Orientador: Katia Cristina Kupper / Banca: Ben-Hur Mattiuz / Banca: Sérgio Florentino Pascholati / Resumo: Dentre as principais doenças que ocorrem na pós-colheita em citros destacam-se o bolor verde, bolor azul e a podridão azeda, ocasionadas pelos fungos Penicillium digitatum, P. italicum e Geotrichum candidum, respectivamente. Uma alternativa para o controle destas doenças se dá por meio da utilização de leveduras. Sendo assim, objetivou-se no presente estudo isolar, selecionar e identificar leveduras de solos, folhas, flores e frutos de citros de diferentes regiões produtoras do estado de São Paulo, com potencial de aplicação como agentes de biocontrole aos fitopatógenos de pós-colheita. Foram obtidos 95 isolados de leveduras de 14 municípios do estado de São Paulo, sendo o filoplano a fonte de 90,5% dos isolados. Nos ensaios in vitro realizados com G. candidum, o ACBL-77 proporcionou o maior valor de inibição do crescimento micelial do fungo (35%) e os isolados ACBL-68 e ACB-K1 (Saccharomyces cerevisiae), os que proporcionaram maiores valores de inibições na germinação de conídios, 83 e 82%, respectivamente. Quando se avaliou o controle da podridão azeda em frutos de Laranja Pêra, três isolados (ACBL-23, ACBL-44 e ACBL-77) foram os mais eficientes no controle da doença de maneira preventiva e curativa. Em ensaios realizados in vitro com P. digitatum, cinco isolados de levedura (ACBL-76, ACBL-82, ACBL-84 e ACBL-87) proporcionaram valores de inibições do crescimento da colônia do fungo acima de 80%. Entretanto, in vivo somente dois isolados (ACBL-82 e ACBL-86) foram capazes de controlar o progresso e também a incidência da doença, quando utilizados preventivamente. Na avaliação da inibição do crescimento micelial in vitro do P. italicum, oito isolados proporcionam valores de inibições acima de 80%, sendo que o ACBL-04 proporcionou 100% de controle. Nos ensaios in vivo, quatro isolados (ACBL-04, ACBL-05, ACBL-08 e ACBL-11) foram eficientes na diminuição ... / Abstract: Among the major diseases that occur in citrus post-harvest stand out green mold, blue mold and sour rot, caused by Penicillium digitatum, Penicillium italicum and Geotrichum candidum, respectively. An alternative for the control of these diseases is through the use of yeasts. Thus, the aim of the present study was to isolate, select and identify yeasts from soil, leaves, flowers and fruits of different citrus producing regions of the São Paulo State, with potential application as biocontrol agents for postharvest pathogens. Ninety-five yeast isolates were obtained from 14 counties in the São Paulo State. The phylloplane was the source of 90.5% of the isolates. Tests conducted in vitro, with G. candidum showed that ACBL-77 presented the highest inhibition of mycelial growth (35%) and both strains ACBL-68 and ACB-K1 (Saccharomyces cerevisiae), provided the highest values of inhibitions of conidia germination, 83 and 82%, respectively. When the control of sour rot in fruits of 'Pera' sweet Orange was evaluated, three isolates (ACBL-23, ACBL-44 and ACBL-77) were the most effective in controlling the disease in a preventive and curative way. In in vitro assays with P. digitatum, five yeast strains (ACBL-76, ACBL-82, ACBL-84 and ACBL-87) inhibited the mycelial growth with values above 80%. However, when the ability of yeast to control green mold was evaluated on orange fruits, only two isolates (ACBL-82 and ACBL-86) were able to decrease the progress and also the incidence of the disease when used preventively. Eight isolates inhibited the mycelial growth of P. italicum above 80%, and the isolate ACBL-04 provided 100% of inhibition. In in vivo assays, four isolates (ACBL-04, ACBL-05, ACBL-08 and ACBL-11) were effective in reducing the progress of blue mold as well as in inhibiting the incidence of disease when applied preventively / Mestre

Resumo: Os ecossistemas costeiros são considerados de grande importância sócio-econômica, política e cultural, pois possuem alta produtividade que suporta uma ampla gama de atividades econômicas e de lazer. Possuem elevado valor paisagístico, atraindo inúmeros habitantes e, assim, contribuem ao desenvolvimento das cidades litorâneas. Além disso, oferecem suporte às comunidades biológicas com manutenção de muitas espécies residentes ou que utilizam a zona costeira como berçário para reprodução, beneficiando a biodiversidade como um todo. Sendo uma região que sofre grande pressão antrópica, a Zona Costeira está sujeita a inúmeros impactos causados por atividades humanas, tais como as portuárias, industriais e de exploração de petróleo. Essas geram impactos por lançarem diversos poluentes, entre eles os hidrocarbonetos e metais que podem ter efeito deletério na biota local. No ambiente marinho, o compartimento mais afetado em relação a essa contaminação é o sedimento em função dos derivados de petróleo que atingem as águas costeiras possuírem maior densidade, nele se depositando. Atualmente existe uma grande preocupação com os impactos gerados por atividades antrópicas em ecossistemas litorâneos e muitos estudos têm sido feitos em busca de alternativas para avaliar e remediar tais impactos. Uma delas consiste no uso de micro-organismos tanto como indicadores da contaminação por poluentes quanto para a diminuição da contaminação, processo popularmente conhecido como biorremediação. Deste modo, o presente estudo teve como objetivos: 1) avaliar o efeito da presença de hidrocarbonetos na abundância de bactérias heterotróficas, cianobactérias e leveduras em sedimentos e águas estuarinas de duas regiões distintas, dos Estuários de Santos e do Rio Itanhaém, tanto no que diz respeito às características ambientais... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Coastal ecosystems have great socio-economic, political and cultural importance, as well as high productivity which support a wide range of economic activities and leisure. They have high landscape value thus attracting numerous people contributing to the development of coastal cities. Moreover, its high productivity supports biological communities and maintenance of many species living or using the coastal zone as a nursery for breeding, benefiting whole biodiversity. Being a region that suffers high anthropogenic pressure, the Coastal Zone is subject to numerous impacts caused by human activities such as port activities, industrial and oil exploration. These generate impacts on the environment by launching several pollutants, including hydrocarbons and metals that can have deleterious effects on local biota. The most affected marine environment is the sediment due to oil products that reach coastal waters have a higher density and end up being deposited in sediments. Nowadays there is great concern about the impacts generated by human activities on coastal ecosystems and many studies have been done in search of alternatives to evaluate and remedy such impacts. One alternative is the use of micro-organisms both as indicators of contamination by pollutants and for reduction of contamination, a process popularly known as bioremediation. Thus, this study aimed to evaluate the effect of the presence of hydrocarbons in the abundance of heterotrophic bacteria, cyanobacteria and yeast on sediment and estuarine waters of two distinct regions: The Estuaries of Santos and Itanhaém River are located in the metropolitan area of Santos, Sao Paulo State; and to isolate microorganisms with emphasis on yeasts, for further evaluation of its potential both as bioindicators of hydrocarbon contamination and bioremediation of estuarine sediments in order to contribute... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Fernando Carlos Pagnocca / Coorientador: Ana Júlia Fernandes Cardoso de Oliveira / Banca: Hilda de Souza Lima Mesquita / Banca: Marcelo Antonio Amaro Pinheiro / Mestre

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina. Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia. / Made available in DSpace on 2012-10-22T16:56:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 231338.pdf: 2306929 bytes, checksum: d6024b930edc5b3c0a8fcc17e42eedfd (MD5) / In the present report we have analyzed the kinetics of growth, sugar consumption and ethanol production on synthetic or rich medium containing maltose or maltotriose by a S. cerevisiae strain with the AGT1 permease as its unique a-glucoside transporter. Our results show that in order to efficiently consume and ferment these sugars from the medium it is required constitutive expression of the transporter gene, which can be achieved by the presence of constitutive MAL (e.g. MAL63c) regulator. Besides constitutive expression of the permease, growth on rich medium also increased the fermentation performance of the cells. While a good correlation between the activity the AGT1 transporter and the fermentation performance of the cells was observed, the same was not true for the activity of the intracellular a-glucosidase. This AGT1-containing yeast strain ferments maltotriose more efficiently than maltose due to higher expression of the AGT1 permease during growth on maltotriose, leading to higher uptake rates of this sugar into the cells. Our results also indicate that during maltotriose fermentation by yeasts with constitutive expression of the AGT1 permease transport across the plasma membrane may no longer limit sugar utilization by S. cerevisiae cells.

Orientador: Márcia Justino Rossini Mutton / Banca: Flávia Cecílio Ribeiro Bregagnoli / Banca: Francisco Vicente Gaiotto Cleto / Resumo: As indústrias sucroenergéticas têm como preocupação o controle de contaminantes da fermentação, responsáveis por afetar a viabilidade da levedura, provocando diversos transtornos no processo, comprometendo a eficiência fermentativa e o rendimento industrial. Dentre as alternativas para o controle das contaminações, destacam-se o uso de antimicrobianos sintéticos. Sua utilização continua pode favorecer o desenvolvimento de cepas resistentes, contribuindo para o incremento do custo de produção, além da possibilidade de incorporação de resíduos no produto final. Objetivou-se avaliar o efeito do biocida convencional (monensina sódica) e biocidas naturais preparados à base de própolis (Extrato Hidroalcoólico de Própolis - EHP e Extrato Oleoso de Própolis- EOP) sobre a fisiologia das leveduras, o controle dos contaminantes do processo fermentativo e composição do destilado. O delineamento experimental utilizado foi o Inteiramente Casualizado com parcelas subdivididas, com 4 repetições. Os Tratamentos Principais foram: Testemunha, EOP, EHP e monensina sódica (Kamoran WP). Os Tratamentos Secundários constituíram-se nos 10 ciclos fermentativos. Avaliaram-se as características químico-tecnológicas do caldo, mosto e vinho, parâmetros microbiológicos das leveduras e composição do destilado obtido. Os resultados obtidos demonstraram que os biocidas avaliados apresentaram efeito similar, sendo efetivos no controle dos contaminantes da fermentação, não afetando negativamente suas características fisiológicas. Não afetaram a composição a composição do destilado final obtido / Abstract: The control of fermentation contaminants is one of the sugar mills concerns. The fermentation contaminants are responsible to affect the yeast viability, generating several overturns to the process, compromising the fermentative efficiency as well the industrial yield. Among the alternatives to control contamination, the use of synthetic antimicrobials can be highlighted. Its progressed use may favor the development of resistant strains, contributing in production cost improving, besides the possibility of residues incorporation into the final product. This work aimed evaluate the effect of conventional biocides (sodic monensin) and natural ones based on propolis (Propolis Hydroalcoholic Extract - EHP and Propolis Oily Extract - EOP) under the yeasts physiology, the fermentative process contaminants control, and the distilled composition. The experimental design used was the split-plot with four replications. The main treatments were: Control, EOH, EHP, and sodic monensin (Kamoran WP). The secondary treatments were the 10 fermentative cycles. The evaluated characteristics were: juice, must, and wine chemical-technical characteristics, yeasts microbiologic parameters, and the distillated obtained composition. The results obtained showed that the evaluated biocides presented similar effect, being effectives to control the fermentation contaminants, not affecting negatively its physiologic characteristics. They did not affect the composition of the distilled obtained / Mestre

Orientador: Gustavo Rezende Siqueira / Coorientador: Ricardo Andrade Reis / Banca: Izabelle Auxiliadora Molina de Almeida Teixeira / Banca: Wignez Henrique / Banca: Odilon Gomes Pereira / Banca: João Luiz Pratti Daniel / Resumo: Objetivou-se determinar o tamanho médio de partícula ideal para a ensilagem da cana-de-açúcar e o uso na alimentação animal. Para isso, foram realizados dois experimentos. No experimento 1, silos experimentais foram utilizados para avaliar o perfil fermentativo (0, 3, 7, 14, 28 e 56 dias de armazenamento) das silagens com quatro diferentes tamanhos de partículas, que compuseram os seguintes tratamentos: T5: silagem de cana-de-açúcar picada a 5 mm; T10: silagem de cana-de-açúcar picada a 10 mm; T15: silagem de cana-de-açúcar picada a 15 mm e T20: silagem de cana-de-açúcar picada a 20 mm. Nas silagens com 56 dias de armazenamento foram determinadas as perdas de matéria seca e realizadas análises químicas, além da estabilidade aeróbia, por 12 dias. Com 4, 8 e 12 dias de exposição aeróbia, o crescimento da população de leveduras e os valores de pH foram determinados. Esse experimento foi realizado por dois anos consecutivos, sendo as mesmas variáveis analisadas. No segundo experimento, avaliaram-se silagens de cana-de-açúcar com os mesmo tamanhos de partículas, armazenadas em silos tipo superfície, e utilizadas em dietas para bovinos de corte em confinamento. Nas avaliações de desempenho produtivo, consumo dos nutrientes, comportamento ingestivo e índice de seleção foram utilizados 40 bovinos da raça Nelore, com 20 meses de idade e peso corporal inicial de 395 ± 23 kg, confinados por 99 dias. Para o estudo de parâmetros ruminais e taxa de passagem da fibra, foram utilizados 8 bovinos da raça Nelore, com 24 meses de idade e 470 ± 34 kg, com cânula ruminal. As dietas com diferentes tamanhos de partículas das silagens afetaram o consumo dos nutrientes, exceto para a fibra em detergente neutro, além dos tempos desprendidos com ruminação e mastigação pelos animais, promovendo consumos preferenciais das frações das dietas, mas não afetou o ganho de peso diário dos animais, com ganho médio de ... / Abstract: This study aimed to determine the ideal average particle size for sugarcane silage and its use in animal feed. For this, two experiments were conducted. In experiment 1, experimental silos were used to evaluate the fermentative profile (0, 3, 7, 14, 28 and 56 days) of the silage with four different particle sizes, composing the following treatments: T5: sugarcane silage chopped to 5 mm; T10: sugarcane silage chopped to 10 mm; T15: sugarcane silage chopped to 15 mm and T20: sugarcane silage chopped to 20 mm. In the silages with 56 days of storage, were determined the dry matter losses and evaluated chemical composition and aerobic stability for 12 days. The yeast population and pH values were determined in 4, 8 and 12 days of air exposure. This experiment was carried out for two consecutive years, with the same variables. In the second experiment, sugarcane silages with the same particle size were stored in silos type surface, and used in diets for beef cattle feedlot. For evaluation of productive performance, nutrients intake, feeding behavior and selection index, were used 40 Nellore young bulls with 20 months of age and 395 ± 23 kg of initial body weight, confined for 99 days. For the study of ruminal fermentation and passage rate of the fiber, were used 8 Nellore young bulls with 24 months of age and 470 ± 34 kg of body weight, with ruminal cannula. The diets with different particle sizes of silages affected the nutrients intake, except for the neutral detergent fiber (NDF), besides the rumination and chewing times by animals, promoting preferential intake of diets fractions, but there was not effect for average daily gain, with an average gain of 1.49 kg.dia-1. Different particle sizes influence to fermentation characteristics and chemical composition of sugarcane silage, but this factor is not the only defining the silage quality. Higher particles size induces the diet selection by animals, with preferential intake of smaller ... / Doutor

Orientador: Margarete Teresa Gottardo de Almeida / Coorientador: / Banca: Ana Marisa Fusco Almeida / Banca: Debora Aparecida Pires de Campos Zuccari / Resumo: Os homens e animais possuem uma relação milenar, em que o grupo das aves, em especial, é utilizado amplamente para diversas finalidades, tais como alimentação e companhia. As aves são retratadas como disseminadoras de patógenos ao ambiente, entretanto, o conhecimento a respeito deste papel a determinadas espécies aviárias, intimamente correlacionadas ao ser humano, são um tanto escassos. O presente trabalho teve como objetivos isolar, identificar e caracterizar o fenótipo e o genótipo de leveduras obtidas de fezes de cinco aves de cativeiro: galinha (Gallus gallus domesticus), Pássaro-do-amor (Agapornis spp), Periquito-australiano (Melopsittacus undulatus) calopsita (Nymphicus hollandicus) e canário (Serinus canaria domesticus). Para tanto, foram avaliadas 247 amostras de fezes destas cinco espécies aviárias, provenientes de sete cidades localizadas na região noroeste do estado de São Paulo, Sul de Minas Gerais e sudoeste do Mato Grosso do Sul. A coleta foi realizada com auxílio de espátulas estéreis. O material foi semeado em ágar Sabouraud dextrose e ágar semente de Níger, como titulações. A identificação das espécies baseou-se nas características macro e micromorfólogicas, e bioquímicas. Ademais, todos os isolados identificados, foram submetidos ao teste de antifungigrama por disco-difusão (CLSI, documento M44-A), frente a anfotericina B, cetoconazol, fluconazol e itraconazol. Aqueles que apresentavam padrões de suscetibilidade dose-dependente ou resistente, foram submetidos ao teste de microdiluição em caldo (CLSI, documento M27-A3). A ocorrência de leveduras se deu em 89% das amostras, variando de 77,5% a 94,0% independente da ave estudada. Foram obtidos 318 isolados, pertencentes a 29 espécies diferentes. O gênero prevalente foi Candida com 183 isolados (57,5%), seguido de Cryptococcus com 45 (14,2%), Rhodotorula com 38 (11,9%) e Trichosporon com 36 (11,3%); os demais gêneros totalizaram 16 isolados... / Abstract: Men and animals have an age-old relationship, where the group of birds, in particular, is widely used for various purposes, such as food and company.Men and animals have an age-old relationship, where the group of birds in particular is widely used for various purposes, such as food and company. The birds are portrayed as disseminators of pathogens to the environment, however, knowledge about this role certain avian species, closely correlated to humans, are somewhat scarce. This study aimed to isolate, identify and characterize the phenotype and the genotype obtained yeast stool five captive birds: chicken (Gallus gallus domesticus), Love bird (Agapornis spp), Budgerigar (Melopsittacus undulatus) cockatiel (Nymphicus hollandicus) and canary (Serinus canaria domesticus). Therefore, we evaluated 247 stool samples of these five avian species from seven cities located in the northwest from State of São Paulo, southern of Minas Gerais and southwestern Mato Grosso do Sul. The collection was performed using sterile spatulas. The material was seeded in Sabouraud dextrose agar and seed Niger agar, with titrations. The identification of species was based on biochemical and macro and micromorphological characteristics. In addition, all isolates identified were submitted to antifungal susceptibility testing by disk diffusion (CLSI, M44-A), compared to amphotericin B, ketoconazole, fluaconazole and itraconazole. The occurrence of yeasts occurred in 89% of samples, ranging from 77.5% to 94.0% of the studied independently bird. There were obtained 318 isolates belonging to 29 different species. There were obtained 318 isolates belonging to 29 different species. The prevalent genus isolated was Candida with 183 (57.5%), followed by Cryptococcus with 45 (14.2%), Rhodotorula with 38 (11.9%) and Trichosporon with 36 (11.3%); other genres totaled 16 isolates (5.0%). Note that, in the number of fungal species isolated, C. albicans, C. guilliermondii, C. ... / Mestre

Orientador: Crispin Humberto Garcia Cruz / Banca: Alexandre Rodrigo Coelho / Banca: Elisabete Yurie Sataque Ono / Banca: Vanildo Luiz Del Bianchi / Banca: Eleni Gomes / Resumo: A patulina, toxina com potencial carcinogênico, mutagênico e teratogênico produzida por Penicillium spp., Aspergillus spp. e Byssoclamys spp., pode ser encontrada em maçãs, sucos comerciais e outros produtos não fermentados constituindo-se num problema neste setor agroindustrial. Em bebidas fermentadas, porém, não é detectável mesmo que a matéria-prima esteja visivelmente contaminada. O presente trabalho visou quantificar a patulina tanto no tecido deteriorado de maçãs in natura quanto na parte sadia ao redor da lesão, monitorar a degradação no processo fermentativo típico utilizando Saccharomyces cerevisiae e degradar a toxina presente em produtos derivados de maçã pela ação do composto bioativo produzido pela levedura. A micotoxina foi quantificada por CLAE em sistema isocrático de fase reversa e detector UV a 275 nm. O grau de recuperação alcançado foi de 86,24% e os limites de detecção e de quantificação foram 4,3 µg/L e 8,6 µg/L, respectivamente. Foram analisados 35 frutos de maçã in natura cultivar Fuji, tendo sido constatada a presença de patulina em 32 amostras, em concentrações que variaram de 1,01 a 120,4 mg/Kg de tecido na porção deteriorada e de 0,02 a 5,02 mg/Kg de tecido, na sadia. Para avaliação da cinética de degradação de patulina, suco de maçã contendo 5,0 µg de patulina/mL foi inoculado com 0,25g de células de levedura seca ativa/L, sendo observada uma maior redução no teor de toxina de 81,6% nas primeiras 48 horas de fermentação. Este tempo foi utilizado como parâmetro para obtenção do extrato bruto contendo o composto bioativo capaz de degradar a toxina. Na cinética de degradação de patulina pelo extrato bruto estéril inoculado com 3,0 µg de patulina/mL, foi obtida a maior taxa de degradação (50%) da toxina nas primeiras 48 horas, seguido de uma degradação mais lenta de apenas 5,7% nas 48 horas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Patulin, a toxin with potential carcinogenic, mutagenic and teratogenic effects produced by Penicillium sp., Aspergillus sp. and Byssoclamys sp., can be found in apples, juices and other commercial non-fermented products making up a problem in the agribusiness sector. However, patulin is not detectable in fermented beverages even if the raw material is visibly contaminated. This paper aimed to quantify patulin in both the tissue deteriorated fresh apples and at the sound around the lesion, to monitor the degradation in typical fermentation process using Saccharomyces cerevisiae and degrade the toxin present in products derived from apple by the action of the bioactive compound produced by yeast. The mycotoxin was quantified by HPLC in isocratic system of reversed phase and UV detection at 275 nm. The degree of recovery achieved was 86.24% and the limits of detection and quantification were 4.3 µg/L and 8.6 µg/L, respectively. Thirty five fresh apple fruits Fuji were analyzed and it was, found the presence of patulin in 32 samples in concentrations that ranged from 1.01 to 120,4 mg/Kg of tissue in the damaged portion and 0.02 to 5, 02 mg/Kg of tissue in sound. To evaluate the kinetics of degradation of patulina, apple juice with 5.0 µg patulin/mL was inoculated with 0.25 g of cells active dry yeast/L, being observed a greater reduction in the toxin content of 81.6% in the first 48 hours of fermentation. This time was used as a parameter to obtain the crude extracts containing bioactive compound capable of degrading the toxin. The kinetics of patulin degradation by the crude extract inoculated with 3.0 µg patulin/mL showed the highest rate of the toxin degradation (50%) in the first 48 hours, followed by only 5.7% degradation after the remaining 48 hours of analysis. The kinetics of degradation of patulin by the extract dialysate inoculated with 3.0 µg patulin/mL showed... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Ciência dos Alimentos. / Made available in DSpace on 2013-07-16T01:02:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Bactérias lácticas, bactérias acéticas e leveduras podem deteriorar o vinho engarrafado, devido à presença de substratos para a sua sobrevivência e multiplicação. Esses microrganismos deteriorantes alteram a qualidade do vinho através do aumento da acidez volátil, formação de ésteres e fenóis, amargor, aumento da viscosidade, aumento da adstringência entre outras características. O objetivo deste trabalho é detectar microrganismos deteriorantes, tais como, leveduras, bactérias lácticas e bactérias acéticas e s. Nos vinhos de cantinas, as contagens de leveduras, bactérias ácido lácticas e bactérias ácido acéticas variaram entre 1,0x101 e 1,5x105 UFC/mL, 3,0x102 e 1,2x106 UFC/mL e 9,0x101 e 2,0x103 UFC/mL, respectivamente. Nos vinhos artesanais, as contagens de leveduras, bactérias ácido lácticas e bactérias ácido acéticas variaram 5,0x101 e 7,0x105 UFC/mL, 8,3x102 e 2,2x106UFC/mL e 7,0x101 e 1,7x103UFC/mL, respectivamente. Utilizou-se o kit API 50CHL (bioMerrieux®), endonucleases de restrição e primers específicos para a identificação das culturas isoladas, e cepas padrão como controle positivo, tais como, Lactobacillus plantarum ATCC 8014; Lactobacillus delbrueckii subsp. Lactis ATCC 7830; Lactobacillus acidophilus ATCC 4356; Lactobacillus brevis ATCC 367; Lactobacillus fermentum ATCC9338; Lactobacillus Sakei ATCC 15521; Lactobacillus casei ATCC393; Pediococcus acidilactici ATCC 8042 e Pediococcus pentosaceous ATCC 33314. As amostras submetidas ao API 50CHL foram identificadas como L. brevis, P. damnosus e P. pentosaceus. As enzimas DdeI Alu I e Hinf I, usadas na técnica de PCR/RFLP -ARDRA, foram as que detectaram maior nível de polimorfismo, distinguindo todas as espécies padrão ATCC exceto P. acidilactici e P. pentosaceus. Porém a enzima Hinf I distinguiu essas duas espécies através do método PCR/RFLP - 16S-23S rRNA (ISR). Nenhuma amostra isolada e identificada pelo teste API 50CHL (bioMerieux®) como Pediococcus pentosaceus apresentou o perfil de restrição da cepa padrão correspondente; nem houve amplificação por PCR com primers específicos para essa espécie, pois foram identificadas por seqüenciamento do gene 16s rRNA como Enterococcus faecium com 98% de identidade. Diferentes culturas de bactérias ácido lácticas, alteraram o vinho esterilizado previamente, caracterizado pelo aumento das sensações de adstringência e amargor. Lactic acid bacteria (LAB), acetic acid bacteria (AAB) and yeast can spoilage the bottled wine, due the presence of substrates to surviving and proliferation. These microorganisms decrease the quality of wine, through of increase of volatile acid, production of esthers, phenols, bitterness, ropiness and others. The aim of this work is detect spoilage microorganisms in wines such as, acetic acid bacteria and yeasts, lactic acid bacteria (LAB) and acetic acid bacteria (AAB) and identify LAB, isolated from wines. In cantina wines, the counts for LAB, AAB and yeast were 1,0x101 e 1,5x105 UFC/mL, 3,0x102 e 1,2x106 UFC/mL e 9,0x101 e 2,0x103 UFC/mL, respectivly.And in artisanal wines the counts were 5,0x101 e 7,0x105 UFC/mL, 8,3x102 e 2,2x106UFC/mL e 7,0x101 e 1,7x103UFC/mL, respectively. Were used kit API 50CHL bioMerieux®, restriction enzymes (endonucleases) to PCR/RFLP method and specific primer to identify LAB isolated from these wines, using patterns strains: Lactobacillus plantarum ATCC 8014; Lactobacillus delbrueckii subsp. Lactis ATCC 7830; Lactobacillus acidophilus ATCC 4356; Lactobacillus brevis ATCC 367; Lactobacillus fermentum ATCC9338; Lactobacillus sakei ATCC 15521; Lactobacillus casei ATCC393; Pediococcus acidilactici ATCC 8042 e Pediococcus pentosaceous ATCC 33314. The samples submitted to API 50CHL was identified for L. brevis, Pediococcus damnosus and P. pentosaceus The enzymes Hae III DdeI Alu I e Hinf I presented the major polymorphism among the others. Hinf I differentiated P. acidilactici (ATCC8420) e P. pentosaceus (33314) Any sample identified by API 50CHL bioMerieux® for P. pentosaceus presented a restriction profile as the pattern ATCC 33314, and neither was amplified by specific primer, because were identify by 16S rRNA sequencing for Enterococcus faecium with 98% identify. Differents strains of LAB altered a previously sterilized wine, detected by increase of bitterness and astringency.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Ciência dos Alimentos, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2013-12-06T00:11:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 319263.pdf: 2218796 bytes, checksum: cb723dcf7609c7b33741b31205e552b6 (MD5) Previous issue date: 2013 / O fermento natural é usado no preparo de produtos de panificaçãoproporcionando melhorias na massa. Consiste na mistura de farinha decereais composta por bactérias láticas e leveduras desenvolvidas porfermentação espontânea ou pela adição de culturas starters. O objetivoprincipal deste estudo foi desenvolver um fermento natural e identificarbactérias láticas e leveduras interessantes à panificação, avaliando afermentação desses micro-organimos e a sua aplicação em pães. Foramdesenvolvidos três fermentos: com cana de açúcar, maçã e uva. Ofermento à base de uva foi o selecionado para esta pesquisa porapresentar maior volume na fermentação e ser o preferido na análisesensorial. A identificação fenotípica para bactéria lática e leveduras foirealizada usando o kit API 50CHL e 20CAUX e foram tambémcaracterizadas genotipicamente pelo método por sequeciamento. Quatrocepas foram isoladas neste estudo, sendo duas cepas identificadas comoLactobacillus paracasei (LP1 e LP2) e as outras duas comoSaccharomyces cerevisiae (SC1 e SC2). No fermentador, LP2apresentou a mesma fase exponencial que LP1 (15 h), sendo suavelocidade específica de crescimento maior e estatisticamente diferentedos demais. As leveduras SC1 e SC2 apresentaram uma faseexponencial de 10 e 14 h, respectivamente. Os micro-organismosapresentaram uma boa estabilidade após o congelamento e liofilização,sendo que LP2 obteve a menor redução microbiana. Com relação aotempo de fermentação do fermento natural, se constatou que ocrescimento ideal foi o de 48 h. Os maiores volumes encontrados nospães foram com 6 h de fermentação. As amostras de pães com LP1foram descartadas da análise sensorial por apresentarem menor volumeespecífico, massa muito firme e cor da casca pálida. A massa com SC1apresentou o miolo mais macio e uma estrutura de glúten normal, comsuperfície uniforme. O melhor resultado da análise sensorial foi para aformulação com LP2/ SC1 (P < 0,05). Desta forma, o processamento dofermento natural, a partir de culturas starters, pode ser utilizado no setor12de panificação, pois a partir delas é possível obter um produtopadronizado, seguro e de maior facilidade na manutenção. <br> / Abstract : Sourdough is used in the preparation of bakery products to provide improvements in dough. It consists of a mixture of cereal flour, composed of lactic acid bacteria and yeasts, which are developed by spontaneous fermentation or by adding starter cultures. The main objectives of this study were to develop sourdough and to identify lactic acid bacteria and yeasts of use in baking, and to evaluate the fermentation of these microorganisms and their application in bread. Three starter sources were studied with cane sugar, apple and grape. The sourdough from grape was selected for this research because it showed greater volume in fermentation and was the preferred choice in sensory analysis. The phenotypical identification of bacteria and yeasts was performed by using a API 50CHL kit and 20CAUX, and they were also genotypically characterized by the sequencing method. A total of four isolated strains were analyzed in this study, two of these strains being identified as Lactobacillus paracasei (LP1 and LP2) and another two as Saccharomyces cerevisiae (SC1 and SC2). In the fermenter, LP2 showed the same exponential phase as LP1 (15 h) and its growth rate was higher and statistically different from the others. SC1 and SC2 yeasts showed an exponential phase of 10 and 14 hours, respectively. The microorganisms showed good stability after freezing and lyophilization, and LP2 showed the lowest microbial reduction. Regarding the fermentation time of sourdough, it was found that 48 hours of growth was considered to be ideal. The largest volumes were found in breads with 6 hours of fermentation. The samples of breads with LP1 were rejected in sensory analysis due to lower specific volume, very firm dough and a clear crust color. The dough with SC1 presented the softest crumbs and a normal gluten structure with uniform surface. The best results in terms of sensory analysis were for the formulation with LP2/ SC1 (P < 0.05). Thus, the processing of sourdough from starter cultures can be used in the bakery sector intended for consumers because it is possible to produce a standardized, safe and ease of maintenance.

Made available in DSpace on 2015-09-17T15:26:28Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-05-28. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:45:35Z : No. of bitstreams: 1 000844609.pdf: 2890818 bytes, checksum: b4ee325e2c108b83532dac9d76e99151 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A biomassa lignocelulósica é fonte alternativa para a produção de etanol. Entre os substratos produzidos no Brasil, o bagaço de cana-de-açúcar é abundante e disponível. Um uso compatível com a geração do bagaço seria a produção de etanol. Duas formas de hidrólise do bagaço são possíveis, a química e a enzimática. Qualquer que seja a via de hidrólise, o mosto conterá D-xilose por ser a pentose mais abundante na constituição do material lignocelulósico. A disponibilidade de mi-cro-organismos que fermentam pentoses é imprescindível para desenvolvimento de processos de produção de etanol hemicelulósico. Para contornar essa limitação, a pesquisa buscou selecionar cepas de leveduras capazes de converter em etanol a xilose presente no meio semissintético e no hidrolisado hemicelulósico de bagaço de cana-de-açúcar. Para tanto realizou-se coletas de amostras de caldo de cana e flo-res, e o isolamento das cepas foi feito em meio contendo xilose como fonte de carbono. Fez-se uma triagem por meio dos testes biológicos de avaliação de produção de etanol seguindo a metodologia de rastreio em placas. As leveduras que apresentaram respostas positivas no teste das placas foram identificadas por meio do sequenciamento dos domínios D1/D2 do rDNA. De um total de cento e sessenta e cinco cepas isoladas, quatro foram selecionadas por sua possível capacidade de fer-mentar D-xilose. Essas leveduras foram identificadas como Wickerhamomyces ano-malus, Schizosaccharomyces pombe e Starmerella meliponinorum. Foram feitas avaliações quantitativas da produção de etanol a partir da xilose e, para fins de comparação, também foi avaliada a produção de etanol a partir da glicose. As leve-duras que produziram etanol em meio semissintético foram selecionadas para fer-mentação em hidrolisado hemicelulósico de bagaço de cana-de-açúcar. Para essa avaliação, o bagaço de cana foi submetido à hidrólise ácida... / The biomass lignocellulosic is an source alternative for the production of etha-nol. Among the substrates produced in Brazil sugar cane bagasse is abundant and available. Compatible with the generation of bagasse use would be the production ethanol. Two ways are possible hydrolysis of bagasse, the chemical and enzymatic. Whatever the route of the hydrolysis the must contain D-xylose to be the most abun-dant pentose in the constitution of the lignocellulosic material. The availability of mi-cro-organisms that ferment pentose sugars is essential for the development of pro-cesses for production of hemicellulosic ethanol. To overcome this limitation the re-search sought to select strains of yeast capable of converting xylose present in the semisynthetic medium and hemicellulose in bagasse hydrolyzate of cane sugar into ethanol. To both samples was performed on samples of flowers and cane juice and isolation of the strains was done in medium containing xylose as a carbon source. There was screened by means of biological tests for the evaluation of ethanol pro-duction following the methodology for screening plates. The yeasts that showed posi-tive responses in the test plates were identified through sequencing of D1 / D2 do-mains of the rDNA. A total of one hundred sixty-five isolates, four were selected for their possible ability to ferment D-xylose. These Yeast were idenfified as Wicker-hamomyces anomalus, Schizosaccharomyces pombe and Starmerella meliponino-rum. Quantitative evaluation of ethanol production from xylose were made and for comparison were also evaluated ethanol production from glucose. The yeast that produced ethanol in semisynthetic medium were selected for fermentation of hemi-cellulose hydrolyzate bagasse cane sugar. For this evaluation sugarcane bagasse was subjected to acidic hydrolysis and concentrated detoxified with active charcoal. Cell growth and viability by counting in a Neubauer chamber, glucose, xylose, xylitol ...