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Estimação de modelos de duração condicional estocástica por meio da função característica empírica / Estimation of stochastic conditional duration models by means of the empirical characteristic function.

Jose Euclides de Melo Ferraz 27 March 2008 (has links)
Neste trabalho propomos a utilização do método da função característica empírica (ECF - empirical characteristic function), para estimação do modelo de duração condicional estocástica (SCD - stochastic conditional duration). Para determinação das variáveis latentes do processo utilizamos três alternativas: um filtro de Kalman, um filtro obtido por integração numérica e um filtro baseado na expansão de Gram-Charlier até 4ª ordem. Os resultados são então aplicados em séries de duração da GE, Microsoft e USD/EUR. / We propose the use of the empirical characteristic function (ECF) method to estimate the parameters of the stochastic conditional duration (SCD) model. In order to estimate the latent variables we propose the use of three alternatives: a Kalman filter, a filter based on numerical integration (quadrature) and a filter based on the 4th-order Gram-Charlier expansion. The results are applied to the estimation of the parameters of the duration process for GE, Microsoft and USD/EUR.
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Análise clínica e microbiológica de úlceras venosas de pacientes atendidos em Unidades Básicas de Saúde de Goiânia / Clinical and microbiological analysis of the venous ulcers of patients treated at Basic Health Centers of Goiânia

SANTOS, Silvana de Lima Vieira dos 30 March 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T15:25:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE SILVANA LV SANTOS 2012 - texto.pdf: 1699937 bytes, checksum: 1ea3a901a7686050491e179ef0b83b40 (MD5) Previous issue date: 2012-03-30 / This cross-sectional study was performed in the dressing rooms of the primary healthcare network of Goiânia, Goiás, Brasil, with the following objectives: to identify the prevalence of Gram-negative bacteria (GNB) in venous ulcers (VU) with clinical signs of infection; analyze the susceptibility profile of the isolates; detect the production of AmpC &#946;-lactamases and metallo-beta-lactamases, and extended spectrum beta-lactamase (ESBL); describe the clinical signs and symptoms of infection in VU; evaluate the wounds clinical stage of infection and its relationship with the presence of GNB. The data were analyzed by means of descriptive statistics procedures, proportion and Chi-square tests (p<0.05). All ethical aspects were followed. The participants were 69 patients with venous ulcers, with or without arterial complication, totaling 98 wounds. It was verified that 74.5% of the wounds showed GNB growth, particularly enterobacteria (53.8%) and non-fermenting gram-negative bacteria (46.2%). The prevalent species among the enterobacteria was Escherichia coli (24.5%), followed by Enterobacter aerogenes, Pantoea agglomerans and Proteus mirabilis (12.2% each). Regarding the non-fermenting gram-negative bacteria, the prevalent genre was Pseudomonas (66.6%), particularly the species P. aeruginosa (59.5%), present in 25.5% of the analyzed wounds. Regarding the susceptibility profile of the enterobacteria, the highest resistance rates were to tetracycline (38.8%) and amoxicillin-clavulanic acid (26.5%). Among P. aeruginosa, the highest resistance was observed for cefoxitin (100%). Regarding the production of the AmpC enzyme, 30% of the microorganisms in the CESP (Citrobacter spp., Enterobacter spp., Serratia spp. and Providencia spp.) group, and 100% of the P. aeruginosa were resistant to cefoxitin. The remaining microorganisms of the CESP group (70%) that were sensitive to cefoxitin were subjected to a confirmatory test, and 37.5% were found to be positive for the production of the AmpC enzyme. Regarding metallo-beta-lactamase, 23.8% of the non-fermenting gram-negative bacteria showed reduced sensitivity to imipenem, meropenem or ceftazidime. When subjected to the confirmatory test, 8% of the P. aeruginosa were positive for the MBL enzyme. Regarding the clinical signs and symptoms of infection, the highlighted results with >70% frequency are: opaque and/or reddish brown discoloration; increase in exudate volume and pain. Stage-three infection was the most prevalent (71.4%). An association was found between cellulitis and friable granulation tissue that bleeds easily and the culture for GNB. In conclusion, the presence of gram-negative pathogens with resistance profiles in primary healthcare patients suggests the need to implement microbiological surveillance for patients with VU experiencing a prolonged or difficult healing process, and that the identification VU infection should be guided by knowledge regarding the etiology, classic characteristic and clinical stages of infection. / Estudo transversal realizado nas salas de curativos da atenção primária a saúde em Goiânia, Goiás, Brasil, cujos objetivos foram identificar a prevalência de bastonetes Gram-negativos (BGN) em úlceras venosas (UV) com sinais clínicos de infecção; analisar o perfil de suscetibilidade dos isolados; detectar a produção de &#946;-lactamases tipo AmpC, metalo-beta-lactamase e ESBL; descrever os sinais e sintomas clínicos de infecção em UV; avaliar o estágio clínico de infecção das lesões e a relação destes com a presença de BGN. Utilizou-se de análise descritiva, teste de proporções e Qui-quadrado (p<0,05). Os aspectos éticos foram observados. Participaram 69 pacientes com úlceras venosas com ou sem complicações arteriais, totalizando 98 lesões. Verificou-se que em 74,5% das lesões houve crescimento de BGN. Foram identificadas Enterobactérias (53,8%) e bastonetes Gram-negativos não fermentadores (46,2%). Dentre as enterobactérias prevaleceu a espécie Escherichia coli (24,5%), seguida de Enterobacter aerogenes, Pantoea aglomerans e Proteus mirabillis com 12,2% cada um. Em relação aos bastonetes Gram-negativos não fermentadores, destacou-se a prevalência do gênero Pseudomonas com 66,6% e em especial a espécie P. aeruginosa com 59,5%, presente em 25,5% das feridas analisadas. Quanto ao perfil de suscetibilidade das enterobactérias, destacaram-se a resistência à tetraciclina (38,8%), à amoxacilina-ácido clavulânico (26,5%). Entre as P. aeruginosa, a maior resistência foi observada para cefoxitina (100%). Quanto à produção de enzima AmpC, 30% dos micro-organismos do grupo CESP e 100% das P. aeruginosa foram resistentes a cefoxitina. Os demais micro-organismos do grupo CESP (70%) sensíveis à cefoxitina foram submetidos ao teste confirmatório e 37,5% apresentaram-se positivos a produção de enzima AmpC. Em relação a metalo-beta-lactamase, 23,8% dos bastonetes Gram-negativos não fermentadores apresentaram sensibilidade reduzida ao imipenem, meropenem ou ceftazidima. Ao serem submetidos ao teste confirmatório, observou-se que 8% das P. aeruginosa foram positivas para a enzima MBL. Não foi identificada ESBL. Quanto aos sinais e sintomas clínicos de infecção na lesão, destacaram-se, com freqüência >70%: descoloração do tipo opaca e/ou tijolo vermelho escuro; aumento do volume do exsudato e dor. O estágio três de infecção foi o mais prevalente (71,4%). Houve relação entre celulite e tecido de granulação friável que sangra facilmente e o resultado de cultura para BGN. Conclui-se que a presença de patógenos Gram-negativos resistentes em pacientes na atenção primária a saúde sugere a necessidade de instituir-se vigilância microbiológica para os pacientes com UV com processo cicatricial de difícil evolução e que a identificação de infecção nas UV deve ser norteada pelo conhecimento acerca da etiologia, características clássicas e estágios clínicos de infecção.
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Detecção e caracterização de bactérias gram-negativas produtoras de <font face=\"Symbol\">b-lactamases de espectro estendido (ESBL) e AmpC plasmidial isoladas de animais de companhia e búfalos no Estado de São Paulo. / Detection and characterization of gram-negative bacteria producers extended spectrum <font face=\"Symbol\">b- lactamases (ESBL) and pAmpC isolated from pets and buffalo in São Paulo.

Leandro Barbato 14 March 2013 (has links)
O presente trabalho teve como objetivo realizar um estudo de vigilância epidemiológica de bactérias MR em isolados obtidos de amostras de búfalo de bubalinocultura e em animais de estimação apresentando sinais e sintomas clínicos de infecção urinária. O estudo relata resultados inéditos referentes à disseminação de bactérias MR, com alto índice de resistência a antimicrobianos de uso clínico e do agronegócio, constituindo o primeiro reporte mundial da emergência de cepas de Escherichia coli produtoras de <font face=\"Symbol\">b-lactamases de amplo espectro (ESBL) do tipo CTX-M-8 e AmpC plasmidial (pAmpC) CMY-2 na bubalinocultura e a presença de cepas de E. coli produtoras de ESBL do tipo CTX-M-15, CTX-M-8 e CTX-M-2, e pAmpC CMY-1, CMY-2 e DHA-1 em animais de companhia é relatada pela primeira vez no Brasil. Nos isolados de E. coli ESBL positivos, não foi constatada relação clonal. As cepas isoladas de búfalos pertencem aos grupos A e B1 e em animais de companhia foram identificados predominantemente os grupos filogenéticos de alta virulência B2 e D. / This study aimed to conduct an epidemiological surveillance on MDR among Gram-negative bacilli recovered from samples from buffalo and in pets exhibiting signs and symptoms related to urinary tract infection. The study reports the spread of MDR bacteria exhibiting a high resistance profile to veterinary- and human-use <font face=\"Symbol\">b-lactams and quinolones, in livestock of buffalos and in pets, constituting the first worldwide report of CTX-M-8-type extended-spectrum <font face=\"Symbol\">b-lactamase (ESBL)- and CMY-2-type plasmid AmpC (pAmpC)-producing E. coli strains in buffalo. Moreover, to the best of knowledge, this is the first report of CTX-M-15-, CTXM-8-, CTX-M-2, CMY-1, CMY-2- and DHA-1-producing E. coli strains in pets in Brazil. With respect to the origin of resistance, we found no clonal relatedness among MDR. E. coli isolates from buffalos belonging to groups A and B1 and in companion animals, the phylogenetic analysis of virulence in E. coli denoted the predominance of the highly virulent phylogenetic groups B2 and D.
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Structural studies of type IX and type II secretion systems / Etudes structurales des systèmes de sécrétion de type IX et de type II

Trinh, Thi Trang Nhung 21 March 2019 (has links)
Les protéines synthétisées et sécrétées par les bactéries jouent des rôles importants pour leur survie. Les bactéries à Gram négatif ont développé des voies de sécrétion en tant qu'armes principales pour transporter des facteurs de virulence dans l'environnement extracellulaire ou dans des cellules hôte. L'un de ces systèmes, le T9SS a été principalement étudié chez l'agent pathogène oral Porphyromonas gingivalis et chez la bactérie mobile Flavobacterium johnsoniae. Un autre complexe, le T2SS est le principal déterminant de la virulence de la bactérie Pseudomonas aeruginosa, un agent pathogène de la fibrose kystique. Dans le cadre de ma thèse, j'ai résolu la structure atomique de plusieurs composants centraux du T9SS et du T2SS. Concernant le projet T9SS, j'ai essayé de cristalliser le domaine cytoplasmique de GldL de F. johnsoniae. La co-cristallisation de GldL avec des Nbs a été réalisée sans succès. Néanmoins, les structures cristallines de deux nanobody contre GldL ont été résolues par remplacement moléculaire. De plus, j'ai également travaillé sur la protéine PG1058 de P. gingivalis. J'ai résolu sa structure par diffraction anomale à la longueur d’onde du selenium. Concernant le projet T2SS, je me suis concentré sur la partie N-terminale de XcpQ, une sous-unité de la sécrétine. J'ai résolu la structure cristalline de XcpQN012 seul et en complexe avec le nanobody vhh04 à une résolution de 2,98 Å et de 2,9 Å, respectivement. Enfin, j'ai participé à la détermination structurale de TssK, un composant de plaque de base du système de T6SS et déterminer la structure cristalline d'un nanobody contre le domaine périplasmique de PorM. / Proteins synthesized and secreted by bacteria serve many important roles in their survival. In particular, Gram-negative bacteria have evolved secretion pathways as the main weapons for transporting virulence factors into target cells or into the extracellular environment. One of these systems, the type IX secretion system (T9SS) or the Por secretion system, has been studied mainly in the oral pathogen Porphyromonas gingivalis and the gliding bacterium Flavobacterium johnsoniae. Another complex, the type II secretion system (T2SS) is the main determinant of the virulence of Pseudomonas aeruginosa, a cystic fibrosis pathogen. In my PhD thesis, I solved the atomic structure of several core components of both T9SS and T2SS.For the T9SS project, I tried to crystallize the cytoplasmic domain of GldL from F. johnsoniae. The co-crystallization of GldL with Nbs was unsuccessfull. The crystal structures of two nanobodies against GldL were solved by molecular replacement. I also worked on the PG1058 protein of P. gingivalis. I obtained crystals of the selenomethionine-derivatized PG1058 OmpA_C-like domain that diffracted up to 1.55 Å, and solved its structure by single-wavelength anomalous diffraction. For the T2SS project, I focused on the N-terminal part of XcpQ, a subunit of the secretin. I solved the crystal structure of XcpQN012 alone and in complex with nanobody vhh04 at a resolution of 2.98 Å and 2.9 Å, respectively. In addition, I also took part in the structural determination of the base plate component TssK of the T6SS and determined the crystal structure of one nanobody (vhh19) against the periplasmic domain of PorM.
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Macrolide resistance and its linkage to tetracycline resistance /

Chung, Whasun Oh. January 1999 (has links)
Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 1999. / Vita. Includes bibliographical references (leaves 112-144).
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Investigação das comunidades bacterianas cultiváveis e aspectos físico-químicos de wetlands construídos em hotel na serra gaúcha / Investigation of the culturable bacterial communities and physico-chemical aspects in constructed wetlands at a hotel in serra gaúcha

Andréis, Diogo Bonalume January 2016 (has links)
Wetlands são sistemas que apresentam custo operacional e de implantação muito reduzidos se comparados à maioria dos sistemas de tratamento de efluentes. As comunidades microbianas presentes nesse sistema promovem a remoção de poluentes, da matéria orgânica e de nutrientes eutrofizantes. Este trabalho teve como objetivo a identificação das comunidades microbianas cultiváveis presentes no efluente e sua alternância ao longo do sistema em comparação aos dados físico-químicos. Amostras de efluente bruto e tratado foram coletadas no verão e no início do inverno de 2015 no sistema de wetlands construídos em um hotel. As amostras foram diluídas em série até a diluição 10-6 e as últimas três foram inoculadas em placas de Petri, em triplicata, contendo quatro meios de cultura. As amostras foram incubadas a temperatura ambiente (20°C ± 2°C) e 28ºC por 24-48 h. Foram obtidos 76 isolados bacterianos, sendo 54 das amostras de verão e 22 de inverno. Do total de isolados bacterianos obteve-se 18 Gram-positivas e 58 Gram-negativas. A média dos valores de nitrogênio total, nitrogênio amoniacal e fósforo demonstrou eficiência moderada de remoção pelo sistema de tratamento. Observou-se aumento de nitrato no efluente tratado nas duas coletas e um percentual de remoção maior no período de inverno para nitrogênio amoniacal e nitrogênio total. Dentre os 19 gêneros bacterianos identificados observou-se prevalência dos gêneros: Acinetobacter, Bacillus, Enterobacter, Klebsiella, Moraxella e Pseudomonas. As amostras representativas dos principais gêneros identificados bioquimicamente foram selecionadas para sequenciamento de DNA, cujo resultado confirmou os gêneros dos grupos microbianos. / Wetlands are systems that have low implementation and operational costs, when compared to other types of wastewater treatment systems. Microbial communities of wetlands systems promote the removal of pollutants, organic matter and eutrophication nutrients. This study aimed to identify the initial culturable microbial communities of the wetland effluent, as well as their changes throughout the system, and to compare this data with the physicochemical data. Raw and treated effluent samples were collected in the summer and early winter of 2015 in the wetlands system built in the hotel. Samples were serially diluted, up to 10-6 dilution and the last three dilutions were seeded on Petri dishes, in triplicate, into four culture media. After incubation at ambient temperature (20°C ± 2°C) and 28°C for 24-48 h a total of 76 bacterial isolates were obtained, 54 from summer and 22 from winter samples, of which 18 Gram-positive and 58 Gram-negative. The mean values of total nitrogen, ammoniacal nitrogen and phosphorus in the final treated effluent, showed a moderate efficiency of the wetlands system. Nitrate increased in the treated effluent in two samples, although a higher percentage of removal in the winter period for ammoniacal nitrogen and total nitrogen was registered. Among the 19 identified bacterial genera there was a prevalence of Acinetobacter, Bacillus, Enterobacter, Klebsiella, Pseudomonas and Moraxella. Samples that represented the majority of the genera identified biochemically, after being submitted for DNA sequencing confirmed the genera of the bacterial isolates.
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Investigação das comunidades bacterianas cultiváveis e aspectos físico-químicos de wetlands construídos em hotel na serra gaúcha / Investigation of the culturable bacterial communities and physico-chemical aspects in constructed wetlands at a hotel in serra gaúcha

Andréis, Diogo Bonalume January 2016 (has links)
Wetlands são sistemas que apresentam custo operacional e de implantação muito reduzidos se comparados à maioria dos sistemas de tratamento de efluentes. As comunidades microbianas presentes nesse sistema promovem a remoção de poluentes, da matéria orgânica e de nutrientes eutrofizantes. Este trabalho teve como objetivo a identificação das comunidades microbianas cultiváveis presentes no efluente e sua alternância ao longo do sistema em comparação aos dados físico-químicos. Amostras de efluente bruto e tratado foram coletadas no verão e no início do inverno de 2015 no sistema de wetlands construídos em um hotel. As amostras foram diluídas em série até a diluição 10-6 e as últimas três foram inoculadas em placas de Petri, em triplicata, contendo quatro meios de cultura. As amostras foram incubadas a temperatura ambiente (20°C ± 2°C) e 28ºC por 24-48 h. Foram obtidos 76 isolados bacterianos, sendo 54 das amostras de verão e 22 de inverno. Do total de isolados bacterianos obteve-se 18 Gram-positivas e 58 Gram-negativas. A média dos valores de nitrogênio total, nitrogênio amoniacal e fósforo demonstrou eficiência moderada de remoção pelo sistema de tratamento. Observou-se aumento de nitrato no efluente tratado nas duas coletas e um percentual de remoção maior no período de inverno para nitrogênio amoniacal e nitrogênio total. Dentre os 19 gêneros bacterianos identificados observou-se prevalência dos gêneros: Acinetobacter, Bacillus, Enterobacter, Klebsiella, Moraxella e Pseudomonas. As amostras representativas dos principais gêneros identificados bioquimicamente foram selecionadas para sequenciamento de DNA, cujo resultado confirmou os gêneros dos grupos microbianos. / Wetlands are systems that have low implementation and operational costs, when compared to other types of wastewater treatment systems. Microbial communities of wetlands systems promote the removal of pollutants, organic matter and eutrophication nutrients. This study aimed to identify the initial culturable microbial communities of the wetland effluent, as well as their changes throughout the system, and to compare this data with the physicochemical data. Raw and treated effluent samples were collected in the summer and early winter of 2015 in the wetlands system built in the hotel. Samples were serially diluted, up to 10-6 dilution and the last three dilutions were seeded on Petri dishes, in triplicate, into four culture media. After incubation at ambient temperature (20°C ± 2°C) and 28°C for 24-48 h a total of 76 bacterial isolates were obtained, 54 from summer and 22 from winter samples, of which 18 Gram-positive and 58 Gram-negative. The mean values of total nitrogen, ammoniacal nitrogen and phosphorus in the final treated effluent, showed a moderate efficiency of the wetlands system. Nitrate increased in the treated effluent in two samples, although a higher percentage of removal in the winter period for ammoniacal nitrogen and total nitrogen was registered. Among the 19 identified bacterial genera there was a prevalence of Acinetobacter, Bacillus, Enterobacter, Klebsiella, Pseudomonas and Moraxella. Samples that represented the majority of the genera identified biochemically, after being submitted for DNA sequencing confirmed the genera of the bacterial isolates.
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Caracterização da atividade antimicrobiana e tecnologica de tres culturas bacteriocinogenicas e avaliação de sua eficiencia no controle de Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus e Bacillus cereus em queijo Minas frescal / Characterization of the antimicrobian and technological activity of three bacterion producing cultures and evaluation of its efficiency in the Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus e Bacillus cereus control in Minas frescal cheese

Nascimento, Maristela da Silva do, 1977- 04 September 2007 (has links)
Orientadores: Arnaldo Yoshiteru Kuaye, Izildinha Moreno / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-08T11:59:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nascimento_MaristeladaSilvado_D.pdf: 987996 bytes, checksum: b40b83ce1cfdfd6fe5e6d3a67301de6d (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: A biopreservação é uma técnica utilizada para estender a vida útil e aumentar a segurança dos alimentos por meio do emprego de microbiota protetora e/ou seus peptídeos antimicrobianos. O objetivo deste trabalho foi avaliar a atividade antimicrobiana de culturas produtoras de bacteriocinas sobre alguns patógenos Gram-positivos de ocorrência comum em produtos lácteos. As culturas bacteriocinogênicas Lactococcus lactis subsp. Lactis ATCC 11454, Lactobacillus plantarum ALC 01 e Enterococcus faecium FAIR-E 198 apresentaram comportamento distinto em relação à produção de bacteriocinas quando inoculadas em caldo MRS e em leite desnatado reconstituído (LDR) a 10%. Na avaliação do espectro de ação antimicrobiano pelo método de difusão em ágar por inoculação em poços, as bacteriocinas produzidas por Lb. plantarum ALC 01 e E. faecium FAIR-E 198 apresentaram atividade inibitória apenas sobre as linhagens de Listeria monocytogenes, já a nisina produzida por Lc. lactis subsp. lactis ATCC 11454 demonstrou espectro de ação mais amplo, porém com menor atividade que as demais culturas bacteriocinogênicas. Na avaliação da compatibilidade de desenvolvimento associativo com fermentos lácticos comerciais, somente Lc. lactis subsp. lactis ATCC 11454 apresentou atividade (halo de 6mm) sobre as linhagens constituintes de ambos os fermentos lácticos avaliados. A determinação da atividade acidificante foi realizada em LDR 10% após 8 e 24h de incubação a 35ºC; a adição de 0,1% e de 0,5% das culturas bacteriocinogênicas não afetou significativamente a capacidade de acidificação dos fermentos lácticos. Além disso, observou-se que o desenvolvimento associativo dos fermentos lácticos com Lb. Plantarum ALC 01 e E. faecium FAIR-E 198, em ambas as concentrações, proporcionou significativo aumento da atividade das bacteriocinas destas culturas, enquanto que a atividade da nisina de Lc. lactis subsp. lactis ATCC 11454 foi suprimida. A atividade de aminopeptidases foi determinada após desenvolvimento das culturas lácticas em caldo MRS, Lb. Plantarum ALC 01 apresentou as maiores atividades. Também foi analisado o comportamento de patógenos Gram-positivos durante desenvolvimento associativo com as culturas produtoras de bacteriocinas e fermento láctico em LDR 10% a 35ºC por 48h. Lb. plantarum ALC 01 e E. faecium FAIR-E 198 não influenciaram significativamente o desenvolvimento de Bacillus cereus K1-B041 e de Staphylococcus aureus ATCC 27154 durante as primeiras 24h de incubação a 35ºC, contudo apresentaram forte ação inibitória sobre L monocytogenes Scott A. Já Lc. lactis subsp. lactis ATCC 11454 afetou o desenvolvimento de todos os patógenos apenas durante as primeiras 12h de incubação. O fermento láctico demonstrou significativa ação inibitória sobre B. cereus K1-B041 (>7,37 log UFC/ml) e L monocytogenes Scott A (>6,26 log UFC/ml). Em queijo Minas Frescal, não foi observada diferença significativa entre a ação das culturas bacteriocinogênicas e o fermento láctico sobre L. monocytogenes Scott A e S. aureus ATCC 27154. B. cereus K1-B041 demonstrou susceptibilidade a Lb. plantarum ALC 01 e E. faecium FAIR-E 198 após 7 dias. Pelo método de diluição crítica não foi detectada atividade de bacteriocina nos queijos durante os 21 dias de estocagem a 8 ± 1ºC. A adição das culturas produtoras de bacteriocinas como adjuntas ao queijo Minas Frescal não promoveu alteração no pH e na acidez, contudo Lb. plantarum ALC 01 e E. faecium FAIR-E 198 promoveram aumento da proteólise primária e secundária. Embora os resultados obtidos demonstrem que as culturas bacteriocinogênicas avaliadas não possam ser empregadas como único método de conservação, estas podem atuar em sinergia com outros fatores para aumentar a eficiência no controle de patógenos Gram-positivos, especialmente L. monocytogenes, em produtos lácteos fermentados / Abstract: The biopreservation system, such as bacteriocinogenic lactic bacteria cultures and/or their bacteriocins, have received increasing attention and new approaches to control pathogenic and spoilage microorganisms have been developed. The purpose of this study was to evaluate the action of bacteriocin-producing cultures (Lactococcus lactis subsp. lactis ATCC 11454, Lactobacillus plantarum ALC 01 and Enterococcus faecium FAIR-E 198) on some Gram-positive pathogens in different culture media and dairy products. The bacteriocin production was influenced by the media. The antimicrobial activity of these cultures was evaluated by agar-well diffusion assay. The bacteriocins produced by Lb. plantarum ALC 01 and E. faecium FAIR-E 198 presented inhibitory activity on Listeria monocytogenes alone, on the other hand, the nisin produced by Lc. lactis subsp. Lactis ATCC 11454 demonstrated wide action spectrum, albeit with lower activity. In compatibility of associative development evaluation with the commercial starter culture, only Lc. lactis subsp. lactis ATCC 11454 presented activity on the starter culture. The acidifier activity determination was carried out in skimmed milk after 8h and 24h of incubation at 35ºC. The addition of 0.1% and 0.5% of the bacteriocinogenic cultures did not affect the production of lactic acid by the starter culture. The associative development of the starter culture with Lb. plantarum ALC 01 and E. faecium FAIR-E 198 provided significant increase in bacteriocin activity of these cultures, while the activity of Lc. Lactis subsp. lactis ATCC 11454 nisin was suppressed. The aminopeptidase activity was determined after cellular lise of the lactic cultures previously grown in MRS broth. Lb plantarum ALC 01 presented the largest activity. Moreover, the behavior of Gram-positive pathogens was analyzed during co-culture with the bacteriocin-producing bacteria and with the starter culture in skimmed milk. Lb. plantarum ALC 01 and E. faecium FAIR-E 198 did not influence the development of Bacillus cereus K1-B041 and of Staphylococcus aureus ATCC 27154 during the first 24h of incubation at 35ºC. They presented strong inhibition on L. monocytogenes Scott A. Lc. lactis subsp. lactis ATCC 11454 affected the development of the pathogens studied during the first 12h of incubation. The starter culture demonstrated good inhibition of B. cereus K1-B041 (>7.37 log UFC/ml) and L monocytogenes Scott A (>6.26 log UFC/ml). In Minas Frescal cheese, significant difference was not observed between the action of the bacteriocinogenic cultures and the starter culture on L. monocytogenes Scott A and S. aureus ATCC 27154. B. cereus K1- B041 demonstrated susceptibility to Lb. plantarum ALC 01 and E. faecium FAIR-E 198 after 7 days. Bacteriocin activity was not detected in the cheeses during 21 days at 8 ± 1ºC. The addition of the bacteriocin-producing bacteria as an adjunct culture to the Minas Frescal cheese did not promote alteration in the pH and in the acidity, however Lb. plantarum ALC 01 and E. faecium FAIR-E 198 promoted an increase of the cheese proteolysis. Although the obtained results demonstrated that bacteriocinogenic cultures cannot be used as only method of conservation, these can be used as an additional barrier to optimize the control of Gram-positive pathogens, especially L. monocytogenes, in dairy products / Doutorado / Doutor em Tecnologia de Alimentos
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Contaminação ambiental como fator de risco para trabalhador da atenção primária à saúde / Environmental contamination as a risk factor for workers of the primary health care

Pereira, Mayara Regina 28 April 2015 (has links)
Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2015-10-26T14:23:53Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mayara Regina Pereira - 2015.pdf: 2344518 bytes, checksum: 121abb85c9406f07753d362631b51eda (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-10-26T14:46:04Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mayara Regina Pereira - 2015.pdf: 2344518 bytes, checksum: 121abb85c9406f07753d362631b51eda (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-26T14:46:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mayara Regina Pereira - 2015.pdf: 2344518 bytes, checksum: 121abb85c9406f07753d362631b51eda (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-04-28 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Environmental surfaces and items for non-critical health health facilities are in important reservoirs of pathogenic and multiresistant bacteria. This study aimed to analyze the contamination of environmental surfaces and products for non-critical health by gram-negative rods (GNR) as a risk factor for the health of workers in the dressing rooms in básica.Trata is an epidemiological study attention the analytical type, held from May 2013 to June 2014 in five dressing rooms. The collection was through swabs with subsequent microbiological evaluation of the specimens. Of the 61 sites analyzed, 11 (18.0%) had positive culture for BGN with 13 microorganisms isolated. Of these, eight (61.5%) were identified as belonging to the family Enterobacteriaceae: two Serratia ficaria, Serratia odorifera two biogroup II, an Escherichia vulneris, one Enterobacter aerogenes, Citrobacter diversus and one aglomerans Pantoea, which showed resistance, ampicillin (50.0%), cefotaxime (50.0%), cefoxitin (37.5%), carbapenems (37.5%), amoxicillin / clavulanic acid (12.5%). As for the gram-negative non-fermenting rods (GNNFR), we identified five (38.5%) bacteria: Four Stenotrophomonas maltophilia and Pseudomonas stutizeri. All GNNFR were sensitive to carbapenems. It is concluded that the microbiological profile of isolates higher prevalence of Enterobacteriaceae, including emerging species of epidemiological importance to infections. These findings in the ambience after processing represent a risk factor of these agents for health workers. As for the factor of risk for workers against contamination by gram negative environmental surfaces and products for health stands out eventual colonization and infection of workers in the event of imunocomprometimentos future, besides acting as a disseminator of these micro-organisms. / Superfícies ambientais e artigos para saúde não críticos de estabelecimentos de saúde constituem-se importantes reservatórios de bactérias patogênicas e multirresistentes. Este estudo teve como objetivo, analisar a contaminação de superfícies ambientais e produtos para saúde não críticos por bastonetes gram-negativos (BGN) como fator de risco para a saúde de trabalhadores das salas de curativos na atenção primária a saúde. Trata-se de um estudo epidemiológico, do tipo analítico, realizado de maio de 2013 a junho de 2014 em cinco salas de curativos. A coleta se deu por meio de swabs com subsequente avaliação microbiológica dos espécimes. Dos 61 sítios analisados, 11 (18,0%) apresentaram cultura positiva para BGN, com 13 micro-organismos isolados. Desses, oito (61,5%) foram identificados como pertencentes à família Enterobacteriaceae: duas Serratia ficaria, duas Serratia odorifera biogrupo II, uma Escherichia vulneris, uma Enterobacter aerogenes, uma Citrobacter diversus e uma Pantoea aglomerans, os quais apresentaram resistência à ampicilina (50,0%), cefotaxima (50,0%), cefoxitina (37,5%), carbapenens (37,5%), amoxacilina/ácido clavulânico (12,5%). Quanto aos bastonetes gram-negativos não fermentadores (BGNNF), identificaram-se cinco (38,5%) bactérias: quatro Stenotrophomonas maltophilia e uma Pseudomonas stutizeri. Todos os BGNNF foram sensíveis aos carbapenens. Concluiu-se que o perfil microbiológico dos isolados demonstrou maior prevalência de Enterobacteriaceae, incluindo espécies emergentes, com importância epidemiológica para as infecções. Tais achados na ambiência, após seu processamento, representam um fator de risco desses agentes para os trabalhadores da saúde. Quanto ao fator de riscos para trabalhadores frente a contaminação por gram negativos de superfícies ambientais e produtos para saúde destaca-se a colonização e eventual infecção do trabalhador em caso de futuros imunocomprometimentos, além de atuar como veiculador desses micro-organismos.
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Colonização nasal de cirurgiões-dentistas em atividade docente por bactérias gram-negativas: interfaces com as medidas de prevenção e controle / Nasal colonization with gram-negative bacteria of dental surgeons performing teaching activities: interface with the prevention and control measures

Batista, Késia Cristina de Oliveira 28 March 2016 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-08-25T15:41:01Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Késia Cristina de Oliveira Batista - 2016.pdf: 2882952 bytes, checksum: 8ca4241645e2fbd94d861045795c419e (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-08-25T15:41:26Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Késia Cristina de Oliveira Batista - 2016.pdf: 2882952 bytes, checksum: 8ca4241645e2fbd94d861045795c419e (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-25T15:41:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Késia Cristina de Oliveira Batista - 2016.pdf: 2882952 bytes, checksum: 8ca4241645e2fbd94d861045795c419e (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-03-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / This was an epidemiological, cross-sectional analytical study, performed in a Higher Education Institution (HEI) of Goiás/Brazil, with data collection from July to October 2014. Data were collected through a structured questionnaire and biological material collection (nasal swab). The level of nasal cavity colonization of DS teachers by Enterobacteriaceae was considered high (22.0%), with 14.6% of professionals being colonized by multiresistant microorganisms. These results were associated with inadequate personal habits and provide evidence for broadening the discussion of this issue among DS and directing strategies for controlling the biological risk for dentistry workers. / Trata-se de um estudo epidemiológico, transversal e analítico, realizado em uma Instituição de Ensino Superior (IES) de Goiás/Brasil, com coleta dos dados de julho a outubro de 2014. Os dados foram obtidos mediante aplicação de questionário estruturado e coleta de material biológico (swab nasal). A colonização da cavidade nasal dos CD docentes por Enterobacteriaceae foi considerada elevada (22,0%), sendo que 14,6% dos profissionais estavam colonizados por micro-organismos multirresistentes. Os resultados encontrados foram associados a hábitos pessoais inadequados e oferecem evidências para ampliar a discussão desta temática entre CD e direcionar estratégias para o controle do risco biológico aos trabalhadores em odontologia.

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