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COMPARATIVE ANALYSIS OF SOYBEAN (GLYCINE MAX) ACCESSIONS USING INTER SIMPLE SEQUENCE REPEAT (ISSR) AND RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA (RAPD) MARKERS

Alamri, Sarah 16 May 2014 (has links)
Soybean (Glycine max) is an important crop in the world in terms of total production and usage. It is also among the least diverse species. The main objectives of the present study were 1) to determine differences between ISSR and RAPD marker systems in detecting genetic variation in soybeans and 2) to identify and characterize accession- diagnostic molecular markers in G. max accessions. Genomic DNAs from 108 G. max accessions from 11 different gene pools were analyzed using several ISSR and RAPD primers. The levels of polymorphic loci detected with the two marker systems were in general moderate and similar.. Overall, 82% of genetic distance values were above 0.40 based on ISSR analysis. However, RAPD data revealed that the accessions from different countries are closely related with 64% genetic distance values below 0.40. The dendrograms constructed with ISSR data revealed that the South Korean accessions formed an out-group while the RAPD analysis showed that accessions from Sweden were separate from the other 10 gene pools. One variety-diagnostic marker generated with ISSR 5 primer was identified in the accession Kao Chien Tao from China. This marker was cloned, and sequenced. Although RAPD and ISSR marker systems detected similar levels of genetic variability, they target different regions of the soybean genome, resulting in different clustering of the 11 gene pools indicating different genetic relatedness among them. This finding demonstrates the usefulness of both marker systems in assessing diversity and relatedness among Glycine max gene pools.
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Impacto das mudanças climáticas sobre a produtividade e pegada hídrica da soja cultivada na região do Matopiba. / Impact of climate change on productivity and water footprint of soybeans grown in the Matopiba region.

SILVA, Roberta Araújo e. 15 August 2018 (has links)
Submitted by Maria Medeiros (maria.dilva1@ufcg.edu.br) on 2018-08-15T13:02:14Z No. of bitstreams: 1 ROBERTA ARAÚJO E SILVA - TESE (PPGMet) 2018.pdf: 3397527 bytes, checksum: d7b0de649c1e410cbeabdeea5fe40e82 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-15T13:02:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ROBERTA ARAÚJO E SILVA - TESE (PPGMet) 2018.pdf: 3397527 bytes, checksum: d7b0de649c1e410cbeabdeea5fe40e82 (MD5) Previous issue date: 2018-01-30 / CNPq / Neste estudo foram avaliadas as condições atuais e os efeitos das mudanças climáticas sobre a produtividade e pegada hídrica da soja cultivada na região de Matopiba. Para simular a produtividade da cultura foi usado o modelo AquaCrop versão 5.0 da FAO, calibrado com dados do ano de 2016 e validado com os de 2014, usando parâmetros de clima, solo, cultura e manejo coletados em duas campanhas experimentais realizadas entre os meses de junho e outubro nos anos de 2014 e 2016 em Palmas, TO. O desempenho do modelo foi avaliado utilizando os indicadores estatísticos: erro de previsão (Ep), coeficiente de determinação (R2), raiz quadrada do erro médio (RMSE), erro médio absoluto (EMA), eficiência de Nash e Sutcliffe (NSE), e o índice de concordância de Willmontt´s (d). A calibração e validação da produtividade da cultura de soja estimada pelo modelo AquaCrop, apresentaram resultados satisfatórios, ilustrando a robustez e a aplicabilidade geral do modelo. O modelo AquaCrop subestima a produtividade de grãos de soja, para condições de estresse hídrico severo durante todo o ciclo de cultivo. Após a calibração e validação, o AquaCrop foi utilizado como ferramenta de simulação de produtividade da cultura da soja para o cenário atual (2016) e de mudanças climáticas a médio (2045/2046; 2055/2056) e longo prazo (2075/2076; 2064/2095), alimentado por dados de dois modelos climáticos (HadGEM2-ES e MIROC5) e considerando as RCP 4.5 e 8.5. Em seguida, calculou-se a pegada hídrica (verde, azul e cinza) de soja atual dos principais municípios produtores, de cada estado que compõem a região do Matopiba. Posteriormente, avaliaram-se os efeitos das possíveis mudanças climáticas sob a produtividade e pegada hídrica da soja, considerando as variações climáticas com foco na temperatura, precipitação e CO2. Os modelos climáticos projetaram aumento da produtividade em ambas as RCP consideradas, porém mais acentuado sob a RCP 8.5, em decorrência do aumento da temperatura e concentração de CO2 e a precipitação, que mesmo sofrendo redução nos totais pluviométricos ao longo do tempo, ainda atendendo a necessidade hídrica da soja. As PHsoja atuais da região do Matopiba, variaram de 2036,60 m³t-1 a 2584,12 m³t-1, valores similares aos encontradas na literatura. Sob cenários de mudanças climáticas, a PHsoja decresce ao longos os anos. A PHsoja futura decresce, especialmente a componente verde, devido ao aumento menos acentuado da evapotranspiração, resultando em maior rendimento final. As PHverde diminuem ao longos dos anos, as PHazul aumenta na mesma proporção e as PHcinza apresentam comportamento praticamente continuo. Os resultados deste estudo podem ser usados para quantificar a produtividade futura da soja, a demanda de água e a sua utilização, bem como obter informações úteis para a gestão dos recursos hídricos na região de estudo. / This study evaluated the current conditions and effects of climate change on the productivity and water footprint of soybean cultivated in Matopiba region. To simulate crop productivity, the FAO AquaCrop version 5.0 model was used, calibrated with data from 2016 and validated with 2014, using climate, soil, crop and management parameters collected in two experimental campaigns conducted between the months of June and October in the years 2014 and 2016 in Palmas, TO. The performance of the model was evaluated using the statistical indicators: prediction error (Ep), coefficient of determination (R2), square root mean error (RMSE), mean absolute error (EMA), Nash efficiency and Sutcliffe (NSE) and Willmontt's agreement index (d). Calibration and validation of soybean crop productivity estimated by the AquaCrop model presented satisfactory results, illustrating the robustness and general applicability of the model. The AquaCrop model underestimates soybean grain yield for severe water stress conditions throughout the growing cycle. After calibration and validation, AquaCrop was used as a simulation tool for soybean crop productivity for the current scenario (2016) and medium-term (2045/2046; 2055/2056) and long-term (2075/2076; 2064/2095), fed by data from two climatic models (HadGEM2-ES and MIROC5) and considering RCPs 4.5 and 8.5. Then, the water footprint (green, blue and gray) of the current soybean of the main producing municipalities of each state that compose the Matopiba region was calculated. Subsequently, the effects of possible climatic changes under soybean productivity and water footprint, considering the climatic variations with focus on temperature, precipitation and CO2, were evaluated. The climatic models projected increase of productivity in both RCP considered, but more accentuated under RCP 8.5, due to the increase in temperature and concentration of CO2 and precipitation, that even undergoing a reduction in rainfall totals over time, still taking into account water requirement of soybeans. The current PHsoja of the Matopiba region, ranged from 2036.60 m³t-1 to 2584.12 m³t-1, values similar to those found in the literature. Under scenarios of climate change, the PHsoja decreases over the years. The future PHsoja decreases, especially the green component, due to the less accentuated increase of the evapotranspiration, resulting in greater final yield. PHverde decreases over the years, PHazul increases in the same proportion and PHcinza show practically continuous behavior. The results of this study can be used to quantify future soybean yield, water demand and utilization, as well as to obtain useful information for the management of water resources in the study region.
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Desempenho agronômico, adaptabilidade e estabilidade de genótipos precoces de soja / Agronomic performance, adaptability and stability of precious soybean genotypes

Selestrino, Paulo Rogério 15 June 2018 (has links)
Submitted by Paulo Rogério Selestrino (pr.selestrino@hotmail.com) on 2018-08-13T18:13:09Z No. of bitstreams: 1 Dissertação FINAL Paulo Selestrino 2018_parcial normaliz (2) (1).pdf: 1048374 bytes, checksum: 7a31f6f3f045dfa2a9951d0f71080fc1 (MD5) / Approved for entry into archive by Neli Silvia Pereira null (nelisps@fcav.unesp.br) on 2018-08-13T19:41:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 selestrino_pr_me_jabo.pdf: 1048374 bytes, checksum: 7a31f6f3f045dfa2a9951d0f71080fc1 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-13T19:41:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 selestrino_pr_me_jabo.pdf: 1048374 bytes, checksum: 7a31f6f3f045dfa2a9951d0f71080fc1 (MD5) Previous issue date: 2018-06-15 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / A soja constitui-se na principal oleaginosa cultivada no mundo. Neste contexto, o Brasil se destaca como o segundo maior produtor mundial do grão. Dentre os muitos desafios encontrados pelo melhoramento genético, um dos principais está relacionado com a variação ambiental, que muitas vezes dificulta a seleção e recomendação de genótipos superiores. Sendo assim, faz-se necessário que os ensaios experimentais sejam conduzidos em vários ambientes, por vários anos para que possa ser analisado o comportamento quanto a adaptabilidade e estabilidade, visando futuras recomendações. Neste contexto, o objetivo do presente estudo consistiu em avaliar a desempenho agronômico, a adaptabilidade e estabilidade de genótipos de soja precoces. Os experimentos foram instalados em dois locais, a saber: localidade de Jaboticabal nos anos agrícolas 2012/2013, 2013/2014, 2015/2016 e 2016/2017 e localidade Piracicaba nos anos agrícolas 2014/2015 e 2015/2016. O delineamento utilizado foi de blocos ao acaso com três repetições. Foram avaliados os caracteres agronômicos número de dias para a maturidade e produtividade de grãos. Para estimar a adaptabilidade e estabilidade dos genótipos avaliados, foi utilizada a metodologia de Eberhart e Russell (1966). Desta maneira, foi possível detectar os genótipos mais responsivos e adaptados às regiões de cultivo. Para o caráter produtividade de grãos, merecem destaque os genótipos 4, 6,11, 26, 27, 29 e 34, sendo linhagens pertencentes ao programa de melhoramento de soja da UNESP Jaboticabal, todos com médias superiores à média geral e portadores de boa estabilidade fenotípica para o caráter. Para o caráter número de dias de maturidade, destacaram-se os genótipos 4, 5, 7, 9, 13, 15, 18, 22 e 35, sendo também linhagens pertencentes ao programa de melhoramento de soja da UNESP Jaboticabal, todos com médias inferiores à média geral, portanto portadores de maior precocidade e com boa estabilidade fenotípica para o caráter. Dessa forma, por meio do presente estudo, foi possível identificar genótipos de soja superiores e que podem ser indicados para áreas de reforma de canaviais para o Estado de São Paulo. / Soy is the main oilseed crop in the world. In this context, Brazil stands out as the world's second largest producer of grain. Among the many challenges encountered by genetic improvement, one of the main challenges is related to environmental variation, which often hinders the selection and recommendation of higher genotypes. Thus, it is necessary that the experimental tests be conducted in several environments, for several years so that behavior can be analyzed for adaptability and stability, aiming at future recommendations. In this context, the objective of the present study was to evaluate the agronomic performance, adaptability and stability of early soybean genotypes. The experiments were installed in two locations, namely: Jaboticabal locality in the agricultural years 2012/2013, 2013/2014, 2015/2016 and 2016/2017 and locality Piracicaba in the agricultural years 2014/2015 and 2015/2016. The experimental design was a randomized block design with three replications. The agronomic characters were evaluated for the number of days for grain maturity and yield. To estimate the adaptability and stability of the evaluated genotypes, the methodology of Eberhart and Russell (1966) was used. In this way, it was possible to detect the genotypes more responsive and adapted to the growing regions. For grain yield, genotypes 4, 6, 11, 26, 27, 29 and 34 deserve special mention, being strains belonging to the soybean breeding program of UNESP Jaboticabal, all with averages above the general average and good stability phenotypic character. For the number of days of maturity, the genotypes 4, 5, 7, 9, 13, 15, 18, 22 and 35 were highlighted, being also lineages belonging to the soybean breeding program of UNESP Jaboticabal, all with lower averages to the general average, therefore bearers of greater precocity and with good phenotypic stability to the character. Thus, through the present study, it was possible to identify superior soybean genotypes that can be indicated for sugar cane reforestation areas for the State of São Paulo. / CNPq: 132711/2016-8
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Potencial fisiológico de sementes de soja e sua relação com a condutividade elétrica / Physiological potential of soybean seeds and its relationship with electrical conductivity

Prado, Jessica Pavao do 17 July 2018 (has links)
Submitted by Jessica Pavão Do Prado (prado.jessicapavao@gmail.com) on 2018-08-17T00:52:13Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Jessica Pavao do Prado.pdf: 766382 bytes, checksum: 6819f3e605d8522c00720b0893462537 (MD5) / Approved for entry into archive by Neli Silvia Pereira null (nelisps@fcav.unesp.br) on 2018-08-17T17:16:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 prado_jp_me_jabo.pdf: 766382 bytes, checksum: 6819f3e605d8522c00720b0893462537 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-17T17:16:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 prado_jp_me_jabo.pdf: 766382 bytes, checksum: 6819f3e605d8522c00720b0893462537 (MD5) Previous issue date: 2018-07-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Para avaliar o vigor de lotes de sementes são necessários testes de vigor rápidos e eficientes, entre eles destaca-se o teste de condutividade elétrica por ser capaz de detectar a deterioração de semente ainda em sua fase inicial, tendo em vista a desorganização das membranas celulares. Para o teste de condutividade elétrica se estabelecer como parte do programa de controle de qualidade nas empresas produtoras de sementes são necessárias informações que correlacionem níveis de condutividade elétrica com o potencial de desempenho da semente. Desta forma o presente trabalho teve por objetivo o estudo da utilização do teste de condutividade elétrica como alternativa para avaliação de vigor de sementes de soja verificando sua relação com diferentes testes de vigor e assim sugerir valores de condutividade elétrica para determinação de valores ou faixa de valores que indicam o potencial de desempenho de um lote de sementes em campo. Para tanto, foram utilizadas sementes de soja de quatro cultivares - BRS 388 RR, BRS 1010 IPRO, BRS 1001 IPRO e BRS 1007 IPRO, cada um representado por 11 lotes divididos em quatro repetições. As sementes foram avaliadas por meio dos testes de: condutividade elétrica, germinação, tetrazólio, envelhecimento acelerado, primeira contagem de germinação, classificação do vigor de plântulas, emergência de plântulas em campo e emergência de plântulas em areia. Determinou-se também o teor de água das sementes. O teste de condutividade elétrica apresentou correlação significativa e negativa (p<0,01) para todos os testes avaliados. A análise de regressão linear possibilitou a separação dos lotes de sementes de vigor muito alto: CE < 70 μS.cm-1.g-1; alto: CE entre 71 a 90 μS.cm-1.g-1; médio: CE entre 91 a 110 μS.cm-1.g-1 e baixo: CE > 111 μS.cm-1.g-1. / In order to evaluate the vigor of seed lots, fast and efficient vigor tests are necessary, among them the electrical conductivity test, because it is able to detect the seed deterioration still in its initial phase, in view of the disorganization of the cellular membranes. For the electrical conductivity test to establish as part of the quality control program in the seed producing companies, information is required that correlate levels of electrical conductivity with the potential of seed performance. In this way the present work had the objective of the study of the use of the electrical conductivity test as an alternative to evaluate the vigor of soybean seeds, verifying its relation with different vigor tests and thus to suggest values of electrical conductivity for determination of values or range of values which indicate the potential performance of a field seed batch. For this, soybean seeds of four cultivars - BRS 388 RR, BRS 1010 IPRO, BRS 1001 IPRO and BRS 1007 IPRO were used, each represented by 11 lots divided into four replicates. The seeds were evaluated through the following tests: electric conductivity, germination, tetrazolium, accelerated aging, first germination count, seedling vigor classification, emergence of seedlings in the field and emergence of seedlings in sand. The water content of the seeds was also determined. The electrical conductivity test showed significant and negative correlation (p <0.01) for all tests evaluated. The linear regression analysis allowed the separation of seed lots of very high vigor: CE <70 μS.cm-1.g-1; high: CE between 71 to 90 μS.cm-1.g-1; mean: CE between 91 to 110 μS.cm-1.g-1 and low: CE> 111 μS.cm-1.g-1. / 1596391
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Eficácia de tiodicarbe, cadusafós e condicionador de solo via tratamento de sementes e/ou sulco de plantio no controle de nematoides na cultura de soja / Effectiveness of thiodicarb, cadusafos and soil conditioner applied in seed treatment and / or planting groove in the control of nematodes in soybean crop

Guarnieri, Carlos Cesar de Oliveira 14 June 2018 (has links)
Submitted by Carlos Cesar De Oliveira Guarnieri (carloscesarguarnieri@gmail.com) on 2018-08-02T18:26:04Z No. of bitstreams: 1 EFICÁCIA DE TIODICARBE, CADUSAFÓS E CONDICIONADOR DE SOLO VIA TRATAMENTO DE SEMENTES E OU SULCO DE PLANTIO NO CONTROLE DE NEMATOIDES NA CULTURA DE SOJA.pdf: 756636 bytes, checksum: 89d88ef49a1b212168332c38507a27e0 (MD5) / Approved for entry into archive by Neli Silvia Pereira null (nelisps@fcav.unesp.br) on 2018-08-03T17:20:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1 guarnieri_cco_me_jabo.pdf: 756636 bytes, checksum: 89d88ef49a1b212168332c38507a27e0 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-03T17:20:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 guarnieri_cco_me_jabo.pdf: 756636 bytes, checksum: 89d88ef49a1b212168332c38507a27e0 (MD5) Previous issue date: 2018-06-14 / Os principais métodos de controle de nematoides na cultura de soja atualmente utilizados são a resistência ou tolerância genética da planta, a rotação/sucessão de culturas resistentes/não hospedeiras e poucos são os estudos com o uso de produtos químicos/biológico e condicionadores de solo. Um dos métodos adotados para a aplicação de nematicida químico nas lavouras de soja é a aplicação via tratamento de sementes, porém os estudos de controle com este método, na grande maioria dos casos, apontam período de proteção de até 30 dias após a emergência das plantas, e na maioria das vezes tem trazido resultados insatisfatórios. A aplicação de nematicida químico, no sulco de plantio, ou associação do tratamento de sementes com a aplicação no sulco de plantio, pode melhorar os resultados de eficácia e eficiência, todavia esta técnica é pouco estudada no Brasil para a cultura de soja, consequentemente são poucos trabalhos que comprovem essas características nos produtos disponíveis atualmente. Também, o uso de um condicionador de solo poderá contribuir com um melhor desenvolvimento radicular, da planta e na eficácia e eficiência do produto nematicida químico. O objetivo deste estudo foi avaliar a eficácia e eficiência do nematicidas químicos tiodicarbe, cadusafós e do condicionador de solo Maskio, usados em tratamento de sementes e/ou aplicados no de sulco de plantio, no controle dos nematoides de galha (Meloidogyne incognita), de cisto da soja (Heterodera glycines) e das lesões radiculares (Pratylenchus brachyurus) na cultura de soja. Foram instalados ensaios a campo em áreas naturalmente infestadas pelos nematoides, e em vasos onde foram avaliados o desenvolvimento e produtividade da cultura e a redução na população de nematoides. Nenhum dos tratamentos testados causou sintomas visuais de intoxicação na cultura. Isoladamente, o tratamento de sementes com tiodicarbe (600 mL 100 kg sementes-1) é tão eficaz na redução da população total de P. brachyurus nas raízes da soja, quanto o tratamento de sulco com cadusafós (4,0 L ha-1) ou cadusafós + Maskio (4,0 L ha-1 + 2,0 L ha-1). Porém nenhum tratamento aumentou significativamente a produtividade da cultura. Para que haja incremento significativo em produtividade foi necessário associar a aplicação de tiodicarbe na semente e no sulco de plantio para áreas infestadas por P. brachyurus. Para áreas com M. incognita os tratamentos, de semente ou de sulco, podem ser eficazes no controle e incrementar em produtividade a cultura da soja se utilizados em área com alta infestação de nematoides de galha. A aplicação de tiodicarbe nas sementes foi tão eficaz na redução de cistos de Heterodera glycines quanto a aplicação no sulco de plantio de tiodicarbe, cadusafós, Maskio e suas associações. A associação de tiodicarbe nas sementes e uma aplicação no sulco melhorou a eficácia de controle de cistos de H. glycines, saindo de 27% de eficácia para tratamento de sementes isolado, para 75% de eficácia para o tratamento com tiodicarbe nas sementes associado ao uso da mesma molécula no sulco de plantio. / The main methods of nematode control in soybean crop currently used are resistance or genetic tolerance, rotation / succession of resistant / non - host crops, and few studies with the use of chemical / biological and soil conditioners. One of the methods adopted for the application of chemical nematicide in soybean crops is the application through seed treatment, but the studies in the control of this method, in the great majority of cases, indicate protection period up to 30 days after the emergence of the plants, in the most of the time it has brought unsatisfactory results. The application of chemical nematicide, in the planting groove, or association of the treatment of seeds with the application in the planting groove, can improve the results of efficacy and efficiency, however this technique is little studied in Brazil for the soybean crop, consequently are few works that prove the effectiveness and efficiency of the currently available products. Also, the use of a soil conditioner may contribute to a better root development of the plant and to the effectiveness and efficiency of the chemical nematicide product. The objective of this study was to evaluate the efficacy and efficiency of the chemical nematicides thiodicarb, cadusafos and the Maskio soil conditioner, used in seed treatment and / or applied to the planting groove, in the control of root-knot nematode (Meloidogyne incognita), soybean cist nematode (Heterodera glycines) and root-lesion nematode (Pratylenchus brachyurus) on soybean crop. Field trials were carried out in areas naturally infested by nematodes, and in pots where the development and productivity of the crop and the reduction in the nematode population were evaluated. None of the treatments tested causes visual symptoms of intoxication in the culture. Seed treatment with thiodicarb (600 mL 100 kg seed-1) is as effective in reducing the total population of P. brachyurus in soybean roots as in grouper treatment with cadusafos (4.0 L ha-1) or cadusafos + Maskio (4.0 L ha-1 + 2.0 L ha-1). However, no treatment significantly increases the productivity of the crop. In order to have a significant increase in productivity it is necessary to associate the application of thiodicarb in the seed and in the planting groove to areas infested by P. brachyurus. For areas with M. incognita, seed or planting groove treatments may be effective in controlling and increasing soybean productivity if used in an area with high root-knot nematode infestation. The application of thiodicarb in the seeds is as effective in the reduction of Heterodera glycines cysts as the application in the planting groove of thiodicarb, cadusafos, Maskio and their associations. The association of thiodicarb in seeds and a planting groove treatment improves the control efficacy of H. glycines. Leaving 27% efficacy for isolated seed treatment, to 75% efficacy for treatment with thiodicarb in seeds associated with the use of the same molecule in the planting groove.
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Sensores de dossel no monitoramento da variabilidade temporal das culturas da soja e do amendoim / Canopy sensors in monitoring of the temporal variability soybean and peanut crops

Carneiro, Franciele Morlin [UNESP] 27 July 2018 (has links)
Submitted by FRANCIELE MORLIN CARNEIRO (franmorlin1@gmail.com) on 2018-09-08T15:08:07Z No. of bitstreams: 1 Tese_Versao Final.pdf: 3331484 bytes, checksum: 4e98fd8e90b26d730cc16a31488e4aa7 (MD5) / Approved for entry into archive by Neli Silvia Pereira null (nelisps@fcav.unesp.br) on 2018-09-10T17:45:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 carneiro_fm_dr_jabo.pdf: 3331484 bytes, checksum: 4e98fd8e90b26d730cc16a31488e4aa7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-10T17:45:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 carneiro_fm_dr_jabo.pdf: 3331484 bytes, checksum: 4e98fd8e90b26d730cc16a31488e4aa7 (MD5) Previous issue date: 2018-07-27 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Técnicas de Sensoriamento Remoto estão sendo aplicadas na agricultura e tem demonstrado grande potencial em seu uso por apresentar ótimas vantagens, tais como, método não destrutivo, rápido, obtenção de dados em tempo real, proporciona o monitoramento da variabilidade temporal da cultura ao longo dos estádios de crescimento da planta, dentre outras. Assim, os objetivos deste trabalho foram: (i) determinar qual estádio de desenvolvimento da cultura obtêm-se o tempo ótimo de coleta das leituras dos sensores por meio das melhores correlações entre os indicadores de qualidade (índices de vegetação x biomassa fresca e seca, largura de dossel, índice de clorofila, produtividade e maturação); (ii) comparar os índices de vegetação (Normalized Difference Vegetation Index - NDVI, Normalized Difference Red-Edge Index - NDRE, e Inverse Ratio Vegetation Index - IRVI) por meio do monitoramento da variabilidade temporal nas culturas do amendoim e da soja, proporcionará as melhores qualidades de leitura ao longo do processo; (iii) avaliar o comportamento dos índices de vegetação (NDVI e NDRE) com a biomassa fresca e seca, o índice de clorofila e a produtividade para a cultura da soja e do amendoim, como também, verificar a evolução destes índices por meio do estádio de desenvolvimento das culturas. Os experimentos foram realizados na safra de 2016/17, para o estudo do comportamento espectral das culturas da soja e do amendoim como também da variabilidade temporal dos índices de vegetação, em áreas agrícolas nos municípios de Dumont e de Jaboticabal, estado de São Paulo, Brasil. O delineamento experimental dos experimentos foi baseado no Controle Estatístico de Qualidade – CEQ. Nos experimentos de amendoim e da soja incluíram 63 e 65 pontos amostrais, respectivamente, com GRID 30 x 30 m. As avaliações foram realizadas aos 30, 45, 60, 75 e 90 dias após a semeadura (DAS), correspondendo desde o estádio vegetativo das culturas até o R6, por meio do sensoriamento remoto a nível de coleta terrestre com a utilização de dois sensores de dossel (GreenSeeker e OptRX) para a análise do comportamento dos indicadores de qualidade, como a biomassa fresca e seca, índice de clorofila, produtividade e os índices de vegetação (NDVI e NDRE). Os índices de vegetação NDRE e NDVI apresentaram alto potencial para a detecção no monitoramento das culturas da soja e do amendoim durante o estádio de desenvolvimento, principalmente o NDRE por ser menos sensível a saturação da sua leitura com o incremento da biomassa. O tempo ótimo de leitura de acordo com as análises de correlação e regressão apresentaram que aos 45 e 60 DAS (estádio de desenvolvimento R1 e R2 do amendoim, e da soja V5 e V6) mostraram os melhores valores. Houve interferências entre as culturas nas leituras dos sensores por apresentarem comportamento espectral diferente em virtude da morfologia e fisiologia vegetal se diferirem. / Remote Sensing Techniques are being applied in agriculture and have demonstrated great potential in their use because they present great advantages, such as non-destructive method, fast, obtaining data in real time provides the monitoring of the temporal variability of crop growth stages, among others. Thus, the objectives of this work were: (i) to determine the crop growth stages, the optimal time for collecting the sensor readings was obtained through the best correlations between the quality indicators (vegetation indices x fresh and dry biomass, canopy width, chlorophyll index, yield and maturation); (ii) to compare vegetation indices (Normalized Difference Vegetation Index - NDVI, Normalized Difference Red-Edge Index - NDRE, and Inverse Ratio Vegetation Index - IRVI) by monitoring temporal variability in peanut and soybean crops, determining which of them obtained the best reading qualities throughout the process; (iii) to evaluate the behavior of vegetation indices (NDVI and NDRE) with fresh and dry biomass, chlorophyll index and yield for soybean and peanut, as well as to verify the evolution of these indices through the stage development. The experiments were performed on the 2016/17 season to study the spectral behavior of the soybean and peanut crops as well as the temporal variability of vegetation indices in agricultural areas in the municipalities of Dumont and Jaboticabal, in the state of São Paulo, Brazil. The design of experiments was based on the basic assumptions of the Statistical Quality Control – SQC, containing 63 and 65 sample points with GRID 30 × 30 m. The parameters were evaluated at 30, 45, 60, 75, and 90 days after sowing (DAS), from vegetative stages to R6, by means of proximal sensing using the GreenSeeker and OptRX sensors for the analysis of the behavior of quality indicators, such as fresh and dry biomass, chlorophyll index, yield and vegetation indices (NDVI and NDRE). The NDRE and NDVI presented high potential for detection and monitoring of soybean and peanut crops during the growth stage, especially NDRE because it is less sensitive to the saturation reading with the increase of the biomass. The optimal time according to the correlation and regression analyzes showed that at 45 and 60 DAS (peanut development stages R1 and R2, and soybean V5 and V6) showed the best values. There were interferences between crops in the sensor readings because they presented different spectral behavior because of physiological and morphological plant if they differ. / CNPq: 142367/2015-0
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Transformação genética de embriões somáticos de soja [Glycine max (L.) Merr.] utilizando o bombardeamento e sistema Agrobacterium de maneira integrada

Wiebke, Beatriz January 2005 (has links)
O objetivo do presente trabalho foi otimizar o sistema de transformação genética de embriões somáticos de soja [Glycine max (L.) Merr.] utilizando a biolística e o sistema Agrobacterium de maneira integrada. Os antibióticos, adicionados ao meio de cultura para supressão da bactéria após a transferência do transgene, foram o alvo do estudo. Inicialmente, comparou-se o efeito de diferentes tratamentos com antibióticos sobre o tecido embriogênico de soja e sua eficiência na supressão da linhagem LBA4404 de Agrobacterium tumefaciens durante o processo de transformação. A carbenicilina (500 mg/l) apresentou efeitos diferentes sobre o tecido vegetal das duas cultivares testadas. Os tecidos embriogênicos da cv. IAS5 não apresentaram diferenças significativas em relação ao controle, enquanto que a proliferação dos embriões somáticos da cv. Bragg foi três vezes maior com a adição deste antibiótico ao meio de cultura. Contudo, a presença da carbenicilina nas duas concentrações testadas (500 e 1000 mg/l) não foi eficiente para supressão de Agrobacterium. Por outro lado, nos tratamentos com cefotaxima sozinha (350 e 500 mg/l), ou cefotaxima (250 mg/l) + vancomicina (250 mg/l) esta bactéria foi completamente suprimida da superfície dos embriões somáticos após 49 dias de tratamento. No entanto, enquanto a presença de cefotaxima, em qualquer concentração, foi prejudicial à sobrevivência do tecido embriogênico, a combinação de cefotaxima + vancomicina não afetou significativamente os embriões somáticos de soja até os 63 dias de tratamento. Portanto, os resultados indicam que o tratamento com cefotaxima + vancomicina por um período de 49 - 63 dias é o mais adequado para a transformação genética de soja, por suprimir Agrobacterium e apresentar mínimos efeitos sobre o tecido embriogênico. Por fim, conjuntos de embriões somáticos de soja foram transformados e tratados com a combinação recomendada de antibióticos para avaliação da eficiência do método na obtenção de transformantes estáveis. Foram obtidos 48 e 232 clones higromicina-resistentes para Bragg e IAS5, respectivamente. Para cv. Bragg, 26 plantas foram obtidas de um único clone, enquanto 580 plantas foram regeneradas de 105 clones da cv. IAS5. As plantas transgênicas eram férteis e morfologicamente normais. A presença do transgene no genoma destas plantas foi confirmada por análises moleculares. Portanto, a adequação dos antibióticos permitiu o desenvolvimento de um método de transformação altamente eficiente para soja. Os resultados do presente trabalho constituem o primeiro registro (1) do efeito de antibióticos sobre tecidos de soja ou de leguminosas e (2) de obtenção de transformantes estáveis de soja utilizando a biolística e o sistema Agrobacterium de maneira integrada.
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Transformação de soja (Glycine max (L.) Merrill) com plasmídeos e cassetes gênicos contendo o gene chit1 de Metarhizium anisopliae visando a obtenção de plantas resistentes a doenças fúngicas

Petry, Debora Todt January 2009 (has links)
A soja é uma das espécies cultivadas de maior importância econômica para o Brasil, atualmente o segundo maior produtor mundial deste grão. Contudo, doenças causadas por fungos são um dos principais problemas enfrentados pelos produtores de soja, o que leva a grandes perdas. Uma das alternativas para superar este problema é a utilização de cultivares com resistência genética. Com este objetivo, foram realizados quatro experimentos independentes de transformação genética de soja, em que o gene chit1, que codifica uma quitinase, enzima capaz de degradar paredes fúngicas, foi transferido para culturas embriogênicas, através da metodologia de biobalística. O gene marcador hpt, que confere resistência ao antibiótico higromicina, também foi utilizado. Em três dos experimentos realizados, uma nova metodologia foi testada, em que sequências desnecessárias, presentes nos vetores de transformação, não são colocadas na planta, e sim apenas os cassetes gênicos, contendo regiões regulatórias e codificadoras. No 1° Experimento realizado, foram obtidas plantas transgênicas transformadas com plasmídeos, mas estas não produziram sementes. No 2° Experimento, foi obtida uma linhagem transgênica, oriunda da transformação com plasmídeos. Foi confirmada a presença e a expressão do gene de quitinase em uma planta T0. Esta planta gerou uma progênie de 16 plântulas. Destas, 10 foram analisadas por PCR e foi confirmada a transmissão do transgene marcador para seis plantas T1. Análises moleculares complementares são necessárias para a determinação do padrão de herança dos transgenes. Como resultado do 3º Experimento realizado, foram obtidos 3.298 embriões histodiferenciados da cultivar Bragg (2.804 oriundos da transformação com plasmídeos e 494 da transformação com cassetes) e 2.286 para a cultivar IAS (759 com plasmídeos e 1.527 com cassetes). Do 4º Experimento realizado, foram obtidos 1.339 embriões histodiferenciados da cultivar Bragg (1.312 oriundos da transformação com plasmídeos e 27 da transformação com cassetes) e 1.035 para a cultivar IAS5 (851 com plasmídeos e 184 com cassetes). Mesmo considerando a possibilidade de alguns dos embriões obtidos serem escapes à seleção, a resistência ao antibiótico é um forte indício de transformação estável. Já foram obtidos embriões germinados oriundos da transformação com cassetes, resultantes dos 3° e 4° Experimentos. Com a condição transgênica comprovada, será realizada uma comparação dos padrões de integração gerados por transformação com plasmídeos e cassetes gênicos. / Soybean is one of the most important crops in Brazil, which is nowadays the second world largest producer. However, injuries caused by fungus are one of the main problems faced by the producers, causing great losses. One of the possibilities to deal with this problem is the utilization of cultivars with genetic resistance. With this goal, four independent soybean transformation experiments were performed. A chitinase gene, chit1, which can break fungal cell walls, was transferred to soybean embryogenic cultures, through the use of biolistic. The selection marker gene hpt, which confers hygromycin resistance, was also transferred to the embryos. In three of the performed experiments, a new methodology was tested, where unnecessary sequences, that are part of the transformation vectors, were not introduced into the plant, but only the gene cassettes, which contain regulatory and coding sequences. In the first experiment, transgenic plants were obtained, but they left no progeny. In the second experiment, one transgenic line was obtained from the plasmid transformation. The presence and expression of the chitinase gene in one T0 plant was confirmed. 16 T1 plantlets were obtained. 10 were analyzed by PCR, and the transmission of the marker gene to six T1 plants was confirmed. Further molecular analyses are necessary in order to determine the inheritance pattern of the transgenes. As a result of the 3rd Experiment, 3.298 histodifferentiated embryos of the cultivar Bragg were obtained (2.804 from the plasmid transformation and 494 from the gene cassettes transformation) and 2.286 of the cultivar IAS (759 from the plasmid transformation and 1.527 from the gene cassettes transformation). From the 4th Experiment, 1.339 histodifferentiated embryos were obtained for cultivar Bragg (1.312 from the plasmid transformation and 27 from the cassettes) and 1.035 for IAS (851 from the plasmid transformation and 184 from the cassettes). Even considering the possibility that some of the embryos obtained may have escaped selection, the hygromycin resistance is a great indication of stable transformation. Plants transformed, resulting from the 3rd and 4th experiments, were already obtained with the minimal cassettes. Once their transgenic nature is proved, the patterns of integration of plasmid transformed plants and cassette transformed plants will be compared.
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Caracterização de genótipos de soja quanto à eficiência de uso de fósforo / Characterization of soybean genotypes to phosphorus use efficiency

Silva, Frederico Dellano Souza 01 September 2016 (has links)
Submitted by Gustavo Caixeta (gucaixeta@gmail.com) on 2017-03-06T18:13:06Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 391609 bytes, checksum: 827c54a2f79546afffd9ac3ddb0515ee (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-06T18:13:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 391609 bytes, checksum: 827c54a2f79546afffd9ac3ddb0515ee (MD5) Previous issue date: 2016-09-01 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A economia de fertilizantes fosfatados, de modo particular em solos tropicais, passa pela utilização de genótipos de plantas com maior eficiência de uso de fósforo (P). Os objetivos deste trabalho foram identificar genótipos de soja eficientes no uso de P, identificar a importância relativa dos componentes da eficiência de uso de P (EUP) para baixa e alta disponibilidade de P no solo e avaliar a diversidade genética entre os genótipos com base em características relacionadas com EUP. Foram utilizados vinte e sete genótipos de soja avaliados em duas condições contrastantes na disponibilidade de P (baixa e alta disponibilidade). Utilizou-se o delineamento inteiramente casualizado, em esquema fatorial com quatro repetições. As eficiências de uso (EUP), absorção (EAP) e utilização (EUtP) foram mensuradas, bem como as seguintes características relacionadas às mesmas: crescimento diário (CD), matéria fresca de parte aérea (MFPA), de raiz (MFR), e total (MFT), matéria seca de parte aérea (MSPA), de raiz (MSR) e total (MST), volume de raíz (VR), relação parte aérea/raíz (RPAR). Nesse trabalho foi detectada interação, genótipos x níveis de P, significativa, e o desdobramento para cada ambiente (baixo e alto nível de P) indicou a existência de variabilidade entre genótipos. Em condições de baixa disponibilidade de P, verificou-se que os valores de eficiência de uso são maximizados para genótipos de soja. Principalmente nesse ambiente, a eficiência de utilização foi o componente mais importante da eficiência de uso de P. Na condição de alta disponibilidade de P, o genótipo de soja NS7505IPRO destacou-se como eficiente no uso de P, enquanto que na condição de baixa disponibilidade, destacaram-se os genótipos AS3680IPRO e M7110IPRO. Os genótipos eficientes no uso de P na condição de baixa disponibilidade, AS3680IPRO e M7110IPRO, podem ser utilizados para geração de populações segregantes com uma elevada frequência de genes favoráveis à eficiência de uso de P. / The economy of phosphate fertilizers, particularly in tropical soils, involves the use of plant genotypes with higher phosphorus (P) use efficiency. The objectives of this study were to identify efficient soybean genotypes in P use, identify the relative importance of the P use efficiency (PUE) components for low and high availability of P in the soil and the genetic diversity among genotypes based on characteristics related to PUE. Twenty seven soybean genotypes used were evaluated in two contrasting conditions in the P availability (low and high availability). A completely randomized design in a factorial design, with four replications, was used. Use efficiency (PUE), absorption (PAE) and use (PUtE) were measured and the following characteristics related to the same: daily growth (DG), shoot fresh weight (SFW), root fresh weight (RFW) and total plant fresh weight (TFW), shoot dry weight (SDW), root dry weight (RDW) and total plant dry weight (TDW), root volume (RV), shoot-to-root ratio (RSR). In this work, was detected interaction genotype x P levels, significant, and the split for each environment (low and high P) indicated the existence of variability among genotypes. In low P condition, was found that the use efficiency values are maximized for soybean genotypes. Especially in this environment, PUtE was the most important component of PUE. In high P condition, the availability the soybean genotype NS7505IPRO stood out as efficient in the use of P, while in the low availability condition, stood out the AS3680IPRO and M7110IPRO genotypes. The efficient use of P genotypes in the low availability condition, and AS3680IPRO M7110IPRO can be used to generate segregating populations with a high frequency of favorable genes of PUE.
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Efeito de plantas de soja no predador Supputius cincticeps (Heteroptera: Pentatomidae) em campo / Effect of soybean plants on the predator Supputius cincticeps (Heteroptera: Pentatomidae) in the field

Zanuncio Junior, José Salazar 31 July 2003 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-03-20T18:19:08Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 500759 bytes, checksum: ec71bd05164a71c82555bbfe8e3199d4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-20T18:19:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 500759 bytes, checksum: ec71bd05164a71c82555bbfe8e3199d4 (MD5) Previous issue date: 2003-07-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os percevejos da família Pentatomidae são, em geral, fitófagos e considerados pragas agrícolas de grande importância econômica, principalmente em plantios de soja. No entanto, nesta família estão incluídos os percevejos predadores da subfamília Asopinae, como inimigos naturais importantes em áreas reflorestadas e plantios agrícolas. Este trabalho foi desenvolvido no campo experimental do laboratório de Entomologia do Departamento de Biologia Animal da Universidade Federal de Viçosa (UFV), em Viçosa, Estado de Minas Gerais. Como os percevejos predadores podem utilizar, também, plantas na sua dieta, este trabalho teve como objetivo estudar possíveis efeitos de plantas de soja Glycine max (L.) Merril na fase ninfal e adulta e no crescimento populacional do predador Supputius cincticeps (Stäl) (Heteroptera: Pentatomidae) com os cultivares de soja susceptível (UFV 16) e resistente (IAC 100) a fitófagos no campo. Ninfas de segundo estádio de S. cincticeps foram submetidos aos seguintes tratamentos: T1- pupas de Tenebrio molitor L. (Coleoptera: Tenebrionidae) em soja resistente (IAC 100), T2- pupas de T. molitor em soja susceptível (UFV 16) e T3- pupas de T. molitor. Não foi observado efeito de plantas de soja na fase ninfal de S. cincticeps, exceto na viabilidade do quarto estádio. O número de ovos por fêmea desse predador foi de 164,3 ± 29,64; 190,2 ± 22,06 e 127,9 ± 28,07 e o de ninfas por fêmea de 109,7 ± 25,69; 100,5 ± 13,02 e 70,7 ± 15,75 nos tratamentos T1, T2 e T3, respectivamente, sem diferenças significativas. O número de posturas por fêmea e o período de oviposição foram maiores na planta susceptível (UFV 16), com 23,4 ± 4,43 posturas por fêmea e 47,0 ± 5,36 dias que no controle (11,3 ± 2,70 e 27,1 ± 4,96 dias) e semelhante ao tratamento com planta IAC 100 (resistente) (13,3 ± 2,36 e 33,7 ± 4,26 dias). Os períodos de pré-oviposição, pós-oviposição e a longevidade de S. cincticeps foram semelhantes entre tratamentos. A taxa líquida de reprodução (Ro) foi maior com planta resistente e susceptível que no controle. A estimativa dos demais parâmetros de crescimento populacional de S. cincticeps foram semelhantes entre tratamentos, com taxa intrínseca de crescimento populacional (rm) de 0,038 e 0,037 com soja resistente e susceptível e de 0,025 sem planta. O tempo para esse predador duplicar seu número de indivíduos (TD) foi de 18,47; 18,89 e 27,81 dias nos tratamentos T1, T2 e T3, respectivamente. A presença de plantas de soja na dieta aumentou o número de indivíduos de S. cincticeps no campo, pois o predador apresentou maior taxa líquida de reprodução com plantas, mas a taxa intrínseca (rm) e a razão finita (λ) de crescimento populacional foram semelhantes entre tratamentos. Isto indica que esses cultivares são compatíveis com o uso de S. cincticeps no manejo integrado de pragas da soja, embora o cultivar susceptível possa ser mais recomendável por ter proporcionado maior esperança de vida e longevidade média da população desse predador no campo. / Stinkbugs are, generally, phytophagous and they are considered agricultural pests of economic importance, mainly in soybean crop. However, predators of the sub-family Asopinae have been reported as important natural enemies in reforested areas and agricultural crops. This research was developed in the experimental field of the laboratory of Entomology of the Animal Biology Department of the Federal University of Viçosa (UFV) in Viçosa, Minas Gerais State. The objective of this research was to observe possible effects of the susceptible (UFV 16) and resistant (IAC 100) soybeans Glycine max (L.) Merril on life history characteristics and life table parameters of the predator Supputius cincticeps (Stäl) (Heteroptera: Pentatomidae) in the field. Second instar nymphs of S. cincticeps were submitted to the treatments: T1 - Tenebrio molitor L. (Coleoptera: Tenebrionidae) pupae with the resistant soybean (IAC 100), T2 - T. molitor pupae with the susceptible soybean (UFV 16) and T3 - T. molitor only. No effect of soybean plants was observed on development of S. cincticeps, except for the survival of the fourth instar. The number of eggs per female was 164.3 ± 29.64; 190.2 ± 22.06 and 127.9 ± 28.07 and the nymphs were 109.7 ± 25.69; 100.5 ± 13.02 and 70.7 ± 15.75 in the treatments T1, T2 and T3, respectively. The number of egg masses per female and the reproductive period was better with the susceptible soybean (UFV 16) (23.4 ± 4.43 egg mass per female and 47.0 ± 5.36 days) that in the control (11.3 ± 2.70 and 27.1 ± 4.96 days) and similar to the treatment with plant IAC 100 (resistant) (13.3 ± 2.36 and 33.7 ± 4.26 days). Pre and post-oviposition periods and longevity of S. cincticeps were similar between treatments. The net reproductive rate (Ro) was higher with the resistant and susceptible soybeans than in the control. The life table parameters of S. cincticeps were similar between treatments with intrinsic rate of population increase (rm) of 0.038 and 0.037 with the resistant and susceptible soybeans and 0.025 without plants. The doubling time (DT) was 18.47; 18.89 and 27.81 days in T1, T2 and T3, respectively. Plant feeding by S. cincticeps increased the number of individuals of this predator in the field because it presented higher net reproductive rate with plants, but its intrinsic (rm) and the finite (λ) rate of increase were similar between treatments. Soybean plants are compatible with S. cincticeps in integrated pest management on this crop, although the susceptible soybean (UFV 16) may be more recommended because it provided higher longevity of this predator in the field.

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