19, IAC Holambra Stwart, BRS Gralha, BABR01-1576. Plantas de cada genótipos foram confinadas juntamente com 200 adultos de mosca branca em gaiolas com armação de ferro cobertas com tecido voil . Os resultados mostraram que, nos dois tipos de teste, o genótipo mais resistente, quando comparado aos padrões de resistência foi Barreiras

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV13MA121.pdf: 2648167 bytes, checksum: 59970008b360631f92048903e41ccc75 (MD5) Previous issue date: 2013-07-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The seed quality is due as a set of characteristics that determine its value for sowing, indicating its potential performance under adverse conditions, following as criteria the genetic physical, physiological and sanitary attributes. The soybean cultivars are classified by maturation groups (GM). This work objectified to evaluate the genetic quality associated with physiological and seed sanitary quality, and the contribution of high yield components from soybean cultivars of maturation group different. The experiment was carried out with 16 cultivars of soybean from GM and cycle, under field conditions in the 2011/2012and 2012/2013 growing season using randomized block design with three repetitions in Santa Catarina countries: Campos Novos place.The cultivars used were: 7 veryearly cycle cultivars (GM 4.7 to 5.8), 5 early (5.9 to 6.2 GM) and 4 medium (GM 6.3 to 6.7). In growing season 2011/2012 due to low rainfall precipitation (3.5 mm / day) in stages between pre-harvest ripening, observed a low incidence of pathogens in soybean seeds (0.1% to 8.5%) which the GM cultivars of 6.3 to 6.7 (semi-early cycle) had a higher incidence of fungi in seeds (0.1% to 8.5%). In 2012/2013 with the condition of high rainfall (6.9 mm / day), the cultivars belonging to GM 4.7 to 5.8 cycle veryearly showed the highest incidence of fungi in seeds (0.0% to 12.4 %), which allowed indicate a higher incidence of fungi on seeds due to higher rainfall. Cultivars GM 4.7 to 5.8 with veryearly cycle had higher yields, and yield components between the number of pods per plant and number of seed per pod, its characters have greater potential for selection and identification of superior genotypes for yield in soybean seeds. The physiological quality of soybean seeds was dependent from cultivar used and interaction with growing season, because the GM 6.3 to 6.7 cultivars showed higher physiological quality in the MF, due to rainfall in the maturation stage contributing to its better development. In general, the physiological and sanitary seed quality can be attributed by interaction between genetic quality and environmental conditions / A qualidade da semente é definida como um conjunto de características que determinam seu valor para a semeadura, indicando seu potencial de desempenho sob condições adversas, seguindo como critérios os atributos genéticos, físicos, fisiológicos e sanitários. As cultivares de soja são classificadas por grupos de maturação (GM). O objetivo do trabalho foi avaliar a qualidade genética associada à qualidade fisiológica e sanitária, e a contribuição dos componentes de rendimento para elevadas produtividades em cultivares de soja de diferentes grupos de maturação. O experimento foi conduzido no município de Campos Novos (SC) nas safras 2011/2012 e 2012/2013 e, utilizou-se 16 cultivares de diferentes GM e ciclo, sendo 7 cultivares de ciclo superprecoce (GM 4.7 a 5.8), 5 precoce (GM 5.9 a 6.2) e, 4 semiprecoce (GM 6.3 a 6.7). Na safra 2011/2012 devido a baixa precipitação pluviométrica precipitação (3,5 mm/dia) nas fases entre maturação e pré-colheita houve baixa incidência de patógenos nas sementes de soja (0,1% a 8,5%) nas quais as cultivares do GM 6.3 a 6.7 (ciclo semiprecoce) apresentaram maior incidência de fungos nas sementes (0,1% a 8,5%). Na safra 2012/2013 com condição de alta precipitação pluviométrica (6,9 mm/dia), as cultivares pertencentes ao GM 4.7 a 5.8 de ciclo superprecoce foram as que apresentaram maior incidência de fungos nas sementes (0,0% a 12,4%), o que permitiu indicar a maior incidência de fungos nas sementes em função das maiores precipitações pluviométricas. As cultivares do GM 4.7 a 5.8 com ciclo superprecoce, apresentaram maior produtividade e, entre os componentes de rendimento, o número de vagem por planta e o número de semente por vagem são caracteres de maior potencialidade para a seleção e identificação de genótipos superiores para o rendimento de sementes em soja. A qualidade fisiológica das sementes de soja foi dependente da cultivar utilizada e da interação com as condições ambientais, pois as cultivares do GM 6.3 a 6.7 apresentaram maior qualidade fisiológica na MF, devido à uniformidade de precipitação no estádio de enchimento de sementes contribuindo para o seu melhor desenvolvimento

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV14MA142.pdf: 646523 bytes, checksum: e0bd829f134f5d24d758fee703f47aa9 (MD5) Previous issue date: 2014-06-27 / The objectives of the survey and typing traditional orchards subsistence containing fig plants in rural and urban perimeter Catarina were performing. Characterize the roughness of the fig tree clones and evaluate the use of homeopathic preparations in fig rust control in organic production systems. The metodology used for the survey and location of fig germplasm nigger were held through technical visits. We conducted 43 interviews with semi-structured questionnaire, rising information about the history, potential use, ways to use the fruit and procedures for management of fig. For characterization of resistance expedriments were conducted at the Experimental Station of the Agriocultural Research and Rural Extension, Lages, SC and the Federal Institute of Santa Catarina Concord Campus, in the period 2013/2014. The experiments consisted of evaluation of 35 clones in four replication, with and experimental ploto f fours plants, the revews were incidence and severity of rust on the leaves fortnightly. The study wth the use of homeopathic preparations was conducted in the greenhouse and the field at trhe Federal Institute of Santa Catarina Concord Campus, SC, in two cropping cycles, 2012/2014. The experimental design was a randomized block with four replications, the field and eight replicates in a greenhouse. The homeopatic treatments were prepared: Belladonna, Ferrum fosforicum, Aconitum napelus and biotherapic of fig leaves, all in CH12 (twelfth order of Hahnemann s centesimal dolution), Bordeaux mixture 0.2% and 0.3% sulfue syruo. Witnesses were water and non-intervention. It was found that the cultivation of the fig tree is associated with the lemon, orange, bergamoteiras, vines, peac, persimmon and plum trees in backyards, near the home. Phytosanitary problems were repprted by 86% of respondentes in rural areas and 14% in the urban áreas. All respondentes (43) figs intended for personal use and also sells only one. The age of the plants of figs were between 8-65 years. Two accessions of purple figs and two accessions of fine purple fig showed less incidence and severity ofrust on the leaves. The availability of Creoles genotypes resistance to rust offers potential for use on a comercial scale in the locations studies. In the greenhouse, fig treated with Belladonna 12CH, 0.2% Bordeaux misture and lime súlfur to 0.3% showed less senescence and showed the lowest área under the disease progress curve. The field, fig treated with Belladonna 12CH, 0.2% Bordeaux mixture and lime súlfur to 0.3% also showed the lowest área under the disease progress curve and a lower incidence of rust average of seven ecaluations. Holders of knowledge about the cultivation and use of fig fruits are prevalente in the elderly. There Creoles genptypes high resistance rust. Belladonna and nosode rust were equivalente to Bordeaux mixture in most trials in the management of rust fig / Este estudo teve objetivo de reconhecer germoplasma crioulo de figo, o conhecimento associado e avaliar a resistência da figueira e uso de preparados homeopáticos no manejo da ferrugem. A localização e levantamento de germoplasma de figo crioulo foram realizadas através de visitas técnicas a área rural no Oeste Catarinense e urbana de Lages. Realizou-se 43 entrevistas com questionário semi-estruturado, levantandose informações sobre o histórico, potencial de uso, formas de utilização do fruto e procedimentos de manejo de figueiras. Para caracterização de resistência experimentos foram realizados na Estação Experimental da Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural, Lages, SC e no Instituto Federal Catarinense Campus Concórdia, no período de 2013/2014. Os experimentos constaram de avaliação de 35 clones em quatro repetições, sendo a parcela experimental de quatro plantas. As avaliações foram quinzenais de incidência e severidade de ferrugem nas folhas. O estudo com uso de preparados homeopáticos foi realizado em casa de vegetação e a campo no Instituto Federal Catarinense Campus Concórdia, SC, em dois ciclos de cultivo de 2012 a 2014. O delineamento experimental foi de blocos ao acaso com quatro repetições, a campo, e oito repetições, em casa de vegetação. Os tratamentos foram os preparados homeopáticos: Belladonna, Ferrum fosforicum, Aconitum napelus, e bioterápico de folhas de figueiras, todas na CH12 (décima segunda ordem de diluição centesimal hahnemanniana). Calda bordalesa a 0,2% e calda sulfocalcica a 0,3% foram os tratamentos padrão. Testemunhas foram a água e não intervenção. Verificou-se que o cultivo da figueira está associado, a limoeiros, laranjeiras, bergamoteiras, videiras, pessegueiros, caquizeiros e ameixeiras em quintais, próximos às residências. Problemas fitossanitários foram reportados por 86% dos entrevistados na área rural e 14% no perímetro urbano. Todos os entrevistados (43) destinam os figos para consumo próprio e apenas um também comercializa. A idade das plantas de figos foi entre 8 a 65 anos. Dois acessos de figo roxo e dois acessos de figo roxo fino mostraram menos incidência e severidade de ferrugem nas folhas. A disponibilidade de genótipos crioulos resistentes a ferrugem oferece potencial de uso em escala comercial nos locais estudados. Em casa de vegetação, figueiras tratadas com Belladonna 12CH, calda bordalesa a 0,2% e calda sulfocálcica a 0,3% apresentaram menor senescência e apresentaram menor índice de área abaixo da curva de progresso da doença. A campo, figueiras tratadas com Belladonna 12CH, calda bordalesa a 0,2% e calda sulfocálcica a 0,3% também apresentaram menor índice de área abaixo da curva de progresso da doença e menor incidência da ferrugem, média das sete avaliações. Detentores do conhecimento sobre o cultivo e uso de frutos de figo são predominantes de terceira idade. Belladonna e Nosódio da ferrugem foram equivalentes a calda bordalesa na maioria dos ensaios no manejo da ferrugem da figueira

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:25:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Michel_Aldrighi_Goncalves.pdf: 1516499 bytes, checksum: 9da5ae7039fd806dd67f130ae9fec997 (MD5) Previous issue date: 2011-03-02 / The present work aimed to evaluate and characterize the behavior of different peach genotypes submitted to variations of period and type of pruning, in the region of Pelotas, RS. The work was carried out in Pelotas, RS, in an experimental area belonging to Embrapa Clima Temperado (CPACT) during 2009 and 2010 seasons. Two experiments were done: the first one was comprised of a combination among three periods of pruning (Winter pruning WP; winter pruning plus summer pruning WSP; and summer pruning SP) and three genotypes (Cascata 805, Cascata 834 (BRS Kampai) and Cascata 952 (BRS Rubimel), resulting in nine distinct combinations. The second experiment consisted in three types of pruning (short pruning SP; long pruning LP; and no shoot topping NST) and two genotypes (Riograndense and Leonense), resulting in six treatments. In general, the chemical characteristics of the fruits are not affected by the different pruning period, as well as, the fruitset. BRS Rubimel did not show uniformity of yield in the following years when using the summer pruning; however, BRS Kampai had a good yield equilibrium at all pruning date tested. Trees pruned only in the winter period showed higher vigor whether compared to other studies. The different types of pruning directly affected the number of flowers and fruits, diameter and mean mass, and yield. The short pruning stimulates the growth of undesirable shoots, making unviable the summer pruning practice. In general, the variations of pruning type and period could be commercially used depending on the genotype studied. / Com o presente trabalho objetivou-se avaliar e caracterizar o comportamento de diferentes genótipos, submetidos a variações de época e tipo de poda na região de Pelotas, RS. O mesmo foi conduzido no município de Pelotas, RS, em uma área experimental pertencente a Embrapa Clima Temperado (CPACT), durante os anos de 2009 e 2010 e, composto de dois experimentos: o primeiro teve como tratamentos a combinação de três épocas de poda (Poda de inverno (PI), poda de inverno mais poda de verão (PIV) e poda de verão (PV)) e três genótipos (Cascata 805, Cascata 834 (BRS Kampai) e Cascata 952 (BRS Rubimel), resultando em nove combinações distintas; o segundo experimento os tratamentos foram compostos por três tipos de poda (Poda curta (PC), poda longa (PL) e poda sem desponte (PSD) e dois genótipos (Riograndense e Leonense), resultando em seis tratamentos. Em geral as características químicas dos frutos não são alteradas com as variações de época de poda estudadas, assim como a frutificação efetiva. BRS Rubimel não apresentou uniformidade produtiva com a sucessão de cultivos com poda apenas no período de verão, já a BRS Kampai teve um bom equilíbrio produtivo em todas as datas de podas testadas. Plantas podadas apenas no período de inverno apresentam maior vigor quando comparadas com as demais estudados. Já os diferentes tipos de poda influenciaram diretamente no número de flores e frutos, diâmetro e massa média, assim como na produtividade. A poda curta estimula o crescimento de ramificações indesejáveis tornando mais trabalhosa a prática da poda verde. De maneira geral as variações de tipo e época de poda podem ser utilizadas comercialmente dependendo do genótipo trabalhado.

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-10-20T18:58:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thais Augusto Marinho - 2012.pdf: 1266028 bytes, checksum: cd93decbadceaf3e44ca429c0702442e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2014-10-20T20:08:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thais Augusto Marinho - 2012.pdf: 1266028 bytes, checksum: cd93decbadceaf3e44ca429c0702442e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-20T20:08:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thais Augusto Marinho - 2012.pdf: 1266028 bytes, checksum: cd93decbadceaf3e44ca429c0702442e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2012-02-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Hepatitis C represents an important public health problem. Although acute hepatitis C virus (HCV) infection is often asymptomatic, 50 to 85% of these cases progress to chronic disease, and can lead to liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma. Accidents involving contaminated sharps occur in recyclable waste collectors as a result of contact with glass, ferrous sharp, needles and syringes, demonstrating, thus, the increased risk of these professionals in acquiring infections by the parenteral route, such as hepatitis C. There is currently very little data on HCV infection among recyclable waste collectors. This study aimed to investigate the epidemiological and molecular profile of the hepatitis C virus infection among recyclable waste collectors in Goiânia, Goiás. A total of 431individuals were interviewed for socio-demographic characteristics and risk factors for HCV infection. Blood samples were collected and sera were tested for the presence of antibodies to HCV (anti-HCV) using an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and immunoblot. All samples were submitted to HCV RNA detection by polymerase chain reaction (PCR) with primers complementary to the conserved area of the 5’ non-coding (NC) region of HCV. Positive HCV RNA samples were genotyped by direct sequencing analysis of the NS5B region of viral genome, followed by phylogenetic analysis. The HCV infection prevalence was 1.6% (95% CI: 0.6-3.6) in recyclable waste collectors in Goiânia-GO. In a multivariate analysis, history of sexually transmitted disease was independently associated with this infection, while the variables history of blood transfusion and number of sexual partners showed an association with a borderline P value (p = 0.05 and p = 0.07, respectively). Viral RNA was detected in five of the seven anti-HCV positive samples, and the genotype 1, subtypes 1a (n = 1), 1b (n = 2) and 1a/1b (n = 2) were identified in the study population. Although the HCV infection prevalence found among recyclable waste collectors in Goiânia-GO is similar to that observed in local blood donors (1.4%), this population is in risk to HCV by sexual and parenteral transmission. / A hepatite C representa um importante problema de saúde pública. Apesar da infecção aguda pelo vírus da hepatite C (HCV) ser geralmente assintomática, 50 a 85% dos casos evoluem para cronicidade, podendo desenvolver cirrose hepática e carcinoma hepatocelular. Acidentes com objetos perfurocortantes contaminados podem ocorrer em catadores de materiais recicláveis como consequência do contato com vidros, materiais ferrosos pontiagudos, agulhas e seringas, evidenciando-se, assim, o risco aumentado desses profissionais em adquirir infecções por via parenteral, como a hepatite C. São escassos os trabalhos sobre a infecção pelo HCV em catadores de materiais recicláveis. O presente estudo teve como objetivo investigar o perfil soroepidemiológico e molecular da infecção pelo vírus da hepatite C em catadores de materiais recicláveis em Goiânia, Goiás. Um total de 431 indivíduos foi entrevistado sobre características sociodemográficas e fatores de risco para infecção pelo HCV. Amostras de sangue foram coletadas e os soros testados para detecção de anticorpos para o HCV (anti- HCV), por ensaio imunoenzimático (ELISA) e immunoblot. Todas as amostras foram submetidas à detecção do RNA viral por reação em cadeia da polimerase (PCR) com iniciadores complementares as região 5’ não codificante (NC) do HCV. As amostras RNA-HCV positivas foram genotipadas por sequenciamento direto da região NS5B do genoma viral, seguido de análise filogenética. A prevalência da infecção pelo HCV em catadores de materiais recicláveis em Goiânia-GO foi de 1,6% (IC 95%: 0,6–3,6). Pela análise multivariada, história de doença sexualmente transmissível foi independentemente associada a esta infecção, enquanto as variáveis história de transfusão e número de parceiros sexuais apresentaram associação marginal (p = 0,05 e p = 0,07, respectivamente). O RNA viral foi detectado em cinco das sete amostras anti- HCV positivas, sendo identificado o genótipo 1, subtipos 1a (n=1), 1b (n=2) e 1a/1b (n=2) na população estudada. Apesar da prevalência da infecção pelo HCV em catadores de materiais recicláveis em Goiânia-GO ser semelhante a observada previamente em doadores de sangue (1,4%), a referida população mostrou-se em risco transmissão sexual e parenteral do HCV.

Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2017-12-15T16:34:33Z No. of bitstreams: 2 Tese - Nativa Helena Alves Del-Rios - 2016.pdf: 5653902 bytes, checksum: 8bdbf3d657fcdca5983ccf5099b3b42d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Rejected by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com), reason: Veja com a Cláudia se realmente devemos colocar na BDTD, pois no sumário vi artigo "a ser submetido". on 2017-12-18T13:47:56Z (GMT) / Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2017-12-18T16:39:42Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Nativa Helena Alves Del-Rios - 2016.pdf: 5653902 bytes, checksum: 8bdbf3d657fcdca5983ccf5099b3b42d (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-12-19T12:05:01Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Nativa Helena Alves Del-Rios - 2016.pdf: 5653902 bytes, checksum: 8bdbf3d657fcdca5983ccf5099b3b42d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-19T12:05:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Nativa Helena Alves Del-Rios - 2016.pdf: 5653902 bytes, checksum: 8bdbf3d657fcdca5983ccf5099b3b42d (MD5) Previous issue date: 2016-03-08 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Crack users are uniquely vulnerable to acquisition and transmission of infectious agents such as hepatitis C virus (HCV) because the artifacts used for drug consumption are often shared among individuals with lesions in the oral cavity. The objective of this study was to investigate the epidemiological and molecular profile of infection with hepatitis C virus among in-treatment crack users in Goiania, Goias, Central Brazil. The population consisted of 600 crack users in a drug treatment hospital in Goiania (Spiritist Hospital Euripides Barsanulfo - Euripides House), from August 2012 to April 2013. Blood samples were tested for antibodies to HCV by (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay - ELISA). Samples with anti-HCV reagents were subjected to detection of viral RNA by RT-PCR (Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction). All HCV RNA-positive samples were genotyped by line probe assay - LiPA, using the 5 'NC and direct sequencing of the NS5B region of the viral genome, followed by phylogenetic analysis. The prevalence of HCV infection among the study participants was 3.7% (95% CI: 2.4% -5.6%). Viral RNA was detected in 63.6% of the samples for the 5 'NC region and 54.5% in the NS5B region. Genotypes 1 and 3 were identified, predominantly subtype 1a (n = 7) followed subtype 1b (n = 3) and 3a (n = 2). Following logistic regression, age older than 40 years (OR: 17.72; 95% CI: 6.22 to 50.48) and a history of injection drug use (OR: 11.10; 95% CI: 3.95 to 31, 22) were associated with HCV infection (p <0.05). These findings reinforce the need to implement public health policies emphasizing prevention and control of hepatitis C, aimed specifically toward crack users. / Os usuários de crack são considerados uma população vulnerável à aquisição e transmissão de agentes infecciosos, como o vírus da hepatite C (HCV), pois os artefatos utilizados para consumo da droga, muitas vezes, são compartilhados entre indivíduos que possuem lesões na cavidade oral. Este estudo teve como objetivo investigar o perfil epidemiológico e molecular da infecção pelo vírus da hepatite C em indivíduos usuários de crack institucionalizados em Goiânia-GO. A população foi constituída por 600 usuários de crack em tratamento em um hospital psiquiátrico de Goiânia (Hospital Espírita Eurípedes Barsanulfo – Casa de Eurípedes), no período de agosto de 2012 a abril de 2013. Os soros foram testados para a detecção de anticorpos para o HCV (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay - ELISA). As amostras anti-HCV reagentes foram submetidas à detecção do RNA viral pela RT-PCR (Transcrição Reversa - Reação em Cadeia pela Polimerase). Todas as amostras RNA-HCV positivas foram genotipadas pelo método line probe assay - LiPA, utilizando a região 5’ NC e por sequenciamento direto da região NS5B do genoma viral, seguido de análise filogenética. A prevalência da infecção pelo HCV em usuários de crack institucionalizados foi de 3,7% (IC 95%: 2,4%-5,6%). O RNA viral foi detectado em 63,6% das amostras para a região 5’ NC e 54,5% para a região NS5B. Foram identificados os genótipos 1 e 3, com predomínio do subtipo 1a (n=7), seguido dos subtipos 1b (n=3) e 3a (n=2). Após regressão logística, idade superior a 40 anos (OR: 17,72; IC 95%: 6,22-50,48) e antecedentes de drogas injetáveis (OR: 11,10; IC 95%: 3,95-31,22) foram associados à infecção pelo HCV (p < 0,05). Os achados reforçam a necessidade de implementação de políticas públicas de saúde, com ênfase na prevenção e controle da hepatite C, voltadas para os usuários de crack.

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2017-03-23T21:02:36Z No. of bitstreams: 2 Tese - Marina Pedroso de Oliveira - 2017.pdf: 6913469 bytes, checksum: 0f52c792d453bdaabe154c7fca4f726b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-03-24T11:03:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Marina Pedroso de Oliveira - 2017.pdf: 6913469 bytes, checksum: 0f52c792d453bdaabe154c7fca4f726b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-24T11:03:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Marina Pedroso de Oliveira - 2017.pdf: 6913469 bytes, checksum: 0f52c792d453bdaabe154c7fca4f726b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-21 / Outro / Men who have sex with men (MSM) are more vulnerable to hepatitis B virus (HBV) infection when compared to the general population. In Brazil, the epidemiological profile of hepatitis B in MSM is still poorly understood. This study aimed to estimate the prevalence of HBV infection in MSM in Goiânia-Goiás and to analyze the associated factors, perform a molecular characterization of the viral isolates, as well as to investigate the vaccine situation against hepatitis B in this population. A cross-sectional study was conducted among MSM in the City of Goiânia, Central Brazil. From March to November 2014, a total of 522 participants were recruited using respondent-driven sampling (RDS). After signing the consent form, MSM were interviewed and a blood sample was collected. All samples were tested for HBV serological markers and HBV DNA. HBV isolates were sequenced for the determination of HBV genotypes and subgenotypes by phylogenetic analysis and for identification of mutations in viral genome. Data were analyzed using the RDSAT and SPSS programs. The overall prevalence of HBV infection (presence of anti-HBc marker) was 15.4% (95% CI: 8.7-25.8) and the rate of HBsAg carriers was 0.6% (95% CI: 0.2-1.6). Age over 25 years old, receptive anal intercourse, previous sex with women, and history of sexually transmitted infection (STI) were factors associated with HBV infection. Viral DNA was detected only in HBsAg-positive individuals, and occult HBV infection was not observed in the study population. HBV isolates were classified into genotype A (subgenotypes A1 and A2).Mutations in the S (T131N), basal core promoter (BCP) (A1762T/G1764A) and Pre-C/C (G1862T/G1888A and G1862T) regions of the HBV genome were identified. About 40% (95% CI: 32.3-48.8) of the participants had serological evidence of previous HBV vaccination (reactive for isolated anti-HBs), while 76.2% reported having previously received the vaccine. In addition, 44.3% (95% CI: 36.1-52.9) of MSM were susceptible to HBV infection. A greater frequency of positivity for anti-HBs alone was observed among MSM up to 25 years old, followed by declining vaccination with increasing age. By contrast, an increase in HBV infection with increasing age was found. HBV vaccination was associated with unprotected anal intercourse and history of STI (with a borderline p-value). In this study, we observed a poor agreement when comparing the self-reported and serologic evidence of HBV vaccination (k = 0.17). These results reveal a high overall prevalence of HBV infection in the study population associated with sexual risk behaviors, and in contrast, a low frequency of hepatitis B vaccination, evidencing a need for public health strategies to increase vaccine coverage in MSM, in addition to monitoring HBV carriers. / Homens que fazem sexo com homens (HSH) apresentam maior vulnerabilidade para infecção pelo vírus da hepatite B (HBV) quando comparados à população em geral. No Brasil, o perfil epidemiológico da hepatite B em HSH ainda é pouco conhecido. Este estudo teve como objetivos estimar a prevalência da infecção pelo HBV em HSH em Goiânia-Goiás e analisar os fatores associados, realizar a caracterização molecular dos isolados virais, bem como investigar a situação vacinal contra hepatite B e fatores associados. Estudo transversal conduzido em HSH na região metropolitana de Goiânia-GO. De março a novembro de 2014, um total de 522 participantes foi recrutado utilizando o método respondent-driven sampling (RDS). Após assinatura do termo de consentimento livre e esclarecido, os HSH foram entrevistados e amostras sanguíneas coletadas. Todas as amostras foram testadas por ensaio imunoenzimático (ELISA) para detecção dos marcadores sorológicos da hepatite B e submetidas à extração e amplificação do HBV DNA. Os isolados do HBV foram sequenciados para determinação dos genótipos e subgenótipos do vírus por análise filogenética e para identificação de mutações no genoma viral. Os dados foram analisados utilizando os programas RDSAT e SPSS. A prevalência global da infecção pelo HBV (anti-HBc) foi de 15,4% (IC 95%: 8,7-25,8) e do HBsAg de 0,6% (IC 95%: 0,2-1,6). Idade acima de 25 anos, sexo anal receptivo, relação sexual com mulheres e história de infecções sexualmente transmissíveis (IST) foram fatores associados à infecção pelo HBV. O DNA viral foi detectado apenas nos indivíduos HBsAg positivos, não sendo observada infecção oculta na população estudada. Os isolados do HBV foram classificados como pertencentes ao genótipo A (subgenótipos A1 e A2) do HBV. Mutações nas regiões S (T131N), promotora basal do core (BCP) (A1762T/G1764A) e Pré-C/C (G1862T/G1888A e G1862T) do genoma viral foram identificadas. Cerca de 40% (IC 95%: 32,3-48,8) dos participantes tinham evidência sorológica de vacinação contra hepatite B (anti-HBs isolado), enquanto que 76,2% relataram ter recebido a vacina previamente. Além disso, 44,3% (IC 95%: 36,1-52,9) dos HSH eram suscetíveis à infecção pelo HBV. Observou-se uma maior positividade para anti-HBs isolado entre os HSH com até 25 anos de idade, seguido de seu declínio com o aumento da idade e, por outro lado, verificou-se aumento da infecção pelo HBV. A vacinação contra a hepatite B foi associada ao sexo anal desprotegido e marginalmente à história de IST. Neste estudo, notou-se, ainda, uma baixa concordância entre evidência sorológica e auto relato de vacinação (k = 0,17). Estes resultados revelam uma prevalência global elevada da infecção pelo HBV na população estudada e sua associação com comportamentos sexuais de risco e, em contraste, uma frequência baixa de vacinação contra hepatite B, evidenciando a necessidade de políticas públicas contínuas de saúde voltadas para os HSH, incluindo estratégias para aumentar a cobertura vacinal, além do monitoramento dos indivíduos portadores do HBV.

As enzimas CYP2D6, CYP2C19 e CYP2C9 são responsáveis pelo metabolismo de aproximadamente metade dos 200 medicamentos mais prescritos nos EUA. Padronizamos ensaios de genotipagem baseados na discriminação alélica com o sistema TaqMan® em 198 indivíduos. Para o gene CYP2D6, os alelos *1 e *2 foram os mais freqüentes, seguidos pelos alelos *4, *41, *35, *17, *5, *10, *6, *29 e *9. Desenvolvemos também uma nova metodologia para a determinação do número de cópias do gene CYP2D6. Para o gene CYP2C19, o alelo *1 foi o mais frequente, seguido pelos alelos *17, *2 e *3. Nosso estudo foi o primeiro a determinar a freqüência alélica do gene CYP2C19 no Brasil. Para o gene CYP2C9, o alelo *1 foi o mais frequente, seguido pelos alelos *2 e *3. Desenvolvemos uma metodologia reprodutível e acessível para a genotipagem dos polimorfismos principais dos genes CYP2D6, CYP2C19 e CYP2C9. A identificação precoce de indivíduos suscetíveis a efeitos adversos, bem como de metabolizadores rápidos pode trazer grandes benefícios aos pacientes possibilitando assim uma medicina personalizada. / The enzymes CYP2D6, CYP2C19 and CYP2C9 metabolize approximately half of the 200 most prescribed drugs in the USA. We standardized genotyping tests based on allelic discrimination, using TaqMan® genotyping system in 198 samples. For the CYP2D6 gene, allele *1 and *2 were the most frequent, followed by alleles *4, *4, *35, *17, *5, *10, *6, *29 and *9. We have also developed a new methodology for determining the copy number variations of the CYP2D6 gene. For the CYP2C19 gene, the allele *1 was the most common, followed by the alleles *17, *2 and *3. In our concern, our study was the first to determine the allele frequency of the CYP2C19 gene in Brazil. For CYP2C9 gene, the allele *1 was the most common followed by the alleles *2 and *3. We developed a methodology reproducible and accessible for genotyping the most important polymorphisms of the genes CYP2D6, CYP2C19 and CYP2C9. The previous identification of individuals at risk to develop adverse drug reactions as well as ultrarapid-metabolizers may bring benefits to the patients, leading to a personalized therapy.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Objetivou-se com este trabalho avaliar genótipos de arroz de terras altas com tolerância à herbicidas do grupo químico das imidazolinonas, em três diferentes ambientes (combinação ecossistema x sistema de plantio) e genótipos de arroz irrigado com tolerância à herbicidas em seis diferentes ambientes (combinação dois anos x três sistemas de manejo da água de irrigação) em Roraima. Foram avaliadas as características de floração média (50%), altura de plantas (cm), número de panículas por m2, número de grãos por panícula, massa de 1000 grãos (g), produtividade de grãos em (kg. ha-1) e rendimento de grãos inteiros no beneficiamento e de qualidade de cocção para ambos os sistemas e acamamento (escala de notas), severidade de doenças (escala de notas) apenas para o arroz de terras altas. As médias de produtividade dos genótipos foram submetidas às análises de adaptabilidade e estabilidade pelas metodologias propostas por Annicchiarico (1992) e Wricke (1965). Para o agrupamento das médias dos tratamentos, foi aplicado o teste de Scott e Knott, em nível de 5% de probabilidade. Para o arroz irrigado, concluiu-se que o genótipo AB 101053 (BRS Formoso (RB)////Cypress CL) é o mais promissor para lançamento em Roraima, por apresentar alta produtividade (8.260 kg.ha-1), boa estabilidade produtiva e rendimento de grãos inteiros no beneficiamento (62,1%) e grãos soltos após a cocção. Para o arroz de terras altas os genótipos A10ER7 (BRS Pepita////Cypress CL), A10ER10 (CNAs 9023////Cypress CL) e A10ER11 (BRA 01504////Cypress CL), são os mais promissores para futuros lançamentos em Roraima. / The objective of this work was to evaluate genotypes of upland rice with tolerance to herbicides of the imidazolinone chemical group in three different environments (combination ecosystem x cropping system) and rice varieties with tolerance to herbicides in six different environments (combination two years x three management systems of irrigation water) in Roraima. We evaluated the characteristics of flowering period (50%), plant height (cm), number of panicles per m2, number of grains per panicle, 1000 grains (g), grain yield (kg ha-1) and whole grain yield in processing and cooking quality for both systems and lodging (note scale), disease severity (grading scale) only for upland rice. For the average rice yield were subjected to analysis of stability and adaptability of the proposed methodologies Annicchiarico (1992) and Wricke (1965). For the grouping of the treatment means test was applied Scott e Knott at 5% probability. For rice, it was concluded that the genotype AB 101053 (BRS Formoso (RB)////Cypress CL) is the most promising for release in Roraima, due to high yield (8,260 kg ha-1), good stability productive and whole grain yield in processing (62.1%) and loose grains after cooking. For upland rice genotypes A10ER7 (BRS Pepita////Cypress CL), A10ER10 (9023 CNAs////Cypress CL) and A10ER11 (BRA 01504////Cypress CL), are the most promising for future releases in Roraima.