Submitted by Vanessa Zaffani Sant'Ana null (vanessazsbio@gmail.com) on 2017-10-10T19:00:01Z No. of bitstreams: 1 Vanessa Zaffani Sant'Ana..pdf: 1913553 bytes, checksum: a1dccd2bae0ad9102e270554ce3d6aee (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-10-11T18:12:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 santana_vz_me_ilha.pdf: 1913553 bytes, checksum: a1dccd2bae0ad9102e270554ce3d6aee (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-11T18:12:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 santana_vz_me_ilha.pdf: 1913553 bytes, checksum: a1dccd2bae0ad9102e270554ce3d6aee (MD5) Previous issue date: 2017-08-14 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A aroeira (Myracrodruon urundeuva) é uma espécie dioica e se encontra na lista de espécies ameaçadas de extinção, devido ao seu alto valor econômico e à destruição do seu habitat. Dessa forma, se faz necessária a adoção de estratégias para a conservação ex situ dessa espécie arbórea nativa, de tal modo que a variabilidade genética das populações seja mantida. O objetivo deste trabalho foi quantificar a proporção sexual, a sobrevivência e a variação genética do diâmetro à altura do peito (DAP), em seis testes de progênies de M. urundeuva provenientes de seis populações distintas originárias de três biomas (Caatinga, Cerrado e Mata Atlântica). O delineamento utilizado, em cada teste de progênies, foi o de bloco casualizado. As estimativas de componentes de variância e parâmetros genéticos, para os caracteres quantitativos para os caracteres quantitativos, DAP e sobrevivência, foram realizadas pelo método REML/BLUP (máxima verossimilhança restrita / melhor predição linear não viciada). O tamanho efetivo da população foi calculado com base no número de indivíduos com flores masculinas e femininas, em um modelo que não há controle de gametas (RS). Verificou-se com base nas estimativas dos parâmetros genéticos que as procedências de Itarumã e Seridó expressam maior variação genética para o caráter DAP, o que possibilita sua utilização na conservação e no melhoramento genético. Foram encontrados altos percentuais de sobrevivência o que caracteriza uma ótima adaptação da espécie no local de plantio. A proporção sexual foi tendenciosa, com predominância de plantas com florescimento masculino (3♂:1♀), porém a maior parte dos indivíduos de M. urundeuva, procedentes dos diferentes biomas, não floresceram em Selvíria-MS. O tamanho efetivo populacional variou conforme a razão sexual, sendo que os testes de progênies que se aproximaram mais do valor real de indivíduos reprodutivos foram aqueles originários de Seridó (RN), Itarumã (GO) e Petrolina (PE). As subpopulações dos testes de progênies de Itarumã e Selvíria são as mais próximas geneticamente da população de referência (T), ou seja, possuem a mesma representatividade genética. Portanto, a seleção dos indivíduos dentro dos testes de progênies não deve considerar apenas o caráter de crescimento (DAP), mas também basear-se na razão sexual e no tamanho efetivo populacional, para a sua futura transformação em um pomar de sementes por mudas. / The aroeira (Myracrodruon urundeuva) is a dioecious species and is on the list of endangered species due to its high economic value and the destruction of its habitat. That way, becomes necessary the adoption of strategies for the ex situ conservation of native tree species, such that the genetic variability of populations is maintained. The objective of this work was to quantify the sex ratio, the survival and the genetic variation of the diameter at breast height (DBH), on six test progenies of Myracrodruon urundeuva from six distinct populations originating three biomes (Caatinga, Cerrado and Atlantic Forest). The design used, in each progeny test, was a randomized block design. Estimates of variance components and genetic parameters, for quantitative traits DBH and survival, were obtained by REML / BLUP method (restricted maximum likelihood / best linear prediction untainted). The effective population size was calculated based on the number of individuals with male and female flowers in the population, in a model that there is no control of gametes (RS). It was verified based on the estimates of the genetic parameters that the Itarumã and Seridó provenances express greater genetic variation for the DBH character, which allows their use in conservation and genetic improvement. High survival percentages were found, which characterizes an optimal adaptation of the species at the planting site. The sex ratio was biased, with predominance of male flowering plants (3♂:1♀), but most of M. urundeuva individuals, from the different biomes, did not flower in Selvíria-MS. The effective population size varied according to the sex ratio, being that the progeny tests that approached more of the real value of reproductive individuals were those originating from Seridó (RN), Itarumã (GO) and Petrolina (PE). The subpopulations of the tests progenies of Itarumã and Selvíria are the closest genetically of the reference population (T), that is, they have the same genetic representativeness. Therefore, the selection of individuals within the progeny tests should not only consider the growth trait (DBH), but also be based on sex ratio and effective population size for its future transformation into a Seed Orchard. / FAPESP: 2015/15693-7

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-06Bitstream added on 2014-06-13T19:18:12Z : No. of bitstreams: 1 perezviegas_m_me_ilha.pdf: 402677 bytes, checksum: bbfc07fa77debb297881fa5d75487697 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Os marcadores de microssatélites tem sido utilizados com grande freqüência como ferramenta efetiva para estudos de estrutura genética de populações, fluxo gênico, parentesco e para quantificar os efeitos da fragmentação de habitats e guiar estratégias de conservação e melhoramento genético. Este trabalho teve como objetivo avaliar a diversidade genética e o sistema reprodutivo em progênies de duas populações de Myracrodruon urundeuva, procedentes de Aramina-SP e Selvíria-MS, assim como verificar os efeitos da ação antrópica sobre estas populações. Foram avaliadas 25 progênies de cada população, cada uma com 17 a 20 indivíduos, sendo analisados oito locos polimórficos de regiões microssatélites. Observouse 118 alelos nas duas populações e o número efetivo por loco ( e A ∧ = 4,05) foi inferior ao número médio de alelos por loco ( ∧A= 14,75), indicando elevado número de alelos em baixa freqüência. O índice de fixação (F = 0,210 e 0,107, respectivamente para Aramina e Selvíria) foi positivo, relativamente alto e significativamente diferente de zero. A taxa de cruzamento multilocos ( ∧ m t = 1,000 e ∧ m t = 1,000) e unilocos ( ∧ s t = 0,989 e ∧ s t = 0,999) para as populações de Aramina e Selvíria, respectivamente, foram altos, confirmando que a espécie é obrigatoriamente de cruzamento. A diferença entre a taxa de cruzamento multilocos e unilocos indicam cruzamentos entre indivíduos aparentados na população de Aramina. 9 Entretanto, as duas populações apresentaram alta diversidade genética, o que as qualifica para utilização em programas de conservação e melhoramento genético da espécie. / The microsatellite markers has been often employed as effective tool for studies of genetic structure of populations, gene flow, relationship and also for to quantify environmental fragmentation effects and to outline strategies for conservation and breeding. This study aimed to evaluate the genetic diversity and mating system in progenies of two Myracrodruon urundeuva populations from Aramina-SP and Selvíria-MS, as well as verify the effects of antropic action on these populations. From each population were evaluated 25 progenies, with 15-20 individuals each, using genetic data from 8 microsatellite loci. There was 118 alleles in both populations and the actual number per locus ( e A ∧ = 4.05) was lower than the average number of alleles per locus ( ∧A = 14.75), indicating high number of alleles in low frequency. The fixation index (F = 0,210 e 0,107, respectively for Aramina and Selvíria) was positive, relatively high and significantly different from zero. The multilocus outcrossing rate ( ∧ m t = 1,000 e ∧ m t = 1,000) single-locus ( ∧ s t = 0,989 e ∧ s t = 0,999) for the populations for Aramina and Selvíria, respectively, they were high, confirming that the species is obligatorily for outcrossing. The difference between the multilocus outcrossing rates and single-locus outcrossing rate indicates mating among relatives in the Aramina population. Meanwhile, the 11 two populations had high genetic diversity, which qualifies them for use in programs for conservation and breeding of this species.

As áreas protegidas são consideradas pilares para estratégias de conservação da diversidade biológica. Presume-se que a distribuição destas áreas representa a proteção de espécies e ecossistemas. Dentre as 20 metas globais para a redução da perda de biodiversidade, a Meta 11 de áreas protegidas estabelece, dentre outros aspectos, que 17% das áreas terrestres devem ser cobertas por sistemas de áreas protegidas ecologicamente representativos, efetivos, conectados e integrados a paisagens terrestres mais amplas. Neste estudo avaliou-se a representatividade ecológica, a efetividade e a integração a paisagens mais amplas do sistema de unidades de conservação, e perspectivas para subsidiar a sua ampliação no bioma Pampa. Além das unidades de conservação stricto senso, em parte das análises também foram considerados os sistemas complementares de terras indígenas e mecanismos de preservação em propriedades rurais definidos pela Lei de Proteção da Vegetação Nativa. A avaliação da representatividade foi feita considerando o Pampa (nível nacional) e também os 11 sistemas ecológicos presentes no bioma (nível regional). Foram levantadas 53 unidades de conservação no Pampa, com cobertura total de 3,23% do bioma Os mecanismos de preservação em propriedades rurais têm potencial de ampliar o sistema de áreas protegidas para até 9,64%, porém ainda depende de validação do órgão ambiental. O percentual protegido por unidades de conservação nos sistemas ecológicos variou entre 0% e 17,76%, sendo que nove dos 11 sistemas possuem menos de 3% em unidades de conservação. Os dados indicaram que as unidades são relativamente efetivas, pois 64% delas mantiveram ou recuperaram sua cobertura de vegetação nativa. As análises sugerem ainda, que a efetividade associada à cobertura vegetal no interior das unidades possui uma relação com a dinâmica no seu entorno. De forma geral, as unidades sofrem influência das alterações no uso da terra em suas adjacências. Para manutenção da efetividade da unidade de conservação, a unidade deve ser manejada considerando essas influências do entorno. Na perspectiva de ampliação do sistema, o esforço para conservação deve ser centrado na criação de novas unidades de conservação e diversificação de categorias. Os dados aqui obtidos indicam que o Pampa dificilmente alcançará a meta de 17% em um sistema de áreas protegidas ecologicamente representativo até 2020. / Protected areas are considered cornerstones for biodiversity conservation strategies. It is presumed that the distribution of these areas represents the protection of species and ecosystems. Among the 20 global targets for reducing biodiversity loss, Target 11 establishes that 17% of land areas must be covered by ecologically representative, effective and connected systems integrated to wider terrestrial landscapes, among other aspects. This study assessed ecological representativeness, effectiveness, and integration of protected area system, into wider landscapes of the Pampa biome. Perspectives to subsidize protected area expansion were also considered here. The representativeness assessment was made by considering the Pampa (national level) and also the 11 ecological systems present in the biome (regional level). Complementary systems of indigenous lands and mechanisms of preservation in rural properties defined by the Law of Protection of Native Vegetation was considered for the national level. Fifty-three protected areas were found in Pampa, with a total coverage of 3.23% of the biome Preservation mechanisms on rural properties have the potential to extend Pampa protected area system to up to 9.64%, but still depend on the environmental agencies validation. The percentage protected by protected areas in ecological systems ranged from zero to 17.76%, and nine of the 11 systems have less than 3% in protected areas. Data indicated that protected areas are relatively effective since 64% of them maintained or recovered their native vegetation cover. Data also indicated that protected area effectiveness has a relation to the dynamics in its surroundings regarding land use and vegetation cover. It is possible to affirm that Pampa protected areas are influenced by changes in land use in their vicinity. Protected areas must be managed considering these environmental influences to maintain their effectiveness. In perspective of expansion of the protected area system, the effort for conservation should be centered on the establishment of new protected areas with the diversification of management categories and in ecological systems with low percentages of protected areas cover. Data obtained here indicates that Pampa is unlikely to reach the 17% target in an ecologically representative protected area system by 2020.

Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2016-12-07T16:22:53Z No. of bitstreams: 2 Tese - Rodrigo Soares de Castro - 2016.pdf: 5776299 bytes, checksum: 5c221af09289c691e9ae2d0146748a62 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2016-12-13T15:38:02Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Rodrigo Soares de Castro - 2016.pdf: 5776299 bytes, checksum: 5c221af09289c691e9ae2d0146748a62 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-13T15:38:02Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Rodrigo Soares de Castro - 2016.pdf: 5776299 bytes, checksum: 5c221af09289c691e9ae2d0146748a62 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-05-30 / This study aimed to analyze the quantitative genetic variation within and between natural subpopulations of Hymenaea stigonocarpa (Mart. Ex Hayne), fruit tree from the Cerrado region. Six mother trees were sampled in each of the 25 subpopulations from the states of Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Minas Gerais and Bahia, covering a large area of the Cerrado biome. In each tree they were collected twenty fruits, which served for evaluation of biometric data of fruits and seeds. Twenty seeds of each mother tree were sown in a nursery, with five seeds per plot in four randomized blocks, constituting a test of provenances and progenies of half sibs. Analysis of variance were performed using the hierarchical model for the characters of initial development. With the produced seedlings it was planted a germplasm collection in vivo in Escola de Agronomia of Universidade Federal de Goias.The major phenotypic variation coefficients in fruits and seeds were found in the characters number of seed (47,87%) weight of the pulp (47.74%) and fruit weight (44.06%). The analysis of variance of the physical characteristics of the fruits and seeds revealed the existence of significant variation for all characters in all levels analyzed: among subpopulations, between mother trees within subpopulations and between fruit within mother tree. Of the ten characters analyzed in six the greatest variation was found between fruit within mother tree. Significant variability was found between subpopulations and between progenies within subpopulations for most quantitative traits studied, showing a great genetic variability of the sampled material, which is important for sustainability of the species and future breeding program. The heritability estimates of traits were also high, indicating success in the selection of desirable traits in a breeding program for the species. The comparative analysis between the estimated value of the QST and FST index showed no significant difference for eight of ten characters analyzed, demonstrating that there is no evidence of the action of natural selection in the differentiation between the studied subpopulations and that the differentiation found can be explained by the action of genetic drift combined with gene flow restriction between subpopulations. The value of correlation coefficient between phenotypic and geographical matrix was 0.164 (p <0.05) by Mantel test, indicating a weak correlation between the phenotypic subpopulations means and the distances between them. / O trabalho teve o objetivo de analisar a variação genética quantitativa entre e dentro de subpopulações naturais de Hymenaea stigonocarpa (Mart. ex Hayne), árvore frutífera da região do Cerrado conhecida como jatobá, jatobá do cerrado ou jatobá do campo. Foram amostradas seis árvores matrizes em cada uma das 25 subpopulações distribuídas pelos estados de Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Minas Gerias e Bahia, abrangendo uma grande área do bioma Cerrado. Em cada árvore foram coletados vinte frutos, que serviram para avaliação dos dados biométricos de frutos e sementes. Vinte sementes de cada matriz foram semeadas em uma área telada, sendo cinco sementes por parcela em quatro blocos ao acaso, constituindo um teste de progênies de meio irmãos hierarquizado. Foram feitas análises de variância e seus componentes pelo modelo hierárquico para os caracteres de desenvolvimento inicial das plântulas. Com as mudas produzidas foi plantado um banco de germoplasma in vivo na Escola de Agronomia da Universidade Federal de Goiás. Os maiores coeficientes de variação fenotípica dos frutos e sementes foram encontrados nos caracteres número de sementes (47,87%), peso da polpa (47,74%) e peso do fruto (44,06%). A análise de variância dos caracteres físicos dos frutos e sementes revelou a existência de variação significativa para todos os caracteres em todos os níveis hierárquicos analisados: entre subpopulações, entre matrizes dentro de subpopulações e entre frutos dentro de matrizes. Dos dez caracteres analisados, em seis a maior variação foi encontrada entre frutos dentro de matrizes. Foram constatadas variabilidades significativas entre subpopulações e entre progênies dentro das subpopulações para a maioria dos caracteres quantitativos de desenvolvimento inicial de plântulas estudadas. Tal resultado denota variabilidade genética do material amostrado, que é importante para a preservação da espécie e também para um futuro programa de melhoramento visando o seu aproveitamento econômico. As estimativas de herdabilidade encontradas nos caracteres estudados também foram altas e adequadas para o sucesso na seleção de caracteres desejáveis em um programa de melhoramento para a espécie. A análise comparativa entre os valores estimados dos índices QST e FST não diferiram significativamente em oito dos dez caracteres analisados, demonstrando que não existe forte evidência da ação da seleção natural na diferenciação entre as subpopulações estudadas e que a diferenciação encontrada pode ser explicada pela ação da deriva genética combinado com a restrição de fluxo gênico entre as subpopulações. O valor encontrado no teste de mantel feito entre as matrizes fenotípica e geográfica foi de 0,164 (p<0,05), denotando uma fraca correlação entre os dados fenotípicos das subpopulações avaliadas e as distâncias entre elas. Pelo correlograma de mantel verificou-se que a correlação entre as matrizes embora fraca, ela diminui constantemente através das classes de distância, chegando a zero por volta dos 500 km. Tal diminuição constante da influência da distância na diferença fenotípica entre as subpopulações caracteriza um padrão clinal.

As áreas protegidas são consideradas pilares para estratégias de conservação da diversidade biológica. Presume-se que a distribuição destas áreas representa a proteção de espécies e ecossistemas. Dentre as 20 metas globais para a redução da perda de biodiversidade, a Meta 11 de áreas protegidas estabelece, dentre outros aspectos, que 17% das áreas terrestres devem ser cobertas por sistemas de áreas protegidas ecologicamente representativos, efetivos, conectados e integrados a paisagens terrestres mais amplas. Neste estudo avaliou-se a representatividade ecológica, a efetividade e a integração a paisagens mais amplas do sistema de unidades de conservação, e perspectivas para subsidiar a sua ampliação no bioma Pampa. Além das unidades de conservação stricto senso, em parte das análises também foram considerados os sistemas complementares de terras indígenas e mecanismos de preservação em propriedades rurais definidos pela Lei de Proteção da Vegetação Nativa. A avaliação da representatividade foi feita considerando o Pampa (nível nacional) e também os 11 sistemas ecológicos presentes no bioma (nível regional). Foram levantadas 53 unidades de conservação no Pampa, com cobertura total de 3,23% do bioma Os mecanismos de preservação em propriedades rurais têm potencial de ampliar o sistema de áreas protegidas para até 9,64%, porém ainda depende de validação do órgão ambiental. O percentual protegido por unidades de conservação nos sistemas ecológicos variou entre 0% e 17,76%, sendo que nove dos 11 sistemas possuem menos de 3% em unidades de conservação. Os dados indicaram que as unidades são relativamente efetivas, pois 64% delas mantiveram ou recuperaram sua cobertura de vegetação nativa. As análises sugerem ainda, que a efetividade associada à cobertura vegetal no interior das unidades possui uma relação com a dinâmica no seu entorno. De forma geral, as unidades sofrem influência das alterações no uso da terra em suas adjacências. Para manutenção da efetividade da unidade de conservação, a unidade deve ser manejada considerando essas influências do entorno. Na perspectiva de ampliação do sistema, o esforço para conservação deve ser centrado na criação de novas unidades de conservação e diversificação de categorias. Os dados aqui obtidos indicam que o Pampa dificilmente alcançará a meta de 17% em um sistema de áreas protegidas ecologicamente representativo até 2020. / Protected areas are considered cornerstones for biodiversity conservation strategies. It is presumed that the distribution of these areas represents the protection of species and ecosystems. Among the 20 global targets for reducing biodiversity loss, Target 11 establishes that 17% of land areas must be covered by ecologically representative, effective and connected systems integrated to wider terrestrial landscapes, among other aspects. This study assessed ecological representativeness, effectiveness, and integration of protected area system, into wider landscapes of the Pampa biome. Perspectives to subsidize protected area expansion were also considered here. The representativeness assessment was made by considering the Pampa (national level) and also the 11 ecological systems present in the biome (regional level). Complementary systems of indigenous lands and mechanisms of preservation in rural properties defined by the Law of Protection of Native Vegetation was considered for the national level. Fifty-three protected areas were found in Pampa, with a total coverage of 3.23% of the biome Preservation mechanisms on rural properties have the potential to extend Pampa protected area system to up to 9.64%, but still depend on the environmental agencies validation. The percentage protected by protected areas in ecological systems ranged from zero to 17.76%, and nine of the 11 systems have less than 3% in protected areas. Data indicated that protected areas are relatively effective since 64% of them maintained or recovered their native vegetation cover. Data also indicated that protected area effectiveness has a relation to the dynamics in its surroundings regarding land use and vegetation cover. It is possible to affirm that Pampa protected areas are influenced by changes in land use in their vicinity. Protected areas must be managed considering these environmental influences to maintain their effectiveness. In perspective of expansion of the protected area system, the effort for conservation should be centered on the establishment of new protected areas with the diversification of management categories and in ecological systems with low percentages of protected areas cover. Data obtained here indicates that Pampa is unlikely to reach the 17% target in an ecologically representative protected area system by 2020.

The genus Restrepia is well known to orchid enthusiasts but its micromorphology has not been described, and its pollination and breeding systems have not been investigated. The aim of this investigation was, therefore, to add to existing knowledge so that the resultant data could be used to facilitate ex situ conservation initiatives. A detailed electron microscopy study (SEM) of the floral organs was performed. This confirmed the structure of the dorsal sepal and lateral petal osmophores, their secretory nature together with that of the synsepal and the labellum. It was postulated how, by manipulating different labellar surface textures, the flower might use these ‘tactile guides’ to steer the insect (fly) through the flower. The cirrhi were postulated to help by destabilising the pollinator in flight, trapping it and bringing about pollination. The papillate structure of the calli was established and their optical properties investigated. Media comparison investigations established that Western medium supported the highest germination rates and, with the addition of banana supplement, the highest rates for seedling growth and development. This represented the first protocol for axenic germination of Restrepia in the literature (Millner et al., 2008) and provided a tested methodology for investigating breeding systems and producing Restrepia plant material for both scientific and horticultural purposes. Self-pollinations were found to produce fewer embryos compared to cross-pollinations. The operation of self-incompatibility (SI) was confirmed by the study of pollen tube growth which further confirmed the time interval between pollination and fertilisation. A time line from pollination/fertilisation to flowering was established. The type of SI in operation was best explained by gametophytic incompatibility. This demonstrated that it was possible to raise Restrepia hybrids and species from seed, by performing intraspecific crosses so helping to preserve them for posterity and relieve pressure on wild populations. Narrow endemic Restrepia species face combined threats from habitat loss, habitat degradation and problems of viable seed production due to the effects of SI and inbreeding depression (ID). Recently developed online resources, such as GeoCAT, were used to perform a Red List assessment in order to identify the degree of threat individual species faced, both globally and nationally. All species were classified as facing substantial levels of threat; although this was lessened for populations in protected habitats. Conservation is needed for cultivated collections as well as these wild populations by keeping alive existing knowledge and expertise in growing these species.

Submitted by Jos? Henrique Henrique (jose.neves@ufvjm.edu.br) on 2018-02-16T17:56:15Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) cristiane_coelho_moura.pdf: 2162662 bytes, checksum: b2941635e812ffa2d1ef219667e8df5f (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2018-03-09T19:32:06Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) cristiane_coelho_moura.pdf: 2162662 bytes, checksum: b2941635e812ffa2d1ef219667e8df5f (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-09T19:32:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) cristiane_coelho_moura.pdf: 2162662 bytes, checksum: b2941635e812ffa2d1ef219667e8df5f (MD5) Previous issue date: 2017 / Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM) / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES). / Anglo American / Com o intuito de gerar informa??es para produ??o de mudas direcionadas ? projetos de restaura??o de Matas de Galeria, objetivou-se neste estudo, descrever a morfologia e aspectos biom?tricos do fruto e da semente, as caracter?sticas morfofuncionais e desenvolvimento da pl?ntula, e obter a classifica??o fisiol?gica quanto a capacidade de armazenamento das sementes da Richeria grandis Vahl. Verificou-se tamb?m a influ?ncia de diferentes composi??es de substratos e n?veis de redu??o solar sob a emerg?ncia de pl?ntulas e crescimento de mudas via propaga??o sexuada e a viabilidade da t?cnica de miniestaquia na propaga??o assexuada da R. grandis, submetidas a diferentes concentra??es do regulador de crescimento ?cido indolbut?rico (AIB). A coleta de sementes ocorreu em 18 ?rvores-matrizes estabelecidas em Matas de Galeria inund?veis localizadas no Parque Estadual do Biribiri, Diamantina, MG e, todos os experimentos foram conduzidos em Viveiro Florestal e laborat?rio de Sementes pertencente ao Centro Integrado de Propaga??o de Esp?cies Florestais (CIPEF- UFVJM). A caracteriza??o morfol?gica e biom?trica de frutos e sementes se deu por observa??es a olho nu e mensura??es utilizando um paqu?metro universal. A fim de observar o comportamento fisiol?gico, sementes rec?m beneficiadas desta esp?cie foram armazenadas em sacos de papel ao ar livre, e foram submetidas a testes de germina??o e umidade (%) periodicamente. As caracter?sticas morfofuncionais foram observadas, a olho nu, mediante processo de desenvolvimento (desde a protrus?o radicular, emerg?ncia at? o surgimento do primeiro prot?filo) em laborat?rio e casa de vegeta??o. Utilizou-se tr?s composi??es de substratos e tr?s n?veis de sombreamento para testar o efeito destas combina??es sobre a qualidade de mudas jovens da R. grandis, para tal, foi mensurado ao longo de 210 dias, a altura, di?metro do coleto, n?mero de folhas, clorofila total e biomassas secas. Por fim, a base de estacas apicais provenientes de mudas jovens resgatadas em ambiente natural da R. grandis, foram emergidas em quatro concentra??es de AIB e avaliadas aos 90 dias, mensurando o incremento em altura e di?metro, sobreviv?ncia (%), enraizamento (%), calogenia (%) e brota??es (%). Ressalta-se que, para todos os experimentos, os princ?pios b?sicos da experimenta??o (repeti??o, casualiza??o e controle local) foram atendidos, utilizando diferentes delineamentos experimentais. Diferentes ferramentas para an?lise estat?stica tamb?m foram utilizadas para auxiliar na tomada de decis?o. O fruto da R. grandis ? simples, seco, do tipo c?psula, deiscente, com comprimento m?dio de 16,24 mm e largura m?dia de 8,57mm. A semente ? elipsoide com presen?a de sarcotesta, apresentando comprimento m?dio de 7,40mm e largura m?dia de 4,57 mm. A R. grandis apresenta sementes recalcitrantes, a emerg?ncia ? do tipo Fanero-ep?geo-foli?ceo, e o processo de desenvolvimento para a semente se tornar uma pl?ntula completa delonga por, no m?nimo, 50 dias. Os substratos compostos por diferentes propor??es de vermiculita, casca de arroz e Bioplant?, associado com os sombreamentos 30 e 50% foram respons?veis por promover mudas da R. grandis de melhor qualidade. A t?cnica de propaga??o vegetativa por miniestaquia ? vi?vel, uma vez que houve 100% de sobreviv?ncia e alta porcentagem de enraizamento at? para o tratamento sem adi??o do AIB. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncia Florestal, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2017. / The aim of this study was to describe the morphology and biometric aspects of the fruit and seed, the morphofunctional characteristics and development of the seedling, and to obtain the classification the storage capacity of the seeds of Richeria grandis Vahl. It was also verified the influence of different compositions of substrates and levels of solar reduction under the emergence of seedlings and growth of seedlings via sexual propagation and the viability of the technique of minicache in the asexual propagation of R. grandis, submitted to different concentrations of the regulator of indolebutyric acid (IBA) growth. Seed collection occurred in 18 matrix trees established in flooded Forest Mills located in Biribiri State Park, Diamantina, MG, and all experiments were conducted in Forest Nursery and Seed Laboratory belonging to the Integrated Center for the Propagation of Forest Species ( CIPEF-UFVJM). The morphological and biometric characterization of fruits and seeds was by naked eye observations and measurements using a universal caliper. In order to observe the physiological behavior, freshly harvested seeds of this species were stored in paper bags in the open air and germinated and tested (%) periodically. The morphofunctional characteristics were observed in the laboratory and in the greenhouse by means of a developmental process (from root protrusion, emergence until the first protophyte). Three compositions of substrates and three levels of shading were used to test the effect of these combinations on the quality of R. grandis young seedlings. The height, collection diameter, number of leaves , total chlorophyll and dry biomass. Finally, the base of apical cuttings from young saplings rescued in the natural environment of R. grandis, were emerged in four concentrations of IBA and evaluated at 90 days, measuring the increase in height and diameter, survival (%), rooting (% ), calogenia (%) and sprouts (%). It should be noted that for all experiments, the basic principles of experimentation (repetition, randomization and local control) were met using different experimental designs. Different tools for statistical analysis were also used to aid in decision making. The fruit of R. grandis is simple, dry, capsule type, dehiscent, with an average length of 16.24 mm and an average width of 8.57 mm. The seed is ellipsoid with presence of sarcotesta, presenting an average length of 7.40 mm and an average width of 4.57 mm. R. grandis presents recalcitrant seeds, the emergence is of the Fanero-epigene-foliaceous type, and the development process for the seed becomes a complete seedling delonged for at least 50 days. The substrates composed of different proportions of vermiculite, rice husk and Bioplant ?, associated with shading 30 and 50% were responsible for promoting R. grandis seedlings of better quality. The technique of vegetative propagation by minicutting is feasible, since there was a 100% survival and a high percentage of rooting even for the treatment without addition of AIB.

Modelos de ocorrência e abundância de espécies são importantes ferramentas para a elaboração de estrategias para a conservação da biodiversidade. Nestes artigos aplicamos, pela primeira vez, modelos de distribuição e abundância no entorno de uma Usina Hidroelétrica no Sul do Brasil, com o objetivo de mostrar possíveis aplicações destas técnicas no planejamento de ações de coleta e conservação, in situ e ex situ, destas espécies. Nossos objetivos secundários foram (i) modelar a ocorrência e abundância de plantas em um trecho da bacia do rio Pelotas e (ii) verificar o efeito da detectabilidade em modelos de ocorrência. Para tanto dividimos a tese em dois capítulos e cinco questões. No primeiro capítulo procuramos responder as seguintes questões: (1) existe relação entre a probabilidade de ocorrência e a abundância observada? (2) Modelos baseados na abundância são melhores para predizer a ocorrência de espécies do que modelos baseados apenas na ocorrência das espécies? No segundo capítulo, tentamos responder se (3) amostragens exaustivas, com presenças e ausências bem descritas, produzem modelos de ocorrência mais precisos? (4) Se a relação entre a ocorrência da espécie e as variáveis ambientais que descrevem sua distribuição é alterada de acordo com a detectabilidade? (5) Qual o impacto de falsos zeros na área ocupada estimada para a espécie? O trabalho foi realizado no entorno da UHE Barra Grande, erguida no rio Pelotas, entre os Estados de Santa Catarina e Rio Grande do Sul. Localizada na bacia do rio Pelotas, seu reservatório ocupa uma área de aproximadamente 90 km2 e seu entorno perfaz uma área aproximada de 4.600 km2, onde amostramos 388 parcelas georreferenciadas (10 x 50 m) distribuídas aleatoriamente. Em cada parcela contamos o número de indivíduos de nove espécies arborescente com altura ≥ 1,5 m. No primeiro artigo, modelamos, utilizando modelos lineares generalizados (GLM), a distribuição e abundância das nove espécies estudadas em relação a 15 variáveis ambientais, e demonstramos que modelos de ocorrência são mais precisos do que modelos de abundância. Demonstramos também que a probabilidade de ocorrência é positivamente correlacionada com a abundância observada, o que abre a possibilidade de utilizarmos a probabilidade de ocorrência como um indicador da abundância das espécies. No segundo capítulo, verificamos o impacto de falhas de detecção em modelos de distribuição de espécies, utilizando como espécie modelo A. angustifolia. Simulamos o impacto de falsos zeros na precisão dos modelos, na seleção das variáveis resposta (variáveis ambientais) e nas estimativas de área ocupada pela espécie. A redução da detectabilidade ocasionou alterações tanto na precisão dos modelos quanto na área estimada de ocorrência e nas variáveis ambientais que explicam a ocorrência de A. angustifolia. A área ocupada não apresentou padrão bem definido, porém mostrou tendência de elevação de acordo com a diminuição da detectabilidade, elevando com isso o erro de comissão dos modelos. A precisão dos modelos (AUC e correlação entre probabilidade de ocorrência e abundância observada), apresentou queda em relação ao redução da detectabilidade, enquanto apenas uma variável ambiental foi incluída em todos os modelos (pH do solo). Existe um grande possibilidade de uso destas técnicas como informação básica para planos de conservação, monitoramento e manejo da biodiversidade no entorno de empreendimentos hidroelétricos, porém, para que possamos tirar inferências fortes sobre as espécies e ecossistemas em questão, devemos observar sempre a necessidade de levar em conta os impactos da detecção imperfeita das espécies. / Species occurrence and abundance models are important tools in the development of biodiversity conservation strategies. This study presents, for the first time, the application of distribution and abundance models in the environment surrounding a hydropower dam in southern Brazil. The aim is to demonstrate the possible application of these techniques in planning collection and conservation strategies of the species inhabiting the area, in situ and ex situ. We also aimed at (i) modeling the occurrence and abundance of plants in a section of the Pelotas River basin and (ii) verifying the effect of detectability in occurrence models. This thesis was therefore divided into two chapters and five questions. The first chapter is an attempt to answer the following questions: (1) Is there a relationship between occurrence probability and abundance? (2) Are models based on abundance better to predict the occurrence of species as compared to models that utilize only species occurrence? The second chapter addresses the questions: (3) Do exhaustive sampling procedures, with well-sampled presences and absences, lead to more accurate occurrence models? (4) Does detectability influence the relationship between species occurrence and environmental variables? (5) What is the impact of false zeros in the estimated area occupied by one given species? This study was conducted in the area surrounding the hydropower plant “Barra Grande”, in the Pelotas River, on the border of the Rio Grande do Sul and Santa Catarina states. Located in the Pelotas River basin, the dam occupies an area of approximately 90 km². The surrounding area accounts for 4,600 km², where 388 plots with 10 x 50 m were randomly distributed and georeferenced. In each plot, individuals of nine selected tree species taller than 1.5 m were surveyed. In the first paper, we modeled the distribution and abundance of the species studied using generalized linear models (GLMs), utilizing 15 environmental variables. Occurrence models were proved to be more accurate than abundance models. The positive correlation between occurrence probability and observed abundance was also demonstrated, which opens the possibility to utilize occurrence probability as an indicator of species abundance. The second chapter reports the impact of failures in detection in species distribution models, using A. angustifolia as model species. We simulated the impact of false zeros in model accuracy, in the selection of response variables (environmental variables) and in estimates of the area occupied by A. angustifolia. The decrease in detectability caused changes in both model accuracy and in the environmental variables that explain the occurrence of A. angustifolia. The area occupied did not have a well-defined pattern, though it showed a trend towards elevation, in accordance with the decrease in detectability, thus raising the commission error in the model. The accuracy of models (AUC and correlation between occurrence probability and observed abundance) decreased with the decrease in detectability, while only one environmental variable was included in all models (soil pH). These techniques offer great potential in the collection of essential information in biodiversity conservation, monitoring and managements strategies in hydropower projects. However, robust inferences about species and ecosystems in question can only be drawn considering the need to evaluate the impact caused by defective species detection.

Modelos de ocorrência e abundância de espécies são importantes ferramentas para a elaboração de estrategias para a conservação da biodiversidade. Nestes artigos aplicamos, pela primeira vez, modelos de distribuição e abundância no entorno de uma Usina Hidroelétrica no Sul do Brasil, com o objetivo de mostrar possíveis aplicações destas técnicas no planejamento de ações de coleta e conservação, in situ e ex situ, destas espécies. Nossos objetivos secundários foram (i) modelar a ocorrência e abundância de plantas em um trecho da bacia do rio Pelotas e (ii) verificar o efeito da detectabilidade em modelos de ocorrência. Para tanto dividimos a tese em dois capítulos e cinco questões. No primeiro capítulo procuramos responder as seguintes questões: (1) existe relação entre a probabilidade de ocorrência e a abundância observada? (2) Modelos baseados na abundância são melhores para predizer a ocorrência de espécies do que modelos baseados apenas na ocorrência das espécies? No segundo capítulo, tentamos responder se (3) amostragens exaustivas, com presenças e ausências bem descritas, produzem modelos de ocorrência mais precisos? (4) Se a relação entre a ocorrência da espécie e as variáveis ambientais que descrevem sua distribuição é alterada de acordo com a detectabilidade? (5) Qual o impacto de falsos zeros na área ocupada estimada para a espécie? O trabalho foi realizado no entorno da UHE Barra Grande, erguida no rio Pelotas, entre os Estados de Santa Catarina e Rio Grande do Sul. Localizada na bacia do rio Pelotas, seu reservatório ocupa uma área de aproximadamente 90 km2 e seu entorno perfaz uma área aproximada de 4.600 km2, onde amostramos 388 parcelas georreferenciadas (10 x 50 m) distribuídas aleatoriamente. Em cada parcela contamos o número de indivíduos de nove espécies arborescente com altura ≥ 1,5 m. No primeiro artigo, modelamos, utilizando modelos lineares generalizados (GLM), a distribuição e abundância das nove espécies estudadas em relação a 15 variáveis ambientais, e demonstramos que modelos de ocorrência são mais precisos do que modelos de abundância. Demonstramos também que a probabilidade de ocorrência é positivamente correlacionada com a abundância observada, o que abre a possibilidade de utilizarmos a probabilidade de ocorrência como um indicador da abundância das espécies. No segundo capítulo, verificamos o impacto de falhas de detecção em modelos de distribuição de espécies, utilizando como espécie modelo A. angustifolia. Simulamos o impacto de falsos zeros na precisão dos modelos, na seleção das variáveis resposta (variáveis ambientais) e nas estimativas de área ocupada pela espécie. A redução da detectabilidade ocasionou alterações tanto na precisão dos modelos quanto na área estimada de ocorrência e nas variáveis ambientais que explicam a ocorrência de A. angustifolia. A área ocupada não apresentou padrão bem definido, porém mostrou tendência de elevação de acordo com a diminuição da detectabilidade, elevando com isso o erro de comissão dos modelos. A precisão dos modelos (AUC e correlação entre probabilidade de ocorrência e abundância observada), apresentou queda em relação ao redução da detectabilidade, enquanto apenas uma variável ambiental foi incluída em todos os modelos (pH do solo). Existe um grande possibilidade de uso destas técnicas como informação básica para planos de conservação, monitoramento e manejo da biodiversidade no entorno de empreendimentos hidroelétricos, porém, para que possamos tirar inferências fortes sobre as espécies e ecossistemas em questão, devemos observar sempre a necessidade de levar em conta os impactos da detecção imperfeita das espécies. / Species occurrence and abundance models are important tools in the development of biodiversity conservation strategies. This study presents, for the first time, the application of distribution and abundance models in the environment surrounding a hydropower dam in southern Brazil. The aim is to demonstrate the possible application of these techniques in planning collection and conservation strategies of the species inhabiting the area, in situ and ex situ. We also aimed at (i) modeling the occurrence and abundance of plants in a section of the Pelotas River basin and (ii) verifying the effect of detectability in occurrence models. This thesis was therefore divided into two chapters and five questions. The first chapter is an attempt to answer the following questions: (1) Is there a relationship between occurrence probability and abundance? (2) Are models based on abundance better to predict the occurrence of species as compared to models that utilize only species occurrence? The second chapter addresses the questions: (3) Do exhaustive sampling procedures, with well-sampled presences and absences, lead to more accurate occurrence models? (4) Does detectability influence the relationship between species occurrence and environmental variables? (5) What is the impact of false zeros in the estimated area occupied by one given species? This study was conducted in the area surrounding the hydropower plant “Barra Grande”, in the Pelotas River, on the border of the Rio Grande do Sul and Santa Catarina states. Located in the Pelotas River basin, the dam occupies an area of approximately 90 km². The surrounding area accounts for 4,600 km², where 388 plots with 10 x 50 m were randomly distributed and georeferenced. In each plot, individuals of nine selected tree species taller than 1.5 m were surveyed. In the first paper, we modeled the distribution and abundance of the species studied using generalized linear models (GLMs), utilizing 15 environmental variables. Occurrence models were proved to be more accurate than abundance models. The positive correlation between occurrence probability and observed abundance was also demonstrated, which opens the possibility to utilize occurrence probability as an indicator of species abundance. The second chapter reports the impact of failures in detection in species distribution models, using A. angustifolia as model species. We simulated the impact of false zeros in model accuracy, in the selection of response variables (environmental variables) and in estimates of the area occupied by A. angustifolia. The decrease in detectability caused changes in both model accuracy and in the environmental variables that explain the occurrence of A. angustifolia. The area occupied did not have a well-defined pattern, though it showed a trend towards elevation, in accordance with the decrease in detectability, thus raising the commission error in the model. The accuracy of models (AUC and correlation between occurrence probability and observed abundance) decreased with the decrease in detectability, while only one environmental variable was included in all models (soil pH). These techniques offer great potential in the collection of essential information in biodiversity conservation, monitoring and managements strategies in hydropower projects. However, robust inferences about species and ecosystems in question can only be drawn considering the need to evaluate the impact caused by defective species detection.

Modelos de ocorrência e abundância de espécies são importantes ferramentas para a elaboração de estrategias para a conservação da biodiversidade. Nestes artigos aplicamos, pela primeira vez, modelos de distribuição e abundância no entorno de uma Usina Hidroelétrica no Sul do Brasil, com o objetivo de mostrar possíveis aplicações destas técnicas no planejamento de ações de coleta e conservação, in situ e ex situ, destas espécies. Nossos objetivos secundários foram (i) modelar a ocorrência e abundância de plantas em um trecho da bacia do rio Pelotas e (ii) verificar o efeito da detectabilidade em modelos de ocorrência. Para tanto dividimos a tese em dois capítulos e cinco questões. No primeiro capítulo procuramos responder as seguintes questões: (1) existe relação entre a probabilidade de ocorrência e a abundância observada? (2) Modelos baseados na abundância são melhores para predizer a ocorrência de espécies do que modelos baseados apenas na ocorrência das espécies? No segundo capítulo, tentamos responder se (3) amostragens exaustivas, com presenças e ausências bem descritas, produzem modelos de ocorrência mais precisos? (4) Se a relação entre a ocorrência da espécie e as variáveis ambientais que descrevem sua distribuição é alterada de acordo com a detectabilidade? (5) Qual o impacto de falsos zeros na área ocupada estimada para a espécie? O trabalho foi realizado no entorno da UHE Barra Grande, erguida no rio Pelotas, entre os Estados de Santa Catarina e Rio Grande do Sul. Localizada na bacia do rio Pelotas, seu reservatório ocupa uma área de aproximadamente 90 km2 e seu entorno perfaz uma área aproximada de 4.600 km2, onde amostramos 388 parcelas georreferenciadas (10 x 50 m) distribuídas aleatoriamente. Em cada parcela contamos o número de indivíduos de nove espécies arborescente com altura ≥ 1,5 m. No primeiro artigo, modelamos, utilizando modelos lineares generalizados (GLM), a distribuição e abundância das nove espécies estudadas em relação a 15 variáveis ambientais, e demonstramos que modelos de ocorrência são mais precisos do que modelos de abundância. Demonstramos também que a probabilidade de ocorrência é positivamente correlacionada com a abundância observada, o que abre a possibilidade de utilizarmos a probabilidade de ocorrência como um indicador da abundância das espécies. No segundo capítulo, verificamos o impacto de falhas de detecção em modelos de distribuição de espécies, utilizando como espécie modelo A. angustifolia. Simulamos o impacto de falsos zeros na precisão dos modelos, na seleção das variáveis resposta (variáveis ambientais) e nas estimativas de área ocupada pela espécie. A redução da detectabilidade ocasionou alterações tanto na precisão dos modelos quanto na área estimada de ocorrência e nas variáveis ambientais que explicam a ocorrência de A. angustifolia. A área ocupada não apresentou padrão bem definido, porém mostrou tendência de elevação de acordo com a diminuição da detectabilidade, elevando com isso o erro de comissão dos modelos. A precisão dos modelos (AUC e correlação entre probabilidade de ocorrência e abundância observada), apresentou queda em relação ao redução da detectabilidade, enquanto apenas uma variável ambiental foi incluída em todos os modelos (pH do solo). Existe um grande possibilidade de uso destas técnicas como informação básica para planos de conservação, monitoramento e manejo da biodiversidade no entorno de empreendimentos hidroelétricos, porém, para que possamos tirar inferências fortes sobre as espécies e ecossistemas em questão, devemos observar sempre a necessidade de levar em conta os impactos da detecção imperfeita das espécies. / Species occurrence and abundance models are important tools in the development of biodiversity conservation strategies. This study presents, for the first time, the application of distribution and abundance models in the environment surrounding a hydropower dam in southern Brazil. The aim is to demonstrate the possible application of these techniques in planning collection and conservation strategies of the species inhabiting the area, in situ and ex situ. We also aimed at (i) modeling the occurrence and abundance of plants in a section of the Pelotas River basin and (ii) verifying the effect of detectability in occurrence models. This thesis was therefore divided into two chapters and five questions. The first chapter is an attempt to answer the following questions: (1) Is there a relationship between occurrence probability and abundance? (2) Are models based on abundance better to predict the occurrence of species as compared to models that utilize only species occurrence? The second chapter addresses the questions: (3) Do exhaustive sampling procedures, with well-sampled presences and absences, lead to more accurate occurrence models? (4) Does detectability influence the relationship between species occurrence and environmental variables? (5) What is the impact of false zeros in the estimated area occupied by one given species? This study was conducted in the area surrounding the hydropower plant “Barra Grande”, in the Pelotas River, on the border of the Rio Grande do Sul and Santa Catarina states. Located in the Pelotas River basin, the dam occupies an area of approximately 90 km². The surrounding area accounts for 4,600 km², where 388 plots with 10 x 50 m were randomly distributed and georeferenced. In each plot, individuals of nine selected tree species taller than 1.5 m were surveyed. In the first paper, we modeled the distribution and abundance of the species studied using generalized linear models (GLMs), utilizing 15 environmental variables. Occurrence models were proved to be more accurate than abundance models. The positive correlation between occurrence probability and observed abundance was also demonstrated, which opens the possibility to utilize occurrence probability as an indicator of species abundance. The second chapter reports the impact of failures in detection in species distribution models, using A. angustifolia as model species. We simulated the impact of false zeros in model accuracy, in the selection of response variables (environmental variables) and in estimates of the area occupied by A. angustifolia. The decrease in detectability caused changes in both model accuracy and in the environmental variables that explain the occurrence of A. angustifolia. The area occupied did not have a well-defined pattern, though it showed a trend towards elevation, in accordance with the decrease in detectability, thus raising the commission error in the model. The accuracy of models (AUC and correlation between occurrence probability and observed abundance) decreased with the decrease in detectability, while only one environmental variable was included in all models (soil pH). These techniques offer great potential in the collection of essential information in biodiversity conservation, monitoring and managements strategies in hydropower projects. However, robust inferences about species and ecosystems in question can only be drawn considering the need to evaluate the impact caused by defective species detection.